ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig1113_LTR-Cassandra_21 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1084450544612-
Contig1113_LTR-Cassandra_22 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3494461644964-
Contig1113_LTR-Cassandra_23 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3534505945411-
Contig1113_LTR-Cassandra_24 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1064541345518-
Contig1113_LTR-Cassandra_25 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2714552445794-
Contig1117_LTR-Cassandra_26 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3024218542486+
Contig1124_LTR-Cassandra_27 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3227371874039+
Contig1124_LTR-Cassandra_28 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra917404074130+
Contig1124_LTR-Cassandra_29 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3577413274488+
Contig1139_LTR-Cassandra_30 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3303094031269+
Contig1142_LTR-Cassandra_31 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9219502041+
Contig1166_LTR-Cassandra_32 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra228466693+
Contig1170_LTR-Cassandra_33 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2462151221757+
Contig1170_LTR-Cassandra_34 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2392176622004+
Contig1196_LTR-Cassandra_35 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3261310513430+
Contig1201_LTR-Cassandra_36 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3461169912044+
Contig1220_LTR-Cassandra_37 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2442628126524-
Contig123_LTR-Cassandra_38 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra83217295217377+
Contig123_LTR-Cassandra_39 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra103226089226191+
Contig123_LTR-Cassandra_40 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra127226302226428+

< 2 3 4 5 6 > Total 24


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Cassandra_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

108

Start:

44505  

End:

44612

Strand:

-

>Contig1113_LTR-Cassandra_21

TCACCTCCACTCATAGGGCGCAACGTCCTCGTGGCGCATCAGGACCATCACTCCCAATGGTGTGAGCCCACTTGACACCACACTCATCTGTGTTTGGCTCTGTTACTA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Cassandra_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

44616  

End:

44964

Strand:

-

>Contig1113_LTR-Cassandra_22

TGTATCGCTCTGACAACCATCGTCTCTTGGCACCATGGTCCTCTCTCGGCCCGTTGGCCCCATCCTCGTGCGACGGTTAGTGCCCTACTCCGGGAGGCTTGAAAGACTTGTTAATGTCTCTACAAATTACCACTTGATCTTTTCTCATTTATTAGCTTCACTCATACGATATTGGAAATGGCTTCCCGATAGATCGCTCATCCTTATTTGGCTCTACCTCAAGTACACTTAACTCTTGAGTGATCAGTGGCAGAAAAGATAAGTTCAATTTGGTGACATATGTATCCAAATCAATTCTTTTTAAGTCTCTTCACATGCACCAACATATATAAGAAATCCGGATGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Cassandra_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

353

Start:

45059  

End:

45411

Strand:

-

>Contig1113_LTR-Cassandra_23

TGTAACACCCCGACCACCACCAACCATGTGCATCCACCGTCTCTTGACCCGTGGGCCCCACCCTTGTCCTGCGACCAATGCGCTACTGCGGTAGGCTCTAAAGACTTGTTACTATCCCTAAAAATTACCACATGATCTTTTATGTGTTTTGTTTTCACTCGCACGGTATCAGAAATCACTTTATGATATGTCTTATATCCTAATACTACTTCAACCCAAGCACACTTAACTCTGAAGTTCTCTCTGAACAAGTGACAGAAAAGATAAATGCAATTTGGTAACATAGGTAGCCAAATCATATCACTTAAGCTCTTATCATGAACCACTATATTTTCTGAAATTGGGGTATTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Cassandra_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

106

Start:

45413  

End:

45518

Strand:

-

>Contig1113_LTR-Cassandra_24

TCACCTCCACTAACAAATCGGAATGTCCTAGTTGCGTACCAAGACCACCACCCCCAATGGTGTGAACCCACATCTCTCCATAATCAACTGAGTTTGGGTCTGTTAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Cassandra_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

271

Start:

45524  

End:

45794

Strand:

-

>Contig1113_LTR-Cassandra_25

TGTAATGTCCCGAACGGCACCGTCCATGGGCACCCACACCCTCTCTCGGTCTGTGGACCTCATCCTTGTTTGACAGCCGATGCACTATTATGGGTGGCTCAAAAAACTAATCACTATCCCTACAAATCACCACATGATTTTTCTCCGTGTTTTGTCCTCACTTGCATGGTACCAAAAATCACTTCCTAATAAGTCATCCATTCTAGAATTACGCTAGCCTAACCACACTTAACTTTGAAGTTCTCTCTAGATAAGTGATGAAAAAGATAAG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1117_LTR-Cassandra_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

302

Start:

42185  

End:

42486

Strand:

+

>Contig1117_LTR-Cassandra_26

TGATTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACTATCCTGACAGAACTTCAGAGTTAAGCGTTCTTGGGATGGAGTAGTATTAGGATGTATGACCTATCGGAAAGTCATTTCCGGTACCGTGTGTACAAGGCCAAAACACGGAGAAATATCATATGGTGATTTTTAGGGACAATAAACAAGTCTTTAGAGGCTCTTAGGATAACGCAGCGGCCGTTGCACGAGGATGGAGCCCACATGCCAAGAGAGGGTGTGGGATCCCACAGACGGGGATGGCCACGGCCATTAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1124_LTR-Cassandra_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

322

Start:

73718  

End:

74039

Strand:

+

>Contig1124_LTR-Cassandra_27

GATCCATGTGGAGCACTTAAAATATTTTTTTTGGTTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATATTGGTTGTCACTAATCCAGAGAAAACTCCACATTTAAGCGTGCTTGAGCTTGAGGAATTTAAATATAGGTGCAATACCTGAAAATTATTTTTGATACCGTGCGAGTGAGGCCAAAACATTGAAAAATATAATATGTTGATTTGTAGGGATATTAACAAGTCTTTCGAGCCTCCAGGAGTAGTGCACCGACCATTGGACGTGGGTCTACAAGCCAAGAGTGGACATGGGAGTCCATAGACGATAGGGGTTAATGCGTTGCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1124_LTR-Cassandra_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

91

Start:

74040  

End:

74130

Strand:

+

>Contig1124_LTR-Cassandra_28

AGTGGTATCAGAGCCGAACCTAGATGAATCATCATCGAGGGTGCCGGTCTTGGTACGCAATGAGGACGTTTCAATCTGTTAGTGGGGGTGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1124_LTR-Cassandra_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

357

Start:

74132  

End:

74488

Strand:

+

>Contig1124_LTR-Cassandra_29

TATAACACCCTGAACTCTAAAAGAATGGTGATGCATGAAGAGAGCTTAACATTTTGGATTTGCCTACTTACGTCACCAAAATGTTCTTATCTTTTTTCGTCACTTGTCTAGAGAGAATTCCAGAGTTAAGCAGGCTTGAGGTGGGCCAATTTAAGGATTGGTGAATTATCGGGAAGTGATGTTCGATACAGGGCAAGTGAGGCAAAACAACAAGAAAGATCATGTGGTGCTTTGTAGGGATAATAATTAGTCTTTCAAACCTTCCGGAGTAGCGTACTTACCATCGAACAAGGATGGGATCCACATGCCGAGAGGGAACATGGTAGTCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1139_LTR-Cassandra_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

330

Start:

30940  

End:

31269

Strand:

+

>Contig1139_LTR-Cassandra_30

TGTGACATCCCAAAATCTGGTATATGGTAGTGCATGAAAAGAAACTTAAAATAATTGATTTGGCTATCTATGTTACGAAGATGCATTTATATTTTTCGTCAACCATTCTGACTTAACTCAAGAATTAAGCGTGTTTGGGCTGTAAAAACACTATGATGTGTGTGTCTACTGGAAAATGATTATTGGTACCGTGTGAGTGAGACCAAAACACGGGAAATATCATGCGGTGATTTGTAGGGACAATAAACAAGTTTTTAGAGCCTATTGAGATTACAAACCAGCCGTCAGACGAGGATGGGCCATGGACCTAGAGAGGATGTGGGGGCCCAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1142_LTR-Cassandra_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

92

Start:

1950  

End:

2041

Strand:

+

>Contig1142_LTR-Cassandra_31

TGTAATATTTTGATTTTTAGAAAATGGTGGTTCACAGAGAGAGTTTAAAATAATTGATTTAGCTATAATATTATCTAAGTACATTTATCTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1166_LTR-Cassandra_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

228

Start:

466  

End:

693

Strand:

+

>Contig1166_LTR-Cassandra_32

TGGTGGGCATGATTTGGGAGAGTGCTTAACGAGCGATTGATTCTGGCATCTACTGTCACCAATGTTGCACCTTATCTTTTCCGTCACCATCCCGGGTCAGAATTCCACAGTTAAGCTGGCTTGGGTTGGAGTAGCATTAGGGATTGGGCTGAAGCCTACCGAGAAGCTGATTTGTCACGGTACCGGTGGTGAGTGAGGACTAAAACACGGGGGAAAGGATCATGTTGT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1170_LTR-Cassandra_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

246

Start:

21512  

End:

21757

Strand:

+

>Contig1170_LTR-Cassandra_33

TGTAACATCCCGATTTCTGGTATATGGTGGTGCATGATGAGAGGCTTAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACCATCCGGTCAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGAAACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAGATTATGTGGTGATTTGTAGGGATAGTAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1170_LTR-Cassandra_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

239

Start:

21766  

End:

22004

Strand:

+

>Contig1170_LTR-Cassandra_34

AGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGAAACCGTGTGAGTGAAGCCAAAACACGGGGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGATAGTAAACAAGTCTTTCGAGCAACTCGAGATAACGAACCGGCCGTCGGACGAGGGTGGGGCCCATGGGCCTAGAGAGAACGTGGGAGCCCACAGGCCTAGAGAGGTCGTGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1196_LTR-Cassandra_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

326

Start:

13105  

End:

13430

Strand:

+

>Contig1196_LTR-Cassandra_35

TGTAACATCCCGATTTGTGGTATATGGTGGCGAATGATGAGAGGTTAAAACATTTGATTTTGCTACCTATGTCACCAAAGTACACTTATCTTTTCCGTCAACCATCCGGTCAGAACTCTAAAGTTAAGCGTGCTTGGACTGGAGTAACACTAGGATGGGTGACCTACCAGGAAGTGATTGTCAGTACTGTGTGTGTTAGGCCAAAACACGGGGAAAGATCATGTGATGATTTGTATGAACAGTAAACCGGCCTTTGGACGAGGATGGGACCCATGGGCCTAGAGAGGGTGTGGGGACCCACGGACGGTGGCGGTCGGAGCGTTATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1201_LTR-Cassandra_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

346

Start:

11699  

End:

12044

Strand:

+

>Contig1201_LTR-Cassandra_36

TGTAACATCCCGGTTTCTGGTATATGGTGGTGCATGATGAGAGACTTAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACTAAAGTGCACTTATCTTTTCTGTCAACCATCTCGTCTGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCATTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGAAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGACAATAAACAAGTCTTTAAAGCCTCTCGAAATAATAAACCGGCCGTCGGACGAGAGTGGGGCCCATGGGTCTAGAGAGGGTGTGGGTCTCACGGGCCTAGAGAGGGT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1220_LTR-Cassandra_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

244

Start:

26281  

End:

26524

Strand:

-

>Contig1220_LTR-Cassandra_37

GCCCCACTGCCTTCTCTAGGCATGTGGGTCCACGCTCTCGTCTAGGCCCGTGGTGCCCGTTCCCTTCCCTCCGACGGACGCTGCGTTATTTTTAAGATGGTTTAAAAAACTTGTTTATTGTCCGTACATCCCCACATGATCTGTTCCCCGTGTTTTGGCCTCAACTCAACACGGTACCGGAAATGACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTAGTACCAGTGCAGCCAAAAACACATTTTAACTATG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig123_LTR-Cassandra_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

83

Start:

217295  

End:

217377

Strand:

+

>Contig123_LTR-Cassandra_38

TGGTATCAGAGCCAAAGTCAGACAATGTAGAGTCATGTTCATACTGTTGGGATGACAGTCTTGGTATGTAACGAAGACGGTGC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig123_LTR-Cassandra_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

103

Start:

226089  

End:

226191

Strand:

+

>Contig123_LTR-Cassandra_39

CACGAAAGTGTAATTATCTTTTCCATCAATCATCTTGACAGAACTAAATGATTAAGAATACTTGAACTAGAGGGAAGGAAGGATAGGTTAATGGAAAGTGATT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig123_LTR-Cassandra_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

127

Start:

226302  

End:

226428

Strand:

+

>Contig123_LTR-Cassandra_40

GTATCTAAGCTGAACCCAGATAAGTGTGAAGACATTGGGCTCACACCATTTGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGTTTCGTACGTAACGAGAATGTTGAGCTCTGTAAATGGGATTAAT