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Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_322 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7812145807421458854-
Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_323 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus38712145894921462819-
Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_324 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus18312146296921464799-
Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_325 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5372146481921465355-
Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_326 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4442146535221465795-
Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_327 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus19952146579521467789-
Contig00002_LTR-Caulimovirus_328 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9753149+
Contig00038_LTR-Caulimovirus_329 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1412296723107-
Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_330 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9485124658512558+
Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_331 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus862349714623497231-
Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_332 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus11070541277054236-
Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_333 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1141394754813947661-

< 13 14 15 16 17 > Total 17


Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_321

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1025

Start:

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End:

21458072

Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_321

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_322

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

781

Start:

21458074  

End:

21458854

Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_322

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_323

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3871

Start:

21458949  

End:

21462819

Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_323

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_324

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

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End:

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Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_324

CATTGAAAATTCAATTATTCCGATATCCTTTTCTTTGCTCTTCGTATCTTCAACGGATTCGTGGCTTGAAGAAGAGGTAAGAGTTGGTTTCTTTGTTGGATTGACCACGAATTCGGATTCCTTTTGCTTTATGGGCCTCAAACGTGACGTATTTGCCTTGTAGTCAATGCTTGAGGTTGTGCCATATCTGGATGTGAAAGCTTCATCAGAAGACAAGAATCCAGGAGGCGATGGTTTTGTTCTTTGCTCTTGATATCCAGTTAGGAAACCTGGGGAGTAAGATCCTTGATATGCTGGGAATCCTGGGAAAGTGCTTCCGAAAGGACTTAAGTATGTATCTGCTCGTGACTGGTTTTGAACCATACTTTCCAAGCTTCTCTTTAAATCTTTCAGCTGATTTTTAAGACTGGCCGTTTCTGCTTCTTTGCTTTTGAAGGAAGATGTATTAACCATCATGTGTTGAGCCATGGTCATCATTTCTTGATGAAGGTTGTTGAGTCGTCCATGGATCTCTATTATTGAACTCTGAAGGCTGCTTAATCTTTTATTATTACTGTTGGTGAGCAGATCAAATTTGTGGTTGATCGTTGTTAGCAGCTGATTTTGTGCCAGAGCGTTCTCCGTCTGCCAGTTAAGGACTTTTTCTCCTTGGCTTAGCAGATCAGGACCGGAGGAGTTGATGGCTTTTGAAAGGATCTTCGCAGTATGAGCGATGTTATCTTTAATAAAATCTTCGGGAGGAGGAAAATCGCTTTCTTGCATCATCATGAGTCTGGGCTCTTCTCTTTTTTCTGAGTATTGGACGATAAATTCGTACTTTTCTCCTTCGCCTAGTGGTCCGACTGTGGGGTCTCCTTCGAGATACCTCTTGTATAGTGGATCTTTCTTTTTTCTCCTTCTTCTCTGTATATCTTCGTCAGATTCGTATAAATCTTCTGTGCATGCTGTGCAGGAGCAAACATCAAAGTATTGATGTCCATTTTCATCCATGAATGGGTATACGACTGATCCATCTTGTTTGAATGAGAGTGGTTTGGGAATCTGCTCCTGTGCTGGACCATAGAACATGTCTTCGTCAATTTGTATAGCAAATTGAGTGAATAGCTGTTTCTGAAACGAAGATGTTCTTGGTTTTTCAAACTTGATCTCCGTTGTCCCATCACTCCGAGATTGGAAGCTAACTTCTGACATCTGAATAGGTGATTGTGCTGCTTGGTGTAGCTTCTCATAGCTGGTTACCCAAGATTCTGGTAGTCGCTTGAGTAATTCTTCACGAGTGATTTGACGGGGAATTTGAGCCGAGTTTGATGCTTGAGATGCTGAGGTCACTTCCAGGTATAACGCGTCATCAGATGAGGGAAGTGAAAGATCTAAAGCATGATCTTGGATCCGGTAGACTATTTGGTGATGTAGCGTTGCTATTACGCTCTTATCTTGCATAGGTGCTCCAATGAGCTGTAGCTGGACTTTGAGCGTTTGTAGCAGGTTTGGATCCGCCAGTGAAACATTAAAGTTTGGAAACAGTGTTACAAATACTGTTCCGGCGTTTAATGTTGTTTGGACTGTTCCGATGCAGGCTTGTTGGTATGACTTTAATCTTGAGTCGATTAAAGCCATTCGAGCAACTACTGGCAGACGTTTTCGAGCATGTAAGGTTAGCCCAAGGCGAACAACTCCAAAGTGGAGATGTGTGTAGCCTTGTTGTTGCCATAGTCTTGGTAGATTCTCCGGAATGTTGAGCGAGATGAACTGTTCTTCTTCTGTAGTAGGAACTTGGCAGGACGAGAATTTGCTGGATTGCACATACTCTAAGACTCTTCTGCTGGAGGGT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_325

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

537

Start:

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Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_325

CCTTGACAGAAAAAGCATTTGGTTTTTTGGAAAAGTATTCATATGGATTTACTAAAGGGAGGGTTGTTTCTGGGAGTTGATCTCCGGGAACATATTCGATTTGATATGTAGAAGAACGGCTTTTGCTTTTAGGTAAAGTAGAAATTGCAAACTGGGAATCGATCATTTGAGGGTTGGAATTTGCCATAATGAAATTTTGTTTTCCAGAACATTCAACAACAATCTATCATAAATAATGATTCATTCAATTATTTCTACAAGCGATGGCTCTGATACCATTATCTTAAGCGATGGGTACTAAGATGGAAGTCGTGTTGACAAAGTCGTATTGACAGACGAGTTCGACAAAATTCCAAGTATTGGGAGCTATTAGGGCATCTACTCTTAAGCCTCTTTCCGTGCTCAACCACTTTTAGGAATTTCATCTCCCACGAATATCATGTTGACAGAGTCGTATTGACGAACCAGAGCTTATGCTTAAGAAGATGAAACAGAATCGCCACTTGCAGAATAACCGAAAGAAATCAAGACTTATGA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_326

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

444

Start:

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End:

21465795

Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_326

ATGATATCGATTCGAGATCATGATTCTCTAAATCGATGTCTGGGAGAACTCTTGATATCGAGTTGATGAGATATTGCTTCTTCTTCTTTGATTTGTTTGGACAATTCTTCGCGAAATGTCCTTCTTTGCGACACAAGAAACATTTTGTAGTTTTCTTGAAGGTTTTCTTTTTCCTGAAGAACCTTTTGCGTCTAAACTTGTTAAAACGCTTGTGGAATGGCTTCTTGAACTTTCTTGACTTGTGTCGTTTGTCACATGAACAGGCTTTCTTGGACTTAGAGCACTTGATATTTAGATCCGGCCTTGCACAAATCTTGGATAATTGTTTGGACTTATCCATGAATTCCATCCAGAATTCCTTTTGCTTGCAAAGCTTATCGAGTGTCCTGAAGACGTGCTGTTGGATTTGGCCAATAGAAATATATTCTATCTTTTGACCTTGGT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_327

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1995

Start:

21465795  

End:

21467789

Strand:

-

>Lachesis_group6_LTR-Caulimovirus_327

TGTTCTTCGAATAATAAATCGGGTGGTGTATGTCTTTTATAATAAGGTTTTCTTGATTTCATAATCTTATTTTTTATTCTATTGATTTCTAAGCTGTCTTCTTCTGATTGAGTATTACTTTGAATAGATATATTATCATTTTCATCAATAGTATTTATTCTTTTACTTTTGTCTAACTTATCTAACCTATTTGCTATAGATTTTAAGATTTCATTTTCAGGGAATTTTACTTGTCTAGATATTATGCAAAGGGATGCTGAATACCAAGGTTATATTGTTCTAGTTTATTATTTTCATTAGAATCTAACTTATTATCTATATGATCTATTTGTTTAGAAATTGTATGCAATAACTGACTTTGATAGTTATTTTGTTGATAAATAGATTTTATATCTTGCATAACTACTTGTTCTTTATCATCTTTATTAGCTCCTGTTTTAAATGGTTTTGCTATTATTTGTCTATCAGTCATTTTTAATTTTATATCACATAAAGGTGGATGCACTGATTTAATTGTGTTTCCATCTAATTTTTCCCAAATCTGACTTAAAGATGTGCTACCATTAATTGTTTTGAAAGGATAATTTATTTCATTTGCTATTGCATAAACTTCAAACCAAAGGAAAAATGGGATGTCTATTTCTTTCATTGTCATGGTGTCATACCATTTGCTTCTTAATTCAGTGACTTCTTGCTTAGAAAAATTATTGAAATACCAAATTCTTTTCTCTTTATTTTCTTCTGAATAAAATTATTTTCTAATATATTCTTTATTAATTGTATATTCTTTAATTATAACATTTATTGATTTTGCAAAATCAGAAAGTGTAGGAGATGTTGGAAAATTATCTTCTACTTCTGGTTCAGCTATTGGTGCTTTAAATTTAATATCTTTTTAATATTTTGATTTACACTTTCAGTTTCTGAATCTATACTGGATTGTCCAGTGCGATATTCAGAAAATGAAGGTCTTGAACTACTACATGTACTAATTCTTGGTGGAATTGGATCTCTATATGATCCAAATTGTAATAATATCTTACCATCTGGTTGCTCTATTATTTTTGAAATATTTCTTTGATCAATATTTCTAGGTGGTTGTGTAATATCTATTTTCCATTGTTCTAGTATAGTTATTTCTGTCCATTTTAATTGTTTGGGTGCATAAGTAGAAGTTGGTGTATCATTACTATGTGCAGCTAAAATTGTTGTTTCACCTTTATTATCTTTTAATAAACATCTAAGATTAAATTCAGATGTTGATTGTTTAAAATAAATTTTATATAGTAATAAATATCCATGTCTACCACTTTGAAATTTTATTTCAGGTAGATGAACATTTAATACTAAAGTGTTGAGTATTGTAGGATCATGCAAACTTACTTGATAATTTGGAGCACAATTAAAATAGATAGCTCCATTGCATAAATTTGATTGTACAACTCCTAAAAGAGAATCTTCAAATTTTAATAAAGTTTTATCTCTTAATAACATAAGAATAGGTGAATCTATTCCAGTTCTTAATAATGATTTTATTGCTATTTGAATAAGACCAAAATGAAGATAATTAAAACCTTTTTGTTTATATTTATCCAAGGCTATTGATGATAATAATTTATTTTCTTCAAATTCATTTTGAAGAGATAGTGTTTGTTCATATTCTCTTATTGAATAAGCTGTTTTAAAATCAAAAGTCCCAGTTTCATAAATATTTTCTGGATTAATATGGGGTAATTGATTTTTTGATATTTCTTGATCAAAAGAGGTAATTTTTGTTATTATTTCTCTTGAATTAATTGTTGATGCTGAATTAGATGCATGTTTATTTTTAAAGAGCTTTCTAAAAGAAGACGCCATGACTTATTCTAAATTAAAACACATACTAGAGGATACTAACCTGTTCTGCTTTGATACAGCTTCCGGCTTGCCAACGGTCTTACGGCCTCTATCTCGGGACTTGCTGCCTGGAACATCTAAAGCAACAGTATCTTGGCA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00002_LTR-Caulimovirus_328

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

97

Start:

53  

End:

149

Strand:

+

>Contig00002_LTR-Caulimovirus_328

GAAAACTTTTAGAATCAAAACATGCAGCTTCTACATCTCATACAAGTATACAACTATTAATCCAAGAGATATTATGTCAAAAATAACCTCATTTAAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00038_LTR-Caulimovirus_329

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

141

Start:

22967  

End:

23107

Strand:

-

>Contig00038_LTR-Caulimovirus_329

TTATTTTATGCGATGTTTATATTAAGATGGATAGTCGTGTTGACAGAGTCGTATTGACGAATGAGTTCAATAAAATTCAAAGTATTGGAAGTAATATGGGCAATTCTAAACCTCTTTCGAGCTCAACCACCGTTAGGAATT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_330

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

94

Start:

8512465  

End:

8512558

Strand:

+

>Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_330

AGACATCCTCTGCAGAAGCCTATTAAAAGAAATTAATATGATCGCAAGTTCATCATCCACAGAAAAGGTTATTACGACTTCGAAGCAAACATGC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_331

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

86

Start:

23497146  

End:

23497231

Strand:

-

>Lachesis_group3_LTR-Caulimovirus_331

AGAAAAAAGAAAGATCCACTGCATGATCTTGGATCCGGTAAACTATTTGATGATGTAACGTTGCTATTATGTTCTTATCTTGCATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_332

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

110

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7054236

Strand:

-

>Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_332

TTTTGAAAACTTTTATTTTAAAGACATGCAACGAATTGCATCAGTTTATTGAAAATGTTTTTATAAAAACTTTTGAAAACTTAAAAGGATCGTTTTAGTCTGATACCAAA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_333

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

114

Start:

13947548  

End:

13947661

Strand:

-

>Lachesis_group5_LTR-Caulimovirus_333

GGATCGGTCAAGAAAGGATTAAAGTAGATTAGGTTTGGGTGAAAATCGTTTTGAAAACCTTTTAAAGAAAACGATGCAGAATACTTCTTAAAGATCGTTTAGCATCTGATACCA