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Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_23 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus186361137975+
Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_24 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3776813511910+
Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_25 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1851237112555+
Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_26 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus743132931133673-
Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_27 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus746133742134487-
Scaffold11842_LTR-Caulimovirus_28 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus280712807+
Scaffold12302_LTR-Caulimovirus_29 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus137813831361384513+
Scaffold124_LTR-Caulimovirus_30 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3751813318507+
Scaffold124_LTR-Caulimovirus_31 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus971881518911-
Scaffold124_LTR-Caulimovirus_32 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1115450151451265+
Scaffold124_LTR-Caulimovirus_33 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3274503220506493-
Scaffold124_LTR-Caulimovirus_34 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3113506601509713-
Scaffold12453_LTR-Caulimovirus_35 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus136571371+
Scaffold12659_LTR-Caulimovirus_36 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1037946593947629+
Scaffold12659_LTR-Caulimovirus_37 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3072947730950801+
Scaffold12659_LTR-Caulimovirus_38 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2508950814953321-
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Scaffold13083_LTR-Caulimovirus_40 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus217777291777507+

< 2 3 4 5 6 > Total 22


Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11214_LTR-Caulimovirus_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

108

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54400  

End:

54507

Strand:

-

>Scaffold11214_LTR-Caulimovirus_21

AAATTTTTCTTTCCAAAAGTATTGGTTTGAATCTTGTCGGAGTAAGACACTAGTGAGAAAGGTGTTTTTGTACCATTGGAAATCACTTAGTGTTTTACATTTAAGATT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

296

Start:

5802  

End:

6097

Strand:

+

>Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_22

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Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1863

Start:

6113  

End:

7975

Strand:

+

>Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_23

CCATCTCTCACCAGAAAAGTGAAGGAGTATGTTCAAGCCAGCAAATTCTCTtcctgccaagtTCCAGCGACCGAAGAAGAGCAGTTTATATCACTTGAAATCCCATCGCATCTTCCACGGCTCTGGCAACAacaagggttcaCACACCTACACTTTGGTGTTGTTCGGATCGGTCTAACCTTACATGCTCGAAAAGGATTACCGGTCACGGCACAAATTTCTTTAGTCGATTCTAGACTAAAGAcatatcaacaAGCATGTATTGGCACCGTTCAAACCACCCTAAATGCAGGAACAATTTTTGtaacactgttCCCTAACTTTAATGTCTCTTTAAAAGATCCTAATCTTTTAAAGGCACTTAAAGTTCTGGTACAAATTGTTAGAGCTCCTATGCAAGAAACAAGTATGATAGCTACAGTTCATCATCAAATTGTTTATCGGGTCCAAGATCATGCCCTTGATCTAGTCctcccttcatcagaagaagcactgtttcttgaagtcacatcagcttctcaagctccaaatgccatccaaattccttgccaaatatcatgagaagaactaatccagaagctaccggaatcatggGTGACCAGTTATGAAAAGCTCCATCAAGCACCACAAGAACCTATCCAAACGACTGAAGCAATATTCCCGTCAAGAAATGATGGAACCACAAAAATCAAGTTCGAAAAGCCAAGAAGATCCTCTTTCTGAAGACCACCGTTGTTCACGCAATTTTCTATCCAAATCGATGAACGATAATTCCAAGGGCATTACAAAGAACAATATCCAAAACCAAGCTCTTTTGAGAAAAATGGATCATTCGTATATCCATTCAAAGAAGAAAATGGACATTGTCTCTTCGACGTCTGCAATTGTACAGCTTGTGAAGAAGCTGCTTATGAATCTGACGATGAAAAAAGAAGACGAAGGAGAGCAAAGAAAGATCCCCTTTACAAATGATATCTAGAAGGAGATCCAACAGTAGGTCCAGTCGGAGAAGATAATTCCCGATATGAATTTATTGTGGAATATTCATCTCAGAAGAAAAAGCAAgaactccctgaAGTCATGATGTTCAATCCAAATAACTTCCCACCAGCCGAAGACTTCACTACGGATGATATTGCTCATAGTCCAAAGATAGTTCCAAATACAATCAACTCCTATATCCCTGTTCAAATTACTCAAGCAGAAAAAGTTCTCAATTGGCAAACGGAGAATGCTGTCGCTCAAAATCAACTTATTCATACGATCAATCAAAAAATGGatcaaatggcgAACAACTACAGCAAAAGATTCAACAGCTTACAGAGCTCCATAACAGAAATTCATGAACGACTGGACCAGCTGCACCTAGAAATGATGACTATGGCAAAAAACATGCTAATCAACACTTCAAGTTTTCGAAGCAAAGaagctgagatGTCAAGCCTCAAAAATCAATTAAAAGACCTTCAAAAATGCCTTGAAAATATGAGGCAGAACAGAAGATCGACATATGCATTCTTCCCTCTATTCGGGAATATAGATACAGAACCCTCGTATCAAACATCCTACTCTCCGGGATTCCTTTCACAAGGCAGTAAAAGACCAGTTACACCTTCAGCAGGTTTCCTGTCATCTGATGAAGTATTCACATCCCGTTATGCTATGTCATCTTTACCAACTTTCAAACCAATATATCGGGAGAAAACAAGAAGATACAAAGAAAAAGAAACGCCAGCCCAACCATTTAAAAAATCAATTCTCTCTTCCTCACCGTCGAGCCACGACTCTTTTGAAGAACACAAAGGAGGAGAAGACAAAGGAAAAGGCAAGATTGAAGAAATTGGTATCATTGAGTTCTCAATG

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3776

Start:

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End:

11910

Strand:

+

>Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_24

GATGAATCCCTTCCAAGACAATTTGCCATAGGTGAAGGAAGCCATACTCCTAAAGAAGAACCTGACATAAATAAAGTATATTCAGATGAAGAAATGCGCGATTATCGTCAGTTCCATGGAGAAAATAGGCAACCAAGACAATTTGCCTCaaaagtcatcaCATTCACATTTGATGACATTCCGTTTAACAACTGGAATGATCGTCTTCATGAATTCTATGCATGGATGACTTCTGAAGCCCTTACTTCACTAACACATATCGTCATTCAACAATTCACTGCTCGTCTTTCTGGAGCATTGAAAGAATGGTGGAACTCTCTTGGAGATTACAGACAAATGCAAGTCTATCAAACTACCATTCTGCTACTGTTAGGAGAAATTCACAGAGAATTCATCGGCACCCCTAATCATATCAAAGATTAGTTACAAGAAGAATACTTCGCGGCAAAATGTTGTTCTCTCCAGAAAAAAGATCTTGCAAAATACTTTGAAAGACAGACGAAAAGATATTATGCCCTTGATGgtcttaacaacCCAAGTTTGAAGCACATCTATCTTTCATCCATTCCCAACAATCTCAGCCAACAAACGAAACTCTACATCAGAGATCCAAACCAGAAGATTGAAGAAATCTCCATTGGACAAATCCAACAATACGTCTTTAGAACACTTGACAAACTCTGTAAACAAAAAGAGTTTTGGACGGAATTTATGGACAACTCAAAGCATCTAACGAAGACATGTTCCAAATCAAACATATCCGTCAAGTGTTCCAAAAAGAAATCGTGTTCGTGTAACGACCGCAAGAACTTTCATAAGTCCAAGAAGTTCTCAAGAAAGTCTCCATTCAGACGCAAAAGATTCTTTCGACGGAAAAGAAGTTTCAAGAAAACAACAAAAGGTTTTTTTCTCGCAAAGAAGGACACTTTGcaaaaaattgtCCAAACAAATCCAAGAAGAAAGTGCAGTATCTCGTCAGTTCCATATCTAGCATAGCGCcagaacttgatCTCGATCACCATGATCTTGAATCAATTTTATCTTATGATAGTGATGAAAATGATGCGATATGCGGATATTCAGACTTAGAAGAAATATTATCTCAAGAAGAAGAATGCTACAAGATTACAAAATTACCAAGACAAGAAGAAGAATACACGACACCACATCTTCCTGTCACGGTTTTCGATCCAGACAAAAAAATACGACCAGTCCACATAATTGCATTCATCGACACTGTAGGCCACACATCAATCATGAATCCAAAGGTGCTTCCACCAACAATATGGTTACCGTATCAGCAAGAATTCAGAGTAGCAAATGCAGGCTCTCTCAAAGTTAAACTCAAGTCTAagccaataatCATTGAAGTCTTTCCAGGATGTTAAATTACAACACAAGTTCTTGGATCaacagaaccagGGAAAGATATCATATTAGGATGAGATTGCTACTATAAACTCAAGAAGGATTATGACATCTCTATTGAACCACGAGGTGTAAAGTGGAACAATACCTTCAAACCATTCACAACCATACCAAGACTCTTCTCAGTTGACGACCTTATGATGTCTGAGTTCAACAACATCGAAGAAGAAATCGAAAAAGTCTCATGTGCGGATTCACACTGCAACTTCCTACAAAAATGCAAAGAACCTTTGTGGCTCAATCTAGAATTCTTTGTATCACTTCCTTTCAAAGagaatgtgatCACTACGCCAACTAAAGCAAGCCATGCAGTAATGCCTCTGGAATTACTCCAACAAGTAAATGAAGAATGTGACCAGCTCATTAACCAAGGAATAGTCTCAACAAAAAATTCACCATGGGCGTGTAaggccttttatGTCAATAAAAGAGCAGAAAAAACACGAGGAAAACTAAGAATTGTAATTGATTACAAGCCACTGAATAAATTTCTTCAAGATGTCAAGTTTCCACTTCCGACAAGAAAGGCGTTGTTGCAACACCTCTCCAGGGCAATTATTTTCTCAAAATTCGATTTAAATCAGGATTTTGGCAACTTGGagtcaaaccaGAAGAAAGACACAAGACGGCGTTATGTCTTCCCAACAGACATCTAGAGTGGAAAGTCCTACCCTTTGGGCTGAAGACAGCTCCATCCCTGTTCCAGCAAGCGATGCTAAAAATATTCAAGCCATTGGTtcacacagccCTAATCTACATCGATGATATCCTCTTATTTTCCAAAACTAAAGAAGATCATGTCAAGACTCTAAAACAGATTCATGACCTAGTCCGAAAATATGGAATCATGCTCGCGGCAAAAAAGATGACCATATCTCAACCAACGATTGATTTCCTTGGAGTCAAGATTAAAAAAGGTCAATTCACACCACAAGCCCATTTAGCTACATAACTACTCTCATTCTCCGATGAGAATCTGACAAGACGACAGGTGTAACAATTTCTCGGTGTAATCAATTATGTCGGCGACTTTAttccaaagctGTCACAGCTGACTCAGCCATTGAGAAAGCTGTTGCAAAAGAATCCCCCACAATGGAGCAAACGACAAAAAGCTAAAAGAAGAAATTCAAAATCTGCCACCCCTAAAGATTCTCTCTACTGGAAAAAAATCCTACAAACCGACGCAAgtgacaaatatTGGGGAGCAATATTATTTGATGAGATTGAAGGGACAAGACAAATTTGTGCCTACAAAAGCGgacgctttaagGAGTCAGAAATGCACTATCACTCAACGTTCAGAGAAATTTTAGCTGTCAAAAGAGCTATTGAAAGATTCGAGTTTTACCTGATAGTTTATAAATTCAAAATTGAAATGGATATgtcatcttttcCAAAGATGCTCCAATTCAGTCAGAAAGTGGTCCCTCATCAGCAGTTACTACGATGGAGTGAGTAGTTCTCAAAGTATGATTTCGACTCTGCCTATTTAAAGGgcacgaagaaCATCCTAGCAGACATGCTCAGTCGTAAACCACTAAACAGTATCTATACAATGACGAGCAAACCAAGTTCAAGCTCTTCATCAATAAGAAATCTCTACAACTTCACGAGCAACATACCTGAAGATGCAAAAGATCTTATCAAATCCGAACAATTCTACAACCGAGTCAATCAAAAGATTTTCAAATACCAGTCCATCATCTTTTCCAATCATGGCAGTGAAAATCGATACATATCACCACTTGGTATCCATCCTGACTAcccatttgctCACCTCTACAGAATCCAGAATGTCAACCTACCTGAAGAAGTTCTATGTTTCCTTTGGTACCTTTGTGCGGTATACCCTATTGGAATTATTTTTGATATTCCATGGTTGTACCAATACATCCACAGTCCGAGTTATGCAGCCAATAGCCTTTCAACCTTCCTAGGATGGTTCGCTACAAAGAATACTTGGAGTACCAAGCTCCGCAACTCAACAAAAACGCTCAACTACCCATTCAAGAAGTTAAGAAGCTCAACCAGTTACAATCTGTTCTTCAACCCTCACATCATTTATTTCTTCAAGCGACCTATCAACATCAATCCAAAAACTGGAAAAGTCTATGCAATGCCTACTTTAATCCATCACAAGGATTTCAACAAAAGAATTCGTGCAGATTTCAATATGGCAGACAATGAAGCCTTCGAAGcctttcagacTCATGCATTTAACCTCAACAACGCAACACAGAAGTTTGCTATTTCTTAGAAACCAAACTGGTTATTTTATGAAATCGACTATCAGATGACGCTTGATGAAGACGTCCAATAGTTCATGTCAAAGCAAGAATAAGAAG

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

185

Start:

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12555

Strand:

+

>Scaffold11774_LTR-Caulimovirus_25

TGATGTATGAGGTAAGTGCTTATACAAGCAAATTAATCCTCTCCCTATAAATAAGTGTGTACCCTTCCTATGTAAGGAACAACTTTCATTCTATAAAATATTTTATCTCTCTAAACTCTCATGTCTCTCTAAATTCTCTCTAAGTTTTCTAGATGTCAACATCTTCATAAAATTTTTTTCTTTCT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

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Start:

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133673

Strand:

-

>Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_26

TGTATTGTGTTTTGTTGGAGATACAAAATTTCTTTAGATTTCATTGGTGATAAGAAATTAAATGATAATTTCGTTCCTACTACTTCTGTTAttatacctaaCTCTGTTACTTTAAATGGGTATATTTGAGTAAGGAAAGGTGTACCTAATATATTCTTGAGTCAGATTTTTTACTAGAATGAATTGATTTTTAAAGCAATATTCTTGATTACATATTTTTACACTGGGTAATTTATATTATATTTTTAAATTACTTCCATTAGCGCCACTTAAACGTTCAGTTATTTTTTCATAATATTTAGTTGGTATTAATCTTTCACGAATACAGTTATAATCCGCTCCGGAATCTATTAAAGCTATTGTATTTATTTGAAAATTATGTCCTATgtgtaaagtaatattagtgtaccatttttgatagtttatattattaatattttggatatagttattttcttcttcaatattttgattacttgttgaagcttgagattttgttgtttctagtaaatttaaacgagcatcgatttgtagttgattcagattttgttgattaacagcaagttgtaattcTTTGATCTGGGTTTTTAATTGCTTAATTTCGTTTTGTAATTCTCCTGTAGGTACTTGCTTAGATAAACTTTGGGATGGATATTTTTCAATTATTTTATTTAGACTAAAGGGTtgtggattttgtaattgatttTCTTGATATACTATATCTTTTAGTTTTAATAAATATT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

133742  

End:

134487

Strand:

-

>Scaffold11793_LTR-Caulimovirus_27

GATATAACATTAATTACTTTACAATTACATAAATTATCGGATAATTCTTGAGATTCCGTAGAAGAATCATTAGAATTTTCTATATCATTTATTGAATAATTACCTTCTGTATCGCTAGATAATTCTGAATCTGATAATAATAATttagttaatttTTCTTGTATGTCAGGTTGATCTTGAAATATTTCATTGATTTTCTTTTTCAATTTACATTCTTTTGAGGTATGGTCGGGTCTTTTACAGTTCCAGCAAACTAATTTTTGTTTTGGTTTATAATTTTTTTGTATTTTTTGAATAATTTTTTGttttagaataATAGTTACTGTTTGGTTGTTGATTATATAGTTTATATTTTTTATGGTATCTATTGTTTCTTTGTTTATATtgtatacgtttTACTCTAGAAGGTGGATTAAGTCTACTATAACCATATTGTTCACAGAATGAACCCATAGTTAAATTGAGCTTAAAAATTTTACTTCGTTTTTTGTCTTTATGTTCTTGGCATATTGATAATCCTTCTTTTTTAACAAaggcaaataaTTGTCCATATGTTATGGTATTCCAGGGGATTGGTTGTCCACCAAAATAGTCATTTAGTTTGTTGATTATTCTTtctgcaaagaaAGACGGTAATCCGGAGATAAACCGTTTTTTCCAGAAAGATTGATTACAATCATGCTTTTGGAATATATTGGTTATAAATATAtctttgtaccaTTTAAAATCGCCTAATGTTGGGCATC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold11842_LTR-Caulimovirus_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

1  

End:

2807

Strand:

+

>Scaffold11842_LTR-Caulimovirus_28

TCTAAATCAACTATTAATTCAAGAGAAATTATGACAAAATTAACAACTTTTGATCATGCAATAACCCAAAATAAACTACCTCATATTAATCCAGAAAATATATATCAAATCGGAACGTTCGATTTCAAGACTGCTTATTCAATAAAAGAACATGAGCAAACTTTATCTCTTCAGAATGAATTTGAGGAAATCAAGCTATTATCAGCACTTACCTTAGACAAGTATAAACAAAAGGGATTTAATTACCTCCATTTGGGACTTATTCAAATAGCTATTAAACCCCTATCAAGAACAGGCATCGATCAACCAATACTAATGCTATTAAGGGATAAGACTCTTTTGAAATTTGAAGATTCGCTTCTAGGAGCGGTTCAATCAAATTTATGCAATGGAGCGATTTACTTTAATTGCGCCCCAAATTATCAAATCAGCTTACATGACCCAACTATACTCAACACTTTAGTATTAAACGTTCATTTACCAGAAATGAAATTCCAAAAAGAACGACATGGATATCTATTATTATATCGTATCTATTTTAAACAATCTACCTCTGAGTTTAATCCAAGATGTTTATTACAAGATAATAAAGGAGAAACAACTATATTAGCAGTCCATGGTAATGATACTCCCACTGCTACCTATGCACCTAAACAATTAAACTGGAATGAAATAACCATTCCAGATCAATGGAAGATAGAAATTACTCAACCACCTAGGAACTTTGAACAAAAAAGAATATCAAAAATAGTAGAACAAGATGACGGAAAAATATTATTACAATTTGGATCATTCAGAGATCCACTACCTCCTAGAATTAGTACATATTATTCTAATTCGAGAGCCTCTTGTTCTGAATTTCGTACTGAGCAATCTAGTGTTAGTTCAGATACAGAAAGAGTTAATCAAACTACTAGGCAAGATAATTCAATCAGATTCAAGGCTCCTATAGCGGAACCAGATCAATTAAGATATCCAACCTCTCCTACGCCATCAGATTTCAAATCTATTAATGTAATAATAAAAGAATATACGATCAATAAACAATATATTAAAGAAGACTTTTATTCAAATAATAATAATGAAAAAAGAATTTGGTATTTCAAAACATTTTCTAAACAACAAACAAATAAATTTAGACAAGAATGGTATAAACATATGATGGAAAAAGAAATAGATATTCCATTTTTTACTTGGTTTGAAACCTATGCAAATATGAATAATATTAACTATCCCTTTAAGACAATCAACACCAGTTCAACCCTAAGTCAAATATGGGAAACTATAGATGGTAGTAAAACCAAATCAGTTCATCCACCATTAAGAGATTTAAAAATAACCACATCTAATAGACAAGTTTTAGATACGCCTTTTAAGACAGGAGCTAACCAAGATGACAAAAACCCAGTAACCTAATCAGACATTAAAGCTGTTTATCAACAGAACAACTATCAAAGCCAATTACTTCATACTATATCAAAACAAATAGATCATATCGATAATAAAATAAATGAGAATGATAAATTAGCCTCTAATAATCAACCTACTCAACATCCCTTTTCATCTGTAACACCACCATTGTTCAAACCAATAACTAGACAAGTTAAATTCGGAGAAAATGAAATTTTAAAGTCAATAGCCAATAAACTAGAAAAATTAGATAAAGGCAAAAATATAAATATGATAGGAGAAAATGACAATGAATCTATTCAATCAGCTATACAAACAGAAAGTGATATACAAGAAATTAATCGAATAAAAAATAAAAATATGAGATCTAATAAACCATATTACTCAAGACATTCCCCACCTGATCAATTATTTGAAGAACATCATAAATATTCTAGTCATATGTATTCAGGAAACGGCATATATGAATGGAATATAGATGGAAAGTCTGAATATGAAATAATGAGTCTATTACAAGAAATGGGTATGGCAGTTATAGCCTTCAAAGCAACTAGTACATCATTAACAGATAAGCAAGCATGTATTATGTTATTAGCAGGATTTACTGGAGCACTAAAATTCTGGTGGGATAACTCGCTAGATCCAATAACACAAAACTCTATAATCAACCATGTTGAAACCATTCAAACAAAAGATGAAGATGGTTTCATTATAGAAACTGAAAAACAAAATGCTGTAGAAGTATTAATCCATACAATTACGATGCATTTTATCGGTAACCCGACTGATGAATTAGAAAGCAAAAAGATAGTATTAACCAATTTAAGGTGCCCAACTTTAGGAGATTTTAAATGGTATAAAGATGTTTTCATAACCAACATATTTCAAAGAAATGATTGTAATCAAGCTTTCTGGAAAGAACGATTTATCGGGGGATTACCAACTTTTTTCGCAGAAAAAGTAATTAATAAATTAAAAGAACTTACTGGAGGACAACCTGTCCCCTGGAATACTATAACATATGGTCAATTATCTGCATTCGTTAAAAAAATAGGGCTATCAATATGTCAAGAACAAAAGGACAAAAAACGTAACGATAAATTCAAATTTAAAATAACCATGGGTTCATTTTGTGAACAATATGGTTACGAAAAATTTAATCCACCTTCTAGGACTAAACGTATTAGTCATAGAAATAGAAAACCCAATAATATAGAATATTACAAAAAACGAAAAAATTTCAACAATTATACCAAGCAGAACTATTCCAAAAATAAAAAGGGTTTCAATTCAGCAAATAAACAAAAAATAGTATGTTGGAATTGTAAACGACCCGGACATAAGTCCACAGAATGCAAGATGAAAAAGAAAATAAATGAAATATTTCAAGATCAACC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold12302_LTR-Caulimovirus_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1378

Start:

1383136  

End:

1384513

Strand:

+

>Scaffold12302_LTR-Caulimovirus_29

CAATTATGTTCAGATTTACCAACTGCTTTCTGGGATAGAAAACAACATATTGTTGATCTACCCTATGGAGAAAAATATGATGAAAGAGAAATTCCTACAAAGGCTCGTCCAATTCAGATGAACTCTAATTTAGAAAGTCATTGTAAGAAAAAATTTCAGAATTTCTAAACAAAAAAAATAATTTCGAAATCAAGATCTTCATGGTCCTGTGCAGCTTTCTATGTGAATAAAAATTCTGAAATAGAAAGAGGGACTCCAAGACTTGTAATAAGTTATAAACCTTTAAATTCGGCAATAAAATAGATTAGATATTCAATACCAAATAAAAAAGATCTCCTTCAAAAACTTCATTCTGCACACATATTTTCAAAATTTGATTTAAAATCAGGATTTGGCAAATCCAAATATCTGAAAATGATCGATATAAGACAGCATTCACTGTTCTTTTTGGGCAATACCAATGGAACGTAATGCCTTTTGGTTAAACAAATGCACCTTCAGAATTTCAAAAAATTATGAATGACATATTTTCCGAATATTCAAAATTTTGTATAGTATATATCGATGATATAGTTATTTTCTCAAACTCTCTTGAAGAACATTTCAAACGCGTAAAAATATAACTATGATGCATGAAAAAATAGACTTGTTATTTCAAAAAAAAAAATGTCTTTATTCTAATCAAAATTAGATTTTTTGGTCATTACATATCCAAACGTATGATAAAACCAATAGAAAGTTCATTATAATTTGTTAATAAATTTCCTGACAAACTTTTAAACAAGATTCAGTTACAAAGATGCCTTGGAAGTCTTAATTACGTCCTAGATTTTTGTCCAAATATCAAtagaatagctAGACCACTACATGATCGTTTAAAGAAAAACCCAACCCCTTGGACAGATGATCATACTGTTCTAGTTCAAAAAATTAAAATATAAGTCTTAGAGATCCTATGTCTGCATATAGAGGACCCATATTTAACAAAAATTGTAGAAATAGAAGCTTTTGATATAGGATACAGGGCTATTCTAAAACAAAAGGAAACAACTAGTCGTGAGAGTATAATACAATTTACTTCTGTCCATTGGAAGAAACCCCAGAAAAATTACTCAACTATTAAAAAAgaaatattaagTATAGTTTTATGTATACAAAAATTCCAAAGTGATCTTTTAAATCAAAAGTTTATTCTGAGAATTGATTGTAAAAGCGCCAAAGATGTTATACAAAAAAAGTTAAGAATCTTGTTTCGAAACAAATTTTTGCCCGATGGCAGACTTTATTAAATTTTTTTTATTTTGATATAGAATATATTAAAGGAGAAACAAATTTTATTCCAAATTTCTTAACTCGAGAATTTCTCCAAAACAAGTAC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold124_LTR-Caulimovirus_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

375

Start:

18133  

End:

18507

Strand:

+

>Scaffold124_LTR-Caulimovirus_30

GAGGTAAACGCTTACATAAGCGAATTTATCATCTCTTATAAATATGTGTGTACTCCTTCTATGTAATTCACAATTTACATTCACTAAATAATATATTCTCTCTCTAAGTTTCTCTCTCATGAGTTTCTAAGTTTTTTTCTAGTTTTCTAGATCTCAACATCTTCATAAGCTTTGTTTCTCTCTTTCATACATAAGTAAGCGATCGAAGTATTATTAGGTTTAGATAAGTATTGTAGAGTCTCCTATCTAAACAACACGACGGTCAATACGACTTTCATGAGAGGAAATTTATAACAGTGGTTGGGTCATACCTAAGAGTTAGCGCCTATGTATGCTCCATTTACCTGAAATCATTCGTGTCTGTCAAACACGACT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold124_LTR-Caulimovirus_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

97

Start:

18815  

End:

18911

Strand:

-

>Scaffold124_LTR-Caulimovirus_31

TTACTTTATATCTTGTCGTCGATTCGTTCAATGCTCCATCTCGAATTCGAACATGTGTTCGTCGCAACATCCGTAGTGATCGTTAGGACATTTGTAC

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold124_LTR-Caulimovirus_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1115

Start:

450151  

End:

451265

Strand:

+

>Scaffold124_LTR-Caulimovirus_32

TTTGTATTCGATTTTGATATTCAATACATAAAAGGCGAAAATAATTCTTTACCAGATTTTCTAACCAGAGAGTATTTACAGGGTAAAACAAGTGATATTCAACAAAGTAACCAAGATGAGTGAATCAAAGAACAAAAAACCGATGGCAGCATCAGACTATATCAAGAATCAGCCCTATCTCCAGGGCAAACTACTTACTACTCAAAACCCTTTTTCGGTACTCGCCAAATTTCCACCATTATCTTATTCCAAAGCAGCAGCAGCAGAAGTCAATCCTCATCGACACCTGCTCAAGCTTCTACCCAATCAACAACCAAGTCGACCTATTATTCAAAACAACAAAAACAACACCTTATGACCACCCAATTCACCAAAaccattaccctCAAAGAACTCCAACAATTTACCAAAAGAGTCTTCTATGATGATAGCCTCTACCTCACCGACAACCTCACCAAAAACCGTACCTTTTATGAGTATGTTCTAGTAGACTCTAAGTCGGTCGAAATTACCCATTATCCAGACAAAACCAACCCTAACCTCATTTCCTACTCCACCTGCGAAATTCTTAAAATCAGTTCTATCCCATACCTTGGCTTTATTCACCATCATACCCAAAAACCATTTTTCACTCCTGGCTACCATATTCCGGGATATACCTATGTTGATTACCAAAACGCCttctttcgaaCCTTCTATCTTCGACCTTACGACCACTTTTGGTTCATATCCTTTGATCTAAACTGTCCTAAATCAATcccaggatggTTTAACGAATGGTGGTACTGGTTCGGACCTTCTGACCCGATCTACCCATCAGACATACTCAAAACATATTCCCCCCCACTACCTCAAACACTTACCTCCACAACCGATCAGTCCATTATCCAAAATCTCTTTCCACATTGACATGGGcattccttggaTTTGTTCATGGCATTTTAACCTTGCACTTCATCTACCCGATATGCCTTACTCCCTCATCCGCGAATTCCGCATTAAATGGTGGGATAAGTACAACCTTGGCCGGTGTTCTCTAGCCAACATCTCTCGCTTCTTCGAAATTCATCATCAACTCCATACCGCTATCAAAGTTGTCTCCAAATCTGTATTTT

Boechera stricta (v1.2)

ID:

Scaffold124_LTR-Caulimovirus_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3274

Start:

503220  

End:

506493

Strand:

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>Scaffold124_LTR-Caulimovirus_33

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Boechera stricta (v1.2)

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Boechera stricta (v1.2)

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Boechera stricta (v1.2)

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