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Retrotransposons

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LTR

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Retrotransposons

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LTR

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-

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Retrotransposons

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LTR

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-

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Retrotransposons

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LTR

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Retrotransposons

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+

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+

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-

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-

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Retrotransposons

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LTR

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-

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TATATATAGAGTACATAGGGAATCTAGGTTAAGTACAATGCCCTGATGGGCCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

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-

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ID:

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Retrotransposons

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LTR

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-

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Retrotransposons

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LTR

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_53

TGGTATCAGAGCTTCAGCTTGTTGCTCAAGATATGGGGGATATCATTCCTAGTACTCGTACAAAAGCACTGAATACTTCCTCAATCCATTGCCCTATGTTAAACTCAACCAACTATACCGTATGGGCCATGCGGATGAGGGTTTTGCTCAGAGTACACAAGGTCTGGGAGACTGTTGAAACAGAGGCTGGAT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

120

Start:

4463968  

End:

4464087

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_54

AACAGAGGCTGGATGTGATGTTCGGATGAGAGGAGATTATCTGACATTACATGATCAAGATGGAAGACTCCTTATGAAGGCAAACAGATCAAAGAATCGTTTATATAAAGTAATCATGGA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

297

Start:

4464193  

End:

4464489

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_55

TGTTGGAATAAGCTTGGAAGAAACTTGAAGTGCAAGTTTCCTAATCCTAATCAAAGTGTGTTTCTAGAAGGTTATGATTAGAAAAGGAAATTTAGGAGTTATCTAAAAGGAAATTTAGGAGTTATCTAAAAGAAATTTGTTTATCTATTGGAATTAGGAGTTAGCTAATTCATTCTCTATATAAGGAGTTGCAGAGTTGTTGCAAATACTTATGAGTTGAGAGAGAGAGATTAAGAGAGGCTTTAGTTTTTGAGTAATTTTTCTAAAGCTAATAAAAGAAGTTGCTTTTATTAATTC

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

91

Start:

5040733  

End:

5040823

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_56

TGGGCAATGGACTTAACCTCATTAAAACCCTACCCGGTAAACCTATTGGAACAAACCCGGGTGTAAGGAAAAAGAATATTAAGCCATCATC

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

2226

Start:

5074143  

End:

5076368

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_57

GGTGAGTGAAATGGGAGAATCAAGCAATTTTGCGCAGCCAAGCATTCCAAAATTCGACGGGGACTACGATCATTGGAGCCTCCTCATGGAGTATCTCTTGAGATCAAAGGAATACTTTGGGGTGGTGAAAGATGGAGTCGGTGAGCCAACCAATGAGAAGACGCTGTCTGAGGCACATAAAAAGGTCCTTGCTGAGGCAAGATTGAAGGATCTCAAAGCGAAAAACTATCTCTTCAGTGCAATTGACAAATCCATTCTCAAGACAATCACATTGAAAGATACTTCCAAGCAACTGTGGGATTCGATGAAAACAAAATACCAAGGAAATTCAAGAGTGAAGCGGGCCCAGTTACAGACGTTGAGGAGAACGTTTGAGTTGTTGGAGATGAAGATTGGAGAATCCATCTCTGAATACTTCACAAGGGTGATGGTGGTGGCCATCGACATGAGAAATTGTGGAGATGACATGCAAGATGTCAAAATTGTGGAGAAAATCCTGCGTACATTAAATGAGAGCTTCAACTACATTGTTTGTTCTATTGAGGAGTCCAACGACATTGACAGTCTCTTGGTTGACGCACTGCAGAGCTCGTTACTGGTGCATGAGCAAAAGATGAGAAGACCAAGTTATGGTGGAGAAGAACAAGCGCTGAAAGTCACTTCCGATGATCGAAATGGCAGAGGCAGAGGAAGAATAGGCCAAGGAAGAGGACGCGGGAGAGGAAGAACTTTCAACAAAGCCACCATAGAATGTTTCAAATGTCACAAACTTGGACATTTTCAGTACGAATGTCCAAGCTGGGATGGAAAAGCTAACTATGCGGAGGTAGACGGCGAAGAAGACGACATGTTGCTGATGGCGTTCACAGAATTTGATCATGATACGCTGTTGATGGCTCTCACAGGAAATGAGAAAGGTGAAGAAGTGGTTCCTAGATTCTGGTTGCAGCAATCACATGTGTGGTAACAAGTCTTGGTTCTCCACACTCGACGAAGAATTTCGTCATTTAGTGAAGCTAGGAAACAATTCTCAATTAAAGGCGATGGGAAAAGGGAACGTGAACGTGCAAATGAACGGAAGATCACACACAATCACTGATGTGTATCATGTACCTGATTTGAAGAGCAACTTGTTCAGTATTGGACAACTTCTCGAGAAAGGATGTGAAATCTTGATGAAACACAGAGTTTGCAAGCTGTTTCATCCGAAACTAGGTCAAGTCATGGAGTCAAAGATGACAACAAACAGATTGTTCAAAATCATGGCAACCAAAAATCCGATGAACGCTGCATCCAAGTGCTTGCAGGCTGTCACAACAGATGAGTTTCAGCTCTGGCATCGCAGATATGGACATCTCAACTACAAGGGTCTGAGAACTTTGAAATATCAGAATATGGTGAAAGGGTTGCCACATCTAAAGACAACGGAGGAAGCTGCAAAGTGTGTGAGCTGTTTGGTGGGAAAACAACATCGGGAAAGCATCCCAAAGAAGAGTTTATGGCGTTCATCCCAGAGATTGGAACTGATACACTCAGATCTCTGCGGCCCAATCTCTCCAGCGTCAAACAGTGATAAGAGATATATTCTCACCTTTATTGATGATTACAGCAGAAATGTGTGGATTTATTTCTTATCACATAAATCTGAGACTTTTACTTTGTTTACAAGATTCAAAAGTCAGGTGGAGAGAGAAACTGGAGAGGCGTTGGTGTGATTGAGAACAGACAGAGGGGGTGAATTCATGTCTAATGAGTTTAAACTTTTTTGTGAAGAGACGGGGATAAGCAGACAGCTCACAACAGCCTTCACGCCACAACAGAACGGCGTCGCCGAACGCAAAAATCGTACTATTATGAATATGGTGCGATGCATTCTAAATGACAAAGGAGTCCCTCGACGGTTCTGGCCTGAAGCAGCAAGATGGGCAGTTCATGTTCTTAATAGAAGTCCAACCTCTGTAAAACCAACGGTGGACTATTTCAGAGTGTTTGGTTGTCTGGCACATGTCCATGTTCCAGATCAAAGAAGGAAGAAGCTGGACGATAAGAGCATCACATGTGTGCTAATTGGAGTGAGCAGTGAATCAAAGGGTTACAAATTGTATAACCCAGTTACGGAGAATGTCGTAACGAGTAGAGACGTTGTGTTCGAAGAAGAGAAAGGATGGGATTGGGAAAAGAAAACTGGAGAAATAAACAGAGAGCAGCTGATTTGGGAGGATTTTG

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1565

Start:

5076584  

End:

5078148

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_58

GTGATGTTCACTTCAATGGACGATCCAGTCACATATGATGAAGCCAAAGGAGATGAGAAATGGGTAAAAGCGATGGAAGCTGAGCTGGATTCAATTGAGAAAAATGGAACATGGTTTCTTACGGTGTTACCAAGAGGAGCAAAGAAGATTGGAGTGAAGTGGGTTTATAAAACAAAGCTCAATGAGAAAGGAGAAGTAGACAAATACAAGGCTAGACTCGTCGCAAAGGGGTACGCACAACAACAAGGTGTAGATTATAATGAGGTGTTTGCCCATGTAGCAAGATGGGACACAATACGTATGATCTTAGCACTGGCGGCTCAAGAAGATTGGTGCGTGTACCAGTTGGACGTAAAGAGTGCATTTTTACACGGTGAGTTATCTGAAGATGTTTATGTGGAGCAGCCGTAGGGATATACAAAAAAGGAGAGGAGAACAAAGTTTACAAGCTCACAAAGGCTCTTTACGGCTTGAAACAGGCACCCCGTGCTTTGTACAGTAGAATCGAAGCATATTTCACCAATGAGGGATTTCAGAGGTGTGAATATGAGCACACACTGTTTGTGAAAATCGGTGAAGGTAACAAGATTCTCATTGTTAGTCTTTATGTGGATGATTTGATCTTTACGGGGAATGATATGAGTATGCTTGAAAAGTTCAAATCATCCATGAAGGAAGAGTTTGATATGACCGATTTGGGAAAGATGAAGTATTTTTTAGGGGTTGAAGTGATACAAGATGCAGATGGGATTTTCATTCATCAAAGGAAATATGCTGGAGAAATCTTGGAAAGATTTAATTTGCAGTGTGCAAATGAGGTTAAGAATCTAATTGTGCCAGGATCAAGACTCTCAAAGGAAGGAGATGGGAATAAGGTGGATCCGACGCTGTACAAGCAGTTAATTGGAAACTTGATGTATATTACATCAACGAGGCCAGATGTGATGTATGTGGTGTGTTTGCTGAGCAGATACATGGCGGATCCTACCGATCAACATATGCAGGCGGCTAAAAGAGTGTTACGTTATCTGAAAGGTACTCTGGATTTTGGTGTGTTTTACAAAAGAGGAGCTTTTGGTGAGTTAACTGTCTATACGGACAGTGATTACGCCGGAGACGTCGATGACAGAAGGAGTACAAGTGGTTATGTCTTTCTTCTGAGTGGGGGAGCTGTAGCGTGGGCGTCGAAGAAGCAGCCGGTGGTAACCTGGTAACCTTATCCACGACAGAGGCTGAGTTTGTTGCAGCGGCTTACTGGGCTTGCCAGTGTGTTTGGATGAGGAGGATTTTATCAGAGTTTGGATTGGAGCAGACAAGAAGCACGACAATCATGTGTGATAATAGCTCAGCTATTAAGTTTTCTAAGAACCCGGTGTTTCACGGACGAAGCAAACACATCGATGTCAGGTTTCATTTTCTAAGGGATCTTACTAAAGATGGAGTTGTTAAGCTTGTTCACTGTGGAACAAATGATCAGATTGCAGACATCTTAACTAAGCCACTGAGATTAGAAGTGTTCGTGCGTTTAAGAGAAAAGCTTGGAGTTTGCAGAAGGTTAAACTGAA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

Start:

5101157  

End:

5101252

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_59

TATATATAGAGTACATAGGGAATCTAGGTTAAGTACAATGCTCTGATGGGCCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3480

Start:

5101253  

End:

5104732

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_60

CTCCCCCTTGGACGAGTGAACCGGGTCAGCTACTCAATCGGGATCTCGATAATGCGCTGGGGAATGTTGCCTCATTAAAACCTTACCAGGAAAAACCCAGTGGGACAAAACCATGGTGAAGGAAAAAGAGTACAACACGCATTACTCCCCCTGATTGTAGCATCACTGCAGATCTCTAAGTCTATACATTCCTATCTGTTTGACAAGCTTCCGGTGTGTTGAAGTAGGCAATGATTTGGTGAAGAGGTCAGCTGAATTCTCACTGGATCGGACCTGCTGAACGCTGAGAGTGCCGTCCTTCTGCCAGTCTGAGGTTGAGAAGAACTTCGGTAGAATGTGCTTCGTCCGATCTCCTTTGATATATCCTTCCTTGAGCTGAGCTATGCATGCCGCGTTGTCTTCATACATCACCGTGGGCTGTGTGTCTTCGTCCATACCACAATCTCTGCGGATGTGCTGAGTCATGGAGCGCAGCCAGACGCATTCCCTACTAACCTCATGAATGGCTAGGATTTCAGCATGGTTTGATGAAGTGGCAGTGAGTGTCTGCTTCATTGATCTCCAAGAGATGGCTGTTCCTCCATGCGTAAAAACGTAGCCAGTTTGAGACTTGGCAGTGTGCAGATCTGATAGATATCCTGCATCGGCGAAGCCGACTAACCCATCTTTATTTTGGTTAGTATAGAAGAGTTCTAAGTCTTGAGTACCTCGAAGGTATCTTAGGAGATGTTTTATACCGTTCCAGTGCCTCTGAGTTGGAGATGAACTATATCGAGCGAGGAGGTTCACGGCGAAACATATGTCTGGTCTAGTGTGACTAGCCAGGTACATTAACGCTCCTACAGCACTGAGGTATGGCTTTTCAGGACCAAGGATTTCTTCATCATCCTTTTTGGGACCAAGAGGGTCATCACTTAAGCTTCTAACTACCATTGGGCTGGTCAATGGGTGAGCTTGGTCCATATTAAATCGCTTGAGTACCTTTTCGATATAAGCCGATTGATGCACAAGGATTCCTTCTTTGATGTACTCAAGTTGTAATCCCAAACAGTACTTTGTTTTGCCTAGGTCTTTCATTTCGAATTCTGCTTTTAAGCAGTCGACTGTTTGGGAGATCTCACCAGATGTTCCGAGGATGTTTAGATCATCCACGTATACTGCTATGATTACAAATCCTTTGTTTGAGTACTTCTTGATGAAGATGCATGGACTGATGGGGTCATTTTTGTAGCCTTCTTTGATGAGGTAATCGCTGAGGCGGTTGTACCACATACGCCCACTTTGTTTCAGTCCATACAAGGATTTGTTCAGCCTGATGCAGTATTGATCTCGAGATGCATTTTTGTCTTTTAGTTCAATGCCATCTGGGAGTCTCATATATATTTCGTTGTCCAGGGGCCCATAGAGATATGCGGTTACAACATCCATTAACCGCAGATCAAGATTTTCTCTTATGGCCAGACTTATGAGGAATCGGAATGTTGTTGCATCCACCACTGGAGAATAAGTCTCCTCATAATCGATTCCGGGTCTCTGTGAGAATCCTTGTGCTACAAGCCGTGCTTTGTATCGAACGACTTCACCGAGTTCGTTCCTTTTGCGCACAAAGACCCATTTGTGGCCCACTGGCTTGATGTGTGATGGGGTCTGGATGATCGGACCGAACACGTTTCTGAGTTTGAGACTCTTTAACTCCACGTTTATGGCTTCTTTCCATTTTAGCCAATCTGTTCGATGTGTACACTGTGTTATTGACGTGGGTTCTAGATCCTCTTGCGTGAGCGCAACATCAAGTGCTACTTTGTATGCAAAGAGTGCATTTAAGTCGACTTCTTTTCGATTCCATTGTATTCCGGACATATTGTAATTGATGGAGATCTCATTGTTATCTTCTGAACCTGGAGATTCGGCGTCCCGAACTTCCATTGAGGGTTCATTAGATTGAGTCTCAGCCGCGGCTATGTCTGATATTGCAGGAATCCCGGTTTCGGTTATTGCACCTTTCTTTGATTTCTGGGGATTCTTATCTTTGGAACCGAGAGGTCTGCCCCGTTTGAGACGTGGTGCAGACTCTGTAGCAACTTGGGTCTGTCCCGTTGGGACAGCTATTCGTACTGGTGCATTACAAGCTGGGATGTACGATTTGGTTACTTTGGTCGGGTCAGCAAAGGAATCTGGCAATTGATTAGCTAGCTTTTGATAATGAATAATCTTTTGGATCTCTGAATCACATTCTAGAGTCCGAGGATCTTGCCAATTTAATGATGTTTGATTCCATGAAAGATCTTTGACCAGCTTGTTTGTCTCACCACCTAAAGAGGGATATACCGATTCATCGAATTGGCAATCCGCATATCTGGCCTTGAAGAGATCTCCAGTGGTTGGCTCGAGATATCTTATGATGGTGGGAGAGTCAAAACCAACATATATTCCCATCCTTCTTTGAGGTCCCATTTTGGTTCGATGTGGTGGAGCAATGGGTACATATACTGAACACCCAAATGTTTTAAGATGGGAGATGTCTGGCTCATGACCCGAGAGTAGTTGGGATAGGGAATATTTGTGTTCACTAGATGGCCGGATGCGTATGAGTTCAGCAGCATGTAATACTGCATGTCCCCATGCTGAGGCCGGGAGCTTTGATCTCATGAGTAATGGTCGGGCTATCCATTGAATGCGTTTAATGAATGATTCAGCCAATCCATTTTGAGTATGGACATGTGCTACAGGATGTTCCACGGTTACCCCCATGGCCATACAGTAGTCATTAAACGCTTGTGAGGTAAATTCACCAGCATTGTCAAGGCGGATAGTCTTTAGTGGGAAGTCAGGGAAATGGGCCCGCAATTTTATGATTTGGGCCAAGAACCTAGCGAAGGCTTGGTTCCGAGAGGACAAGAGACAAACATATGACCAACGGGTCGATGCGTCTATAAGGACCATGAAGTACCGGAATGGTCCGGAAGATGGATGTATAGGTCCACAGATATCGCCCTGGATTCTTTCTAGGAAATGAAGTGTTTGTTTACGCATCATATTTGCACCGGGATGACCGAGCCGGTCGTGCCAAATAGTATAATCAGTAAACCGGGCTTTGAGAGTGGTATTAGCTTCAATCATACTGACTTTAGCATGGTAAAGTCCAGTAGAGAGCGCGGGTATGGTTTCGAGGATTTGTTTATGGCCGTCTACGGTTTTAGTGACTAGGAGGGATTCTTTGTTCCCTTGACCTTGGGTTTCTATGTGGAAACCATTCTGTCTTATATCCTTGAAGCTCAGAAGATTTCTCTTCGAACTAGGAGAATATAGAGCATCTGGTATTTCAAGTTGTGTGCCATTTGATAGCAACACATAGGCATGGCCATATCCTTCGATAAGGTTTGAGGGACCCGCGATGGTGCTAATATTTGCGGTTTGATAGGTTAGGTTTATGAAGTAACTTTTGTTTCTTAAGATAGTGTGGCTGGATCCACTATCTAC