Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_81Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
192Start:
614058End:
614249Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_81
atgaagtaaagtaTGTGTGATGGATGAGGTAAGTGCTTACGCAAGCAACTTAATCCTCTCCTAAGTGTGTACCCCCTATTTAAGATATAACTTTCATTTTATAAAATATTTTCTTTCTCTAAACTCTTATGTCTCTATAAATTCTCTCTAAGTTTTCTAGATCTCAACATGTTCATAAGCTTTTTTTTCTTC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_82Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
954Start:
970489End:
971442Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_82
TATGAATCTGACTATGAAAAAAGAAGACGAATGACAGCGAAGAAAGATCCCTTTTACAAACGATATCTAGAAGGAGATCTAACAGTAGGTCTACTTGGAGAAGATAATTCCCGAtatgaatttaTTGTGGAATACTCATCTTAGAAGAAAAAGCAAGAACTCCCTGAAGTCATGATGTTCAATCCAGACAATTTCCCACCATCCGAAGATTTCACTAAGGGTGATATTGCtcatagtccaaAGATAGTTCCAAATACTATCAACTCCTTTGACCCTATTCAAATTACTCAAGCagaaaaagttcTCAACTGGCAAACGGAGAATGCTGTCGCTCAGAATCAACTCCTTCATACGATCAATCAAAAAATAGATCAAACGGCGAACTACTACAACAAAAGATTCAACGTCTTACAGAGCTCCATAACAGAAATTCATGAACGTTTGGACTAGCTGCATCTAGAAATGACGACTATGGCAAAAAACATGCTAGTCAACACTTCAAGTTTTCGAAgcaaagaagctGAGATGTCAAGCCTCAAAAATCAATTAAAAAATCTTCAAAAATGCCTTAAAAGTATGAAGCAGAACAGAAGATCGACAGATGGATTCTTCCCTCCATTCGGGAATATagatacagaacCTTCGTATCAAACATCTTACTCTCTAGGATTCCTTTCACAAGGCAGTACAAGACCAGTCACACCTTCAGCAGGTTTCctgtcatctgaTGAAGTGTTCACATCCCGTTATGCTATGCCATCTTTACCAACTTTCAAGCTAACATATCGGGAGAAAACAAGGAGATACAAAGAAAAAGAAACGCCAGCCCAACcatttataaaaccaattctctcttcctcaccgTCAAGCCACGACTCTTTTGAAGAACAAAAAAGAGGAGAAGACAAAGGAAAAGGCAAGACTGAAGAAATTGGTATCATTGAGTTCTCaatg
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_83Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
3798Start:
971602End:
975399Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_83
GATGAATCCCTTCCAAGACAATTCGCCATAGGTGAAGGAAGCCACactcctaaagaggaacctgacatagatgaagtatattcagatgaagaaatgcgcgattatcgccagttccatggagaaaaTGGGCAACCAAGACAATTTGCCTCAAAAGTCATCACATTCACATTTGATGTCATTCCGTTTAAAAAATGGAATGATTATCTTAATGAATTCTATGTATGGATGACTTCTGAAGCCCTTacttcaccaaCACATATCGTCATTCAACAATTCACTGCTCGTCTTTCTAGAGCATTAAAGGAATGGTGGAACTCTCTTGGAGATTACagacaaatgcaAATCCATCAAACTACCATTCTACTACTGTTAGGAGAAATTCATAGAGAATTCATCGgcactcctaatCATATCAAAGATCAGTTACAAGAAGAATATTTTGTGGCAAAATATTATTCTCTCCGGAAGAAAGATCTGGCAAAACACTTAGAAAGACAGACAAAAAGATAATATGCCCTTGATGGTCTTAACAATCCAAGTTTGAAGCACGTCTATCTttcatccattCCCAACTATCTCAGCCAACAAACAAAACTCTATATCAGAGATCAAAACCAGACGATTGAAGAAATCTCCATTGGCTAAATCCAACAATACGTCTTTAGATCACTTGACAAACTCTGTAAACAAAAAGAGTTTTGGACGGAAttcatggacaaCTCAAAGCATCTAACGAAGATATGTTCCAAATCCAACTTATTCATCAAGTGTTCCAAAAAAAAATCGTGTTCGTGTAGCGACCGCAAGAACTTTCATAAGATTAAGAAGTTCTCAAAAAAGCCTCTATTCAGACGCAAAAGATTCTTTAGACGGAAAAAAGTTTCAAAAAAACAACAAAATATTTTCTCTGTCGCAGAGAAAGACACTTTGCAAAAAATTGTCCGAACAAATCCAAGAAGAAGATGCAGTATCTCGTCAACTCCATATCCAGCATAGCGCCAGAACTTGATCTCGATCACTATGATCTTGAGTCAATTTTATCTTATGACAGCGATAAAAATGATGTGATATGCGGATATTCAGACATAGAAGAAGAAGAAATATCATTTGAAGAAGAAAAATGCTACAAGATTACAAAATTACCTAGACAAGAAGAATAACACACAACACCACATCTTTCTGTCACGGTTTTTGATCCAGACAAGAAAATACGACCAGTCCAcataattgcaTTCATCGACACAGGAGCCCACACATCAATTATGAATCCAAAGGTGCTTCCACCAGCAATGTGGttaccgtatcaACAAGAATTCAGAGTAGCAAATGCAGGCTCTTTCAAAGTTAAACTCAAGTCTAAGCCAATAATCATTGAAGTCTTTCCAGGAtgtcaaattacaACACAAGTTCTTGGATCAACTGAACCAGGGAAAGATATCATATTAGGATGAGATTGCTACTACAAACTCAAGAAAGATTATGACATCTCTATTGAACCAcgaggtgtaaaATGGAACAATTCCTTCAAACCATTTACAAATATACCAAGAATCTTCTCAGTTGAAGACCTCATGATgtctgagttcaACAACATCAAAGAAGAAATCGAAAACGTCTCATGTGCGGATTCACACAGCAACTTCCTACAAAAATGCAAAGAACCTTTGTGGCTCAATTCAGAATTCTTTGTATCACTTCCTTTcaaagagaatgTGATCACTACGCCAACTAAGGCAAGTCATGCAGGAATGCCTCTAACATTACTTCAACAAGAAAATGAAGAATGCGACCAACTTATTAACCAAGGAATAATCTCAACAACAAATTCATTATGGGCGTGTAAGGCCTTTTATGTCAATAAAAGAGCAGAACAAGCAAGAGGAAAACTAAGACTTGTAATTGATTACAAGCCACTGAATAAAATTTTTCAAGACGTCAAGTTTCCACTTCCGGCAAGAAAGGCGTTGTTACAACACCTCTCCGGGGCAACTATTTTCTCTAAAATCGATTTAAAATCTGGATTTTGGCAACTTGGAATCAAACCAGAAGAAAGACACAAGACGGTGTtctgtcttccCAACCGACATCTAGAATGGAAAGTCCTACCTTTTGGATTAAAGACAGCTCTGTCCCTGTTCCAGTAAGTGATGCTAAAAATATTCAAGCCATGGTTCACACAGCCATAATCTACATCGATGATATCCTCTTATTttccaaaaccgAAGAAGACCATGTCAAGACTCTAAAACAGTTTCGTGATCTGGTTCGAAAACATGGAATCATGCTCACGGCAAAAAAGATGACCGTAACTCAACCAACGATTGATTTCCTTGGAGTCAAGATTACAGAAGGATAATTTACACCACAAGCCCATTTAGATACATAACTACTCTCCTTCCCCGATGAGAATCTGACAAAACGACAAGTGCAATAATTTCTTGATGTAATCAATTGTATCGGCGACTTTATTCCAAAGCTGTCACAGCTgactcagccatTGAGAAAGCTGTTGCAAAATAATCCCCCACAATGGAGTAAATGACAAACTGACACGGTCAAAAAAGCTAAAAGAAGAAATTCAAAAGCTACCACCTCTAAACATTCTCTCTACTGGAAAAAGAATCCTACAAACCGACGTAAGTGACAAATATTGGGGAGCAATATTATTTGAAGACATCGACAAGACAAGACAAATTTGTGCCTACAAAAATGGACGTTTTAAGGAGTCAGAAATGCACTATCACTCAACGTTCAAAGAGATTTTAGCTGTTAAAAGAGCTATTGAAAGATTCGAGTTCTACCTGATAGGacataaattcaAAATTGAAATGGATATGTCATCTTTTCCAAAGATGCTCTAATTCAGTCAGAAGATGGTTCCTCATCAGTAGTTACTACGATGGAGTGAGTGGTTCTCAAAGTATGATTTCGACTCTGCCtatttaaagggcacgaagaacatcctagcagacatgctcagtcgtaaaccactaaacactatctatacaatgacGAGCAAACCAAGTTCCAGCTCTTCATCAATAAGAGATCTCTACGACTTCATCGACAACATACTTGAAGATGCAAAAGATCTTATCAAATccgaacaattcCACAACCGCGTCAATCAAAAGATTTTTAGATACTAGTCCATCATCGTCGCCAATCATGACAGTGAAAATCGGTACATATCACCACTTGGTATCCATCCTGACAACCCATTTGCTCACCTCTACAGAATCCAGAATgtcaacctaccCGAAGAAGTTCTATGTTTCCTCTGGTACCTTTATGCAGTATACACTATTGGAATTATCTTTGATATTCCatggatgtacCAATACATCCACAGCCCGAGTTATGCAGCCAACAACCTTTCAACCTTCCTAGGATGGTTCGCTACAATGAATGTCTGGAGTACCAAGCTCCGTAACTCAGCAAAAACGCTCAACTACCCTTTCAAGAAGTTAAGAAGCTCAaccagctacaatCCATTCTTCAATCCACATACCATCTACTTCTTCAAGCGACCTATCAACATTAATCCAAAATCTGGAAAGGTCTACGCGATACTTACTTTAATCTATCACAAGAATTTCAACAAAAGAATACGTCCAGATTTCAATATGGCAGACAATGAAGCCttcgaagccttTCAGACTCATGCATTTAACCTCAACAACGTAACACAGAAGTTTGATATTCCCTACAAACCAAACTGGTTAttttatgaaatTGACTATCAGATGACGCTTGATGAAAACCTCTAATGGTTCATGTTAAAGCAAGAACAAGAAG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_84Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
757Start:
975624End:
976380Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_84
ATGAAGTAAAGTATGTGTGATGGATGGGGTGAGTGCTTATGCAAGCAACTTAATCATCTCCTATAAATAAGTGTGTATCCCCCCTGTGTAAGACACAACTTTCATTCTATAAATATTTTCTCTCTCTAAACTCTCATGTCTATCTAAATTCTCTCTAAGTTTTCTAGATCTCAATATCTTCATAAGCTTTGTTTCTTCCTCTCATCACaaattagggaTCCGATGTTTCTTAGGTCTAGGTAAGCAAAGTAAAGTCTCCAATTTATGAAAGTATTCTAGAGTCTCCGGTCTAAACAACACGACGGCCAATACGGGCTTTCGTGGAGGGTAATCTCTAAGAGTGGcttgagtcatGGCTGGATAAGTGTTAGCGCCTACGTATACTCGCCTTACTTGAGATGAACCGCCATGTCTGTCCAACACGACTTTGTCAATACGTTTAGATATGTGAAACTCTCATACATGACTTAAATCTGTGTGACCCTCTTGCCTATCTTTTATCAATTTGGTATCAAAGCCCAACACTTGTGTATGTTTGGGATAATTATTGTTTATGTTGATTGTTCGAGTTTCTGGAAAACTTAATTCTCATTATCATGTCTGATCTTCAAGTTATTCATTCCCCTTTTCAAATTTCTACCTTACCCCAAAATAAAAACAAGCATTTTCGTCTAAAATAGATTCCCTTTATGAGGTTGAATATGTTCCGggagatcgtcaCCCCGAAACTACTCTTCCTCTTATAAATCCTTATGAA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_85Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
938Start:
976408End:
977345Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_85
CCATCTTCCaccagaaaagTCAAGGAATATGTTCAAGCCAGCAAATTCTCTTCCTCCCAAGTTTCAGCGACCGAAGAAGAGCAGTTCAtatcacttgaaATCCCACCGCATCTTCCACGGCTCGGGCAATACCAAGGGTTCACACACCTACACTTTGGTGTTGTGTGGATCGGTCTCACCTTACATGCTCGAAAAGGATTACTGGTCACAACACGAATTGCTTTAATCGACTCTAGACTAAAAACATATCAACAAGCATGTATTGGCACCGTTCAAACTACCCTAAACACAGGAACTGTTTTTGTAACACTATTCCCTAACTTTAATATCTCTTTGAAAGATCCTAATCTTTTAAAAGTACTTAAAGTTCAGTTACAAATTGTTGGCGCACCTATGCAAGAAATAAGTATGATAGCTACGCTTCATCATCAAATTGTTTATCGGGTCCAAGATCatgcccttgatctagtcctcccttcatcagaagaagcactgtttcttgaagtcacatcagCTTCTCAAGCTCCAAATGCCATCCAAATTCCTCGCCAAATATCACGAGAAAAACTAATATAGAAGCTGCCGGAATCATGGGTGACCAgttatgaaaagCTCCATCAAGCACCACAAGGACCTATCTAAACGACTGAAGCAATATTCCAGTCAAGAAATGATGTTCACGCAGTTTTCTATCCAAATCGATGAACGAGAACTGCAAGGGCATTACAAAGAGCAATATCCAAAACCAAGCTCTTTtgagaaagatgGATCATTCGTATATCCATTCAAAGATGAAAATGGATATTGTTTCTTCGACGTCTGTAATTGTACAGTTTGTGAAGAAGTTGCTTATGAATCTGACGATGAAAAAAGAAGACGAATGAGAGCGAAGAAATATCCCCTTTACAAACGACTACAAACGTCCACTTGGAGAAGAT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_86Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
205Start:
978142End:
978346Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_86
AGGAAGaaacaaaacttatgaagaTGTTGAGATCTAGAAAACTTAGAGAGAATTTAGAGAGACATGAGAGTTTAAAGAGAGAAAATATTTATAGATGAAAGTTGTGTCTTACATAGGGGGTACACACTTATTTATAAGAGAGGATTAAGTTGCTTGCGTAAGCACTCAACTCATCCATCACACATACACACCTTATACATTACTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_87Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
3376Start:
978794End:
982169Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_87
ATTGGAGGTCTTCATCAAGCGTCATCTGTTAGTTAATTTCATAAAATAACTAGTTTGGTTTGTAGCGAATAACGAACTTATGTGTTGCGTTGTTAAGGTTAAATGCATGAGTCTGAAAGGCTTCGAAGGCTTCATTGTCCGCCATATTGAAATCTGGATGTATTCCTTTGTTGAAATCCTTGTGATGGATTAAAGTAGGCATCGCGTAGacctttccagattttggattgatgttgataggtcgcttgaagaagtagatggtatgtggattgaagaatggattgtagctggtTGAGCTTCTTAACTTCTTGAAAGGGTAGTTGAGCGTTTTTGCTGAGTTACTGAGCTTGGTACTCCAGACATTCATTGTAGCGAACCATCCTAGAAAGGTTGAAAGGCCATTGGCTGCATAACTCGGGCTGTGGATGtattggtacatCCATGGAATATCAAAGATAATTCCAATTGTGTATACTGCATAAAGGTACCAGAGGAAACATAGAATTTCTTCGGGTAGGTTGACATTCTGGATTCTATAGAGGTGAGCAAATGGGTAGTCAGGATGGATACCAAGTAGTGATATGTACCGATTTTCACTGCCATGATTGGAGACGATGATGGACTTGTATCTGAAAATCTTTTGATTGATGCTGTTGTGGAATTGTTCGGATTTGATAAGATCTTTTGCATCTTCGGGTATGTTGTCGGTGAAGTCGtagagatctctTATTGATGAAGAGCTGGAACTCAATTTGCTCGTCATTGTATAGATAGTGTTTAGTGGTTTACGACTGAGCATGTctgctaggatgttattcgtgccctttaaataggcagagtcGAAATCATACTTTGAGAACCACTCACTCCATCGTAGTAACTGCTGATGAGAGACCATCTTCTGACTGAATTGGAGCATCTTTGGAAAATATGACATATCCATTTCAATTTTGAATGTCTTATCAGGTAGAACTCGAATATTTCAATAGCTCTTTTGACAGCTAATATCTCTTTGAACGTTGAGTGATAGTGCATTTCTGACTCCTTAAAGCGTCCGTTTTTGTAGGCACAAATTTGTCTTGTCCCGTCAATCTCTTCAAATAATATTGCTCCCCAATATTTGTCACTTGCgtcggtttgtaGGATTCTTTTTCCAGTAGAGGGAATCTTTAGGGGTGGCAGCTTTTGAATTTTTTCTTTAAGCTTTTTGACCGCGTCAGTTTGTCGTTTACTCCACTGTGGGGGATTATTTTGCAACAGTTTCTCAATGGCTGAGTCAGCTGTGACAGCTTTGGAATAAATTCGCCGACATAATTGATTACACCGAGAAATTGTTGCACTTGTCGTCTTATCAGATTCTCATCGGGGAAGGAGAGTAGTTCTGTAGCTAAATGGGCTTGTGGTGTGAATTGTCTTTCTGTAATCTTGACTCGAGCATGATTCCATGTTTTCGAACCAGATCATGAAACTGTTTTAGAGTCttgacatggtcttcttcggttttggaaaataagaggatatcatcgatgtagattagggctgtgtgaaccaatgacttgaatatttttagcatcgcttactggaaCAGGGACGGAGCTGTCTTTAATCCAAAGGGTAGGACTTTCCATTCTAGATATCGGTTGGGAAAACAGAACGCCGTCTTGTGTATTTCTTCTGGTTTGACTCCAAgttgccaaaatCTTGATTTTAAGTCAAATTTTGAGAAAATCGTTGCCCAGAAAGGTGTTGTAACAATGCCTTTCTTGTCGGAAGTGGAAACTTTATGTCTTGAAGAAATTTATTCAGTGGCTTGTAATCAATTACAAGTCTTagttttcttcGTGCTTGTTCTGCTCTTTTATTGACATTAAAGGCCTTACAAGCACATGGTGAATTTGTTGTTGAGACTATTCCTTGGTTAATGAGTTGGTCACATTCTTTATTTGCTTGCTGAAGTAATGCCGGAGGCATTCCTGCatggcttgccTTAGTTGGCGTAGTGATCACATTCTCCTTGAAAGGAAGTGATACAAAGAATTATGGATTGTGCCACAAAGGTTCTTTGCATTTTTGTAGGAAGTCGCTATGTAAATGTACACATGAGACTTTTTCGATTTCTTCTTTGATGTTGTTGAACTCAGACATCatgaggtcttcaactgagaagagtcttggtatagttgtgaatggtttgaaggaattgttccattttACACCTCGTGGTTCAATAGAGATGTCATAATCCTTCTTGAGTTTGTAGTAACAATCTCATCCTAATATGATATCTTTCTCTGGTTCAGTTGATCCAAGAACTTGTGTTGTAATTTGACATCCTAGAAAGACTTCAATGATTATTGGCTTAGACTTGAGTTTAACTTTGAGGGAGcctgcatttgctactctgaattcttgctgatacggtaaccacattactggtggaagcacctttggattcaTGATTGATGTGTGGGCTCCTGTGTCGATGAATGCAATTATGTGGACTGGTTGTATTTTTTTTCTGGATCGAAAACCGTGACAGGAAGATGTGGTGTTGTGTGTTATTTTTCTTGTCTAGGTAATTTTGTAATCTTGTAGCATCCTTCTTCTTCAGATGATATGTCTGAATATCCACATATCGCATCATTTTCATCGATGTCATAAGATAAAATTGACTCAAGATCATggtgatcgagATCAAGTTCTGGCGCTATGCTAGATATGGAGTTGATGAGATACTGCCTCTTCTTCTTGGATTTGTTTGGACAATTTTTTGCGACAGAGAAAACATTTTGTTGCTTTCTTGAAACTTCTTTTCCGTCTAAAGAAtcttttgcgtcTGAATGGAGGCTTTCTTGAGAACTTCTTGGTCTTATGAAAGTTCTTGCGGTCGCTACACGAACACAATTTCTTTTTGGACACTTGATGGATAAGTTGGATTTGGAACATATCTTCGTTAGATGCTTTGAGTtgtccatgaatTCCGTCCAAAACTCTTTTTGTTTACAGAGTTTGTCAAGTGTTTTGAAGACGTATTGTTGGATTTGGCTAATGGAGATTTCTTCAATCGTCTGGTTTTGATCTCTGATATAGAGCTTCGtttgttggctgaGATAGTTGGGAATGGATGAAAGATAGACGTGCTTCAAACTTGGGTTGTTAGGACCATCAAGGGCATAATATTTTTTTGTCTGTCTTTCAAAGTGTTTTGCAagatctttcttCTGGAGAGAACAACATTTTGCCGCAAAATATTTTTCTTGTAACTGATCTTTGATATGattaggagtgcCGATGAATTCTCTATGAATTTCTCTTAACAGTAGCGGAATGGTAGTTTGATGGATTtgcatttgtctGTAATCTCCAAGAGAGTTCC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_88Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
194Start:
1129586End:
1129779Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_88
ATCGCTAACTTGTGTTTGAAAGAAAGAAACaaaacttatgaagatgTTGAGATCTAGAAAACTTAGAGAGAATTTAGAGACTCATTTTAGAGAGAGGATATTATTTCCGAAAAATGAAACTTATCCTTCCCATGAAGGGGTACACACATATTTATAGGAGAGGTTTAAGCATACTTAAGTAAGCGCTTACCTCA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_89Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
3829Start:
1130191End:
1134019Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_89
TCTTCTTTGataatcttctTTTGGGTATTCTGCTTTTGCTTCTTTCTCTTCTTCTTTTGATATGAAGAAATGGAGGTCTTCATCGAGAGTCATCTGGTAGTCAAGCtcataaaatgACCAATTCATTTTATAAGGAATGGCAAACTTTTGGTATGTGTTGAGGCGGAAAGCATGTAGCTAGAACGACTCAAAAACTTCATTGTCGGCCATGTTGAAATCTGGACGGAATCCTTTGTTGAAATCTTTGTGGTGGATCAATGTTGGCATTGCACAAACCTTTTGTGATCTTGGATTGGGATTGATAGGCCTGTGAAAGAAGTAGATGGAGTGCGGATTGAAGAACGGATTATAAGTATTGGAATTCTTCAGCTTCTTGAaggggtaattgAGTGCTTTTGCTGAGCTGCGAAATTTGGTGTTTCAATCATTCATTGTAGCGAACCATCCTAAGAAGGTGGAAAGACCGTTGGCTGCATATATGCGGTAGTGGATATATTGGTATAACCATGGAATATCAAAGATAATTCTAATAATATATACTGCACAAAGGTACCAGAGGAAACAAATAACTTCTTCTGGGAGGTTGACATTCCGGATTCTGTAAAGATGAGCGAATGGATAGTGAGGATGAATTCCAAGTGGTGTAATGAAGTGGTTGTCAGCTCCGTGGCTGCTCAAGATTATAGACTGGTATCGAAACATCCTTTGCTTGAGGTATAGAATGTTCCGTCTTTGATGATGTCTTTTGTATCTTCAGGTATGTTGCTGCTAAAATCGTAAAGGCTTCTTTTTGCGGAGGAGTTAGGACCTGGGACAGTTGTCATTGTATAGAATGTCTTTAATGGGTTGCGGCTGAGCATGTCTGCTAAGATATTCTTCATGCCCTTTAAAAAGGCGGATTCAAAATCGTAATTCGAAAACCTTTTACTCCAACGTAGCAATTGCTGATGTGGAATTATCTTCTGACTGAACTGTAGCATTTTTGGAAAAGATGACATGTCCATCTcgattctgaatttgtgtccaatcaggtaaaactcgaattttttaatagctcttttgacggctaggatttctTTGAATGTGGAGTGGTAGTGCATTTCTGACTCTTTGAAACGACCACTTCTGTAGCCACAAATTTGTCTATTTTCATCAATCTCTTCGAACAGCATTGCTCCCCAATACTTATCACTGGCATCggtctgaattaTTCGTTTTCCTGTAGAAGGAATCTTTAGGAGTGGTAGCTTATGTATTTCTAGCTTTAGCTTTTTGACTGCTTCAGTCCGTCGTGTAGTCCACTATGGAGGATTCTTTTGGAGCATCTTTCGCAAAGGCTGTGTCAGTTGGGACAGCTTTGGAATAAAGTCACAAACGTAATTGATTACGCCTAAGAATTGTTGTACTTGCCTTCTCATCAGGTTTTCATCAAGGAAAGAGAGTAATTACGTGGCAAGGTGAGCTTGAGGTACAAatcttccttcaTTGATCTTGACACCAAGGAACTCGATATCTTGTTGTGCTATAATCATCTTTTTGCTGAGAGCATGATTCCATAATTTTTTactatatcatgAAATTGCTTCAGAGTTCGGATATGCTCATCTTTACTTGTAGAGAACAGGAAGATGTCATTAATATAGATCAACGTTGTGTGGACCAATGGCTTGAATATTTTTAACATTGTTTGTTGGAACAAGGACGAAGCTGTTTTTAGACCAAAGGGTAgaactttccatTCAAGATGGCGATTAGGTAGACAAAACGCCGTTTTGTAACTTTCTTCTGGCTGGATCCCAAGTTGCCAATACCCTGATTTTAAATTAAACTTTGAGAAAATGGTTGCTCTTGATAGGTGTTGTAGCAATGCTTTTTTTGTTGGCAGTGGGAACTTGATATCTTGGAGGAATTGATTTAGAGGCTTAAAGTCGATGACTAGCCGTAATTTTCCTCGTGTTTGTTCTGCTCTCTTGTTGACATAGAAAGCTTTGCAAGCCCATGGTGAATTCGTTGGTGAGACTATGCCTTGTTTGATGAGTTGTTCGCTTTCTTCATTTGcctgttgtagtAACGCTGGAGGCATCCCTGCATGACTTGCCTTTCTTGGTGTAGTGATTACATTTTCTTTAAAGGGAAGAGATACAAAGAACGCCGGATTAAGCTATAATGACTTCTTGCATTTTTGGAGGAATTCACTGTGAGAATCTGCACATGAGACGTTTTCAATTTCTCCTTTGAtgttttcgaactttaacaccattggatcttcgattgtgaagagtcttgggatggttgcaAAAGCTTTGAAGAAACTTTTCCATTTAACTCCTCTAGGCTCGATGGAGATATCAAAATTTTTCTTTAATGCATAATAGCAATCCCATCCTAGGATGATATCTTTGCCAAGTACTTGAGTCGTTATCTGGCATCCTCGAAAGACTTCTATGGTGATTGATCTTGATTTGAGTTTGATCTTTAGAGAACCCGCATTtgcaactctgaACTCTTGCTGGTATGGTAACCACATGGATGTCGGAAAGACTTTTGGGTTCATGATCGAGGTATAAGCCCCAGTATCTAAGAAAGCAATAATATGGACTGGACGCATCTCTTTTTCTGGATCAAAAATTGTTACAGGGAGATGTGGTGTCTGTACCTCTTCTTGCTGTGGAATTTCTGTAATTTTATAGCATCCTTCTTCCTTTTCAGATGATGATTCGTCGTCTTTAGAATCTAAATATCCGCATATTGCATCTTTTATATCACTATCGTAGGAGAGTATTGATTCAAGATCGTGATGACATAGATAAAGTTCTGGGGCAATATTGGATATCGAATTGATGAGATATTGCTCATATTTCTTGGAATTATTAGAGCAATTTTTGCGAAGTAACCTTCTTTGTGACAGAGGAAGCATCTTGTATTCTCTTGAAAGTGTGTTTTCTTCTATAGAATCGTTTACGCCTGAATGGGGATTTTCTTGGGAGACGCCTTGTTTGTGAGATATTTTCCTGCGTTTATCACATGAGCAAGATTGTTTCTTCGAACATTTGATAGATAAATTGGACTTCGAGCATACTTTGGATAGATGCTTTGATTTGTCCATGAATTTCTGACTAGAATTCTTTCTGCTTGCAGAGCTTATCGAGTGTTCGGAAGACATACTGCTGGATTTGGCCTATGGAAATTTCTTTAACCGCTTGGTTTTGATCTTTGATGTAGAGCTTCGTTTGTTGGCTGAGATAATCGTCTATGGAGGAGACATATACATGCTTCAAACTTAGATTATTGAGACCATCAAGTGCATAGTatctttttgttTGTCTTTCAAAATGTTTTGCCAGATCTCTTTTCTTCAAGAAACAATATTTTGCTGCAAAGTATTCTTCTTGGAGTTGTTTTCTGATATGGTTGGGAGTACCGATAAACTCTTTGTGGATTTCTCCTAGTAatattgggatagtagtttggtaaacttgtaggtgtctgtactctccGAGGAAATTCCACCATTCTTTTAGTGTGCCAGAAAGGCGAGCAGTGAATTATTAGATAACTTGATAAGTTGGTGAAgtaagggcttCGGAAGTCAGCCATGCATGGAAGTCATCAAGACGTTCATTCCATTTTTCAAAGGGAATGTCATCAAATGTGATTGTGATGACTCTTGATGCAAATTGTCTTGCTTTTCTGATATCTTCATGTTGGTCATACTGAAATTGCATTTCTTCGTCATTGGCTATTTCATTGATGTTTGGCTCTTCttttggcatgCTGCTTTCTCCTTGTTGTATGGCAAACTGTTTTGAGAGCGATATATCATCTTCTG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_90Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1629Start:
1134371End:
1135999Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_90
TATAACATAACGAGATGTGAATATCTCATCAGAtgataggaaacCTGGGGAAGGTATTGCTGGTTTTGTTGTATTTTGTGAAAGTAATCCTGGGGAATAGGAACCTTGGTATGAAGGCTCCGTATATAAATTGGTGAAGGGAGGAAAGTATAAATATGTCGTTTTTCTGTTCTGCTTTACTTTCAAGGCATCGTTGAAGATCTTTAAGCTGATTTTTTAGATTTGACatttctgcttctttgcttcgaaagcttgaagtattcaccaacatgttttgtgccattaacaacatctcttggtgtagttagtctaatcggccatggatctctgcgatggagctttgcaaggtgttgaatCTTTTGTCGTAGTTATTCGCCATTTGATCCATTTTGTGATTGATTGTATGTAGAAGTTGGTTTTGAGCTATGTCGTTCTCTGTTTGCCAATTGAGAAATTTTTCTGCTTGACTTAGTTGGTCGAGTCCAGCAGAATTAACTGTACTTGGTATTATCTTCGAGCTATGAGATACATAGTCTTTCGTGAAGTCGTCAGGCGGAGGGAAATTGTTTGGGCTGAACATCATGACTTCAGTAGGTTTTGGATTTTTTTTGTGGAATATTGGACGATATACTTGTATCTTGGATTATCTTCTCCCAAGGGCCTATTGTTGGATCTCCATCTAGATATCGTTTGTAGAGTGAGTCTTTCTTTTCTTTTCGTCTTCTTCTTTTCTCGTCATCAGACTCCGATTTATATTCAGTACAGGCAGTACAGGTGCAGACATCGAAGAATTGATGGCCATTTTCGTCCTTGAAGAGATGTAAAATTGATCCATCATGCTCAAAAGAGATTGTCTTTGGGTATTGGTCTTTGTAAGGGCCATGGAATTCTTGTTCATCAACTTGAATGGACAATTGGATGAACATCGGTCTTCGGGATAGGGATGTTCGCGGCTTCTCGAAttttatcttcgtcgttccatcatttcttggttgaaaagatacttcggaagactgaatggggccttgaggtgcctgatgaagtttttcataacttgttacccatgtttcaggatgcttctgtatgagttcttctcgggatatTTGGCGAGGGATCTGGATAGCATTAGGTGCTTGGGAGGCTGAAGTGACTTCTAGAAATAGTGCTTCATCTGTTGAAGGAAGgaccaagtcaaGAGCATGGTCTTGAACTCGGTAAACCATCTAATGGTGTAATGTAGCTATTACACTTGTCTCTTGTATAGGTGCGCCAACAATCTGTAATTGAACTTTGAGTGCCTTCAAGATATTAGGGGAACAGTGTTACAAAAATTGTTCctgcatttagCGTAGCTTGGACGGTGCCTATACATGTTTGTTGATAAGTCTTGAGCCTGGAGACAACTAAAAGCGATCCATGATGTGACCGGTAATCCTTTTCGAGCATGTAAAGTGAGTCCGATTCGTACAACACCAAAGTGTAGATgtgtgaatccttgctgttgccaaagccttggaagatgttccgggatgtttagtgagatgaatTGCTCTTCTTCGGTGGCTGGAACTTGGCATGAGGAGAATTTGCTGGCTTGGACATATTCTTTGACCTTTCTGGTGGAAGATG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_91Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
296Start:
1136016End:
1136311Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_91
AACACCACGAACAGAAAAGATACTTGATTTCCTAGCGAAGATTTCATAAGGATTTACAAGAGGAAGAGTAGTTTCAGgtaatcgatctcctggaacatattcaacctcataaagaaaatctatattaaaagaggatgcttgatttctgtgtttaggtaaagtAGAAAATTTTAAAGGGGAAGGGATGATTTGAGAGTTAGACATTGATGATGATGGTTAACTTTTTCCAGAAACTCAAACAAACaacataaacaaTGATTCTCACTAACATACACAAATCATGCGCTCTGATACCA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_92Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1390Start:
2351789End:
2353178Strand:
->Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_92
gtaCCTGTTTTGGAGAAATTCTCGAGTCAAAAAATCTGGAATAAAATTTGTTTTTTCTCCTTTAATATATTCTATATCAAAATCGAAAATACTTAGTaatgcctgccATCGGGCAAAAATTTGTTTTGAAGCAAGATTTTTAACATCTTTTGGTAAAACATCTTTGCCGCTTTTACAATCAATTCTTAGTAAAAACTTTTGAtttaaaagatcGCTTTGAAATTTTTGTATACATAAAACTATACTTAATATTTCTTTTTAAATAGTTGAATAATTTTTCTGGGTCTCATTCCAATGAGCATAAGTAAATTGTATTATATTTTTACGACCGGTTGTTTCTTTTTGTTTCAGAATACCCTCGTATCCTATATCAGAGGCATCTTTTTCACAATTTTTTCTAGGTTTGGGTCCGCAATatgcagacatgGAATTTCTAAGACTTGTTTTTTAATCTGTTGGACAAGAGCGGTATGCTCTTCAGTCCAaggggctgggtTTTTCTTTAAACGATCATGTAGTAGTCTACCTATTCTGTTAATATTTGGACAAAAATCTAGaacataatttAGACTTCCTAGGAACCTTTGTAATTGGGTTTTGTCTAAGAGTTTGTTAGAAAATTTATTTGCAAACTCTAATGATCTTTCTATTGGTTTTATCATTCATTTGGATATGTAATGACCAAGAAATCTTATTTTGGTTTGCAAAAAAAGGCATTTTTGTTTTGGAAATAACAAGTCCATTTTTTCGTGCAACATAGTAAAATGCTTTTAGATGTTTAAAGTGTTCATCAAGAGAGTTTGAAAAGATTAGTATGTcatcaatatatattatacaaaattttgagtattctgagaatatgtcattcataattctttgaaattttgaaggtgcattctttaaaccaaagggcatcacgttccattggtattgcccaaaaggaacagtaaATGTTGTTTTATATCGATCATTTTCAGATATTTGGATTTGCCAAAATCCTTATTTTAAATCGAATTTTGAAAATATATGTGTAGAATGAAGTTTTTGAAGGAGGTCTTTTTTATTAGGAATTGGATATCTAATCCattttaatgcTGAATTTAACGGTTTGTAATTTATTACAAGTCTTGAAGTTCCTCTTTCTATTTCAGAATTTTTGTTTATTTAGAAAGCAGAACAAGACCATTGAGATCTTAACTTTGAAATAAATTTTTTGTTTAAAAGTTCTGAAATTTCTCTCTTACAATGACTCTTTAAATCAGAGTTCATCTGAATTGGTCGAGGCTTTGTAGGAATTTCTGTTTCATCAAAATTTTTTTCATAGGGTAGATCAACAATGTGTTGTTTtctatcccagAAAGCAGTTGGTAAATCTGAACATAATTGTTTT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_93Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1113Start:
3120111End:
3121223Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_93
ACTTAAGCAATATTCCAGTCAAGAAATGATGGAACCACATAAATCAAGTTCGAAaagccaagaacatcctctttccgaaggcCACCGTTGTTCACGCAGTTTTCTATCCAAATCGATGAACGAGAACTCCAAAGGCATTACAAAGAGCAATATCCAAAACCAAACTCTTTTGAGAAAGATGGATCATTCGTATATCCATTCAAAgatgaaaatggACATTGTTTCTTCGACGTCTGCAATTGTACAGCTTGTGAAGAAGCTGCTTATGAATCTAACGATGAAAAAAGAAGACGAATGAGAGCGAATAAAGATCCCCTTTACAAACAATATCTAGAAGGAGATCCAAACAAATTCCCACCATCCGAAGATTTCACTAAGGGTGATATTGTTCATAGTCCAAAGATAGTTCCAAATATTATCAACTCCTCTGGCCCTATTCAAATTACTCAAGCAGAAAAAGTTCTCAACTGGCAAACGGAGAatgttgtcgctcagaatcaactccttcatacgatcaatcaaaaaatggatcaaatggcgaacaactacagcaaaagattcaacggcttacagagctccATAACAGAAATTCATGAACGTTTGGACCAGCTGCATCTAGAAATGATGACAATGGCAAAAAACAAGCTAGTCAACACTTCAAGTTTTCGAAGCAaagaagctgagATGTCAAGCCTCAAAAATCAATTAAAAGATCTTCAAAAATACCTTGAAAGTATGAAGCAGAACAGAAGATCGACAGGTGCATTCTTTCCTCCATTCGGGAATATAGATacagaaccttCGTATCAAACATCTTACTCTCCGGGATTCCTTTTAAAAGGCAGTACAAGACCAGTCACACCTTCAGTAGGTTTCCTGTCATCTGATGAAGTGTTCACATCCCGTTATGCTATGCCATctttaccaactttcaagccaatatatcgggagaaaacaaggagatacaaagaaaaagaaacgccagcccaaccatttaaaaaaccaaTTCTCTCTTCCTCACCGTCAAGCCACGACTCTTTTGAAGAACAAAAAGGAGGAGAAGACAAAGGAAAGGGCAAGGCTGAAGAAATTAATATCATTGAGTTCTCAATG
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_94Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
1168Start:
3121375End:
3122542Strand:
+>Scaffold15774_LTR-Caulimovirus_94
CAGAAGATGATGAATCCCTTCCAAGCAAATCCGCCATAATTGAAGGAAGCCACAATCCTAAAGAGGAACCTGACATAGATGAAGTAtattcagatgAAGAAATGCGCGATTATCGCCAGTTCCATGGTGAAAATGGGTAACCAAGACAATTTGCCTCAAAAATCATCACATTTACATTTGATGACATTTCGTTTAACAAATGGAATGATCATCTTGATGAATTCTATGCATGGATGACTTCAAGCCCTTACTTCACCAACACATATCGTCATTCAAAAATTCACTACTCGTCTTTCTGGAGCATTAAAGGAATGGTGGAACTCTCTTGGATATTACAGACAAATGCAAGTCCATCAAACTACCATTCCGCTACTAGTAGGAAAAATTCATAGAGAATTCATCGGCACTCCtaatcatatcAAAGATCAGTTACAAGAAGAATATTTTGCGGCAAAATGTTATTCTCTCCAGAAGAAAGATCTTGCAAAACATTTTGAAAGACAAACGAAAAGATATTATGCCCTTGATGGTCTTAACAACCCAAGTTTGAAgcacatctatCTTTCATCCATTCCCAACTATCTCAGCCAACAAACGAAGCTCTATATTAGAGATCAAAACCAGACGATTGAAGAAATCTCCATTGACCAAATCCAACAATACGTCTTCAGAACACTTGATAAACTCTGTAAACAAAAAGAGTTTTGGACGAAATTCATGGACAACTCAAAACATCTAACGAAGATATGTTCCAAATCCAACTTATCCATCAAGTGTTCCAAAAGGAAATCGTGTTCGTGTAGCGACCGCAAGAACTTTCATAAGTCCAAAAAGTTCTCAAGAAAGCCTCCATTCAGACgcaaaagattCTTTAGACGGAAAAGAAGTTTCAAGAAAACAACAAAATGTTTTGTCTGTCACAGAGAATGACACTTTGCAAAAAATTGTCCAAacaaatccaaGAAGAAGAGGCAGTATCTCGTCAACTCCATATCCATCATAACGTCTGAACTTGATCTCGATCACCATGATCTTGAGTCAattttatcttaTGACAGCGATGAAAATGATGCGATATGCGGATAGTCAGACACGGAAGAAGAAGAAATATCATCTGAAGAAGAAGAATGATACAAGATTACAAAATTACCAAGACAAGAAGAAGAAC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15860_LTR-Caulimovirus_95Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
177Start:
71872End:
72048Strand:
->Scaffold15860_LTR-Caulimovirus_95
TGGAAAAATTCTCGATTCCAAAAATCTCGATCAAAATTTGTTTTTCCTTTAATATACTCTATATCAAAGTCAAAAATACTTAGTAAAGTTTGCAATCGAGCAAAAATTTGTTTTGAATCAAGATTTTTAACATCTTTtttgtaaaacATCTTTGGCACTTTTACAATCAATTCTTAA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold15860_LTR-Caulimovirus_96Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
845Start:
74097End:
74941Strand:
+>Scaffold15860_LTR-Caulimovirus_96
CAATTATGTTCAGACTTACCAACTGTCTGAGATATAAAACAACATTTTGTTGATCTACCCTATAAAGAGAAATATGATGAAAGAGAAATTCATACAAAGGCTTGTCTAATTCAGACGAAATCTGATTTAGATAGTCATTGTAAAAAAGAAATTTTAGAACTTCTAAACAAGAGATTAATTTCAAAATCAAGATCTCCATGGTCTTGTGCAACTTTTTATGTGAATAAAAACTCTGAAATAGAAAGAGGGGCTCCAAGACTTGTAATAAATTACAAACCATTGAATTCTCCATTAAAATAAATTAGATATCCAATACCAAATAAAACATATCTCCTTCAAAAACTACATTCTGCACACGTATTTTCAAAATTCGATTTAAAATCAAGATTTGGGCAAATCCAAATATCTGAAAATGATCGATATAAAACAACATTCACTATTCTTTTTGGACAATACCAATGGAACGTAATGCCCTTTGGTTTGAAAAATGCGCCTTCGGAATTTCAAAGAATTATGAATGACAAACTTTCAGAATATTCAAAATTTTTGTATAGTATATATTGATGACATACTTATCTTCTCAAACTCTCTCGATAAACATTTCGAACACTTAAAAACATTTTACCATGTCGTATGTAAAAATAGACTTGTTATTTCAAAAACAAAGATGTCTTTATACCAAACCAAAATTAGATTTCCTGGTTATTACATATTCAAAGGCATGATAAAACCAAAAGAATGATCATTAGAATTTGCAAACAATTTCTTGACAAACTTTTGGACAAAACTCAATTACAAAGGTTCCTTGGAAGTCTTAATTACGTCTTAGATTTTTTCCAAATATC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_97Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
3344Start:
19453End:
22796Strand:
->Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_97
TATTGTTGGGTAAAGTGGCTAGGAGTTACTAAGGGAATGGATTTAGAGATAGATTTGACTAAAAGTTGGTCGTGGCGACTGGTTTGGAAAAGTGTTTGAATGGTGGATAGGGAGCAACGATCGAGATTGTATTTATCCCACCATTTGACTCGGTATTCTTTGACAAGGGAATATGGCATATCGGGTAGGGTGAGTAAAAGGTTAAAATGCCACGAGCAGATCCATGGGATACCCAGGTCTGCATGAAAGAGTATTTTGGGATAGGGGCCGATGGGTTTTTGGGTTAGGTGTTTGGTGAAGTATGGGTAGGATGTTTTTAGAACTTCAGGTGGATAGATTTTGTCGGAAGGTCCGAACCAATGCCACCATTTATTAAACCATCCGGGTATGTGTTTAGGGAATTTTTGGTCAAAAGAAATGAACCAGGAGTGGTCATAGGGACGTAGGTATAGGAATCTGAGCCAGGCGTTTTGGTAATCTATATAAGAGTAGCCTGGGATTGGAAAACCGGGTTGAGAAAAGGGTCTTGTAGTATGGAGGTGGAGTAGACCAAGGTCGTTGATAGATGCTATACGGAGTATTTTACAGGTGGAGTAAGAGATGAGGTTTGGATTAGTTTTGTCTGGGTAATGAGTTACTTCGATAGATTTTGAGTATACCAGAATATACTCATAGAAGGTTCGGTTTTTGGTTATGTTGTCTgttggatagaGTGTATCTTGATAAAAGGTTCGGTTTATGAACTGCTGGAGTTCTTTGAGTTTAATGGGCTCGGTATGATGGGTCGTCATAAGGTGTTGTTTTTGGGGTTTAAGGAAATAGGTAGATTTGGTTAGTGGCTCTTGGATAGGTTGGGAGGGTTGGCCCTTTTCTGTGGCTACAGCCTTTGAATAGGAAAGAGGTGGAAATTCAGCTAACGCTGAATATTGATTTTGAATAGTCGAGGGTATTCCTTGAAGGTGTGGTTGGTTCTTGATATAATCGGACGAAGTCATAGGTTTTTTTGACTTAGGGTCTGTCATCTTGAATATCTTGTTGATTATCTGTGAATTTACCCTGTAAATATTCACGTGTTAGAAAATCTGGTAAAGAATTATTTTCGCCTTTAATATATTGAAtatcgaaatcaAATACTGAAAGAATAGCTTGCCATCGGGCAAAAATTTGTTTTGATACCAAATTTTTGACATCCTTTTTCAGTATTTCTTTTGCTGATTTACAGTCGACTCGTAATAAAAAAAATTTATTGATTAAATCATCTTGAAATTTGGAAATGCAATTAACTATAGAAAGGACTTCTTTTTTAACAGTTGAATAATTTTTCTGGGGTCCTAGCCAGATTCCAGAATGAAATCTAGCTATTGTTTCTTGACTAGATTCTGAAAGTTTTTGTTTAAGTATGCCACCATAACCTAATTCAGAAGCATCAGTTTCTACAATCATATATGCTTCTGGGTTTGGTATAGTAAGACATGgaagggttttaACCTTCTGTTTAATTTGTTGAACTAATTTTGTATGTTGAATAGTCCAAGGCTTTGGATTTTTTTGTAATCGTtgaaataaaggTTGAATAGTTTTACGGAGATTTGGAAGAAAATCCGAAACATAGTTTAGACATCCTAAAAATCGTTGTAATTGAGTTTTCTCTCTTAACTCATCGGGGAATTTGTCTGCAAATTCTATTGATCTTGAGATGGGAACAATAGTTCCTTGATAAATGTTATGTCCTAAAAATCTTATTTTTGTTTGGAATAAGGACATCTTTTTTGCTGATACTACTAATCCATGTTTTGTGACTATGTTTAAAAATGTTTTTAAGTGATGGAAATGTTGATCGATGGATGTTGAATATATTAATACATCGTCAATatagacaatggtgaatttagaatattgattgaatatatcattcataatatgttgaaattcagaaggtgcatttttaagaccaaaaggcattacattccattcataatgtccgaatggtattgtggatgcagttttgtatttatctttttcggctatttgaatttgccaaaatccgcttttcatatcaaattttgaaTATACTTTAGCATTGTATAATCGTTTTAATAAATCTCGTTTATTGGGTATTGGATATCTAATCCATTGAAGTACATCGTTTAGGGGTTTGTAATtaattactagtCGTGGTACTCCCCGTTCTTTCTCGGCTTGATTATTAACATAAAAGGCTGAACAACTCCAAGGGGATTTGGACGGTCTGATAAGTTTTTTCGTGAGTAGATCATTTATTTCTTGCTTACAAATTTCTAACAATTCCTTATTCATCTGAATAGGTCTTGCTTTAGTGGGTATATTTTTCTCATTGAATTCCTTTATATATGGGAGTTCAACAGTATGCTGTTTTCTTTCCCAAAAGGCGTTTGGTATTTCCGAACATATTTGTTTTACAAGATCAGCTTCGATAGCTTTTATGTTCTCTTTTATATACTGCATATTAAGTTGTTCTTCTATTTTTGAATAAGTTATTTCTTCCTGCAGATGTTGAATATGCTTTTGTTTTCCTTTAATTATGTTTATTGTTTTTTGAATAGTGTTTTGTTGAAGACTTAAAATTTCTTTAGTCTTCATTGGAGATATAAAATTGAATAATAACTTAGTACCTACTACTTTTGTCGATATACCTATTTCAGTTaccttaaaagggtaaatttgagtgaagaaaggagtgcctaatatgatttctTGTGTTAGGTTTTTTACTAAAATAAACTGATTCTTAAAACAGTATCCTTGGTTATATATTTTCGCACATGGTAGTTTATATTGTACCTTTAAACTACTACCATTAGCACCACTTAATCTTTCGGTGGTTTTTTCATAATATTTTGTTGGAATAATTCCTTCacggatacaattgtaatccgcgccagtatccattaaggcaattatgtttattttaaaatcatggcctacatgtaaagtaataTTTGTGTACCATTTTTGATAATTAATTTTATTAATTATTTGTATATAATCTTTATTATCTAATTGTTCTATGTTATTATTAATCTCTGGgttttgattacTTGATGATGCTTGATTATTTTGTGAGTCGATTAGAGATAGTCTTGCGTCTATTTGTCATTGCTTAAGCTCTTGTTGATGAATAAACACCTGTAACTCTTTAATTTGAGCTTTAATCTGCTTAATTTCATTTTGTAATTCGCCGGTTGATACTTGTTTGAATAAACTTTGAGTTGGATATttctcaaatattttatttAGACTAAATGGTTGTGGCGTAGATATTTTAGTTTCTTGATTTATTAAGTCTTTTAATTTTATTAAATATT
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_98Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
263Start:
22816End:
23078Strand:
->Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_98
ATCTATTTTATCTATGATATTAGTAAGAATTGTTTATCTTTATCATTGGTTATAACGTTAATTGTTTTACAATTGCTTAAATTGTCAGATAGTTCCTGTGATTCGGTTGAAGAATCACTTGAGTTTTCAATTTCATTTATTAAGTATTCATCATTAGAATTTTCCGACGATTCTGATTCTGATATTAGAAGTTTGGTTAATCTTTCTTGAATACCAGGTTGATCTTGAAATATTTCATTTATTTTCTTTTTCATCTTGCATTC
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_99Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
240Start:
25659End:
25898Strand:
->Scaffold16335_LTR-Caulimovirus_99
GTTGTTAATTTTGTCATAATTTCTCTTGAATTAATAGTTGATTTAGAAGTAGAAGAAGATGTATGTTTTGGCTTGAACATCTTTCTAAATGATAAAGCTATGGTTATGATCAGAAGAAGTTTTCAAAAGAAACTTACCACTTCTACGGGATCGCTTTTTGCTGGCTTGCCAACGGTCTTACGGCCTACTCCGAGGACTTGCTGCCTGGAACACCATCAACTCCGGCGGTTTAGTAGAAGA
Boechera stricta (v1.2)
ID:
Scaffold1774_LTR-Caulimovirus_100Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-CaulimovirusLength:
184Start:
66194End:
66377Strand:
->Scaffold1774_LTR-Caulimovirus_100
AGGAAGAAACAAAGCTTATGAAGATGTTGAGATCTAGAAAACTTAGAGAGAAtttagagagacatgagagtttagagagagaaaatattttatagaatgaaagttatctcttacataggggggggggggggtacacacttatttataggagaggaTTAAGTTGCTTGCGTAAGCACTTACCTCA