Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr3_LTR-Cassandra_81Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
355Start:
14215052End:
14215406Strand:
->Chr3_LTR-Cassandra_81
TGTAACGCCCCGACCGTCCCTACTAGTGAGTACCCACTTCCTCTCTTAGGCCCGTGGGCCCCACCCATGTCAGACGATTGGTGCATTAATTCTGAAGGCTTTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTCTCCATGTTTTGGTCTCACTCACACGGTATCGGGAATCATTTTCGATAGGTCACCCTTTCTAATACTACTCCAGCCTAAGCACGTTTAACTCTCAAGTTCTAACTAGAGGAGTAACGGAAAAAATAAGTGCACTTTGTGACATAGGTAGTCAAATCAAATCTCGTAACTCTCTCCACATACACTACCATATACCAAAAATCGGGATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr3_LTR-Cassandra_82Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
356Start:
14215514End:
14215869Strand:
->Chr3_LTR-Cassandra_82
TGTAACGCCCCGACCATCCCTACCAGTGAGCACCCACGTCCTCTCTTGGGCCCATGGGCCCCACCTGTTTGATGGTCGGTGCATCAATTTTTAAAAGACTCTAAAAACTTGTTAGTATCCCTACAAATCACCATATGATCTTTCCTCTTGTTTTGCCCTCACTCACACGGTACCAGAACTCATTTCCCGATAGGAAACTCATTATAATACTACTTCAGCCCAAGCACGCTTACCTCTGGAGTTCTAACTAGAGAAGTGACGGAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAAATCTTTTAATTCTCTCCACATACACTACCATATACCAGAAACCGAGATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr3_LTR-Cassandra_83Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
331Start:
15948031End:
15948361Strand:
+>Chr3_LTR-Cassandra_83
TGTAACATCCCAGTTTCTAGTATATAGTGGTGCATGAGGAGAGCTTAAGATATTTGATTTGGTTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCTATCATTCCTCTAGTTAGAACTTCAGAATTAAGCGTGCTTTGGCTAGAGTAGCACCAGAATGGGTGACCTATCGGAAAGTGATTCCTAGTACTGTGTGAGTGAGGTCAAAACACGGAGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGATAATAACAAGTCTTTGAAGCCTCTTAAAATTAATGCACCGGCCGTCGGACGATGGTGAGACCCACATGCCTAGAAAGGGCGTGGAGGCTCAC
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr3_LTR-Cassandra_84Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
216Start:
15948615End:
15948830Strand:
+>Chr3_LTR-Cassandra_84
TCCAGAGTTACGCTTGCTTGGGCTGAAGTAGCATTAGAATACGTGACCTATCGGGAAGTGATTCCCGTTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAAATCATGTGGTGATTTGTAGGGATAGTAACAAGTCTTTTGAGCCTCTTAAAAATTAATGCATCGGCCGTCGGACGAGGGTTAGACCCACGGGCCTAGAGAAGACGTGAAGGCTCAC
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr3_LTR-Cassandra_85Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
349Start:
16823752End:
16824100Strand:
->Chr3_LTR-Cassandra_85
TGTAACGCCCATACCGTCCCTACCAGTGAGCACCCACATCCTCTCTCGGGCATGGGCCCACCTTTATCCGACGGTCGGTCCGTTAATTTTGAAGGCTCTTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCTGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACTGAGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCACTCTACTCCAGCCCAAGCACACTTAATTCTGAAATTCTAAGTAGAGGAGTGACGGAAATGATAAGTTCACTTTGGTGATATAGGTAACCATATAAAATCTGTTAAACCTCTCCACATACACTACCACATACCAGAAACCGGGATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_86Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
333Start:
714304End:
714636Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_86
GTGAGTCTCCATGCTCTCTTTAGGCCCGCGGGCTTCACCCTCGTTCGACGACCGGTGCATTAATTCTGAAGGCTTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCATATGATTTTTTTCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTCACACCCATCTTAGTACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTCTCAGAATAGTTGACAGAAAAGATAAATGCACTTTGGTGATATAGGTAGTCAAATCAAATCTCTTAAGCTTTCTTCATGCACCATTATATATACTAAAAACCAGGATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_87Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
331Start:
714831End:
715161Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_87
GTGAGCCTCCACGCCCTCTCTAGGCCAATGTGCCTCATCCTCGTCCGACGGCTGGTGTATAATTCTGAAGGTGCTAAAGACTTGTTATTATACCTACAAATCACTACATGATCTTTTCTCGTGTTTTGACCTCACTCACACGGTACCGATAATCGCTTCTCAGTATATCACCTATCTTAGTATTACTTTATCCCAAACACGCTTAACTTTGGAATTCTCTTAGAATAGTTGACAAAAAAGATAAGTGCACTTTAGTTAAATAAGTAACCAAATCAAATCTCTTAAACTCTCCTCATGCACTATTATATATACCAGAAACCAGAATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_88Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
328Start:
2873572End:
2873899Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_88
AATATCCCGCTTTCTGGTATATGGTAGTGTATGTGGAGAGGGTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAATGCACTTATCTTTTCCGTCACTCCTCTCTAGTTAGAACTCCAGAGTTAAGCATGCTTGGGCTGGAGTAGTACTAGAATGGATGACCTATCGAGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGTGAGGCCAAAAAACAGGGAAATATCATGTGGTGATTTCTAAGGATAGTAACAAGTCTTTACAGCCTTCAGAATTAATGCACCAGCCATCGGACGAGGGTGAGGCCCATGGGCCTAGAGAGAGCGTGGAGGCCCAC
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_89Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
103Start:
2873983End:
2874085Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_89
TGGTATCAGAGCCCTAGGTTATGTCAAACCTGTTCTCACCCGGGAGGTAGTCTTGAGGGCGGTGGGTTCAGAACGAGGACGTTGCGATCTGTTAGTGGGTGTG
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_90Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
360Start:
2874088End:
2874447Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_90
TGTAACATCCTGATTTCTGGTATATGATAGTGTATGTGGAGAGGGTTAAGAGATTTGATTTGGCAACTTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCACTCCTCTAGTTAGAACTCCAGAATTAAGTGTGCTTGGGCTGGAGTAGTACTATAATGGGTTACCTATCGGTAAGCGATTCCCAGTACCGTGTGAGTGAGGCTAAAACACGGGGAAATATCATGTGGTGATTTGTAGAGATAATAACAAGTCTTTAGAGCCTCGTAAAAAAATAACGTACAAAACGTCGGACAGGGGTAGGGCCCACGGGCCCAAGAGATGACTTGGCTGCTCATTGGTAGGGATGTTCCGGGCGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_91Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
345Start:
3445946End:
3446290Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_91
TGTAACATCGCGATTTCTGCTATATATAGTGGTGCATAAGGAGAGCTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCACTCCTCTAGTTAAAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGAATGAGTGACTTATCGGGAAGTGATTTCCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAATACGGGAAAAGATCATGTGGTGATTTATAAGGATAGTAACAAGTCTTTGGAGCCTCACGACCGTCAGACAGGGGTGGGGCCCACGTGCCCGAAAGAGGACGTAGGTGCTCACTGGTAGGGACGGTCGGGGAGTAACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_92Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
340Start:
3607201End:
3607540Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_92
CTACCAGTGAGCACCCACGTCCTCTCTCGGGACCATGGGCCCCACCCCTGTCCGACGGCCGGTCCATTATTTTTTAGAGGGTCTAAAGACTTGTTATTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGAGAATCACTTTCCGATAGGTCACCCATTCTAGTACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTATGGAGTTCTCTCAGGATGGTTGACAGAAAAGATAAGTGCACTTTGATGATATAGGTATCCAAATCAAATCTCTTAAACTTTCCTCATGCACCACTATATATACCAGAAACCAGGATATTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_93Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
315Start:
4205881End:
4206195Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_93
TGTAACATCCTGGTTTCTAGTATAGAGTGGTGCATGAAAAGAGTTTAAAAATTTTGATTTGGTTACCTATATCACCAAAATGCTCTTATATTTTCCGTCACTCGTTTAATTAGAACTCTAGAATTAAGCATGCCTAAACTGGATTAATATTAGTGTGATTGAAGCCAAAACAAATAAAAAGATCATGTGGTGATTTTTAGGAATTAATAACAAGTCTTTCGAACCTCTTAAAATAATAGATCGGCTGTCGGAAGAGGGTTGGGCACCCAGGCCTAGAGAAGGCGTGGAGGCCCACAGGCGTAGAGAGGGTGTGGG
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_94Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
282Start:
4206248End:
4206529Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_94
GTCACAGACTGTTCTTATCTTTTCCGTCACTCGTCTAGTTAGAACTCCATAGTTAAGTGTGCTTAGGCTGGAGTAATATTAGATGGGTGACCTACTGGGAAGTGATTATCGGTATTGTAAGTGAGGCCAAAACATGGGGAAATATCAGGTGGTGATTTGTAGGAATAGTAACAAGTTTTTCGAGCCTCTTAAAATAATGCAACGGGCATCGGATGAGGGTGTGGGATCCACGGGTCTGGAAAGGGCATGGGGGCAATGGACGGAAGCGGTCGGGACGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_95Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
337Start:
6858994End:
6859330Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_95
TGTAACGTCCTGATTTCTGGTATATGGTAGTGTATGTGGAGAGGGTTAAGAGATTTGATTTGGCTATCTATGTAACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCACTCCTCTAGCTAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGTGTGGGCTGGAGTAGCACTAGAATGGGTGATCTATCAGAAAGTGATTCCTGATACCGTGTGAGTGAGGTCAAACACGAAAAAGATTATGTGGTGATTTATAAGGATAGTAACAAGTCTTTGGAGCCTTCAGAATTAACGGACCATGGGCCGACGGACCCAAAAGAAGATGTGGGTGCTCACTGGTAGGGATGGTCGGGGCGTTA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_96Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
154Start:
6954811End:
6954964Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_96
TGTGACATCCTGATTTCTGGTATAGTGGCGCATGAGGAGATTTAAGAGATTAGATTTGGCTACTTATGTCACCAAGTGCATTTATCTTTTTATGTCACTTGTCCATTTAGAACTCCAGAGTTAAGCATGATTGGGCTGAAGTAGCATTAGGATG
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_97Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
201Start:
6958191End:
6958391Strand:
+>Chr4_LTR-Cassandra_97
GGATGGGTGACATACAAGGAAGTGATTGTCAGTATCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGAGAAATATCATGTGGTGATTTGTAGGGGATAGAAACAAGTCTTTAGAGCCTCTCGAGATAATCAACCGGCTATCGGACGAGGATGGTACCCACAGATTTAAATAGGGTATGGGTGATCACAGACNNTGGCGGTATGGACATT
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_98Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
358Start:
8643431End:
8643788Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_98
TGTAATGCTCCGACCGTCTCTACCATTAAGCACCCACGTCCTCTCTTCGGCCCGTGGGCCCTACTACTCTCTGACGGTTGGTGCATTAATTTTCTTCGAGGTTCTGAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTCTCTGTGTTTTGGCCTCAATCATATGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTAACCCATCCTAGTACTATTCCAGCACAAGCCACTTAACTCTGGAGTTCTCTCAGGATGGTTGATAGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGATATAGATAGCCAAATCAAATCTTTTAAACTCTCCTCATGCACCACTATATAACAGAAACCAGGATATTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_99Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
358Start:
8643896End:
8644253Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_99
TGTAATGCCCCGACCGTCCCTACCAGTGAGCACCCACGTCCTCTCTCGGGCCCGTGGGCCCCACCACTGTCTGATGGTCAGTGCATTAATTTTTTCGAGGCTCTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCCGTATTTTGGCCTCACTCACACAATACCGACAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTACTACTCTAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTCTCGGGATGGTTGACAGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGATATAAGTAGCCAAATCAAATCTTTTAAACTCTCCTCATGCACCACTATATACCAGAAACCGGGATGTTACA
Cardamine hirsuta (v1.0)
ID:
Chr4_LTR-Cassandra_100Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
359Start:
9841271End:
9841629Strand:
->Chr4_LTR-Cassandra_100
TGTAATGTCCCATCCGTCCCTACCAGTGAGCACCTACGTCCTCACTCGGGTCTGTGGGCCCCACCTCTGTCCGACAGTCGGTCCGTCATTTTTTTAAGAGGCTCTAAAGACTTGTTACTATCCCTACAAATCACCACATGATCTTTTTCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGGGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATTCTAGTGCTACTCCAGCCAAAGCATGCTTAACTCTAGAGTTCTAACTAGGAGTGACCAAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAAATCTCTTAAACTCTCCTCATGCACCACTATATATACCAGAAACTAGAATGTTACA