ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_41 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1455779079780533+
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_42 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus243783483783725+
Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_43 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus217785588785804+
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_44 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus143811481571149594-
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_45 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus21811511441151361-
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_46 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus16911514521151620-
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_47 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus145620986402100095-
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_48 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus21721016672101883-
Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_49 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus24321037312103973-
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_50 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus385318478318862-
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_51 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus656318912319567-
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_52 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus217321125321341-
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_53 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus321322181322501-
Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_54 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus639787193787831+
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_55 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus14413094321309575-
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_56 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus104413097801310823+
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_57 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus17913223761322554-
Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_58 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus51513227011323215+
Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_59 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus282183567183848-
Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_60 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2542184200186741-

< 3 4 5 6 7 > Total 22


Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1455

Start:

779079  

End:

780533

Strand:

+

>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_41

AAAAAACAAAAGAATCATTAGAAACattaattataaaggagaaaatcacaaaattaaacaaattgtttgaagaacaactttgttcagatttaccaactgccttctgggataaaaaacaacacattgttgatctaccctatgaagagaaatttgatgaaagagaaattcctacaaaggctcgaccaattcagatgaactctgaattagaaagtcattgtaagaaaaaaatTTCAGAACTTCTAAACAAAAAATTAATTTCAAAATCAAGATCTCCATGGTTTTGTGCAGCTTTCTATGTGAATAAAAATTCTGAAATAGAAAGAGGAACTCCGAGActtgtaataaattacaaacctttaaattcagcattaaAATGGATTAGATATCCAATACCAAATAAAAAAGATCTTCTTCAAAAACTGTATTCTGCTCACATATTTTCAAAGTTCGATTTAAAATCAAGATTTTGGTAAATCTAAATATCTGAAAATGATCGATACAAAACAGCATTTACTGTTCCTTTTGGGcaataccaatggaacgtaatgccttttggtttgaaaaatgcaccttcagaatttcaaagaatcatgaatgacatattctcagaatattcaaaatttgtatagtttatattgatgatatacttatcttttcaaaCTCTATTGACGAACATTTCAAACATCTAAAAACGTTCTACTATGTTGCACAAAAAAATGGACTTGTTATTTCAAAAACAAAAATGTCCTTATTCCAAACTAAaattagatttcttggtcattatatatccaaaggtatgataaaaccaatagaaaggtcaatagagtttgccaataaattttctgacaaactcttagacaaaacccaattacaaaggttcctaggaagccttaattacgtcctagatttttgtccaattatcaatagaatagccagaccattacatgaccgtttaaagaaaaacccaaccccttggacagacgagtataccgctatagTTCAACAAATTAAAAAACAAGTCTTAGAAATCTCGTGTCTGCATATAGCAGACCCGAATTTAACAAAAATTATAGAAACAGACGCCTCTGATATAGGATATGGGGGTATTCTGAAAAAAAAAAAACAAATGGTCGTGAAAATATAAtacaatttacTTCTGCTCATTGGAATGAAATCCAAAAGAATTATTCAACTATTAAAAAAGAAATATTAAGTATAGTTCTATGTATACAAAAATTTCAAAGTGATCTTTTAAAccaaaatttttTACTAAGAATTGATTGTAAAAGCGCCAAAGATGTTTTACAAAAAGATTTTAAAAATCTTGCTTCTAAACAAATTTTTGTCCGATGGCAGGCATTACTAAGTATTTTCGATTTTGATATTGAatatattaaaGGAGAAACAAATTTTATTCCAGATTTCTTGACTCGAGAATTTGTCCAAAACAGGTAC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

243

Start:

783483  

End:

783725

Strand:

+

>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_42

TTTGAAACAATTCATTTAttttcataacaTGCTTTACAAAGACATAGAGAAAAGAATTTCAAATATATACATATTGTTTTTGTCCAAGTCGCTATTAAACCACTTTCAAAAGAAGGTCTTAACACCTCAATACTAGTTATCTTAAGAGATACTAGATTTAAGTTATTTGAAGATTCTTTACTTAGCTCTATAGAATCAAGTTTATGTgctgatccaatatcttttgattgctatccaaatttt

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

217

Start:

785588  

End:

785804

Strand:

+

>Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_43

aacaaaatgcCGTAGCAACCCTAGTCTTAGCTATAACTCTTCGTTTCATAGGAGATCCTTTAGTCTTTAGAGATAAAAACGCAGAACTTCTTTCAAATCTTAAATgtaaaaaactaAGTGATTTCCAATGGTATAAAAACACTTTCCTTACTAGAATCTTACTCCGACAAGATTCAAACCAATCTTTTTGGAAAGAAAAATTTATAGCAGGACTCCC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1438

Start:

1148157  

End:

1149594

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_44

GTACCTGTTTTGGAGAAATTCTCAAGTCAATAAATTTGGAATAAAATTTGTTTCTTCTTTAATATATTCAATATCAAAATGGAAAATACTTAGTAATGCCTGTCATCGGGCAAAAATTTGTTTAGAAGCATGATTTTAAACATCATTTTGTAAAACATCTTTGACGCTTTTACAATCAATTCTTAGTAAAAacttttggttTAAAAGATCACTTTGAAATTTTTGTATCCATAGAACTATACTTAATATTTCTTTTGGGTTTCATTCCAATGAGCAGAAGTAAATTGTATTATATTCTCACGACCATTTATTTTTTTTTGTTTCAGAATACCCCCGTATCCTATATCAGATGCGTCTATTTCTACAATTTTTGCTAAATTCGGGTCTGATATATGCAGACACGGGATTTCTAAGACTTGTTTTTTAATTTGTTGACCTAGAGCGGTATGCTCGTCTGTCCAAGGAGTTGAGTTTTTCTTTAAATGGTCATGTAATGGTCTGGCTATTCTATTGATATTTGGACAAAAATCTAGGacataattaagacttcttaggaacctttgtaattgggttttgtctaagagtttgtcagaaaatttattggcaaactcTAATGACCTTTCTATTGGTTTTATCATACCTTTGGATATATAATGACCAATAAATCTAATTTTAGTTTGGAACAAGGCCATTTTTGTTTTTGAAATAACAAGTCCATTTTTTCGTGCCACATAGTAAAACGTTTTTAGATGTTTGAAATGTTCGTGAATAGAGTTTGAAAAGATAAGTATATCATCAATATAAACTATACAAAATtttgaatattcTGAGAATATGTTATTCATGATTCTTTGAAATTCTGAAGGTGCATTTTTCTAACCAAAAGACATTACGTTCCATTGGTATTGCCCAAAAGGAACAATAAATGCTGTTTTGTATCGATcattttcagatATTTGGATTTGCCAAAATCCTAATTTTAAATCGAACTTTGAGAATATGTGAGCAGAATGCAGTTTTTGAAAAAGATCTTTCTTTTTATTTGGTATTGGATATCTAATCCATTTTaatgctgaatTTAAAGGCTTGTAATTTATTACAAGTCTCGGAGTTTCTCTTTCTATTTTGGAATTTTTTTTCACATAGAAACCAGCACTAGACCATGGAGATCTTGATTTTGAAATTAattttttgttTAGAAGTTCTGAAATTTCTTTCTTACAATTACTTTCTAATTCAGAGTTCATCTTAATTGGTCGAGCCTTTGTAAGAATTTCTCTTTCATCAAATTTCTCTTCATagggtagatcaacaatgtgttgttttctatcccagaagacagttggtaaatctaaacaaagttgttcttcaaacaatttgtttaattttgtgattttctcttttataattaatatttcTAATGATTCTTTTGTTTTTT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

218

Start:

1151144  

End:

1151361

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_45

TGGAAGTCCTGCAAGAAATTTTTCTTTCCAAAATGGTTGGTTTGAATCTTGTCGGAGTAAGACCCTAGTGAGAAATGTGTTTTTGTACCATTGGAAATCACTTAGTTTTTTACATTTAAGATTTGAaagaagttttGCGTTTTTATCTCTAAGGACTGAAGGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATTGCTAAGACTAGGGTTGCTACAGCATTTTGTT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

169

Start:

1151452  

End:

1151620

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_46

AGTTATCCCACCATCCTATTAATTGTCCGAAAAATCCGGCTATAAGGAGCTCAGCtacggttttaTCTTCATTTCCTATTTGTGTTCTATAAGCGTTTGCAGTCATAGTCATTTTTTGAAAGAAATTTAGGATATTATATTCAGATATACCATCAATATTCCAATCATA

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1456

Start:

2098640  

End:

2100095

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_47

GTACCTGTTTTGGAGAAATTCTCGAGTCAAGAAATCCGGAATAAAATttgtttctcctttaatatattctatatcaaaatcaaaaatacttagtaatgcttgccaacaggcaaaaaTTTGTTTTGAAGCAAGATTTTTAACATCCTTTTGTAAAACATCTTTAGCGTTTTTACAATCAATTCTTAATAAAAACTTTTGGTTTAAAAGATCACTTTAAAATTTTTGTATACATAAAATTATACTCAATATCTCTTTTTTAATAGTTGAGTAGTTTTTctgtgtttcatTCCAGTGAGCAGAAGTAAATTGTATTATATTTTCACGACTAGTTAATTTTTTTTGTTTCAGAATACCTTCGTATCCTAGATCAAAGGCGTCTGTTTCTATAATTTTTGCTAGATTTGGGTCTGCTATATGCAGACACGGAATTTTTAGAACCTGTTTTTTAATTTGTTGGACTAGAGCGGTATGCTCAACCGTCCAAGGGGTTGGGTTTTTCTTTAACCGATCATGTAAAGGTctagctattctATTGATATTTGGACAAAAATCTAGGACGTAATTAAGACTTCTTAAGAACCTTTACAATTGGGTTTTGTCTAGAAGTTTGTCACGAAATTTATTGGCAAACTCTAATGACCTTTCTATTGGTTttatcataccTTTGGATATATAATGACCAAGAAATCTAATTTTAGTTTGAAACAAGGACATTTTTGTTTTGGAAATAACAAGACCATTTTTTCTCGCGACATAGTaaaacgtttttagatgtttgaaatgttcatcaatagagtttgaaaagataagtatgtcatcaatataaactatacaaaattttgaatatTCTGAGAATATGTTATTCATGATTCTTTGAAATTCTGAAGGTGCATTTTTTAAACCAAAATGCATTACATTCCATTGGTATTCCCCAAAAGGAATAGTGAATGCTGTTTTGTATCGGTTATTTTCAGATATTTGGATTTGCCAAAATCCTTATTTTAAATCGAACTTTGAAAATATATGTCCAGAATATAAGTTTTGAAAAAGATCTTTTTTATTTTGTATTGGATATCTAATCCATTTTAATGCTGAATTTAAAGGCTTGTAATTTattacaagtcttggagttcctctttttatttcggaatttttatttacataaaaagctgcacaagaccatggagaccttgattttgaaattaattttttgtttagaagttctgagaTTTTTTTCTTACAATGACTTTCTAATTCAGAGTTCATCTGAATTGGTCGAACCTTTGTAGGAATTTCTCTTTCATCAAATTTTTCTTCATAAGGTAGATCAACAATATGTTGTTTTCTATCCCAGAAGACAGTTGGTAAATCTGAAAAAGTTGTTCTTCAAACAATTTTTTTTATTTTGTGATTTTCTCTTTTGTAATTAATGTTTCTAATGATTCTTTTGTTtttt

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

217

Start:

2101667  

End:

2101883

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_48

GGGAGTCCTGCAAGAAATTTTTCTTTCCAAAAAGGTTGGTTTGAATCTtgtcggagtaagactctagtaagaaaagtgtttttataccattggaaagcacttagttttttacatttaagatttgaaagaagttctgCGTTTTTATCTCTAAGGACTGAAGGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATATCTAAGAGTAGAGTTGTTACGGCATTTTGTT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

243

Start:

2103731  

End:

2103973

Strand:

-

>Scaffold13129_LTR-Caulimovirus_49

aaaatttggaTAGCAATCAAAAGATATTGGACCAGCACATAAACTTGATTTTGTAGAGCTAAGTAAAGAATCTTCAAATAATTTAAATCTAGTATCTCTTAAGatagctagtattgaggtgttaagaccttcttttgaaagtggtttaataccgacttggactaaaccaatatgtatatatttgaaattcttttctctatgtctttgtaaagcatgttctgaaaataaatgaattgtttcaaa

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

385

Start:

318478  

End:

318862

Strand:

-

>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_50

GTACCTGTTTTGGAGAAATtctcgagtcaAGAAATCTGGAATAAAATTTGTTTTTCCTTTAATATATTCTATATCGAAATCGAAAATACATAGTAATGCCTACCATCGGGCAAAAATTTGTTTTGAAgcaagattttTAACATCTTTTTGTAAAACATCTTTTGAGCTTTTAAAATCAATTCTTGATAAAAAAATTTTGATTTAAAAGATCGCTTTGGAATTTTTGTATACATAAAACAATACTTAATATTTCTTTTTAATAGTTGAGTTATTTTTCTGGGTTTCATTCATGAGTAGAAGTAAATTGTATTATATTTTCACGACCGGTTGTTTCCTTTTGTTTCAGAATACCCCCATATCCTATATCAGAGACGTCTGTTTCCAC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

656

Start:

318912  

End:

319567

Strand:

-

>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_51

TAGTATGTCATCAATATATACTATACAGAATTTTGAGTATTCTGAGAATATGTCATTCATAattctttgaaaTTCTGAAGGTGCATTCTTTAAACCAAAGGGCATTACGTTCCATTGGTATTGCCCAAAAGAAACAGTAAATACTGTTTTATATCGATCATTTTCAGATATTTGGATTTGCCAAAACCATGATTTTAAATCGAATTTTGaaaatatatgtGCAGAATGAAGTTTTTGAAGAAACTCTTTTTTATTAGGTATTGGATATCTAATCTATtttaatgctgAATTTAAAGGTTTGTAATTTACTACAAGTCTTGGAGTTCCTCTTTCTATTTCAGAATTTCTGTTGGTGTAATTTACTAAAGCAGCACAAGACCATAGAGATCTTGACTTTGAAATTAATTTTTTGTTTAGAAGTTCTGAAAtttctttcttaCAATGACTCTCTAAATCAGAGTTCATCTGAATTGGTCGAGCCTTTCTTGGAATTTCTCGTTCATCAAATTTTTCTTCTAAGGATAGATCAACAATGTGTTGTTTTCTTTCATAGAAGGCAGTTGGTAAATCTGAAAATAATTGTTCTTCAAATAATTTACTTAGTTTTGAAATTTTTTCTTTTGTAATTGGGATTTTTAAAGTTTCTTTTGTTTTTT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

217

Start:

321125  

End:

321341

Strand:

-

>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_52

tggaagtcctgcaagaaatttttctttccaaaaGGGTTGGTTTGAATCTTGTCGGAGTAAGACCCTAGTGAGGAAGGTGTTTTATACCATTGAAAATCACTTAGTtttttacatttAAGATTTGAAAGGAGTTCTGTGTTTTTATATCTAAGGACTGAAAGATCTCCTATGAAATGAAGAGTTATAGCTAAGACTAGAGTTGCTACggtattttgtT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

321

Start:

322181  

End:

322501

Strand:

-

>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_53

tatttcgattggtaataggatttgctgtttttgaataaggaaaataaatattattttctttggcataatcctcaaaccaattgaaaaataaaacttggactttgtatttttaaagatatgtATAATATTCTTCTTGGATGTTTTCTTTGTTGTTTGAGAATTCTTTGAAAAGCCAAATTCTTTTTTGTAAGTTATTTTTTGAATAAAATTTTTCCCTTAAGAATTTTTTATCAATTTCGAAATCTTTTTCTAAAACGTTTAACTCATTAGCCAtattatcagtaatagctgaaaatgttgggctagtaggttcagattttg

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

639

Start:

787193  

End:

787831

Strand:

+

>Scaffold13404_LTR-Caulimovirus_54

AAAAACATGACTAGTACCAAAATGTCTTTCTTCCAAACAAAAATTAGATTTCTTGGTCATTACATATCCAAAGGTATGATAAAACCAATAGAAAAATTATTAGAATTTGCGAATAAATTTCCTAACAAACTTTTGGATAAAACTCAATTGCAAAGGTTCTTTGGAAGTCTTAATTACGTCTTAGATTTTTGTCCAAATATCAATATAATAGCTAGATCATTACATGATCATTTAAAGAAAAACCCAACTCCTTGGACAGATGAGCATACCGCTCTGGTTCAAAAGATTAAAAAACAAGTCCTAGAAATCCCATGTCTGTATATAGCGGATCCAAATTTAAGGAAAATTGTAGAAACAAACACCTCATATATAGGATATGGATGTATTCTGAAACGAAAAGAAACAAATGATCATGAGAGTATAATACAATTTACTTCTACCCATTGGATCGAAACCCAAAAAAAACTACTCAACTATTAAGAAAGGAATTTTAAGTATAGTTTTAAGTATACAAAAATTTCAAAGTGATCTTTTAAATCAAAAGTTTCTCCTAAGAATTGATTGCAAAAGTGCCAAAGATGTTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTTGATTCAAAACAAATTTTTTCCCGATGGAAAGC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

144

Start:

1309432  

End:

1309575

Strand:

-

>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_55

GAACAACGGTCTAAGTTGTATTAGTCCCACTATTTTATTCGATATTTTTGGACTAATATGTAGCCAGTAGGGCATGTCTGGTAAAAACGAAATAAGGATATAGTGCTAAGATAGTATCCAAGGTATTTCCAATAAATGTGAAAA

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1044

Start:

1309780  

End:

1310823

Strand:

+

>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_56

AATCAGTAAATGTTATTTTAAAACTTTTTAAAATAGATTAATAATATCTTAAAGAATAATTCTTATTAGATAAAAATAAAAATAAAAGAAACCGTTAATTTAACACTTTTGTCAAAGAAAAcaacaatttcaTTTAAAGAAATATGGTATGATTATATGAAAACTATGGAAGCAACTATCCATTTTTTGTTTGGTTTTAAACATTTTTTTTGTCACACATTTGGTTTTAAACATATGCATTAGAAAACAAAATAGACTACCCTTATAAAAAATGAATTAATAAAGACTAATTCAACCTTATATAATACATGGGTAATGACTTACGGAGAAAAATATAAATTAGTCTACACACTATAAAAAGATATaaaaattcacACTCCTCAAAACACAAGTAATAACTACACCGTTCAAAACTGAAACAAACAATGATGATAGAGATTCAATTAATATTGGTTGATATTAAAATAGTTATAAACAAAACagttaccaaaaTCAAATATTACACACTATTTCACGACAAATATATCACATAGATAACAAAATATAAAAAGACGAAAACAATTCAATAACAAACTATCAACCATTTTCACATAATTTCAAAACAATTTCACCACCCATCTTTAAACCCTTAACCAAACCTATATAATTTCAAAAAATGCACTTTTAAAATCAATTTCTTGTAGATTAGATCAATTAGACAAAGGTAAGGGAATAAATGATATTGATGAAAATATTCAACATGTAACTGATGAAGAAGACATTGAATAAAATTGAATAAAATTTTCAACAATCCAAAAAACCATATTACCCTAGACACTCCTCACCCGATCTACTATTTGAAGAACATCACCAATTTGCTACAATAATTTTTTACAATAGAAAAGGTATATATGAATGGAAtgattaaagatCCAAATATGAAATGATTAATTTATTTCAAAAAATGGTGATTTTAGCCTAGTCTATAATGCTAAAGGAGCATCAAATAAGCAATCACGCATCCTTCTAATTTCAAGATGTAAAGGGAACTTTAAAATTTTGGTG

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

179

Start:

1322376  

End:

1322554

Strand:

-

>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_57

gaacaacggtctaaGTTGTATTAGTCCCACTAATTCGATATTTTTGGACTAATGAGTAGGGCATGTCTGGTAAAAATGAAATAAGGTTATAGTGCTAAGATAGTATCCATGGTATTCTCAGTAAATGTGAAAATCTATttttggcaatGGGCCTATAGGTTGGTGTGTTTTGTGTTTGG

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

515

Start:

1322701  

End:

1323215

Strand:

+

>Scaffold13671_LTR-Caulimovirus_58

AATCAGTAAATGTTATTTTAAAACTTTTTAAAATCGATTAATAATATCTTAAAGAATAATTCTTATTAGCTAAAAATAAAAATAAAAGAAACCGTTAATTCAACACTTTTGTCAAAGAAAAcaacaatttcaTTTAAAGAAATATGGTATGAATATATGAAAACTATGGAAGCAACTATCCATTTTTTTGTTTGGTTTTAAACATATGCATTAGAAAACAAAATAGACTACCCTTATATAAAAAATGAATGAATAAAGACTATAGTTCAACCTTATATAATACATGGGTAATGACTAACGGAGAAAAATATAAATTAGTCTACACACTATAAAAAGATATAAAAATTcacactcctcaaaacacaagtaataactacaccgttcaaaactgaagcaaacaatgatgatagagattcaattaatatggttgatattaaaatagttataaacaaaacagttaccaaaatcaAATATTACACACCATTTCATGATAATTAGATCACATAGATAACAAA

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

282

Start:

183567  

End:

183848

Strand:

-

>Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_59

TAGTAAGGAATTGACTTATATCAATAATTCGTTATTTAAAGAGGTTATTTTTGTTGTAATTTCTCTTGAATTAATTGTACTATGAGATGCAGATGCTGCATGTTTATTTTTAAAAAATTTTCTAAGAGTCATAGCCATGTTTCCAAACTAGGTTTAAACTTAAAGCTAGGGAAGACTAACCGGATTCTTCGTCGACACAACTGAGGCTTGCCAACGGTCTTACTGCCTGACTTCTAGGGCTTGCTGCCCGGAACACCTACAGTAACAGTGTTTTAGAAGAGG

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2542

Start:

184200  

End:

186741

Strand:

-

>Scaffold15089_LTR-Caulimovirus_60

AGGTGTTGTTTTTGAGGTTTGGAGTAATAGGCTGATTTTTGAGAGATATTAGGAGGAGGATTTTGAGTAGTGGCGGAGGATTGACTTTTGTCAGTTGTTACtgcttttgagtaggatagagggggaaattcggcaagtgccgagaaagagttttgattttgtgagaggtttgccctgaAGATGGGGCTGATTCTTGATATAATCCGATGGAGTGATCGGTTTCTTGTTCTGTGAGTCACTCATCTTGAATATTTTGTTTGATATCCGGCTTATTTCCCTGTAAATATTCTCTTGTTAGAAAATCGGGTAAAGAATTATTTTCTCCTTTTATATATTGAATATCAAAGTCAAAAACTGATAAAATGGCTTGCCATCTGGCAAAGATTTGTTTAGAAACCAAATTTTTGACATCTTTTTGTAAAATTTCTTTGGCTGACCTACAGTCAACACGTAATAAAAATTTTTTGTTTATTAAATCGTCTTGAAATTTTGTAATGCAATTGACTATAGAAAGAACTTCTTCTTTAACGGTAGAATAGTTTTTCTGAGGTCCTAACCATACACCAGAATGGAATCTAACTATAGACTCTTGGGTGGTTTGTGGATGTTTTTGTTTTAGTATGCCTCCATAACCTATTTTAGAGGCATCGGTCTCAACTATCATATCGGCTTCTGGATGTGGTATTGCTAGACAGGGTAAGGTTTTGACCTTTTGTTTAACTTGTTGGACCAGACTTGTATGAACGTTGGTCCAAGGTTTAGGGTTTTTTTTGTAATCGTTGGAATAAGGGTTGAATGGTTTTCCTTAGGTTTGGCAAGAAATCGGAAACATAATTGAGACATCCTAAGAACCTTTGCAATTGAGATTTTCCTCGTAATTCGTCTGGAAATTTGGCTGCAAATTCTATAGATCTTGCTATTGGTGTAATTGTTCCTTGATATATATTATGGCCTAAGAATCGAATTTTTGTTTGGAATAATGACATTTTTTTAGCAGATAAAACTAATCCATGTTTTTTAATTATATTGAGAAATGTGTATAAATGGCTTATGTGTTGATCAATTGAGTTAGAATATATTAATACGTCATCTATATAAACAATTGTAAATTTTGAATAATTGTTGAATATATCATTCATTATATGTTGGAATTCTGAAGGTGCATTTTTAAACCCAAATGGCATCACGTTCCATTCATAATGTCTGAACGGGACAGTAAATGCCGTTTTATATTTATTTTGTTCTTCGATTTGGATTTGCCAGAATCCGCTTTTCATATCGAATTTTGAATAAATTTTTGCATCATATAATCTTTTTAATAAATCTCTTTTGTTAGGTATTGGATACCTAATCCATTGTAAAACATCGTTAAGAGGTTTATAGTTAATTACTAGTCATGGTACTCCACGTTCCATTTCTGCGTGATTATTAACATAGAAAGCCGAACAACTCCAAGGAGATTTGGAAGGTCGTATAAGTTTTTTCTTTAATAAGTCATTTATTTCTTGTTTACAATGTTCTAATAATTCTTTGTTCATTTGAATAGGTCGTGCTTTAGTTGTTATAAGTTTTTCATTAAAATCTTTTATATATGGAAGTTGAACAcaatattgtttTCTTTCCCAAAATGCATTTGGTAAATCTGAGCATACTTGATTTAGTAAATCATTTTCTATTGATTTTATTTTATCTTGAATACGAGATGTTTAAGTTGTTCTTCTATTTTTTGATAGGTTATTTCGTCTTGTAAATATGTAATATGTTGTTTTTTTACCATTTATTAAATTTATTGTTTTTTGGATTGTGTTTTGTTGAAGATACAGAATTTCTTTAGATTtcataggtgaTAAGAAATTAAATGATAATTTTGTTCCTACAACTTCTGTTATTATACCTAGTTCTGTTACTTTAAATGGATAGATTTGAGTAAGGAAGGGAGTTCCTAATATAACTTCTTGAGTTAAGTTTTTAACTAAGATAAATTGATTTTTAAAACAATATCCTTGATTACATATTTTGGCACTTGGTAATTTATACTGTACTTTTAATTTACTTCCGTTAGCACCACTTAGGCGTTCTGTCGTTTTTTCATAATATTTAGTTGGTACCAGACCTTCGCGAATGCAGTTATAATCTGCTCCGGAATCTATTAATGTTATCGTATTTATCTGAAAATCATTTCCTATATGTAGAGTAATATTTGTGTACCATTTTTGATAATTTATTTtattaatatttTGGATATAATTATTATCTTCTTCTGTCATTTGTTTACTTGTTGAACCTTGAGAATTTGCGGTTTCTATTAATTTTAATCTAGTATCTATTTGTAATTGATTTAATTCTTGTTGATTAACCGGAAATTATAATTCTTTAATTTGTGTTTTTAAATTCTTGACTTCATTTTGTAATTCTCCCGTGGTTACTTGTTTAAATAGACTTTGGGTAGGATATTTTTCAATTATTTTATTCAGACTAAAAGGCTGTGGATTTTGTAGTCGATTTTCTTGATATACTATGTCTTTAAGTTTTAATAAATATT