ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig1458_LTR-Cassandra_61 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33156655995-
Contig1465_LTR-Cassandra_62 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32954775805+
Contig1465_LTR-Cassandra_63 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra23484638696+
Contig1465_LTR-Cassandra_64 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra10986978805+
Contig1465_LTR-Cassandra_65 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33388119143+
Contig1469_LTR-Cassandra_66 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1441164411787-
Contig1470_LTR-Cassandra_67 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2782277223049+
Contig1470_LTR-Cassandra_68 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1102305023159+
Contig1470_LTR-Cassandra_69 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2042316123364+
Contig1508_LTR-Cassandra_70 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra335306640+
Contig1508_LTR-Cassandra_71 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3347771110+
Contig1508_LTR-Cassandra_72 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3242210322426+
Contig152_LTR-Cassandra_73 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3644117641539-
Contig1524_LTR-Cassandra_74 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33818002137+
Contig1539_LTR-Cassandra_75 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3242602226345-
Contig1546_LTR-Cassandra_76 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1141273612849-
Contig1550_LTR-Cassandra_77 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3236070161023+
Contig1576_LTR-Cassandra_78 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra280215494-
Contig1588_LTR-Cassandra_79 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra953459134685-
Contig1588_LTR-Cassandra_80 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2923469134982-

< 4 5 6 7 8 > Total 24


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1458_LTR-Cassandra_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

331

Start:

5665  

End:

5995

Strand:

-

>Contig1458_LTR-Cassandra_61

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1465_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

329

Start:

5477  

End:

5805

Strand:

+

>Contig1465_LTR-Cassandra_62

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1465_LTR-Cassandra_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

234

Start:

8463  

End:

8696

Strand:

+

>Contig1465_LTR-Cassandra_63

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1465_LTR-Cassandra_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

109

Start:

8697  

End:

8805

Strand:

+

>Contig1465_LTR-Cassandra_64

AGTGGTATCAGAGCCAAACCCAGATGAGTGTAGAGACATGTGGGCTAATACCATTGATGGTGCCGGTTTGGTACACAATGAGGACGTTGCGATCTCTTAGTGGGGGTGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1465_LTR-Cassandra_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

8811  

End:

9143

Strand:

+

>Contig1465_LTR-Cassandra_65

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1469_LTR-Cassandra_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

144

Start:

11644  

End:

11787

Strand:

-

>Contig1469_LTR-Cassandra_66

AAGGTACCTATCTTGAAAGCGCTCTAACACAAGCACACATACATTTTTAAATTCTCTCGAAATGAGTAATACAAAAAAGTGCATTCTGATAATATTAGATAATCAAATCAATACTTAAAATCTTTCACATGTACTTCAAAATTC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1470_LTR-Cassandra_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

278

Start:

22772  

End:

23049

Strand:

+

>Contig1470_LTR-Cassandra_67

AAAGTGTTTTTATCTTAGCAATCACTTATCGAGAGAGAACTCCTGAACTAAGCAGGCTTAAGCTTCAGTAATTTAAAGATGGGTAGCCTACTAGGAAATGATTTTTCATACCGTGCGGGTTAGGCCAAAAAACTGAAAAGATCATGTAGTGATTTGTAGAGATAGTAATAAGTTTTTTGAGCCTTCTGGAGTAGTGCACCAGCCGTCGGACAAGGGTGGGATCTATAGGCCAAGAGATGACTTGGAAGCCCATAGATGATAGCAGACGAGGCGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1470_LTR-Cassandra_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

110

Start:

23050  

End:

23159

Strand:

+

>Contig1470_LTR-Cassandra_68

AATGGTATCAGAGCCAAACCCATATGATTGTATAGACATGTGGGCTCACACCATCGAGTCTGCCGGTCTGGGTAAGCAATGAGGACGTTACGATCTTTTAGTGGGGGTAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1470_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

204

Start:

23161  

End:

23364

Strand:

+

>Contig1470_LTR-Cassandra_69

TATAACACCCTGAATTCTAAAGAATGTTGGTCCATGAGAAGCGCTTAAGATATTTTGTTTGCCTACTAATGTCACTAAAGTGTAATTATATTTTTTTCATCTCTTCTTCAGATAGAACTCCAAAGTCAAGCATGCTTGAGGTGGATAAATATTTTAAGGTTATATGACATATAGAGAAGTAATTTTTGGTACACTGAAAGTGAG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1508_LTR-Cassandra_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

335

Start:

306  

End:

640

Strand:

+

>Contig1508_LTR-Cassandra_70

GGTATATGGTGGTGCATGATGAGAGGTTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACCATCCGGTCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTTTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAAATCATGTGGTGATTTGTAGGGACAGTAAACAAGTCTTTAGAGCCTCTCAAGATAACAAACCGGCCGTCGGACGAAGGTGGGGCCCATGGACCTAGAGAGGGCGTGGGGCTCACGGACCTAGAGAGGGTGTGGGAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1508_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

777  

End:

1110

Strand:

+

>Contig1508_LTR-Cassandra_71

TGTAACATCCCAGTTTCTGGTATATGGGGGTGCATGATGAGAGGTTTAAGAGAATTGACTGGACTACTTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACCATCTGATCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTAGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTGATTATCGGTACCGTGTGAGTGAGACCAAAACACGGAAAAATATCATGTAGTGATTTGTAGGGACAGTAAACATGTCTTTAGAGCCTCTCGAGATAACGAACTGACCGTCGGACGAGGGTGGAGCCCATGGGCTTAGAGAGGGCGTGGAGCTCACGGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1508_LTR-Cassandra_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

324

Start:

22103  

End:

22426

Strand:

+

>Contig1508_LTR-Cassandra_72

TGTAACATCTCGGTTTCTGGTATATGGAGGTGCATGATGAGAGGTTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACCATCCGGTCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTTTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAAATCATGTGGTGATTTGTAGGGACAGTAAACAAGTCTTTAGAGCCTCTCAAGATAACAAACCGGCCGTCGGACGAAGGTGGGGCCCATGGACCTAGAGAGGGCGTGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig152_LTR-Cassandra_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

364

Start:

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End:

41539

Strand:

-

>Contig152_LTR-Cassandra_73

TGTAATTCCCTGAACGCCACCGTCCATGGACCCCCACACCCTCTCTCGGTCCATGGTCCCCATCCTCGTCTGACGGTCATTGCGCTATCATGAGAAGTTTGAAAGACTTTTTATTATCCCTAAAAATCACCACATGACCCACATGACTTCTCCCCCTTTTTTGGCCTCACTAGCACCGTATAAAAAAATACTTCTCGATAGATCACATATCCTTAAACTGCCAAGCTTAAGCACACTTAACTTTATAGTTCTCTTTAGAAAAGTGACAAGAAATATAAGTGCAATTTGGTGACATAGATATCCAAATTAATTCTTTTAAACTCTCCACATGCACCACCATATACCAAAAGTTCGGGGTGTTATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1524_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

338

Start:

1800  

End:

2137

Strand:

+

>Contig1524_LTR-Cassandra_74

TGTAACATCTCGATTCCTAGTATATGGTGGTGCATTATGAGAGCTTAAGAGGTTTGATTTGGGTATCTATGTTATCAAAGTGCACGTATCTTCTTTTGTCACTTGTCCTAAGAGAACTTCAGAGTTAAGCGTGTTTGGACTATAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTATCGGGAAGTCATTTCCGGTACCGTATGAGTGAGGTTAAAACACGGGGAAAGATCATGCGGTGATTTGTAGGGACACTAAAAGTCGTTTGAGCCTCCTAAAAATAATGCACCGCCCGTCAGACGAGGATGGAGTCCACATGCCTAGAGAGGGTGTGGGGGCTCAGGGACGGT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1539_LTR-Cassandra_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

324

Start:

26022  

End:

26345

Strand:

-

>Contig1539_LTR-Cassandra_75

GTGGGCCCCCATTCCCTCTCTAGGCCCGTGGGTCCCATCCTCATCCGACGGACGGTACGTTATTTTTAGGAGACTCGAAAGACTTGTTTACTATCCCTATAAATCACCACATGATATTTTCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTACCGACAATCACTTCCTGGTAGGTCACCCATCCTAGTGCTACTCCATCCTAAGCACGCTTATGGAGTTCTGTCAGGATGGTTGACGGAAAAGATAAGTGCACTTTGGTAACATATGTAGCTAAATCAAATCTCTAAAGCTCTCATCATGCACCGCCACCAGAAATCGAGATGTTACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1546_LTR-Cassandra_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

114

Start:

12736  

End:

12849

Strand:

-

>Contig1546_LTR-Cassandra_76

GTGCGTTATTTTTAGAAAACTCGAAACACTTCTTTACAGTCCTTACAAATATGACATTTCTCCGTGTTTTGGCCTTATTCATACGGTACCGATAATCACTTCCTGATAGATCAC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1550_LTR-Cassandra_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

323

Start:

60701  

End:

61023

Strand:

+

>Contig1550_LTR-Cassandra_77

GAGAGGCTTAAGAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCAACCATCCGGTCAGAACTCCACAGTTAAGCGTGTTTGAGCTGGAGTAGCACTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCGTGTGAGTGAGGCCAAAACACGGGGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGACGAGGGTGGGGCCCATGGGCCTTTTAGAGCCTCTAAAAATAACAAACCGGCCGTCGGACGAGGGTGGGGCCCATGGGCCTAAAGAGGACGTGGGGCTCACGGGCCTAGAGAGGGTGTGGGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1576_LTR-Cassandra_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

280

Start:

215  

End:

494

Strand:

-

>Contig1576_LTR-Cassandra_78

CTTGTCCGACGATCGGTCTCGCTACTCCACAATACTCGAAGAACATATTACTTTTCTTACAAATCACCACAAGAATTTTCCATGTGTTTTGTCATTACTCACACAGTTTCAAAATTCCCTTCCTGGTATGTCATCCATCCTCAATTTCTCCAACTTAATAAGACTTAATTCTAGAGTTTTCTATGTGAATGCAAGTGCACTTTGGTGACGTAGGTAGTAAAGTAAAATATCTTAAGCATTTTAAATACAGAACCATATTTCTAGAAATCAGGGAGGTATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1588_LTR-Cassandra_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

95

Start:

34591  

End:

34685

Strand:

-

>Contig1588_LTR-Cassandra_79

CAGAGCGCAACATCCTTGTTGCGCACCAGGACCTTCACCCCCGGTGGTGTGAGCCCACTGGACTCCACATTCATTTGGGTTCGTCTCTGATACCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1588_LTR-Cassandra_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

292

Start:

34691  

End:

34982

Strand:

-

>Contig1588_LTR-Cassandra_80

TAATGCCTCGACCGCCAGCGTCTGTGACCTCGGTCTGTGAGCCTCCACGCCCTCTCTCGGCCTGTGGGCCCCACCCTCGTCTGATGGCCGATGCGTTATCCCGAGAGGCTCTAAAGACTTGTTTCTAGGTCACCTATCCTAGTACTATTCCGGCCCAAGCACGCTTAACTCCGGACTTCTGTCAGGATGGTTGATGGAAAAGATAAGTGCAATTTGTTGACATAGGTAGCCAAATCAATTCTTCTAAACCTCTCCCAATGCACCACCATATACCAGAAGTCGGGATGTTACA