ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

286

Start:

14893983  

End:

14894268

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_61

ACGTACTCTCACTAGGCCCGTGAGCCTATCAATATCCGATCGTCGATTTGCTACGTCCGAGAGGTTTAAATAGTTGTTTACTGACCCTACAAATCACCACATGATCTTTGCATGTGTTTTCGGCTCGCTCACACAGTTCCAACAACTATTCCCGGAAGGTCACTCATCCTAAGACTACTCTAACATAAACACGCTTAATTGTGGAGTTCTCTCATGACCTTTGACTGAAAAGATAAGTGCATTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCATTTAAACTTCTTCG

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

310

Start:

14948348  

End:

14948657

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_62

CCACCTCTCTTGATGGGCCTCACGTCCTCTCACTAAGCCCATGAGCCCATCGATACATGACGGTCGGTTTGCTACGTCCGGGAGGCTTAAAGTCTTGTTTACCGACCCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCTGTGTTTTGGCCTCACTCACACAGTTCTGACAACCACTTCCCGTAAGGTCACCCATCATTTGACTACTCCAGCATAAGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTCTCAGGACCTTTTACCAAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTGGCCAAATTAATTCATTTAAACATCTCCGCA

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

303

Start:

14995303  

End:

14995605

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_63

CCTATCTTAATGGGCCTCACGTCCTCTCACTAGGCCCATGAGCCCACTAATATTCGACGGCTGGTTTGCTACGTCTCGGAGGCAAATACTTGTTTACCGACCTTACAAATCACCACATGATCTTTCCCTGTGTTTTGGCCTCTCACACAGTTCCGACAATCACTTCCCGGAAGGTCACCCATCTTTTGACTACTGCAGCATACGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTCTCAAGACCTTTGACCGAAAATATAAGTGCACTTTGGTGACATAAATGGCCAAATCAGTTCATTTAAACCTCTCCGCA

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

14995620  

End:

14995730

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_64

ATTCTCCCCCACTAATAGACCGCAACGTCCTCGTTGCGCACAACGATCGTCACTCCTTAACAGTGTGTGCCCACCACTCTACACTTATCTGGGTTCGGCTCTGATACCACT

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

309

Start:

14995791  

End:

14996099

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_65

CACCTCTCTTAATGGGCCTCACATCTTCTCACTAAGGCCATGAACCCATTAATACCCGATGGCCGGTTTGCTACGCCAGGGAGGTTTAAAGACTTGTTTACCGAGCCTACGAATCACCACATGATCTTTCACTGTGTTTTGGCCTCACTCACATAGTTACGACAACCACTTCCCTGAAGGTCACCCATTCTTTGACTATTCCAGCATAAGCACGCTTAACTATAGAGTTCTCTCAGGACCCTTGACCGAAAATATAAGTGCATTTTGGTGATATAGGTGGTCAAATCAATTCATTTAAACCTCTTCGCA

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

287

Start:

15121409  

End:

15121695

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_66

TTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAATGCATTTATCTTTTTGGTCAAACGTGAAAGAATTCTAGAGTTAAGCGTGCTTATGTTGGAATAATCAAAGAATGCATGACCTTCTGGGAAGTGGTTACTGGAACTGTATGAGCGAGGCCAAAACACATGAAAAGATCATGTGGTGATTTTTAAGGTCAGTAAACAAGTCTTTAAGTCTCCCGAACGTAGCAAACCGACCGTCGGATACATATGGGCTTACAGACATAGTGAGAAAAAATGAGATCTATTAAATGAGGTGG

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

289

Start:

15151869  

End:

15152157

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_67

TGCAGAGAGGTTTAAATGAATTGATTTGGGCACATATGTTACCAAATTGGCACTTATCTTTTCGGTCAAAGATCCTGATAGAATTCCACAATTAAGCTTGCTTATGCTTGAGTAGTTCTCGGATGAGTGACCTTCCGGGAAGTGAACCAAAACACAAGAAAATATCATGTGGTGATTTGTAAGGTCGGTAAACAAGTCTTTAAGCCTCTTGAACGTAGCAAACTGGCCGACGAATATGGATGGGCTCATGGGCCTAGTGAGAAGACGTGAGGCCCGTTAATAGAGGTAG

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

87

Start:

15152131  

End:

15152217

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_68

AGACGTGAGGCCCGTTAATAGAGGTAGGCCCATGGGCTGAGAGTGAACATAGGACCCACTGGGTGAGATGACGGTCGGAGTGTTATA

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

315

Start:

15190180  

End:

15190494

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_69

TGTGACACCCTGGTTTTAGGAAATGCGGAGAGGTTTAACGAAATTGATTTGGCTACCTTTATCACCAAAGTGCAATTATCTTTTTAGTCAAAGAACCTAACAGAACTTCTCAACTAAGCGTGCTTACGCTGCAGTAGTCTCGAGATGGGTGACACTCTGAATAGTAATTGTCAAAATTGTGTGAGTAAGAACAAAGCACATAGAAAATATCATGTGGTGATTTGTAGGGTCGGTAACAAGCTTTTAATGCCTCCCGGACATAGCAAACCGTTCGTCAGATATGGACAGGACAACGGGCAAGACGTGGAGCCCATT

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

362

Start:

15403205  

End:

15403566

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_70

TGTAACACTCCAACGGCCACCTTTATTAATAAGTTCCACGTCTTTTTTTGTGGTGTTATGCATGTGGGTCTACCCTTATGCAACGTTCAGTTTTTTTTGTATGCGGTAAGTTTTAAAAACTTGTTTATTTGACCCCTAAATCACTACATGATATTTACTCGTATTTTGTCTTCACTTTTGCATGGTTCTAACAATTATTTTTTGGATGGTCTACTCCAACATATATAAGCATACGTAACATTGAATTTATATCCGGATGATATGATTGACCGAAAAATAAATGCATTTTGATTATATAAGTGGTTAGATTAAACTTTTAAAAATTTTCAATATAAACAAATCATTGAAACCAAGGTATTACA

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

154

Start:

15653810  

End:

15653963

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_71

TGTGACACCAAGGTTTCATGATATATAGTGATATATGCGGAGAGATTTAATAGAATTGATTGGCCAATTGTCACCAAATAGCACGTATATTTTCGGTTAAGAGTCATAAGAGAACTCCACTGTTAAGCGTGTTAATTATGGAGTAGTTAGGATG

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

87

Start:

15850728  

End:

15850814

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Cassandra_72

TATAACACCCCAATATTAGGAATATGATGTTGTGTGTAGAGAGGTCTAAAGAATTGGTTTGGCTATCTATGTCACCAGAGTGCACTT

ID:

scaffold_1_LTR-Cassandra_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

326

Start:

15886299  

End:

15886624

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Cassandra_73

TGTAACGCCCTGACCACCATCTTCTTTAATGAGTCTCACATTTTCTCTTCATATATGAACCCACCCTTATTCAACGGTCGGGATGCTATGTCTAAGAATCTTTAAAGACGTGGTTACCGATCCTACAAATCAATACAAACTCGGCAACCACTCTAAGAAATTTACCCATCTTAAAATAACTCCAGCATAAACACGCTTAACGGTAGAAGTCTCTCAAAATGGTTGAGTGAAAAGATAAGTGCACTTTAGGTGACATAGGTTGGTCCAATAAGTTTCTTAAAACCTCTCTATGTACGACAATTTTTTTTGGAAATCGGGGTATTACA

ID:

scaffold_11_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

259

Start:

35827  

End:

36085

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Cassandra_74

CCACTTCTCTTAATGGGCTTCACGTCCTCTCACTAGGCCCATGAGTCCATCAATATCCAAGGTTGGCTTGCTACGTCCAAGAGGCTTAAATACTTGTTTACCGACCCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCTGTGTTTGGACCTCCCTCACACAGTTCCGAGAAACACTTCCCAGAAGGTCATCTATCTTTTGACTACTCCATCTTAAGCACGCTTAACTGCGGAGTTCTCTCAGGACCCTTGACCAAAAATATACGT

ID:

scaffold_11_LTR-Cassandra_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

158

Start:

36083  

End:

36240

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Cassandra_75

CGTAGTTCCGACAAACACTTCCCAGAAGGTCATCCATCCTTTGACTAGTCTAGCATAAGCACACTTAACTGTGGAATTCTCTTAGGACCCTTAACCAAAAAGATAAGTGAATTTTGGTGACATAGGTGGCCAAATCAGTTCATTTAAACATCTCCGCA

ID:

scaffold_12_LTR-Cassandra_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

276

Start:

242043  

End:

242318

Strand:

-

>scaffold_12_LTR-Cassandra_76

AATGGGTCTCACGTCCTCTCACTAGGTTTGTGAGCCCATCCATATATGACGGCCAGTACTTGTATACCAACCCTAAAAATGACCACATGATCTTTCCTTGTGTTTTGGCCTCGCTCACACAGTTCCCGATAATCATTTCCCGGAAAGTCACCTATCGTTTGACTACTCCAGCATAAGCACACTTAACAGTGGAGTTCTCTTATGACCTTTGGTCAAAAAGATAAATGCACTTTGGTGATATATGTGGCCAAATCAATTCATTTAAACCTCTATGCA

ID:

scaffold_1242_LTR-Cassandra_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

168

Start:

2913  

End:

3080

Strand:

+

>scaffold_1242_LTR-Cassandra_77

AGAGGTTTAAATGAATTGATTTGGCCACTTATATCACCAAAGTGTACTTATCTTTTCGATCAATGGTCCTGAGAGAAGTCCACAGTTAAGCGTGCTTATGTTGGAGTAGTCAAAAGATGGGTGACCTTCTGAAGTGGTTGTTTGAACTGTGTGAGTGAGGCCAAAACA

ID:

scaffold_13_LTR-Cassandra_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

297

Start:

103564  

End:

103860

Strand:

-

>scaffold_13_LTR-Cassandra_78

AGTGGGTCCACGTCCACTCTTAGCCCGTGCGTCCACCTATATTTGACGGCCGGTTTGCTATGTTCGAAAGGCTTTGAAAACTTGTTTACCGGCCCAAGGAATCACCACATGATCTTTTCGCAGTTTTTTGTTTTCACTCGCATAGTTCTAGCGCACAATTACTTCATAGAAGGCCGCATATGCTGAGACTACTCGAGCATAAACATGGTTAACTATAGACTTCTTTCAACACTTTTGACCGAAAAGATAATTGCACTTTGGTAACATATATGACAATTTAAATTTTAAAATTTAAAC

ID:

scaffold_1386_LTR-Cassandra_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

150

Start:

2995  

End:

3144

Strand:

+

>scaffold_1386_LTR-Cassandra_79

AGAAGTCCACAGTTAAGCGTGCTTATGTTGGAGTAGTCAAAAGATGGGTGACCTTCTGAAGTGGTTGTTTGAACTGTGTGAGTGAGGCCAAAACACAGGAAAAGATTTTGTGGTGATTTGTAGGATCATTAACCAATTATTTAAGCCTCC

ID:

scaffold_14_LTR-Cassandra_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

303

Start:

99681  

End:

99983

Strand:

-

>scaffold_14_LTR-Cassandra_80

CCATCTCTCTTAATGGGCCTCACGTACTCTCACTAGGTCTATGAGCCTATCAATATTCGACGGTCAGTTTGCTACGTTTGGGTAATGTCTTGTTTACCGATCCTACAAATCACCACATAATCTTTCCTTGTGTTTTGGTTTCACTCATACAGTTCTGACAACCACTTTCCGAAAGGTCACTCATCATTTGACTACTCTAGCATAAGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTCTCAGGACCCTTAACCAAAAACATAAGTGCATTTTGGTGAGATAAGTGGCCAACTCAATTCATTTAAACCTCTCCG