Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_61Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
22148572End:
22148919Strand:
->R1_LTR-Cassandra_61
TGTAACGCCCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATCGTTTACTGACCCTGCAATCACCACATGACCTTTCCCCGTGCTTTGGCCTCACTCACACGGTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGAAGTTCTAAACGGATGTATGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_62Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
137Start:
22175056End:
22175192Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_62
TGTAACATCCCGAGTTATGATATATAAAAAGACTTAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTTGATTTACATTTTCCGTCACACATCCACCTAGAATTCTTTTTAGTGGTTTGGTTGAGCTAGGTTCAG
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_63Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
296Start:
23496905End:
23497200Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_63
CTTTTCCGTCACACATCCGTTTCAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTATTGTGATAAAGATCAGGTGTACCTATCGTAGTGAAATAAGATTCGCGATACCGAGTAAGTGAGGCCAAAACTTTCTCACGGGGAAAGGCCGAGGTGGTGATTAAAGGATCAGTAAACAATGACTTCGAGCCTCGGAAAATGTCTTTAACGACCGAACCTCGCCAATGGGATGGCGCCCACTAGAAAGAGAGAGCGAACCTGGACGACCCATTCAGCCGTGGGCGGTCGAGGAATTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_64Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
357Start:
23497341End:
23497697Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_64
GTCACATTACGGTCTAGAGGTATCGTGATATGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTTGACTTACCTTTTCCGTCACACATCCGTTTAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTAAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGAGCCTTGGAAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGGGCCCACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGGCGGGTCGGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_65Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
24813386End:
24813733Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_65
TGTAACATCCCGAGTTGTGATATGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAATTGACTTACCTTTTCCGGAACACATCTTAAAAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTGGAAGGATGGGTGACCTATCAGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTAAGTGAGGCCAAAACACGGAAAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGATCAGTAAACAATGATTTCGAGCTTTGGAAAATTAATGACCGACCGTCGGATAGGATGGGGCCCACGGGCCGAATGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTAGACGGGTCGGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_66Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
24813839End:
24814186Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_66
TGTAACATCCCGAGTTGTGATATGTGAAAAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTTGACTTACCTTTTCCGGAACACATCTTGAAAGAACTCCAAAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGAAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTAATTCGCGATACCGTGTAAGTGAGGCCAAAGCACGGGAAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGAGCCTTGGAAAATTAATGACCGACTGTCGGATGGGATGGGGCCCACGGGCCGAATGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTAGACGGGTCGCGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_67Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
324Start:
26131840End:
26132163Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_67
ATACGAAAAGATTTAAGAGAATTGATTTGACTATCTATCACTAAAATTAACTTACCTTCCGTCACATATCCATTTAGAACTTCAGAGTTAAGCGTGCTTTGGCTGAAGTAGTTAAATGATTGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCATGGTATTGTGCGAGTGAGGTGAAAGCATGAAAATATGTCGGATAATGATTGCAAGATTAGTAAAAAATGATTGCGAGCCTTGGAAAATTTACCCTCTAACTGTTGGAACAGGATGAGACCCACATGCCAAGAGAGTGGGCGTGGGCGGCCCATTAGCCGTGGACGGTCGGAACGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R1_LTR-Cassandra_68Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
205Start:
26132282End:
26132486Strand:
+>R1_LTR-Cassandra_68
GTTGTGATATATGGAAAAACTTAAGATAATTGATTTGACTATCTATGTTACCAAGTTGACTTAATTTTTCTGTCACATATCCATTAGAACTCCAGAGTTAAGGGTGTTTGGGCTAAAGTAGTGAAATGATGAGTGACTTATCAAAAAATGATTCGCGAAGTCGTGCGAGTGAAACCAAAACACTGAAAAAAGTCATGTGATGATT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_69Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
84Start:
479606End:
479689Strand:
->R2_LTR-Cassandra_69
TGTAACGCCCCGACCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGACCCCATCCCATCCGACGGTCGGT
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_70Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
348Start:
479980End:
480327Strand:
->R2_LTR-Cassandra_70
TGTAACGCCTCGACCGCCCACGGCTTATGGACCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCTCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTTCCAAAGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGATCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCGAGCATGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGTCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_71Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
182Start:
480434End:
480615Strand:
->R2_LTR-Cassandra_71
TGTAACACCCCGACCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACAGTCGGTCATTAATTTTTCCAAAGCTCGAAATCATTGTTTACTGATCCTACAATCACCACCCGACCTTTTCCCGTGCTTTGGACTCACTTACATTGTTTACTGAC
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_72Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
105Start:
635171End:
635275Strand:
->R2_LTR-Cassandra_72
CAAGCTTAATTGTGAAATTCTTCACAAACAATTAACCAAAATGCCAAATGCATTTTAACTGTATCATTCAGTCAAACCCATTCTTTTAATTTTTCACATGCACCA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_73Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
314Start:
684207End:
684520Strand:
->R2_LTR-Cassandra_73
TATGACGCCTCCGACCACGGTTAATGGGCTTCCACGACCGCTCTCTCGGTTGTGGATCTCATCCCGTCCGATAGCCAGTCCGTTAATTTTTCCAAGATTCAAGAGTTTTGTTTAGTGACTCTACAATTACTATATGATTTTTTTCTGTTTTTTGGCCTCAATTATATGATATCGCAAATTCCGATAGGTTACGCATCATTTCACTACTCCAGTTCAAAGTACATTTACTGTAGAGTTCCAAACGGACGTGTATTGAAAAAGGTAAGTCCACTTTGATGACATAGATAGTCAAATTAATTCTTTTAAACCTTTTC
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_74Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
319Start:
684642End:
684960Strand:
->R2_LTR-Cassandra_74
TGTAACGTTTCTGACCGCTCACGGCTAATGAGCATTCCACGCCTGCTTGCTCGGTCCATGGGCCCATCCCGTCTGACGTTCTATCCGTTAATTTTTCTAAGTCTCGAGAAATTTGTTTATTGACCCTATAATCACCACATATGACATTTTTCATGCTTTGGTCTCACTCATACGATATCAAAAATCAATTTCTGATAAATCATCTATCTTTCCACTACTCCATTTCAATCACATTTAACTCTGGAATTTGAAAGAGATATACCGGAAAATATACACTGTGATAACATATGTAGGCAAATCAAATCTCTTGATTCTTTCC
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_75Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
247Start:
3864522End:
3864768Strand:
+>R2_LTR-Cassandra_75
AGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAATGTCGAGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACAATGATTTCGATCCTTGAAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATGGGGCCTACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGACGGTCGAGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_76Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
326Start:
4470354End:
4470679Strand:
+>R2_LTR-Cassandra_76
ATGTAAAAAGGTTTAAGAGAATTGATTTGGCTACTTATGTTATTAAAGTTGACTTACGTTTTTTGGAGCACATCCTGAAAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTAGACTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGATCTATCGGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTAAGGGAGGCCAAAGTACGGGAAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACGATGATTTCGAGCGTTGGAAAATTAACGACCGACCGTCGGATGGGATAGGATCCATGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGCCGTGGGCGGTCGGGACGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_77Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
326Start:
4470806End:
4471131Strand:
+>R2_LTR-Cassandra_77
ATGTAAAAAGGTTTAAGAGAATTGATTTGGCTATCTATGTCACCAAAGTTGACTTACCTTTTCCGGAACACATCCTGAAAGAATTCCAGAGTTAAGCGTGCTTAGACTGGAGTAGTGAAAGGATGGGTGACCTATCAGGAAGTGATTCGCGATACCGTGTAAGTGAGGCCAAAGCACGGGAAAAGGTCGGGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACGATGATTTCAAACCTTGGAAAATTAACGACCAACCGTCGGATGGGATGGGGCCCACGGGCCGAGAGAGCGGGCGTGGGTGGCCCATTAGTCGTGGACGGTCGGGAAGTTATA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_78Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
326Start:
4665056End:
4665381Strand:
+>R2_LTR-Cassandra_78
ATATGAAAAAGATTAAGATAGTTGATTTGACTACATATGTCACCAAAGTGCGCTTATCTTTTCCGACACATATCCGTTTAGAACTCTACAGTTAAACGTGCTTGAACTGGAGTAGTAAAAGGTTAGATAACCTATCATGAAGTGATTCGCGATACCATGTGAGTTAGGACAAATCACGGAAAAATGTCATATGGTGACTACATGGTTAGTAAATAATGATTTGACCCTTGGAAAATTATTGCACCGTCCGTCAGATGGGATGGGGTCCACGGACCAAAAGAACGGACGTAGGTGGCCCATTACTCATGGACGGTCGGGGCGTTACA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_79Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
213Start:
4665508End:
4665720Strand:
+>R2_LTR-Cassandra_79
GCATATGGAAAGGTTTACAGGAATTGATTTGGCTATATATCTCACCAAATTGCGTTTACTTTTTTGGACACACATCCGTTTAGAACTACACAGTTAAGTGTGTTTAAGCTAGAGTAGTAGAAGAATGAATAACCTATCGAAAGGGATTCGCGATCTTGTGTGAGTGAAACTAAAACATAGAAAATAATCATGTGGTAATTGCAAAATCAATAA
Raphanus sativus (v1.0)
ID:
R2_LTR-Cassandra_80Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
306Start:
6134764End:
6135069Strand:
->R2_LTR-Cassandra_80
TGTAACGCCCCAACCGTATTCGTCAATGGATCATCACCCGGATCATTATTTGTTAGTTGGCTAGTGCATTATTTGGGAGATTTGAAAAACTTGTTACTGGTTCCGTAATCACTATGTTTCATGTGCTTTGTCTTTATTCACACACAATACTGAAAATGACTTCTCAAGTGACCGACCCTAGATTTCTCAACTCAAGCAAAGTTAATTCTTAAATGCTTTTTAGATGTAAAACGAAAAAGATAAATTCACTTCAGATGATATATAATCATGTAACTTCTTTTAATCATCTTCAGATAGACCATCACA