Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_41Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
122Start:
20184973End:
20185094Strand:
->R1_LTR-Cassandra_41
ACCCATTCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACAGTTAACTGTGGATTTTTTTCAAGATGTACTCCGGAAAAGGTAAATCAACTTTGATGACATAGGTAGCCAAATCAATCCTCTTAAGCCTTT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_42Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
350Start:
20187087End:
20187436Strand:
->R1_LTR-Cassandra_42
TGTAACACCCCAACCGCCCACAGCTAATAGGCCACCCACACCCGCTCTCTCGGCTCTTGGGCTCCATCCCTTTCAGACGGCCGGTTCATTAATTTTCCAAAGGCTCAAGAGTCATGTTTACTGATACTACAATCACCACCCTACATTTCCCCGTGCTTTGGCCTCACTCGCACGCTATCACGAATCACTTCCTGATTGGTCACTCATCCTTCCACTACTCTAGCTCAAGCACGGTTCACTCTAGATTTCTTTCAAGATGTGCTTCGAAAAAGGTAAGTCAACTTTTATGTCATAGGTAGCCAAATCAATCCTCTTAAGCCTTTCTATATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_43Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
336Start:
20710569End:
20710904Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_43
GTTGTGATATACGGAAAGGTTTAAGAGAATTGATTTAGCTACCTATGTCACCAAAGTCGACTTACCTTTTCCGTCACACATCCGTTTAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGACTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTGAGTGAGGCCAAAGCACAGTGGAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACGATGATTTCGAGCCTTTGGAAAATTAACGACCGGCCGTCAGATGGGATGGGGCCCACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCATGGACGGGTCGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_44Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
349Start:
20711010End:
20711358Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_44
TGTAACATCCCGAGTTGTGATATACGGAAAAGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATGTTACCAAAGTCGACTTACCTTTTCCGTCACACATCCGTTTAGAACTGCAGAGTTAAGCGTGCTTAGGATGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTGAGTGAGGCCAAAGCACGGAGAAAGGTCGAGTGTTGATTGTAGGGTCAGTAAACGATGATTTCGAGCCTTTGGAAAATTAACGACCGGCCGTCAGATAGGATGGGGCCCACTAGCCGAGAGATCGGGCGTGGCTGGCCCATTAGCCGTGGACGGGTCGGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_45Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
309Start:
20795946End:
20796254Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_45
AAGAGAATTTATTTAGCTACATATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGGCACACATCTTTTTAAAACTTCAGAGTTAAGCATGCTTGAGCTGGAGTAGTGGAATGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATAGCGTGAAAGTGAGGTCAAAGCACGGGGAAATGTCATATAGTGACTCCAGGTCAGTAAATAATGATTTTGTACCTTTTGAAAAATTTATGCACCGACCGTTGGAACAGGATAGGGCCTACGGGCCGAGAAAGCGGGTGTGGATGGCGCATTAGCCGGTCGGGGTATTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_46Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
307Start:
20796375End:
20796681Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_46
ATATGGAAAGGCTTAAAAGAATTGATTTGACTACCTACATCACCAAAGTGCGCTTACCTTTTTCGACAATAATCCGTTTAGAACTCCAGTGTTAAGCGTGCTTGAGCTGAAGTGGTGGAATGATGGGTGACCTATCAGGAATTGATTCACGATAGCGTGTAAGTGAGACCAAAACACGGGAAAATATCATATGGTGACTGCAGGGTCGGTAAACAATGATTTCAAACCTTCTGAAAAATTTACACACCGACCGTTGGAACGAACAGGCGTGGATGGCCCATTAGCCGTGGACGGTCGGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_47Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
267Start:
21442150End:
21442416Strand:
->R1_LTR-Cassandra_47
CCCATTCCATCCGACGGTCGGTCCGTTAATTTTTCCAAAGACTCAAAATCATTGTTTACTGACGCTGCAATCACCACATGATCTTTCCTGTGCTTTGGCTTCATTCATACGATGTCGCGAATCACTTCCCGATAGATCATCCATTCTTGCATTACTTGAGTCAAAAGCACACGCTAACTCTAGAATTCCAAATAGATGTGTTCCCGAAAAGGTAAGTTCACTTTAGTGCATATGTAGCCAAATCAATTCTCTTAATCCTTTCCATAT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_48Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
286Start:
21442542End:
21442827Strand:
->R1_LTR-Cassandra_48
TATATCGTCCCGACCGTCCACGACTATTGGATCATCCACACCCGTTATCTCGGTCTGTGAGCTCCATCCTATCCGATGGTCGGTTCGTTAATTTTTCAAAAGACTTGAAATCATTGTTTAATGATCATGCAATCACCACATGACATTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTCGCCCTTCCATTACTTCAAATCAAGCACACTTAACTCTAGAATTTTAAATAGATGTGTTTCCAAAAAGATAAATGCACTTTGGTGATGTAGATAGCCAAATCGATTTTCTTAAACTTTT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_49Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
280Start:
21485953End:
21486232Strand:
->R1_LTR-Cassandra_49
ATGGGTCCAATCATGTCTAACGGGTGGTGCGTTAATTTTTCCGAAGGCTCAAATCATTATTTCCTGACCCTACAATCACCACATGACCTTCTCTCGTGCTTTAGTCTCACTCTCACGATATCGCGAATCACTTCACGACATGTTATCCATCATTCTAATATTCCAGTACAAGTACATTTAACTCTTGAATTTTAAATGAATGGTTGACCGATAAGATAAGTTAATTTTGGTGATATAGATTGTCAAATCAATGCTCTCAAGTTTTTCCATACATCACAAT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_50Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
209Start:
21545516End:
21545724Strand:
->R1_LTR-Cassandra_50
TGTTTTGGCTACAGTCACAGGATAATGCTAATCATTTCACGATATATTACCCATCCTTACAGTACTTTAGCTTAAATACTCTTAACTCAGATGTTCTTTTTGGATGGTTGACAAAAAAAATATATGCACTTTGTTTTCATAGGAAACAAAATAAATTTTTAAAAATCTTTTAACTTATTCTGCGATATACCACAAACATGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_51Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
365Start:
21550052End:
21550416Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_51
TGTAAGATTTTGGTTTGTATTACATGGTAATATATGTTGAAAGGCTTACAAAAACTGATTTGGCTATTTATGTCACCAAATATTATACATATTTTTTTAGTCACACATCCATAAATAATATTAAGGTTAAACATGATTAAAGTGAAAGTAATGGAAAATTTAATGACCGAAGAAAAAATGATTTGTAATATTATGTGAGTGAGGTTAAACTATAGAAAAATATTATGTAATGATTTCAGTGTTAACAAATTAAGTATTTTGGCATCGGAAAATTAACATAATGTGATAGAGTCCATGTGATAGAGTCCATGGACCGAGTGAACAGATGCAGAGATGCACTGACAGAAGCTGTCGGAGGCATTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_52Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
350Start:
21765819End:
21766168Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_52
TGTAACATCCCGAGTTGTGATGTGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATATCACCAAATTTGACTTACCTTTTCCGAAATACATTCTAAAAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGACCTGGAGTAGTGGAAGGATGAGTGATCCATCAGGAAGTGATTCGCGATAACATGCGAGTAAGGCCAAAGCACGGAGAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGAGCCTTTGAAAAAATTAACGGACCGATCGCTGATGGGATGGAACCCACAGACCGAGAAAACGGGTGTGGGCGGTCCATTAGCCATGGACGGGTCGGGACACTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_53Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
346Start:
21895401End:
21895746Strand:
->R1_LTR-Cassandra_53
TGTAACGCCCCGACCGCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCACTCGGCCCGTGGGTCCCATCCCATCTGACGGTCGCTCATTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGACCTCACTTACACGGTATCACGAATCACTTTCCGATAGGTCACCCATCATTTCACTACTCCAGCCCAAGCACACTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAAGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_54Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
21895852End:
21896199Strand:
->R1_LTR-Cassandra_54
TGTAACACCCCAACCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCAGACGGTCGGTCATTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCACGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_55Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
21981183End:
21981530Strand:
->R1_LTR-Cassandra_55
TGTAACGCTCCGACCGCCCACGACTAATGGGCCACCCACGCCCGCTTTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTTCCAAGGCCCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTTCGTGCTTTGGCCTCACTCACACGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTTTCAGGATGTGTTCCAGGAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAAGTAGTCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_56Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
347Start:
21981636End:
21981982Strand:
->R1_LTR-Cassandra_56
TGTAACGCCCCGACCGCCCACGGTTAATAGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTCTAAGGCTCAGAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGGCTTCACTCACACGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCCGGAGTTCTTTCAGGATGTGTTCCGGGAAAGGTAAGTCAACTTTGATGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGTCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_57Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
334Start:
22019037End:
22019370Strand:
->R1_LTR-Cassandra_57
TGTAACGCCCCGATTCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCTGACCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATTACGAATCACTTTCCGATAGATCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTCCGTATATCACAAC
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_58Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
302Start:
22019651End:
22019952Strand:
->R1_LTR-Cassandra_58
CCCGTGGGCCCCATCTCATCTGACGGTCGGTCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCTGACCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCGCGAATCACTTTCCGATAGGTTGCCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTAAGCCTTTCCGTATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_59Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
336Start:
22034321End:
22034656Strand:
->R1_LTR-Cassandra_59
TAGCGTCTCTACCGTCCATGGCTAATGGACCATCCACGTTCGTCCCCTCAGTCCGTGAGTTCTATTATATCCGACAAACACGGACTGTGTATTAATTTTTCCGAAGGCTCGAAATTATTTTTTACTAACCCGTAATCAACACATATGGCATTCTCACGTGCTTTAACCTCACTCCATAATACCGTGAATCATTTTCTAACAGGTTACCCATACTCCAGTATTCCATGTCAAATATGCTTCTCTGGAATTCTAAATAAATGGTTGATTAAAAATGTAAATCGACTTTGATGACATAGGTAGTAAAATCAATTCTCTTAAGCTTTTCTACGTGTACCA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_60Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
284Start:
22034808End:
22035091Strand:
->R1_LTR-Cassandra_60
CCCACGCCTTCTCACTCGGCCCATGACCCCATCTCATCCGACAGACGGTGCGTTAATTTTTTTGAATACTCGAAATTATTGTTTATTGAGCTGAAATCACCATATGATCTTATTCCGTTCTTTGACCTCACTCGAACAATATCGCGAATCACTTCCCGACATAATATTCATTCTTCCATTATTCCAGTCTAAGCACACTTTAACTCTGGAGGTCTAAATAGATAGTTGACCTTTGATAACATATGTAGCCAAATCAATTATTTTAAATCTTTCTATATATACTA