ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr2_LTR-Cassandra_21 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra13511537271153861-
Chr2_LTR-Cassandra_22 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra14515216971521841+
Chr2_LTR-Cassandra_23 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra36127305032730863+
Chr2_LTR-Cassandra_24 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35827309712731328+
Chr2_LTR-Cassandra_25 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35840751934075550-
Chr2_LTR-Cassandra_26 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35943432044343562-
Chr2_LTR-Cassandra_27 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra29646093134609608+
Chr2_LTR-Cassandra_28 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35251341815134532-
Chr2_LTR-Cassandra_29 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra19951346075134805-
Chr2_LTR-Cassandra_30 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35751349125135268-
Chr2_LTR-Cassandra_31 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra23055364275536656-
Chr2_LTR-Cassandra_32 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35258939815894332+
Chr2_LTR-Cassandra_33 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra14658943905894535+
Chr2_LTR-Cassandra_34 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra11858945365894653+
Chr2_LTR-Cassandra_35 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34858948405895187+
Chr2_LTR-Cassandra_36 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra13559406405940774+
Chr2_LTR-Cassandra_37 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31960691286069446+
Chr2_LTR-Cassandra_38 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33378556897856021+
Chr2_LTR-Cassandra_39 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra20785113278511533+
Chr2_LTR-Cassandra_40 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra10785115608511666+

< 2 3 4 5 6 > Total 14


Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

135

Start:

1153727  

End:

1153861

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_21

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

145

Start:

1521697  

End:

1521841

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_22

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

361

Start:

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End:

2730863

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_23

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

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Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_24

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

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End:

4075550

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_25

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

4343204  

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4343562

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_26

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

296

Start:

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Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_27

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

352

Start:

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End:

5134532

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_28

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

199

Start:

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End:

5134805

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_29

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

357

Start:

5134912  

End:

5135268

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_30

TGTAACACCCCGACTGTCCCTACCAGTGAGCACCCACGTCCTCTCTTGGGCCTGTGGGCCCAACCCTGTCCGACGGTCGGTCCGTTAATTCGGAAGGCTCTAAAGACTTGTTACTATCCCTATAAATCACCACATGATCTTTCCCCATGTTTTGGCCTCACTTACAAGGTACCAGGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATTATAGTGCTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTCTTAGGATGGTTGATAGAAAAGATCAGTGCACTTTGGTGATATGGGTAGCCAAATCAAATCTCTTAAGCTCTCCTCATGCACCTCTACATATACCAGAAACTGGGATTTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

230

Start:

5536427  

End:

5536656

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_31

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

352

Start:

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5894332

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_32

TGTAATATCTCGATTTCTGATATATAGTGGTGCATGATGAGAGTTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCATTTATCTTTTCTGTCAATCATCTTGAGAGAACTCCATAACTAAGTGTGCTTGGGCCGAAGTAATATTAGATGCGTGCCCTACTGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTAAGTGAGGCCAAAACACGGAAAAAATTATGTGGTGATTTGTAGGGATAGTAACAAGTGTTTAGAGCCTCTTAAAAACTTAATGCACCAGCCGTCGGACGAAGATAGGACCCACAGGCCTAGAGAGGGCATGGAGGCCCACATGACTAGAGAGGGTGTGGGG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

146

Start:

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End:

5894535

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_33

GGGAAAAGATCATGTGGCGATTTGTAAAGATAGTAACAGATCTTTCAAGCCTTTTAAAATAATGCTTCAGCCATCGGACGAGGATGGGGCCCACGGACCTAGAGAGGGCGTGAGGTGCTCACGGATGGTGGTGGTCGAGGTTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Start:

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Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_34

GAGAAAGATCATGTAGTGATTTGTAGGGACCGTAACAAATCTTTGAAGCATCTTAAAATAATGCACCGGCCATCAGACGAGGATGGGGTCCACGGACCTAGAAAGCGTGGAGGTCCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

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Start:

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Strand:

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>Chr2_LTR-Cassandra_35

TGTAACATCCCAGTTTTTAGTATATAGTGGTGCATGAGTAGAGTTTAAGATTTGGCTACCTACATCACCAAAGTGCACTTATCGTTTCCGTCAATCGTCTAGTTAAAAATGCAGAGTTAAGCGGGCTTGGCCTGGAATAATATTAGATGGGGGACCTACCAAGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGAATGAGGTCAAAACACGGAGAAAGATTATGTGGTGATTTGTAGGGATAGTAACAAGTCTTTCAAGCCTCAGGAAATAACGCACCGGCCATCAGACAAAGATATGACCCATAGTCCTAGAGACGAAGTGAGATTCTCACGGATAGTTGTGGTCGGGGTATTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

135

Start:

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5940774

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_36

ATCTGGTGATTTATAGGGACTCTAACAAGTTTTTAGAGCTTCTTGAGATAACAAACCAGCCGTCAGACGAGGATGGAGCCCACGGGCCTAGAGAGGGCATAGGTGATCATGGACGGTGGCGGTCAAGGGCTTTAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

319

Start:

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6069446

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_37

TATAACTTCCTAGTTTCTGGTATATCATGGTGCATGAGGAGAGCTTAAGAGATTTTATTTGGTTATCTATATCACCTAAGTGCATTTATTTTTTCTGTCACTAGTCCAGTTAGAACTCCAGGGTTGAACGTGTTTAGGCTGGAGTAGCAGTAGGATGGGTGACCTACATGGAACTGATTGTCGGTGCAGTGTGAATTAGGCCAAAACAAAGGAAAATATGATGTGGTGATTTGTAGGGATAATAACAAGTCTTTAAAGCCTCTCGAGATAACGAACCGGCCGTCGAACGAGAACGAGACAGATCATTGAACCCTAGAGA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

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Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_38

TGTGACATCCCGGTTTCTGGTATATAGTAGTGCATGAGAAGAGTTTAAGAGATTTGATTTGGCAACCTATATCACTAAATTGCACTTATCTTTTCCGTCACTCCTCTATTTAAAATTTCAGAGTTAAACGTGTTTGAGCTGGAGTAGCACTAGAATGGGTGACCTATCGGGAAATGATTTCCGGTACCGTGTGAGTGAAACCAAAACACAAAGAAAGATTATGTGGTAATTTATAGAAATAATAACAAGTTTTTGAAGCCTCTTAAAATTTTAATGCCCTGACCGTCGGACGAGGATGAAGTCCACAGACCTAAAAAAGGCGTGGAGGCTCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

207

Start:

8511327  

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8511533

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_39

GAGAACTCAAAAGTTAAGCGTGTTTGGGCTGGAGTAGTACTAGGATAGGTGGCCTATAAGAAAATAATTTCTGGTACGTGAGACCAAAACACGGAAAAATATAATGTGGTGATTTATAGGGAGATAAACATGTCTTTTGAGCCTCCCGGGAGGAGTGCACCAATCGTCAGACAAGGGTGGGACTCACGGGCTGAGAAAGGGCGTGGG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

107

Start:

8511560  

End:

8511666

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_40

TGGTTTCATAGCTGAAGACAGATGAGTGTGAAGAAAAATGGGCACACAACATCGGGGGTGACAGTCTTGGTGTGCAACAAGGATGTTGCGCTTTGTGAGTGGGGTGA