ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig969_LTR-Caulimovirus_601 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1716187862048+
Contig991_LTR-Caulimovirus_602 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus23089889217+
Contig995_LTR-Caulimovirus_603 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus923422534316-
Contig999_LTR-Caulimovirus_604 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus23850675304-

< 27 28 29 30 31 > Total 31


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig969_LTR-Caulimovirus_601

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

171

Start:

61878  

End:

62048

Strand:

+

>Contig969_LTR-Caulimovirus_601

CAGTTCTAATAACAACCGACACGACCCACGAGTCCTAATCATCCTCCTCCTCATAGCCTTGATTCCACGGACACACACTTACTTTTCCTGCATCAAACAAAAGAGATGCATAAGTATTTCAACAAATACTTAGTGAGGCAATCCTCCCGTCTACAAGCTATACACACAAAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig991_LTR-Caulimovirus_602

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

230

Start:

8988  

End:

9217

Strand:

+

>Contig991_LTR-Caulimovirus_602

AATTGCAACTAAGTCCTTTGACTTTTTACTCTTTGAAAACAGCCCCATAACTTCTAATTGTAACAATTAAACCCACCACAACTTTCTGATCTAACAGAAACGATCCCAAACTTTCCGATTCTCCATTTTAACACCTCAGATTATTATTTGGTTCAAATAAAATCTGAAAAATTAATCAGCTCCTTAATCCGAAAATAAATTCAACTTTCCGTTTCCGAAATACGGATGTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig995_LTR-Caulimovirus_603

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

92

Start:

34225  

End:

34316

Strand:

-

>Contig995_LTR-Caulimovirus_603

GTTAATTTCGTGGTTGTGGATCCGTTTGATAATTAATGGTATGAGACATTAATTATCGTGTTTAAAAAAAAAAAACGGGTCGGGTCGTTTCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig999_LTR-Caulimovirus_604

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

238

Start:

5067  

End:

5304

Strand:

-

>Contig999_LTR-Caulimovirus_604

AACATCCATGTCCCGGAAACGGAAAGTTGAATTTATTTTTCCGGATTAAGAAGTTGGGTTATACAGATTTTATTTAAAACAAATAATAATCTGTGGTGCTTTAATATGAGAATCGATAAGGTGGGGTTGAATATATTAAATTAGAAAACTGTGTTGGGTTCAGTTGATTAAAACAGAAGTTATAGGGCTGCTTTGCAAAGATGGGGACTTAGTGGAAATATGGAGAAGTTAAAAAAAA