ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
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scaffold_1_LTR-Copia_22 RetrotransposonsLTRLTR-Copia9616015941601689+
scaffold_1_LTR-Copia_23 RetrotransposonsLTRLTR-Copia9616148051614900-
scaffold_1_LTR-Copia_24 RetrotransposonsLTRLTR-Copia360316149011618503-
scaffold_1_LTR-Copia_25 RetrotransposonsLTRLTR-Copia135816186911620048-
scaffold_1_LTR-Copia_26 RetrotransposonsLTRLTR-Copia154217044681706009-
scaffold_1_LTR-Copia_27 RetrotransposonsLTRLTR-Copia125017065201707769-
scaffold_1_LTR-Copia_28 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16117085751708735-
scaffold_1_LTR-Copia_29 RetrotransposonsLTRLTR-Copia11224524342452545+
scaffold_1_LTR-Copia_30 RetrotransposonsLTRLTR-Copia171524531812454895-
scaffold_1_LTR-Copia_31 RetrotransposonsLTRLTR-Copia258724550852457671-
scaffold_1_LTR-Copia_32 RetrotransposonsLTRLTR-Copia19126506592650849+
scaffold_1_LTR-Copia_33 RetrotransposonsLTRLTR-Copia360926648892668497-
scaffold_1_LTR-Copia_34 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8926836912683779+
scaffold_1_LTR-Copia_35 RetrotransposonsLTRLTR-Copia20226837952683996+
scaffold_1_LTR-Copia_36 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16429868012986964-
scaffold_1_LTR-Copia_37 RetrotransposonsLTRLTR-Copia410429870492991152-
scaffold_1_LTR-Copia_38 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16429912432991406-
scaffold_1_LTR-Copia_39 RetrotransposonsLTRLTR-Copia360331411693144771-
scaffold_1_LTR-Copia_40 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8531449593145043-

< 2 3 4 5 6 > Total 588


Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1067

Start:

1600527  

End:

1601593

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_21

CCTAGGCAAACAAGTACTGTTTGGGATTACAACTTGAGTACATCAAAGGAGGAATCCTTGTGCATCAATCGGCTTATATCGAAAAGGTACTCAAGCGATTTAATATGGACCAAGCTCACCCATTGACCAGCCCAATGGTAGTTAGAAGCTTAAGTGATGACCCTCTTGGTCCCAAAAAGGATGATGAAGAAATCCTTGGTCCTGAAAAGCCATACCTCAGTGCTGTAGGAGCGTTAATGTACCTGGCTAGTCACACTAGACCAGACATATGTTTCGCCGTGAACCTCCTCGCTCGATATAGTTCATCTCCAACTCAGAGGCACTGGAACGGTATAAAACATCTCCTAAGATACCTTCGAGGTACTCAAGACTTAGGACTCTTCTATACTAACCAAAATAAAGATGGGTTAGTCGGCTTCGCCGATGCAGGATATCTATCAGATCCGCACACTGCCAAGTCTCAAACTGGCTACGTTTTTACGCATGGAGGAACAGCCATCTCTTGGAGATCAATGAAGCAGACACTCACTGCCACTTCATCAAACCATGCTGAAATCCTAGCCATTCATGAGGCTAGTAGGGAATGCGTCTGGCTGCGCTCCATGACTCAGCACATCCGCAGAGATTGTGGTATGGACGAAGACACACAGCCCACGGTGATGTATGAAGACAACGCGGCATGCATAGCTCAGCTCAAGGAAGGATATATCAAAGGAGATCGGACGAAGCACATTCTACCGAAGTTCTTCTCAACCTCAGACTGGCAGAAGGACGGCACTCTCAGCGTTCAGCAGGTCCGATCCAGTGAGAATTCAGCTGACCTCTTCACCAAATCATTGCCTACTTCAACACACCGGAAGCTCGTCAAACAGATAGGAATGTATAGACTTAGAGATCTGCAGTGATGCTACAATCAGGGGGAATAATGTGTGTTGTACTCTTTTTCCTTCACCATGGTTTTGTCCCACTGGGTTTTTCCTGGTAAGGTTTTAATGAGGCAACATTCCCCAGCGCATTATCGAGATCCCGATTGAGTAGCTGACCCGGTTCACTCGTCCAAGGGGGAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

Start:

1601594  

End:

1601689

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_22

TGTTATAACACATATCATATATGAACTCTTATACCGGCCCATTAGGCCCATCAGGGCATTGTACTTAACCTAGATTCCCTATGTACTCTATATATA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

Start:

1614805  

End:

1614900

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_23

TATATATAGAGTACATAGGGAATTTAGGTTAAGTACAATGCCCTGATGGACCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3603

Start:

1614901  

End:

1618503

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_24

CTCCCCCTTGGACGAGTGAACCGGGCCAGCTACTCAATCGGGATCTCGATAATGCGCTGGGGAATGTTGCCTCATTAAAACCTTACCAGGAAAAACCCAGTGGGACAAAACCATGGTGAAGGAAAAAGAGTACAACACGCATTACTCCCCCTGATTGTAGCATCACTGCAGATCTCTAAGTCTATACATTCCTATCTGTTTGACGAGCTTCCGGTGTGTTGAAGTAGGCAATGATTTGGTGAAGAGGTCAGCTGAATTCTCACTGGATCGGACCTGCTGAACGCTGAGTGTGCCGTCCTTCTGCCAGTCTGAGGTTGAGAAGAACTTCGGTAGAATGTGCTTCGTCCGATCTCCTTTGATATATCCTTCCTTGAGCTGAGCTATGCATGCCGCGTTGTCTTCATACATCACCGTGGGCTGTGTGTCTTCGTCCATACCACAATCTCTGCGGATGTGCTGAGTCATGGAGCGCAGCCAGACGCATTCCCTACTAGCCTCATGAATGGCTAGGATTTCAGCATGGTTTGATGAAGTGGCAGTGAGTGTCTGCTTCATTGATCTCCAAGAGATGGCTGTTCCTCCATGCGTAAAAACGTAGCCAGTTTGAGACTTGGCAGTGTGCGGATCTGATAGATATCCTGCATCGGCGAAGCCGACTAACCCATGTTTATTTTGGTTAGTATAGAAGAGTCCTAAGTCTTGAGTACCTCGAAGGTATCTTAGGAGATGTTTTATACCGTTCCAGTGCCTCTGAGTTGGAGATGAACTATATCGAGCGAGGAGGTTCACGGCAAAACATATGTCTGGTCTAGTGTGACTAGCCAGGTACATTAACGCTCCTACAGCACTGAGGTATGGCTTTTCAGGACCAAGGATTTCTTCATCATCCTTTTTGGGACCAAGAGGGTCATCACTTAAGCTTCTAACTACCATTGGGCTGGTCAATGGGTGAGCTTGGTCCATATTAAATCGCTTGAGTACCTTTTCGATATAAGCCGATTGATGCACAAGGATTCCTCCTTTGATGTACTCAAGTTGTAATCCCAAACAGTACTTTGTTTTGCCTAGGTCTTTCATTTCGAATTCTGCTTTTAAGCAGTCGACTGTTTGGGAGATCTCACCAGATGTTCCGAGGATGTTTAGATCATCCACGTATACTGCTATGATTACAAATCCTTTGTTTGAGTACTTCTTGATGAAGATGCATGGACTGATGGGGTCATTTTTGTAGCCTTCTTTGATGAGGTAATCGCTGAGGCGATTGTACCACATACGCCCACTTTGTTTCAGTCCATACAAGGATTTGTTCAGCCTGATGCAGTATTGATCTCGAGATGCATTTTTATCTTTTAGTTCAATGCCATCTGGGAGTCTCATATATATTTCGTTGTCCAGGGGCCCATAGAGATATGCGGTTACAACATCCATTAACCGCAGATCAAGATTTTCTCTTATGGCCAGACTTATGAGGAATCGGAATGTTGTTGCATCCACCACTGGAGAATGAGTCTCCTCATAATCGATTCCGGGTCTCTGTGAGAATCCTTGTGCTACAAGCCGTGCTTTGTATCGAACGACTTCACCGAGTTCGTTCCTTTTACGCACAAAGACCCATTTGTGGCCCACTGGCTTGATGTGTGATGGGGTCCGGATGATCGGACCGAACACGTTTCTGAGTTTGAGACTCTTTAACTCCACGTTTATGGCTTCTTTCCATTTTAGTCAATCTGTTCGATGTGTACACTGTGTTATTGACGTGGGTTCTAGATCCTCTTGCGTGAGCGCAATATCAAGTGCTACTTTGTATGCAAAGAGTGCATTTAAGTCGACTTCTTTTCGATTCTATTGTATTCCGGACATATTGTAATTGATGGAGATCTCATTGTTATCTTCTGAACCTGGAGATTCGGCGTCCCGAACTTCTATTGAGGGTTCATTAGATTGAGTCTCAGCCGCGGCTATGTCTGATATTGCAGGAATCCCGGTAACGGTTATTGCACCTTTCTTTGATTTCCGGGGATTCTTATCTTTGGAACCGAGAGGTCTGCCCCGTTTGAGACGTGGTGCAGACTCTGTAGCAACTTGGGTCTGTCCCGTTGGGACAGCTATTTGTACTGGTGCATTACAAGCTGGGATGTACGATTTGGTTACTTTGGTCGGGTCAGCAAAGGAATCTGGCAATTGATTAGCTAGCTTTTGATAATGAATAATCTTTTGGATCTCTGAATCACATTCTAGAGTCCGAGGATCTTGCCAATTTAATGATGTTTGATTCCATGAAAGATCTTTGACCAGCTTGTTTGTCTCACTACCTAAAGAGGGATATACCGATTCATCGAATTGGCAATCCGCATATCTGGCCTTGAAGAGATCTCCAGTGGTTGGCTCGAGATATCTTATGATGGTGGGAGAGTCAAAACCAACATATATTCCCATCCTTCTTTGAGGTCCCATTTTGGTTCGATGTGGTGGAGCAATGGGTACATATACTGAACACCCAAATGTTTTGAGATGGGAGATGTCTGGCTCATGACCCGAGAGTAGTTGGGATGGGGAATATTTGTGTTCACTAGATGGCCGGATGCGTATGAGTTCAGCAGCATGTAATACTGCATGTCCCCATGCTGAGGCCGGGAGCTTTGATCTCATGAGTAATGGTCGGGCTATCCATTGAATGCGTTTAATGAATGATTCAGCCAATCCATTTTGAGTATGGACATGTGCTACAGGATGTTCCACGGTTACCCCCATGGCCATACAGTAGTCATTAAACGCTTGTGAGGTAAATTCACGAGCATTGTCAAGGCGGATAGTCTTAAGTGGGAAGTCAGGGAAATGGGCCCGCAATTTTATGATTTGGGCCAAGAACCTAGCGAAGGCTTGGTTCCGAGAGGACAAGAGACAAACATATGACCAACGGGTCGATGCGTCTATAAGGACCATGAAGTACCGGAATGGTCCGGAAGATGGATGTATAGGTCCACAGATATCGCCCTGGATTCTTTCTAGGAAATGAAGTGTTTGTTTAGAGATTTTAACTGGTGAAGGCCGAGTGATCAATTTGCCTTGAGAACAAGCTGTGCACATGAGGTGTTGAGGATAAGCTCGGTTTTCTTTGAGGGTATGCCCTTGGGAGTTTTGAATTAGTTTACGCATCATATTTGCACCGGGATGACCGAGCCGGTCGTGCCAAATAGTATAATCAGTAAACCGGGCTTTGAGAGTGGTATTAGCTTCAATCATACTGACTTTAGCATGGTAAAGTCCAGTAGAGAGCGCGGGTATGGTTTCGAGGATTTGTTTATGGCCGTCTACGGTTTTAGTGACTAGGAGGGATTCTTTGTTCCCTTGACCTTGGGTTTCTATGTGGAAACTATTCTGTCTTATATCCTTGAAGCTCAGAAGATTTCTCTTCGAACTAGGAGAATATAGAGCATCTGGTATTTCAAGTTGTGTGCCATTTGATAGCAACACATAGGCATGGCCATATCCTTCGATAAGGTTTGAGGGACCCGCGATGGTGCTAATATTTGCGGTTTGATAGGTTAGGTTTATGAAGTAACTTTTGTTTCTTAAGATAGTGTGGCTGGATCCACTATCTAC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1358

Start:

1618691  

End:

1620048

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_25

TTCAGATGATTGAATTAATCGAGGAGATCAGCTGTTTCATAGTCCATGGGGTCGGTCTGCTCGTTTGTGGTGTTCTCATCATCAAGGAGGTCGTCACCTTCCAGGTTAGCAGCATCGACTGGCTGAGTCATGTTGGCTTCAGCAGGAGCTTTTCCGTACTTCTGGTATAGATCGCAGTGGATCTTGGGGGTGCGACATTGCTTTGTTGGTGTGGTCGGGGTTGGTGTGGCGGGTCGGCTTGGTGATGCCTCGACCACGACCAGGACCATAACTGAGGTTAGGTCGGTTGCCACGACCATGTCCGCGTCCATGTCTTCCACGTCCATGTCCTCGGCCATTACCACGTCCATTACCACGTCCACGGCGGTGATCTGAGGATCTATCGGGTTGAACATGGTAGGACTCTTGACGAGAAGCTGGGACAGGAGCCGATCCCGAGGGCCTCATAGCGCTGTTCCTCATAAGCAGCTGGTTATTCTTCTCAGCGAGGAGAAGACAGGACAACAAGTCTTCGTACAATGTGTGTTTCATTGCACGGTATTGTTGTTGGAGCACAACATTCTCTGTGTTGAATGTGGATAATGTTTTCTCGAGGAGATCATTATCTGTCACATCCTCGCCACAGAGTTTCCGGATGGCAACAATACGAAAGAGTTCGTTGTTGTAATCATCTACGGATTTGTAGTCCTGGAACCGAAAGTTCTTCCAGTCGAAATCTGCCTGAGGCAACTGGACCATTTTCTGATGGTCATATCGCTTTTTCAGCGCTTGCCACAATTCAAGTGGATTCTCAAGAGTGAGATATTGCTGCTTAAGGCTCGGGGCCAGATGATGGCGTATGTGACATATCGCCTGAGACTGTCCCTTACGGGATGCGGTGTTACCGTCGGTAATACATGCATCGAGTTCTTTTGATGCAAGGAACAAGCGCATGTCTAGGGCCCACTCGAGGTAGTTATCCCCGGAGACGTGAAGGGCCTCGAATTCACATTTCTGAATGTTTGACATCTGAAACATGAGATTGATTTTGTTAGGGATTGTTTTGAGAAAATTTTGAATGCTGATGATGAAACTTTCTATTTTGAGAATATTTCTATTTTAGGAAAGTTTCTAAATTTGGAAAGTTTCTAATTTGGGTAATTTTCTAAATGAGGAAAGTTTCTATGTCGGGAAAATTTCTATATGAGGAAAGTTTTTATATGAGGAAACTTTCTATTAGAGGGAACTTTCTCGGAAATAGTAAATTTTAAAGGGTATGGTTTTAGTTACCCCGAACATGATGTCGGTTTAATAGCTGTGATTTAATCGGTTAAAGCCGAATATAATTTCGGTTAATGAGAACCAGGTTTAGCCGGTTT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1542

Start:

1704468  

End:

1706009

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_26

GTCCAATACTCCCCCTCAAGATGGTGAGTGGAGGTCACGAACTCCCATCTTACGAAGAAGATAAGAGAATTGAACACGTCCAAGAGCTTTAGTCAAAAGATCCGCCAACTGTTCAGTTGTTCGAACATAAGCAGGTACAAGTAAACCATCCTGAAATGCATCCTAAATGATATGGCAATCATTCTCAATATGTTTAGTCCGTTCGTGAAAAACTGGATTGCGAAGAATGTCAAGAGCGGACTTGTTATCACAGAAAAATGACACTGGTTCCGGATGAGGGACGCCAAACACAGGAAGTAGTTCCAATAGCCATTGCAGCTCTGAATATGTGTACGACATCGCTCTATATTCGGCTTCGGAAGAAGAACGCGAAACAACCTTCTGTTTTTTCGTCTTCCATGAAATGATAGAGTCACCAAGAAGAACAACATAACCAGTCAAGGAACGCCGAGAGATAGGACAAGACGACCAATCGGAATCACAGTAAGCTTTGACATGAAGGTTCGGATTGGAGTTGAAGAAAAGGCCTTGACCAAGCGTCCCCTTGAGATAACGAACAACCCGAAGAGCAGCATCCCAATGTTTCTTTCGCGGCTGAGCAAGAAACTGAGGCAAGAGATGTACAGCGTAACTTAAGTCAGGTCGAGTAATCGACAAATAAACCAAACGACCGATGAGACGTCTATAGCGCTTTGGATCGTCATAATAGTCGCCTTCATCACGTGCCAAAGTGTGATTTTGTTCCATAGGAGTGTCATACGGTCGTCCACCAGTTAAGCCACATTCCGTAATGATGTCCAAAGTATATTTCCTTTAAGACACATAAATGCCTTCTTTCCCACGTGAAATTTCGAGGCCGAGAAAATATTTCAAGACGCCAAGATCTTTCATATGAATACAGTGACACATGTAGGCTTTAAACTTGGTTAGAAGATCAGGGTCGTTACCACCAATAACAAGATCATCCACGTAGACAAGGACGTATACACACGACGAGCCACGGCAATAAGAGAACAAAGAATAATTTTTCTTGTTCTGAACAAAACCAAACCGCAGCAAGGACTCCGAGAGCTTAGCGAACCAGCATCGAGGAGCCTGTCGAAGTCCATAAAGAGATTTCTTGAGACGACACACTTTGTTGGAATCAGTTGCGTCAAACCCTGGTGGAAGCTTCATATAAACCTCCTCTTTGAGATCTCCATGTAAAAATGCATTGTGCACATCCATCTGATACAATTCCCAGTTTTTCGCAGCTGCAATCTTCAAGAAAGCCCTGATCGTAGTCATTTTTATGACGGGAGCAAAGGTCTCATCATAGTCTGTGCCTGCCTCTTGTCGATTTCCTAAGACCACCAAACGAGCCTTATATCTTTCGAGTGTGCCATCTGAGTTAAGCTTCACCTTGAAAACCCACTTGTTACCGATGGCGTGTTTGCCTGGCGGAAGGTCTACGACATCCCAAGTGTGGTTTTTTTCAAGTGAACGACCTCATCTTTTGATGCCAGTCTCCAATGTTCGTGCTGCATCGCTTCTTTGAATGAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1250

Start:

1706520  

End:

1707769

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_27

TCAGCATAGGGAAAAACACCTTCATGAAAATGGACGTCACGAGAGACAAATGTCTTCTCTGTTTTGAGATCTAGTACCAGCCAACCCTTCTTTCCGAATGGGTAACCAAGAAAGACGCAGCGAGAGCTTCGATCCTCAAACTTGTCGCCAGCTCGAGGTGTGCGTGTGACGTAACATAGACACCCAAACGTGCGAACTTCATCATAGGTTGGGGCTCGTTGAAAAACTAGCTCATACGGTGTTTTCCCATTTAAGAGTGCCGATGGTGTGCGATTTATAAGAAATGCTGCCGCTTGGATACTCTCTCCCCAAAAACGATTCGGAAGACGAGCTTGGAAGAGCAGAGAACGAGCGACATTAAGTATGTGCCTGTGCTTCCTCTCGACGCGTCCATTCTGCTGAGGTGTATAAACACAGGAGGTTTGGTGCGAGATACCAATATCAGCAAAAAATGTGCGAAGAGGAAGAAATTCGGTGCCGTTATCTGTACGTACTGTCTTTACTTTCTTTCCAAACTGTCGTTCAACCCAGCTTATGAAATTCTTTAAAACGATCGCAACAGAGGATTTTTCTAGAAGAAGATGTGTCCAAACTGCCCGTGAGAAATCATCCACAATAGTTAAGAAGTATGTAGAACCACACGTAGATTTTGTGCGATATGGTCCCTATACGCCGCAGTGAATCAAGGTAAATAAATCATCTGCTTTATTAGAACTTTCTGGAAAAATAACACGGGATTGTTTTGCGCGAAAACACACATCACAACACTTTTCTAGATCACTAATGCTCCTACTAAAACCACCAATGTTTGAAAGAAAAGACAGAACTTTGGAAGACGGATGACCCAATCTTCTATGCCACAATTCTCGGTTGTCCAACTTAGCTATCTGATTGACTTGAGGAAGAACCGCTCCAGCCAAATGATAAACCCCATTGTGTGCCTCACCCGCTCCAATCAAAGTCCTCGAAGCTTGATCCTGTATCAAACAAAAATCGCGAGTGAATGTCACAGAACTTGCAATATCACGAAGCAATTGAGCGACAGAGATGAGTGTCGTATGTAAATCAGGTGCATAGAACACATGATGGAGAATCAATTTTCCACCGAGATTGAGGGTTCCGTGACGAGTGCTCCAAGTAAGTTTGCCGTTTGGTAACTTAATGGGACAGGCATTGATATCACGAAGGTCCGTCAAAAGGTTAATGTCTCCGGTCATATGGTGACTTGCTCCGGAGTCAATTAGCAAGTC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

161

Start:

1708575  

End:

1708735

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_28

ATCCATCCGATCATCAATGAGTTCACTATATCCCACCGTTCGGCATCGTCGGAGCCGTTATCTGGTCGCTTTAGGCTTCCGTCGAGAAAGCCTAACTTTCTTTTCGTGCGAAAAGCATTAACCATGAGCTTTGACCAACGCTCATAGTTTGCTCCATCCAA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

112

Start:

2452434  

End:

2452545

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_29

TGTTTGAAGAACCAAACAAAGGTAAGAAAATTGATTGCTACACCGTAACGTGGAGTTTAATGATGGTCTTCTCAAGTTGCTTCATGTAAAGACAAATATTCAGATAGCTGAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1715

Start:

2453181  

End:

2454895

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_30

ATATTCCCCTCAAGATGAGCCAAATATTGAAATAAGACTCATCTTGCCAATAAGATCTTGGAACAGAGTAGGGTATAGAGGTTTAGTTAGAACATCTGCGATCTGATGATGAGTCCTGACATGCATCGTCTTGAGTAAACCACTTTCAATTCTTTCCCGAGTAGTATGACAGTCGTTTTCCACATGTTTGGTTCGTTCGTGGAAGACTGAATTATTAGCGATCTGGATTGCAGCTGTGGAGTCACAAAACAGAGGAACAGGGCTTGTCTGAGGAACTTGTAACTCTGTGAGTAGTTTTACCAGCCAATCGATTTCACAACTAGCCAATGCCATAGCTCTGTATTCGGATTCTGCCGATGAACGAGATACCACATCTTGTTTCTTGGATTTCCAAGATAAGAGAGAATTACCAAGAAACATACATAATTCAGTTGTAGAACGTCTAGTATCTGGACAAGATGACCAATCAGCATCGCAAAAGGCTTTTAGTTGTAGTTCAGTGTTTGATGGATAGAATAAACCCAAACCAATTGTTCCTTTGATGTAGTGAACCACCTTATAAGCTGCATTTAGATGTGATCGTTTCGGAGCTGAAGAAAACTGGCAAAGTTTGTTGACAGCATAGGATATATCCGGTCTGGTAATTGTTAGATACATCAATTTACCAACCAATCGACGATAGACTTCTGGATTCTCCAATGCTGGTTCATCATTATGCAGACTCAGCTTGAGACTTGGTTCCATTGGAATGCTTGAAGGTCGACATCCCAATAGACCAGTTTCTTCCAATAGCTTAAGGCATATTTTCGTTGGCAAATAGAGATTCCTTTACTCGAACGAGCAATTTCAAGACCAAGAAAATACTTGAGAGGACCTAAATCCCTGAGTTTAAACATCTTTGCCAAATCCAGTTTTAACTGAGTTACGGCTTCCTCATCACTGCTTGCAATTACTATATCATCGACATAAACCAGCAATGCAACATAATTCTCAGCTGTATGTCGAATGAATAATGCATGATCTGAGTGAGACTTACGAAAACCCAATGTTGTGAGAGCTGAACTGAACTTTAAGAACCATTGCCGTGAGGCTTGTTTGAGTCCATAAAGTGATTTCTGCAGCTTGAGTACAGCATTTTCAGGAAGAGATTCCCCCTTTCTTGATGCATATCCTGGAGGCAAAGTCATATAAATTTCTTCATCTAAATCTCCATTTAGAAATGCATTTGAGATGTCCAACTGATGTAGAACCCAGTTCTTAGCCGATGAAACAGCAAGTAGAGTCTTTACAGTTGTCATTTTAGCAACCGGAGAGAAAGTATCTACGAAGTCAATGCCTTCTTGTTGTGTGTATCCCTTGGCGACCAAACGAGCTTTGAATCGTTCTAGGGATCCATCAGCATTCAGTTTGACTTTGTAGATCCATTTGCATCCGATAGGTGTTTTGCCTTCAGGTAAAGAGCAAACTACCCAAGTGTTGGTTGCTTCCAAAGCATCTTCCTCTATTCCCATAGCATCACACCATTCTTTGATCTTCCTAGCTTGAGTATAGCAGCTTGGTTCTGCATATTTGTCCACTGTACATACAAAAGCTTGATGATGATCAGAAATTTTGGTTAGATTGATGTAAGCATTGATGGGATAACGAGCATCTGAGATTGTGTTGCAGTAGTAATCTCGAAGATGTGCAGGAAGCTTGCTTTGTCGTTTTGAAGA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

2587

Start:

2455085  

End:

2457671

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_31

TTCAAAGAATACCACATGTCTTGATATTGAAATCTGATTAGACTCCAAATCAAGCAGTTTATAACCTTTGTATCCTGCAGGGTACCCCAGAAAAACACATGCTCGAGATCTTGGTTCAAACTTGTGTCGTTGATTAGTTGATGTTGACTTGTAACAAAGACATCCGAAGACTTTCAGCATGGAATAGTCTGGAGACTTGTTGTAAAGCATTTCAAATGGAGACTTATTCTTCAGTAAAGGAGAAGGTAGTCTATTGATCAAGAAGACAGCAGATAGTACACAATCTGACCAATATTCCAATGGAACATTCGCTTGAAACATCAAAGATCTAGCAATATTTAAAATGTGCTGATGTTTCCTTTCCACAACAGAATTTTGTTGTGGTGTTTCTGGACAAGAATGGTAAGCGATGATACCTCTTTGTTTGAATAGATTTACAAACTTCAGTTCATGAGCATTGTCTGATCTCAGTGATTTGACTTTCTTTTGAAACTGAGTCTCGGCCATTTGTAAGAACTCTGGAACTACTTGAAGAGCATCATACTTCATTTTCATCATGAATACCCAAGTAGCTCTGCTGTGGTCATCGACTATTGTCAAAAAATATCTGTATCCTTCAGTAGATGATACAGAAAACGGTCCCCAAGTGTCCATATGTATAAGATCAAAAGGAGCATGAGACATATTGTTGTGTGATACGAAAGGTAGGTGTTTCTGCTTTGCTAATTGACACGTTTGGCAATGAATAGGATCTTCTTTATTTCTTTTCTGCAATCCAAGTACATTATTCAGAAGATCAAGCTTTGTGTAGGAAGGATGTCCTAACCTACTGTGCCATAAAGCAGTATCAATAACAACAGATGAACAGAAAGATTGATTGACATTAATGGGAGAATTCAGAAGAGAAGAGCTGTCCAGAACATATAGTCCTCCGATTTGTTTACCCTGTCCAATCATCCACGCCTTGGTATGATCCTGTATCACACATGAGTTGTCATCAAAATAAACTCTCGACTTTAAATCCCTTGTCAGTTGACTGATGCTCAGAAGATTTAGACGAAAGTCAGGAATGAATAACACATTATTGAGGGTAATGTGATCATTCAGTTTGATAACTCCAACTCCTGCAATCTTGACATTAATACCCGTAGGAAGAGTGACTGAGGATCCCAAATCAAAAGAAAGAGCGGTGAATAGATCTCTATCATGAGAAACATGATGAATTGCACCACTATCGATGATCCATGTTTGAGGTCTCAGAACGTTTTTAGAGGTTGTCAAAATTCCAATAAAACATAATGTAGAGAAGGAGAAAGATATACCAGTCGCTGCAGAATCATTAATATCACTAGTTGATGTAGAGGCAACTGTGATTGATTGAGCTGTTGGATTTTGAAGTTGTGTGCTAAAATAAGCAATCACATCTTGTATCTGAGTCTTGGACATTCCTCCAACCAAGGTAGCAATATCAGTAGGTCCAATGGGAACATCTTTTGTTTCCAAAGATAGATTTGCCACTACTGGTTTCGCCGGTTGAGAAGATTTGTCTTGTGTACTCGCCAGTTTGTGTTTGAATCCTGGTGGATAGCCATGTATTTTGTAGCATTTATCCACTGTGTGTCCTGTATATCCACAATGAGAACACTTGACTTTTGGTTTGTTGTTGTATGATGATTGAGTTGCATTGACAGAGACAGATGTAGAAGCTGAGACATTGAATGCAGATCCAGTTGCAGGGGAGATGTTGCGTTGATTATAATCCTGATCCAAGAGGTTATAAATCTCTGCAAGTTCCGGAATGTTTTTCTTCGTAATGATTTGGCTTCTGGCATTTGCATATGAATCATTTAGACCAGCAAGAAACTTGATAATCTTGACATTCTCAGCTCTTTTGTCCATTGTTTTGCAACATTGACAATTATGGCAAGTACTAACACCTTCTGATCCATCTAAATCATCCCAAAGAGTCTTTAAGGTAGTATAGTATTCTGAAAGATCCATCGAACCTTGTTGCAGAGACCAGATCTGTTGAGTAAGTTGATAAGAACGGGGAAGATTTGTGATGTGAAATCGAGTGAGCAAATCTTTCCAAATCTCTGCAGCATCGTTGAATCGAAGGATGCTTTTGTAGATCTGTTTCGTGACTGAATTCAGAATCCACGATTTTACCATGCTATTGCAGCGAGACCAAATCCTGAAAATAGGTTGCGATTCGTGTGGTCTTGGTAAAGATCCATCAACGAAAGCTAATTTGTTCTTCGCATCTAACGCAATAGTCATAGCTATGTTCCAGGAGGAGTAATTTGTTCCATCAAGAATCTCAGGTATGATTACATTACCCGGATTATCTCCATTTGTGAGATTATATGGAGAATAGATGTCCGTGTAATCAATCTGAGGAAGAAGAACATTTGTATTTTGATTCGGGAAGTTTGATGGAGGGATTTGGTGATTTGGTGATGGAATCGGTAGATTTGGGGTTGGGATTGGGGAATCTGGAGAAGAATCACGATTCTGAGATGTTGAAGCAGCTCAGGATCGAGTATTCACCGTGCGACGCCGCAAATTCTTGACGGAAACCATCGCA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

191

Start:

2650659  

End:

2650849

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_32

TGCCCCGGTGGTATTCTTTGACAACATCAGTGTTTTGTTCATCTCTTCTCTAATCCAGTCCAATAACACCGCACCAATCACGTTGACATCGACTTTGTAAGGGAACAGGCTGCACTTGGCCAAGTAAAGTATGCCGACATCTTCATAAAAGGCCTACGAACATCACTATTTCAGGAATCCTGCTCTAGCCT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3609

Start:

2664889  

End:

2668497

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_33

CTCCCCCTTGGACAAGGTAACCGTGCCTGTCACAAAACCGGGATCTCTATAATGCGCTGGGGAACGTTGCCTTATTAAAACCTTACCAGGAAAACCCAGTGGGAAAAACTATGGTGAAGGAAAAAGAGTACAACACGCATTACTCCCCCTGGTTTAGGCATCACTGTAGATCTCTAAGTCTACGCATTCCTATCTGATGAATGAGCTTCCGGAGTGTAGAAGTCGGTAATGATTTAGTGAATAGATCGGCTGAATTTTCGCTTGATCGGACTTGCTGAACCTTGACCTGACCATCCTTCTGTAGCTCATGAGTGAAGAAGAATTTGGGCAGAATATGCTTCGTCCGGTCACCTTTGATGTAGTCGTCCTTGTGTTGAGCGATACAAGCTGCATTGTCTTCATACATCACCGTAGGCTCCTTATCTTCGTCCATACCACAATCTGATCGGATATGCTGAGTCATGGACCGCAACTAAACACACTCTCTACTAGCTTCGTGAATGGCCAAGATTTCCGCATGGTTGGATGAGGTAGCGGCAATAGTCTGCTTCATGGATCTCCAAGATATGGCTGTTCCTCCATGCGTGAAAACATAACCGGTTTGAAACCGGGCATAGTGCGGATCTGACAAATATCCTGCATCAGCAAAACCAACTAGATCATCCTTGTTATGGTTAGAATAAAATAATCCCAAGTCCTTAGTACCTTGAAGGTATCTAAGGATGTGCTTAATACCGTTCCAGTGCCTTTGAGTTGGACACGAACTAAAGCGAGCTAAGAGACTCACGGCAAAGCAGATGTCTGGTCTAGTGTGACTAGCCAAGTACATTAATGCTCCTATGGCACTGAGGTATGGCATTTCAGGACCGAGAATTTCTTCATCGTCCTTCTTTGGACCGAATGGATCACTATCCAATCCAAGGCTCCTCACAACCATTGGGCTGGTCAATGGGTGGGCCTGGTCCATATTGAATCTCTTGAGTACCTTTTCAGTGTATGCCAATTGATGCACAAGGATTCCGTCATTGACGTACTCAAGTTGTAATCCCAAACAGAATTTAGTTTTGCCTAGGTCTTTCATTTCAAACTCTGCTTTTAAGCATTCAACTGTTTGGGCGATTTCACCAGATGTTCCGAGGATGTTCAAGTCATCCACGTATACTGCTATGATTACAAATCCTTTGTTTTGATATTTTCTGATGAAGATGCATGGGCTGATCGGATCGTTTTCGTAGCCTTCTCTGATGAGATATTCGCTTAACCGGTTATACCACATACGTCCGCTTTGTTTCAGTCCATATAAGGATTTGTTCAGCCTAATGCAGTGTTTATCAAGAGATGCATGCTTATCTTTGAGCTCAATACCATCTGGTAATCTCATATAGATTTCACTCTCCAGTAGTCCATAAAGATATGCGGTTACAACATCCATTAACCGCAAATCTAAGTTTTCTCTTATGGCCAGACTTATGAGGAATCGAAATATAGTTGCATCCACCACTGGAGAATAAGTCTCCTCATAATCGATTCCGGGTCTCTGTGAGAATCCTTGTGCTACAAGGCGTGCCTTGTATCTAACGACTTCGCCGAGTTTGTTTCTTTTACGCACAAAGACCCATTTGTTTCCCACTGGTTTAACATCGAATGGTGTCCTTAAGATCGGACCAAACACATTCTATTTCTTTAAACTATTCAACTCCACGTTTATGGCTTCTTTCCATTTCAGCCAATCTGATCTATGAGTGCACTCAATTATAGACGTGGGTTCTAGATCCTCTTGCGTGTGCGCAATCTCAAGTGCTACCTTGTATGCAAAAGTTTCATTGATGTCGACATCTTTTCTGTTCCATAGAGAACCGAATATGATATAATTGATTGAGATCTCATTATTATCAATCCCTTCAGAACCTTGAGTTTTGGCGTCCCAAACCTCTTGAGATGGTTTGATAGGGTAAGTATCAGCTGAGGCTGTATCCGTGTTCTCTTGAATCCCGGTTTCAATCATTGCACCTTTCTTTGATTTCCGGGGATTCTTATCTTTGGAACCTGGTGGTCTGCCACGTTTCTTACGTGCGTCAGACTCTGTAGCAACTTGACTTTTCCCTGAGGGGACATCTATTCGTACTGGTGCATTACAAGTTGGTATGTACGATTTGGTAACTTTGTTCGGGTCAGCAAAGGAATCTGGCAATTGATTAGCTAGCTTTTGTAAATATATAATTCTTTGGACCTCTGAATCACATTCTAGAGTCCGAGGATCTTGCCATTGTGTGGATGTTTGATTCCATGAAAGTTCTTTTACCAGCTTGTCTGTCTCACCACCTAATCTAGGATATACTGATTCATCAAATCGGCAATCTGCATATCTGGCTTTAAACAGATCTCCTGTAGTTGGCTCGAGATATTTTATGATGGTGGGAGAATCAAAACCAACATATATTCCCATCCTCCTTCGAGGTCCCATTTTAGTCCTCTGTGGTGGTGCAATGGGTACATAGACTGAACACCCAAATGTTTTAATATGGGAGACGTCTGGCTCATGACCCGTTAGCAATTGGGATGGTGAATATTTGTGCTCACTAGATGGTCGTATGCGTATTAGTTCAGCGGCATGTAAGACTGCGTGTCCCCAAGCTGAGACCGGGAGTTGTGACCTCATGAGTAATGGTCTAGCAACCCATTGAATTCGTTTAATGAAGGATTCAGCTAATCCATTTTGTGTATGGACATGTGAACGGGATGTTCAACACTTACCCCCATGGACATACAATATTCATTAAACGCTTGGGAAGTGAATTCACCAGCATTATCAAGACGTATAGTCTTTAATGGGAAGTCTGAAAAATGGGCTCGTAATCTGATGATTTGGGCCAATAACCTAGCAAAAGCCTGGTTCCTAGAAGAGAGCAGACAGACATGCGACCAGCGGGTCGATGCGTCAATGAGGACCATGAAATATCTGAATGTCCCACAAGGTGGGTGAATTGGTCCACATATGTCTCCTTGGATTCTTTCCAGAAAGTTCAAGGTCTCTTTAGACACTTTGACTGGTGAAGGTCGGGTAATCAGTTTCCCTTGTGAGCAAGCTGTGCACTTGAGGTGCTGAGGGAAAATACCATTTGGTTTAAGGTTGTGCCCTTTAGAATTCTGGACTAATTTACGCATCATGTTCGCACCGGGATGACCCAGGCGATCATGCCAAATAGTGTAATCTAAAAACCGTGCTTTGATAGCAGCATTAGCCTCAATCATACTGACTTTAGCATGGTAAATGCCAGTAGATACGGCGGGTATAGTTTCAAAAACTTGTTTATGGCCATTTATCATTTTAGTGATAATTAAAAACTCTTTGTTCCCTTCATCCTGAGTTTCGATATGAAAACCATTCAATCTTATGTCTTTGAAACTCAATAGGTTTCTCTTAGAACTGGGTGAGTATAAGGCATCAGAGATATCTAGATATGTGCCATTTGATAACAGCACATTAGCTTGGCCATGGCCCTCTATTAGGCTCGAACTACCCGCTATAGTGCTAATGTTTGCGGTTTTGATTACTAAATTTATGAAGTAATTCTTGTCTTTTAGAATGGTGTGGCTCGATCCACTATC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

89

Start:

2683691  

End:

2683779

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_34

CATTGCTCTTGTTGAGAGGTAATTTAACACGAGAATTCAAACCATCCGAAGTGATAAAAGGGCTCAGACTTTATTTGTCTCAGAGATTT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

202

Start:

2683795  

End:

2683996

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_35

CGATGTTGCGCGAGCTCTCCGTTTTTCAAGCTCACTAACCGATCAGATTTTGGGGACAACGTGCTCTTGCTACCGTTACCTCATAAATCGAACTGTGTTATCCGTGTTACAAGGAAATACACCTTTCGAGATGTTATACAATCTACTCCTCTTGAGCATTTCAAAGTGTTTTCTTTGTCTACGTTATGTACATAATAATAAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

164

Start:

2986801  

End:

2986964

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_36

AGAACACAAAGTTTTAAGAATAACTCTCTTATTGCTTTAGAAAACTGACTCAAAAACTAAAGCACTCAAACTCTGATAAGTAAAACCACAACTTTGGTAACTCCTTATATAAAGAAAGATTTAGACAACTTCCTAAACCTAATGGAATTTAGATTACTCCTAAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4104

Start:

2987049  

End:

2991152

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_37

TTCTCCCCCTTAAGCTTGAAATCACTCTTGAACACTTCATGTACTCCAATGAGATCTCTCATCTCTTTGAATTTAATCCTTCCAAGTGCCTTTGTTAAAATGTCAGCCTTCTGTTCTGCGCCTGGAACATGCTCCACTCCGATCTGCCCTTTTTCAACGCATTCTCTAATAAAGTGATATCTCCTATGTATGTGCTTGCTTCTTCCATGAAACACAGGATTCTTTGTGAGAGCTATGGCTGATTGATTGTCAATGCGAATGATGACTCTTTCACTTTGGGAACTAATAACTTCACACAACAAATCCTGTAACCAGATGGCTTGTCGAGTAGCTTCTGTTCCGGCCATAAATTCGGCTTCACAGGATGAAAGTGCCACTATCTCTTGTTTCTGCGAACACCATGATATTGGACTTTCACCTAGATAGAAAATATGTCCTGAGGTGCTCTTGCCGTCGTCTGGATCTACATTGTGACTACTGTCACTGTATCCGATTAGTTTAGGAACCTTTGTTGCTGATTTTCCAAACTTCAAACCCAAAGAAGCGGTTCCTTTCAAATACCTCAAGCAATGCTTCATTGCAGCTCCATGAGACTCTCTTGGACTCTGCATATATCGGCTCAAGACTCCTACACAGAAAGATAAATCCGGCCTTGTATGAAGCAAATAACGAAGGCAGCCAACGTTTTTCCGGTATCCTGTAGCATCAATCTCCTTTTCGTCTTCAGCCTTTGATAGTTTCAGTCCAAGCTCCATTGGTGTATGAGTTAGATTGCAGTTTTCCATCCCTGCTTCTTCAAGAATCTTCAACGCATATCGAGCTTGACATAGAGTTATCCCTTCTTCATGTTGACAGACTTCAATTCCTAGATAATATGTCAGCTTTCCAAGATCACTCATATCAAATTTGGAGGACATCTCTTTCTTGAACTGATCGATGATCTCTCTATTAGTTCCTGTAACAAACAAGTCATCTACATAGATTGCCACAAGCAGCAGATTTCCTTTTATCTCCTTTCGATAAACAGAAGGCTCTTTAGCACACTTTGTAAAACGCAGTTCCTGCAGAATTTGGTTAAGCTTGTTATTCCAGGCTCTTGGTGCTTGTCTTAATCCATATAATGCCTTGTTTAGTTTATAAACTTTTCCTTCGCTTCCTTTCTTTTCGAAACCTTCTGGCTGTGTAACAAACACTGTTTCTTTTAGCTCACCGTGAAGGAACGCCGTTTTAACATCCAAATGATGTATCTCCCACTTATGAGAAGCCGCAAGATTGATGAGAAGCCTTATAGTTTCAAGACGTGCAACTGGTGCGAAGACTTCGTCGAAATCAATCCCATATCTCTGCACATATCCTTTTGCAACCAAACGTGCTTTGTACTTGTTAATGCTTCCATCCGAGTTTCTTTTTAGCTTAAATACCCACTTTAAGCCAATTGGTTTTGCTCCAGCTGGAAGATCAACAAGAGTCCAGGTCTGATTTTTTTCGATGCTATGGATCTCATCTTCACATGCGAGTCTCCACTCCTTTAGACTTTTCGCTTCTCTGTAATTTCAGGTTCGTTATTCAGACATAGTAGTAGCTTTTCTCCTTCCTCTTCGGCGAGCAGAACATAGTTATCAACGAGATACTTGGGTTTCACCGATGGTCTTGTTGACCTTCTTAGAGTTGGAACAGATTCGTTGACGTCTCCTACATCGTTCTCCTGTTCGTATGTCTGTATCGGTGATTCCTGCTCATCTTCTTCATTATCGTTTTCTGCAGTTTCGTTCACATGCTCTTCTTCGTTTTCTTCATATTGTTGGATGCCGTGGTTTCCAAATTTCCCGATTGTGACTTTGAAGCCATCATCATGTTGCTGTTCTGAGTTCTCTGAATTCCAATTCCACCCTTTTGTTTCATCGAACACAACGTCTCGACTCACAACTATCCTTCGAGCTGGTGGATCAAGCAATCGGTATGCCTTTGATCCAGGCTCTGTTCCGAGGTGAACGAGTATCCGAGATCTGTCATCAAGCTTCTTCAACATCGGTTTTTCTACTTTGGCGTATGCGATACATCCGAAGATTCTGAGATGCCCCAAACTTGGCTTCTTATCCCGAAAATTCTCATATGGTGTCCGATCTTTGAGTGCTCGAGTTGCTACTCTGTTCAAGAGATATGTCGAATGTCTGATTGCCTCACCCCATAGATAATTTGGTACTTGCTTGTCTTTCATTATGCTTCTCGCCATCTCTATTAGAGTTCTATTACGTCTCTCAACAACTCCGTTTTGTTGAGGCGTGTATGGGGCTGTGAGGTGTCTTTTGATTCCTTCTGCGTCGCAAAAAGAGTTGAACTCGAGAGAGACAAATTCTCCTCCTCTGTCTGTTCTAAACGTTTGTATCTTCTTTCCTGTTTCCCCTTCTACAAGGCTTTTAAATTTCTTGAATTTGCAAAAAGCTTCACTCTTTTCTTTTAGCAAAATCGTCCACATATATCTTGAACAGTCGTCGATAAGCACAAAAATATATTTGTTCCCAGCAAGTGTACTCGGCGAGATCGGACCACACAAATCTCCATGTATAAGCTCAAGTGTCTTAGTTGCTCTGTAGGAAGTTGCTTGAGGAAATACTTTCCTGGCTTGTTTTCCTAATAAACATGAGCCACATATCTCCTTTTGAAAATTCACATTTGAAATTCCTTGAACAAGTTCTCTTTGCACCATTGACTTGATCGTGTCGAAGTTGATATGTCCCAATCGTGAGTGCCACCTCCTTGATTCACTGATTGAGGACAGGTGCAGGCTCTCGCTCTCTCTTATTCCCATGCGGACTTTATACAACCGATTTCTAGACCTTGTAGCTTTGACTAGTAGCTTCCCGTCTCGGTCGTGCATAGTAAGGCATTCTCCTCTCATCCTTATGTCGCAACCAGACTCTGTAGCTTGACCAAGACTGATAATGTTGCTCTTCAAATCTGGAATAAAGTATACATCTGTCATGATTCTCGGTTCTCCATTTATGTCGGTGAAAGATATTGCTCCTTTTCCTTTTATGTCGATGCGAGAATCATCACCAAACCTTACTTTCCCTGTGATTGACTCATCAATGTTAGAAAAATATCTCCGATCACCCGTCATGTGATTACTTGCCCCATTATCAAGGTACCATAAGTTCTCATCTCCAGAGTTTGTCTCGTAATCACTTGGTCTGCAATGTTTCTCGTTCAAAAATACTAGCTCGTGCATTAACAGCTCGTCTGCGCTTTGCGTTTCTGAATTATTGGTTTCTTGTGCTTCTTGTAGCTTGAGGAGCCGATCAGGGCAGTCTGAAGCATAATGACCGAGTTTATCACATCGATAACATGTTACCGACGATGCGTCTCTCTGTCCATTACTGTTAAACCGTCCACGACCTCTGCCTCTTCGTCCTCCGCGACCACGACCTCTCCAATTGTTGTTATAGTCGCGATTTTGTTGCCCTGTTTGGTCCTCTGTTTTCGCATACATTAGTTTGCTGGAGTCTTCCTGTGCTTCGGCTTCTTCAAAGATTCTTTCCTCATAAGCTTTTAAACGTCCAATAATGTCTTCGAAGGTAGTAGTGTTGAGATCCAAAACTTGCTCTAAAGAAGCCACTATATGAATGTATTTTTGTCGTGGTAAGCTCTTGAGAAATTTCTTCACAAGTTTAGGTTCTTCAACAACCACTCCTAATGCCGCCGATTTTGTTGAGATTTCCGAAAGTTTTCCAGCAAATTCATCTATGGATTCCGAATCTTTCATCTTCAATCTATCGAATTCAGCCATCAAGGTTTGTAGCCGAGCTTCTCTGACTCTATCAGCACCCATATGCCTTGTCTTTATGGCCTCCCACACTTTCTTTGCAGTTTCGAGCTCTCCGACCTGTAACACGAGTGATTCCGGCATCGATTGGAACAGTAACGCCATCGCCAATGTGCTCTTCTCATCGTTTGCTGTTCCTGGTTCGATACTTTCCCAAACTTTATGAACTTTGAGACAAACTTTCATTCGCATGGACCAAACCGTGTAGTTGGTTGGGGTGAGCATCGGACATTGAATAGAAGAAAGTCCTCCTCCTTCTTTAGGTTTATCTGTTGCTGCGA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

164

Start:

2991243  

End:

2991406

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_38

AGAACACAAAGTTTTAAGAATAACTCTCTTATTGCTTTAGAAAACTGACTCAAAAACTAAAGCACTCAAACTCTGATAAGTAAAACCACAACTTTGGTAACTCCTTATATAAAGAAAGATTTAGACAACTTCCTAAACCTAATGGAATTTAGATTACTCCTAAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3603

Start:

3141169  

End:

3144771

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_39

CTCCCCCTTGGACGAGTGAACCGGGTCAGCTACTCAATCGGGATCTCGATAATGCGCTGGGGAATGTTGCCTCATTAAAACCTTACCAGGAAAAACCCAGTGGGACAAAACCATGGTGAAGGAAAAAGAGTACAACACGCATTACTCCCCCTGATTGTAGCATCACTGCAGATCTCTAAGTCTATACATTCCTATCTGTTTGACGAGCTTCCGGTGTGTTGAAGTAGGCAATGATTTGGTGAAGAGGTCAGCTGAATTCTCACTGGATCGGACCTGCTGAACGCTGAGAGTGCCGTCCTTTTGCCAGTCTGAGGTTGAGAAGAACTTCGGTAGAATGTGCTTCGTCCGATCTCCTTTGATATATCCTTCCTTGAGCTGAGCTATGCATGCCGCGTTGTCTTCATACATCACCGTGGGCTGTGTGTCTTCGTCCATACCACAATCTCTGCGGATGTGCTGAGTCATGGAGCGCAGCCAGACGCATTCCCTACTAGCCTCATGAATGGCTAGGATTTCAGCATGGTTTGATGAAGTGGCAGTGAGTGTCTGCTTCATTGATCTCCAAGAGATGGCTGTTCCTCCATGCGTAAAAACGTAGCCAGTTTGAGACTTGGCAGTGTGCGGATCTGATAGATATCCTGCATCGGCGAAGCCGACTAACCCATCTTTATTTTGGTTAGTATAGAAGAGTCCTAAGTCTTGAGTACCTCGAAGGTATCTTAGGAGATGTTTTATACCGTTCCAGTGCCTCTGAGTTGGAGATGAACTATATCGAGCGAGGAGATTCACGGCGAAACATATGTCTGGTCTAGTGTGACTAGCCATGTATATTAACGCTCCTACAGCACTGAGGTATGGCTTTTCAGGACCAAGGATTTCTTCATCATCCTTTTTGGGACCAAGAGGGTCATCACTTAAGCTTCTAACTACCATTGGGCTGGTCAATGGGTGAGCTTGGTCCATATTAAATCGCTTGAGTACCTTTTCGATATAAGCCGATTGATGCACAAGGATTCCTCCTTTGATGTACTCAAGTTGTAATCCCAAACAGTACTTTGTTTTGCCTAGGTCTTTCATTTCGAATTCTGCTTTTAAGCAGTCGACTGTTTGGGAGATCTCACCAGATGTTCCGAGGATGTTTAGATCATCCACGTATACTGCTATGATTACAAATCCTTTGTTTGAGTACTTCTTGATGAAGATGCATGGACTGATGGGGTCATTTTTGTAGCCTTCTTTGATGAGGTAATCGCTGAGGCGGTTGTACCACATACGCCCACTTTGTTTCAGTCCATACAAGGATTTGTTCAGCCTGATGCAGTATTGATCTCGAGATGCATTTTTGTCTTTTAGTTCAATGCCATCTGGGAGTCTCATATATACTTCGTTGTCCAGGGGCCCATAGAGATATGCGGTTACAACATCCATTAACCGCAGATCAAGATTTTCTCTTATGGCCAGACTTATGAGGAATCGGAATGTTGTTGCATCCACCACTGGAGAATAAGTCTCCTCATAATCGATTCCGGGTCTCTGTGAGAATCCTTGTGCTACAAGCCGTGCTTTGTATCGAACGACTTCACCGAGTTCGTTCCTTTTGCGCACAAAGACCCATTTGTGGCCCACTGGCTTGATGTGTGATGGGGTCCGGATGATCGGACCGAACACGTTTCTGAGTTTGAGACTCTTTAACTCCACGTTTATGGCTTCTTTCCATTTTAGCCAATCTGTTCGATGTGTACACTGTGTTATTGACGTGGGTTCTAGATCCTCTTGCGTGAGCGCAACATCAAGTGCTACTTTGTATGCAAAGAGTGCATTTAAGTCGACTTCTTTTCGATTCCATTGTATTCCGGACATATTGTAATTGATGGAGATCTCATTGTTATCTTCTGAACCTGGAGATTCGGCGTCCCGAACTTCCATTGAGGGTTCATTAGATTGAGTCTCAGCCGCGGCTATGTCTGATATTGCAGGAATCCCGGTTTCGGTTATTGCACCTTTCTTTGATTTTCGGGGATTCTTATCTTTGGAACCGAGAGGTCTGCCCCGTTTGAGACGTGGTGCAGACTCTGTAGCAACTTGGGTCTGTCCCGTTGGGACAGCTATTCGTACTGGTGCATTACAAGCTGGGATGTACGATTTGGTTACTTTGGTCGGGTCAGCAAAGGAATCTGGCAATTGATTAGCTAGCTTTTGATAATGAATAATCTTTTGGATCTCTGAATCACATTCTAGAGTCCGAGGATCTTGCCAATTTAATGATGTTTGATTCCATGAAAGATCTTTGACCAGCTTGTTTGTCTCACCACCTAAAGAGGGATATACCGATTCATCGAATTAGCAATCCGCATATCTGGCCTTGAAGAGATCTCCAGTGGTTGGCTCGAGATATCTTATGATGGTGGGAGAGTCAAAACCAACATATATTCCCATCCTTCTTTGAGGTCCCATTTTGGTTCGATGTGGTGGAGCAATGGGTACATATACTGAACACCCAAATGTTTTGAGATGGGAGATATCTGGCTCATGACCCGAGAGTAGTTGGGATGGGGAATATTTGTGTTCACTAGATGGCCGGATGCGTATGAGTTCAGCAGCATGTAATACTGCATGTCCCCATGCTGAGGCCGGGAGCTTTGATCTCATGAGTAATGGTCGGGCTATCCATTGAATGCGTTTAATGAATGATTCAGCCAATCCATTTTGAGTATGGACATGTGCTACAAGATGTTCCACGGTTACCCCCATGGCCATACAGTAGTCATTAAACGCTTGTGAGGTAAATTCACCAGCATTGTCAAGGCGGATAGTCTTTAGTGGGAAGTCAGGGAAATGGGCCCGCAATTTGATGATTTGGGCCAAGAACCTAGCGAAGGCTTGGTTCCGAGAGGACAAGAGACAAACATATGACCAACGGGTCGATGCGTCTATAAGGACCATGAAGTACCGGAATGGTCCGGAAGATGGATGTATAGGTCCACAGATATCGCCCTGGATTCTTTCTAGGAAATGAAGTGTTTGTTTAGAGATTTTAACTGGTGAAGGCCGAGTGATCAATTTGCTTTGAGAACAAGCTGTGCACATGAGGTGTTGAGGATAAGCTCGGTTTTCTTTGAGGGTATGCCCTTGAGAGTTTTGAATTAGTTTACGCATCATATTTGCACCGGGATGACCGAGCCGGTCGTGCCAAATAGTATAATCAGTAAACCGGGCTTTGAGAGTGGTATTAGCTTCAATCATACTGACTTTAGCATTGTAAAGTCCAGTAGAGAGCGCGGGTATGGTTTCGAGGATTTGTTTATGGCCGTCTACGGTTTTAGTGACTAGGAGGGATTCTTTGTTCCCTTGACCTTGGGTTTCTATGTGGAAACCATTCTGTCTTATATCCTTGAAGCTCAGAAGATTTATCTTCGAACTAGGAGAATATAGAGCATCTGGTATTTCAAGTTGTGTGCCATTTGATAGCAACACATAGGCATGGCCATATCCTTCGATAAGGTTTGAGGGACCCGCGATGGTGCTAATATTTGCGGTTTGATAGGTTAGGTTTATGAAGTAACTTTTGTTTCTTAAGATAGTGTGGCTGGATCCACTATCTAC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

85

Start:

3144959  

End:

3145043

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_40

TTCAGATGATTGAATTAATCGAGGAGATCAGCTGTTTCATAGTCCATGGGGTCGGTCTGCTCGTTTGTGGTGTTCTCATGATCAA