ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig1617_LTR-Caulimovirus_21 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus108474888571+
Contig1617_LTR-Caulimovirus_22 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus135285909941+
Contig1617_LTR-Caulimovirus_23 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus6911004210732+
Contig1617_LTR-Caulimovirus_24 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus11831075011932-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_25 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus11301194013069-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_26 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus18941318315076-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_27 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3101508415393-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_28 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus15142164023153-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_29 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus31812316926349-
Contig1617_LTR-Caulimovirus_30 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3002635326652-
Contig1689_LTR-Caulimovirus_31 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus138843435730-
Contig1725_LTR-Caulimovirus_32 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus841245712540+
Contig1744_LTR-Caulimovirus_33 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4355034250776+
Contig1744_LTR-Caulimovirus_34 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1605077150930+
Contig1769_LTR-Caulimovirus_35 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2792694427222+
Contig1769_LTR-Caulimovirus_36 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2332753127763-
Contig1824_LTR-Caulimovirus_37 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3332242722759-
Contig1824_LTR-Caulimovirus_38 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3642275923122+
Contig1859_LTR-Caulimovirus_39 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5781780218379-
Contig1859_LTR-Caulimovirus_40 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus921894119032-

< 2 3 4 5 6 > Total 31


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1084

Start:

7488  

End:

8571

Strand:

+

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_21

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1352

Start:

8590  

End:

9941

Strand:

+

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_22

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

691

Start:

10042  

End:

10732

Strand:

+

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_23

GAGTATTTTCAGGATGCACAGCTCCCAGATGATGATATGAATATCGACGAAGTTGCAAAAATGTTTAATATCGACATCAATACAGCATCACAAGACGACTTCGAAGAACCAGAAATGGAGTATGAATGCCCAAATGATCATTACGGCTGCTGTGACAAACATATCATCAAATTCGAGATTGATCATTAAGTGGATAATCGTAACTTTTAAAATATGTTTAATTATTAATAAGTGTGTTTTAAGTATGTAAGCGATACTGTAATCGTATAAATAAATCGTATCGTCAGCGTTGATGTAATTGCTGATGTAATAATGATGTAAGCGATGATGTAATCGCTGAGGTAAGCAGTTAGGCCAGCCTGCCTAATTTTAACACTATAAATATGTGTGCCAACCCCTTGTGAAATAACATCTCATTTTTTACTAAAAAACCTCTCTCTAGTTTATCTCTCTAAGTACGAAGTTCCAAATTCTCTCTTGTTTTCCAGACTTCAGAAAGTCTTCATAAGCTTTGATTTCTTTTTTCTATCATTCGTAAGTCGACGATCTGCTCATTTTCTGTAGTTGAGTCTTCCGGTTTATCAATACGACGGTCTACAGAACGTTCGTGGAGAGGTATAGGCAATTCCTAACTATGGGTTGAGCGTATCAGTGGCTAGAGATGCCCGTAAGAGCTCCCTTTACCTGGAAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1183

Start:

10750  

End:

11932

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_24

GCTATAATCATCTTTCAGGCCGAGAGCATGATGCCATATGCGTTTATGATTTCTTGAAACTTCTTGAGAGTTTGAACATGTTCTTCACCAGTCGATGAAAACAACAAGATGTCGTCAATGTAGATTAACGCCGTTTGGAGGAGAGGCTTGAATATTCGCAACATTGCTTGTTGGAACAGTGACGGTGCAGTTTTGAGACCGAAAGGTAGAACATTCCACTGGAGGTGGCGATTAGGTAGACAAAACGCCGTTTTGTACCTTTCGTCTGGTTTGACTCCAAGTTGCCAGAATCCCGATTTCAAATCAAACTTCGAAAATATAGTGGCTCCTTGAAGATGTTGAAAAAGAGCCTTCTTGTTTGGCAGGGGAAACTTAATGTCTTGCAGATATTGATTCAATGGCTTGTAGTCAATCACCAATCTGAGCTTTCCTCTTGCTTGCTCCGCACGATTATTAACGTAGAATGCTTTACATGCCCATGGTGAATTGGTTACTGATACAATTCCTTGTCCTACTAGCTGGTCACATTCTTTATTTACTTGTTTGAGTAGTGCAGGTGGCATTCCAGCATGACTGGCTTTTGTCGGAGTTGTGAGGACATTCTCTTTGAAGGGCAACGACACAAAGAACTCCGTATTTAGCCATAGCGGATTATCACATTTTTGCAGAAAATTTGTGTGTGTGTCTACACAGGACATTATCGTGATTTCTTCCTTGATTTTTTTGAATTCAGCAGATGTAAAGTTTTCAACTGTGAACGGCCGAGGTATCGTTGTAAAAGCCTAAAAAAAGGTTTTCCACTGCACTCCTCTTGGTTCGATAGAAATATCGAAATTTTTCTTTAACACTGAATATGTATCCCACCCTAGTATCAGATCTTTTCCAGGTGTTGATGAGCCAAGAACCTCTGTCGTAATTTAGCATCCTGGGAAGATTTCTATGATGATTGGCCTTGACTTGAGCTTGATTGTTAACGAGCCAGAGTTTGCAACTCTAAACTCCTGTTGGTGTGGCAACCACATAGAAGAGGAGAGAATTTTGGGATTCATTATTGTTGTTTGAGCGCCTGTGTCGATGAATGCGACAGCATGAACCGGCTCTTGTTTTCTTGACGGATCAAAGATCGTAATTGGCAAGTGTGGTGCTTGGAACTCGTTTTCTGGCGGCTTTTTAGTGATCTTGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1130

Start:

11940  

End:

13069

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_25

GTGGTCTGCTTGGATCTCATCTTCTCGCGGCTTCTGAGCGATCTTGAAACAACAATCATCTTGTTCTTTATATGATGAATTGGACGAGCTGTCATAATCTGAATACCCACAAATGACATCTTTCTCATCACTATCGTATGAGAGTAATGATTCAAGATCGTGGTTGTCGAGATCGATATCTGGTGCTATATCTGATATCGAGTTGATGAGATACTACTTCTTCTTCTTTGATTTATTTGGGCCGGTTTTCGCGAGATGTCCTTCCTTACGACACAGAAAACATTTCGTCGTCTTTTGAAAACTTCGCTTTTTTTCTGAAAAATCGTTTTCGTCTGAACTTGTTGAAATGCTTCGGGACTGGTCGCCTGAATCTTCACAAGAACAGGATTTTTTGGATTTTGGGCATTCGATAGACAGGTCTGGTCTAGCACATATTCTTGATAACTGCTTAGACTTGTCAATGAATTCAATCCTGAATTCTTTTTGCTTGCAAAGTTTATCCAGCGTTCTGAAAACATACTGTTGAATCTTACTAATGGAAATTTCTTCAATCATATGTCCTTGGTCTGTGATGTATAACTTCGTTTATTGGCTGAGATAATCATCGATTGATGAGAGATATACTTGCTTAAAACTTGGATTGTTTAAGCCATTGAGTGTGTAATATCTCCGTGTCTGTCGTTCAAAGTGCTTTGTTAAATCTCTTTTCTTCGATGAACAACATTTTGCTGAGAAGAAATCTTCTTGTAGTTGTTCTTTTAGATGAGTTGGCGTGCCGATAAATTCTCAGTGGATTTCTCCCAGAAGTATCGGTATCGATGTCTAATAGACTTGCTGTTGTCTGTATTCGCCAAGGGAATTCCACCATTCTTTTAGTGTTCCTGAGAGTCTTGCCGTGAATTGTTGTATAACAAGCTCTAGAGGAGAAGTTATTGCTTCGGAATTCATCCATGCATGAAACTCCTCAAGACGATCATTCCATCTTTCGAAAGGAATGTCATCAAACGTAAACGTTGTGACCTTTGAGGCGAATTGCTTTTGTGGCATCTCTTGATGCTTTAGTGGCGCATAATTCATCTCTTCGTCGCTTGAGAGGACTTCATTTATGTCTGGTTCTTCCTTTGGTGTAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1894

Start:

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End:

15076

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_26

TTGAACTATCGGCTCCTGTTTTGGACCACTAGGGTGTTTGCTGAGACCATTGAGCAGATTTGACATCGAGAATTCGATTATTCCGATATCCTTTCCTTTCTTCTTTTTGTCTTCAGTTGATTCATGACTAGAGGAAGAAGTGAGAGTCGGTCGTTTAGTTGGATTGACCAGTAACTCTGATTCTTTCTGTCTCCTTGGCTTTGTTCAGGTTGACCTCGGTTTGAAGTCGCTGACTGGTGTCATTCCAAAGCGCGAAGTGAATGCTTCATCAGAGGATAGAAATCCAGGCAGAGACGTCTTCGGCTTTTGATCTTGATAACCCGAAAGGAATCTGGCGAGTAGGATCCTTGATACCTGGGTATTCCTGATGACATACCTCCAAGGGGGTATATAATACGTACTGGCCGAATGTCGATTCTGTACCAAGCTTTCAAGGCTACTTTGGAGATCCTTCAACTGATTCTTTAGACTAGCCGTTTCAACTTTTTTGTTTCTGAAATGGGGCGAATTAACCATCATATGTTGGGCCATCATCATCATTTCTTCGTGAAGATTGTTTAACCGTTCATGGATCTCTGTGATTGAACTTTGAAGACTGTTCAATCTTTTGTCGTAACCACCAGCGATTTGATCAACTTTGCGGTTCATTGTTGACAATATTTGATTCTGAACGAGAACATTTTCTGTTTGCTAATTGAGAACATTTTCTCCTTGGCTTAGCTGGTCTGGTCCTAAAGGGTTGATGGCGCGTACAAGAATTTTTGGACTGTGAGCGACACCATTTTTGTTGAAATCTTCGGGTGGAGGGAAATCATCAGTTTGCATCATTATGATTTGTTTAGGCTCCTCTTTTTTCTCCGAATATTGGACAATAAAGTCGTATCTGTCATCTCCTAACGAGCCGATAGTTGGATCGCCTTCGAGATACCTCTTGTAAAGAGGATCCTTCTTTTTTCTTCTCCTTTGTCGAATTTCTTCATCAGATTCATATGCTGCGTCCATACAAGCTGTACAAAAACAAACATCAAAATATTGATGTCCGTTTTCAAACATGAAAGGGAATAGAACTGAGTCATCTTGCCCAAAAGAAATTGGTTTTGGCATTTGCATCCTTGCTGGACCGTAGAATTCGTGTTCATCGATTTGAATGGCAAATTGAGTGAACAGTTGCTTTCGAAATGACGATGATCTTGGTTTTTCAAACTTGATCTCCGTTGTTCCATCATTTCGAGAGTGAAAACTGACTTCTGAAGATTTAACTGGGGCCTGAGCCGTTTGGTGCATCTTTTCATAACTTGTTTACCCATGACTCCGGCAAACGACGTAGTAGCTCTTCACGAGAGATCTGTCGAGGAATCTGGACGGAGCTGGGTGCTTGTGATGCTGAGTTTACTTCGAGGTATAACGCTTCATCTGATGAGGGCAATACAAGATCAAGGGCGTGATCTTGGATTCTGTAGACTATTTGGTGATGAAGGGTTGCTACCACAATTTTCTCTTGCATAGGTGCTCCAACGAGCTGTAATTGGACTTTGAGCGTCTTGAGAAGATTCGGATCTTGTAAAGAGACATTAAAGTTAGGAAACAGTGTTATAAATACTATTCCGGCGTTTAATGTTGTCTGTACTGTTCCGATGCATGCTTGCTGATATGATTTTAGCCTTGTATCGAGCAAAGCGATTCGTGCCGTGACTGGCAGACCTTTTCGTGCGTGTAAGGTCAAACCAATTCGTATAACACCAAAGTGTAGATGCGTATACTTTTGTTGTTGGCATAGCTTTGGCAAGTTTTCTGGAATATTGAGAGAGATAAACTGCTCTTCTTCAGTAGATGGGACTTAACACAATGAGAACTTGCTGGACTGAACATACTCAAGGACTCTTCTGTTTGAAGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

310

Start:

15084  

End:

15393

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_27

ATGAGTTCTCGGACTCCTCTGATAGAAAAGGCACTAGGTTTTTTTGCAAAATACTCGTAAGGATTTACAAGTGGAAGAGTAGTTTCTGGTAATCGATCTCCTGGAACATACTCGATCTCGTACAAGGAATTGATAGGCGAGGAAGAAGAAAGATTTTTATTTTTTGGTAAAGTACAAATTGCAAATTGAGAATCGACGGTTGGGGGATTCGAAATAGACAATATGTGAAATTGTTTTCCAGAACATTCAAAACAATCAATCATAAACAATAATTCATTCCACCATAACGCAAGTCTAGGCTCTGATACCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1514

Start:

21640  

End:

23153

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_28

CACTAGCATCAGTCTGTATGATGCGTGTTCCGACAGTGGGAATCTTTAGAGGGGGTAGCTTCTGGATAGCTATCTGTAGGCTTTTGACCGCTTCAGTTTGTCGTATTGTCCATGGAGGTGGATTCTTCTGGAGCATTTTCTGGAGTGGTCTTGTCAATCGCGATAATTGCGGGATGAAGTCGCCGACATAATTAATAACTCCAAGAAATTGTTGGACTTGACGTCTGGACAACTGCTCATCTGAAAAATCAAGTAATGCTGTAGCTAAATGGGCTTGTGGTGTTACTTGTCCATTAGCAATTTGCATCCCAAGAAACTCAATATTGGGCTGAGCTATGATCATTTTCCGGGCAGAAAGCATAATGCCGTATGCTTTGATTATTTTTTGAAATTGCTTGAGCGTCCGAACATGTTCTTCATTAGTTGGCGAGAACAATAGGATGTCGTCAATGTAGATTAGCGCTATATGAAGGAGAGGCTTGAATATTCGCAACATGGCTTGTTGGAATAGTGATGGCGCCGTCTTGAGACCGAACGGTAGGACATTCCACTGGAGGTGGCGATTAGGTAGACAAAAGGCCGTTTTATACCTTTCTTCTGGTTGGACTCCAAGTTGCCAAAATCCAGATTTTAAATCGAATTTTGAGAATACAGTGGCTCCTTGAAGTTATTGGAAAAGGGCTTTCTTGTTTGGCAAGGGGAACTTAACATCTTGCAGGTACTAGTTCAATGGCTTGTAGTCAATCACCAGTCTAAGTTTTCCTCGTGTTTGTTCTGCACGATTGTTGACGTAAAACGCCTTGCATGCCCATGGTGAATTAGTCGTTGATGTAATGCCCTTTGCCACCAACTGGTCGCATTCTTCATTTGCCTGTTTGAGTAATACAGGAGGCATTCCAGCATGACTAGCCTTTGTTGGGGTTGTTAGAACATTTTCTTTGAACGGCAGTGATACAAAGAACTCCGAATTTAGCCAAAGCGGATTATTGCATTTCTGCAGAAAATCCGTGTGCGATTCAGCACATGACATAATCTTGATTTCTTCTTTGATCTTCTCGAATTGAGGAGAGGTAGGGCCTTCAACAGTGAATAGTCGAGGTATTGATGTGAAAGCCTTGAAGAGGGTCTTCCATTTTATTCCTCGAGGTTCGATAGAGATATCGAAATTCTTCTTTAACACCGAATATGTATCCCATCCAAGTATTAGATCTTTACCAGGAGTTGATGATCCTAGAACCTCCGTCGTGATTTGGCATCCTGGGAAAATCTCTATGATGATTGGTCTTGATTTGAGCTTGATCGTTAGGGATCCAGAATTTGCAACTCTAAACTCCTGTTGGTGCGGTAACCACATGGAGGATGAGAGAATATTGGGATTCATGATCGTTGTGGGGGCGCCTGTGTCTATGAATGCAACAGCATGTACCGGCTTTTCGTTTCTTGACGGATCGAAAATTGTAACTGGAAGATGCGGTGCTTGAAAATCTTCTTCGGGTGGCTTATTATTGATCTTG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3181

Start:

23169  

End:

26349

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_29

GTTTGAAATTCTTCGTTTTGAGGCTTCTGAGTGATTTTAAAGCAGCAATCATCGTCGTCTTCATATGAGGACTCAGACGAACTATCATAGTCCGAATATCCACATATAGCATCCTTCTCGTCACTGTCATATGAGAGGACTGATTCGAGGTCATGTTTGTCGAAATCAATATCTGGAGCGATATTTGATATCGAGTTGATGAGATATTGTCGCTTCTTTCTTGACTTATTTGGACAGTTTTTTGCAAAATGTTCTTCCTTGCGACATAGGAAACACTTTGTTGTCTTTTGAAAACTTCGTTTCTTCCTGAAAAATCGTCTTCTTCGGAATTTGTTAAAATGTCTTGGGACTGGTCGCTTGAATCTTTTAGATTTATTCCGTGAATCACAAGAACATGATTTCTTGGATTTGGGGCATTTGATGGAGAGATCTGGACGAGCGCATATCTTTGATAATTGTTTGGATTTGTCCATGAATTCTGTCCAGAATTCCTTCTGCTTGCAGAGTTTATCAAGCGTCCTGAACACATACTGTTGTATCTGACCAATATAAATTTCTTCAACCGTCTGGCCTTGATCTCTAATGTACAGCTTCGTTTGTTGACTGAGATAGTCGTCAATGGATGAGAGATACACTTGCTTAAAACTTGGATTGTTTAAGCCATTAAGTGCATAATATCTCCTTGTTTGTCTTTCAAAATGCTTTGCTAAGTCTCTTTTCTTTAATGAACAACATTTTGCAGAAAAGAACTCTTCTTGTAGTTGATCTTTGAGATGATTTGGCGTGCCGATGAACTCTCTGTGGATTTCTCCGAGGAGTATAGGTATTGTTGTCTGGTAGACTTGTTGTTGTCTGTAATCGCCAAGTGAATTCCACCATTCTTTTAAGGCTCCTGAGAGTCTTGCTGTAAACTGCTGCATAACTAACTCTAGAGGAGAGGTTATTGCTTCGGAATTCATCCATGCTTGAAACTCGTCTAGACGATCATTCCATTTTTCAAAAGGAATATCGTCAAACGTGAACGTTGTGACTTTTGAGGCGAATTTTTTTTGCGGCACTTCTTGCTGCCTTGGAGGCACATAGTTCATCTCTTCGTCGCTTGAGAGAACTTCATTTATATCTGGTTCTTCCTTTGGTGTAGCCGGACCTCCTCCTATAACGAATTGGTTAGGAAGAGATTTTTCATCAAAACTGTCTTCATGGCTACTTGAGCTTGTCTCTGAGTAATGATTAATCGTTTTGATCGGGTGTGAAGAACTTGCTTGAGGCTCCTGAACCAATGGCTTTTGAGTTTGGCTATTAGGGTCTTGGCTGAGATCTTTGAGTAGATTGGAGATCGAAAAGTCGATTATTCCAATATCTTTTCCTTTCTTCTTTTTATCTTCAGTTGACTCAAGACTAGAGGAAGAAGTGATCGTTGGTCGTTTAGTCGGATTGACTACAAACTCCGATTCCTTCTGTCTTCTAGGTTTTGGACGGGCTGTCCTTGGTTTGAAATTACTGACTGGGGTCGACATTCCAAAGCGCGAAGTAAATGCTTCGTCTGAAGATAGAAATCCAGGTAGGGGCGTCTTTGGCTTTGGTTCTTGATATCCCGAAAGAAATCCTGGTGAGTACGATCCTTGATACATGGGCATTCCAGATGGCCTACCTCCAAAGGGAGTATATGTACTGGTCGACTGTTGATTCTGTATCATACTTTCAAGACATCTTTGAAGATCCTTTAACTGATTCTTTAAACTAGTTGTTTCGCCTTCTCTGGCTCGAAAGTGTGGTGAATTAACCATCATATGTTGAGCCAACGACATCATTTCTTCATGAAGGTTGTTTCATGAAGGTTGTTTAACCGTTCATGAATCTCTGCGATTGAACTCTGAAGACTGTTCAATCTTTTGTCGTTAATACCAGCCATTTGATCGACTTTGTGATTTATCGTTGTCAATAGTTGATTTTGAACTAGGGCGTTCTCTGTTTGCCAATTGAGAACTTTTTCTCCTTGGCTTAGCTGGTCAGGTCCTAGCGGGTTGATGGAGCGTGCTAGAATCTTTGGACAGTGAGCGACACCGTTTCTGTCGAAATCTTCAGGTGGAGGGAAATCATCAGTTTGCATCATCATGATTTGCTTAGGCTCCTCCTTCTTTTGAGAATATTGAACGATGAAGTCATATTTATCATCTCCTATCGGGCCGACAGTTGGATCACCTTCAAGATACCTCCTGTAAAGAGGATCTTTCTTTTTCCTTCTTCTTCTTCGAATATCTTCATCAGATTCATATGCTGCGTCCTGACAAGCCGTACAGGAACAAACATCAAAATACTGATGTCCGTTTTCATCCATGAAAGGGTAGAAAGCTGAGCCGTTTTGACCAAAAGAAATTGGCTTTGTCATTTGTTCTTTTACTGGACCGTAAAATTCGTGTTCATCAATTTGAATAGCAAATTGGGTGAACAGTTGTTTTCGGAATGATGATGATCTTAGTTTTTCGAACTTGATCTCCGTTGTTCCATCATTTCGAGAGTGAAAACTGACTTCTGATGATTGGATCGGTGCTTGCGCCGCTTGATGCATTTTCTCATAACTTGTTACCCATGACTCCGGTAAACGTTTGAGTAGCTCTTCGCGAGAGATTTGGCGAGGGATCTGGACCGAGCTGGGTGCTTGTGATGCTGAATTGACTTCTAGATATAACGCTTCGTCTGACGAGGGTAATACAAGATCTAGGGCGTGATCTTGAATTCTGTAGACCATTTGGTGATGAAGCGTTGCTGCTACACTCTTCTCTTGCATAAGTGCTCCAACGAGCTGTAATTGAACTTTCAGCGTCTTGAGAAGATTCGGATCTTGCAGAAAAACATTAAAGTTAGGAAACAGTGTTACAAATACTGTTCCGGCGTTCAATGTTGTCTGTACTGTTCCGATGCAGGCTTGCTGATACGATTTCAGCCTTGTATCGAGCAAAGCGATTCGTGCCGTAACTAGTAGACCTTTTCGTACGTGTAAGGTCAGACCAATTCGTACAACACCAAAGTGTAGGTGTGTATATCCTTGTTGTAGCCATAGCTTTGGCAGGTTCTCCGGAATGTTGAGAGAGATAAACTGCTCTTCTTCAGTAGCAGGGACTTGACATGATGAGAACTTGCTGGATTGGACATACTCAAGGACTCTTTTGTTGGAAGAAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1617_LTR-Caulimovirus_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

300

Start:

26353  

End:

26652

Strand:

-

>Contig1617_LTR-Caulimovirus_30

GATGAGATCTCGGACTCCTTTAACAGAAAAAGCGCTGGGCTTTTTTGCAAAGTATTCGTATGGATTTACAAGGGGAAGAGTTGTTTCAGGTAAACGATCTCCTGGAACATACTCGATTTCATAAAGACAATTAATAGAAGATGAAGATGAAGAGGAAATATTTTTTTGGCTTTTATTTTTAGGTAAAGTAGAAATTGCAAATTGGGAATCGATAGTAGACGGATCTGAAGTAGACATGATGAGAGGTTGTTTTCTAGAATATTCGAAATAATCAATCATAAACAATGATTCATTCCACCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1689_LTR-Caulimovirus_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1388

Start:

4343  

End:

5730

Strand:

-

>Contig1689_LTR-Caulimovirus_31

ACCACCATTCGCAGAACCAGCCTGGGACTTGCTTATAGCACATTGGATCAAAGGACAAGAACCAAGAATGATCGAATGCCCTTAAGAATAATGCCCGGAAGAAGGCGTTTTGATAATCTACATAAGTATATCCTAGATTATGAAAGCCAGGGGTTGAAAAGGACTTGGTAGTATGAAGGTTGAAGAAACCAAGGTCTTGAATAGAATGGACTGTTAAGATTTTACAGGTTGAATAGGCTATGAGGTTAGGATCGGATTTATCTGGGTATTGAGTTATTTCAGCAGACTTAGAGTCTACTAGAATGTACTCATAAAAGGTACGGTTTTTGACTATATTGTCGGTCTTTATAGGCTATCTTCATAGAAGATTCTTTTGGTAAAAGCCTGGAGTTCTTTGAGTGTAATTAGTTTGGTAAATTGGGTGGTCATGAGGTGTTGTTTTTGTGGTTTTAAGTGGTATACAGATTTTTCAGTGGTTGTTTGGGTTGGTTGAGTAGATTTTGTGGATGTATGGGCTTGGATATCAGTGGTAACTGCTTTTGAGTAAGATAGAGGTGGAAATTCGGCGAGAGCCGAAAAAGTGTTTTGCGTAGGTAAATTCTTTCCTTGCATACTTGGTTGTTTCTTGATATAGTCCGATGCTGACATCGGCTTCTTTTGTTTTTGATCACTCATCTTGAATAAATTTGTGTTGAATATCTGATGATCTAACCTGTAAATATTCTATTGTTAGAAAATCGGGTAAAGAATTATTTCCGCCTTTAATATATTGAATATGAAAATCAAAAGCGGATAAAATAGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGAAACTAAATTTTTAACATCTTTTTGTAATATTTCTTTAGCTGATTTACAATCAACCCGAAGTAAAAAAAAAATTGTTTATTAAATCGTCTTGAAATTTTGAAATGCAATTGACTATTGAAATAACTTCTTTTTTAACTGTGGAGTAAGATATTTGAGATCCTGTCCAGACTCCGGAATGAAATCGAACTATAGATTCTTGCTTAGACTCTGGGAGTTTTTGTTTAAGTATGCCACCGAATCCTATATCAGAAGCATTTGTTTCTACTATCATATCTGCTTCAGGGTTTGGTAGGGTTAGACAAGGAAGGGTTTTGACCTTTCCTTTAACTTGTTTGACTAAATTGGTGTGTACACTAGACCATGGTTTGAGATTTTTTTTGTAATTTTTGGAATAAGGGTTGAATGGTTTTCTTAAGATTGGGTAAAAAGTCGGACACATAATTTAAGCATCCTAAAAATCTTTGTAATTGTGTTTTTTCTCTTAATTCGTCTGGGAATTTATCTACAAATTCTATTGATCTTGAAATAGGTGTAATTGTTCCTTGGTATATGTTATGAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1725_LTR-Caulimovirus_32

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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84

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>Contig1725_LTR-Caulimovirus_32

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig1744_LTR-Caulimovirus_33

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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>Contig1744_LTR-Caulimovirus_33

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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>Contig1744_LTR-Caulimovirus_34

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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LTR

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1859_LTR-Caulimovirus_40

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Retrotransposons

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LTR

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>Contig1859_LTR-Caulimovirus_40

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