ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
RUS09082_LTR-Cassandra_1121 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra316277592+
RUS09253_LTR-Cassandra_1122 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34914321780-
RUS09365_LTR-Cassandra_1123 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra19710571253-
RUS09365_LTR-Cassandra_1124 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32813801707-
RUS09690_LTR-Cassandra_1125 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra23699334-
RUS09690_LTR-Cassandra_1126 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra359468826-
RUS09709_LTR-Cassandra_1127 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra332288619-
RUS09709_LTR-Cassandra_1128 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2418331073-
RUS09722_LTR-Cassandra_1129 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra297153449-
RUS09722_LTR-Cassandra_1130 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra329583911-
RUS09984_LTR-Cassandra_1131 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3337201052+
RUS09984_LTR-Cassandra_1132 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra11310531165+
RUS09984_LTR-Cassandra_1133 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra23111661396+
RUS09997_LTR-Cassandra_1134 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2086213+
RUS10263_LTR-Cassandra_1135 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2171217+
RUS10311_LTR-Cassandra_1136 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra325304628-
RUS10516_LTR-Cassandra_1137 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra17118612031-
RUS10610_LTR-Cassandra_1138 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra28582366+
RUS10978_LTR-Cassandra_1139 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3366691004+
RUS10998_LTR-Cassandra_1140 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra233536768-

< 53 54 55 56 57 > Total 57


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09082_LTR-Cassandra_1121

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

316

Start:

277  

End:

592

Strand:

+

>RUS09082_LTR-Cassandra_1121

ATACGAAAAGGCTTAAAATAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTTGTTTTACTTTTTCCGTCACACATCCGTTAAAACTCCTGTGTTAAGCGTGCTTGGACTAGAATAGTGAAAGGATTGGTGACCTATCGAAAAATGATTTGCGATACCGTGCGAGTGAGGTCAAAGCACGGTAAAAGGTCATGTGGTGATTCTAGGGCCAGTAAACAATGCTTTCGGGCTTTGGAATAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGGACCCACTAGCCGAGAGAGCAGGCGTGAGTGGCCCATTAACCGTGGGCGGTCG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09253_LTR-Cassandra_1122

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

1432  

End:

1780

Strand:

-

>RUS09253_LTR-Cassandra_1122

TGTAACGTTCTGACTGCCCATAGTTAATGGAACATTCACACCGCTTACTCGATCCGTAAGTCTCATTCTGTCTGATGAACGGTGCATTAAATTTTTCAAAGGTTTGAAATCATGATTTTTTTGACTCTGCAATTACCACGATTTTACCTTATATTTTGGCCCCACTTGCATGATATTGAGAATCATTTTCCGATAGTCACCCATCATTTTATTATTCCAGTATAAACACGTTTAATCTTGAAATTTTAAACGAATAAATGACGAAAAAGATAAATGCACTTTAGTAACATATATATCCAAATCGATTCTTTTAAGCTTTCCAACATATACCATAAATCGGAATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09365_LTR-Cassandra_1123

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

197

Start:

1057  

End:

1253

Strand:

-

>RUS09365_LTR-Cassandra_1123

ATCACTACCTGACATTTCTCTGTGTTTTGGCATCACTCGCACGGTATCGCAAATCATTTCCGATAGGCTATCCATCATTTTACTACTCCAGACCAAACACATTTAACTCTGGACTTCTAAATAGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAATTTTAATGACATAGATAGCCAAATCAATTCTTTTAAGTATTTCCATAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09365_LTR-Cassandra_1124

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

328

Start:

1380  

End:

1707

Strand:

-

>RUS09365_LTR-Cassandra_1124

TGTAACGTCCCGACCGCCCACGGCTAATGGGCCGTCCACGTCCGCTCTCTCGGCCCATTGGCCAATCCCGTTCCAATGATCGGTACGTTATTTTTTCTAAGGCTCCAAATCATTGTTTACTGACCTTCCAATCACCATTTGACCTTTCCCTGTGTTTTGGCCTGACTCGCATGGTATCACGAATCACTTTTCGATAGATAACTTATTCTTTCACTCTTCCACCCAAGCACGCTTAACTCTGGGAATCTAAAACGGATGTATGACGAAAAAATTAAGTCAACTTTGATAACATAGATAACCAAATCAATTCTTTTAATCTTTTCTATAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09690_LTR-Cassandra_1125

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

236

Start:

99  

End:

334

Strand:

-

>RUS09690_LTR-Cassandra_1125

TTACTAATCCTGCAATCACCATCCGACCTTTTTCCGTGTTTCGGCCTTAGTTGTATGGTATATCGAATCATTTTCCAATAGGTCATCTATCATTTCACTACTTCAGCTCAAACACGCTTAACTGATTTGGAATTATAAATGGATGTGTGACGAAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGATAGCCAAATCAATTTTCTTAAGCCTTTTCATATACCACAAACCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09690_LTR-Cassandra_1126

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

468  

End:

826

Strand:

-

>RUS09690_LTR-Cassandra_1126

GACCACTGCACCTAATGGACCACCACACCCACTTTCTCAGTCTGTGGGTCCTATTCCATCCGATGCTCGATCCGTTAGTTTTTTCGAAGACTCCAAATCATTGTTTACTGATTTTTAAATCACCACATGACCTTTTTCTTCCCCCCCCCCCCTTCTTCCTCCGTACTTTGACCTTACTTGCATAGTATCGCAAATCATTTTCTAATAGATCACTCGTCTTTCACTAACTCTAGTTCAAACATGTTTAAATTTGGAATTCTAGACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAATCAATTTTGTTGACATAGTACCAAATCAATTTTCTTAAGCATTTTTCATATACCACAAACCGGAATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09709_LTR-Cassandra_1127

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

332

Start:

288  

End:

619

Strand:

-

>RUS09709_LTR-Cassandra_1127

TATATCGCTCTGACTGTCTACAACTAATGGGTCTTATACGCCTGATCATTTGGTTCGTGGACTCCACTCCATGTAATAGATGGTCCATTAATTTTTTCGGAAGTTTGGAAGATTTGTTTAATGATCCTACAATTACTATATGATCTTTACATGTGTTTTGGTTTCACTTACACGATACCACAAATGATTTCTCTCAATATGTCATTCATTCTTTGTAGCTCTTTCTGGATGTGTACCTAAAAACATAAGTGCATTTTGGTGACCTAGGTAACCAAGCAATCTTATAAACCTTTTAACATATTCTACCATATATCACAAACCAGCATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09709_LTR-Cassandra_1128

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

241

Start:

833  

End:

1073

Strand:

-

>RUS09709_LTR-Cassandra_1128

TTACTGATCTTTCAATTACCACATGACTTTTTCCTGCATTTTGATCTCACTCATACGATATCACAAATTACTTCTCGATAAATCATTCATTTTTGACTACTCTATCTCAAGCACGTTTAAATCTACAGTTCTTTCTTGATATATGCCTGAAAAAATAAATATATTTTGGTAACATAGATAATCGATAAATTATTTTAAACCCTTTAATATACACTCCCATATACCACAAACCTGAGAGCTA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09722_LTR-Cassandra_1129

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

297

Start:

153  

End:

449

Strand:

-

>RUS09722_LTR-Cassandra_1129

AATGGGCCGCCCACGTCCGGTCTCTCGGCTTGTGGACCTCATCCCATCCAACAATTGGTCCGTTAATTTTTCTAAAAATTCGAAATCATTGTTTACTGACTCTACAATCACCATCCGATCTTTTCTGTACTTTGGCCTCACTTACACGATATTGCGAATCATTTTTCGATAAGTCACTCATGCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTTTGAAGTTCTAAACGGATGTGTGACAGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGTCTTT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09722_LTR-Cassandra_1130

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

329

Start:

583  

End:

911

Strand:

-

>RUS09722_LTR-Cassandra_1130

TGTAACGCTCGACCGCCCACGGCTAATGGGCTACCCACGCCCGCTCTCTCGAACCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGATCGGTCGGTAAGTTTTTCTCAAAGGTTTGAAATCATTGTTTACTGATCTTACAATCACCAACCGACCTTTCCTCGTGCTTTGGTCTCACTTACACGGTATCGCAAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAACACGCTTAACTTTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACAGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGATAGCCAAATCGATTTTCTTAAACTTTTTCATAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09984_LTR-Cassandra_1131

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

720  

End:

1052

Strand:

+

>RUS09984_LTR-Cassandra_1131

GTAGTATATATGGAAAAGGTTTAAGAGAATTGATTTAGCTATCTATCTCACGAAAATGCATTTACTTTTTAGGGCACATATCTATTTAAAGCTCCATAGTTAAGCGTGTTTGAGTTAGAGTAATGGAAGGATGGGATCTATTGAGAAGTGATTTCCGATATCGTGTGAGTAAGGCAAAAGCACGGAAAATGTAATGTGGTGATTGTAGGGTCAGTAAAAAAACTTCCGAACCTTGGAAAAAATAACGCACCATCTGTCTGACAAAATGAAGCCCACAGGCCGAGTGAAGCGGGCGTGGAAAGTCCATTTTTCATGGACGGTCGGGTAGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09984_LTR-Cassandra_1132

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

113

Start:

1053  

End:

1165

Strand:

+

>RUS09984_LTR-Cassandra_1132

AGTAGTATTAGAGCCTAACCCAAACAAGGGTGGATTCATGTGTGGAGTCACACTAACATGGTTAACAATCTTGGGGGCAACGAGGATGTTGTGGTCTTTGAAAGGAGGTGAAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09984_LTR-Cassandra_1133

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

231

Start:

1166  

End:

1396

Strand:

+

>RUS09984_LTR-Cassandra_1133

TGTAATATCCCGATTTGTGGTATATGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTAATTACATATATCATCAAAGTGGCTTAAATTTACATATATATATATATATATATTTAAAACTCCAAAGTTAAACGTGATTGAGCTGGAATAGTGGAAGAATAGGTGACTTATCGGAAAGTAATTTGTGATACTGTGTGAGTGAGAACAAAACACGGGAAATATCATGTGGTGATTGCAGG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS09997_LTR-Cassandra_1134

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

208

Start:

6  

End:

213

Strand:

+

>RUS09997_LTR-Cassandra_1134

AGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATAGCGTGCGAGTGAGGCCAAAGTACGGGGAAAGGTCGGGTGTTGATTGCAGGGTCAATAAACAATGATTTCGAGCCTTGAAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGAACCCACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGGCGGGTCGGGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10263_LTR-Cassandra_1135

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

217

Start:

1  

End:

217

Strand:

+

>RUS10263_LTR-Cassandra_1135

AGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCAGGAAGTGATTCGCGATACCTTGTAAGTGAGGCCAAAGCACGGGGAAAGGTCGGGTGGTGATGGAAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGAGCCTTGGAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGAGCCCACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGACGGGTCGGGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10311_LTR-Cassandra_1136

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

325

Start:

304  

End:

628

Strand:

-

>RUS10311_LTR-Cassandra_1136

TGTAATGCTCCGACCCGTCCACGCTTAATGAACCATCCACACCCGTTTTTGGCCCGTGGGTCTCATTCTATCCGACGGTCGGTCGTTAGTTTTCCAAGGCTCGAAATCATTATTTACTGACCCTGCAATCACCATCCGACCTTTCCCCGTGTTTTGGTCTCACTCACACGGTATCACGAATCAATTCCCGATAGATCATCCGTCTTTTCACTACTCTAGTCCAAGCATGTTTAACTCTGGAATTCTAAACGGATGTTTGACGGAAAAGGTAAGTCGACTTTGGTGATATAGATAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10516_LTR-Cassandra_1137

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

171

Start:

1861  

End:

2031

Strand:

-

>RUS10516_LTR-Cassandra_1137

AATCACTTTCAGATATGTCATCCATCATTTCACTACTTCATCTTAAACACGCTTGACTATAAAATTTTAAATGGTTGTGTACAAAAAAAAATAAACACACTTTGATGATATAAATAGTCAAATCAATTACTTTAAGCTTTTTCATACATCACAAAAACTCGGAATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10610_LTR-Cassandra_1138

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

285

Start:

82  

End:

366

Strand:

+

>RUS10610_LTR-Cassandra_1138

GAATATAATATATGGAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGTTACCTATGTCACCAAAGTTGACTTATTTTTCGGTCACATATCCGTTTAGAACTTTAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTTGAGTAGTGAAAGTTTGGGTCATCTATAAGGAAGTGATTTGCGATACCGTGCGAATGAGTCAAAATACGGGGAAAGGTCATGTGGTGATTTCAGAGTCAGTAAATAATGATTTCGAGCCTTTGGAAAAATTAACAGACCAACAGTCGGATGAGATGGAGTCCACAGTCC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10978_LTR-Cassandra_1139

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

669  

End:

1004

Strand:

+

>RUS10978_LTR-Cassandra_1139

GTTGTGACAGGTGGAAAAACTTAAGAGAATTGATTTTGCTTTTTATGTTATTAAGGTGAAATTATATTTTTTGGTACACATCCGTTTAAAACTACAGAGTTAAGCATTTTTGAGTTGAAGTAGTAAAATGATGGGTAATCTATCGGAAAGTGATTCGTGTTATCGTACAAATGAAGCCAAAACACAGGAAAACGTCGGGGGTGATTATAGGGTTAGTAAACAAGACTTTTGGACCTTAGAAAAATTAGCGCACCATTCGTCAGATGGGATGAGGCCCACGAATCGAGAAAACGAAAGTCGATGGCCTATTAGCCGTGAGCGGTCGGAGGAATTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

RUS10998_LTR-Cassandra_1140

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

233

Start:

536  

End:

768

Strand:

-

>RUS10998_LTR-Cassandra_1140

GGTGCGCTAATTTTTGTATGCCCAAAAGATTTGTTTATTAATTTTTGAATTACCACATGATGTTTTCTCTTGCTTTGCCTCACTCGTAGGATGTTGCAGTTCACTTCCCGATAAGTAAATGCACTTTAGTTACATTCTTTCTGGATGTGCAACCAAAAAAGTAAATACACTTTAATAACATATATATATATATATAATTAAATCAATTCTATTAAGCTTTCACCATATACCAC