ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr3_LTR-Cassandra_61 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra10595012189501322+
Chr3_LTR-Cassandra_62 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra18095013249501503+
Chr3_LTR-Cassandra_63 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra28895145899514876+
Chr3_LTR-Cassandra_64 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra14495148849515027+
Chr3_LTR-Cassandra_65 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35595151389515492+
Chr3_LTR-Cassandra_66 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1471051921110519357-
Chr3_LTR-Cassandra_67 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1861051947210519657-
Chr3_LTR-Cassandra_68 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3331070320010703532+
Chr3_LTR-Cassandra_69 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2061070372110703926+
Chr3_LTR-Cassandra_70 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2931100802611008318-
Chr3_LTR-Cassandra_71 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3571100842611008782-
Chr3_LTR-Cassandra_72 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2261107767111077896+
Chr3_LTR-Cassandra_73 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1041107791711078020+
Chr3_LTR-Cassandra_74 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1771107802511078201+
Chr3_LTR-Cassandra_75 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1771169525411695430-
Chr3_LTR-Cassandra_76 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1081169543211695539-
Chr3_LTR-Cassandra_77 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2051169556011695764-
Chr3_LTR-Cassandra_78 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3471274586912746215+
Chr3_LTR-Cassandra_79 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra921316415513164246+
Chr3_LTR-Cassandra_80 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3281316459213164919+

< 4 5 6 7 8 > Total 14


Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

105

Start:

9501218  

End:

9501322

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_61

GTTTCAGAGCCGAAGCCAGATGAGTGTGAAGACAAATGGACTCACACCATCATGGGTGGCAGTGTTGGTGCGCAATAAGGATGTTTTGCTTTATGAGTGGGATGA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

180

Start:

9501324  

End:

9501503

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_62

TATAACATCTCAATTTATTGTATATGGTAGTGCATAAAAAAGAGCACTTAAGAGATTTTATTTAGCTATTTATGTCACTAAAGTGCTCCTATCTTTTCTATTACTTGTCCAAAGAGAATTCCAGAGTTAAGTGTGATTGGGTTGAAGTAGTAGTAGGATGGATTATCTATCGGAAAGTAA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

288

Start:

9514589  

End:

9514876

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_63

TATAAAATCTCAGTTTCTGTTATATAGTAGTATATGAGAAGAATTTTTAAAAAATTATTTGGCTACCTACATCACTAAAGTGTATTTATTTTGTTTGTCACTCATCTCAGAGAACTCTAAAATTAAGCATGTTTAAGTTGGAGTAGTATTAGGATATGTGACTTACTGAAAAGTGATTGTCAGTACCATGTGAGTAAAACTAAAACACGGGAAAAGATCATGTAGTAATTTGTAGGATGGTAACAAGTCTTTGAAGCCTTATAGAAAATTAACGGACCGATTGTCAGA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

144

Start:

9514884  

End:

9515027

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_64

AGAGATCATGTAGTAATTTGTAGGATGGTAACAAGTCTTTGAAGCCTTATAGAAAATTAACGGACCGACTGTCAGAGAAAAATAGACTCATAAGCCTGACAGAGGACATAGGTGCTTACTGCTAGGGACAGTCAATGCGTTATA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

9515138  

End:

9515492

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_65

ATATTCCAGTTTCTGGTATATAGTAGTGCATGAGGAGAGTTTAAAAGATTTGATTTGACTACCTATATCATCAAAATGCACTTATCTTTTCTGTTAATCATCCTGAAAAAACTCTAAAGTTAAGCGTGTTTAGGCTGGAATAGTATTAAGATAGATGATATATCAGATAGTGATTGTTAGTAGCATGTGAATAAGACTAAAATACAGAAAAAGATCATGTGGTGATTTATAAAAATAGTAACAAGTGTTTGAAGCTTCATAAAAAATTAATAAACCAACCATCAAATAAAGGTGGGATATATATGCCTGAGAGAAGACATGGATGCTCACTGGTAAAGACGATCGGATCGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

147

Start:

10519211  

End:

10519357

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_66

CTACTTCAGTTCCGACATGCTTAACTCTGGAGTTTTCACTTGACAAGTGACGAAAAAGAAAAGTGCATTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAAATATTTTAAACTATCTTCATGCACCACTATATACCAGAAATTAAGATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

186

Start:

10519472  

End:

10519657

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_67

TGTAACGTCTTGACCGCCACTGTCCATGAGCCCCCACGCCCTCTCTAGGCTTGTGGGCCCCACCCTTATCCGACTGTGTGTTATTTCGAGAAGCTCTAAAACGTTGTTAACAAATCACCACATGATATTTCTCCATGTTTTGGCCTTACTCACACGGTACCGACTATCATTTCTAAATAGGTTATC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

10703200  

End:

10703532

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_68

TGTAACATCACAGTTCCTGATATATATAGTGGTGCATGAGAAGAGGTTAAGAAATTTGATTTTGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCTGTCAACCATCCTAAGAGAACTCCAGAGTTAAGCATGCTTAGGCTGAAATAATATTAGGATGGTTGACCTATCGGGAAGTGATTGTTGGTGTCGTGTGAGTGAGGCAAAAACACTGGGAAATATCATGTAGTGATTTGTAGGGATAGTTACAAGTCTTTAGAGCCTTCCGAATTAATGCACCAGGCCGTCGGACGAGGGTGAGGCCCACAGGCCTAGAGAAGGCATGGAGGCTCAC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

206

Start:

10703721  

End:

10703926

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_69

TGTAACATCCCGGTTCCTTGTATATATAGTGGTGCATGGAGAGTTTAAGAGATTTGATTTGGCCTACCTATATTATCAAAGTGCACTTATCTTTTCTATCAACCATCGAGAGAGAATTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGAAGTAGTATTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

293

Start:

11008026  

End:

11008318

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_70

ACCCTCTCTAGGCCCATGGGCCTCCACACCCTCTCTAGGCCTGTAGGTCCCACCCTCATCCGACGGCTGGTGCGTTAATGCTGGAGGGCTCCAAAGACTTATCACCATCCCTACAAATCACCATATAGTCTTTCCCCCTCGTAGTGCTACTCCAGCCCAAACATGCTTAAATTTTGAAGTTCTAACTGGACATGTAACAAAAAAGATAAGTGCATTTTGGTTACATAGGTAGCCAATTCAAAAATTTAAACTCTCCTCATGCAGCACTGTATAACAGAAATCGGGATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

357

Start:

11008426  

End:

11008782

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_71

TGTAACGCCCCAACCGCCACCGTCCATGAGCCCTCACACCCTCTCTAGGCCCATGGACCCCGCACCCTCGTCCGACGGCCGGTGCATTAATCCGGGAGGGTCCAAAGACTTGTTACCATCCCTAAAAATCACCACATGATCTTTCTCCGTGTTTTGGCCTTACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCAGTAGGTCACCCGTCCTAATGCTACTTCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTAGAGTTCTAACTAGACAAGTGACATAAAAGATAAGTGCATTTTAGTGACATAGGTAGCCAAATCAAATCTCTTAAACTCTCTTTATGCACTACTATATACTAGAAACTGGAATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

226

Start:

11077671  

End:

11077896

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_72

GGTCGGAAGAACTCCAAAGTTAAGCGTGTTTGGGCTGGAGTAGTACTAGGATTTGTGGCCTATCAAAAAATCGTTTCTGGTACCATGTGACTGAGACCAAAAGACGGAAAAAGATCATGTGATGATTTATAGGGAGAGTAACATGTCTTCTGAACCTCCTGGGAGGAGCGCACCAGTCGTCAGACAAGGGTGGGGCTCACGGGCTGAGAGAGGGTGTGGGTGCTCA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

104

Start:

11077917  

End:

11078020

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_73

TGGTTTCAGAGACAAAGCTAGATGAGTGTGAAGACAAGTAGGATCACACCATCGGGGGTGGCAGTCTTGGTGCGCAACAAGGATGTTGTGCTTTGTGAGTGTGG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

177

Start:

11078025  

End:

11078201

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_74

TGTAACATCCCAATTTGTGGTATATGGCACTGCATGAGGAGCACTTAAGATATTTTATTTAGCTATTTATGTCACTAAAGAGCACTTATATTTTCCGTCACTTGTCCAAAGAGAATTTCAGAGTTAAGCGTGATTGGGTTGGAGTCATAATAGGATGGATTACCTATTGGAAAGTAA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

177

Start:

11695254  

End:

11695430

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_75

TTACTTTCCGATAGGTATTCCATCCTACTACTACTCCAACCCAAGCACGCTTAATGCTATAATTCTCTTTAGACGAATGCTGAAAAATATAAGTGCACTTTAGTGATATAAATAGCTAGATAAAATCTCTTAAGTGCTTCTCATGCACCACCATATACCAGAAATTAGGATATTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

108

Start:

11695432  

End:

11695539

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_76

TCACCCCCACTCACAAAGCGCAACATCCTTGTTGCGCACCAAGACTGCCACCCCCGATGGTGTGAGCCCACTTTTCTTCACACTCATCTGGCTTCAGCTATGAAACCA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

205

Start:

11695560  

End:

11695764

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_77

TGAGCACCCACGCCCTCTCTTGGCCCGTGAGTCCCACCCTTGTTCGATGACTGGTGCGCTCCTCCCGGGAGGCTCAGAAGACATGTTACTCTCCCTATAAATACCACATTATATTTTCCGTGTTTTGGTCTCACTCACACTGTACCAGAAATGATTTTCTTATAGGCCACCCATCCTAGTACTACCGCAGCCCAAACATAATTAA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

347

Start:

12745869  

End:

12746215

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_78

TGTAACACCTGTTCTGATATATGGTGGTCCATGTTAAGGCTTAAAAGAGTTATGTGGCTGCATATGTCACTAAAGTACACTTATATTTTTCGTCACTTCCATAAAGAACTTTAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAATTTAAGGATGGTTACACACTGAAAATTGATTGTTGGTACTGTGTGAGTGAAGAAAAAAATATGGAAAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGAATAATAACAAGCCTTTCGAGTTTCTTGGGATAACAAACCGGCCATCAGACAAGAGTGGATCCACGGACCGAGAAAGCATGTGGGAGCCCATGAATGGTGGCGGTCGAAGCGTTATA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

92

Start:

13164155  

End:

13164246

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_79

TGTAACATCCCGATTTCAATCAATATAATAGTGCATGCGTAACATTTAAAATATTAGGTTACATATATCATCAAAGTGTATTTATCATTTTC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

328

Start:

13164592  

End:

13164919

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_80

TTAAAATATTTGAATTGGTTACATATATCATTAAAGTGTATTTATCATTTTCGTCACTTATCTAGAAAGAACTCAAAAGTTTAGTATGTTTGATCTGGAGTAATATTAGAATAGGTGACATATCGGAAAGTTGTTTGTGGTACTCACCATCATTTGTGATACCGTGTGAGTGAGTTCAAAACACAAAGAAATATCATATGGTGATTTGTAGAGATATTAACAAGCCTTTCGAATTTCTAAAGATAATGCACAAGCCGTCGAATAAAAATGGGGTTCATATCTCGGAAGATGACGTGGCTTCTCACAGAAGATGGCGGTCAGAGCGTTA