ID:

scaffold101_LTR-Cassandra_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

344

Start:

3131495  

End:

3131838

Strand:

+

>scaffold101_LTR-Cassandra_21

TGCAACACTCGGATTTCAGAAAATATAGTATTGATGTATGCAGAGAGATTTTAAAAATAGATTTGACCACATATGTCACCAAAATATATTTATCTTTTCGGTCAATTATCTTAAGAAAACTTCACAGTTTAAGCGTGTAGTTAGTTAGGTGTAATTTCGCAAAGTGATCTCAGAACTATGTGAATGAGGACATAATACAGAGAAATATTATGTGATGGTTTGTAAGATCGGTAAACAAATATTTAAAACGTTGTGAATATAGCATACTGATCGTTGGGTAAAAGTGGGCCCACAAACCGAGAGAAAACGTGGAGTCCATAAAATTGGCGGTCAGAGGCTTTACA

ID:

scaffold1022_LTR-Cassandra_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

160318  

End:

160672

Strand:

+

>scaffold1022_LTR-Cassandra_22

TGCAATACTTCGCCTTCGAAAAATTTGGTGGTGCATGAAATTTTAAAAAAAAATTAGTTTGGTTACTTTTGTTATTCTAGTGCATTTCTTTTTCGGTCAAACATCCTAAAAAACTTCATACTTAAATGTGTTTAAATTGGTCAAATTTAAGAATGAGTGATTTACTAGAAATGTGTTTTTGGTGAACGATCTATTATGTGAATAAAGATAAAATACTAAAAAATAATTATGTGGTGACTTGTAGAATTAGTAAATAAGTTTTTGAAGTCTCCATAAATACTAGCCGTCGTAATAATGTGGGCCACGGGCCCAGTGAGAACATGAGATCCACTAAGGATAGCGGTGAGAATGTTAC

ID:

scaffold106_LTR-Cassandra_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

146

Start:

14638  

End:

14783

Strand:

+

>scaffold106_LTR-Cassandra_23

TGTAAAACCCTCTAATTTAGAGAAATATAGTCGTGAATAAGGACAATTTAAAAGAATTGATTTGTCCACATACATCATCAAAGTACAGTTAACTTTTCCGTCAAACATGCTGTGAGAGAATTCTACAATTAAGGATGTTTGAACTG

ID:

scaffold106_LTR-Cassandra_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

270

Start:

1402791  

End:

1403060

Strand:

+

>scaffold106_LTR-Cassandra_24

TGCACTTATCTTTTTGGTAACTTGATCAGAGAATTCTAGGGGTTAAACATGCTTAAATTTGAATAGTTGAATGATAGATAATTTTTCAGAATGATTTTTGAAACTGTGTGAATAAAGACAAAACACGAAAAAAAATCATATGGTGATTTGTAAGGTCGATAAATAAGTCTTTAAAACCTCTTAGATGTAGCGTGCCGACCATCGAGTACAAAAGGGCCCACATGACAAACATGATGTGGGCCTATTAAAAATGGCGGTCGGGACGGTACA

ID:

scaffold106_LTR-Cassandra_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

282

Start:

1407792  

End:

1408073

Strand:

-

>scaffold106_LTR-Cassandra_25

CCGACGGTAGGTACACTATTTTTGGAGGTTTTAAAAACTTTCGATTCTATAAATCACCACGTAATATTTTTTCTTTTTTTTGTTTTCATTCATATGGTACCAAAAATCACTTCACGATAGGTTATCCATCCTGAAATTTTCCTACTTTAAGCACGCTTAACTGTGAAATTCCCTCGGGATGTTTAACCGAAAATATAAGTGGACTTCGATTGTAGAGGTGGTCAAATCTATTCTTTTAAACTTTCTTCATGCACTACATATTTCCCAAATCGGAGTGTTACA

ID:

scaffold106_LTR-Cassandra_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

339

Start:

2168778  

End:

2169116

Strand:

-

>scaffold106_LTR-Cassandra_26

TATAACGCCAAGAACCGTCATTTTAATAGGTCCCATATTTTCTCTAGACATGTAAGTCCACCTTATTGGTTGAATAGTTGGTACTTTATATTCAGAAAGTTTTAAAAATTTGTTATCGATTCTACAAATGTTGTACAACATGATATTTCTATGTGTTTTGTTTTTACTCATACGATTTCGAAAATCATTTTCTGGAATGTCACATATCATTCAACTACTCGAACTTAATCACATTTAATTTTAAAATTTTCTCTGGACAAGTAATCGAAAAAATAAATGTATTTTGGTGAAATAGGTGGTCAAATCAATTTTTTAATCATGTCTTTATGTATTACCATA

ID:

scaffold106_LTR-Cassandra_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

291

Start:

2729727  

End:

2730017

Strand:

+

>scaffold106_LTR-Cassandra_27

TCAGGAATATTTCCTGCTGCATGACGATAGTTTAAAAGAATTACTTTAGTCACTTACGTCACCAATGTTCTTATTTTTTGGTTAAACATTCTAGGAAAATTTTAGAATGGACGACTAGGAAGTGATTCTCACTATTGTGTAATAGAGAACAAAACACATAAAAAGATTACGTGGTAATTTGTAGCACCAGTAAATAAGTTTTTAAAACTTTCAGTACAGACCGTAAGGAAAAAGTGGTTCACGGACTAGAGAAAACATGGTGCCACTAAAAATGACTGTCGGAATGTTACA

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

218

Start:

162888  

End:

163105

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_28

ATGTTTTGTTCTCACTCACACGATTCAGAAAATCATCTCCCAGAAAGTTACTCATCCTTTGACTACTCCAACTCAAACACACTTAACTTTGAGTTTTCTCTAGACAAAAGACCAAAAAGATAAGTGCATTTTGGTAACATATATGGCCAAATCAATTATTTGAAACCATCTCTGCATGCACCACCATATACCATATTTCCAGAAACTGAGGTGTTACA

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

113

Start:

163106  

End:

163218

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_29

ATTCCTCCCTACTAACAGACCGCAACGTTCTCGTTGCACACCAAGATCGTCACCACCGATGGTGTGAACCCTTTTGTCTCTACACACATTTTGGGTTCGGTTCTGATACCACT

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

370

Start:

163219  

End:

163588

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_30

TGTAACGTCCGGACCGCCCCATTAATCGTCACCACATGTGAAGACATGGCCCGTGAGCCCACCTTACCGGTCAAATAATCGGTACACTACGTCCAAAAGGCTTTGAAGATTTGTTTACCAACCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCTTGTGTTTTCTTCTCACTCACACGGTTCCGAAAATCACTTTTTGGAAGGTCACCCATTCTTTGACTACTCCAACTCAAGCACGCTTAACCTTGGAGTTTTCTTTGGACAAGTGACTGAAAAGATAAGTGTACATTGGTGACAAAGGTGGCCAAATCAATTCTTTTAAACCTCTATGCATGCACCACCATATAGCATATATTTTTGGAAACCGGGGTGTTACA

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

330

Start:

850868  

End:

851197

Strand:

+

>scaffold110_LTR-Cassandra_31

TGTAACACCCCAATTAAAAAAAATATGGTGGTGGACACAAAAAAGTTTTAAAACAACTGATTTGACACTTATATTATCAAAATACATTTATTTTTTGGTCAAACATTATAAGAAACCTTCACAGTTAAGCGTACAGTATGCTGGAGCAATTTAAAGATAAGTAACTTTTGAGAAAGTCATTCTCGAAACCGTGTAAGTAAAGAAAAAATATGTAAAAAATCATCTGGTAATTGTAGGGTCGGTAATCAAATCTTTAAAGTTTTGTACGGACATAGCCTACCGGCTATCGGGTAGAAAAGTAATCCAATGAGCCGAGGGAAAACGTGGGGC

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

137

Start:

1907148  

End:

1907284

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_32

GTCACCCATCATAAACATTTTCCAGCTCAAAAACGTCTCAAAATGTTTAATCAAAAAGATAACTACATAAGTAGTCAAATCAATTATTTTAATTTTTACTCATACACTACCATATTTTTTAAAATCGCGATGTTATA

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

366

Start:

2239394  

End:

2239759

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_33

TGTAACGACCTGGCCGCTATTTTAATAGGCACCACGTCCTCACCGATCGGTGATGCCCACCTTACCGATAGAATAGTCGGTACACTGCATCCGGGAGACTTTACAGACTTGTTTACAGACTCTACAAATCACCACATGATCTTTCCCCGTGTTTTTTCCTCACTCACACGGTTCCAAAAATCACTTTTTGGAATGTCACTCATCCTTTGACTACTCCAGCTCAAGCACACTTAATCTTGGAGTTTTTTCTAGACAAACAACAGGAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATATATGGCCAAATCAATTCTTTTAAATCTCTCCGAATGCACCACCATATATTATATTTTCTGAAATAGGGGTGTTACA

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

112

Start:

2239760  

End:

2239871

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_34

ATTCACCCCCACTAACAGATCGCAACGTTTTCATTGCATACCAAGATCGTCACCCCCAATGATGTGAGCCCTTTTGTCTCCACACACGTTTTGGTTTGGCTGTGATACCACT

ID:

scaffold110_LTR-Cassandra_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

370

Start:

2239872  

End:

2240241

Strand:

-

>scaffold110_LTR-Cassandra_35

TGTAATGCCCCGACCACCACATTAATGGGCCTCTCGTCCTCACCGGCCTGTTGGCCCACCTTACCAGTCGAACGGTCGGTATACTACGTCCGAGAGGCTTTACTGACTTGTTAATTTATAGACCCTAAAAATCACCACATGATCTTTTTCCGTATTTTGTCATCACTCACATGGTTCTGAAAATCACTTCCCGGAAGGTCACCCATCTTTTGACTACTCTAGCTCAAACACGCTTAACCCTAGAGTGTTTTCTGGACAAGTGACCGAAAAAATAAATGCACTTTGGTGACATAGGTGGCCAAATTAATTCTTTTAAATTTTTCGATATACACCACCATAATATTATATTTCGTGCAATTGGAGTGTTACA

ID:

scaffold111_LTR-Cassandra_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

345

Start:

1548249  

End:

1548593

Strand:

-

>scaffold111_LTR-Cassandra_36

TATAACGTCCTAACCACCACCCTTAATGGCCTCACATCGTCTCTCGGCCGTTGTTTCACCTTCACCGGACAACCGGTTTGCTAAGTCTAAAGACATTAAAGACTTGTTTACCATATTACAAATCACCACATGATCTTTTCTGTGTTTGTTCTTATTTACACGGTCCCGGAAATTATTTCGCAGAAGATCACATACCTCTCAACTAATTTAATTCAAATGTTCTTAACCTCGGCGTTTTCCTAAACAAGTGACTGAAAGGATAATTGTATTTTGGTGACATAGGTGACCATTTCTCTTAAATCTCTCTGTATGTACTATTATATTTTCTGGAAGTGGCATATTACA

ID:

scaffold111_LTR-Cassandra_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

263

Start:

1674814  

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1675076

Strand:

-

>scaffold111_LTR-Cassandra_37

GGACTCGTTGGTCCATTTTTTTACCTGATGGTCGGTACCCGAGAGAATTTAAAGATTTATTTACCAACCCTATAAATCACAATACGATTTTCTATCGTGTTTTTTCTTAATTCACATGATTCCAAAAATTATTTTTCGGAAAGTCACCAATCATTTAACTACTCCAACTCAAACATGCTTAACTCTGATATTCTCTCTCAATAAGTGACCGAAAATATATGTGCATCTTTTTACAAATGTGGCCAAATCAATTATTTAAAATC

ID:

scaffold111_LTR-Cassandra_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

213

Start:

1754876  

End:

1755088

Strand:

-

>scaffold111_LTR-Cassandra_38

CTTTAAATATTTGTTTATAGCCCTGTAAATCACCATCTAATCATTTTCTATGCTTTGTCTTTACTCACATAGTATTAAAAATAATTTTCCAGATTTCTTTTCACCTCAATTACCCTTAAATGTGGAGTTTTTTCAAAATATTTCACCAAAAATATAATGGCGCTTTAACAACATAGATAGCCAAATGAATTACTTTAGACTCTCCGAATGCAC

ID:

scaffold111_LTR-Cassandra_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

329

Start:

1781025  

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1781353

Strand:

-

>scaffold111_LTR-Cassandra_39

TGTAACGTCCCGACCGCCAATCTAAATAGGCTCCACGTCCTCTCATGAATCATGGGCCCACTTTTTTATCCGACGGCGGTATACTATATTCCGGAGAACTTAAAAATTACCATACGATTTTGCTCAGTGCTCTGTCCTCACTTTTTCAAGAATCACTTACGGGAGATCACTTATTCTATAACTACTCCAGCTCAAGTGTACCTAACCCTAAAGTTCTTTTTAGATAAGTGATCTAAAAGATTAATATATTTTGGTAATATAAATGGCCAAATGCAATCTTGTAAAATTTCTCTACATGAAATACCATATTTTCTAATATCGGGATGTTA

ID:

scaffold111_LTR-Cassandra_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

231

Start:

2228302  

End:

2228532

Strand:

-

>scaffold111_LTR-Cassandra_40

AGATTTTAATGAATAGTTACAGATCCTATAATCATCATGTTATATTTTTCGTATTTTACTCTTATTCACGCGGTATTAACTATCATTTTCTAGTAGGTCACTATTTTAAAATTTTCTCAGCTAAAACACGAGTAACTATGAAATTTTGTTGGGGTGTTTGAACGAAAAAATAAGTACACTTTAGTGGTATAGATATCTAAATCAATTTTTAAGCTTTCTTCATGTATTATC