ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig123_LTR-Cassandra_41 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra242226428226669+
Contig1242_LTR-Cassandra_42 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35023012650-
Contig1259_LTR-Cassandra_43 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1364955149686+
Contig1273_LTR-Cassandra_44 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35449865339-
Contig1273_LTR-Cassandra_45 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35654825837-
Contig1273_LTR-Cassandra_46 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra38459456328-
Contig1274_LTR-Cassandra_47 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra38190129392-
Contig1280_LTR-Cassandra_48 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1541877118924-
Contig1280_LTR-Cassandra_49 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1221894519066-
Contig1332_LTR-Cassandra_50 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2771383614112+
Contig1337_LTR-Cassandra_51 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3645092751290+
Contig1395_LTR-Cassandra_52 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31855305847+
Contig140_LTR-Cassandra_53 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra882242522512+
Contig1406_LTR-Cassandra_54 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31596619975+
Contig141_LTR-Cassandra_55 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3433944939791+
Contig141_LTR-Cassandra_56 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra943979739890+
Contig141_LTR-Cassandra_57 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3073989240198+
Contig1415_LTR-Cassandra_58 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1392842028558-
Contig1426_LTR-Cassandra_59 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2692848628754+
Contig1426_LTR-Cassandra_60 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3332898229314-

< 3 4 5 6 7 > Total 24


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig123_LTR-Cassandra_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

242

Start:

226428  

End:

226669

Strand:

+

>Contig123_LTR-Cassandra_41

TGTAACACTATGATTTCTCGTATATTGTGCTGCATTGGAAATTGATTTGGCTACCTATGCAACCAAAATACACTTATCGTTTTTGTGAATCATTATGACAGAACTGCAAGGTTAAAGTTCTTAAGTTGGAGCGATGGAAAGATGGGTGACCATCTGGAATAACAATTTTCAGTACCGTGTGTGTGAGAATAAAATATAGGAAAAGATATTGTGTTGATTTGTAGGGACAATACACATCTCTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1242_LTR-Cassandra_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

350

Start:

2301  

End:

2650

Strand:

-

>Contig1242_LTR-Cassandra_42

GTAAGCCCCACGCCCTCTCTAGGTCCGTGGTTCCCCACGTCCCCTCTAGGCTCATTGTCTCCACCCTAGTCCGACGGCCGGTTCGTTATCTCGAGAGTATATAAAGACTTGTTTACTATCCCTACAAATCGCAACAAGATCTTTCTCCGTGTTTTGGCCTCACTCACGCAGTATCACTTCCCGGTAGATCACTCATCCTAGTACTACTCCAGTTCAACCACGCTTAACTCTGGAGTTCTGTCAGGATGGTTGATTGAAAAGATAAAAGCACTTTGGCAACATCGGTAGCCAAATCAAATCACTTAAACTCTCATCATGCACTACCATATAGTAGAAACCGGGATGTTTCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1259_LTR-Cassandra_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

136

Start:

49551  

End:

49686

Strand:

+

>Contig1259_LTR-Cassandra_43

TGTAACATCCCGATTTTTGTTATATGATGGTGGAATGTAGTTGAATTTTAATATATTTGATTTGGCTACATATGTTACTAAAATGCATTTATATTTCCTGTCAGTTGTCTAGAAGAAACCAAGTTACGCATGCATG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1273_LTR-Cassandra_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

354

Start:

4986  

End:

5339

Strand:

-

>Contig1273_LTR-Cassandra_44

CCCGTGGGCCCCCACGTCCTCTTTAGGCCCATGGGCCCCACCCTCGTCCGACGGGGGACCCTCGTCCGACGGCCGGTTTGTTATCTCGAGAAAACTCTAAAGATTTGTTTACTGTCCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCCAGGCCAAGCACGCTTAACTGTGAAATTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAAGTAGCCAAATTAATTATCTTAAACCTCTCATCATGCACCACCATATACCAGAAATCGGGATGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1273_LTR-Cassandra_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

356

Start:

5482  

End:

5837

Strand:

-

>Contig1273_LTR-Cassandra_45

GCCCCACACCCTCTCTAGGCTCGTGGGCCTCCACGTCCTCTCTAGGCCCATGGGCCCAACCCTCATCTGTCGGCCGGTTTGTTATCTCAAGACAACTCTAAAGGTTTGTTTACTGTCCCTACAGATCACCACATGATCTTTCCCCGTGTTTTGACCTCACTCACACGGTACCGATAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCCAGCCCAGACACGCTTAAATCTGGAGTTCTGACCGGATGATTGACGGAAAAGATAAGTGCTCTTTGGGTAACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAACCTCTAATCATGCACCACCATATACCAGAAACCGGAATGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1273_LTR-Cassandra_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

384

Start:

5945  

End:

6328

Strand:

-

>Contig1273_LTR-Cassandra_46

TGTAACGCCCCGACCGCCACCGTCCGTGGGCCCCCACACCCTCTCTAGGTCCGTAGCATACCAGTCTTTTCTATTATCAAATGATATCTGTTTTATTTGCAGTGATTGTGTTATCTCGAGAAAACTCCAAAGATTTATTTACTGTCCCTATAAATCACCACATGATATTTTCCCGTGTTTTGGCCCCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGGTAGGTCAGCCATCCTAGTGCTATTCCAGTCCAAGCACGCTTAACTATGGAGTTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTCTCGTCATGCACCACCATATACCAGAAATCGGGATGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1274_LTR-Cassandra_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

381

Start:

9012  

End:

9392

Strand:

-

>Contig1274_LTR-Cassandra_47

AAGGCCCCGCAACCCACCCTTAATCTAGGCCCCATGGGCCCCCGCACGTTCTCCCTCAGGCCCCAATGGACCCCCACCCTCGTCCGACCGGCCGGTTTTGTTATTTTCGGGAGGGCTCTAAAAGACTTGTTTCACTGTTCCCTAGACAAATCACCAACATGATCTTTTCCCCCGTGTTTTGGCCTCACCTCCCCAGCACGGGTACCCAAAACAACAAACTTCCGCGGGTAGGTCACCCATCCTAAAGTGCTTACTTCCAAGCCGCAAAGCACCGCTTAAAAGACTGTTGGAGTTTCGACCCCGGGATGGTTGACCGGGGGAAAAGAAATAAAAGCTTGCACCTTTGGTGAACATAAGGTAAGCCCAAACATCAATTCTCTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1280_LTR-Cassandra_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

154

Start:

18771  

End:

18924

Strand:

-

>Contig1280_LTR-Cassandra_48

TGTAACGTCTTTACCGCCACAATCGGTGGATATTTACATTCTTTCGGTCCGTGGACTCTATCCTCATCCGACGGCTGGTGCGTTATTCCGAAAGATTTAAATTTTTTTTTTCTGTTTATATAAACCACCAAATGATCTTTCCTCATGTTGTTCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1280_LTR-Cassandra_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

122

Start:

18945  

End:

19066

Strand:

-

>Contig1280_LTR-Cassandra_49

TTCTTTTGGGACAAGTGGCGCCAAAGATAAATGCAATGTAGTAACATAGGTATTAGGTTGCCAAATCAATCTCTTAATCTTTCCTCATACATAACCATATTTAATGAAATTTGGGTGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1332_LTR-Cassandra_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

277

Start:

13836  

End:

14112

Strand:

+

>Contig1332_LTR-Cassandra_50

TGTAACATCCCAATTTCTGGTATATATGGTGGTGCATGATGAGAGCTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGGGCATTTATCTTTTCTGTCAACCACTGACAAAACTCCAGAGTTAAGCGTGATTTGGATGGAGTAGTAATATGATGGGTGACCTATTGGGATATTTCTGGTACCGTGTAAGTGAGGCCAAAACATGAGAAAATATCATGCGGTGATTTGTATGGACAGTAAACAAATCTTTAGAGCCTCTCGGGATAGCGCACTGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1337_LTR-Cassandra_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

364

Start:

50927  

End:

51290

Strand:

+

>Contig1337_LTR-Cassandra_51

TGTAACATTCCGATTTCTGGTATATTGTGGTGCATGATGAGAGGTTTAAGATATTTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATTTTTTCCGTCAACCATTCTGACAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTACTATGATGGTTGACCTACCGGGAAGTGTTTATCGGTATTCCGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGAAAAGATCATGTGGTGATTTGTACGGACAGTAGACAAGTCTTTAGAGCCTCCTAAAAAATAACGCATTGTCCGTCGGACGAGGATGGGGCCCATGGGCCTAAAGAAGACATGGGCCCATGGACGGTGGCGGTCGGGACATTATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1395_LTR-Cassandra_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

318

Start:

5530  

End:

5847

Strand:

+

>Contig1395_LTR-Cassandra_52

TGAAACATCCCGTTTTCTACTATATGTGTGGCATGATGAGAAGTTTAAGTGATTTTGATTTGGCTACCGATGTTGCCAAAGTGCTTTTATCTTTTCAATCAACCATCCTGGACAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGGTTGAACTGGAGTAGTACTAGGATGAGTGATCTACCGGAAGTGGATACTGCGTGAGTGAGGCCAAAACACGGAGAAGACGTTGTTGCGATTTGTAGGGATAGTAAACAAGTCTTTATTACTCTCGAGATAACGAACCGGCCGTCGGACTAGGGTGGAGACAATGAGCCTAGAGGGGACGTGGGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig140_LTR-Cassandra_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

88

Start:

22425  

End:

22512

Strand:

+

>Contig140_LTR-Cassandra_53

TCCATAATCAAACGTGTTTGATTTGGAGTGATTTTATGATTGATAGCCTACATGGAAATTATTCTCAGTACTATGTGAGTGAGGACAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1406_LTR-Cassandra_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

315

Start:

9661  

End:

9975

Strand:

+

>Contig1406_LTR-Cassandra_54

TGTAACATTCTGATATCTGGTATATAGTGGTGCATGAGGAGAAGTTTAAAATAATTTATTTGGCTACCTATGTCAACAAAGTCAACTTATCTTTTCCGTCTACCATTCTTATAAAACTGCAGAGTTAAGCGTGTTTGGGATGGAGTAGTATTAGGATGTGTGACCTATCGGGAAGTGATTTCCGGTACCGTGTGAGTAAGGCTAAAACACGGGGAAAGATCAGATAGTGATTTGTAGGAACTCTAAACAATTCTTTAGAGCCTCTCGGGATTGCGCACCGATTGTCGGACGAGGGTGGGCCTACGGGCTGAGAGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig141_LTR-Cassandra_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

343

Start:

39449  

End:

39791

Strand:

+

>Contig141_LTR-Cassandra_55

TGTAACATCTTGATTTCTGATATATTGTGGTGCATTTCGAGAGTTTAAAGAATTGATTTGACTATCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTTTGTTACTTGTTATGAGAGAATTCTATCGTTAAGTATGCTTGGCCTGGAGTAGTATTAGGATATGTGACATATCGGGAAGTCATTTTCGGAATGTGTGAGTGAGGCCAAAACACAGGAAAAAAATCATGTGGTGATTTGTATGGACAATAAATAAGTCTTTAGAGCTTCCCGAGATAACGTATCGGTCGTCGGATGAGGATGTGCCCATAGACCAAGAGGCAGCACAGATAGTGGCAGTCGGGTAGCTAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig141_LTR-Cassandra_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

94

Start:

39797  

End:

39890

Strand:

+

>Contig141_LTR-Cassandra_56

TGGTATTAGAGTCGAACCCTGATGAGTGTGGAGTCAAGTGGGCTCACACCCATCGAGGGTGACGGTCCTCGTTGTGTTCTGTGAGTGGGGATGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig141_LTR-Cassandra_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

307

Start:

39892  

End:

40198

Strand:

+

>Contig141_LTR-Cassandra_57

TGTAACATCTCAGTTTCTGGTATAGTGGTGATGCATGTCGAGAGCTTAAAAGAATTGATTTGGATACCTATGTCACCAAAGTGCAGTTATCTTTTTGTCATTTGTCCTGAGAAAACTCCTGTTAAGGTGGCTCGGCTAGAGTAGTATTAGGATGAGTGAACTATAAGAAAATCATTATGGTCGACCGTGTGAGTGATGTCAAAACATCATATGATGATTTGTAAGAACAGTAAAACAACTTTAGAGTCTTCTGAAATAATTAGCCGCCGGCTGTCGGACAAGAGTGGAACCCAAAAAGGGCGTGAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1415_LTR-Cassandra_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

139

Start:

28420  

End:

28558

Strand:

-

>Contig1415_LTR-Cassandra_58

TATAATGCCCCGACCGCCATAGTTCATGGGCACCCACACCTTCTCTCGACCCGTGGGCTCCACCCTCGTCTGGTGGTCGGTGCACTATCTCGGAAGATTCGAAAGATTTGTTTATTGTCCCTACAAATTATAATACGAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1426_LTR-Cassandra_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

269

Start:

28486  

End:

28754

Strand:

+

>Contig1426_LTR-Cassandra_59

ATGTAGTGGTGCATGATGAAGAGGCTAAAGAAGAATTGATTGGCCTACCTATGTCACCAAACGTGCAGCTTATCTTTTATGTAACCAGTGGCCGTCAGAATACTCCACAGTAAGCGGCTTGGATGGATAGCACTACGATGCGGGTGACCTATCGGGAACATTGATGACAACTACCGGTTACCGTGTGAGTGAGGACCAACAACAACGGGAAACGATCATTGTGGTACGATTTGTAGCGTAGCAGTAAACCAAGGCGATTTAAGAGCCTC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1426_LTR-Cassandra_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

28982  

End:

29314

Strand:

-

>Contig1426_LTR-Cassandra_60

CCCATGGGCCCACGTCCTCTCTAAGCCCATGGGCCCCACCCTCGTCCGACGGCCGATTAGTTATTTCGAGAGGCTCTAAAGACTTGTTTACTGTCCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTACAGTCCAAGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTGACCGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTCTCATCATGCACCACTATATACCAGAAACCGGGATGTTACA