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R1_LTR-Cassandra_42 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3502018708720187436-
R1_LTR-Cassandra_43 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3362071056920710904+
R1_LTR-Cassandra_44 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3492071101020711358+
R1_LTR-Cassandra_45 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3092079594620796254+
R1_LTR-Cassandra_46 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3072079637520796681+
R1_LTR-Cassandra_47 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2672144215021442416-
R1_LTR-Cassandra_48 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2862144254221442827-
R1_LTR-Cassandra_49 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2802148595321486232-
R1_LTR-Cassandra_50 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2092154551621545724-
R1_LTR-Cassandra_51 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3652155005221550416+
R1_LTR-Cassandra_52 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3502176581921766168+
R1_LTR-Cassandra_53 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3462189540121895746-
R1_LTR-Cassandra_54 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3482189585221896199-
R1_LTR-Cassandra_55 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3482198118321981530-
R1_LTR-Cassandra_56 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3472198163621981982-
R1_LTR-Cassandra_57 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3342201903722019370-
R1_LTR-Cassandra_58 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3022201965122019952-
R1_LTR-Cassandra_59 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3362203432122034656-
R1_LTR-Cassandra_60 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2842203480822035091-

< 3 4 5 6 7 > Total 57


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

122

Start:

20184973  

End:

20185094

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_41

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

350

Start:

20187087  

End:

20187436

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_42

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

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End:

20710904

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_43

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

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20711358

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_44

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

309

Start:

20795946  

End:

20796254

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_45

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

307

Start:

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20796681

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_46

ATATGGAAAGGCTTAAAAGAATTGATTTGACTACCTACATCACCAAAGTGCGCTTACCTTTTTCGACAATAATCCGTTTAGAACTCCAGTGTTAAGCGTGCTTGAGCTGAAGTGGTGGAATGATGGGTGACCTATCAGGAATTGATTCACGATAGCGTGTAAGTGAGACCAAAACACGGGAAAATATCATATGGTGACTGCAGGGTCGGTAAACAATGATTTCAAACCTTCTGAAAAATTTACACACCGACCGTTGGAACGAACAGGCGTGGATGGCCCATTAGCCGTGGACGGTCGGGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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267

Start:

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End:

21442416

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_47

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

286

Start:

21442542  

End:

21442827

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_48

TATATCGTCCCGACCGTCCACGACTATTGGATCATCCACACCCGTTATCTCGGTCTGTGAGCTCCATCCTATCCGATGGTCGGTTCGTTAATTTTTCAAAAGACTTGAAATCATTGTTTAATGATCATGCAATCACCACATGACATTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTCGCCCTTCCATTACTTCAAATCAAGCACACTTAACTCTAGAATTTTAAATAGATGTGTTTCCAAAAAGATAAATGCACTTTGGTGATGTAGATAGCCAAATCGATTTTCTTAAACTTTT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

280

Start:

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End:

21486232

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_49

ATGGGTCCAATCATGTCTAACGGGTGGTGCGTTAATTTTTCCGAAGGCTCAAATCATTATTTCCTGACCCTACAATCACCACATGACCTTCTCTCGTGCTTTAGTCTCACTCTCACGATATCGCGAATCACTTCACGACATGTTATCCATCATTCTAATATTCCAGTACAAGTACATTTAACTCTTGAATTTTAAATGAATGGTTGACCGATAAGATAAGTTAATTTTGGTGATATAGATTGTCAAATCAATGCTCTCAAGTTTTTCCATACATCACAAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

209

Start:

21545516  

End:

21545724

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_50

TGTTTTGGCTACAGTCACAGGATAATGCTAATCATTTCACGATATATTACCCATCCTTACAGTACTTTAGCTTAAATACTCTTAACTCAGATGTTCTTTTTGGATGGTTGACAAAAAAAATATATGCACTTTGTTTTCATAGGAAACAAAATAAATTTTTAAAAATCTTTTAACTTATTCTGCGATATACCACAAACATGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

365

Start:

21550052  

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21550416

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_51

TGTAAGATTTTGGTTTGTATTACATGGTAATATATGTTGAAAGGCTTACAAAAACTGATTTGGCTATTTATGTCACCAAATATTATACATATTTTTTTAGTCACACATCCATAAATAATATTAAGGTTAAACATGATTAAAGTGAAAGTAATGGAAAATTTAATGACCGAAGAAAAAATGATTTGTAATATTATGTGAGTGAGGTTAAACTATAGAAAAATATTATGTAATGATTTCAGTGTTAACAAATTAAGTATTTTGGCATCGGAAAATTAACATAATGTGATAGAGTCCATGTGATAGAGTCCATGGACCGAGTGAACAGATGCAGAGATGCACTGACAGAAGCTGTCGGAGGCATTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Cassandra

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350

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21766168

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_52

TGTAACATCCCGAGTTGTGATGTGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATATCACCAAATTTGACTTACCTTTTCCGAAATACATTCTAAAAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGACCTGGAGTAGTGGAAGGATGAGTGATCCATCAGGAAGTGATTCGCGATAACATGCGAGTAAGGCCAAAGCACGGAGAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGAGCCTTTGAAAAAATTAACGGACCGATCGCTGATGGGATGGAACCCACAGACCGAGAAAACGGGTGTGGGCGGTCCATTAGCCATGGACGGGTCGGGACACTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

346

Start:

21895401  

End:

21895746

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_53

TGTAACGCCCCGACCGCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCACTCGGCCCGTGGGTCCCATCCCATCTGACGGTCGCTCATTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGACCTCACTTACACGGTATCACGAATCACTTTCCGATAGGTCACCCATCATTTCACTACTCCAGCCCAAGCACACTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAAGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

21895852  

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21896199

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_54

TGTAACACCCCAACCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCAGACGGTCGGTCATTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCACGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

21981183  

End:

21981530

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_55

TGTAACGCTCCGACCGCCCACGACTAATGGGCCACCCACGCCCGCTTTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTTCCAAGGCCCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTTCGTGCTTTGGCCTCACTCACACGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTTTCAGGATGTGTTCCAGGAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAAGTAGTCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

347

Start:

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End:

21981982

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_56

TGTAACGCCCCGACCGCCCACGGTTAATAGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTCTAAGGCTCAGAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTCTCCGTGCTTTGGCTTCACTCACACGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCCGGAGTTCTTTCAGGATGTGTTCCGGGAAAGGTAAGTCAACTTTGATGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGTCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

22019037  

End:

22019370

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_57

TGTAACGCCCCGATTCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCTGACCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATTACGAATCACTTTCCGATAGATCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTCCGTATATCACAAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

302

Start:

22019651  

End:

22019952

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_58

CCCGTGGGCCCCATCTCATCTGACGGTCGGTCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCTGACCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCGCGAATCACTTTCCGATAGGTTGCCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTAAGCCTTTCCGTATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

22034321  

End:

22034656

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_59

TAGCGTCTCTACCGTCCATGGCTAATGGACCATCCACGTTCGTCCCCTCAGTCCGTGAGTTCTATTATATCCGACAAACACGGACTGTGTATTAATTTTTCCGAAGGCTCGAAATTATTTTTTACTAACCCGTAATCAACACATATGGCATTCTCACGTGCTTTAACCTCACTCCATAATACCGTGAATCATTTTCTAACAGGTTACCCATACTCCAGTATTCCATGTCAAATATGCTTCTCTGGAATTCTAAATAAATGGTTGATTAAAAATGTAAATCGACTTTGATGACATAGGTAGTAAAATCAATTCTCTTAAGCTTTTCTACGTGTACCA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

284

Start:

22034808  

End:

22035091

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_60

CCCACGCCTTCTCACTCGGCCCATGACCCCATCTCATCCGACAGACGGTGCGTTAATTTTTTTGAATACTCGAAATTATTGTTTATTGAGCTGAAATCACCATATGATCTTATTCCGTTCTTTGACCTCACTCGAACAATATCGCGAATCACTTCCCGACATAATATTCATTCTTCCATTATTCCAGTCTAAGCACACTTTAACTCTGGAGGTCTAAATAGATAGTTGACCTTTGATAACATATGTAGCCAAATCAATTATTTTAAATCTTTCTATATATACTA