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scaffold113_LTR-Cassandra_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

157

Start:

1078342  

End:

1078498

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_41

CATCACATTCTCTTTTCCGTGTTTTGTTTTCACTCACACGATTCCGAAAATCACTTCTCGGAAGGTCATTCATCTTTTAACTATTCTAGCTCAAACACATTTAATCCTTGAATTATTTATATAAGTGACCGAAAAGATAAATGCTTTTGGTGATATA

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

125

Start:

1178268  

End:

1178392

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_42

TGTAACGCTTCAACCACCATTTTAATAGGTCTCACATCTTCACCTAGTATGTGGATTGACTTTCTCCAGCCCAACAATCGATATGTTACGTCTGGAATATTTTAAAGACTTGTTTACCGATCCTA

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

1433605  

End:

1433938

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_43

TGTAACGCCTGACAGCTACTCTTAGTGGGTCTCACATCCTCATGTGGTCCCATCTTCGTATGTTACCTATAGAAAAGCTTTAAAGAATTGTTTACCGATCCTATAAATCACCATCTAATATTTTCCTTGTTTTATTCTCACTGATTCCGAGAATCACTTTCCGGAAGATCACTCATTTTTTAACTATTCCAGCTCAATCAAGCTTAAATCTAAATTTTTCTCTGGATAAGTGACCGAAAAGATAAATGCACTTTAATGATATAAATGTGACCAAATCGATTCTTTTAAACATCTCTCTATGCACCAACATATTTTTTGAAATCAGGGTGTTATA

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

318

Start:

3523471  

End:

3523788

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_44

TGTAATGCCCAGCCCACTATTTTTAGTGTCTCTTAATCCTTTCTCGGCCCATGAATTCACTATCTCTCAACAACAGTTACGCTATTTCTGTAAGTTTTGAGACTTGTTAATCAATTATACATAAAATCAAGTATTTTGTCTTTACTCACACGATACTATAATAAATCACTTCCGAGTACATCACTCATCCTAATTTTATCTAGTTTAAATACAGTTAATTATAAAATTCTCTCAAAATATTTAATCGAAAAAATAAATTCACTTTGATGACACAAATAATCAAACCAATTCTTTTAGTTTTTCTTCATGCATCATCAT

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

340

Start:

3632893  

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3633232

Strand:

+

>scaffold113_LTR-Cassandra_45

TGTAACATCCCAATTTTTTAAAATATGGTTGTGTAATTTTTTTTAAAAAAATTGAGTTGCCTACGGCACCAAAACACATCTATCTTTTCGGTCAAACAACCTAAAATTACTATATACTAAACGTGCTAAAACTGAAATATTTTTAAGGGTAAATGGGCTACCAAAAAGTGGTTTCCAGTAATTCATAGTTGAATATATAACACATTAAAAAATCACATAATAATTTGTAAAAGCGATAAACAAGTATTTAAAACTTCTATAAATAATATACCAGCTGCCAGATAGACTTAGAGCCGAGAAAAAACATAAACCCACAAAAAATAGGGATCGAGACGTTACA

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

293

Start:

3920343  

End:

3920635

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_46

GTAATGTCCCGACTGCCACTTTTAGTGGTTCCACGATCTCTCTCGGCTTGTGGATCTACTCTTTCTCGATGGCTAGTATGCTATTGTTCAGAAATTTTAAGGATTTGTTTACTGTGATATTTTCTTGTGTTTTGTCTTCATGGAAAATGGTACTTATTTTGAAATTTTTTCTAACTCAAAATGCTTAATGGTGTAATTTTTTTAGGATGTTCGATCGAAAAGGTAAGTGGATTAAAAATTTAATGATATAAATAGTCAAAATCATTTTTATAAGCTCTCTCCACCATATTTCT

ID:

scaffold113_LTR-Cassandra_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

305

Start:

3921371  

End:

3921675

Strand:

-

>scaffold113_LTR-Cassandra_47

TGTAACGTCCCGACCGCCATTTTTAATGGATCTCATTTTTTTTTGGCCTATGAGTTCACTCTTTCTCAATGGTCAGTATGCTATTTCTAGAGACTAAAAATTTGTTTACCGACCCTACAAATCACTACATAATCTTTTTACATATTTTGTTTTCACTTATATAGTATCGAAAATCACTTCCAAATAGACTATATATCCATCCTAAAAAATTTCCGAACTCAAGTATGTTTAACTATCGAATTCTTGCAGGATGCTTGACGGAAAACGTACAAATTTTTTAGTAAGATAAGTAATCAATCAATTTT

ID:

scaffold117_LTR-Cassandra_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

117

Start:

100018  

End:

100134

Strand:

+

>scaffold117_LTR-Cassandra_48

CTGGTTTTAGGAAATATAATGGTGTTTGCACGAGCAGATTTTAAAAGAATTGATTTGATTATATATCTGGTTTAATTAAATGTATTTATCTTTTCGGTTAGACATTTTAAGCGAATT

ID:

scaffold119_LTR-Cassandra_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

366

Start:

622678  

End:

623043

Strand:

-

>scaffold119_LTR-Cassandra_49

TGTAACGCTCCGACTGTCATCTTAATGAGCCCCACATCCTCATCTGGCCTGTGGGTTTATATTACCGATTGAACAGTCAGCATGCTACGTCCGAGAGGCTTTATAGATTTGTTTATCGATCCTACAAATCATTACATGATATTTCTCTGTGTTTTATCCTCATTCACACAGTTCCAAGAATCACTTTCCAAAATTCACCCATCTTTTGACTACTCCATCTCAAGCATGCTTAACCCTGAAGTTCTCTCTAGACAAGTGAACGAAATTAAAAGATAAGTGAACTTTGGTGATATAGGTGGTCAAATCAATTCTTCTAAGCTCCTCCGCATACACTACCATATATCATATTTTCTGGAACTGGGTGTT

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

372

Start:

714082  

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714453

Strand:

+

>scaffold12_LTR-Cassandra_50

TGTAACATCCCAGTTTTAGGAAATATAATATGTGGTGGTGCATGCAGAGAAGTTTAAAAGAATTGATTTGGTTACCTATTTTACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTTACTTTTCTAGAAATAATTTTAAAGTTAAACGTGCTTGAGCTGGTAGTTGAAAGATGGGTGACTTTTCAGAAAATTATTTTTATTATTGTGTGAATAAAGATAAAACACAGGAAAATATATGATATCATATTTTCATATGATGATTTGTAGGATTGGTAAAAAAAATTAAAATTTTATGGATGTAATGTTCTGACCGTCAGATAAATTAGGCCCATGAGTCCGAAGAAGATATGGAACCTATTAAAATGGTGATCGAGCATTACA

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

302

Start:

804607  

End:

804908

Strand:

-

>scaffold12_LTR-Cassandra_51

TGTAACGTCCCGATTGCACTTTTAATGAGCCCCACATTATTTCCGGCCCATGGGTTCATTTTATTGGTCGCTACGTCATGATAACTTTAAATACTTGTTTTGTTTTGTGTTTTGTCTTCACTCACACAGTTCTGGAAATCATTTTTCGAAAGGTCACCCATTCTACAATTCTCTAGAGTTCTTTCTGAACAAGTAACCAAAAATATAAATACATTTTGGTGACATAGGTGGCCAAATCAATTCTCTTAAACCTCTTCGCATGCACTACCACATACCATATTTCCTAAAATAAGGATATTATA

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

804909  

End:

805019

Strand:

-

>scaffold12_LTR-Cassandra_52

ATTAATCCTCACTAACATACCGTAACGTCCTTATTACGTACCAAGATCGTCACCCTAAAAGAGTGAGCTCTTTTGTCTCCACACACGTCTGGATTCGACTCTGATACCACT

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

361

Start:

805020  

End:

805380

Strand:

-

>scaffold12_LTR-Cassandra_53

TGTAATGCTTCAACTGCACCCTTAATGAGTCTCACGTCCTCTCTGGTCTGTGGGCCCACCTTACCGGTCTGACGATCTATATACTACTCTAAAGGCTTTTAAAACTTGTTTACTGACTCTACAAATCACCACATAATTTTTCCTGTATTTTATCCACACTCACATGGTTCTTGGAATCACTTTTTGAGAGGTCACCCATCTTCTAGTACTCTAGCTCAAGCACACTTAACCCTGAAGTTCTCTCTGGACAAGTGACCAAAAAGATAAGTACACTATGGTGACATAGGTAGCCAAATAATTTCTTTTAAACCTTTCCGCATGCACCGTCACATACCATATTTCCTAAAACTAGGGTGTTACA

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

215

Start:

2108383  

End:

2108597

Strand:

-

>scaffold12_LTR-Cassandra_54

TGTAACATCCCGACCGTCACATTAATAGGCCCCACGTTCTCATCCGGCCTGTGGGTCAACCTTACCTGTTCGACTGTCAGCACATTAAATTCAGGAGACTTTAAAGACTTGTTTACCGATCCTACAAATCACCACATGATATTTCCCTGTGTTTTTTCCTTACTCATACGGTTCCAAGAATCACTTTCTCGAAGGTCACCTATCCTTTATCTACT

ID:

scaffold12_LTR-Cassandra_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

156

Start:

2112756  

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2112911

Strand:

-

>scaffold12_LTR-Cassandra_55

CTATTTCAACTCAAGCACGCTTAATCCTGGAGTTTTCTCTGGACAAGTGACCAAAGAGATAAATACACTTTGGTGACAAAGATGACCAAATTAATTCTTTTAAACTTCTCTGCATGTACAACCATATATCATATTTCCTAAAACTAGGGTGTTACA

ID:

scaffold121_LTR-Cassandra_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

367

Start:

34882  

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35248

Strand:

+

>scaffold121_LTR-Cassandra_56

TGTAATACCCCTATTTTTTGAAAATATGATATATGGTGGTGCATGCGAAGAGGTTTAAAAAAATTGATTTAGCCATTTATATTACTAAAGTGTATTTATCTTTTCGGTCACTTGTCCAGAGAGAACTCTAGGATTAAGAGTGCTTAAGCTGGAGTAGTTAAAGGATGAGTGACTTTTCGAGAAGTGATTTCGAAACCGTGTAAGTGAGGGTAAAACATGGAGGAATATCATGTGGTGATTTCTAAGGTCAATAAACAAGTCTTTACAACCTACTAGACGTAGAGTACCGACCGTCAGGCCGGTAAAATGGGCATACAGGCCTAGAGAAGACGTGATGGCACATTAATGTGGCAGTCGGGACGTTATA

ID:

scaffold121_LTR-Cassandra_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

35249  

End:

35359

Strand:

+

>scaffold121_LTR-Cassandra_57

AGTGGTATAAGAGCTGAACCTAGACGTGTGTGAAGACAAAAAAGCTCACACCATTAGGGGTGACGATCTTGGTATGAAACAAGGACGTTGTGGTCTGTTAGTGCGGGTGAA

ID:

scaffold121_LTR-Cassandra_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

278

Start:

35361  

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35638

Strand:

+

>scaffold121_LTR-Cassandra_58

TGTAACACCTCGGTTTCTGGAAGATATGATATATGGTGGTGCATGAGGAGAGGTTTATGAGAATTGATTTGACCACCTATGTCACAAAAGTGCATTTATCTTTTTGGTCACTTGTCCATAGAGAACTCCGATGTTAAACATGTTTAAGTTGGAGTAGTTGAAAGATGAGTGACTTTTCGGATAGTGATTTTCGGAATTATGTCAATGAGAACAAAACACGAAAATAATATCATGTAATTATTTGTAGCGTCGATAAACAAGTCTATAAAACCTGTCAG

ID:

scaffold125_LTR-Cassandra_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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363

Start:

559225  

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559587

Strand:

-

>scaffold125_LTR-Cassandra_59

TGTAACTTCTCGACCGCCACTTTAGTGGGTCTCATGTCCTCTCTAGGTTTGTGGACCCACCCTTACTGGTGCAACAGTCGGTACGCTATGTCCAAGAGGCTTTAAAGACTTGTTTACCCTACAAATCACAACATGATTTTTCCCCTTGTTTTGTCCTCACTCACACAGTTCCGAAAATTACTTCCCGAAAGGTCACTCATCCTTCAACTACTCTAACTCAAGCACGCTTAATCTTGTAGTTCTTTCTGGACAACTGACGGAAAAGATAAGTGCACGTTGCTGACATAGGTGGCCAAATTAATTCTTTTAAACCTCTTCACATACATCACCATATATCATATTTCATGAAACCAGGGTGTTACA

ID:

scaffold125_LTR-Cassandra_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

559588  

End:

559698

Strand:

-

>scaffold125_LTR-Cassandra_60

ATTCACCCCCACTAACAGACCGCAATGCCCTTGTTGCGTACCAAAATCATCACCCCTTGACAATGTGAGCCATTTGGTCTCCACACATATCTGGGTTCGGCTCTGATACCA