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Contig2251_LTR-Caulimovirus_62 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus19341592017853+
Contig2251_LTR-Caulimovirus_63 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7321796118692+
Contig2251_LTR-Caulimovirus_64 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1121963019741+
Contig2251_LTR-Caulimovirus_65 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus19871974321729+
Contig2251_LTR-Caulimovirus_66 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7052174522449+
Contig23_LTR-Caulimovirus_67 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus34271049513921-
Contig23_LTR-Caulimovirus_68 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus31761401317188-
Contig23_LTR-Caulimovirus_69 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus11629193993100-
Contig23_LTR-Caulimovirus_70 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus11839311894300-
Contig23_LTR-Caulimovirus_71 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus18669440196266-
Contig23_LTR-Caulimovirus_72 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2129627196482-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_73 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus70844845191-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_74 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus38651885573+
Contig2320_LTR-Caulimovirus_75 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus104155686608-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_76 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus31066136922-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_77 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus68770507736-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_78 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus19078448033-
Contig2320_LTR-Caulimovirus_79 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus160580319635+
Contig2320_LTR-Caulimovirus_80 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus543969410236+

< 4 5 6 7 8 > Total 31


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig222_LTR-Caulimovirus_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

87

Start:

55289  

End:

55375

Strand:

-

>Contig222_LTR-Caulimovirus_61

TACAAGTCATGTTGATCAATTTGGATGGCAAATTGAGTAAAAACTGCTTTTGAAACGATGATGATCTTGGTTTTTCGAACTTGATCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2251_LTR-Caulimovirus_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1934

Start:

15920  

End:

17853

Strand:

+

>Contig2251_LTR-Caulimovirus_62

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2251_LTR-Caulimovirus_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

732

Start:

17961  

End:

18692

Strand:

+

>Contig2251_LTR-Caulimovirus_63

GAATACTTTCAGGATGCCCAGCCCCCAGATGATGATATGAATATTGATATTGACGAAGTCGCCAGAAGATTCAACATCGAAGTCAATGCAATATCACAGGACAATTTCAAAGAACCAGAAGAAGAATATGAATGCCCAGATGATCACTACGGATGCTGCGAAGAACACATGATCGAGTTCGAGATTGATCATTAGTTGGGTAATCATAAGTATTAAGTTATGTTTAATTATTAAGTATGTTTAAAGTGTGTAAGCGATATTATAATCGCATAAATAAAGTGTACTGTAAAGCGATGATGTAATTGCTGATGTACTAATGATGTAAGCGATGATGTAATCGCTGACGTCAGCAGTTAGGCAGCCTGCCTAACTTCTCTACTATAAATATGTGTGTAACCCCCTTGTGAAATATCATCTCATTTTCCACTTAAAAACCTCTCTCTAGCTTCTCTCTAAAAATGTTCTAAATTCTCTCTAAGTTTTCCAGACTTCAGAGTATCTTTCATAAGCTCTGATTTCTTTCTTTCATTCACAAGTTGACGATCTGCTCCTTTGCGGTGGTCGAGTACTCTTCCGGTTTCGTCAATACGACGGTCTACAGAACTTTCGTGGAGAGGTATAGGCAATTCCTAATAGTGGGTTGGGCGTATAGTGGCTAGAGAATGCCCGTTTGAGCTCCCTTTACCTGGAATCCTATCCCCGCGTTAGTCTGTCTGACTTAGTCAATACGAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2251_LTR-Caulimovirus_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

112

Start:

19630  

End:

19741

Strand:

+

>Contig2251_LTR-Caulimovirus_64

TATGGTAGCAGAGCCTCGACTTGTGTTTTGGAGGAATGAATCATTGTTTATGATTGATTATTTTGAATGTTCTGGAAAACACTTTCATCCAAATGTCTACTTCAGATCCCCC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2251_LTR-Caulimovirus_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1987

Start:

19743  

End:

21729

Strand:

+

>Contig2251_LTR-Caulimovirus_65

GTTCTTAATTGGCAAACAGAAAACGCCCTGGTTCAGAATCAACTATTGCAAACAATAAATCGCAAAGTTGATCATATCGCTGGTAATTATGACAAGAGATTGAACAGTCTTCAGAGTTCAATCACGGAGATTCACGAGCGGTTAAACAACCTTCATGAAGAAATGATGACTTTAGCCCAACATATGATGGTTAACTCCCCTCACTTTCGAGCCAAACAAGCTGAAACAGCTAGTTTGAAGAATCAACTGAAGGATCTTCAAAGATGCCTTGAAAGCTTGATACAAAATCGACAGCCAGCTAGTTCGTATACTCCCTTTGGCAGTATGCCATCTGAAGTACCCCTGTATCAAGGATCCTACTCACCAGGATTTCTTTCGGGATATCAAGAACCAAAGCCAAGGAAGCCCTTACCTGGATTTCTATCTTCAGATGAGGTATTTACTTCATGCTTTGCGATGTCAACTCCAGTCGGTGACTTCAAGCCAAGGTCATCCCGAACAAAACCAAGAAGGCAAAAGGAATCGGAGTTTGTGGTCAACCCAACAAAACGACCTACTCTTACTTCCTCTTCCAGTCATGAATCAACTGAGGATAAGAAGAAAAAAGGAAAAGATATTGGAATTATCGAATTCTCAATGTCTAAGCTGCTCAACGATATTGGTGAAAACTCTGGTGGCCCAAAACAAGAACCGATGGTTCAAGTTCTCCAAGCAAGTGTCCCGGATCCGATCAAAATGATTGATCATTATTCAGACACAAGCTCAAGCAACTTCAACGCCAACTCTGACGAAGAATCTCTACCTAAACAATTTGTCATAGGCGAAGGTTCTTATATACCAAAGGAGGAACCAGATATAAACGAAGTTTTTTCAGGCGATGAAGAAATGAACTATGCACCTCCAAGGCAGCAGGAGATACCACCAAAGCAATTCGCCTCAAAAGTTACAACGTTCACGTTCGATGATATTCCTTTCGAAAAATGGAATGATCGTATCGATGAATTTCAAGCATGGATGAATTCCGAAGCCCTAACCTCGCCGCTAGATCTTGTCATACAACAATTCACGGCAAATTCTCAGGAGCCTTAAAAGAATGGTGGAATTCTTTAGGCGATTATAGACAGCAACAGGTCTATCAAACGACGATACCGATACTCCTCGGAGAAATCCACAGAGAGTTCATCGGAACGCCAACTCATCTAAAAGACCAGCTGCAAGAAGAATTCTTTGCTGCAAAATGCTGCTCATTAAGGAAAAGAGACTTAGCGAAGCATTTTGAAAGGCAGACAAAGAGATATTATGCGCTTAGTGGCTTAAATAATCCAAGCCTGAAGCAAGTATATATCTCGTCAATCGATGATTATCTTAGCCAGCAAACGAAGTTATACATCAGAGACCAAGGTCAAACAGTTGAAGAAATCTCTATTGGTCAAATTCAGCAGTATGTCTTCAGAACGCTGGATAAGCTTTGCAAGCAGAAAGAAATTTGGTCAGAATTAATGGACAAATCCAAGCAGCTATCAAGGATATGTGCTCGTCCGGATCTCTCTATCAAATGTCATAAATCCAAGAAGTCATGTTCTTGTGATTCACGGAGCAAGCCGAGAAAATACAAGAGATCTATCCCGAAGCATTTCAACAAATTCCGAAAAAGACGATTCTTCAGAAAGAAGCGAAGCTTTCAAAAAACGACGAAGTGTTTCTTATGTCGCAAGGAAGGACATTTCGCGAAAAACTGCCCCAACAAATCAAAGAAGAAGAAGCAATATCTTATCAACTCCATATCAAAGATAGCACCTGACATCGACCTCGACAGTCGCGATCTCGAGTCTGTCCTCTCATACGACAGCGACGAGAATGATGCTATATGCGGTTATTCGGACTATGATAGTTCATCTGAATCATCATATGAAGACGACGATGATTATTGTTTCAAGATTAGTCAAAAACCACAAGAAGTCGAGCTCCAAGCAGAGCATTCACCAGT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2251_LTR-Caulimovirus_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

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End:

22449

Strand:

+

>Contig2251_LTR-Caulimovirus_66

GCCTCCAGATGATGAGTTCCAAGCACCTCATCTACATGTTACGATCTTCGATCCATCAAGAAAAGAAGACCCAGTTCATGCTGTTGCATTCATTGATACTGGAGCACACACTACGATTATGAATCCCCAGATTCTTTCCTCTTCCATGTGGTTACCGCATCAACAAGAGTTTAGAGTTGCGAACTCTGGTTCGTTAACAATCAAGCTTAAATCAAGACCAATCATCATAGAGATCTTCCCTGGATGTCAAATCACAACCGAAGTTCTTGGCTCGTCAACACCCGGAAAAGATCTAATACTTGGGTGGGATACATACTCAGTGTTAAAGAAGAAGTTCGATATCTCTATCGAACCTCGAGGAGTAAAATGGAAAAATCTTTTCAAGGCTTTCACAACGATACCTCGTCTGTTCACTGTTGAAGGCTCTACCTCTCCTCAGTTTGAAGAAATCAAGGAAGAAATCACAGTCATGTCATGTGCTGAATCGCACACAGATTTTCTTCAGAAATGCAATAATCCGCTTTGGCTGAATAAGGAATTCTTTGTGTCATTGCCATTCAAAGAAAATGTCCTTACAACCCCGACGAAAGCCAGCCATGCAGGAATGCCACCTGCTTTACTCAAGCAAGCGAATGAAGAATGTGACCAGCTAATAAGCCAAGGAATTGCGTCAGCAACCAATTCCCCATGGGCATGCAAGGCGTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig23_LTR-Caulimovirus_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

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End:

13921

Strand:

-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_67

TTTTGATTTGGTTGACTTTTTTGAGCTAGAGGAAGCCGTAGGGCTTGCGGGTTTAGATGTTTGCTTAGGTTGTGGTTTAGATTGGGTAGGCTGGGGTTTTGGTTGTGAGAGTTGGCTAGGAGTTAGTAATGGTATCGATCGGGATACCGTTTTGACTATTTGAGTAAGTTCTTTATTGGATTGAAAGAACTTTTGAATGTTGGTTAAGGAACAGCGGTCCAAGTTGTATTTTTTCCCACCATTTGACTCGGAATTCCCGAATCAAGGAGAATGGCATATTAGGGAGTAAGTTGGTAAGGTGGAAATGCCAACAACATATCCATGGAATACCCATGTCGATATGGAATTGGATTTGGTTGAATGGGATAATGGGTTGACTAGGTACGTGTTTGAGGTAGAATGGTCTAGAGGTTTTGATTATTTCTGTTGGGTAAATTTCATTGATGGGGCCAAACCAATGCCACCATTCGTAGAACCAGCCTGGTATCGTTTTTGGGCATTGATGATCAAAGGATATAAACCAGGAATGGTCATATGAACGTAGGTAGAAGGTTTTGAAGAGGGCTTCTTTATAGTCGGTGTAAGTATATCAATCGATATAGAAGCCGGCGGTGTAGAAGGGTTTTTGCGTATGATGGTTAAGAAAACGAAGGTCTTGAATATAGGCTATGCGTAGTATCTTACACGTTGAATAGGATATAAGGTTGGGGTTGTTTTTATCTGGATAATGTACTATTTCAGCAGACTTAGAGTCTACTAGAATGTACTCATAGAAGGTACGGTTTTTGATAACGTTATCTGTTGGATATAAGGAGTCTTCATAGAAGACAGAAGAGGTGAAACGCTGTAAGTCTCTAAGAGTTACAGGTTTGGTTATATTTGTTGTCATAAGGTGTTGTTTATTCTCTTTAAGGAAGTACTGGGCCTTTTGGGCCGGTGTTTGAGTAGATGGCTGGCCTTTTTCAGGATAAGCCGCTTTTGCATAAGAAAGGGGTGGATATTCAGCTAGAGCTGAGAAGTTGTTTTGAATAGAAAGTGGTTTTCCTTGCATATGAGGTTTCCGATGCTTTCATCGGCTTCTTGCTTTTACGGTCCGCCATCTTGATAATTGGTTGGAATATCTTGATTTTTTCCCTGCAAATATTCTCTTGTTAGAAAATCTGGTAAGGAATTATTTTCGCCTTTAATATATTGAATATCGAAATCAAATGCAGATAGAATAGCTTGCCATCTGGCAAATATTTGTTTTGATACTAAATTTTTAACATCTTTTTGTAATATTTCTTTGGCCGATTTACAATCGACTCTTAGTAAGAAACGTTTGTTAATTAAATCGTCTTGAAATTTTGAAATACAATTGACTATTGATAGAACTTCTTTTTTAACTGTTGAATATTTTGTTTGTGGTCCTAGCCAGATGCCAGAATGGAATCTTACTAGAGACTCTTGTTTAGAGTTAGGTAATTGTTGTTTAAGAATACCACTATATCCTAAATCGGATGCGTCGGTTTCTACTATCATATAGGCGTTTGGATTTGGTAAAGTTAGGCAAGGTAAAGTTTTGACTTTTGCCTTGACTTGTTTAACCAGATCAGTATGAATACTGGTCCATGGTTTAGGATTTTTCTGTAGTCTTTGAAATAATGGTTGAATAGTTTGTCGTAGATTTGGAAGGAAATCTGATACATAGTTCAGACATCCTAAGAATCTTTGAAGTTGCGTTTTTTCCCTTAGTTCATTGGGGAATTTATCCGCAAATTCAATATATCTTGAAATAGGTGTTATTGTTCCTTGATAAATATTGTGTCCTAAAAATCTTATTTTTGTTTGAAATAAAGACATTTTTTTAGCGGATAGGACTAATCCGTGTTTTTTTACTACGTTTAGAAACGTGTTTAAATGATTTATATGTTGATCAATCGAGTTTGAATAAACTAATACATCATCGATGTATACTATTGTGAATTTAGAATAATTATTGAATATATCATTCATTATGTGTTGAAATTCAGAGGGTGCGTTTTTAAGGCCAAAGGGCATTACGTTCCATTCGTAATGTCCAAATGGTACAGTGAATGCGGTTTTGTATTTATCTTTTTCGGCTATTTGTATTTGCCAAAAACCGCTTTTCATGTCAAATTTTGAATAGATTTTTGCATCGTATAGTCTTTTTAATAAATCTCTTTTATTGGGTATTGGATATCTTATCCATTGTAGTACATCAATAAGTGGTTTATAGTTGATTACTAAACGTGGTACTCCGCGTTCTTTTTCTGCTTGATTATTAACATAGAAGGCCGAACAACTCCAGGGGGATTTGGACGGTCTTATAAGTTTCTTTTTTAATAAATCGTTGATTTCTTGTTTACAATGTTCTAGCTGTACGTTATTCATTTGAATAGGTCTAGCTTTGGTTGGAATAATTTTTTCGTTAAAATCTTTGATATAGGGAAGATCAACATTATGCTGTTTTCTTTCCCAGAATGCGTTTGGAATATCTGAACATACTTGATTTAACAAGTCGTTCTCTATTGATTTTATTTTATCTATAATGTAGGGTGATTTAAGTTGTTCTTCTATTTTTTATAGGTTATTTCTTCTTGTAAAGATTGAATATGATTTTGTTTTCCTTTTATAAGGTTTATTGTTTTGTGTATTGTATTTTCTTGTAATAATAATACCTCTTTCATTTTTATTGGTGATAGGAATTTGAATAATAGTTTAGTTCCCATTACTTTGGTGCTAATTCCGTATTGGTTTACGTTAAATGGGTATATTTGAGTAAAGAATGGTGTTCCTAGGATTACTTCTTGTGATAAATTCTTTACTAGGATAAATTGGTTTTTAAAACAATAACCGTTGTTGCATATTTTACCACATGGTAATTTGTATTTTACATTTAGGCTACTGCCGTTTGCGCCACTTAGGCGTTCGGTAGTTTTCTCATAATATTTAGTTGGTATTAAGCCTTCACGGATGCAGTTATAATCTGCTCCGGAATCCATAAGAGCTATGATTTCTATTTGAAAATCATGTCCTATGTGTAGCTTAATCTTTGTATACCATTTTTGATAATTAATTTTATCAATTATTTGAATATATTCTTCGTCGTCTTGAATATCTGATTCAATTTCTTTTCCTTTTGAATTACTAGTTGATGGTTGATTATTATTTTCTATTAATGTTAATTTTGCATCTATCTGTAATTGTTTTAATTCTTGTTGATTAACTATGACTTGTAATTCTTTAACTTGTGTTTTTAGTTGCTTGATTTCGCTTTGCAATTCACCCGTGGTGACTTGTTTAAATAAACTTTGTGTGGGGTATTTTTCGTATATTTTGCTTAAACTGAAAGATTCTTGAGTAGTGAATTTATTTTCTTGAGATACTAAATCTTTTAGTTTTAATAAGTATTGTTTTTTAATTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig23_LTR-Caulimovirus_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3176

Start:

14013  

End:

17188

Strand:

-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_68

ATCTGATAATTGTTGAGTTTCTGTAGAAGAATCATTTAAGTTTTCTACTTCATTTATTGAATTATCACTATTGCTTTCTTCAGATGTTTCTGATTCTGAAGTAAGTAATAGTTTAGTTAATTTCTCTTGAATATCAGGTTGATCTTGAAAGATTTCATTAATCTTTCTTTTCATTTTACAATCAGTGGACTTGTGTCCGGGTCGTTTGCAATTCCAGCAAACTATATTTTGTTTATTAAATTTATTTTTTGAATAATTTTTATTTTGTTGATATTTTTTATTTTTTGAAAATTTGTTTTTTGAATAATATTGATTTACAGGTCTTTTATAATCATTATTTTGTGATAATGCCGATTACTTCTTTATCTAAATTTTTGGCGATTAATCCTAGAAGGTGGATTAAGTGGTTGGTATCCATATTGTTCACAAAATGAACCCATGGATATCTTAAATTTGAATTTATCATTACGCTTTTTATCGCGTTGTTCTTGACATATTTCTAAACCTTGCTTTTTAACAAAGGCAAATAATTGACCATAAGTTATTGTATTCCAAGGGATTTGTTGCCCTCCAGAATACTCTTTTAGTTTATTGATTACTCTTTCTGCAAAGAAAGATGGTAAGCCAGAGACAAACCGTTCTTTCCAAAATGGTTGATTACAATCTTTTCTTTGAAATATATTTGTTGTAAATACATCTTTATACCATTTAAAATCCCCTAAAGTTGGGCATCTTAAATTGGTTAGGATTAGTTTCTTGCTTTCTAGTTCTTCTTCTGGATTACCAATAAAATGCATGGTTAAGGTGTGGATTAATACTTCTACAGCATTTTGTTTTTCAAAGGTTTCATAGTAACCTTCTACATCTTGTTCTGTTTTAATTATTTCTACATGATTGATTATTTGTTCTTGAATATGTGGTTCAATGGCGTTATCCCACCAATATCTTAGTGCGCCAGTGAAACCAGCTAATAACATTATACATGCTTGTTTATCGGGATTTCCACTAGCTTTAAACGCTAGAGCTTCCATACCCATTTCTTGAAATAAATTCATAATTTCATATTCTGATCTACCGTCTATATTCCGTTCGTGTAGATCATCACCAGTGTATACATTTTGAGTAAATTTATGATGTTCTTCAAATAGAACATCGGGTGGTGAATGTCTAGAATAATAAGGTTTATTAGACCTTATGTTTCTTTTTATTCTATTGATTTCTTGATCCTCGGAATCTAAGGATTGAGTATTCTCATTTTCATCTATATTGTTTATCCCTTTTCCTTTGTCCATATATTCTAATCTTGCTGAGATTGATTTTAATAATTCATTTTGTGGAAATTTAATTTCTCTTTTTAATGGTTTAAATATTGGTGTTGATATTGAGGAAAATGGGTGTGGAATAATTTGGGTTTTTTCTTCATTGACTGTATCTATTTTTGTATCTATATGATCTATTTGTTTAGCTATTGTATATAATATTTGACTTTGATAATAGTTCTGTTGATAAATACTTTTTATTTCTTGTTTGGATACAGGTTCTTTGTCTATCTCATTGGCTCCTGTTTTAAACGGAGTTGCAATGATTTGTCTATTTGATATTTGAATTTTTAAGTCAGATAATGGGGGATGTATAGATTTAATCTTTTTTCCATCTACTTGTTCCCATATTTGACTTAAGGATGAACTTGTATTAATTTCTTTGAATGGATAATTGATATTATTGGCTATTGCATAGGTTTCAAACCATATAAAGAATGGAATGTCCAATTCCTTTATTGTCATACAATTATACCATTTTTTCTAAATTCAATTGTTTGTTGCTTAGGAAATATCTTGAAATACCAATTTCTTTTTTCTTTGTTATTTTCTGAATAAAAATTCTTTTTTATATATTCTTTATTGATTACGAATTCTTTTAGAATTACATTGATAGTATGAAAATCGGATTGCGTAGGTGATGTTGGATATAGATTTGTTTCTGGTTCAGCTATTGGTGCTTTGAATTTTATTGGGTCATTTTGATTAATGTTTTGGTTTACGCTTTCCGTATCTGAATCGATACTGGATTGACCAGTTCGATATTCAGAGAAAGAGGCTCTTGAAGGCATACGACCTTCAGAGAAAGATGTTCTTGAATAGTATGAACTTATTCTTGGAGGGAGTGGTTCTCTAAATGAACCGAATCTTAATAGTATTTTCCCATCCGGTTGTTCAAGTATACTTGATATATTTCTTTGCTCAATATTTCTAGGTGGTTGAGTAATTTCTATTTTCCATTGATCTGGGATAGTAATTTGATTCCAATTTAATTGTTTAGGTGCATAAGTAGCTTTTGGCATATCTTTACTATGTACTGCTAATATTGTTATTTCTCCTTTATCGTCTTGTAATAAACATCTGGGATTAAACTCAGAGTTTGATTGCTTAAAGTATATTCGGTATAGTAATAAATATCCGTGTCTATCAGTTTGAAATTTTAATTCTGGTAGATGGATATTTAATACTAGCGTATTGAGTATAGTAGGATCGTGTAGACTAACTTGATAGTTAGGAGCGTAGTTAAAGTAAACCGCTCCGTTGCATAAATTCGATTGAACTACTCCGAGGAGTGAGTCTTCGAATTTTAATAGGGTTTTATCCCTTAGTAGCATAAGTATAGGTTGGTCTATACCGGTTCTTGATAGTGGTTTAATCGCTATTTGGATAAGTCCAAAGTGTAAATAAGTAAACCCTTTTTGCTTATATTTGTCTAGAGCTAGTGATGATAAAAGCTTTATTTCTTCAAACTCATGTTGAAGAGATAAAGTTTGCTCATGTTCTTTTATTGAATAAGCAGTTTTGAAATCAAATGTTCCAATTTGATATATTAATTCTGGGTTAATATGTGGTAATGAGTTTCTTTTAATCTCATTACTAAACGTTGATATTTTTGATATGATTTCTCTAGAGTTTATTGTTGATTTAGATGAAGATGCTTGATTAGACTTAAACAGCTTTCTTAAAGAAGATGCCATGATAAACTCTTAAATAAAACACATATTAAACAGAATCTTTACCTTTTCTTTCAAGGCACAGCTGTGGCTTGCCAACGGTCTTACTGCCTATCGAGGACTTGCAGCCTGGAACACCTGCAGCATCAGTGTCTTTGCAGAAGAGGCTCGGGTCTGGCTAAGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig23_LTR-Caulimovirus_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1162

Start:

91939  

End:

93100

Strand:

-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_69

TGATGGAATGAATCATTGTTTATGATTGATTATTTCTTGAAATTGCTTGAGCGTTCGAACATGTTCTTCATTAGTTGGCGAGAACAGTAGGATGTCGGCAATGTAGATTAGCGCTGTATGAAGGAGAAGCTTGAATATTCGCAACATGGCTTGTTGGAATAGTGATGACGCCGTTTTGAGACCAAACGGTAGGACATTCCACTGGAGATGGCGATTAGGTAGACAAAAGGCTGTTTTGTACCTTTCTTCTGGTTGGACTCCAAGTTGCCAAAATCCAAATTTTAAGTCGAATTTTGAGAATACCGTAGCTCCTTGAAGTTGTTGGAAAAGGGCCTTCTTGTTTGGCAAGGGGAACTTGACATCTTGCAGGTACTGGTTCAATGGCTTGTAGTCGATCACCAGTCTTAGTTTTCCTCGTGTTTGTTCTGCACGATTGTTGACGTAAAACACCTTGCATGCCCATGGTGAATTAGTCGTTGATGCGATGCCTTGTGCTACTAGCTGGTCACATTCTTCATTTGCCTGTTTGAGTAATGCGGGTGGCATTCCAGCATGACTTGCCTTTGTCGGGGTTGTAAGCACATTTTCTTTGAACGGTAGTGCCACAAAGAACTCTGAATTTAGCCAAAGTGGATTATTGCATTTTTGCAGAAAATCCGTGTGCGATTCAGCACATGACATAATCTTGATTTCTTCTTTGGTTTTTTCAAACTGAGGCGAGGTAGGGCCTTCAACAGTGAATAGTCGAGGTATGGATGTGAAAGCTTTGAAGAAAGTCTTCCATTTTATTCCTCGAGGTTCGATAGAGATATCGAAATTCTTCTTTAACACCGAATATGTATCCCATCCAAGTATTAGATCTTTACCAGGAGTTGATGATCCAAGAACCTCCGTCGTAATTTGGCATCCTGGGAAAATCTCAATGATGATTGGTCTTGATTTGAGCTTAATCGTTAAGGATCCAGAATTTGCAACTCTGAACTCTTGCTGGTGAGGTAACCACATGTAGGATGAGAGAATATTGGGATTCATGATCGTCGTGTGAGCGCCTGTCTATGAATGCAACATCATGTACCGGCTTTTCGTTTCTTGACGGATCGAAAATTGTAACTGGCAGATGCGGTGCTTGAAAATCTTCTTCGGGTGGCTTATTATTAATCTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig23_LTR-Caulimovirus_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1183

Start:

93118  

End:

94300

Strand:

-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_70

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig23_LTR-Caulimovirus_71

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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1866

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96266

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-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_71

TCTTGAGTTTGGCCATTAGGGTCTTTGCTGAGGTCTTTGAGCAGATTGGACATCGAAAACTCGATTATTCCAATATCTTTTCCTTTCTTCTTTTTATTTTCAGTTGACTCATGACTAGAGGAAGAAGTGATCGTTGGTCGTTTAGTCGGATTAACTATAAACTCCGATTCCTTCTGTCTTCTTGGTTTTGGACGGGCTGTCCTTGGTTTGAAGTTACTGACTGGAGTTGACATTCCAAAGCGCGAAGTGAATGCTTCATATGAAGATAGAAATCCGGGTAAGGGCGTCTTTGGCTTTGGTTCTTGATATCCCGAAAGAAATCCTGGTGAGTAGGATCCTTGATACATGGGTATCCCAGACGACATTCCTCCAAAGGGAGTATACGTACTGGCGGACTGTCGATTTTGTATCATACTTTCGAGGCATCTTTGAAGATCCTTCAATTGATTCTTTAAGCTGGCCGTTTCAGCTTCTCTGGCTCGAAAGTGAGGTGAATTAACCATCATATGTTGAGCCAACGACATCATTTCTTCATGAAGGTTGTTTAACCTTTCATGGATCTCTTCGATTGAACTCTGAAGGCTGTTCAATCTTTTGTCGTTAATACCAGCCATTTGATCGACTTTGTGATTTATCGTTGTCAATAGCCAATTCTGAACTAGTGCGTTCTCTGTTTGCCAATTGAGAACCTTTTCTCCTTGGCTTAGCTGGTCTGGTCCTAGCGGGTTGATGGCGCGCTTGGACTGTGAGCGACACCGTTTCTGTTGAAATCTTCAGGTGGAGGGAAGTCATCAGTTTGCATCATCATGATTTGCTTTGGCTCCTCCTTCTTTTGAGAATATTGGACGATAAATTCATATTTATCATCTCCTAATGGACCAACAGTTGGATCGCCTTCAAGATACCTCTTGTAAAGAGGATCTTTCTTTTTCCTTCTTCGTCGCCGAATATCTGCATCAGATTCATATTCTGCGTCCTGACAAGCCGTACAGGAACAAACATCAAAGTATTGATGTCCGTTTTCGTCCTTGAAAGGGTAGAGCACTGAGCCATTCTGACCAAAAGAAATTGGTTTTGGCATCTGTTCCTTTACTGGACCGTAGAATTCGTGTTCATCAATCTGAATAGCAAATTGAGTGAACAGTTATTTTCGGAATGATGATGATCTTGGTTTTTCGAACTTGATCTCCGTTGTTTCATCATTTCGGGAATGAAAACTGACTTCTGATGATTGGATCGGTGCTTGCGCTGCTTGATGCATCTTCTCATAGCTTGTTACCCATGACTCCGGTAAACGTTTGAGTAGCTCTTCGCGAGAGATTTGGCGAGGGATCTGGACTGAGCTGGGTGCTTGTGATGCTGAATTGACTTCGAGATATAACGCTTCGTCTGACGAGGGCAATACAAGATCTAGGGCGTGATCTTGAATTCTATACACCATTTGGTGATGAAGCGTTGCTGCTACACTCTTCTCTTGCATAGGTGCTCCAACGAGCTGTAATTGAACCTTCAGCGTCTTGAGAAGATTCGGATCTTGTAGAGAAACATTAAAGTTGGGAAACAGTGTTACAAATACTGTTCCGGCGTTCAATGTTGTCTTCCGATGCATGCTTGCTGATACGATTTCAGCCTTGTATCGAGCAAAGCGATTCGTGCTGTGACTGGTAGACCTTTTCGTGCGTGTAAGGTCAGACCAATTCTTACCACACCGAAGTGTAGATGCGTATATCCTTGTTGTAGCCATAGCTTCGGCAGGTTCTCCGGAATATTGAGAGAGATAAACTGCTCTTCTTTGGTTGCTGGGACTTGACACGATGAGAACTTGCTTGATTGGACATACTCAAGGACTCTTCTGTTGGAAGAAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig23_LTR-Caulimovirus_72

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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212

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-

>Contig23_LTR-Caulimovirus_72

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2320_LTR-Caulimovirus_73

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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5191

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-

>Contig2320_LTR-Caulimovirus_73

TGGTTTGAAGTCGCTGACTGGAGGTGTCATTCCATAGCGCGATGTGAATGCTTCATCAGAGGATAGAAATCCAGGCAAAGACATCTTCGCCTTTTGATCTTGATAACCCGAAAGGAATCCATGTGGATAGGATCCTTGATACATGGTCATCCCGGATGGCATACCTCCAAAGGGAGCAGAGAATGTGCTAGCCGAATATTGATTTTGTACTAGGCTTTCGAGGCTTCTTTGGAGATCCTTCAACTGTTTTTTTAGGCTATTCGTTTCCGCTTCTTTACTTTTGAAGTGGGGCGAATTAACCATCATGTGTTGGGCCATCGTCATCATTTCTTCGTGAAGGTTGTTTAACCGTTCATGGATCTCTGTGATTGAACTTTGAAGACTGTTCAATCTTTTGTCGTAACCACCAGCGATTTGATCAACTTTGCGATTTATCGTTGTCAATAGTTGATTCTGAACGAGAGCATTTTTTGTTTGCCAGTTGAGAACCTTTTCTCCTTGGCTTAGCTGGTCTGGTCCTAGAGGATTAATGGCGCGTGAAAGAATTTTAGGACTGTGAGCGACACCATCTCTGTTGAAATCTTCGGGTGGAGGGAAATTATCATTCTGCATCATCATAATTTGTTTAGACTCCTTCTTTTTCTCCGAATATTGAACAATGAAGTCGTATCTGTCATCTCCTAACGGGACGACAGTTGGGTCGCCATC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig2320_LTR-Caulimovirus_74

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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+

>Contig2320_LTR-Caulimovirus_74

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig2320_LTR-Caulimovirus_75

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Retrotransposons

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LTR

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_75

TCATCATAATTTGTTTAGACTCCTCCTTTTTCTCCTAATATTGGACAATAAAGTCGTATCTGTCATCTCCTAACGGGCCGACAGTTGGGTCGACTTCGAGATATCTTTTGTAAAGAGGATCCTTCTTCTTTCTTCTCCTTCGTTGGATATTTTCATCGGATTCATATGCTGCATCCATACATGCCGTGCAAGAACAAACATCAAAGTATTGATGTCCGTTTTCGTCCTTGAAAGCAAATAAAACTGTGCCATCTTGACCAAAAGAAATTAGTTTTGGCATTTGTTTTCTTGCTGGACCGTAGAATTCGTGTTCATCGATTTGAATAGCAAATTGAGTGAGCAGTTGTTTTCGAAATGACGATGATCTTGGTTTTTCGAACTTGATCTCCGTTGTTCCATCATTTCGAGAGTGAAAACTGACTTCTGAAGATTGAACTGGTGCTTGAGCGGCTTGGTGCATCTTTTCATAGCTTGTTACCCATGACTCCGGTAAACGACGTAATAGTTCTTCGCGAGAGATCTGGCGAGGAATTTGGACCGAGCTGGGTGCTTGTGATGCTGAGTTTACTTCGAGGTATAACGCTTCATCTGATGAGGGTAATACAAGATCAAGGGCGTGATCTTGGATTCTGTAGACTATTTGGTGATGGAGGGTTGCTACCACGCTCTTCTCTTGCATAGGTGCTCCAACGAGCTGCAATTGGACTTTGAGCGTCTTGAGAAGATTCGGATCTTGCAGAGAGACATTAAAGTTTCCAAACAGTGTTATAAATATTGTTCCGGCATTTAATGTTGTCTGTACTATTCCGATGCAGGCTTGCTGATATGATTTTAGTCTTGTAGACATTTTCGTGCGTGTAAGGTCAAACCAATTCGTACAACACCGAAGTGTAGGTGAGTATACCCTTGTTGTTGCCATAGCTTCGGCAGGTTCTCTGGAATATTGAGAGAGATGAACTGCTCTTCCTCGGTTGCTGGGACTTGACACGATTAGAACTTGCTGGACTGAACATACTCAAAGACTCTTCTGTTTGAAGAAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig2320_LTR-Caulimovirus_76

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Retrotransposons

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LTR

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_76

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig2320_LTR-Caulimovirus_77

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Retrotransposons

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LTR

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_77

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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LTR

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_78

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Retrotransposons

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_79

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Retrotransposons

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>Contig2320_LTR-Caulimovirus_80

TCCATCATCCTCGCAAAATACGGTATCCACTGCCACTACATTGCACCGATGGGAATCCATCCGGATTATCCGTTTGCTCACCTCTACAAGATTGAGAGCACTCACATGCTAGAAGAAGTTCTCTGTTTCCTCTGGTATCTCTGTTCCGTCTACACCATTGGCATCACTTTCGACATACACTGGCTATATCAGTATGTCAGTGCTCAACAAGGAGGTCAAAGAGACTGCTTCTCAACATTCCAGACATGGTTCGCATCACTATCCATCTGGATTGGAAAACTAAGGAAAGCAGCAAAAGCAACATGCCTACCGTTCAAAAAGCTGAAAAGGCAAGCAGCCCTCAACCCGTTCTTCAACCCACACACGGTATACTTCTTCCACCGACCGGTTCAGGTAAACATGAAGTCAAACAAGGTACATGCACTACCGACGCTCATTCATCACAACGACTTTCACAAAGGAATTCGTCCAGACTTCAACCTACATGACAACAAGGCGTATGAAGATTTCCAGACTCATGTGTTCCGCCTCAACAACGCCAGA