Eutrema salsugineum (v1.0)
ID:
scaffold_9_LTR-Copia_11741Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CopiaLength:
820Start:
12747835End:
12748654Strand:
->scaffold_9_LTR-Copia_11741
AGAAGCATGCTTATTTCTGCTTTACCGCTACTCGCAAAACGCAAGTCCATCTCAGCAAAGAAATGTTAGAGATCTGTGATCTCCTCATCACCTCTAAAGGTTTCTGGAATGGTATCCATAATGATCATTAAACCAATACGGTTAGAACATTCTCAGTTCTCATGAACTGCTTTATACTCAATAGTGCTGGTATCGGTAGGAGAAGCAGGTTGTCCCATCCTTAATGCAAGGTCAAGATCCATACACCCAATAATAATCTTAACTTTACTTTTCCATTCCGTGTAGTTGGAATAAGTAAGTGTTGGAATTGAACTTAAATTTACAGATACTGCAGTGAAATTCACTGCAAAAGAGAGAAATTATTATTAGTAACACACTACTAAATCAAATTAATCAATAAATTATAAATAAATGATTTTACAACCCATCTCAAGATACCAAGTGCAATATTATCTTTGAACAGTAATATTAAGTGCTAGCGATACTTTTGTTGAAACAATCAAACACTGGCAATAATGTATGATAAACAATAAACCTATCTTTGGATTGATTTATCATTCACATGGTTATTCCGAATAATCGTCACATGTTTATGATCACAGGTATGTATATAATTCGGCCAAATACAAACCTACCTTTATGTCAATTTAATATTCGCATGAATATACATACGCACATAACATATAATATTATCCATAAAAATATCCACAATAGAGGTTACTTTGGCAACATATTGCATCTATTAATCCACTTAAAATATTGAACTTGTACAATTAAAATTTTATCTATTGAATAGGAGCTTAATTTTATTCTTGTGCAG
Eutrema salsugineum (v1.0)
ID:
scaffold_9_LTR-Copia_11742Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CopiaLength:
96Start:
12767883End:
12767978Strand:
->scaffold_9_LTR-Copia_11742
CAAATCCAAAAATTTGCTCAAAAGTTTTCAAAAATTTCCAAAGCTTTGAAAAAATAAAACTCTAAAGCCTTGAAACTGATTAAAACTTTTGAAAAA
Eutrema salsugineum (v1.0)
ID:
scaffold_9_LTR-Copia_11743Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CopiaLength:
4432Start:
12786063End:
12790494Strand:
+>scaffold_9_LTR-Copia_11743
CTGAAAAGTCTTTTAAAATCCGAAAATATAAAAATCCTTTGAAAACTTTTCAAAACGTAGTAAAAACACCTGCAAAAGATATTAAAGTGATCCATAAAAATGGTCAAATTCCGGTGTTATCAACTCCCCCAGACTTAGACTTTTTTTTGTCCTCAAACAAAACAAAGACCAAATCTCGGTGAGAGGTTTGAAAACGCAGGAACTAACAAAATCTCAGAGACCACACTTGTAGACTAATATCAATCATTATGCATCAATCGGTAATAACCTATAAAATTCTCACTAAAAGTACGGGTATAACTAGTTTGTTAATCCGTCATGCGGAAATCTATACACTTAGATTTAACTACCAGTCAACTAGTTATAAACATTTATTAAAAATTTTGGTGATTCTCATCAAAGAAAGTATAAGCAAGGCGATCTAATCTAGGTATCAAAAGGGGTCATTCTAGGGGTGAGGCTTAAAGTGTTTCTGTGTTACCTGAAGATCTGGAGGATGCAAGATAATATGCAAAACCGCAAGAGAGAGTGAACCTATTGATATCCACACTTTCCAGTCAATTTCTTCTTGCCATAAATCTTTGGTCTTCTTCCTCAGGTTCTCTCCTAAATCCCCCAGACTTAGATTTTTGTCTAACTTACAAAGTCATAGCTCCATAGATGAATAATGGTTGCCTTTGCTCCAAATAATTTTGACAATCTAAGACTCATTAGGCTTTTGTTTCCTTTCCTTTCATTTTTTTTTTGAGATAGAGGAAACAACTTTAGATATAGATTCATAGAGAGCACAAAATTGCCAACAAGAATGAATTTTCTGAGGCAATATAAAGCTTGATAAGGTTTCTGATACTCTTCCTTCCCAATTCCATTCAGTTTTACTCTTGAGTGACTAAAAACTGCGTCGTTCCTCTTCTCTCCAACATTTTTGCACACATCTGCTGATATAAACGAAAGAGAGAATGCATGAGGTTCGAAAATAAAGGTTTGGGTTTAGGGTATGGTACCAGCTAAAGATGAACTGGCCACCTAGGACAACAAAGATTGGTAAAAATGAGGAAAATGATGTCCTAGATGTATAGCTCGATGCCTGCTTATAATCAATGATGAGAAAATTAGATATCAATATTAACGTCAAATAAAAAGAGCTAGTATATCTTGTCAGAAAGAATCTCCATGAATAGAAGTCCTCTGGTGGGAGTTCGTAGTGCAAGTACTTAAGCTACCGCCTAGTCTAGTGCTAACCACAAATGAGCTATCATGCGTAGTGTAGAAGCGTCAGGTCTAAGTCATCATATTTTTGTGTCAAACATTCCTGAAAAATACTAAAAGTCGCATAGGTTACATATTAAAAATTTAAAAAGTACTTGAAATTTGAAAACAAAGCAAGAAAATGATTAGTACGGATAGACATCATCCCCCAGACTTAAATCACATTGCCCCAATGTGAAAAAGTTGGTGAGAAGATGGTAAATAAAAGCAAGATAGTCTAAAAATAGAAGAAAAAAAAATGATGATAGAAGCGTGATGGTGGTGAAATGACGATGAAGTCCTGATCTATCAATCTTCGTCTAATGTGTCTACCTCGAACTGGTGCTGCTCCTGCAGGAAGGTGGCGACGCGCTCAAAACGTCGTCCCTGTCTCTCAACTCTGCGCTCCAGGTCAGACTGTGTGCCTGATGATGTAGATGATGAGGTATGGTCGGTGGAAACTGATGGCTGATAGCGAGAACGTGCTGCAGCTGCGTCGCGATTGGCCTTAGCCACTATGTATTGCCCTATAGTGAGTGGCAGGCGAGGTACAGAAGGTAGAGACTCATCAGGTCCCGGAGTCCATTGTGGGCGTGCTCCGTTACACAGTCTCGGGACTGATGCTGAAGGTAAACAAACTCGGTGTTTCTCGGTGGCAGTGCAATATTTGTAACCGAACCTGTCTGGATTGAAAATGGCACGAGAGATAGTGTGATCGCAAGAAGGATAGAGTAGGTCATACCAGACGTCGACAAGTGGATCATCAGATGAGAAATCAAATCCCAAAAGCAGTAGTAGTATCATCACATCCATGTAAATCATGCTTCACCTTCACCATGTTCTGTGCAATTATCCAGGCAAAGCAGGAAAGTCGAGGGTTGTCCATAAATGGTGTCTGAAGTGTAATGAGCTCGGTCTTCAGGATACACCCGTGTTGGCTCTAGAGAAAATCGTGGGTGCCAAGAGTTTGTGCACAACTCTCACTGCAGGATGAGTAAGAAGGGCTGACTTGGATCTCTTGCTACCATAGACTCCATGACCCATCTCTCTCCACAAGTCAAAATCAGGCTTTTCTTTGAGATGAATGTCATCAGTGTATGGAAGCTTAAGAGCTTCACAAAGTGCAGAAATGGTGAGTGTGTAGGACTGTCCGCGGATAAAGAATGATAAAACACCGTCAGATGCGTTGGGGCTCCTCCTCTTCGTGTGGTGAAGAACTCGCGAACTAGCTCGGCATAAGTTGGAAGATTCAGCTCCATGTAGGGTCCCAACCTAAGTGCCTCGATATACCAGATGATATCTTCTCTGATCCCAAGCATCTCGAGTGTATGATAATCAATGCAGGGCATTGGTTTGATGTTCAGATTCTTGAACCGTCTTGCATAGTCGACTCTTGGGTTGATCTCCATACTAATGTATCTGATCTTTGGTGGCTCGTGAATCGCATGGGCCTCTCGTGAATGTTGGAGGAGCCTCATCACTCGACCTCTTGTTCTCAGTCTAGCTCGGCTCAGCATGTACTCTCCAAGATTACTATCATCGGGTATTGCCTCGGAGCTGTCACCAGTGCAACGGCTTATTCCAGACTCGGTTTGTTCCATGTTCCTGCAAGACAAGATGATTCTCGAAAAAAGAGTAAATATGGATGCTGAGTTTAACGCGTTAACGCTCAGGGATACAAATCAGAGTATCAAGAGATTTGTTAAAACAACAAGCAAGCTTAATCGATATCAATTCAAAAAATCGAGTACTTCATGACCTGATTCGGATTTATGATGTTCTTGACATAGACATTTTCTAAAAATTGGTTTAATTGAGAAATTTCCTTGTCAAATTTATAGGTTACCTAATACGAATCACTAATAACACAACATTTGATCAAATTCATCAACTTTACTAGTCCAAATTTGATTTTCAAAAAGCATATAGAATCCAAATTTCAAAATTCTCAATTCCTCTTAAACCAGGTGTCAAAATCGATTTCCAAACAACCTAGAAGGCCAATCTATTATTATTAAGCTATCTCTTCCACTAATAAACTTAGATTTGAGCTTTTTAAGAAAACCCTAAATTCCAAAATCAATTAAAAATGGCGAGTTTGAGCTTCATACCTTGCTAAAGAGCGATTTGATGATGGATTTGAAATCAGCTTTGAAAAAGAGTGAGGTTTGGTCCAAGAATCGCTTAAGAAGCTTAAGAATTGAAAAAGATGTTCTATCTCTTAAATCTCCAAGTCTCTTGGAAGAGAAGAGGAAAAGGAGTTTTGATCCAAAAAGTGCACTTCCTTTCTTCAAAGAGCGTTTTTGCTACAAAAACACGGGAAAATTTTGGAAATTCAAAAGCTTACGGGAACTTACCTTACTTGTTTGTTACGTAACTGGGAATTAAAAACTTACGGGAAATCAGAATGACCTGTCCCGAGAATGTTCCGAAATCACCGGGAATCTCTGAAAAGCACCAAAAATCAGAGGTCCTGTCTCAACGACAAACGGCCGCGGTTAGGAGACGCACGATCGCGTGTGAATAAGGGTCCGGCCGCGGTCACATTCACGGTGCTGTGGTCGATCATACGTTGGCTGCGGGTTGGTTGGTTGCGACCGCGGCCGATTTTCCTGCGGCCTGCATCCTTCATCCAGGTTCCAGCCAGGCCGAGCAGCTAAAAACATATACTTCTTTTTTGGGATTTTCTATTTTTCTGTTTTTTTGTGCTTTTGTTTTATAAGAGTACCTGAAACTTTAAAAGAAAGAGAAAACATATATTGCAAAAAGAAAGAGAAATCTAAAAGAAAGTGTACCTAAATGGGTTGCCTCTCATTAAGCGCTTTTGTTTTAAGTCGTTTAGCTCGACTTAGGCTTAAAAGATCAGGTAGGAGGACATGGCACTTCTCTTGATGTGCCTTTATCATCCCCAGGTGTTGGAGATTTGGCTTCTTCTCCTTGTAACACCAACTTCTTTCCTTTACTCTTCTTTCGTACTTTAACGTTGTTTAGGACCTTTTTTGTGTTATCAATCAGTTCTTAGATCTGTTCCTCACTAGACTCTGTTGAATCTGGTCGGGATGATTGTCTTGATTTTTGCAAAAGGCCTTGACTTCTCCTTGTCTTTCTCCTTTGGCTGCTTTCCTTTGTTTGAAACATCGTCTGGGACAGTAGGATAAAACTTCTTGTGATCCACATTCAGGAA
Eutrema salsugineum (v1.0)
ID:
scaffold_90_LTR-Copia_11744Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CopiaLength:
4460Start:
4260End:
8719Strand:
+>scaffold_90_LTR-Copia_11744
AACGTATCGAATATGTGGTGGCTCAGGAGCTGCTCGTGTTTCTCTTGAGTGCTGGAGCAATCTCATCACATAGTTTCTTTTTCTCGGTCTGGCTTGGTTCAGCATGTACTCTCCTAGAGTAGCATCATCGGGAATGTCCTCAGAGCTGTCACCAGTGCGACGGCTTCTTCGGGATCTGGTTTGTTCCATTTATTTTTCTGCAAAACGAAATGATTCTTGGAAAAACTGTGAATATGGATGCTGATTTTAACACATTAAGATCAGTTATACTAATACTAGTATAAAGAGATTAATTAAAACCATGAGCAAGCATAATTGACATTAAATCAAAGAAATCGAGATGTTCATGACTAGATTCGGATTTTTGATGTTCTCAACATAGAAATCTTCTAAAAATCGGTTTTAATGAGTAATTTCCATGTCAAACCTATAGGTTACCTAATACTAATCACTAATCACACAAGACTTAATCAGATTCATCAACTTTGCTGTTTTAAATTCGATTTTTATAAAGCATGTAGAATCCAAATTTCAAAAATCTTAATTCCTCTTAAACAAGGTGTTAAAATCGATTTTTAGATAACCTAAAAGGATAATCTATTGTTCTTAAGCTATTTCCACTATCAATAAACCAAGATTTGGGCTTTTTAAGAAAACCCTAAGTTCTAAAATCAATTAAAAATGGCAAGTTTGAGCTTCATACCTTGCTGGAAAGAGAGATTTGATGACAGAATTGAAATCAGCTTTGAAAAAGAGTGAGGTTTGAGCCAAGAATCTCTTAAAAAGCTTAAGAATTGAGAAAGGTGTTCTATCTCCTAAATCTCCAAGTCTTTTGGAAGAGAAGAGAAAAAGGAGTTTTGATCCAAAAAGTGCATTTCCTTTCATTAAAAAGCGTTTTTGTAGCAAAAACGAAAAATTTTCGGGAACTTACCTTTCTTGTCTTGCACGCAAGGAAGGTTTAAAGCTTACGAAATATCTTAGCGGGCTTTACCGGGAATACTCCAGAAATCACCGTGAAACTTTGAAAAGCAGCGGAAATCCGCATCGTCACCTCAACGACCAACGGCCGCGGTCAGGAGACGCGCGACCGCGGCGATTGAGGGCTCGGCCGCGGTCACATTCACGGTGCCGCGGTCGATGCACCCTTGGTCGCGGGTCGGTTCGTCGTGACCGCGACTCTTTCTCCGGCGGCCTTTGTCCAACTTTCTGGTCTTTGCCGGGCCGAGCAGCTAAAAACCTACGCTTTTCTTCTTGGTTTTTCTAATTTTCTGATTTTTTGTGTTTTTGTCTTATAAAATACCTGAAACTTAACAGAAAAAAAAGCATAGATTGTAAAAAGGAAAAGAAAACTAAAATAAAAAGTAGCTAAATGGGTTGCCTCCCATGAAGAATCATAGATTTTAAGTCGTTTAGCTCGACGTAGGCATGAAGAATCAGGCTGATTTGAATGGCACTCCACTTGATGTGCCCTTATCACTTCCGGTCGCTGGAGGTTTTACTCCTTGAGGAGCCGTCTTCTTTCCTTTACTCTTCTTTCGGACTTTAATAGTGTTTAAAACCCTTGTTGTGTTTTCGATCAGCTTCTGGATTTGGTCCTCACTAATTTCTGTTGCATCTGGTGGAATGATGATCTTGATCTTTGCAAAAGCTTTCGGCTTCTCTTTTTCTTTCTCTTTTGGCATGTTCCATTTGCTTGGAAAATCGTCTAGGATAGTCGGGTAGTACCTTCTGCGATCCACATTGAGGAAAACAGCATGCCGGTTTGCGTGATCGATTACTGCTCCTACGGTAGCTAGGAATGGTCTCCCGAAAATGAGTGGCCTCTCCTTGTCTTTATCCATCTCCAGGACTTGGAAATCTGCTGGAACAATCTTGTCTCCCACTAGAACTTGTAGATCATGAATCGCTCCTTCAGTATCTTTTTGGGATGAATCTCCAAAAATAACCTTAACCGTCGATGTCCTTAAGGTTTTTATGCCCAATTTTTCGGCAAATGTCTTCGACATGATGTTGACATTGGCTCCGGAATCGCACAGGCAGTCTGTGAATTTGATTCCTGAAATGAAACATTGGAAAACAAAACGTCCCGGATCTTTGGCTTTTGTAAGCCTTTGAAACGGTGATCGTTCAGGTACCTTAAATGGTGGCTGCTTGGCATCGACATCCTTGTACAGTGGTACAAAGATTGGGGTTTCTTCTTTCTTTCCATCGGTTCTGGCCTCTTCTTCGGGCAATGTGGTTATGGCGTTGCAAAACATCTTAGGGTTATCTTCAACTCTTCCTGGAAGAACTCCACTTTGCCTCTTCATAGAGTCGGCTGTTTGGGCAACTTGCACGTCTAGCTTTTTGACGTGCGAAGATAAAGCTTCAAACTTCCCGTTCAGGTCATTGTACATGCAGTCAACCTTTACGTTCACGTCTTTAGATGCTTTTTCATTCGTCATAACGAGCTGTTGGATGGACTATTCAAGTCTACCGATTTGGGAAGCTAGCTGGTTCATCGTGACTCCTTGCTGTTGTACAAATTTATTGTTAAAACCCGTACATTGGTAGTTATATGGCTGTCGCGGTTGATATGGTCCTGTCCCTCCGAAGTTTCCACCTTGGAACTTGTTTTGGAAGGACTTTTGCTGTGGTGGGTAGTACTGATCTTGAGGATTCTCCACATTTGGATTGCGGTAAGAGAGATTGTTTTAATTTGCATTCCGGAAGTTGTTGTTGAAGCCATTGTTGAAGCGATTTTGATATGGTACTAGCGCTCCTACATAGTTCACATCTTCTTCTTGAAAGGCTTGATTAATGTGATCAATATCACTAGGTCCTTCATCTTCTGCGCCATTGTTGGTCTCACAAGCATGGATTGGGCGATTGTTGCTCTTCAGAAGCGGGCTCATCATGTTCTTCAACTCGGTTATCTCCTTGTTGTCTGTTCCGGTTTGCTTCGTCGATCGATCGTATTCAGGATAATCATTGTTATTGGCTTGAGCCAAATTTTCGATGAGGGCTCTTCCTTGGGCTATCGTCTTTTGTCCGAAATCTCCATTGCTAGCTGTATCAAGTGAAAGTTTGTATTTTGGTTGCAAACCTCTGTAAAATGTTCTCAGCAGGCTTGATCCAGGAAATCCATGGTGAGTGCAATCACGTTCATACTCCTTAAAACGTTCCCACGCTTCATAGAAAGATTCAGTCGGTCCTTGTTGAAAGCTTGAGATCTTTGTTCTCAACAAGTTCGACCTTGACCTAGTATAGAAGTGATTCAGGAAAGCGGTTTTACACTCTTTCCAATTAGTAATAGATCCTGCAGGCAAAGATTTCAACCAACGGTGAGCTTTGTCTGCTAATGAAAAAGGGAAAAACTTACACTTTAAATAGTCTGCTGGAACTTGGTTTGTTCTCATCATGCTGCAGATTTCTTCAAAGAGCTCGATATGGTCCATCGGGTGTTCGTAAGGAACTCCATGGAATTGGTTTTGTTTCACCAATGAGATGATTTGAGGCTTGACTTCAAACTCAATCCGGTTCGGAAATGGAACTTGAATTGCAGATCGGTTCTGAAATTTTATGAGTAGGTGCATCGAAATCAGCTATGCGATGGTTCCTGGCTTGTCTTCGGTGTTGATTTGCTGGCTGCACAGGGCGGTTAACGCGTCCATTTGGCTGCATCCCCGTGTGGTCACCATCGGCTGCATTGATGGGTGCATCAAGGTCTTCTTCTCTCTCGCGGTTCTAGTGATTTCTTGGAGGAACCTCATCCTCATCTCCATCTTGTCGAGCATGATCACCTCCTCTGTGATCATTCTCTTCATTTTCTCCATGTTCGGACCCGTCTTGGTCCATATTTAAAGCTCGGTTAATAGGATCTCCAGGCTGGTTGTCATTGGCCATTCCTTGCGTTCGTCTAAGTCTTCGAAGTTCTCTTTCGTGTCTGTCTATCTCATCTAGAATTGGAATGTTTTCTACAGGTCTGCGCCTGGTATTCATGCAATTCAGAGAAAAACAAATGAAGGGAAAGATAATTCAGAAAAACTTTAAGAAAAAACTAGAGATCAGGTGTCTAGAACAGAAGTTAAAACAAGAAAAATAACAAAAGGCAGCGAAACAAGTCCCCGGCAACGGCGCCAAAAACTTGATGTCGTGTCAACTGCGTGAAGGAACAAGTTTTACCCTTAACAAAAACAAATGAAAGCCGCAAGTGCACAGCTAATCAGTTGTAGTATTTAGGTATCAAATCCACAGAGATTTGTGTGCCTGGTATTCTTCTACGGTTTCTAACTTTATGTCTAGACTAGATTGATTTTAAAGGTTGGTTGTTTATCACGAATTAAACTAAAGTAAAAGAAAGCAAATAAATATATCCAAGAAAGGAAGTAGAAAAATCGAATGGGAAGCAAGTAAAGCAAGTAAAATATCGAACTAAGGCAATTGAAATGCAGATCTAAATAAACAAGTAAAAATCGACT
Eutrema salsugineum (v1.0)
ID:
scaffold_95_LTR-Copia_11745Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CopiaLength:
508Start:
3149End:
3656Strand:
->scaffold_95_LTR-Copia_11745
TCATCCACTTCTTCTTCAGCTTCAGGTAGTTTTTTGAAGGCTGTCCAGTTAGGTGGGAGCTTCTCAATGATGCATGCGGCCTGATAGATCTCACACAGCCTCATACCCTCAGGAGGAGAGTTTGTAGCTCTCTGAATTGAACCATTATTGGCTGCGAGTCCACCATTTTGTAGTCTTGAAATTTTGTCACAGCGTATTTCTAAGATCCATCATCTTCTGTGTGATACTTCTTGTCTAGAGAATCCCACAATTCTTTAGATGTTTCAACATTGCTATACACATCGAACAGTGAATCAGCAAGGCGACTTTGGTTGTATCCTTTCCACAGAAATCTCTGTGTTCTCAAGCTAACATGCTCGCAAGCGCGTAAGCATCATCATTATCCGCTGGAAGAGAGGTCTCTCTTCATGGGTGTACTTTCCAGTTTAAGTGCGGCTAGATAGAAAAACATCTTCTTCTGCCACATTTTAAAATTGGTCCAATAGAACTTTCTGAGAAGGACACCTAC