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Contig00632_LTR-Caulimovirus_22 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3151102152105302+
Contig00632_LTR-Caulimovirus_23 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1218105377106594+
Contig00632_LTR-Caulimovirus_24 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus458121894122351+
Contig00641_LTR-Caulimovirus_25 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus57861396716-
Contig00641_LTR-Caulimovirus_26 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4924694611869-
Contig00641_LTR-Caulimovirus_27 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3861367014055-
Contig00641_LTR-Caulimovirus_28 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3351457814912-
Contig00641_LTR-Caulimovirus_29 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4911493915429-
Contig00662_LTR-Caulimovirus_30 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus578142638143215-
Contig00662_LTR-Caulimovirus_31 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4924143445148368-
Contig00662_LTR-Caulimovirus_32 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus169150169150337-
Contig00703_LTR-Caulimovirus_33 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus65375886665402+
Contig00754_LTR-Caulimovirus_34 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5361536-
Contig00754_LTR-Caulimovirus_35 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus48906345523-
Contig00754_LTR-Caulimovirus_36 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus40173117711-
Contig00754_LTR-Caulimovirus_37 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus33582348568-
Contig00754_LTR-Caulimovirus_38 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus49185959085-
Contig00782_LTR-Caulimovirus_39 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus16793685038528+
Contig00855_LTR-Caulimovirus_40 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7132783428546-

< 2 3 4 5 6 > Total 17


Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00606_LTR-Caulimovirus_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

275

Start:

126713  

End:

126987

Strand:

-

>Contig00606_LTR-Caulimovirus_21

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00632_LTR-Caulimovirus_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3151

Start:

102152  

End:

105302

Strand:

+

>Contig00632_LTR-Caulimovirus_22

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00632_LTR-Caulimovirus_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1218

Start:

105377  

End:

106594

Strand:

+

>Contig00632_LTR-Caulimovirus_23

AATATTTATTAAAATTAAAAGAAATAGTTTATCAAGAAAAAGAATTATCTACTCCATAGCCATTTAGTTTAAATAAAATATTTGAAAAATATCCAACACAAAGTTTATTTAAACAAGTAACAACAGGAGAGTTACAAAATGAAGTTAAGCAATTAAAATCACAAATTAAAGAATTACAATTAACAGTCAATCAACAAGAATTAAAACAATTACAGATAGATGCTAGATTATCATTAGAAGAATCTAAAAATAATAATTCAGCATCTTCAAGTAATCGAAGTCTAAAAAATAAATTAGAAGAAACTGAATGTAATGAAGATTATATACAAACAATTGATAGAATGATTTTTCAAAAATGGTATACTCAAATTACATTGCATATAGGTCATGATTTCAAATTAGAAATAATAGCATTAATGGATACCAGAGATGATTACAATTGTATTCGCGAAGGTATTATACCAACAAAATATTATGAAAAAACAACTGAAAGATTAGGAAGTCCCAATGGTACCAGTTTAAAGGTTCAATATAAACTACCTTGTGCCAAAATCTGTAATCAAGGATATTGTTTTAGAAATCAATCTATCTTAGTCAAAGATTTATAATATTAGGAACACCATTCTTTACTCAAATATATCCTTTCAAGGTAAATGAAATAGGTGTAACAACTAAAGTAGTAGGTACAAAATTGTTATTCAAGTTTCTATCACCCATGAAAACTAAAGAAATTTTATATTTACAACAAAATACTATTCATAAAACAATTAATCTGATAAAAAGTAAACAAGATCATATTAATTATTTACAAGAAGAAATAAGCTATAAAAAAATAGAAGAACAATTACAATTACCAACTATAAAAGATAAAATAAAATCAATAGAAAATGAACTTTTAAAGCAAGTATGTTCAGATCTACCCAATGCATTTTGGAAAAGAAAATAACATACTGTAGAATTACCTTATATTAAAGAATTTAGTGAGAAAAATATACCAACTAAGGCAAGACCTATTCAAATGAATAGAGAATTATTAGAGCACTGTAAACAAGAAATAAATGATTTATTAAACAAAAAATTAATAAGGCCATCCAAGTCTCCTTGGAGTTGTTCGGCTTTCTACGTAAATAATCAAGCCGAAAAGGAACGTGGAGTACCACGGTTAGTAATAAACTATAAACCACTCAATGATGTTCTACAATGGATTAGGTATCCAAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00632_LTR-Caulimovirus_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

458

Start:

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End:

122351

Strand:

+

>Contig00632_LTR-Caulimovirus_24

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00641_LTR-Caulimovirus_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

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Start:

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Strand:

-

>Contig00641_LTR-Caulimovirus_25

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00641_LTR-Caulimovirus_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

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Strand:

-

>Contig00641_LTR-Caulimovirus_26

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Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00641_LTR-Caulimovirus_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

386

Start:

13670  

End:

14055

Strand:

-

>Contig00641_LTR-Caulimovirus_27

AACTCATCCTCATCAATTTGTATAGCAAATTGAGTGAATAATTGCTTCCGAAATGAAGATGATCTTGGCTTTTCAAACTTGATCTCAGTCGTTCCATCACTCTGAGACTGGAAGCTGACCTATGAGGTGTAAACATGTGTTTCTGCTGCCTGATGTAGCTTCTCATAGCTTTTTATACAAGATTTTGGTAGTCGTTTAAGTAATTCTTCGCGACTGATATGTCGAGGTATCTGAATGGAGTTGGGTGCTTGAGATGCAGAAATTACTTCCAGGTATAACGCTTCGTCAGAAGACGGTAATGCAAGATCTAGGGCGTGATCCTGGATTCGATAAACGATCTGATGATGTAGTGTTGCTACTACACTCCTCTCTTGCATAGGTGTTCC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00641_LTR-Caulimovirus_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

335

Start:

14578  

End:

14912

Strand:

-

>Contig00641_LTR-Caulimovirus_28

TAGTTGTACTTCGAGCATCTGTAGCAGGTTCGGATCGTTGAGAGAAACATAAAGTTTGGAAACAGTGTTACAAATACTGTTCCGGCATTTAATGTTGTTTGGACTGTTCCGATACAAGCTTGCTGGTATGACTAAGGCCAAACGAGCTATCACCGGCAGACCTATCCTAGCGTGTAGTTAGACCGAGATGGACTACTCCGAAGTGTAGCTGGGTGTATCCTTGCTGTTTTCATACTCTTGGTAGATTCTCCGAAATATTGAGAGAGATAAACTGTTCTTCTTCCGTCGCTTTGACATGAAAAGAACTTGCTAGACTGCATATTCGAAGACTCTTC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00641_LTR-Caulimovirus_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

491

Start:

14939  

End:

15429

Strand:

-

>Contig00641_LTR-Caulimovirus_29

ACACCTTTTACGGAAAAGGCATTAGGCTTTTTTGAAAAATTCTGATATAGTTAAGGAGGGGAAGAGTTGTTTCTGGGATTTGATCTCCTAGAAAATATTCAATTTGGTAAAGGGAATTTATGGAAGAGGCAGATGAATGACTTTTACTTTTAGGTAAAGTGGATATTGCGAATTAAAAATCAATCGTCAAAGGATTGGAAGCTGGAAATGATGAGAAAATGTTTTCCAGAACATTCAAAAACAATCTATCATAAATAATGATTGATTCATATTGTCTCTGCAAGTATTGGCTCTACTACCATTATCTTAGGCAGTGTATTCGTAGAGAGTGGTTATCGTGTTGAAAAAGTCGTATTGACAAACAAGTTAGATAAAATTCCAAGTATATGGAGCAATTTGGGCAACTCTTGGCCATCATTTATGCTCAACCACCGTTAGGAATTTTATCTCCCTACGAATATTGTGTTGACAGAGTCGTACTGACAAACCAC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00662_LTR-Caulimovirus_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

578

Start:

142638  

End:

143215

Strand:

-

>Contig00662_LTR-Caulimovirus_30

GACAACGTCGTATTGACAAACGAGTTCGATAAAATTCGAAGTATAGTGAGAAATTTTGGGCAACTCTTGGCCTCTCGTTTATTCTCAACCACCGTTAGGAATTTTATCTCTCTATGAATGTCGTGTAGATAGAGTCGTATTGAGAAACAACATCTCGGCCTAAAAAGATGAAACAGAATCGCCACTTAGGGAAACAGAGAAAAAAATCAAGATTTATGAAGATGCTGAGAAGTCTGAAAAACTTTAGAAATTTAGAGACTCATTAGAGAGAGAAACTAGAGAGAAGTTTTTTTATGAAAATCTGATGTGTATTTCACAATGGGGGAGCATACATATTTATAAGGACTTATAGGAGCACTGACATAAGCGCTTACATCATACACACATAATTTATGCGATTACATCATTGCTTACATCATAAAACACACTTAAATACATAATAAGATTTTAAACATGCTTAAACATTAATTATACATATTATGGATTTTAAAGACTTATCTTGTTTATCCTTAGTGAACCATCTCAAATTCAATAATACGCTCGTCGCAACAACCGTAATATTCTCCTGAAAATTTGTA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00662_LTR-Caulimovirus_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

4924

Start:

143445  

End:

148368

Strand:

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>Contig00662_LTR-Caulimovirus_31

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Isatis indigotica (v1.0)

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