Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_41Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1455Start:
779079End:
780533Strand:
+>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_41
AAAAAACAAAAGAATCATTAGAAACattaattataaaggagaaaatcacaaaattaaacaaattgtttgaagaacaactttgttcagatttaccaactgccttctgggataaaaaacaacacattgttgatctaccctatgaagagaaatttgatgaaagagaaattcctacaaaggctcgaccaattcagatgaactctgaattagaaagtcattgtaagaaaaaaatTTCAGAACTTCTAAACAAAAAATTAATTTCAAAATCAAGATCTCCATGGTTTTGTGCAGCTTTCTATGTGAATAAAAATTCTGAAATAGAAAGAGGAACTCCGAGActtgtaataaattacaaacctttaaattcagcattaaAATGGATTAGATATCCAATACCAAATAAAAAAGATCTTCTTCAAAAACTGTATTCTGCTCACATATTTTCAAAGTTCGATTTAAAATCAAGATTTTGGTAAATCTAAATATCTGAAAATGATCGATACAAAACAGCATTTACTGTTCCTTTTGGGcaataccaatggaacgtaatgccttttggtttgaaaaatgcaccttcagaatttcaaagaatcatgaatgacatattctcagaatattcaaaatttgtatagtttatattgatgatatacttatcttttcaaaCTCTATTGACGAACATTTCAAACATCTAAAAACGTTCTACTATGTTGCACAAAAAAATGGACTTGTTATTTCAAAAACAAAAATGTCCTTATTCCAAACTAAaattagatttcttggtcattatatatccaaaggtatgataaaaccaatagaaaggtcaatagagtttgccaataaattttctgacaaactcttagacaaaacccaattacaaaggttcctaggaagccttaattacgtcctagatttttgtccaattatcaatagaatagccagaccattacatgaccgtttaaagaaaaacccaaccccttggacagacgagtataccgctatagTTCAACAAATTAAAAAACAAGTCTTAGAAATCTCGTGTCTGCATATAGCAGACCCGAATTTAACAAAAATTATAGAAACAGACGCCTCTGATATAGGATATGGGGGTATTCTGAAAAAAAAAAAACAAATGGTCGTGAAAATATAAtacaatttacTTCTGCTCATTGGAATGAAATCCAAAAGAATTATTCAACTATTAAAAAAGAAATATTAAGTATAGTTCTATGTATACAAAAATTTCAAAGTGATCTTTTAAAccaaaatttttTACTAAGAATTGATTGTAAAAGCGCCAAAGATGTTTTACAAAAAGATTTTAAAAATCTTGCTTCTAAACAAATTTTTGTCCGATGGCAGGCATTACTAAGTATTTTCGATTTTGATATTGAatatattaaaGGAGAAACAAATTTTATTCCAGATTTCTTGACTCGAGAATTTGTCCAAAACAGGTAC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_42Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
243Start:
783483End:
783725Strand:
+>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_42
TTTGAAACAATTCATTTAttttcataacaTGCTTTACAAAGACATAGAGAAAAGAATTTCAAATATATACATATTGTTTTTGTCCAAGTCGCTATTAAACCACTTTCAAAAGAAGGTCTTAACACCTCAATACTAGTTATCTTAAGAGATACTAGATTTAAGTTATTTGAAGATTCTTTACTTAGCTCTATAGAATCAAGTTTATGTgctgatccaatatcttttgattgctatccaaatttt
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_43Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
217Start:
785588End:
785804Strand:
+>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_43
aacaaaatgcCGTAGCAACCCTAGTCTTAGCTATAACTCTTCGTTTCATAGGAGATCCTTTAGTCTTTAGAGATAAAAACGCAGAACTTCTTTCAAATCTTAAATgtaaaaaactaAGTGATTTCCAATGGTATAAAAACACTTTCCTTACTAGAATCTTACTCCGACAAGATTCAAACCAATCTTTTTGGAAAGAAAAATTTATAGCAGGACTCCC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_44Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1438Start:
1148157End:
1149594Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_44
GTACCTGTTTTGGAGAAATTCTCAAGTCAATAAATTTGGAATAAAATTTGTTTCTTCTTTAATATATTCAATATCAAAATGGAAAATACTTAGTAATGCCTGTCATCGGGCAAAAATTTGTTTAGAAGCATGATTTTAAACATCATTTTGTAAAACATCTTTGACGCTTTTACAATCAATTCTTAGTAAAAacttttggttTAAAAGATCACTTTGAAATTTTTGTATCCATAGAACTATACTTAATATTTCTTTTGGGTTTCATTCCAATGAGCAGAAGTAAATTGTATTATATTCTCACGACCATTTATTTTTTTTTGTTTCAGAATACCCCCGTATCCTATATCAGATGCGTCTATTTCTACAATTTTTGCTAAATTCGGGTCTGATATATGCAGACACGGGATTTCTAAGACTTGTTTTTTAATTTGTTGACCTAGAGCGGTATGCTCGTCTGTCCAAGGAGTTGAGTTTTTCTTTAAATGGTCATGTAATGGTCTGGCTATTCTATTGATATTTGGACAAAAATCTAGGacataattaagacttcttaggaacctttgtaattgggttttgtctaagagtttgtcagaaaatttattggcaaactcTAATGACCTTTCTATTGGTTTTATCATACCTTTGGATATATAATGACCAATAAATCTAATTTTAGTTTGGAACAAGGCCATTTTTGTTTTTGAAATAACAAGTCCATTTTTTCGTGCCACATAGTAAAACGTTTTTAGATGTTTGAAATGTTCGTGAATAGAGTTTGAAAAGATAAGTATATCATCAATATAAACTATACAAAATtttgaatattcTGAGAATATGTTATTCATGATTCTTTGAAATTCTGAAGGTGCATTTTTCTAACCAAAAGACATTACGTTCCATTGGTATTGCCCAAAAGGAACAATAAATGCTGTTTTGTATCGATcattttcagatATTTGGATTTGCCAAAATCCTAATTTTAAATCGAACTTTGAGAATATGTGAGCAGAATGCAGTTTTTGAAAAAGATCTTTCTTTTTATTTGGTATTGGATATCTAATCCATTTTaatgctgaatTTAAAGGCTTGTAATTTATTACAAGTCTCGGAGTTTCTCTTTCTATTTTGGAATTTTTTTTCACATAGAAACCAGCACTAGACCATGGAGATCTTGATTTTGAAATTAattttttgttTAGAAGTTCTGAAATTTCTTTCTTACAATTACTTTCTAATTCAGAGTTCATCTTAATTGGTCGAGCCTTTGTAAGAATTTCTCTTTCATCAAATTTCTCTTCATagggtagatcaacaatgtgttgttttctatcccagaagacagttggtaaatctaaacaaagttgttcttcaaacaatttgtttaattttgtgattttctcttttataattaatatttcTAATGATTCTTTTGTTTTTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_45Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
218Start:
1151144End:
1151361Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_45
TGGAAGTCCTGCAAGAAATTTTTCTTTCCAAAATGGTTGGTTTGAATCTTGTCGGAGTAAGACCCTAGTGAGAAATGTGTTTTTGTACCATTGGAAATCACTTAGTTTTTTACATTTAAGATTTGAaagaagttttGCGTTTTTATCTCTAAGGACTGAAGGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATTGCTAAGACTAGGGTTGCTACAGCATTTTGTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_46Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
169Start:
1151452End:
1151620Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_46
AGTTATCCCACCATCCTATTAATTGTCCGAAAAATCCGGCTATAAGGAGCTCAGCtacggttttaTCTTCATTTCCTATTTGTGTTCTATAAGCGTTTGCAGTCATAGTCATTTTTTGAAAGAAATTTAGGATATTATATTCAGATATACCATCAATATTCCAATCATA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_47Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1456Start:
2098640End:
2100095Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_47
GTACCTGTTTTGGAGAAATTCTCGAGTCAAGAAATCCGGAATAAAATttgtttctcctttaatatattctatatcaaaatcaaaaatacttagtaatgcttgccaacaggcaaaaaTTTGTTTTGAAGCAAGATTTTTAACATCCTTTTGTAAAACATCTTTAGCGTTTTTACAATCAATTCTTAATAAAAACTTTTGGTTTAAAAGATCACTTTAAAATTTTTGTATACATAAAATTATACTCAATATCTCTTTTTTAATAGTTGAGTAGTTTTTctgtgtttcatTCCAGTGAGCAGAAGTAAATTGTATTATATTTTCACGACTAGTTAATTTTTTTTGTTTCAGAATACCTTCGTATCCTAGATCAAAGGCGTCTGTTTCTATAATTTTTGCTAGATTTGGGTCTGCTATATGCAGACACGGAATTTTTAGAACCTGTTTTTTAATTTGTTGGACTAGAGCGGTATGCTCAACCGTCCAAGGGGTTGGGTTTTTCTTTAACCGATCATGTAAAGGTctagctattctATTGATATTTGGACAAAAATCTAGGACGTAATTAAGACTTCTTAAGAACCTTTACAATTGGGTTTTGTCTAGAAGTTTGTCACGAAATTTATTGGCAAACTCTAATGACCTTTCTATTGGTTttatcataccTTTGGATATATAATGACCAAGAAATCTAATTTTAGTTTGAAACAAGGACATTTTTGTTTTGGAAATAACAAGACCATTTTTTCTCGCGACATAGTaaaacgtttttagatgtttgaaatgttcatcaatagagtttgaaaagataagtatgtcatcaatataaactatacaaaattttgaatatTCTGAGAATATGTTATTCATGATTCTTTGAAATTCTGAAGGTGCATTTTTTAAACCAAAATGCATTACATTCCATTGGTATTCCCCAAAAGGAATAGTGAATGCTGTTTTGTATCGGTTATTTTCAGATATTTGGATTTGCCAAAATCCTTATTTTAAATCGAACTTTGAAAATATATGTCCAGAATATAAGTTTTGAAAAAGATCTTTTTTATTTTGTATTGGATATCTAATCCATTTTAATGCTGAATTTAAAGGCTTGTAATTTattacaagtcttggagttcctctttttatttcggaatttttatttacataaaaagctgcacaagaccatggagaccttgattttgaaattaattttttgtttagaagttctgagaTTTTTTTCTTACAATGACTTTCTAATTCAGAGTTCATCTGAATTGGTCGAACCTTTGTAGGAATTTCTCTTTCATCAAATTTTTCTTCATAAGGTAGATCAACAATATGTTGTTTTCTATCCCAGAAGACAGTTGGTAAATCTGAAAAAGTTGTTCTTCAAACAATTTTTTTTATTTTGTGATTTTCTCTTTTGTAATTAATGTTTCTAATGATTCTTTTGTTtttt
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_48Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
217Start:
2101667End:
2101883Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_48
GGGAGTCCTGCAAGAAATTTTTCTTTCCAAAAAGGTTGGTTTGAATCTtgtcggagtaagactctagtaagaaaagtgtttttataccattggaaagcacttagttttttacatttaagatttgaaagaagttctgCGTTTTTATCTCTAAGGACTGAAGGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATATCTAAGAGTAGAGTTGTTACGGCATTTTGTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_49Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
243Start:
2103731End:
2103973Strand:
->Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_49
aaaatttggaTAGCAATCAAAAGATATTGGACCAGCACATAAACTTGATTTTGTAGAGCTAAGTAAAGAATCTTCAAATAATTTAAATCTAGTATCTCTTAAGatagctagtattgaggtgttaagaccttcttttgaaagtggtttaataccgacttggactaaaccaatatgtatatatttgaaattcttttctctatgtctttgtaaagcatgttctgaaaataaatgaattgtttcaaa
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_50Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
385Start:
318478End:
318862Strand:
->Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_50
GTACCTGTTTTGGAGAAATtctcgagtcaAGAAATCTGGAATAAAATTTGTTTTTCCTTTAATATATTCTATATCGAAATCGAAAATACATAGTAATGCCTACCATCGGGCAAAAATTTGTTTTGAAgcaagattttTAACATCTTTTTGTAAAACATCTTTTGAGCTTTTAAAATCAATTCTTGATAAAAAAATTTTGATTTAAAAGATCGCTTTGGAATTTTTGTATACATAAAACAATACTTAATATTTCTTTTTAATAGTTGAGTTATTTTTCTGGGTTTCATTCATGAGTAGAAGTAAATTGTATTATATTTTCACGACCGGTTGTTTCCTTTTGTTTCAGAATACCCCCATATCCTATATCAGAGACGTCTGTTTCCAC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_51Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
656Start:
318912End:
319567Strand:
->Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_51
TAGTATGTCATCAATATATACTATACAGAATTTTGAGTATTCTGAGAATATGTCATTCATAattctttgaaaTTCTGAAGGTGCATTCTTTAAACCAAAGGGCATTACGTTCCATTGGTATTGCCCAAAAGAAACAGTAAATACTGTTTTATATCGATCATTTTCAGATATTTGGATTTGCCAAAACCATGATTTTAAATCGAATTTTGaaaatatatgtGCAGAATGAAGTTTTTGAAGAAACTCTTTTTTATTAGGTATTGGATATCTAATCTATtttaatgctgAATTTAAAGGTTTGTAATTTACTACAAGTCTTGGAGTTCCTCTTTCTATTTCAGAATTTCTGTTGGTGTAATTTACTAAAGCAGCACAAGACCATAGAGATCTTGACTTTGAAATTAATTTTTTGTTTAGAAGTTCTGAAAtttctttcttaCAATGACTCTCTAAATCAGAGTTCATCTGAATTGGTCGAGCCTTTCTTGGAATTTCTCGTTCATCAAATTTTTCTTCTAAGGATAGATCAACAATGTGTTGTTTTCTTTCATAGAAGGCAGTTGGTAAATCTGAAAATAATTGTTCTTCAAATAATTTACTTAGTTTTGAAATTTTTTCTTTTGTAATTGGGATTTTTAAAGTTTCTTTTGTTTTTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_52Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
217Start:
321125End:
321341Strand:
->Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_52
tggaagtcctgcaagaaatttttctttccaaaaGGGTTGGTTTGAATCTTGTCGGAGTAAGACCCTAGTGAGGAAGGTGTTTTATACCATTGAAAATCACTTAGTtttttacatttAAGATTTGAAAGGAGTTCTGTGTTTTTATATCTAAGGACTGAAAGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATAGCTAAGACTAGAGTTGCTACggtattttgtT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_53Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
321Start:
322181End:
322501Strand:
->Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_53
tatttcgattggtaataggatttgctgtttttgaataaggaaaataaatattattttctttggcataatcctcaaaccaattgaaaaataaaacttggactttgtatttttaaagatatgtATAATATTCTTCTTGGATGTTTTCTTTGTTGTTTGAGAATTCTTTGAAAAGCCAAATTCTTTTTTGTAAGTTATTTTTTGAATAAAATTTTTCCCTTAAGAATTTTTTATCAATTTCGAAATCTTTTTCTAAAACGTTTAACTCATTAGCCAtattatcagtaatagctgaaaatgttgggctagtaggttcagattttg
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_54Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
639Start:
787193End:
787831Strand:
+>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_54
AAAAACATGACTAGTACCAAAATGTCTTTCTTCCAAACAAAAATTAGATTTCTTGGTCATTACATATCCAAAGGTATGATAAAACCAATAGAAAAATTATTAGAATTTGCGAATAAATTTCCTAACAAACTTTTGGATAAAACTCAATTGCAAAGGTTCTTTGGAAGTCTTAATTACGTCTTAGATTTTTGTCCAAATATCAATATAATAGCTAGATCATTACATGATCATTTAAAGAAAAACCCAACTCCTTGGACAGATGAGCATACCGCTCTGGTTCAAAAGATTAAAAAACAAGTCCTAGAAATCCCATGTCTGTATATAGCGGATCCAAATTTAAGGAAAATTGTAGAAACAAACACCTCATATATAGGATATGGATGTATTCTGAAACGAAAAGAAACAAATGATCATGAGAGTATAATACAATTTACTTCTACCCATTGGATCGAAACCCAAAAAAAACTACTCAACTATTAAGAAAGGAATTTTAAGTATAGTTTTAAGTATACAAAAATTTCAAAGTGATCTTTTAAATCAAAAGTTTCTCCTAAGAATTGATTGCAAAAGTGCCAAAGATGTTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTTGATTCAAAACAAATTTTTTCCCGATGGAAAGC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_55Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
144Start:
1309432End:
1309575Strand:
->Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_55
GAACAACGGTCTAAGTTGTATTAGTCCCACTATTTTATTCGATATTTTTGGACTAATATGTAGCCAGTAGGGCATGTCTGGTAAAAACGAAATAAGGATATAGTGCTAAGATAGTATCCAAGGTATTTCCAATAAATGTGAAAA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_56Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1044Start:
1309780End:
1310823Strand:
+>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_56
AATCAGTAAATGTTATTTTAAAACTTTTTAAAATAGATTAATAATATCTTAAAGAATAATTCTTATTAGATAAAAATAAAAATAAAAGAAACCGTTAATTTAACACTTTTGTCAAAGAAAAcaacaatttcaTTTAAAGAAATATGGTATGATTATATGAAAACTATGGAAGCAACTATCCATTTTTTGTTTGGTTTTAAACATTTTTTTTGTCACACATTTGGTTTTAAACATATGCATTAGAAAACAAAATAGACTACCCTTATAAAAAATGAATTAATAAAGACTAATTCAACCTTATATAATACATGGGTAATGACTTACGGAGAAAAATATAAATTAGTCTACACACTATAAAAAGATATaaaaattcacACTCCTCAAAACACAAGTAATAACTACACCGTTCAAAACTGAAACAAACAATGATGATAGAGATTCAATTAATATTGGTTGATATTAAAATAGTTATAAACAAAACagttaccaaaaTCAAATATTACACACTATTTCACGACAAATATATCACATAGATAACAAAATATAAAAAGACGAAAACAATTCAATAACAAACTATCAACCATTTTCACATAATTTCAAAACAATTTCACCACCCATCTTTAAACCCTTAACCAAACCTATATAATTTCAAAAAATGCACTTTTAAAATCAATTTCTTGTAGATTAGATCAATTAGACAAAGGTAAGGGAATAAATGATATTGATGAAAATATTCAACATGTAACTGATGAAGAAGACATTGAATAAAATTGAATAAAATTTTCAACAATCCAAAAAACCATATTACCCTAGACACTCCTCACCCGATCTACTATTTGAAGAACATCACCAATTTGCTACAATAATTTTTTACAATAGAAAAGGTATATATGAATGGAAtgattaaagatCCAAATATGAAATGATTAATTTATTTCAAAAAATGGTGATTTTAGCCTAGTCTATAATGCTAAAGGAGCATCAAATAAGCAATCACGCATCCTTCTAATTTCAAGATGTAAAGGGAACTTTAAAATTTTGGTG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_57Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
179Start:
1322376End:
1322554Strand:
->Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_57
gaacaacggtctaaGTTGTATTAGTCCCACTAATTCGATATTTTTGGACTAATGAGTAGGGCATGTCTGGTAAAAATGAAATAAGGTTATAGTGCTAAGATAGTATCCATGGTATTCTCAGTAAATGTGAAAATCTATttttggcaatGGGCCTATAGGTTGGTGTGTTTTGTGTTTGG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_58Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
515Start:
1322701End:
1323215Strand:
+>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_58
AATCAGTAAATGTTATTTTAAAACTTTTTAAAATCGATTAATAATATCTTAAAGAATAATTCTTATTAGCTAAAAATAAAAATAAAAGAAACCGTTAATTCAACACTTTTGTCAAAGAAAAcaacaatttcaTTTAAAGAAATATGGTATGAATATATGAAAACTATGGAAGCAACTATCCATTTTTTTGTTTGGTTTTAAACATATGCATTAGAAAACAAAATAGACTACCCTTATATAAAAAATGAATGAATAAAGACTATAGTTCAACCTTATATAATACATGGGTAATGACTAACGGAGAAAAATATAAATTAGTCTACACACTATAAAAAGATATAAAAATTcacactcctcaaaacacaagtaataactacaccgttcaaaactgaagcaaacaatgatgatagagattcaattaatatggttgatattaaaatagttataaacaaaacagttaccaaaatcaAATATTACACACCATTTCATGATAATTAGATCACATAGATAACAAA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_59Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
282Start:
183567End:
183848Strand:
->Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_59
TAGTAAGGAATTGACTTATATCAATAATTCGTTATTTAAAGAGGTTATTTTTGTTGTAATTTCTCTTGAATTAATTGTACTATGAGATGCAGATGCTGCATGTTTATTTTTAAAAAATTTTCTAAGAGTCATAGCCATGTTTCCAAACTAGGTTTAAACTTAAAGCTAGGGAAGACTAACCGGATTCTTCGTCGACACAACTGAGGCTTGCCAACGGTCTTACTGCCTGACTTCTAGGGCTTGCTGCCCGGAACACCTACAGTAACAGTGTTTTAGAAGAGG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_60Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
2542Start:
184200End:
186741Strand:
->Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_60
AGGTGTTGTTTTTGAGGTTTGGAGTAATAGGCTGATTTTTGAGAGATATTAGGAGGAGGATTTTGAGTAGTGGCGGAGGATTGACTTTTGTCAGTTGTTACtgcttttgagtaggatagagggggaaattcggcaagtgccgagaaagagttttgattttgtgagaggtttgccctgaAGATGGGGCTGATTCTTGATATAATCCGATGGAGTGATCGGTTTCTTGTTCTGTGAGTCACTCATCTTGAATATTTTGTTTGATATCCGGCTTATTTCCCTGTAAATATTCTCTTGTTAGAAAATCGGGTAAAGAATTATTTTCTCCTTTTATATATTGAATATCAAAGTCAAAAACTGATAAAATGGCTTGCCATCTGGCAAAGATTTGTTTAGAAACCAAATTTTTGACATCTTTTTGTAAAATTTCTTTGGCTGACCTACAGTCAACACGTAATAAAAATTTTTTGTTTATTAAATCGTCTTGAAATTTTGTAATGCAATTGACTATAGAAAGAACTTCTTCTTTAACGGTAGAATAGTTTTTCTGAGGTCCTAACCATACACCAGAATGGAATCTAACTATAGACTCTTGGGTGGTTTGTGGATGTTTTTGTTTTAGTATGCCTCCATAACCTATTTTAGAGGCATCGGTCTCAACTATCATATCGGCTTCTGGATGTGGTATTGCTAGACAGGGTAAGGTTTTGACCTTTTGTTTAACTTGTTGGACCAGACTTGTATGAACGTTGGTCCAAGGTTTAGGGTTTTTTTTGTAATCGTTGGAATAAGGGTTGAATGGTTTTCCTTAGGTTTGGCAAGAAATCGGAAACATAATTGAGACATCCTAAGAACCTTTGCAATTGAGATTTTCCTCGTAATTCGTCTGGAAATTTGGCTGCAAATTCTATAGATCTTGCTATTGGTGTAATTGTTCCTTGATATATATTATGGCCTAAGAATCGAATTTTTGTTTGGAATAATGACATTTTTTTAGCAGATAAAACTAATCCATGTTTTTTAATTATATTGAGAAATGTGTATAAATGGCTTATGTGTTGATCAATTGAGTTAGAATATATTAATACGTCATCTATATAAACAATTGTAAATTTTGAATAATTGTTGAATATATCATTCATTATATGTTGGAATTCTGAAGGTGCATTTTTAAACCCAAATGGCATCACGTTCCATTCATAATGTCTGAACGGGACAGTAAATGCCGTTTTATATTTATTTTGTTCTTCGATTTGGATTTGCCAGAATCCGCTTTTCATATCGAATTTTGAATAAATTTTTGCATCATATAATCTTTTTAATAAATCTCTTTTGTTAGGTATTGGATACCTAATCCATTGTAAAACATCGTTAAGAGGTTTATAGTTAATTACTAGTCATGGTACTCCACGTTCCATTTCTGCGTGATTATTAACATAGAAAGCCGAACAACTCCAAGGAGATTTGGAAGGTCGTATAAGTTTTTTCTTTAATAAGTCATTTATTTCTTGTTTACAATGTTCTAATAATTCTTTGTTCATTTGAATAGGTCGTGCTTTAGTTGTTATAAGTTTTTCATTAAAATCTTTTATATATGGAAGTTGAACAcaatattgtttTCTTTCCCAAAATGCATTTGGTAAATCTGAGCATACTTGATTTAGTAAATCATTTTCTATTGATTTTATTTTATCTTGAATACGAGATGTTTAAGTTGTTCTTCTATTTTTTGATAGGTTATTTCGTCTTGTAAATATGTAATATGTTGTTTTTTTACCATTTATTAAATTTATTGTTTTTTGGATTGTGTTTTGTTGAAGATACAGAATTTCTTTAGATTtcataggtgaTAAGAAATTAAATGATAATTTTGTTCCTACAACTTCTGTTATTATACCTAGTTCTGTTACTTTAAATGGATAGATTTGAGTAAGGAAGGGAGTTCCTAATATAACTTCTTGAGTTAAGTTTTTAACTAAGATAAATTGATTTTTAAAACAATATCCTTGATTACATATTTTGGCACTTGGTAATTTATACTGTACTTTTAATTTACTTCCGTTAGCACCACTTAGGCGTTCTGTCGTTTTTTCATAATATTTAGTTGGTACCAGACCTTCGCGAATGCAGTTATAATCTGCTCCGGAATCTATTAATGTTATCGTATTTATCTGAAAATCATTTCCTATATGTAGAGTAATATTTGTGTACCATTTTTGATAATTTATTTtattaatatttTGGATATAATTATTATCTTCTTCTGTCATTTGTTTACTTGTTGAACCTTGAGAATTTGCGGTTTCTATTAATTTTAATCTAGTATCTATTTGTAATTGATTTAATTCTTGTTGATTAACCGGAAATTATAATTCTTTAATTTGTGTTTTTAAATTCTTGACTTCATTTTGTAATTCTCCCGTGGTTACTTGTTTAAATAGACTTTGGGTAGGATATTTTTCAATTATTTTATTCAGACTAAAAGGCTGTGGATTTTGTAGTCGATTTTCTTGATATACTATGTCTTTAAGTTTTAATAAATATT