ID:

Contig00563_LTR-Cassandra_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

77838  

End:

78195

Strand:

+

>Contig00563_LTR-Cassandra_41

TGTAACATCAAGATTTCTGGTAGATATGGAAACATATGTGGGAGAGGTTAAAAGAATTTATTTGGCTACCTATCTCACCAAAGTGCACTTACCTTTTCGGTTGCACATCCAGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTCAAAGGATGGGTGACCTACCAGGAAGTCATTCGCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAACACGGGGAACGGTCATGTGGTGATTGCAGGGATAGTATATCATGACTTTTGAGCCTCCCGGTTAACGCATCGACCGTCGGATAGGGGTGGGCCCAATGGGCCTAATGAGAGGATATGTGGGCTCACTGGTAGGGGCGGTTGAGGCGTTATA

ID:

Contig00583_LTR-Cassandra_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

82

Start:

15520  

End:

15601

Strand:

-

>Contig00583_LTR-Cassandra_42

TTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTTCTTAAGCCTTTCCATATACATACACCACTTTATACCAAAATCGGGAAGTTACA

ID:

Contig00583_LTR-Cassandra_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

357

Start:

15708  

End:

16064

Strand:

-

>Contig00583_LTR-Cassandra_43

TAACGCCCCAGCCGTCCCTAATACTGGCTCCACGCCCACTCACTTGGGCCCGTGGATCTACCCTTGTCCGACAGCCGAGCGTTATTTTTAGAAGGTCCTGGAGGCTTTTTTTTACTGACCCTGCAATCACCATATGACCGTTCCCCATGTTTTTTTTCTCACTCACACGGTATCAAGAATTACTTTCCGGTAGGTCACCCATCATTTAATTACTCCAGCTCGAGCAAAATTAACTGTAGAGTTTTCTCCTGATGTCTGACTGAAAAGGTAAGTGCACTTTGATGACATAGATGGCCAAATCAATTATCTTAAGTCTTTCCATATACACTACTTTATATCAGAAATCAGGATGTTACA

ID:

Contig00583_LTR-Cassandra_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

289

Start:

27547  

End:

27835

Strand:

-

>Contig00583_LTR-Cassandra_44

TATAACGCCCCAACGGCCCCTACCTGTGAGCCCATATGTCCTCTCACTGGTCCCATGGGCCGGCCCACCCCTATCGACGGTCAGTGCGTTAACCGGAAGACTCGAAAATCACGATATACTGACCCTGCAATCACTACATGACTATTCTCCTTTTTTTAGCCTCACTCACATGGTACCGCAAATGACTTGTCGGTAGGTCACCCATCATTTTGACTACTCTAGCTCAAGCATGCTTAACTATGGAGTTCTCTCTGGGTGTGCAACCGAAAATGTAAGTGCACTGGTGATA

ID:

Contig00588_LTR-Cassandra_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

73949  

End:

74297

Strand:

-

>Contig00588_LTR-Cassandra_45

TATAACGTTCCAACCGTCTTTACTAGTGAGTCACCTATTTTTCTATCGGGTTCGTGGGTCTTACCCTTATCCGACAGTCGGTGCGTTATTTGAAAGGCTGGTATACGGACTTTGCAATTACCACATGACCGTTCCCCATGTATTTTCCTAACTCACACGACACAGCAATTGACTTTCCGATAGGTCACTCATCCCTTGACTACTCCAGATTAAGCACGCATAACTCTGGAGTTCTCTCTGGATGTGCAATCGAAAAGGTAAGTGCACTTTAGTGATATAGGTAACCAAATCAATTCTTTTAACCTCTCCCACATATGTTTCTATATATACCAAAAATTAGGATGTTACA

ID:

Contig00599_LTR-Cassandra_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

35867  

End:

36215

Strand:

+

>Contig00599_LTR-Cassandra_46

TGTAACATCCTAATTTTTGGTATATATAGAAACATATGTGGGAGAGGTTAAAAGAATTGATTTGGTTACCTATATCACTAAAGTGCACTTACCTTTTCGATTGCACATCCAGAGAGAACTCCAGAGTTATGCGTGCTTAATCTGGAGTAGTCAAGGGATGAGTGACCTATCGGAAAGTCAATTGCTGTGTCGTGTGAGTTAGGAAAATACATGGGGAACGGTCATGTGGTAATTGCAAAGTCCGTATACCAGCCTTTCAAATAACGCACCGACTGTCGGATAAGGGTAAGACCCACGAACCCGATAGAAAAATAGGTGACTCACTAGTAAAGACGGTTGGAACGTTATA

ID:

Contig00602_LTR-Cassandra_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

356

Start:

131602  

End:

131957

Strand:

-

>Contig00602_LTR-Cassandra_47

TATAAAGCCCCAACGCCCCTACCGGTGAGTCACTCATCCCTCTATCGGGTTCGTGGATCTCACCCCTGTCCGACGGTCGGAACGTTATCAAGGAACCTCGAAAGTCATGATATATTATCCCTGCAATCACCACATGACCGTTTCCCGTGCGTTTTTCCTAACTCACACGATACCGCGAATGACTTCCCGGTAGGTCACTCATCCTTCCACTGCTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGCTCTTTCTGGAAGGTTAAGCGAAAATGTAAGTACACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTATTTTAATCTCTCCCACATATATTTCCATATATACCAGAAATCGAGATGTT

ID:

Contig00606_LTR-Cassandra_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

362

Start:

122085  

End:

122446

Strand:

+

>Contig00606_LTR-Cassandra_48

TAACATCCCGATTTCTTGTTTAATGGAAACGTATGGGTGAAAGGATAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACAAAAATGCACTTACCTTTTCGGCTGCACATCCAGAGAAAAAATCCAGAGTTAAACGTGCTTGAGTTGAAGTAGTCAAAGGGTGGGTGACCTATCGGAAAATCAATCGCGGTATCGTATATATGAGTGAGGCCAAACTACAGGGAACGTTCATGTGGTGATTGCAGGGACAGTATATCATGACTTTCGAGCCTCCCGATAACGCACCGACTGTCAGACAGGAGTGGACAAGCCATGGGCCTAGGGCGAGGACATATGGGCTCATTGGTAGGGGCGTTGGGGCGTTATA

ID:

Contig00606_LTR-Cassandra_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

341

Start:

122553  

End:

122893

Strand:

+

>Contig00606_LTR-Cassandra_49

TGTAACATCCCGATTTCGGGTATAATGAAAATGTATGTGGGAAGGTTAAAAGAATGATTTGGACACCTATGTCACCAAAGTACACTTACCTTTTCGGTTGCACATCCAGAGAGAACTCCAAAGTTAGCGTGTTTGAGCTGAAGCAGTCAAAGGATGAGTGACCTAGCGGAAGTCTTTACGGTACCGTGTGAGTGAGAACAGTCATATGGTGATTGTAGGGACAATATATCATGACTTTCGAGCCTCCCTATAACGCAACGACCGTTGGACTGGGTGGGAAGACACATGGGTCTAGTGAGAGGACGTGAGAGTTCACTGGTAGGAGCGGTTGAGGCGTTATA

ID:

Contig00609_LTR-Cassandra_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

330

Start:

356699  

End:

357028

Strand:

+

>Contig00609_LTR-Cassandra_50

TGTAACATACTGAATTCTGGTGAATAGTGGTGTACTGGAAAGGCTTAAGATAATTGATTTGGCTAGCTATGTCAGCAAAACGCACTTACCTTTTCCATTGTACATTTAGAGAAAACTCTATAGTTAAACGTGCTTCAGCAGGAGTAGTCAAATGACAGAGGACCTACCGAGAAGTCAATCATGGTACCGTGCGAGTGAAGATAAAACACGGGGAATGGTTATGTGGTGGTTGCAGGATCAGTAAACAAGTCTTTCGAGCTTTCCAAATATAATACATCGACCGTCGGACATGGATGTATTCACGGGCCCGAGTGAGTGGGCGGTTGGGGC

ID:

Contig00616_LTR-Cassandra_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

341

Start:

34584  

End:

34924

Strand:

+

>Contig00616_LTR-Cassandra_51

TGTAACATCCCGTTTTCTGGTATATATGGAAACATATGTGAGAGAGGTTAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAATGCACTTACCTTTTCGGTTGCACATCTAGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAATCAAAGGATGGGAGACCTACCGGAAAGTGATTCGCGGTACCGTGTGAGTTAGGAAAAAACATGGGAATAGTCATGTGGTGATTGCAGGGTCAGTATATCATGACTTTCGAACCTCCCGATTAACGTTCCGACCGTCGGACAGGGATGGGCCCAATGGGCCTAATGAGAGGACATGTGGGCCTAGTGAGAGG

ID:

Contig00616_LTR-Cassandra_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

344

Start:

35096  

End:

35439

Strand:

+

>Contig00616_LTR-Cassandra_52

TGTAACATCCCGATTTCTGGTATATATGGAAACATATGTGAGAGAGGTTAAAAGAATTGATTTGGCTACTTATGTCACCAAAGTGCACTTACTTTTTCGGTTGCACATCTAGAGAGAGCTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAATAGTCAAAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTCGCGGTATCGTGTGAGTTAGGAAAAAACACGGGAAACGGTCATGTGGTGATTGCAGGGACAGTATATCATGACTTTCGAGCCTTCCAAAATAACGCACTGACTGTCGGACAGGGGTGGGCCCAATGGGTCTAATGAGAAGACATGTGGGCCTAGTGAGAGGC

ID:

Contig00619_LTR-Cassandra_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

22061  

End:

22419

Strand:

+

>Contig00619_LTR-Cassandra_53

TGTAACATCCGGATTTCTGGTATATATGGAAACATATATGAGAGAGGTTAAAAGAATTGATTTGGTTACCTCTGTCACCAAAGTGCACTTACCTTTTCGGTTAACCGTCCAGAAAGAACTTCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTGGAAGGAAGGGTGACCTACCGGGAAGTCATTTGCAGTACCGTGTGAGTTTGGAAAAAACACGGAGAACGATCATGTGGTGATTGCAGGGACAGTATATCATGAAATTCGAGCCTCCCGAATAATGCACCAACTGTCGGACAGAGGTGCGGCCCACGAGCCCGACAGAGGGATGGGTGACTCACCGGTAGGGGCGGCTGGGGCGTTATA

ID:

Contig00619_LTR-Cassandra_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

22523  

End:

22881

Strand:

+

>Contig00619_LTR-Cassandra_54

TGTAACATCCCGATTTCTGGTATATATGGAAACGTATATGGGAGAGGTTAAAAGAATTTATTTGGCTAACTATGTCACCAAAGTGCACTTACCTTTTCGGTTAACCGTCCAGAAAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTGGAAGGATGGGTGACCCGCCGGGAAGTCATTCGCGGTACCGTGTGAGTTAGGAAAAAACACGGGGAACGGTCATGTGGTGATTGCAGGGACAGTATATCATGACTTTCGAGTCTCCCGAATAACGCACCGACCGTCGGACAGAGGTGGGGCCCACGAGCCCGACAGAGGGATGGGTGACTCACCGGTAGGGACGGTTGGGACGTTATA

ID:

Contig00639_LTR-Cassandra_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

58410  

End:

58764

Strand:

+

>Contig00639_LTR-Cassandra_55

TGTAACATCCTGATTTCTTGTATATATAGAAATGTATATGGAAAAGGTTAAAATAATTGATTTGGCTATATATGTAACCAAAATGAACTTACGTTTTCCGTCACACATCCCCGAAAGAACTCCAGGGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGCAGTGGAATGATAGGTGACCTACCAGAAAATCATTCGCGGTACCGTGTGAGTTAGGAAAAACCACGGAAAACGGTCATGTGCTGATTGCAAGGTCAGTATATCATGACTTTCGAGCCTCCTGAATAAAGCACCAGCCGCCGGACAGAGGTGGGGCCCACGAGCATGATAGAGGCATGGGTGGCTCACCGGCAGAGCCGACCCTCGGG

ID:

Contig00645_LTR-Cassandra_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

316

Start:

69967  

End:

70282

Strand:

-

>Contig00645_LTR-Cassandra_56

GCCCCAACCGTCCACTCACTCGGACCCGTGAATGCATCCCTGTCCAATGGCCGATGTATTATATTTGGAAGGCTCGAGAGACTTGTTTACTGACTCTGAAATCACCACATGACTGTTCCCCGTGTTTTATCTTCATTCACACGATACTGTGATTGACTTCTCGGTAGGTCACCCATCATTTGACTACTCTTGTTCAAGCACGTTTAACTATAGAGTTTTCTCTGAATGTACAAGTGCGCTTTGATGACATAACTAGCCAAATCAATTCTCTTAATCCTTTCCAGTACACCACTATTCACCAGAATTCAGGATGTTA

ID:

Contig00663_LTR-Cassandra_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

240

Start:

85182  

End:

85421

Strand:

-

>Contig00663_LTR-Cassandra_57

TATAATATCCTGAGCACTACCATCCATATATAAGCCCCATACATTCTTTTGGCGCATGGTTTCATCCTGTTTAACAGTTGATGCGTTATTTTAGAAAATTCAAAAGAATTATTCTATGATCCTACAAATCACCACATGAAATATCTCAGTGTATTGTCCTCACTTGGTTATACTGGAAATCACTTCCTCGTATACCATTCATCTTTAAATTAAAGAATGCTTAATTTTAGTGGATTTTCT

ID:

Contig00675_LTR-Cassandra_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

83

Start:

19379  

End:

19461

Strand:

+

>Contig00675_LTR-Cassandra_58

TAACATCCCAATTTCTGGTATATATAGAAACATATGTAGGAGAAATAAAAAAAAATTGATTTAACTACCTATTTCACCAAAGT

ID:

Contig00715_LTR-Cassandra_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

82325  

End:

82683

Strand:

-

>Contig00715_LTR-Cassandra_59

TATAACGCCCCAACCGCCCCTACCGGTGAGTCACCCATCCCTCAGTCGGGCTCGTGGGCCCCACCCCTGTCCGACGGTCGATGCGTTATTCCCGAGGCTCTAAAATCATGATATAATGTCCCTGCAATCACCACATGACTGTCCCCCGTGTTTTTTCCTAACTCACACGATACCGCGAATCACTTCCCGGTAGGTCACCCATTCTTCCACTACTCCAGTTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTTTCAGGGTGGTTAACCGAAAAGGTAAGTGCACTTTGGTGACATAAGTTGCCAAATCAATTCTTTTAACTTCTCCCACTTATATTTCCATATATACTAGAAATTGGGATGTTACA

ID:

Contig00715_LTR-Cassandra_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

360

Start:

82787  

End:

83146

Strand:

-

>Contig00715_LTR-Cassandra_60

TATAACGCCCCAACCGCCCCTACCGGTGAGTCACCCATCCCTCAGTCGGGCTCGTGGGCCCCACCCCTGTCCGACGGTCGGTGCGTTATTCCCGAGGCTCGAAAGCCATGATATACTATCCCTGCAATCACCACGTGACCGTTCCCCGTGTTTTTTTCCTCATTCACACGATACCGCGAATGACTTCCCGGTAGGTCACCCATCCTTTCACTACTCCAGCCCAAGCACGTTTAACTCTGGAGTTCTCTCTGGATGTGCAACCGAAAAGGTAAGTGCACTTTGGTGACATAAGTTGCCAAATCAATTCTTTTAACCTCTCCCACTTATATTTCCATATATACCAAAAATTGGGATGTTACA