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R1_LTR-Cassandra_62 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1372217505622175192+
R1_LTR-Cassandra_63 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2962349690523497200+
R1_LTR-Cassandra_64 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3572349734123497697+
R1_LTR-Cassandra_65 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3482481338624813733+
R1_LTR-Cassandra_66 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3482481383924814186+
R1_LTR-Cassandra_67 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3242613184026132163+
R1_LTR-Cassandra_68 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2052613228226132486+
R2_LTR-Cassandra_69 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra84479606479689-
R2_LTR-Cassandra_70 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra348479980480327-
R2_LTR-Cassandra_71 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra182480434480615-
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R2_LTR-Cassandra_73 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra314684207684520-
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R2_LTR-Cassandra_76 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32644703544470679+
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R2_LTR-Cassandra_80 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra30661347646135069-

< 4 5 6 7 8 > Total 57


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

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Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_61

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Start:

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+

>R1_LTR-Cassandra_62

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_63

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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+

>R1_LTR-Cassandra_63

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_64

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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>R1_LTR-Cassandra_64

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_65

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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>R1_LTR-Cassandra_65

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

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Retrotransposons

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>R1_LTR-Cassandra_66

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_67

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LTR

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>R1_LTR-Cassandra_67

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_68

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LTR

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LTR-Cassandra

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_68

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

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LTR-Cassandra

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84

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Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_69

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

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Strand:

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>R2_LTR-Cassandra_70

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_71

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_72

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LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_72

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Start:

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End:

684520

Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_73

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Start:

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Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_74

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

247

Start:

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3864768

Strand:

+

>R2_LTR-Cassandra_75

AGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAATGTCGAGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGATCCTTGAAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGGGCCTACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGACGGTCGAGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

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Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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326

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Strand:

+

>R2_LTR-Cassandra_76

ATGTAAAAAGGTTTAAGAGAATTGATTTGGCTACTTATGTTATTAAAGTTGACTTACGTTTTTTGGAGCACATCCTGAAAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTAGACTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGATCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTAAGGGAGGCCAAAGTACGGGAAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACGATGATTTCGAGCGTTGGAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATAGGATCCATGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGGCGGTCGGGACGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

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Strand:

+

>R2_LTR-Cassandra_77

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

326

Start:

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Strand:

+

>R2_LTR-Cassandra_78

ATATGAAAAAGATTAAGATAGTTGATTTGACTACATATGTCACCAAAGTGCGCTTATCTTTTCCGACACATATCCGTTTAGAACTCTACAGTTAAACGTGCTTGAACTGGAGTAGTAAAAGGTTAGATAACCTATCATGAAGTGATTCGCGATACCATGTGAGTTAGGACAAATCACGGAAAAATGTCATATGGTGACTACATGGTTAGTAAATAATGATTTGACCCTTGGAAAATTATTGCACCGTCCGTCAGATGGGATGGGGTCCACGGACCAAAAGAACGGACGTAGGTGGCCCATTACTCATGGACGGTCGGGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_79

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Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Cassandra

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213

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Strand:

+

>R2_LTR-Cassandra_79

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R2_LTR-Cassandra_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

306

Start:

6134764  

End:

6135069

Strand:

-

>R2_LTR-Cassandra_80

TGTAACGCCCCAACCGTATTCGTCAATGGATCATCACCCGGATCATTATTTGTTAGTTGGCTAGTGCATTATTTGGGAGATTTGAAAAACTTGTTACTGGTTCCGTAATCACTATGTTTCATGTGCTTTGTCTTTATTCACACACAATACTGAAAATGACTTCTCAAGTGACCGACCCTAGATTTCTCAACTCAAGCAAAGTTAATTCTTAAATGCTTTTTAGATGTAAAACGAAAAAGATAAATTCACTTCAGATGATATATAATCATGTAACTTCTTTTAATCATCTTCAGATAGACCATCACA