ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
R4_LTR-Caulimovirus_41 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4674611406546114531+
R4_LTR-Caulimovirus_42 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1564611452446114679+
R4_LTR-Caulimovirus_43 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1264611733346117458+
R5_LTR-Caulimovirus_44 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3261785952217859847+
R5_LTR-Caulimovirus_45 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7941786111217861905+
R5_LTR-Caulimovirus_46 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus22131786307317865285-
R5_LTR-Caulimovirus_47 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5201786529717865816+
R5_LTR-Caulimovirus_48 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3203199380031994119-
R5_LTR-Caulimovirus_49 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3363517788135178216+
R5_LTR-Caulimovirus_50 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3363518139535181730+
R6_LTR-Caulimovirus_51 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus15361006546100806+
R6_LTR-Caulimovirus_52 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus36384872868487648-
R6_LTR-Caulimovirus_53 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus17092987949298963+
R6_LTR-Caulimovirus_54 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus38294814469481827-
R6_LTR-Caulimovirus_55 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus127394818539483125-
R6_LTR-Caulimovirus_56 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3971123572411236120-
R6_LTR-Caulimovirus_57 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3171123614711236463-
R6_LTR-Caulimovirus_58 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus15541778260117784154-
R6_LTR-Caulimovirus_59 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7263061050430611229-
R6_LTR-Caulimovirus_60 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus50523061134330616394-

< 3 4 5 6 7 > Total 33


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R4_LTR-Caulimovirus_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

467

Start:

46114065  

End:

46114531

Strand:

+

>R4_LTR-Caulimovirus_41

AGGTGTTCCAGACTGTAAATCTTAAAGACAGTTAGTTCGTTGATAAGTATCATTCTGTTCTCGCTAAGAGTCAGGTAGTTTGCATTAAATTTGAATCATAGTATAATTTAAACATGACATCTTCAGTTATGAATAGTTTAAATCAAGACATGCATCTACTTCTTCATCTCAAAAACAATCAATTCAAGAGAAATTATGTCAAAAAATCATTGCATTTAATCAAGACATATCGCATGATCAACTATCTCACATTAGTCCTGAAAATATATATCAAATACGAAATTTTTATTTTAAAACTGCATGTTCTATTAAACAACATGAACAAACTATTATCTTCTATGGCTTTAGAAAAGTAAAGAAGAATTTTTTTTACTATATTCAGTTCGGATTAATACAAATAGGCAAATAGCAATAAAACATTTGTCTAGGACATGGAATGATTCTCCAATACTTATGTTATTAAGAGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R4_LTR-Caulimovirus_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

156

Start:

46114524  

End:

46114679

Strand:

+

>R4_LTR-Caulimovirus_42

TTAAGAGAATTATGTAAAAAACACAACATTTAATCAAGAAATATCGCATGATCAACTACTTCACATTAGTCCAGAATATATATCAAGTATGAACATTTGATTTAGAGCTGCATATACTATTAAAGAATATGAACAAACCATATCATTATAATTTGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R4_LTR-Caulimovirus_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

126

Start:

46117333  

End:

46117458

Strand:

+

>R4_LTR-Caulimovirus_43

AAGAAATCAAATTATTATTTTATATGGCTTTAGAAATATATAGTAGAATTTTTTTAACTGTATTCATTTCGTATTAATAGAAAGAGCAATCAAAACTTTGTCTTGGACATGTATTGATTCTCCAAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

326

Start:

17859522  

End:

17859847

Strand:

+

>R5_LTR-Caulimovirus_44

AATTTCATAAAATAATTTCATAAAAAACCTCTCTCTAAGTTTCTCTCTCTAATGTCTCTCTAAAGTTCTCTAGTTTTCTAGACCTTATCTCATCTTTGATAAGCTCTGATTCCTATCTTCCATACACAAGATGCGATCCAATTCTTAGCTGTAATTCTCCTTGATCGGTTTCCGTCAATACGACTCTGTCAACACGACTTTCGGGGGAGGTGATTATCCTAACAGTGGTTGAGCTTGATCGAAAAGGCCGAGGTAGTGCCTGAATCGCTCCCTATACCTGGAAAATCATCGAACTCGTCTGATCAATAAGACTTTGTCAACACAAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

794

Start:

17861112  

End:

17861905

Strand:

+

>R5_LTR-Caulimovirus_45

CCATCCTCTAACCGAAAGGTTATGGAGTATGTTCAATCTAGCAAGTTCTCATCTTGCCAAGTACCAGCCACTGAAGAAGAACAGTTCATATCATTGAACATTCCGGAGCATCTACCCAGATTATGGCAACAACAAGGCTACACCCATCTCCATTTCGGTGTAGTAAGAATTGGTCTGACCTTACACGCCAGAAAAGGTCTACCAGTCGTTGCTAGGATAGCTTTAATCGATTCTCGATTAAAGTCATATCAACAAGCATGTATCGGAACAGTCCAGACAACATTAAATGCAGGAACAGTATTCGTAACGCTGTTTCCAAACTTTAATGTTTCGCTACAAGATCCAAACCTGTTAAAGACGCTGAAAGTACAGCTTCAACTAATTGGAGCTCCTATGCAAGAGAAGAGTGTAGCAGCCACTTTGCATCATCAGATCGTCTACCGAATTCAAGATCACGCTCTCGATCTTGTACTTCCTTCGTCTGACGAAGCCTTGTATCTCGAAGTTACATCAGCATCTCAGGCACCGAATTCGATACAAATTCCTCGCCAGATATCACGCGAAGAGCTGATAAGACGACTACCGGAGTCTTGGGTGACAAGCTACGAGAAGCTTCATCAAGCCACTCAATCGCCGGTTCAATCTTCAGACGTTAGCTTTCATTCACGGAAAGATGGAACAACGGAAATCACTTTTGAAAAACCAAGATCTTCGTCGTTCAGGCAACAATTATTTACTCAATTTGCCATCGAAGTTGACGAAAGAGATTTCTACGGCCCAGCTAAGAAACAAGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2213

Start:

17863073  

End:

17865285

Strand:

-

>R5_LTR-Caulimovirus_46

ACTGCGAAAAGTCGTGGTACAGTAGTGAAAGATTTGTAGAAATTCTTCCACCGTATGCCTTCTGGTTCGATCGAGATGTTGAATAACTTTTTGAGAGTGCAATATGAATCCCACCCTAATATTACGTCTTTGCCTGGTGCTGTTGATCCAAGGACTGTAGTCGTGATTTGGCATCCTGGAAAAAGCTCAATCGTAATTGGCTTTGATTTGAGTTTGATGGATAATGATCCTGAATTTGCCACACGAAATTGTTGTTGATGCGGTAGCCACATAGAAGACGGGAGAATTTTCGGATTTATTATTGTCGTGTGGGCCCCAGTATCTATGAATGCGATGGCATCGACTGGTTTTTCTTTATGAGCCGGATCAAAGATCTTCACCTGAAGATGTGGAGGGTATTTTTCTTCTTGCTTCGGTGTCTCTGTGATTTTGAAGCAGCAATCTTCATCTTCGTCGTGAGATGATTCAGAGGAATCGTCAGAGTCGGTGTCGGAGTACCCACAAATGGCTCCGCTGTCGTCACTATCATAAGATAGAACTGATTCCAAGTCGTGGGTGTCGATGTCAATATCCGGTGCGATCTTCGATATCGAGCTGATTAGATATTGTTTTTTCTTTTTTGACTTGTTAGGGCAATTCTTAGCATAATGTCCTTCTTTTCGACACAGAAAGCACCTTGTTGACTTCTTGAAGCTTCTTTTCTTTCGAAAGAATTTCTTGCGCCTGAAGGTTGGTGAGCGTTTTGAAAAACGCTTTTTGAATTTCTTGTGTTTTCTATTAGAATCACAAGAGCATGATTTCTTGGACTTCGAGCATTTGATCGATAGGTCTGGTCTTGCACATATTTTTGATAGCTGCTTCGATCGATCCATAAACTCCATCCAGAACTCCTTCTGTTTGCAAAGTTTGTCGAGAGTTCTGAAGACATACTGCTGGATTTGACCAATGGAGATTTCTTCGATTGTTTGTCCTTGATCTCTGATGTACAGCTTAGTCTGCTGACTAAGATAATCATCAATGGACGATAGGTAGACATGCTTCAGGCTTGGATTATTGAGTCCGTTTAGCGCATAATATCTTCTCGTCTGTCTTTCAAAATGCTTCGCAAGATCTTTCTTTTTTAGAGAACAACATTTTGCTGAGAAGAATTCTTCTTGAATTTGTTCCTTTTGATGTGTTGGAGTGCCAATGAATTCTCTGTGGATTTCTCCTAGTAGCAACGGAATTGTTGTCTGATAGACTTGCTGCTGTCTGTATTCTCCGAGGGAATTCCACCATTCTTTAAGTGCGCCAGACAGTCTCGCTGTGAATTGTTGAATTACCAAATGCAGGGGAGACGTAATAGCTTCTGAGTTCATCCATGCATGGAATTCGTCCAACCGATCATTCCATTTGTCGAAAGGGATATCGTCGAACGTAAATACCATAACCTTTGAAGAGAAACGCTTATTGCGAGTTTCTTCTCTTGGGGCTTCATAATTCATGTCTTCCTCACTTGAATATACTTCGTTGACGTTTGGCTCTTGTTTAGGAGTACTTGATCCTTCACCGATTACATACTGTTTCGGGAGCGATTCTTCATCAGAATCTATATCGTATTCACTGGAGCTTGAGTCTGAGAAGTGCTTGATGTTGACGATCGGTGAGGGCTGAGTTTCTTCCTGATGAACTGGTTGATTCTCCAGTAGTTTGGTGGTTTCGACAATATTATCTAGCAAACTAGTCATCGAAAATTCGATGATGCCGATGTCTTTTCCTTTGTTGTCCACCGACTCATGGCTAGATGATGACGTAAGAGTTGGCCTCTTCGGTGGGTTGACTTGGAATTCAGTTTCTTTGTGTCTTCTCGATTTTGATCTGGTTTGTTTTGGCTTTTCCGCGAAGATCGAAGATGAGCCGTATCTTGATGTAAAGGTTTCATCGGAGGATAGAAAACCAGGTAGTGGCGATCTCATTTTTGGGGTTTGGTAGCTCGAAAGGAATCCTGGAGAGTACGATCCCTGGTACATTGGTAAATCTGTCGATGAACTCCCCAAAGGGTTGAAGTAAGAGTCTTTTTGCCGTTGACTGTAGATTAGACTCTCTAAGCTCCGTTGGAGGTCTTTTAATTGATTTTTGAGGCTTGCCGTCTCTGCTTCTTTACTTCGAAATTGAGTCGTGTCAACCATCATGTGCTTCGCCATCGTCATCATCTCCTGATGGAGACTGTTGAG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

520

Start:

17865297  

End:

17865816

Strand:

+

>R5_LTR-Caulimovirus_47

CAAGAGATTTCTACGGCCCAGCTAAGAAACAAGACATCCCAAGGCCATGTCGATTCGACAAAGACGGAAATATAGTCTATCCTTTCATAGATGAAGATGGACACTGCCGCTTTGACATCTGCAACTGCACAGCCTGTTCAGATGCCTACTGGAGCTACGAATCCGACGATGAAAAACGGAGACGAAGAAGAAAGAAAAAGGACCCTCTATACAAAAGGTATCTCGAAGGAGATCCTTCTGTTGGTCCGCTAGGCGATGATAGGTACGACTTTATAGTTGAATACCCCAGCGCAAAAAAGGAACCAGAGCAAGACTTATTGATGATCAGCCCAAACAACTTTCCTCCTCCAGAAGATTTCATCAAAGATGACGTTGCTCATACCCCAAAAATCCTTTCGCCAGCAATAGGTTCTTCTGGACCTACTCAGCTTAGCCAAGCAGAAAAGGTTCTAAACTGGCAAACAGAAAATTCCCTTGCTCAGAATTATCTGTTAACAGCAATAAACCAAAAGGTCGATCA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

320

Start:

31993800  

End:

31994119

Strand:

-

>R5_LTR-Caulimovirus_48

GTCGTGTTGACAAAGTCTTATTGATCAGACGAGCTCGGTGATTTTCCAGGTATAGGGAGCGATTTAGGCACTACCTCGGCCTTTTAGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGATAATCACCTCCCCCAAAAGTCGTGTTGACAAAGTCGTATTGACGGAGACCGATCAAGAAAAATTACAGCTAAGAGTTGGATCACATCTTATGTATGGAAGATAGAAATCAGAGCTTATCAAAGATGAGATAAAATCTGGAAAACTAGAAAATTTTAGAGAGACATTAGAGAGATAAACTTAGAGAGAGGTTTTTATGAAATTATTTGATA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

336

Start:

35177881  

End:

35178216

Strand:

+

>R5_LTR-Caulimovirus_49

AATTATTTACTCAATTTGCCATCGAGGTTGATGAAAGAGATTTCTACGGCCCAGCTAAGAAACAAGACATCCCAAGGCCCTGTCAATTTGATAAAGACGGAAATATAGTATATCCTTTCATAGATGAAGATGGACACTGCCGCTTTAACATCTGTAACTGCACAGCCTGTTCAGACGCCTACTGGAGCTACGAATCCGACGATGAAAAACGAAGACGAAGAAGAAAGAAAAAAGACCCTCTATACAAAAGGTATCTCGAAGGAGATCCTTCTGTTGGTCCGTTAGGCGATGATAGGTATGACTTTATAGTCGAATACCCCAGCGCAAAGAAAGAAA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R5_LTR-Caulimovirus_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

336

Start:

35181395  

End:

35181730

Strand:

+

>R5_LTR-Caulimovirus_50

AATTATTTACTCAATTTGCCATCGAGGTTGATGAAAGAGATTTCTACGGCCCAGCTAAGAAACAAGACATCCCAAGGCCCTGTCAATTTGATAAAGACGGAAATATAGTATATCCTTTCATAGATGAAGATGGACACTGCCGCTTTAACATCTGTAACTGCACAGCCTGTTCAGACGCCTACTGGAGCTACGAATCCGACGATGAAAAACGAAGACGAAGAAGAAAGAAAAAAGACCCTCTATACAAAAGGTATCTCGAAGGAGATCCTTCTGTTGGTCCGTTAGGCGATGATAGGTATGACTTTATAGTCGAATACCCCAGCGCAAAGAAAGAAA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

153

Start:

6100654  

End:

6100806

Strand:

+

>R6_LTR-Caulimovirus_51

TCCGTCAATACGACTCTGTCAACACGACTTTCGGAGGAGGTGATTATCCTAACAGTGGTTGAGCTTGATCGAGGCCGAGGTAGTGCCTGAATCGCTCCCTATACCTGGAAAATCATCGAACTCGTCTGATCAATAAGACTTTGTCAACACGAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

363

Start:

8487286  

End:

8487648

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_52

AGTCGTATTAACGGACGAGCTCGGTGATTTCCAGGTAAAGGGAGCGATTTAGGTACTACCACGGCCCTTTCGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGAAATTACATCCCCGGAAAGCCGTGTTGACAGAGTCGTATTGACGGAAACCGATCAAGAAAAAATCACAGCTATGAATTGGATCGCATCTTGTGTATGGAAGATAGAAAGCAAAGCTTATCAAAGATGAGATAAGGTCTGGAAAACTTGAGAACTTTAAAGAGACATTAGAGAGAGAAACTTAAAGAGAGGATTTTTTTATGAAATTATTTGATGATATTTCTCAAAGAAGTATACACATATTTATAGATGAAGTTAAGGCGCTCACATA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

170

Start:

9298794  

End:

9298963

Strand:

+

>R6_LTR-Caulimovirus_53

GGACGCTTTAAAAATTCTGAAATGCATTATCACTTCACATTCAAAAATATGCTAACTGTAAATAAAACTATTAAAAAGTTCGAATTTCATTTGATTGGACATAAATTTCGCATCGTAATAGATAATATGTCATCTTTTCCAAAAATGTTACAATTCCAGCAAAAAATCGT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

382

Start:

9481446  

End:

9481827

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_54

TTTTATGAAATTCTGAGATGTTATTTCAATATGGGGATACATACTTATTTATAGAAGATCAAGATAAGTACGCTGACATAAGCGATTACATCATCGCTTACATCATGCTTTCATAAGTTCACAATGATTACATCATTGCTTACATCATTATTTCAAACACACTTATTATATATAATTAAACACTGATGATGACTTATTTAATGATCTATTTTGAAATTGATGATGTGATATCACAACATCTGTAGTGATACTCTGGACATGTGTATTCCGATTCCGGTTCCTCATAAGACTTCTGCGAATCGTCGTTGACTTAAATGTTAAACATTTTGCTGATTTCATCAATATTCATGGAGTCGTTTGGGATCTGTGAGTCTTGGAAGTA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1273

Start:

9481853  

End:

9483125

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_55

GACTGGTGGTTTTGCTTGTTTTTCCATGAAAAATTGAAGATCTTCGTTGAGGCTCATCTGGTAGCCACTTGGATAATATGTCAAATTTGGGATGAAAGGAACATGAAATGTTTGTGTGGAATTAATAAGACAAAATGCATGAATCTGAAAGTCTTCATATGGTTTGTTGTCATTGATATTAAAATATGGTCGAATTTCTCGTTGATAGTCATCGTAATGAATGAGGGTAGGTAACACATGGTTTTTGCTGAACTTGACGTTAACTTGAATAGGGCGATGAAAGAAGTATATCGTATGAGGGTTAAAGAAAGGATTAAAACTCCCTCGACCTTTTAACTTCTTAAACGGTAAGCTTGTTCCTTTTGCTAATTTTTTCAATATCCTGATCCAAATGAGTAATGGTGCAAACCATGTTAAGAATGTTGAGAAGCAGTCTTTTTTTCCTTGTTGAGCGTTGATGCACTGGTATAACCATTGGATATTGAAAATTATACCTATAGTGTGGACTAACCAGAGTACCAGAGGAAACCGATAACTTATTCTAGCATGTATGCGTTTTCGATCATGTAGAGATGTGCTAACGGATATTCAGGGTGAATTCCCATTGGTGAAATGAGATGATTGGAGATTCTGTATCTTGACAGGATGATTGATTGGTGGAATAAAATCTTATCATGGAGGTGTTCGTGCATAGCTTTTCTGTTGATAAGCTGATGAGCGTCTTTGGGCATGTTGGGTGCGAAGTCATAGGAACTCTTTGCTGAAGAGTCCTCCATCATTTGTATTTATTTTATTGGGTTTCTACTGAGTATATCAGCGAGAGTATTCTCTGTACCTTTTAAATAGAAGGATACAAAATCGTACTTCGAGAACCATTTACTCCATCGTAATAATTGCTGATGTGGAATCATTTTTTTCTTGAATTGTAACATCTTAGAAAAGATGACATATCCATCTCAATGCGAAATTTATGTCCTATTAGATGAAACTCCAACTTCTCAATAGCCTTCTTGACTGCAAGTATTTCGTTGAACATGGAGTGATAATGCATCTCGGAATCTTAAAACGTCTACTTTTGTATCCACATATTTGACGTTTCCATTTATCTCTTCAAATAGAATGGCTCTCCAATATTTTTCACTTACGTCAGTCTGTAAAATTCATGTTCCTGTAGAGGGAATACTCTATTTTTAGACTTTTGACAACCTACCTCTGTTTGTTGGTTTGTCCAAAGCGGTGGATTCTTTGTCAGCATTTTCTATAGCGGTCTTAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

397

Start:

11235724  

End:

11236120

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_56

ATACAAGATCGAGAGTGTGATCTTGAATTCTCTAGACAATTTGGTGATGAAGGGTTGCTACTACACTTTTTTCTTGCATCGGTGCTCCAACTAATTGAAGCTGAACTTTGAGCTCTTTAAGAGATTTGGATCTTGTAGCGAAACATTGAAGTTTGGAAAAAGTGTTATGAATATTGTTCCTGCATTTTATGTTGTTTGAGCCGTTCCAATGCAAACTTGTTGGTACGACTTCAATCGAGAGTCGACTGAAGCTATTCACGTTATGACTGGTAGATCTCACATGTAAGGTTAGACTGATTCGTACTACAGAAAAGTGAAGGTGACTATAGCTTTGATGTTGCCACAATCTTGATAGGTTCTCCGGGATATCAAAGATATGAATTGTTTTTCTTCCGTG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

317

Start:

11236147  

End:

11236463

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_57

TGATGAGTTCTCGAACACCCTTGACTGAGAAAGTGCTAGGCTTTTTGGCAAAGTATTTGTATGGATTCACCAGGGGATGTGTAGTTTCGGGTAGCTGATCGCCCGGAACATACTCGATTTCGTAAAGAGAGCTAATATTAGATGAGGAAGAACAACTTTTACTTTTAAGAAGGGTAGAGATTGCCAATTGAGAACCAATTGAGGAAGGTTGTGAAGTAGACATTTCGAGAGAGTTGTTTTCCAGATCACTTAGAACAATCAGTCATAAACAGTGATTCTATCAACCATAACGCAAGTCTGTAGGCTCTGATTACATA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1554

Start:

17782601  

End:

17784154

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_58

TTACTATGTCTTTATCATCTCTATTTTCCCAGTTCTAAATGGAGTAGCTATTACTTATCTTTGAGGTGTATATAACTTTATATCTTTTAAAGGTGGATGAACTGATTTAATATTTTCTCCATTAGTTATTTCCCATATATTATACAAAGTTGGACTAGTATTAATTGATTCATTTTTGTAAGGGTAATCTGTTTCATTTTCTTGGGAATATGTTTCAAACCATGTAAAGAATTGAATATTAGTTTTTATATTATTCATATGATCATACCAATTTTCTCGATAGCTAATAGTTGTTTCTTTAGTATTAAATGTTTTAAAATACCATTGTCTTTTATCTGTATTCTTATGAGATAAAAATTCTTCTTTAAAATGTTGTCTATCAATTTCAAATTTTTTTAAATAACATTTACAGATTTAAAGTCTCAAGGTGTTTGAGAAGTGGGAAAATTAGATTCTACTTCAGATTTTTGAATAGGTTAAGCAATAGGTGGTTGCAAATTAATTGGAATTTTTTTTCTGGATTCCTAATTAATTTGTTTTCTACACTTTCATCTGATTGAGTATTAGCCATACCAGAAAAGGAAGATCCTGGGTAAAAGGAACTGATTTTTTTTAATAAGGATGGTTCTCTAAAGGATCCAAATTTTAGTAGTTCAGTTATACTAGTGATAGTTTTTTGTTCAAAATTTCTTGGTGGTTGGGTAATATCAATTATCCATTGGTCATGAATACTATTTTCTGTCCATTTTAGTTGCTTAGGAGTGTAAGTAGATGTGGGAGTATCTTTACTATAAACAGCTAATATTGTTGTTTCTCCTTTATCGTTTTGTAATAAACATCTAAGATTAAATTCTGATGTAGATTGCTTAAAGTATATTCTATATAACAATAGATAGCCATGTCTTTCTTGTTGAAATTTAATTTCAGATAGGTGTACATTTAAACTAATGTATTAAATATTATTGGATTATGTAGATTTACTTTAAAATTCATAGCGCAATTAAAACATACAGCTCCGTTACATAAGTTTGCTTGTACAGCTCCTAAGAATGAATTCAAAATTTAATAGAATTTCATCCCTTAATAACATAAGTATTGGATAATCAATCCCTGTCCTAGACAAAGGTTTGATTGTTATTTGTATTAATCCGAAATGAATACTGTTAAAGTTTTTTCTTCTATATATACTTGTCCAAAGCAATAGAAGATAATGATTTAATTTCTTCAAATTCGTTTTGTAATGATATAGTTTGTTCATGTTCTTTAATAGAATATGCAGTTTTAAAATCAAAATTTTCTATTTGATATATATTTTCTGGACTAAATTGGGGTAGTTAATCATGCGATATTTCTTGATTAAATGTTGTGATTTTTGACATAATTTCTCTTAAATTATTTGTCTTTTGAGACGAAGAAGAAGATGCATGTTTTAATTTAAACCATTTCCTACCTGAAGATGCCATGTTTAAATTATACTATAACTCAAATTTAAATACAAACTAATCGACTCTTAACAGGGACAGAATGATGGCTTACTAACGGACTCACTGTCTT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

726

Start:

30610504  

End:

30611229

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_59

GTCGTGTTGACAAAGTCTTATTGATCAGACGAGCTCGATGATTTTCCAGGTATTGGGAGCGATTTAGGCACTACCTCGGCCCTTTCGATCAAGCTCAACCACTGTTAGGATCATCACCTCCCCCGAAAGTCGTGTTGACAGAGTCGTATTGACGGAGACCGATCAAGAAAAATCACAGCTAAGAATTGGATCGCATCTTGTGTATGGAAGATAGAAATCAGAGGTTATCAAAGATGAGATAAGGTCTGGAAAACTAGAGAACTTTAGAGAGACATTAGAGAGAGAAACTTAGAGAGAGGTTTTTTTATGAAATTATGTTATAATATTTCACAAGGGGATACACACATATTTATAGATGAGGATAAGGCGCTGACATAAGCGCTTACCTCATTGCTTGCATCATGCTTACATAGCGATTATATCATCGCTTGCATCATGCTTACTTAGCGATTATATCATCGCTTTATTTGATTAAAAGCACACATATTTTACATAATTATACATTAATAACGGATGCTTGTTTTAATGATCGATCTCGAACTCGATGATATGCTTGTCGCAGCATCCGTAATATTCGCCTGGGCAGACGTACTCTTCTTCATAATCTGCAATCATTTTTTCTGCCTCTTCGTCGATTTCAATGTTGAACTTCTTTTCTATCTCGTCGATATTCATCTCGTCGTCTGGAAGTTGCGCGTCTTGAAAGAACTCTGGAGGGCATTCTTG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R6_LTR-Caulimovirus_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

5052

Start:

30611343  

End:

30616394

Strand:

-

>R6_LTR-Caulimovirus_60

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