Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig123_LTR-Cassandra_41Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
242Start:
226428End:
226669Strand:
+>Contig123_LTR-Cassandra_41
TGTAACACTATGATTTCTCGTATATTGTGCTGCATTGGAAATTGATTTGGCTACCTATGCAACCAAAATACACTTATCGTTTTTGTGAATCATTATGACAGAACTGCAAGGTTAAAGTTCTTAAGTTGGAGCGATGGAAAGATGGGTGACCATCTGGAATAACAATTTTCAGTACCGTGTGTGTGAGAATAAAATATAGGAAAAGATATTGTGTTGATTTGTAGGGACAATACACATCTCTT
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1242_LTR-Cassandra_42Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
350Start:
2301End:
2650Strand:
->Contig1242_LTR-Cassandra_42
GTAAGCCCCACGCCCTCTCTAGGTCCGTGGTTCCCCACGTCCCCTCTAGGCTCATTGTCTCCACCCTAGTCCGACGGCCGGTTCGTTATCTCGAGAGTATATAAAGACTTGTTTACTATCCCTACAAATCGCAACAAGATCTTTCTCCGTGTTTTGGCCTCACTCACGCAGTATCACTTCCCGGTAGATCACTCATCCTAGTACTACTCCAGTTCAACCACGCTTAACTCTGGAGTTCTGTCAGGATGGTTGATTGAAAAGATAAAAGCACTTTGGCAACATCGGTAGCCAAATCAAATCACTTAAACTCTCATCATGCACTACCATATAGTAGAAACCGGGATGTTTCA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1259_LTR-Cassandra_43Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
136Start:
49551End:
49686Strand:
+>Contig1259_LTR-Cassandra_43
TGTAACATCCCGATTTTTGTTATATGATGGTGGAATGTAGTTGAATTTTAATATATTTGATTTGGCTACATATGTTACTAAAATGCATTTATATTTCCTGTCAGTTGTCTAGAAGAAACCAAGTTACGCATGCATG
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1273_LTR-Cassandra_44Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
354Start:
4986End:
5339Strand:
->Contig1273_LTR-Cassandra_44
CCCGTGGGCCCCCACGTCCTCTTTAGGCCCATGGGCCCCACCCTCGTCCGACGGGGGACCCTCGTCCGACGGCCGGTTTGTTATCTCGAGAAAACTCTAAAGATTTGTTTACTGTCCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCCAGGCCAAGCACGCTTAACTGTGAAATTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAAGTAGCCAAATTAATTATCTTAAACCTCTCATCATGCACCACCATATACCAGAAATCGGGATGTTACA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1273_LTR-Cassandra_45Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
356Start:
5482End:
5837Strand:
->Contig1273_LTR-Cassandra_45
GCCCCACACCCTCTCTAGGCTCGTGGGCCTCCACGTCCTCTCTAGGCCCATGGGCCCAACCCTCATCTGTCGGCCGGTTTGTTATCTCAAGACAACTCTAAAGGTTTGTTTACTGTCCCTACAGATCACCACATGATCTTTCCCCGTGTTTTGACCTCACTCACACGGTACCGATAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCCAGCCCAGACACGCTTAAATCTGGAGTTCTGACCGGATGATTGACGGAAAAGATAAGTGCTCTTTGGGTAACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAACCTCTAATCATGCACCACCATATACCAGAAACCGGAATGTTACA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1273_LTR-Cassandra_46Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
384Start:
5945End:
6328Strand:
->Contig1273_LTR-Cassandra_46
TGTAACGCCCCGACCGCCACCGTCCGTGGGCCCCCACACCCTCTCTAGGTCCGTAGCATACCAGTCTTTTCTATTATCAAATGATATCTGTTTTATTTGCAGTGATTGTGTTATCTCGAGAAAACTCCAAAGATTTATTTACTGTCCCTATAAATCACCACATGATATTTTCCCGTGTTTTGGCCCCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTCAGCCATCCTAGTGCTATTCCAGTCCAAGCACGCTTAACTATGGAGTTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTCTCGTCATGCACCACCATATACCAGAAATCGGGATGTTACA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1274_LTR-Cassandra_47Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
381Start:
9012End:
9392Strand:
->Contig1274_LTR-Cassandra_47
AAGGCCCCGCAACCCACCCTTAATCTAGGCCCCATGGGCCCCCGCACGTTCTCCCTCAGGCCCCAATGGACCCCCACCCTCGTCCGACCGGCCGGTTTTGTTATTTTCGGGAGGGCTCTAAAAGACTTGTTTCACTGTTCCCTAGACAAATCACCAACATGATCTTTTCCCCCGTGTTTTGGCCTCACCTCCCCAGCACGGGTACCCAAAACAACAAACTTCCGCGGGTAGGTCACCCATCCTAAAGTGCTTACTTCCAAGCCGCAAAGCACCGCTTAAAAGACTGTTGGAGTTTCGACCCCGGGATGGTTGACCGGGGGAAAAGAAATAAAAGCTTGCACCTTTGGTGAACATAAGGTAAGCCCAAACATCAATTCTCTT
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1280_LTR-Cassandra_48Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
154Start:
18771End:
18924Strand:
->Contig1280_LTR-Cassandra_48
TGTAACGTCTTTACCGCCACAATCGGTGGATATTTACATTCTTTCGGTCCGTGGACTCTATCCTCATCCGACGGCTGGTGCGTTATTCCGAAAGATTTAAATTTTTTTTTTCTGTTTATATAAACCACCAAATGATCTTTCCTCATGTTGTTCT
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1280_LTR-Cassandra_49Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
122Start:
18945End:
19066Strand:
->Contig1280_LTR-Cassandra_49
TTCTTTTGGGACAAGTGGCGCCAAAGATAAATGCAATGTAGTAACATAGGTATTAGGTTGCCAAATCAATCTCTTAATCTTTCCTCATACATAACCATATTTAATGAAATTTGGGTGTTACA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1332_LTR-Cassandra_50Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
277Start:
13836End:
14112Strand:
+>Contig1332_LTR-Cassandra_50
TGTAACATCCCAATTTCTGGTATATATGGTGGTGCATGATGAGAGCTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGGGCATTTATCTTTTCTGTCAACCACTGACAAAACTCCAGAGTTAAGCGTGATTTGGATGGAGTAGTAATATGATGGGTGACCTATTGGGATATTTCTGGTACCGTGTAAGTGAGGCCAAAACATGAGAAAATATCATGCGGTGATTTGTATGGACAGTAAACAAATCTTTAGAGCCTCTCGGGATAGCGCACTGA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1337_LTR-Cassandra_51Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
364Start:
50927End:
51290Strand:
+>Contig1337_LTR-Cassandra_51
TGTAACATTCCGATTTCTGGTATATTGTGGTGCATGATGAGAGGTTTAAGATATTTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATTTTTTCCGTCAACCATTCTGACAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTACTATGATGGTTGACCTACCGGGAAGTGTTTATCGGTATTCCGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGAAAAGATCATGTGGTGATTTGTACGGACAGTAGACAAGTCTTTAGAGCCTCCTAAAAAATAACGCATTGTCCGTCGGACGAGGATGGGGCCCATGGGCCTAAAGAAGACATGGGCCCATGGACGGTGGCGGTCGGGACATTATA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1395_LTR-Cassandra_52Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
318Start:
5530End:
5847Strand:
+>Contig1395_LTR-Cassandra_52
TGAAACATCCCGTTTTCTACTATATGTGTGGCATGATGAGAAGTTTAAGTGATTTTGATTTGGCTACCGATGTTGCCAAAGTGCTTTTATCTTTTCAATCAACCATCCTGGACAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGGTTGAACTGGAGTAGTACTAGGATGAGTGATCTACCGGAAGTGGATACTGCGTGAGTGAGGCCAAAACACGGAGAAGACGTTGTTGCGATTTGTAGGGATAGTAAACAAGTCTTTATTACTCTCGAGATAACGAACCGGCCGTCGGACTAGGGTGGAGACAATGAGCCTAGAGGGGACGTGGGG
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig140_LTR-Cassandra_53Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
88Start:
22425End:
22512Strand:
+>Contig140_LTR-Cassandra_53
TCCATAATCAAACGTGTTTGATTTGGAGTGATTTTATGATTGATAGCCTACATGGAAATTATTCTCAGTACTATGTGAGTGAGGACAA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1406_LTR-Cassandra_54Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
315Start:
9661End:
9975Strand:
+>Contig1406_LTR-Cassandra_54
TGTAACATTCTGATATCTGGTATATAGTGGTGCATGAGGAGAAGTTTAAAATAATTTATTTGGCTACCTATGTCAACAAAGTCAACTTATCTTTTCCGTCTACCATTCTTATAAAACTGCAGAGTTAAGCGTGTTTGGGATGGAGTAGTATTAGGATGTGTGACCTATCGGGAAGTGATTTCCGGTACCGTGTGAGTAAGGCTAAAACACGGGGAAAGATCAGATAGTGATTTGTAGGAACTCTAAACAATTCTTTAGAGCCTCTCGGGATTGCGCACCGATTGTCGGACGAGGGTGGGCCTACGGGCTGAGAGA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig141_LTR-Cassandra_55Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
343Start:
39449End:
39791Strand:
+>Contig141_LTR-Cassandra_55
TGTAACATCTTGATTTCTGATATATTGTGGTGCATTTCGAGAGTTTAAAGAATTGATTTGACTATCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTTTGTTACTTGTTATGAGAGAATTCTATCGTTAAGTATGCTTGGCCTGGAGTAGTATTAGGATATGTGACATATCGGGAAGTCATTTTCGGAATGTGTGAGTGAGGCCAAAACACAGGAAAAAAATCATGTGGTGATTTGTATGGACAATAAATAAGTCTTTAGAGCTTCCCGAGATAACGTATCGGTCGTCGGATGAGGATGTGCCCATAGACCAAGAGGCAGCACAGATAGTGGCAGTCGGGTAGCTAC
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig141_LTR-Cassandra_56Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
94Start:
39797End:
39890Strand:
+>Contig141_LTR-Cassandra_56
TGGTATTAGAGTCGAACCCTGATGAGTGTGGAGTCAAGTGGGCTCACACCCATCGAGGGTGACGGTCCTCGTTGTGTTCTGTGAGTGGGGATGA
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig141_LTR-Cassandra_57Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
307Start:
39892End:
40198Strand:
+>Contig141_LTR-Cassandra_57
TGTAACATCTCAGTTTCTGGTATAGTGGTGATGCATGTCGAGAGCTTAAAAGAATTGATTTGGATACCTATGTCACCAAAGTGCAGTTATCTTTTTGTCATTTGTCCTGAGAAAACTCCTGTTAAGGTGGCTCGGCTAGAGTAGTATTAGGATGAGTGAACTATAAGAAAATCATTATGGTCGACCGTGTGAGTGATGTCAAAACATCATATGATGATTTGTAAGAACAGTAAAACAACTTTAGAGTCTTCTGAAATAATTAGCCGCCGGCTGTCGGACAAGAGTGGAACCCAAAAAGGGCGTGAGG
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1415_LTR-Cassandra_58Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
139Start:
28420End:
28558Strand:
->Contig1415_LTR-Cassandra_58
TATAATGCCCCGACCGCCATAGTTCATGGGCACCCACACCTTCTCTCGACCCGTGGGCTCCACCCTCGTCTGGTGGTCGGTGCACTATCTCGGAAGATTCGAAAGATTTGTTTATTGTCCCTACAAATTATAATACGAT
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1426_LTR-Cassandra_59Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
269Start:
28486End:
28754Strand:
+>Contig1426_LTR-Cassandra_59
ATGTAGTGGTGCATGATGAAGAGGCTAAAGAAGAATTGATTGGCCTACCTATGTCACCAAACGTGCAGCTTATCTTTTATGTAACCAGTGGCCGTCAGAATACTCCACAGTAAGCGGCTTGGATGGATAGCACTACGATGCGGGTGACCTATCGGGAACATTGATGACAACTACCGGTTACCGTGTGAGTGAGGACCAACAACAACGGGAAACGATCATTGTGGTACGATTTGTAGCGTAGCAGTAAACCAAGGCGATTTAAGAGCCTC
Barbarea vulgaris (v1.0)
ID:
Contig1426_LTR-Cassandra_60Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CassandraLength:
333Start:
28982End:
29314Strand:
->Contig1426_LTR-Cassandra_60
CCCATGGGCCCACGTCCTCTCTAAGCCCATGGGCCCCACCCTCGTCCGACGGCCGATTAGTTATTTCGAGAGGCTCTAAAGACTTGTTTACTGTCCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTACAGTCCAAGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTCTCATCATGCACCACTATATACCAGAAACCGGGATGTTACA