ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
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R1_LTR-Cassandra_22 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3491196061511960963-
R1_LTR-Cassandra_23 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3361242221112422546+
R1_LTR-Cassandra_24 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3031245854912458851+
R1_LTR-Cassandra_25 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3091251753412517842-
R1_LTR-Cassandra_26 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3091251793712518245-
R1_LTR-Cassandra_27 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1931314550013145692+
R1_LTR-Cassandra_28 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2301314640913146638+
R1_LTR-Cassandra_29 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3461469192114692266-
R1_LTR-Cassandra_30 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3461471432614714671-
R1_LTR-Cassandra_31 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2031517615815176360+
R1_LTR-Cassandra_32 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1011517731015177410+
R1_LTR-Cassandra_33 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra871574639615746482+
R1_LTR-Cassandra_34 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2811574654515746825+
R1_LTR-Cassandra_35 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra861588202315882108+
R1_LTR-Cassandra_36 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2901588239015882679+
R1_LTR-Cassandra_37 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3491919825119198599-
R1_LTR-Cassandra_38 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3361919870619199041-
R1_LTR-Cassandra_39 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3471974804219748388-
R1_LTR-Cassandra_40 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3291974848619748814-

< 2 3 4 5 6 > Total 57


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

11960161  

End:

11960509

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_21

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

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End:

11960963

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_22

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

12422211  

End:

12422546

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_23

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

303

Start:

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End:

12458851

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_24

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

309

Start:

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End:

12517842

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_25

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

309

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End:

12518245

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_26

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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193

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_27

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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End:

13146638

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_28

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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346

Start:

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14692266

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_29

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

346

Start:

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End:

14714671

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_30

TAACGCCCCGACCATCCATGGTTAATGGATCATCCATACCCGTTCTTTTGGCTTGTGCGTCCTATCCCGTTTCAATGATCGGTCTATTAACTTTTCTGAAACTCGAAATTATTATTTACTGATCCTGCAATCACCATATGACATTTCCCCGTGCTTTACTCTCATTCGCACGGTATTAGGAATCACTTCCCGATAGGTCATCCATTTTTCACTACTCTAACCCAAACACGTTTAATTATAGAGTTTTAAACGGATGTGAGACAAAAAAAGGTACGTCAACTTGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAATATTTCAATATATCATAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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203

Start:

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_31

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

101

Start:

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15177410

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_32

AACATCTCAGTTTGTGATATATGATAATGCATGTAATGCTAAAGGTTTTATAAGAATTGATTGGAATAATTATGTTACTAAAGTACACTTACTTTTGATCA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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Start:

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_33

AGTAATATCAGAGCCGAACTCAGAAAAATATGAAGTTTAAAGTGGGTTCACACTAACATGGATAACAATCTTGAAGCGCAACAGGGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_34

AGAATTGATTTGGATATCTATGACAACAAAATGTGGTTACATTTTCGGACATAAGTCTGTCTGCTTACAACTCCAAAGTTAAACTTGCTTAAAGTACTAAAATATTAAAATGATAGATGATCTATCAGAAAATGATTCGCAATACTGTGCAAGTAAAATCTAAGCACATGAGAAATGTTGTGTAGTGATTGCATGTTCGATAAAACAAAACCAGTGAGTTTTCAAAAAATTAATGCACCGTCTGTCGCAGAGAATGAGGTCTACAGATCAAGAGAAGGACG

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

86

Start:

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15882108

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_35

GAAAAGACTTAAGAAAATTGATTTGGTTATATATGTTATCAAAATGTTCTTACTTTTTTTTGGCACACATCGAACTCCAGAATTAA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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290

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15882679

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_36

TGTAACATCCTGGATTGTGATATACGAAAAGACTTACGAGAATTTATTTGGCTACCTATATCATCAAAGTACGCTTACCTTTTCCTACACACATCCGTTTATAATTCCAGAGTTAAGCATGTCTGCGCTGGAGTAATGGAAGGATGGTGATCTATTAGGAAGTAACTCACGATACCGTGTAAGTGAGACCAAATCACGGAAAAAATCATGTGGTGATTGCAGAATCAGTAAACATAACATTCGAGCTTCCAAAAAATTAACGCCCCGCCTATCAAATGGGATAAGACCCA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

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Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_37

TATAATGTCCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACCTCCGCTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGGCGGTCGATCCGTTAATTTTCCAAGGCTCTAGAGTCTTGTCTACTGACCTTGCAATCACCACATGACCTTTCTCCGTGCTTTGGTCTCACTTACACGGTATCGCAAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCTTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACAAATGTATGACGGAAAAGTTAAGTCGACTTTGGTGACATATGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

19198706  

End:

19199041

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_38

TATAACGCCCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGTCCGCTCTCTCGTCCCGTGGACCCCATCCCATCCGGCGGTCGATCCGTTAATTTTCCAAGGCTCTAGAGTCTTGTCTACTGACCATGCAATCACCACATGACCTTTCCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCGCAAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGCTTAACTCTAGAGTTCTAAACTGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCGACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTTTGTTAAGCCTTTCCACATATCACAAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

347

Start:

19748042  

End:

19748388

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_39

TGTAACGCTAGACCGCGTACGGCTAATAGCCACCTACGTCCGCTCTCTCAGTCCATAGGCCTTATCCCGTTCGACGGTCGGTCTGTTAGTTTTTCCAAAGACTCGAAATTATTATTTACTGACTCTACAATCACCGCATGACCTTTTTATGTGACTTGTCTTCACTCGGATGCTATCGCGAATCACTTCTCGTTAGATCACTCATCCTCCATTACTCCAGTTCAAGTACGCTTAACTCTAGAGTTCTAAACGCATGTGTACCATAAAAGTTAAGCGCATTTTGGTGACATATGTAGCTAAATCAATTCTCTTAAGCTTTTCCAAATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

329

Start:

19748486  

End:

19748814

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_40

TGTAAAGCCCAGATCGTCCACGGCTAATAGGCCACCCACGCCGATACACTCGACCCATGCACCCTATCCCATCTGACGGGCGATGCGTTAATTTTTTCGAAGACTCGAAATCATTGTTTACTGATATTCCAATCACCACATGATCTTTCCATGTGCTTTGGTCTCATTAGCATGCTATCATAAATCAGTTTCCGTTAGATCATCCATCATTCCACTACTTCATCTTAAGTACGCTTAACTCTAGAGTTTTAAACGGATGTATATCAGAAAAGATAAATACACTTTGATAACATAGGTAACCAAATTAATTCTTTTAACCATTTCTATAT