ID:

Contig00855_LTR-Caulimovirus_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

987

Start:

28695  

End:

29681

Strand:

-

>Contig00855_LTR-Caulimovirus_41

CATGAAAAACTGTAGATCTTCATCAAGGCTCATATGATAATCAATCGAGTAGTACGACCAATTTGGGGTAAAAGGTATGGCGAATGCTTGTCTGGCGTTGTTAAGACGAAAAGCATGAGTTTGGAAATCTTCATATGGCTTGTTATCATGAACATTCAATGCTGGTCGGACTCCTCTGTAGAAGTCATTATGATGAATGAGATTTGGTAAGGCATGAAGTTTACCAGACTTCTTGTTGACTTGGACGGGACGATGGAAGAAGTAGATGGTGTGAGGATTAAAGAACGGGTTGAGAGCTCCTCCTTTTTTGAGTTTTTTGAAAGGCATGCCCCTTGCTTTTGCAGATCTTCTAAGTTTTCCATTCCATATGGTGTGAGGGAAGAAAACCATGTTAGAAAGGTGGAGAAGCACTCTTTTTCGCTATGTTGAGCATTGACGTATTGATAGAGCCACTGGATATCGAAAGTGATGCCAATTGTATGAACTGAACAGAGATACCAGAGGAAACATAGAACTTCTTCAGGCATGTAAGTGCTTTCTATTCTGTAGAGGTGAGCGTATGGATGATCAGGGTAAATGCCCATAGGTGCAATGTAATGATTGTTGATTCCATATCTCGACAAGATTATCGATTGGTATCTGAAGACTCTGTGGTTGAGATGCTCGTGGAGGACACCTCTTTTGATTAGATCATGAGCGTCTTCTGGCATGTTTGCTTCGAAGTCATAAAAGCTTTTTTCTGCAGATGATGAACTTGCCATCATATGAATTTCTTTTTGAGTTTCTTTGTGTGGGCTTCTGCTGAGCATGTCTGCGAGAGTGTTCTTCGTACCCTTTAAATAGAAGTATTTGAAATCATACTTCGAGAACCATTCACTCCATCTCAATAACTGTTGATGTGGGACCATCTTTTTCTTGAATTGTAGCATCTTTGGAAAAGAAGACATGTCCATTTCGATGCGAAATTTATGTCATACCAAATCGAAT

ID:

Contig00855_LTR-Caulimovirus_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

82

Start:

29673  

End:

29754

Strand:

+

>Contig00855_LTR-Caulimovirus_42

AAATCGAATATGTCCCTGGAGATCAACTCCCAGAAACAACCCTCCCTTTAGTAAATCCTTATGAATACTTCTCTAAAAAGTC

ID:

Contig00855_LTR-Caulimovirus_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1519

Start:

29826  

End:

31344

Strand:

-

>Contig00855_LTR-Caulimovirus_43

CAAAAAGACTCAAGTATGTATCGGCTCGCGATTGGTTGTGAACCATACTTTCTAAACTTCTTTTTAAATATCTTAGCTGATTTTTGAGACTGGTTGTTTCTGCTTCTTTGCTCTTGAAGGAAGACATATTTACCATCATGTGTTGAGCCATGGTCATCATTTCTTGGTGAAGGTTGTTGAGTCGTCCATGGATCTCCATTATTGAACTCTGAAGGCTGCTTAATCTTTTATTATTGCTGTTGGCGAATTAATCAAATTTGTGGTTGATCGTTGTTAGCAGCTGATTCTGAGCCAGAGCGTTTTCCGTTTGCCAGTTGAGGACTTTTTCCCCTTGGCTTAGCTGGTCAGGACCGGAGGAGTTGATGGCTTTTGAAAGGATTTTTGGAGTATGAGTGATATTGTCTTTGACAAAATCTTCAGGAGGGGGAAAATCACTTTCTTGTATCATCATGAGTCTGGGCTCATCTCTTTTTTTTTCTGAGTATTGGACAATAAACTCGTATTTTTCTCCTTCGCCTAGTGGTCCGACTGTGGGGTCACCTTCGAGATACCTCTTGTATAGTGGATCTTTCTTTTTTCTCCTTCTTCTCCGTATATCTTCGTCAGATTCGTATAAGTCTTCTGTACATGCTGTGCAGGAACAAACATCAAAGTATTGATGTTCATTTTCGTCCATGAATGGATATACGACTGATCCATCTTGTTTGAACGAGATTGGTTTTGGAATCTGCTCCTTTGCTGGACCATAGAACATATCTTCGTCAATTTGTATAGCAAATTGAGTGAATAGTTGCTTCTGAAACGAAGATGTTCTTGGTTTTTCAAACTTGATCTCCGTAGTCCCATCACTCCGAGATTGGAAGCTGACTTCTGACGTCTGAATAGGTGATTGTGCTGCTTGTGGTGTAGCTTCTCATAGCTTGTTACCCAAGATTCTGGTAATCTCTTGAGTAATTCTTCACGAGTAATTTTTCGGGGAATTTGGGCTGAATTCGGTGCTTGAGATGCAGAGGTCACTTCCAGGTATAACACGTCATCTGAGGAGGGAAGTGAGAGATCTAAAGCATGATCTTGGATCCGGTAGACTATTTTATGATGTAGCGTCGCTATTACGCTCTTATCTTGCATAGGTGCTCCTATGAGCTGTAGCTGGACTTTGAGCGTTTGTAGCAGATTTGGATCCGCGAGTGAAACATTAAAGTTAGGAAACAGTGTTACAAATACTGTTCCAGCGTTTAATGTTGTTTGGACTGTTCCGATGCAAGCTTGTTGGTATGACTTTAATCTTGAGTCGATTAATGCCATTCGAGCAACAACGGGCAGACCTTTTCGAGCATGTAAGGTTAGCCCAAGGCGAACAACTCCAAAGTGGAGATGTGTGTATCCTTGTTGTTGTCATAGTCTTGGTAGATTCTCCGGGATGTTGAGCGAGATAAACTGTTCTTCTTCTGTAGCTGGAACTTGGCAGGAAGAGAATTTGCTTGATTGCACATACTCTAAAACTCTTCTGCTGGAAGGT

ID:

Contig00855_LTR-Caulimovirus_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

159

Start:

31419  

End:

31577

Strand:

-

>Contig00855_LTR-Caulimovirus_44

CTTTTACTTTTAGGTAAAGTAGAAATTGCAAACTGGGAATCGATCATTTGAGGGTTGGAATTTGCCATAACGAAGGTTTGTTTTCCAGAACATTCAATAACAATCTATCATAAATAATGATTTATTCAATTATTTTTGCAAGAATTGGCTCTGATACCA

ID:

Contig00855_LTR-Caulimovirus_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

627

Start:

31588  

End:

32214

Strand:

+

>Contig00855_LTR-Caulimovirus_45

GCATGAAGTCTATCAAACGACAGTCCCACTACTGTTAGGAGAAATTCATAGAGAATTCATCGGTACACCTACCCACCTAAAAGAACTACTGCAAGAAGAATACTTCACTGCAAAATGTTGTTCGTTGAAGAAAAGAGATTTAGCAAAGCACTTCGAAAGACAAACAAAGAGATACTACGCCCTTGATGGTCTCAACAATCCAAGCCTAAAGCAAGTGTATCTCTCCTCGATCGACGACTATCTTAGTCAACAAACCAAGCTGTATATCAGAGACCAAGGTCAAACAATAGAAGAAATTTCTATTGGCAAAATCCAACAAAACGTCTTCAGGACACTCGATAAGCTTTGCAAGCAAAAGGAATTCTGGATGGAATTCATGGACAAGTCCAAACAATTATCCAAAATTTGTGCAAGGTCAGATCTGAATATCAAGTGTTCTAAGTCCAAGAAGGCTTGTTCATGCGTCAAACGACACAAGTCAAGGAAGTTCAAAAAGCCATTCCACAAGCGTTTTAACAAGTTTAGACGCAGGAGGTTCTTCCGAAAAAAGAAAACTACAAAGTGTTTCTTGTGTCGCAAGGAAGGACATTTCGCGAAGAATTGTCCAAACAAATCGAAGAAGAAGAA

ID:

Contig00965_LTR-Caulimovirus_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

532

Start:

31334  

End:

31865

Strand:

-

>Contig00965_LTR-Caulimovirus_46

TTGATTGTGTGAGTTTCGGCTCTCACAATTATTAATTCCCTTACCTTTGTGTAATTTTTCTAATCTATTTGCAATTGATTTTAAAATTTCATTTTCAGGATATTTGACTTGTCTAGTTATTGGTTTGGTTACAGATGAAAATGGATGTTGAATATTTTGATTATACTGATCCATTTTATTATTTTCATTAATATTTATTTTATTGCCTATATTGTCTACTTTTTTAGAAATTGTATATAATAATAGACTTTGATAAAAATTTGTTCATATATTGATTAAATATCCTATATTATTACTTGATCTTTGTCATTTCTATTGGTCCCAGTTTTAATTGGTATGACAATAATATAGCGGTTGGTAGTATATATTTTTAGATCCTTTAATGTTGGATGTACTGATTTGATTTTATTTCCATCAACTTGTTCCCAAATTTGGTATAAGGATGAACTTGTATTAATTTTTTAAATCGATAATTAATGTTAAGTGTGATTGAGTATTTTTCAAACCATATGAAAAATGGGATAATTATTTC

ID:

Contig00965_LTR-Caulimovirus_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1061

Start:

31863  

End:

32923

Strand:

-

>Contig00965_LTR-Caulimovirus_47

TTCAGCTATGGTTGTTTTAAATTTAATTGAATTGTCTTGTTTAATATTCTGGTTTACACTTTCTGTTTTCGAATCTGCACTAGATTGACCAGTACGAAATTCAGAAAAAGAGGCTCTTGAAAGAGCACGATATTCAGAAAATGAGGCTCTTGAATGATATGAACTAATCCTAGGTGGAAGTGGTCCGCTATATGATCTAAGTTGTAGTAATACATATCCATCCATTTGTTCAAAAATTCTAGGAGATAGAGTTATTTTGAGTTTCCATTGATTTGGAATGGTTATTTCATTCCATATCGTTATTCCTTTACTGTTTTGTAATAAACATATGGGGTTAAACTCAGATGTTCATTGTTTAAAAAATAAGATAGAATAGTAAATATCCATGTCGTTCATTTCGGAATTTCATTTATGGTAAATGAACAATTAATACTAAAGTATTGAGTATATTTGGATCATGTAAGCTTATTTGAAAATTATGAGTGCAGTTAAAATAAACTGCTCCATTACATAGATTAGTTTGAACTGCTCCTAGAAGCAAATCCTCCAATTTTAATAGAGTTTTATCGCTTTATAACATGAGTATTGGTGAATCAATACCGGTTCATGATAAAGGTTTTATTGTTGTTTGAATAAGTCCAAAATGGATATAACTAAATCCCTTTTGCTTATATTTATATATAGTGATTGATGATAATAATCTAATTTCTTCAAACTCATTTTGAAGAGATAGAGTTTGCTTATGCTCTTTGGTTACATAAGCTGTTTTAAAGTTAGAAGTACTAATTTGATATATATTTTCTGGATTGATATGCGGTAATTGGTTTTTTGATATTTCTTTATTAAATGAGGTTATTTTGACATAATTTCTCTTGAACTAATAGTTGTATGAGATGTAGAGGCTGCATGTCTTCATTTAAAAAGTTTTCTAAACGATGACGCCATGACTTATTATGGGTTTAAACTCATGCTAGAAGAGATACTCACCAGATCTAGGTCAACACAACTATGGCTTGCCAACGGTCTTACTGCCTCAATTAGGAATTGTTGCATGGAGCACC

ID:

Contig01036_LTR-Caulimovirus_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2825

Start:

51338  

End:

54162

Strand:

+

>Contig01036_LTR-Caulimovirus_48

TTTAATAATGAAATATCAAAAAATCAATTGCCTCATATTAGTCCAGAAAATATATATCAAATCGGTACATTTGATTTTAAAACAGCATATGCAATAAAAGAACATGAACAAACACTCTCTTCAAAATGAATTTGAAGAAATCAAACTATTATCATCAATTGCTTTAGAAAAGTATAAACAGAAAGGATTTAATTATTTTCATTTCGGACTAATTCAAATAGCGATAAAACCTTTATCAAGAACTGGTATCGATTCACCAATACTTATGCTATTAAGAGACAAAACTTTATTGAAATTTGAAGATTCGCTCCTTGGATCAGTCCAAACAAATCTATGCAACGGGGCAGTTTATTTTAATTGTGCTCCTAACTTTCAAATAAGTTTACACGATCCAACTATACTCAACACTTTAGTCCTAAATGTTCATCTACCTGAAATCAAATTTCAAAATGAACGACATGGATATTTATTACTCTATAGAATTTATTTTAAACAATCAACATCTGAGTTTAACCCAAGATGTTTATTACAAGATGATAAAGGAGAAACAACAATTTTAGCTGCACATAGTAAAGATACTCCAACAGCTACTTACGCACCTAAACAATTAAAATGGAATGAAATAACTATTCCAGATGAATGGAAAATAGAAATAACACAACCACCTAGAAACTTTGAACAAAAGAATATATCAAGAATAATTGAACAAATAGATGGGAAAATACTATTACAATTTTGATCATGTAAAGATCCACTTCCACCAAGAATTAGTTCGTATTATTCAAGAAGTTCTTTTAATGAATATTGTGCTCCTTCAAGAGCATCATTTTCCGAATATAGTACTGGTCAATCTAGTGCAGATTCGGAAACTGAAAGTGTAAACCAAAATAAACAAGACAATTCAGTCAAGTTTAAAGCACCAATAGCTGAACCTGAAACTGTATATCCAACTTCTCCTACACTATCAGAATTTAAATCCATAAATGTTATAACAAAAGATTATGAGATTGATAAACAATACATTAAAGAAGATTTTTATTCTAAAGAAAATGAAGAAAAACGAAAATGGTATTTCACAACATTTTCTAAACAACAAACCATAGAATTTAGAAAAAAATGGTATGATTGTATGTTACTAAAAGAAATTAATATTCCATTTTTTATATGGTTTGAAACTTATTCAATAGCACACGATATTACTTATCCATTTAAAATAATTAATGTAAGTTCATCACTAAATCAATTATGGGAACAACTATATGGAAATAAAATTAAATCTGTACATCCTCCATTCAGTGATCTAAAAATAAATACAACCAACCGACATATTATTGCCACACCTTTTAAAACCGGGACCAATAGAGATAACAAAGATCCAATAATAATGCAAGATATCAAATAATTATATGAACAAAACAATTATCAAAGTCAAATATTATACACAATCTCTAGACAAGTAGATAATATTGATAGAAAAATAAATACTAATGATATATTAGAACATAAGGACCCAACTATTCAACATCCTTTCTCATCAATATCCACACCTATCTTCAAAACTGCAACACGACAAATTAAATATTCAGAAAATGAAATATTGAAATCAATAGCAAATAGATTAGATAAACTAGACAAAGGAAAAGGGATCAATAATATTGATGAAAATGATGATGCATCTAGTGCATCTAGTCAAACATCTATATTATCTGAAAGTGATAATCAAGAAATTAATCGAATAAAAAACAAAATAATGAGATCTAATAATATGAAATCAAGAAAACCATATTATAATCGACATTCTCCACCCGATTTATTATTTGAAGAACACCATAAATATTCTCATAATATATATACTGGTGATGGTATATATGAATGGAATATTGATGGACGTTCTGAATACGAAATAATGAATTTATTTCAAGAAATGAGAATGACAACAATAGCATATAAAGCTAGAGGAAATACTGATAAACAAGCATGTGTAATGATAATAACAGGATTTAATGGAACATTAAAATATTGGTGGGATAATTCACTAGATAAAATTACTCAAGATTCAATAATTAATCATGTAGAAATAAGAAGAGTAGAAAATGAAGATGGTCTATATGAAGAAGTAGAACACCAAAATACCGTAGAAGTATTAATCCATACTCTAACCATGCATTTTATTGATAATCCAAATGAAGAATTAGAAAGTAAAAAAATTGTATTAACAAATCTAAGATGCCCTACATTAGGAGATTTTAAGTGGTACAAAGATATATTCGTAACCAACATATTTCAAAGACATGATTGTAATCAACCCTTCTGGAAAGAACGGTTTATCTCAGGATTACCGTCTTTCTTTGCAGAAAGAGTAATCAATAAATTAAAAGATTATTCCGGAGGACAACCAGTCCCTTGGAATTCAATCACTTATGGTCAATTATTTGCATTTATTAAAAAAGAAAGATTAGCAATATGTCAAGAACATAAAGATAAAAAAACAAAAAGACAAATTTAAATTTAAAGAAACCATGGGTTCCTTCTGTAAACAATTCGGCTATAATGAACTTAATCCACCATCTAGAAGAAAACGATAAAAATATAGGCAAAGAAGAAATAACAACAAAAAACAATATTATGAAGATAAAAATTTTGACAAAAAACCAACTAATAAATATTATTCAAAAAATAAAAAAAATTATAAATCAAAGGATAAACAAAAAATTGTTTGTTGGAATTGTAAAAGACCCGGGCATAGATCTACAGAATGTAAAATGAAAAAGAAAATAAACGAAATATTCCAAGATCAACCAGATATCCAAGAAAAATTAACTAAA

ID:

Contig01036_LTR-Caulimovirus_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

156

Start:

60757  

End:

60912

Strand:

+

>Contig01036_LTR-Caulimovirus_49

GAAAAATTAACTAAACTATTAATATCAAAAACAGAAGAATTAGAAGAAACCAACAGTGAATATTCAATCAATGAAATAGAAAACTCTAGTACTTCTTCAGAAGAATCTGAAGAATTATCTGATAATTTATGCAATTGTAAAATGATCAATGTAATA

ID:

Contig01036_LTR-Caulimovirus_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3335

Start:

60983  

End:

64317

Strand:

+

>Contig01036_LTR-Caulimovirus_50

AGTATTTATTAAAATTAAAAGATATAGTATGTCAAGAAAACCAATTGTCTACACCTCAACCATTTAGCTTAAATAAAATATTTCAGAAATATCCAACTCAAATTTTATTTAAGCAACTAACTACTGGAGAATTATAAAACGAAGTTAAACAATTAAAATCACAAATTAAAGATTTGCAATTAATAGTCAATCAACAAGAATTAAAACATCTACAAATGGATGCTCGATTATCATTGATAGAGTCAAAAAATAATAATCAATCATCATTTAGTAAACAAATCATAAAAGATATAAATAAGCAAGAATCATCTGATGATGAACAATATATTGAAATAATTAATAAAATAAGTTATCAAAAATGGTACACTAGCATTACTTTACACATAGTCATAGGTCATGAATTTAAAATAGAAGTAATAGCCTTAATGAACACATGAGCAGATTATAATTGCGTCCGTGAAGGAATAATACCTACAAAATATTATGAAAAAACTACGGAACGCTTAAGTGGTGCTAATGGAAGTAATTTAAAAGTAAAATATAAATTACCATGTGCTAAAATATGTAATCAAGGATATTGTTTTAAAAACTAATTTATCCTAGTACAAAACCTTACACAAGAAGTAATATTAGGTACACAATTTTTAGACAAATATATCCATTTAAAGTAGCAGAATCAGGAGTAACAACGAAAGTAGTCGGTACAAAATTATCATTTAAATTTTTATCTCCAATGAAAACTAAAGAAATTTTAAGTCTACAACAAAACACTATTCAAAACAATTAATTTAATAAAAGGCAAATAAAATCATATTCAATATTTACAAGATGAAATAACAAATAAAAAAATAGAAGAACAATTATCTACACCTTATGTAATAGACAAAATTAAAACAATAGAAAAAGAATTATTAATTCAAGTATGTTCGGACTTACCAAATGCTTTTTGGGAGAGAAAACAAAATTCTGTTGAACTCCCCTATATAAAAGATTTTAACGAGAAAAATATACCAACCAAAGCACGACCTATTCAAATGAACAAAGAATTGTTAGAACATTGTAAACAAGAAATAAAAGATCTATTAGACAAAAAAACTAATCAGACAATCCAAATCTCCTTGAAGTTGCTCAGCTTTTTATGTAAATAATCAAGCAGAAAAAGAACGTGGAGTACCACGTCTAGTAATTAATTATAAACCACTAAATGACGTATTACATTGGATTAGATACCCAATACCTAATAAAAGAGATTTATTAAAACGACTATATAATGAAAAAATCTATTCAAAATTCGATATGAAGAGCGGGTTCTGGCAAATACAAATTGCCGAACACGATAAATACAAAACAGCATTTACTGTACCATTCAGACATTATGAATGGAATGTAATGCCGTTTGGATTAAAAAATGCACCCTCTGAATTCCAACATATAATGAACGATATATTTAAGAATTATTCAAAATTCATTATTGTCTATATTGATGACGTACTTGTTTATTCAACATCAATAGATCAACATATTAGTCATTTACACACATTCTTAAATATAGTTAAAAAACACAGTTTGGTATTATCAGCAAAGAAAATATATTTATTCCAAACTAAAATAAGATTCTTAGGACATAATATATACCAATGAACCATTACACCTATTTCAAGATCAATTGAATTTGCAGATAAATTCTCAGATGAACTAAGGGAAAAATCGCAATTACAAAGATTTTAGGATGTCTAAACTATGTTTCAGACTTCCTTCCCAATCTTAGAAAAACAATACAGCCATTATTTCAACGACTTCAAAAAAATCCAAAACCCTGGACTAGTCAACATACCCATCTAGTCCAAGAAGTTAAACAAAAAGTTAAAACCCTTCCTTGTCTATCCATACCGAACCCTGAAGCAGATATGATAGTAGAAACAGATACTTCAGAAATTGGATATGGAGGAATTTTAAAACAAAAACTTCCAGGAGCCACCTATGAATCTATAATTAGATTTCATTCAGGTGTATGGTTAGGACCACAAAAGAATTATTCTACAGTTAAAAAAGAAGTCATTTCAATCGTAAATTGTATTTCTAAATTTCAAGACGATTTAATAAACAAAAAATTCTTATTATGAGTTGACTGTAAATCAGCAAAAGAAATTCTACAAAAAGATGTTAAAAATTTAGTCTCAAAACAAATTTTTGCCAGATGGCAAGCCATTTTATCAGTCTTTGATTTTGATATTCAATATATTAAAGGAGAAAATAATTCTCTACCAGACTTTCTAACAAGGGAATATTTACAGGGTAAAACAAGCAATCAACAAAATAGCCAAGATGAATGATCCAAAGAAGAAGAAGCCGATGACCGCATCGGACTATATCAAAAATCAACCATCTCTCAAAGGCAAACCCCTGACTATTCAAAACTCTTATTCAGCTCTTGCTGAATTCCCTCCACTATCTTATTCAAAAGCAGCAGCTACAGACAAAAATCAACCATCTACTTCAACATCAACGTCCCAACCACCTTCTCAAAAGACCGCTTACATCATAAAAGCCCACAAAGAACATATCATAACAACCAATTTCACTAAACCAATATCTTTAAAACAACTTCAAGACTTTGTTGGTCGATACCTATATGAAGATTGTCAGTATCCCACTGACAATGTAATCAAAAACCGAACATTTTATGAGTATATTCTAGTAGACTCTCTGTCTGCGGAAATTACCCACTACCCAGATAAATTAAATCCCAATCTCATATCCTACTCAACCTGTAAAATATTACGCATTTGTTCTATTCAAGAACTTAGTTTTATTCACCACCATACTATCAAACATTTCTCTATCCTAGGATATCATATCCCTGGCTATACCTACGTCGACTACCAACAAGCCTTTTTCCGTCTTTTTTACCTTAGACCGTATGACCGTTCATGGTTCATCTCCTTAGACCATAAATGCCCAAAAACTATACCAGGCTGGTTTTATGAATGGTGGCACTGGTTCGGTCCAACCTACCAAATTTACCCACCAGAAATTACCAAGACCTCTTTACCCTTTTATATTAAGCTTGCACCAAAAACCCCTATTCTACCTTTGACCAAGATAAGTTTTCACATAGACATGGGTATACCATGGATATGTTCGTGGCACTATAACCTCACCTCCTATCTACCAAATATGCCATATTCTCTCCTTCGGAAATTCCGAATTAAATGGTGGGACAAATATAATTTGGACCGCTGTTCTCTTACAAATATCCAAAAATATTTTCAAATCACTCAACAAGTAACGGACGTCGTCCGAACCGTATCCCAATCCATCACACTTCTTACCCC

ID:

Contig01066_LTR-Caulimovirus_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1061

Start:

22894  

End:

23954

Strand:

+

>Contig01066_LTR-Caulimovirus_51

GGTGCTCCATGCAACAATTCCTAATTGAGGCAGTAAGACCGTTGGCAAGCCATAGTTGTGTTGACCTAGATCTGGTGAGTATCTCTTCTAGCATGAGTTTAAACCCATAATAAGTCATGGCGTCATCGTTTAGAAAACTTTTTAAATGAAGACATGCAGCCTCTACATCTCATACAACTATTAGTTCAAGAGAAATTATGTCAAAATAACCTCATTTAATAAAGAAATATCAAAAAACCAATTACCGCATATCAATCCAGAAAATATATATCAAATTAGTACTTCTAACTTTAAAACAGCTTATGTAACCAAAGAGCATAAGCAAACTCTATCTCTTCAAAATGAGTTTGAAGAAATTAGATTATTATCATCAATCACTATATATAAATATAAGCAAAAGGGATTTAGTTATATCCATTTTGGACTTATTCAAACAACAATAAAACCTTTATCATGAACCGGTATTGATTCACCAATACTCATGTTATAAAGCGATAAAACTCTATTAAAATTGGAGGATTTGCTTCTAGGAGCAGTTCAAACTAATCTATGTAATGGAGCAGTTTATTTTAACTGCACTCATAATTTTCAAATAAGCTTACATGATCCAAATATACTCAATACTTTAGTATTAATTGTTCATTTACCATAAATGAAATTCCGAAATGAACGACATGGATATTTACTATTCTATCTTATTTTTTAAACAATGAACATCTGAGTTTAACCCCATATGTTTATTACAAAACAGTAAAGGAATAACGATATGGAATGAAATAACCATTCCAAATCAATGGAAACTCAAAATAACTCTATCTCCTAGAATTTTTGAACAAATGGATGGATATGTATTACTACAACTTAGATCATATAGCGGACCACTTCCACCTAGGATTAGTTCATATCATTCAAGAGCCTCATTTTCTGAATATCGTGCTCTTTCAAGAGCCTCTTTTTCTGAATTTCGTACTGGTCAATCTAGTGCAGATTCGAAAACAGAAAGTGTAAACCAGAATATTAAACAAGACAATTCAATTAAATTTAAAACAACCATAGCTGAA

ID:

Contig01066_LTR-Caulimovirus_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

533

Start:

23952  

End:

24484

Strand:

+

>Contig01066_LTR-Caulimovirus_52

GAAATAATTATCCCATTTTTCATATGGTTTGAAAAATACTCAATCACACTTAACATTAATTATCGATTTTAAAAAATTAATACAAGTTCATCCTTATACCAAATTTGGGAACAAGTTGATGGAAATAAAATCAAATCAGTACATCCAACATTAAAGGATCTAAAAATATATACTACCAACCGCTATATTATTGTCATACCAATTAAAACTGGGACCAATAGAAATGACAAAGATCAAGTAATAATATAGGATATTTAATCAATATATGAACAAATTTTTATCAAAGTCTATTATTATATACAATTTCTAAAAAAGTAGACAATATAGGCAATAAAATAAATATTAATGAAAATAATAAAATGGATCAGTATAATCAAAATATTCAACATCCATTTTCATCTGTAACCAAACCAATAACTAGACAAGTCAAATATCCTGAAAATGAAATTTTAAAATCAATTGCAAATAGATTAGAAAAATTACACAAAGGTAAGGGAATTAATAATTGTGAGAGCCGAAACTCACACAATCAA

ID:

Contig01073_LTR-Caulimovirus_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2983

Start:

15721  

End:

18703

Strand:

-

>Contig01073_LTR-Caulimovirus_53

CCACCATTCGTAGAACCATCCTGGAATAGTTTTTGGGCATTTATGGTCTAGGGATATGAACCAAGAATGGTCATATGCCCTAAGGTAAAAGAGACGGAAGAATGCTTGTTGATAGTCTACATAGGTAAAACCATGGATATGGTATCCTGGGGTTGAGAAGGGTTTCATAGTATGGTGGTGAATAAAGCCGAGTTCTTGAATAGAATAAATTCGCAGTATTTTGCAGGTTGAATAAGATATAAGATTAGGATTGGTTTTGTCTGTGTAATGAGTAATCTCTACAGACTTGGAGTCTACTAGAATATACTCATAAAAGGTACGGTTTTTGACTACATTGTCAGTCGGGTATTGAAAATCTTCATAGAGATATCTGCCAACAAAGTTTTGGAGTTGTTTTAAAGTTATTGGTTGAGTAAAGTTGGTAGTGAGGATATGTTCCTTTTGGGGTTTTAGGATGTAATTAGTTTTTTGAGAAGGTTGTTGAGCGATAGTTTGGGAAGGTTTTGGAGTATATGTTTGACCTTTTTCTGTATTAACTGCTTTTGAATAAGAAAGTGGAGGAAATTCAGCAAGTGTTGAATAGGAGTTTTGAATAGTTAAGGGCTTGCCCTGGAGAGCCGGTTGACTTTTGATGTAATCCGATGCAGTCATCGGTTTCTTCTTTTTCTGGTCATTCATTTTGATTGCTTGTTTTTCCCTGTAAATATTCTCTTGTTAGAAAATCAGTAAAGAATTATTTTCACCTTTAATATACTGAATATCAAAATCGAATACTGATAGGATGGCTTGCCATCTAGCAAAGATTTGTTTTGAGACTAATTTTTGACATCTTTTTGTAAAATTTCTTTTGCTGATTTACAATCAACACGTAATAAGAATTTTTTGTTTATTAAATCATCTTGAAATTTGGATATACAATTGACTATTGATAATACTTCTTTTTTAACGGTAGAATAATTCTTTTGAGGTCCTAACCAGATTCCAGAATGGAATCTAACTATGGACTCCGGGCTAGATTCCGATAGTTTTTGTTTAAGGATTCCTCCATAACCTATTTCTGAAGCGTCGGTTTCGACAATCATATTTGCTTCAGGATTTGGTATGGATAAACAAGGGAGAGTTTTAACCTTTTGTTTTATTTGTTGAACTAATTGGGTATGTGTATTTGTCCAAGATTTTGGATTTTTTTGTAATCTTTGAAATAAAGGTTGAATGGATTTTCTAAGATTGGGTAGGAAATCTGAAACATAATTCAGACACCCTAAAAATCTTTGTAATTGTAATTTTTCTTTTAGTTCATCTGGAAATTTATCGGCAAATTCTATTGCCCTAGATGTTGGCGTTATAGTTCCTTGATATATATTATGTCCTAGAAATCTTATTTTTGTTTGGAATAAAGACATTTTTTTAGCGGATAGAACTAAACCATGTTTTTTAACTATACTTATGAAGGTGTTTAAATGACTAATGTGTTGGTCGATTGATGTTGAATAAACAAGTACATCATCGATGTATACAATAGTAAAATTAGAATAGTTGTTGAATATATCATTCATTATATGTTGGAATTCGGACGGTGCATTTTTTAATCCGAATGGCATTACATTCCATTCGTAATGTCCAAATGGCACCGTAAAAGCTGTTTTGTATTTATCATTTTCAGCTATTTGATTTGCCAAAATCCACTTTTCATATCGAATTTTGAGAAGATTTTTGCGTTATAAAGTCGTTTTAATAAATCTCTTTTGTTAGGTATAGGATATCTAATCCATTGTAGGACATCATTTAGTGGTTTATAGTTGATTACTAATCGAGGTACTCCTCGTTCTTTCTCTGCTTGATTATTTACATAAAAGGCCGAACAGCTCCAAGGAGATTTGGATGGCCTTATTAAGTTTTTATTTAATAAATCTGTTATTTCTTTTTTACAATGTTCTAATAATTTCTTATTTATTTGAATAGGTCGAGCTTTGGTTGGTATATTTTTTTCATTGAATTCTTTAATATAAGGGAGTTCTACAGTATGCTGTTTTCTTTCCCAGAATGCGTTTGGCAATTCCGAGCATACTTGTTTTAAAAGCTCATTTTCTATTGATTTAATTTTGCTTATTGTATAGGGTGTTTTTAATTGTTCTTCTATCTTTTTATAAGCTATTTCTTCTTGTAAATACTGAATATGATTTTGTTTCTCTTTTATCAGGTTAATTGTTTTTTGGATTGTATTTTGTTGTAATTGCAAAACTTCTTTAGCTTTCATGGGAGATAGAAAGTTAAAGGATAGTTTTGTACCCATTATTTTAGTAGTTACTCCTGTTTCGGTTACTTTGAATGAATATATTTGCGTAAAAAATGGGGTTCCTAATATTACTTCTTGTGAAAGGTTTTTAACTAGAATGAATTGGTTTATGAAACAATATCCTTGGTTGCATATTTTTGCACAAGGTAACTTATACTGTACTTTTAAGCTACTGCCATTGGCACTGCTTAAACGTTCATCAGTTTTTTCGTAATATTTTATTGGAATAATTCCTTCACGGATACAGTTGTAATCTGCTCCTGTATCCATTAGGGCAATTATATTAATTTTAAAATTTCGTCCAATATGCAGAGTAATATTTGTGTACCATTTTTGATAATTATTCTGTCAATTATTTGAATATAATTTTCATCGTTTTCAGCTTGTCCTAAATTATTCGATTCGGGACTTTGATTACTAGAACATGCCTGAGAATTATTCTTATTTTCTATTAAAGATAATCTAGCATCTACTTGTAGTTGCTTTAATTCCAGTTGATTTATGTTAATTGTAGTTCTTTTATTTGTGCTTTTAGTTGTTTTACTTCATTTTAAAGTTCTCCTGTTGTTACTTGTTTAAATAAATTTTGAGTAGGATATTTTTCAAATATCTTGTTTAAACTAAAAGGCTGTGGAGTGGATAATTGACTTTCCCGAGAGATTATCTCTTTTAATTTTATTAAATATT

ID:

Contig01073_LTR-Caulimovirus_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3199

Start:

18810  

End:

22008

Strand:

-

>Contig01073_LTR-Caulimovirus_54

GATAGTTCATGTGATTCAGAGGATGAATCACTAGAATTTTCGATTTCATTGATTAAGTAATCACTATCATTTTCTTCAGATATTTCTGATTCTGATATTAATAGCTTAGTTAGTTTTTCTTGAATATCTGGTTGATCTTGGAAGATTTCGTTTATTTTCCTTTTCATTTTACATTCCGTTGATTTATGTCGTGGTCTTTTACAATTATAGCATACTATTTTTTGTTTATCTTTTGATTTATATTTTTTATTTTTTGAATAATATTTATCAGTTGGTTTTTTATCAAAATCTTTTTGGTAATGTTTTGATTTTCTAGCTTTTCTTTGCCTATATTTTATTCTTTTAATCCTAGAAGGAGGATCTAGTTTATCATAACCATATTGTTTACAAAATGATCCCATGGTTGTTTTAAATTTAAATTTTCATTTCTTTTCTTATCTTTATGTTCTTGGCATATTGCTAGACCTTCTTTTTTGATAAAAGCGAATAACTGACTGTAAGTAATTGAATTCCATTGTATAGGTTGACCTCCTGAATATTCTTTTAGTTTGTTGATTATTTTTTCTGCGAAAAAGGATGGTAATCCTGAAATAAATCTTTCTTTCCAGAAAGGTTGATTGCAATCCGTTCTTTGAAATATATTGGTTATGAAAACATCTATATACCATTTAAAATCTCCTAATGTTAGACATCTTAAATTGGTTAATACTATTTTTTTGCTTTCTAATTCTTCATTTGGGTTACCGATAAAATGCATAGTTAAAGTATGGATTAATACTTCTACTGCATTTTGATGTTCTACTTCTTCATATAAACCATCTTCTCTTTCTAATCTTCTTATTTCTACATGATTAATTATTGAATCTTGTTTAGTTTGATCTAGTGAATTGTCCCACCAGTATTTTAAAGTTCCATTAAAACCTGTTATTAACATAACACATGCTTGTTTATCAGTATGCCCTCTTGCTTTGAAAGCAATAGCGGCCATACCCATTTCTTGAAATAAATTCATTATTTCGTACTCGGAACGTCCATCAATATTCCATTCATATATACCTTCACCGGTGTATACGTTATGGGAATATTTATGGTGTTCTTCGAATAATAAGTCAGGTGGTGTATGTCTTGAATAATATGGTTTTCTAGATTTCATAATTTTATTATTATTTCTGTATTTTATACGATTAATTTCTAAATTATCACTTTCTGATTGAGTATCTATTTGATTAGACTCATTATCATTTGCATCTATATTATTGATTCCTTTTCCTTTATCTAGGTTTTCTAATCTAGTTGCTTTTGATTTTAAAATTTCATTTTCTGGGAATTTAATTTGTCTAGTTACAGGTTTAAAAATTGGTGTAGTTACTGATGAAAAAGGATGTTGAATATTATTAAATTGTTCTAGTTTATTACTTTCATTATTGTCAATTTTATTATCTATATTGTCTATTTGTTTGGAGATAGTATATAATAATTGACTTTGATAATTATTTTGTTGATAAACGGATTTTATATCTTGCATGATTAACGGTTCTTTATCATCTTTATTGGCTTCGGTTTTAAATGGGGTAGCTAGTATTTGCCGGTTAGTTGTATTTATTTTTAAATCAGTTAAGGAGGATGAACTGATTTAATTTTATTACCATTTACTTGTTCCCATACTTGACTTAAGGATGAACTTGTATTAATAGTTTTGAATGGGTAATCTATATTATTAGTAATTGCATATGTTTCAAACCATATAAAAAATGGGATATCTAATTCTTTAATTGTCATACAATTATACCATTTTTCTCTAAATTCATTAACTTGTTGTTTCGAAAATGTTTCAAAATACCATTCAAGTTTTTCTTTATTTTTATTGAATAAAAGTCTTCTTTTATAAATTGCTTATTTATTTCGTATTCTTTTAATATAACATTTATTTGTCCAAAATCCGATGAACTCGGAGAGGTTGGAAAATTGACTGTCTCAGGTTCTGCTATAGGTGCTTTATATTTAACATCTTGTTTAACATTTGGTTTACGCTTTCTGTTTCTGAATCTGCACTAGAATGTCTAGTACGATATTCGGAAAAAGAAGCTCTTGAAGGTGTTTGATATTCAGAGAAAGAGGGTCTTGAGTAATAAGAACTGATCCTAGGAGGGAGTGGTTCTTTAAAAGATCCAAATTGTAATAATATTTTTCCATCTACTTGTTCAATTATTTTTGAAATATTTCTTTGTTCAAAATTCCTAGGTGGTTGAGTTATTTCCAATTTCCATTGATCTGGAATAGTTATTTCATTCCATTTTAATTGCTTAGGAGCGTAAGTAGCTGCTGGGGTATCTTTATTATGGGCTGCTAAAATAGTAGTTTCTCCTTTATCATCATATAGTAAACATCTTGGATTAAATTCAGATGTTGATTGTTTGAAATAAATTCTGTATAATAAATATCCGTGTCTTTCACTTTGAAATTTAATTTCTGGTAAGTGGACATTTAATACCAATATATTGAGTATGGTTGGATCATGAAGACTAACTTGAAAATTAGGAGCGCAATTAAAATATATTGCTCCGTTGCATAAATTTGATTGAACTGCTCCAAGGAGCGAGTCTTCAAATTTCAATAATGTTTTATCTCTTAAAAGCATTAATATTGGTGAATCTATTCCGGTTCTTGATAAAGGTTTTATTGCTATTTGTATTAACTCGAAATAAATATAATTAAATCCTTTTTGTTTGTACTTATCTAAAGCTATAGAGGATAATAGTTTGATTTCTTCAAATTCATTTTGAAGAGATAAGGTTTGTTCGTGTTCTTTGATTGAATAAGCTGTTTTGAAATCAAAAGTTCCGATCTGATATATGTTTTCTGGATTAATATGAGGTAGACAGTTTTTCGTAATATCTTGACTAAACGAAGTTAGTTTTGTCATAATTTCTCTTGAGTTAATTGTTGATGCTGATGTTGATGCTTGTTTAGATTTAAACAATTTTCTAACAGAAGATGCCATGATTTATTCTAAACTTAGACTCATGCTAGAAAGATATTAATCAGATTCTACTTCAATACCTTTTATGGCTTGCCAACGGACTTGCTGCCTTGCTGAGGTCTTACGGCCTGGAACACCACCGGTATCTGGTAGAGGGATTGATGGCTTTCTAGAGAATCTTTGTTTAGTTTAAAACACGAAATCTTTGTTTTGAAAATT

ID:

Contig01073_LTR-Caulimovirus_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

309

Start:

37523  

End:

37831

Strand:

-

>Contig01073_LTR-Caulimovirus_55

TTTCTTACAATGTTCTAAAAGTTCTTGATTCATTTGAATAGGTAGTGCTTTAGTTGGAATATTTTTCTCATTGAAATCCTTTTCATAAGGAATTTCAACAACATGTCTTTCACGTTCCAAAAATGCATTTGGTATTTCTGAGCATACTTGGTTTAGCAATTCAGTTTCTAGTTTTTTAATCTTATTTACTATCAATGTATCACTTAATTGTTTTTCTATTTGTTGGTATTATATTTCTTGTTGTAAGTATTGTATATGTCTTTGTTTCCATTTATTAAGTTTATAAATTTTTCTATTGTAGAGTTTTGT

ID:

Contig01155_LTR-Caulimovirus_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1694

Start:

19187  

End:

20880

Strand:

+

>Contig01155_LTR-Caulimovirus_56

AGACTATGGCAACAACAAGGCTACACACATCTCCACTTTGGAGTTGTTCGCCTTGGGCTAACCTTACATGCTCGAAAAGGACTGCCTGTCGTAGCTCGAATGGCCTTAATCGACTCAAGATTAAAGTCATACCAACAAGTCTGCATCGGAACAGTCCAAACAACATTAAACGCTGGAACAGTATTTGTAACACTGTTTCCAAACTTTAATGTTTCACTCGCGGATCCAAACCTGCTACAGACGCTCAAAGTTCAGCTACAGCTCATTGGAGCACCTATGCAAGATAAGAGCGTGATAGCAACGCTACATCATCAAATAGTCTACCGAATCCAAGATCATGCTTTAGATCTTTCACTTCCCTCATCTGATGACGCGTTATACCTGGAAGTGACCTCAGCATCTCAAGCACCAAACTCGGCTCAAATTCCCCGTCAAATCACTCGTGAAGAATTACTCAAGCGACTACCAGAATCTTGGGTAACCAGCTATGAGAAGCTACACCAAGCAGCACAATCACCTATTCAGACGTCAGAAGTCAGCTTCCAATCTCGGAGTGATGGGACAACGGAGATCAAGTTTGAAAAACCAAGAACATCTTCGTCTCAGAAGCAACTATTCACTCAATTTGCTATACAAATTGACGAAGACATGTTCTATGGTCCAGCAAAGGAGCAGATTCCTAAACCAATCTCGTTCAAACAAGATGGATCAGTCGTATATCCATTCATGGATGAAAATGGACATCAATACTTTGATGTTTGCTCCTGTACGGCATGCACAGAAGACTTATACGAATCTGACGAAGATATTCGAAGAAGGCGGAGAAAAAAGAAAGATCCACTATACAAAAGGTATCTCGAAGGCGACCCCACGGTTGGACCACTAGGCGAAGGAGAAAAGTATGAATTCATCGTCCAATACTCAGAAAAAAAGAGAAGAGCCTAGACTCATGATGATGCAAGAAAGCGATTTTCCCCCTCCAGAAGAATTTATCAAAGATAATATCGCTCATACTCCAAAAATTCTTTAAAAAGCCATCAGCTCTTCTGGTCCTGACCTGCTCAGCCATGGAGAAAAGGTCCTCAACTGGCAAACGGAGAACGCTCTGGCACAAAATCAGCTGCTAACGTCGATCAACCACAAATTTGATCAGCTCGCCAACAGCAATAATAAAAGATTAAGCAGCCTTCAGAGTTCAATAATGGAGATCCATGGACGACTCAACAATTTTCACCAAGAAATGATGACCATGGCCCAACACATGATGGTAAATACGTCTTCCTTCAAAAGCAAAGAAGCAGAAACAGCCAGTCTCAAAAATCAGTTGAGAGATTTAAAGCGAAGCTTGGAAAGTATGGTTAACAACCAGTCACGAACAGATATATACTCCAGTCCATTTGGAAGTACTTTCCCAGGATTCCCCGCATATCAAGGATCTTACTCCCCAGGTTTCTTAACTGGATATCAAGAGCAAAGATCAAAACCACCGCCTCGTGGATTCTTGTCTTCTGATGAAGCTTTCACATCCCGATATGGCACAACCTCAAACATTGACTACAAGGCAAGCACGTCACGTTCGAGGCCCAGAAAGCAGAAAGAATCCGAGTTCGTGGTCAATCCAACAAAGAAACCAACTCTTACCTCTTCCTCAAGTCATGAATCTGTCGAAGAACAAAATGGAAAAGATATCGGAA

ID:

Contig01155_LTR-Caulimovirus_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3842

Start:

21047  

End:

24888

Strand:

+

>Contig01155_LTR-Caulimovirus_57

AGAAGAATCGCTTCCAAACCAATTTGCAATAGGCGGAGGATCTACAGTTCCCAAAGATGAACCTGATGTCTATGAGGTGGATTCAAGCGATGAAGAGATGGACTATACTCAACCCAGATATCAGAAAACATCATCAAGACCATTTGCTTCAAAAATCATGGTGTTCACATTTGACGACATTCCATTCGAAAAATGGAACGACCGTCTTGACGAATTCCATGCGTGGATGAATTCAGAAGCAATTACGTCACCGACAGAGCTCGTTATTCAGCAATTTACAGCAAGATTCTCTGGTGCACTCAAAGAATGGTGGAATTCTCTAGGAGAATATCGACTGCAACAAGTTTATCAAACGACGATCTCACTGCTATTAGGAGAAATTCATAGAGAATTCATCGGCACACCTACCCATCTAAAGGAACAACTGCAAGAAGAATACTTCACTGCAAAATGTTGTTCATTGAAGAAAAGAGACTTGGCAAAGCACTTCGAAAGACAAACAAAGAGATACTATGCCCTTGATGGTCTCAACAATCCAAGTCTAAAGCAAGTCTATCTCTCTTCGATTGACGACTATCTCAGTCAACAAACCAAGCTGTATATCAGAGACCAAGGTCAAACAATAGAAGATATTTCTATTGGCCAAATCCAACAACACGTCTTCAGGACACTCGATAAGCTTTGTAAGCAAAAGGAATTCTGGATGGAATTCATGGACAAGTCCAAACAATTATCCAAGATTTGTGCAATGCCGGATCTAAATATCAAGTGTTCTAAATCCAAGAAAGCCTGTTCATGTGACAAACGACACAAGTCAAGAAAGTTCAAAAAGCCATTCCACAAGCGTTTTAACAAGTTTAGACGCAGGAGGTTCTTCAGGAAAAAGAAAACGTTCAAGAAAACTACAAAATGTTTCTTGTATCGCAAGGAAGGACATTTTGCGAAGAATTGTCCAAACAAATCGAAGAAGAAAAAGCAGTATCTCATACACTCGATATCAAGGGTTATCCCAGACATCGATTTAGAGAATCATGATCTCGAATCAATTCTATCTTATGATAGTGATGACCAAGATGCTATTTGTGGCTATTCAGATTATGATGATTCTTCTGTTTCATCATTCGAAGAAGAAGAAGAAGATTGTTGTTACAAGATTGATGAAATGCCGCGACGAGAAAGAATTCAAACTCCTCTCTTACCGGTTACAATCTTCGATCCAAGAGAAAAGGTGAAACCAATTCATGCAATTGCATTCATCGACACTGGCGCTCATGCAACCATCATGAATCCGAAGATTCTTCCCTCATCAATGTGGTTACCATATCATCAACAGTTCAGAGTCGCGAATGCTGGGTTATTGTCTGTCAAACTCAAGTCAAAACCCATAACCATAGAACTCTTTCCGGGTTGTCAGATCACAACTGAAGTCCTTGGATCATCTGCACCAGGGAAAGATCTCATATTGGGATGGGATACTTATCAAGTATTAAAAAAGAAGTTTGACATATCACTCGAATCACGAGGCATGAAGTGGAAAGCATACTACAAAGCCTTCCCCACCATTCCTCGTTTATTCACAATTGAAGACCCTGCTGAAGCCAAAGAAACAACTGACCTAGATGAGATTACTGATTTTAACAAAATCAAGGAAGAAATCACACTGGTCTCTTACGCGGATTCGCACACAGATTTCATCAAGAAGTGCAACAACCCATTGTGGTTAAACACAGAATTCTTCGTCTCACTACCATTTAAAGATGAAGTTCTCACGACCCCTACAAAGGCGAGCCATGCAGGAATGCCACCCGCACTGCTGCAGCAAGCAAATGAAGAGTGTGATCAGCTTGTCTCTCAAGGAATTGTAACATCAACAAACTCACTATGGGCATGCAAAGCCTTCTACGTCAACAATCGTGCCGAACAAGCAAGAGGAAAGCTCAGACTAGTTATTGATTACAAACCGCTTAATCAATACCTACAAGATATCAAGTTTCCGCTACCGAATAAAAAGGCTCTCCTACAACATCTTCAAGGAGCAAAGATATTCTCTAAGTTTGATCTGAAATCGGGATTCTGGCAACTTGGTGTCAAGCCTGAAGAAAGGTACAAAACTGCATTTTGTCTACCAAATCGCCATCTTCAGTGGAACGTTTTACCTTTCGGTCTGAAGACGGCGCCATCACTATTCCAACATGCGATGCTACGTATATTCAAGCCACTTCTACATACAGCCTTGATATACATTGACGACATTCTGCTATTCTCTCTAAACAAAGAAGAGCATCTACAGGTCCTCAAACAGTTCCAAGACATAATAAAACAATATGGAATTATGCTCTCGGCCCGAAAGATGATCATAGCTCGGCCCAATATCGATTTTCTTGGAATGGAGATTAAAGAAGGACAGTTTACACCTCAAGCCCATCTAGCTACAGCGCTACTGGATTTTCCGGATGAAAATCTCGCAAAAAGACAAGTGCAACAATTCCTTGGCATAATCAATTATGTCAGCGACTTTATCCCGCAATTATCACAATTGACAAAGACCCCTACAGAAAATGCTGACAAAGAACCCTCCGTTGTGGGGAACGCGACAAACTGAAGCAATCAAAAGGCTGAAGAAAGAAATACAGAGTCTGCCACCTTTAAAGATGCCGTCAACAGGAACGCGCATTCTGCAGACAGACGCAAGTGACAAATATTGGGGGGGCAATATTATTCGAAGAAATTGATGGCAAACGTCAAATCTGTGTATATAAAAGCGGTCGCTTTAGAGATTCGGAGATGCATTATCACTCCACGTTCAAAGAAATCCTTGCGGTCAAGAAAGCAATTGAGAAGTTTGAGTTCCATCTGATAAGACATAAATTTCGCATCGAAATGGACATGTCTTCTTTTCCAAAGATGTTACAATTCAAGCAGAAGATGGTCCCACATCAACAATTATTAAGATGGAGCGAATGGTTCTCGAAGTACGATTTTGAATCCTTCTATTTAAAGGGTACGAAAAACACTCTCGCAGACATGCTCAGCAGAAGCCCACAAAAAGAAACTCAGAAGGAAATTCATATGATGGCAAGTTCATCGGCAGAAAAGAGCTTTTATGACTTCGAAGCAAACATGCCAGAAGATGCTCATGAACTGATCAACAAAGGAGTCCTCCACGAGCATCTCAACCACAAAGTCTTCAGATATCAATCAATAATCTTGTCAAGATACGGAATCAACAGTCATTACATTGCACCAATGGGCATTCACCCTGATCATCCATACGCTCACCTCTACAGGATAGAAAGCACTTACATGCCTGAAGAAGTTCTATGTTTCCTCTGGTATCTCTGTTCAGTCCATACAATTGGTATCACCTTCGATATCCAGTGGCTCTATCAATACGTCAATGCTCAACATGGCGAAAAGGAGTGCCTCTCTACCTTTCTAACATGGTTTTCATCCCTCACCAACTGGAATGTAAAACTAAGAAGATCTGCAAAAGCAAGAGGCATGCCTTTCAAAAAACTCAAAAAAGGAGGAGCTCTCAATCCATTCTTTAATCCTCATACCATATACTTCTTCCATCGTCCTGTCCAAGTTAACAAGAAGTCCGGCAAACTTCATGCCTTACCAGCGCTCATTCATCACAACGACTTCTACAGAGGTGTAAGACCAGACTTCAATGTCCATGACAACAAGCCGTATGAAGATTTCCAAACTCATGCTTTTCGTCTCAACAATCCTAGACAAGCATTCTCCATACCTTTTAACCCAAATTGGTCGTACTACTCGATTGATAATCATATGTGCCTTGATGAAGATCTACAGTTCTTCATGGAAAAGCAACAGAG

ID:

Contig01155_LTR-Caulimovirus_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

627

Start:

25154  

End:

25780

Strand:

+

>Contig01155_LTR-Caulimovirus_58

TACGGATGTCCAGGAGAATATTATGGATGCTGTGACAAACATATCATCGAGTTCGAAATGGATCATTAAGTAAGTAAACCGATCATTATGTATAATTAAGTGTGTATTTTATGATGTAAGTGTGATGTAAGCGATGATGTAATCGCAGTAATATAAGCGTGATGTAAGCGATGATGTAATCGCATAAATAATGGAGAATGATGTAAGCGCTTATGTCAGCGCTCCTCAAAACTCCCTATAAATATGTATGCACCCCCATTGTGAAATAACACATCAGAATTTCCATAAAAACCTCTCTCTAGTTTTCTCTCTCTAATGAGTTTCTAAACTCTCTCAGTTTTCCAGACTTCTCTAACATCTTCATAAGTTTTGGTTTCTTTCGGTTATTCTGCAAGTGGCGATTCTGTTTCATCTTCTTAAGCATAAACTCTGGTTTGTCAATACGACTCTGTCAACATGACATTCGTGGGAGATGAAATTCCTAACAATGGTTGAGCACGAAGAGAGGCTTAGAGTAGATGCCCTAATAGCTCTCAATACTTGGAATTTCGTCGAACTCGTCTGTCAATACGACTTTGTCAACACGACTTCCATCTTAGTTCTCCATCGCTTAAGATAATGGTATCA

ID:

Lachesis_group0_LTR-Caulimovirus_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

903

Start:

16730534  

End:

16731436

Strand:

-

>Lachesis_group0_LTR-Caulimovirus_59

GAGTCGTACTAACAAACGAGTTCAATAAAATTCCAAGTATTGTGAGCAATATGGGAAACTCTAAGCCTCTCGTTGTGCTCAACCACCGTTAGGAATTTTATCTCCATACGAAAGTTATATTGACAGAGTCGTATTGACGAACAATATCTTATGCCTAAGAAGATGAAACAGAATCGCCACTTGCAGAAGAATCGAAGGAAACCAAGACTTATGAAGATGTTTTAGAAGTCTGGAAAACTTTAGAAATTTAGAGACTCATTATAGAGAGAAACTAGAGAGAGATTTTTTTAAATGAAAATCTGATGTGTTATTTCACAATGGGGGTGCATACATATTTATAGGGAGTGCTGACATAAGCATTTACATCATACCACATTATTTATGCCATTACATCATAGCTTACATCACACTTACATCATAGTTATTACATCATTGCTTACATCACACTTACATCATAAAACACACTTAATTAGTAATTATACATAATGAGGATCTTAATTACCTTACTTAGTGATCCATTTCGAACTCGATGATATGCTTATCACAACATCCGTAGTATTCTCCTGGACATCCGTATTCTGGCTCGGGTTCTTCAAAGTCTTGGAAATCTTTAAACTCCTTTTCTGGTTCGGAGTTTATGTCGATGTTGAACATCTTTCCAACTTCATCAATATCAATAATCATCGCATCGTCAGGAGTTTGCGAATCCTGGAAATACTCTAGTGGACACTGTTGAGGTGTCTGTTCTTGTTCTTATTTTATCTTTTTTGGAGTGTCTTGTGCAACTGGTTTTGGTAGTATAAATGATGGTGCACCTTGTTGCTTCGCCATGAAGAAATGTAGATCTTCGTCAAGACTCATATGGTAGTCAATTGAATAGTACGTCCAATTTGGGTTAAATGG

ID:

Lachesis_group0_LTR-Caulimovirus_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1156

Start:

16731470  

End:

16732625

Strand:

-

>Lachesis_group0_LTR-Caulimovirus_60

TCCGTTGATAAGTGATGAGTGTCTTCAGGCATGTTTGCTTCGAAGTCGTTGTAACCCTTTTCTGTGGATGATGAACTAGCCATCATATGATTTTCTTTTAATGGGCTTCTGCTGAGCATGTCTGCGAGGGTGTTATTCACGCCCTTTAAATATAAGGATTCAAAATCGTACTTTGATAACCATTCACTCCATCTCAATAATTTTTTATGTGGGACCATCTTTAGCTTGAATTGTTACATCTTTGGAAAAGAAGACATGTCCATTTCGATGCAAAATTTATGTCCTATCAAATGGAACTCAAACTTCTCAATTGTCGTCTTGACCGCTAGGATCTCTTTGAACGTGGAGTGATAATGCATGTACGAATCTTTGAAGCGTCGAATTTTATATCCGCAGATTTGACGTTTGCCATCAATTTCTTCAAATAATATGGCGCCCCAATATTTGTCACTAGCATCTGTCTGCAGAATGCGCGTTCCTGTTGACGGAATCTTTAAAGGTGGCAGATTCTGTATTTCCTTTTTTAGCCTTTCAATGGCTTCGGTTTGTCGTGTTCCCCACAACAGAGGGTTCTTTGTCAGCATATTTTTCAGGGGTCTTGTCAGGTTCGAAAGTTGCGTGATAAAGTCGCTTACGTAATTGATTACTCCCAGAAATTGCTGAACTTGTCTTTTTGTGAGATTTTCATCTGGAAAATCTAATAGCGCTGTAGCTAGATGGGCTTGAGGTACAAACTGCCCTTTTGTAATCTCCATCCCAAGAAATTCGATGTTGGGCGGAGCTAAAAATCATCTTTCGGGCCGAAAGCATAATTCCGTACTGTTTTATTATGCTTTAAACTGTTTGAGGGATTGAAGATGCTCCTTTTCATTTGGAGAGAACAATAGAATGTCGTCAATATATATCAAGGCCGTGTGTAGCAGGGGCTTGAATATTCAAAGCATCGCTTGTTGGAACAGTGATGGCGCCATTTTTAGGCAAAAAAGTAGAATGTTCCATTGAAGATGTCGATTTGGTAGGCAGAATGCTGTTTTGTATCTTTCTTCCAGCTTGACACCAAGTTGCCATAACCCTGATTTTAGGTCGAATTTAGAAAATATCTTCGCTCCTTGGAGATGTTGTAGGAGAGCCTTTTTATTTGGAAAAGGAAACTTGA