ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr2_LTR-Cassandra_41 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra17785116688511844+
Chr2_LTR-Cassandra_42 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35693096729310027+
Chr2_LTR-Cassandra_43 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1231060283410602956-
Chr2_LTR-Cassandra_44 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3461108981411090159-
Chr2_LTR-Cassandra_45 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1821109025911090440-
Chr2_LTR-Cassandra_46 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1051109044511090549-
Chr2_LTR-Cassandra_47 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3551109055111090905-
Chr2_LTR-Cassandra_48 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra831207792312078005+
Chr2_LTR-Cassandra_49 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3311301179213012122+
Chr2_LTR-Cassandra_50 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3311301230913012639+
Chr2_LTR-Cassandra_51 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3321314519113145522+
Chr2_LTR-Cassandra_52 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3321314570513146036+
Chr2_LTR-Cassandra_53 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3591315424913154607+
Chr2_LTR-Cassandra_54 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3581385270813853065+
Chr2_LTR-Cassandra_55 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1791385317213853350+
Chr3_LTR-Cassandra_56 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35964651826465540-
Chr3_LTR-Cassandra_57 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35964656486466006-
Chr3_LTR-Cassandra_58 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33080883658088694-
Chr3_LTR-Cassandra_59 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra22088474838847702+
Chr3_LTR-Cassandra_60 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra26688481988848463+

< 3 4 5 6 7 > Total 14


Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

177

Start:

8511668  

End:

8511844

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_41

TGTAATTTCCCAATTTATGGTATATGGTGGTGCATGAGGAGCACTTAAGAGAATTTATTTAGCTATTTATCTCACTAAAGTGCACTTATCTTTTCCAACACTCGTCCAAAGAGAATTCCAGAGTTAAGCGTGTTTGGGTTGAAGTAGTAGTAGGATGGAATACCTATCGGAAAGTAA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

356

Start:

9309672  

End:

9310027

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_42

TGTACCACCCCGGTTTCAGAGAATATGGTGATGCATGACGAGAGCTTAAAAGATTTGATTTGGCTATCTATATCACCGAAGTGCATTATTTTCTCCCGTCAGCCATCTAGTTAGAACTTCAGAGTTAAGCGTGGTTGCCATAGGGTACCACTATGATGGGTGACATACCGAGAAATGATTGTCAGTATAGTGTGAATAAGGTCAAAACATGGGGAAAGATCGTGTGGTGATTTGTAGGGATAATAACAAGTCTTTGAAGCCTCTTGGATTAACGCACCGGCCTTCATACGGGGGTGGGGCTCATGAGCTGAGAGAGGGCATGGGTGATCACGAACGATGGCATTCAGGACGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

123

Start:

10602834  

End:

10602956

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_43

CTTTGGAGTTTTCTCTGAAAAAATGATGGAAAAGATAAGTATACATTGATGACGTAAGTAGACAAATCAAATCTCTTAAGCATTCTCTATGTACCATTATATACCATAAATCGAGATATTATA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

346

Start:

11089814  

End:

11090159

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_44

CCCAACCACCACCGTTTGTGGGCTCCCATGTCCTCTCTCTGTCTGAAGCGCTATATCTTCGATCGACGGTCAGTGCAATACTCCATAAAGTTTTAAGGACTTGTTACTATCTCTTCAAATTACCACATGATCTTTCACATTGTTTTTTTCTTGCACTATACTGGCAATCACTTCTCCGCTAGCTCACCCATCCATGAATTTGTTTACATCAGGCATACTTAGCTCTTCAGTTTTCTCTGAACATGTAACAAAAAAGATAAGTACACTTTGGTGACATAGTATGCAAATCAAAAATCTTGAGCGCTCCTCATGTGCCACCATTTTTTGTAGAATTCAGGGTGTTATA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

182

Start:

11090259  

End:

11090440

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_45

AATCACTTTCCGGTATGTCACCCATCCTTAAATTGGTTTACATCGGTCATACTTAGCTCTTTAGTTTTTTTTCTGGACAAGTAACAAAAAAAGATAAGTACACTTTTGTGACATAGCTAGGTAAATCAAAAAATTTAAGCGCTCCTCCTGTACCACCATCTTTTAGAATCCACTATGTTATA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

105

Start:

11090445  

End:

11090549

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_46

CCCCCACTAACAGATCTCATAATCCACAGCATAGTAAGACCATCTCCCTCGATGTTGTGAGCCCACATATCTCTATACTCATCTAGATTCGACTCTGACACCACT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

11090551  

End:

11090905

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_47

TGTAGCGCCTCGATGGCTATCGTCTATGGGCTCCCCACTTCCTCTCTCAGCCTATGGGTCCAACCCTCATCCGACGGTTGGTGCGCTACTCTGGGAGGCTTGAAAGACTTACTACCATCCTTACAAATCACTACATCATCTTTTTATGTTTTTGGCCTCGTAGCACATTATCAAAAATCACTTCCCGATAGGTCATCCTTCATTAAATTGCTCAAATTCAAGCATGCTTAACTAGAGTTCTCTCTAGATAAGTGATAGCCAAGATAAGTGGATTTTGGTGACATAGGTAAACAAATAAAATCTCTTAAACGGTCCGCATGCACTACCAATTCTTTGTAGAATTTAGAGTGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

83

Start:

12077923  

End:

12078005

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_48

TGTAACATCTCGGTATCTGGTATATGGTAGTGTATGTGGAGAGGTTTAAGAGATTTGATTTGGCTACGTATATCACCAAAGTG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

331

Start:

13011792  

End:

13012122

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_49

TGTAATATCCTGGTTTCTAGTATATATAGTGGTGCATGAAAAGAGTTTAAGAGATTTGATTTGGCTATCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCTATCACTCGTCTAGTTAGAACTCTATAGTTAACCATGCTTGGACTGGAGTAATATTAGATGGGAGACCTACCGGAACGTGATTATCGGTACTGTGTGAGTGAGACCAAAACACGGAGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGAGTGGTAACAAGTCTATAGAGCCTTGAAAAACTTAATATACCAGCCATCAGATGAGGGTGGGGCCTACAGACCTAGAGGGCGTGGAGGCCCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

331

Start:

13012309  

End:

13012639

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_50

TGTAACATTCCGGTTTCTGGTATATATAGTGGTGTATGAAGAGAGTTTAAAAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGGGCACTTATTGTTTCCGTCACTCGTCTAGTTAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGGAATATTAGATGGGTGACCTATTGGAAAGTGACTGTTGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAATACGGAGAAAGATCATATGGTGATTTGTAGGGGTGGTAACAAGTCTTTAGAGCCTCGTAAAAATTAATGCACCGGTCGTTGGATGAGGGTGGGGCCCACAGGCCTAGAGGGCGTGGAGTTCCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

332

Start:

13145191  

End:

13145522

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_51

TGTAACATCCCGGTTTCTGGTATATATAGTGGTGCATGAGGAGAGCTTAAGAGATTAAATTTTGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTATGTCAACAATCCTGAGAAAAATCCAGAGTTAAGCGTGTTTGGGCTGGAGTAGTATTAGAATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGAAATGATCATGTGGTAATTTGTAGGGATAGTAACACGTCTTTAGAGCCTTCAGAATTAATGCAACGGCCGTCGAACGAGGGTGACGCCCATGGGCCCAAAGAGGGCGTGGAGGTTCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

332

Start:

13145705  

End:

13146036

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_52

TGTAACATCCCGGTTTCTGGTATATATTGTGGTGCATGAAGAGAGATTAATATATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTATGTCAACCATCTTGAGAGAACTCCAGCGTTAAGCATGCTTGGGCTGGAGTAGTACCAGGATGGGCGACCTACTGGGAAGTGATTGTCGGTACTGTGTGAGTGAGGCCAAAATATGGGGAAATATCATGTGGTGATTTTTAGGAATATTAACAAGTCTTTAGAGCCTTCAGAATTAATGCACCGGCCGTCGGACGAGGGTGAGGCCCACGAACCTAGAGAGGGCGTGGAGGCTCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

13154249  

End:

13154607

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_53

TGTAGCATCCTGGTTTCTGGTATATGGTAGTGTATGTGGAGAGGGTTAAAAGATTTGATTTGACTACCTATATCATCAAAGTGCATTTATCTTTTCTGTCAACCATTATGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTACTAGAATGAGTGACCTATCGGGAAGTGATTCTCAATATCGTGTGAGTGAGGTCAACACACAGGGAAAGATCATGTGATGATTTGTAAGGATAGTAACAAATCTTTAGAACCTCAAAAAAATTAAAAGACCGACCGTCGAACAGGGGTGGAGCCCATGGGTCCGAGAGAAGATGTGGGAGCTAAATGGTAGGGACGGTCGGAGCGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

13852708  

End:

13853065

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_54

TGTACCATCCCGATTTCTGGTATATAGTGGTGAATGATGAGAGTTTAAGAGATTTGATATGGCTACCTATATTACAAAAGTGCACTTATCTTTTCTGTAAATCTTCTAGTTAGAACTCCAGAGTTAAGAGTGCTTAGGCTGAAGTAGCACTAGAATGGGTGACCTATTGGGAAGTGATTCCCGGTACCGTGTGAGTGAGGTAATAACACAAGGAAAAATTATGTGGTGATTTATAGGGATAGTAACAAGTCTTTGGAGCCTTTTTAAAATTAATGCATCAACTGTCGGACAGGGGTGGGGCCCATGGGCCCGAGAGAGGACTTGGGTGCTCAGTGGTAGGGAAGGTCGGGGAGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

179

Start:

13853172  

End:

13853350

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_55

TGTAACATCACTGTTTCTGGTATATAGTGGTGTATGATGAGAGTTTAATAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATATTTTCTGTCACTCCTCTAGTTAGAACTCCATAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTACTAGAATGGGTGACCTGTCAGGAAATGATT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

6465182  

End:

6465540

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_56

TGTAACGTCCCGACCGTCCTTACCAGTGAACACCCACGTCCTCTCTCGGGCCTATGGGCCCCACCCCTGTCCAACGGTCGGTGCATTAATTTTCTACAAGACTCTAAAGACTTGTTATTATCCCTACAAATCACAACATGATCTTTCCCCGTGTTTTAGGCTCACTCACACGATACCGGGAATCACTTCTTGATAGGTCACCCATTCTATTGCTACTTCAGCCCAAGCATGCTTAACTCTGGAGTTTTCTCAGGATGATTGACAGAAAAGATAAGTTCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAAATCTCTTAAACTCTCATCATGCTCCACTATATATCATAAACCGGGATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

6465648  

End:

6466006

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_57

TGTAACGCCCCGACCATCCCTACCAGTGAACACCCACGTCCTCTCTCGAGCCCATGGGCCCCACCCCTGTATGACGGTCGGTGCATTAATTTTCTACAAGGCCCTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCATATGATGTTTTCCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGGGAATTACTTCCCGATAGGTCACCCATTCTAGTGCTACTTCAGCCAAGCACGCTTAACTCTGAAGTTCTCTCAGGATGATTAACAGAAAAGATAAGTACACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAAATCTCTTAAACTCTCATCATGCACCACTATATATCAAAAATTGGGATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

330

Start:

8088365  

End:

8088694

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_58

CCCATGGACCCCACACTCTCTCTAGGCTTATGAGTCCTACCCTCGTCCTACGACCGGTGCATTAATCCTAGAGGCTTGAACGACTTCTTATTATTTCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCTGTTCTTTGGCCTCACTCACAGGGTACTGACAGTCACTTCCTGGTATGTCATCCATCTAATATTACTTCAGCCCAAACACACTTAACTCTGGAGTTTTAACTAGACGAGTGACGAAAAAGATAAGTGCGCTTTGGTGATATAGGTAGTCAAATCAAATTTCTTAATTTTCTCCACACACTACCATATACCAGAAACCGGGATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

220

Start:

8847483  

End:

8847702

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_59

TGTAACATTTCGATTTATGGTATATGGTGGTGTATGAGAATAGCCTTAAAAAATTAATTTTGCTATTTATGTCACCAAAATGCATTTATCTTTTCTGTTAATTGTCCAGTTAGAACTCAAAAGTTAAGTGTGTTTAGGCTGGAGTTGAGAGTGCTTGAGTTGGAATAATATTAGGATGGATGACCTATCGGAAAGTAATTATCGGTGCCATGTGAGTGAG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

266

Start:

8848198  

End:

8848463

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_60

TGTAACATTCTGATTTTTAATATATGATAATACATGAGAATAAGCTTAAAAGAATTGATTTGGCTACTTATGTCACCAAAATGCATTTATCTTTTAAATTATTTGTTCAGTAGAACTTTATAATTAAGCATGCTTAGATTAAAATAACACTAAAATGTGTGATCTATCTGAAAATGATTGTCAGTACCATGTTAGTGAGACCAAAACATAAAACATAGAAAAATATCATATTGTAATTTGTAAAGACATAAAAGAATCTTTAAAGC