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Chr1_LTR-Copia_42 RetrotransposonsLTRLTR-Copia480667043576709162+
Chr1_LTR-Copia_43 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16267091636709324+
Chr1_LTR-Copia_44 RetrotransposonsLTRLTR-Copia74167194566720196+
Chr1_LTR-Copia_45 RetrotransposonsLTRLTR-Copia43567201816720615+
Chr1_LTR-Copia_46 RetrotransposonsLTRLTR-Copia18868804976880684-
Chr1_LTR-Copia_47 RetrotransposonsLTRLTR-Copia14169474486947588-
Chr1_LTR-Copia_48 RetrotransposonsLTRLTR-Copia21071631267163335-
Chr1_LTR-Copia_49 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10473944197394522-
Chr1_LTR-Copia_50 RetrotransposonsLTRLTR-Copia9274287407428831-
Chr1_LTR-Copia_51 RetrotransposonsLTRLTR-Copia43977147077715145+
Chr1_LTR-Copia_52 RetrotransposonsLTRLTR-Copia44077173567717795+
Chr1_LTR-Copia_53 RetrotransposonsLTRLTR-Copia170877177957719502+
Chr1_LTR-Copia_54 RetrotransposonsLTRLTR-Copia239577197137722107+
Chr1_LTR-Copia_55 RetrotransposonsLTRLTR-Copia44077221087722547+
Chr1_LTR-Copia_56 RetrotransposonsLTRLTR-Copia17877427167742893-
Chr1_LTR-Copia_57 RetrotransposonsLTRLTR-Copia12780531688053294-
Chr1_LTR-Copia_58 RetrotransposonsLTRLTR-Copia38881601788160565+
Chr1_LTR-Copia_59 RetrotransposonsLTRLTR-Copia12283764508376571+
Chr1_LTR-Copia_60 RetrotransposonsLTRLTR-Copia22885781028578329-

< 3 4 5 6 7 > Total 128


Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

161

Start:

6704196  

End:

6704356

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_41

TGTTATGAATAAAGATGGATGCCCATTATAAGGCCATCATCGAAGTCCATCATCTAGATGTTTCTAGGGTTTTACCCTTTCCTTGTACTCCTATATAAAGAACCCTTTATCTCAATGGAATAACACACTCATTTCCTCTATCTCTTTCTCTGTTTATAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4806

Start:

6704357  

End:

6709162

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_42

CGTTATCAGCACGCTCTAAAAGGTAGATATAGAGATTCTTACATCTTTTTAAGAACCATGTTTACTTATCGACTCATGGTTCATAGTACTTATTTTCTATTATTGAAACAAAACAATATGAGCCGATCGATGATTATAGTATAGATCGGTAAAAGCATGTTTTCAATGATTCAATAAAGAAGAGAATCATGCTTATCATTTGTTTCTATAATTACTATCGCATGATTTAATGATTCTACAAAGAAAATCGTTAAAGAAGAGAATCATGCTTGTTAATTGTTAATTTTTGTGATTTACTATTACAATATTGAATATATAAATTACCAATTTTATAATTATATAACTAATTTTGTAACTATTCATAGCCCGGTGGTGGGTGATGCAAGCATGTATTAATGTTTTAGCATTCCAGTTTTGAATAGTTGCATCTATATTCAATATCATTTTATAAATATTATATTGTCTAAAATCTATTTATGATTGATATGATATCCCTTATTTAACTCCTTTGATTAAAACTTTATACATATCTTATCACTTTTAGATATTGACTTTTCCATATTAAATATTTGATTTCCATATATTTGATTGTATTATTATTATTTTTACTAAAAACGTTGCAAGATAATTTTTCTTTTTATAAGATTCCATATATCTAAATCTTTGTGTTATTATTATCTAAATCTTTTTATAAGATTTTCATATATTTGATTGTGTTATTATTATTTTTACTAAAAACGTTGCAAGATAATTTTTCTTTTTATAAGATTCTTTTCTCTAAATCTTTGTAGTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTGTTCATGGTTTTGCCCTAATTTTGCACGAAATCATTTTACCCAAATCTTGCACGAATTCATATTACCCTAAATAAAAATTTTGTCAAGATATATGTAAAATCCAGATTTTGCACAAAATAGTTTTATTCTGATTGGTTTTACAATATTGCATTAAAATTGTATTAGTATATAATACTTGATTATTTTATGAAATAAATTGATTGATAAATAACTTAATTTAAAGGTATAATCACTTATAGAAATTTTCATGAATGACTAGTTTAATGTATCTTAAGAAGATATCATATTTTTGATGGTCAAAGTTTTTTCAAGAACTTAAATTATCACCAGAAGTTGAGAAAATAAATATGGTAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAATTTCTAACGATGAAATAATCTAGTATATCAAGTAGTATAAACTCTTATTAAAAGACTTTAGATGAGCATATACATTGTTTTCTATGAGAATACAAAATTAAAATCATCGATGCGGTATAATTCTCCAAATTTTAAAGTTAATATGATGAGATATAAAATACATTATGATTATAGAGTGGAATTAAAAACGAGATGGATGAACTTGAAGTTTCATCATTTCGAGAAGGAGAAGTAATGAATCTCACATGGATAATAAGTGACATATCCAGAAGATTATGTTCAATCTTTGACTACTAAAGATCTAAAAGTTGTATAAAGCAATTCTTATACGAATGTGTTATTAGATAAAATAAGTTATAATTAATTATTTCTGAAACTTCAAGACTTGAAGTCTCTTTGTGAATATAACTCACATTGTTAAGAGAATATCTATGATGCAGAGATGGTAAAACAGACGCTTAAACTTTTACGCAAGTATTGTTGTCCTGTAGACACAATATTTTGAAAGAAATTTTGAGAACTAATATAAACTTAAATCGAGTGTTTTTCAAAGGCTAAGAAAACATATGAGTTATCGATGATAAGTAATACTCATATTCTGAAGTGAATATAAGATCTTACATAGTTAGTCAAATTTAATATCGTTTATACTAGAATATAAAATTTTAATTATTATCTCGTTATTGTTTTATTAACATATGATTGATTATTAAAATACATAGAAGTAATTTTGATTATAAGATCTCATTAAGGGAGTAACTGATAAGCAATGAAAAGTAAATTAGAAGTTTTGAAAGAACTAGAAGTTTCAAAAGAACTAAAAGTTTCAAAAGTATATTTGGCTTAACCGGATTGGTCATCCTGGTTTAATGATGATGTGAAAGTATTGAGAATTATGTGGACATTAGGTGAAAAACCAGAAGATTCTCCCTAATGATTTATCAAATGTTACTTGCTCAGAAAGCAATATGATAATGTGATTTTTACCAGTGTAAGTAATTTGAACTTTATCTATTCGTAAGTATATACAAGGAGATGATTATGGGTTGATCACCCACTATATGACATTTAGATACCTAATGGTTATAAAAGATGCATCGATTCAATGGACGCATTGACTCGATTGTTGCATCGACAAGAAGGTCATATTTATCCTTGTTATAAACCTGCAACATAGAGTTTGCGAGATTACTTTCTTGATTAAAGTACAAGAGTATTTCAGTGTTTATTTATAATAACCATTATTGGATATCCGTTGGGATAAGTGTTTAACATTTTGAAATTCATGTTCATACACAAAATGGTTTAGTAACATCGATACGCATCAAGCCAATGAATAATTAATAGTTTTCCCCATTATTATTGGTTTTGGGTCAGAAACCAAATAGTTTTCATCTAAAAGCTTTGAATGTGAAAAGTGCTCCACCACAGCACGCAGAGATGAACCCTCAAAGGAGGATAAGAATACATGTTGGATATGAATGATAACTAAGCCATCCTAGAAGGATTTATATACCGCTCGTTTTGAAGACTATCATATTATATAGTCAGCTATTCCAACATAATGGGGAGAATGTATACAGCTGGTGAAAAAGATAAATAGAAATGAATTATCAATGATCCTCGGAGTAAAGAATGTATATTAAGAGTCCAAAAGATAATTCAATTACAGAATTTAGCATTGTAATTGCCAGACGCATTTGCTAACCCAAATAAAGTGATGAAGTCACTTATACCAGTTGTAAATTAAATGCTCCAGAATATAATGAATGTCCTGTAAGGACCAATTTTAAACTGCTATTGAGTCTTAAGATCGCATGAAACGTAATAGACCTTGGTTCCAAATATAAATATCCTCGTAAAAGTGAAGGAGCACAAAATTAAGAATGACCAAAATTGAGGAAATAAATATTTTGATGATCTCTTGAAGAGAGTGAATGATCTCTAAAAGAGACATAAACATGACAAATGAAACATTCAAGTACTTGACAATGACGAGATCTAGCTAGCTATGTCATGTCAAAATATAATGGAATCAAAAGCAAATCGACGTCGTAATATATTTGCATGCTATGAGCAGTTGATATTATAGACAAAAAGAAGGATCATGAAAGAAAGTCTATTGAAAAGTGTACACAAAGTAATGATTAGCCAAAAATGGAAAAGAAGAAATAGACATATAATTATAATCTCTAGTAGAGATATTTGGACTAGTAGTCTATGCACATGATGTGTAAAACGAGTGGAAAATAAATGAGTCTTTATGTGAAAGAATAGTGAAATTAATGAGATTTTCACAAAGATAAGAAATGTATTATGAAGAGATATATTCTCTTGTGGTGGATATAATATTTTTTTTTAAGTATCTAAAGTCTGACAATAAGAGACGGAACACTGGATATGACATTTATATGAAATTCTTGAAAGATATAATCTCTGAAGGATTAATTATATGAGAATTATGTTCTCTAGAACTCTACTCGATCGAATAAAAAGAAATATATAACATGGCATATAATCATATAAATGTATATTTATGTTGAGTTTGTCAAAATATATTGATCAAACTAATATTTGTTTTGAAAATCATTAAAACTCCTACAGAGTTATCATAAGTAATACGATGACAATAATGTATGATAAAATATCACTAGATAATGATATTTATAAGTCTATATGAAAACCAATTAATTTTGATCATTAAGATTATGGTTATTAATTCCAACGAGATATTGTATTTGATTGAAAATCATCTCCTGAAGAAGATGTTTCCGAGGGGGAGATTGAATGATATGCGTGTATGTACCCTTTTTCCTTATAATAGTTTTTATCCCACATGATTTTTTTATGACAAGGTTTTTAACGAGACATTAAAGAACACGCAAATAATACACTTGATAAATATTAAGAAATTCTATCAATCATCCAAATGAATATTATACACTAATGATATTTAGAGAAATAAATAAGATGGTCAAGATGAATCATCTAAAAGATTCATGAGCTGCAGAAGAATGGCGTTGTACTTTATCTAGAAATTTGTTCAAGAGAAGATTTGGCAGACTTATTCTCAAATACTGTTTATTCTCTGCCACATCTTCTAATCATGCAGAGATTTTACCAATTCATGAAGCTCCCCGCGAGTGTGTATGGCTAAGATCCATAGTTCACCATATACAAGAAGACTGTGGTATGTATGCAGGGAAAAAGACTCTAACAATTATGTACGAAGACAATGCAGCATGCATCGCACAACTCAAAGACGAATACATCAAAGGCGATAGAACAAAGCATATCCTACCAAAATTCTTCTTCACACATGATCTACAAAAGAGCGACGATGTACAAGTTCTACAGATCCGTTCGAATGATAATCTGGCTGACTTATTCACCAAGGCGCTACCAACTTCTACTTATTCATCGTATCGGATTACGCCGTCTCAAAGATCTCGACGAATATACTCATAAGGGGGAGTAATTGTGTGTTGCACTCTTTTTCCCTTAACCATGGTTTTTCCCATTGGGTTTTCCTGGTACGGTTTTTAATGAGGCAACATTTCAAATACTTTACGAGTTATGATACTATAATGGTCATCAAGGGGGAG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

162

Start:

6709163  

End:

6709324

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_43

TGTTATGAATAAAGATGGATGCCCATTATAAGGCCCATCATCTAAGCCCATCATCTAGATGTTTCTAGGGTTTTACCCTTTCCTTGTACTCCTATATAAAGAACTCTTTATCTCAATGGAATAACACACTCATTTCCTCTATCTCTTTCTCTCTTTATAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

741

Start:

6719456  

End:

6720196

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_44

TCAAGCTCCCCTCGCACCTGCAGATCTCGTTGGGATTAGTGGTCTAAACGATGATGATTGGAAATTGTTACAACACATGCTTGCAGAGCGCAAGAACAAGTCAACAGAACGTCTCTCCGGTAAGTTTTTCTTTGAATCATGGATCATTGATACAAGCGCGTCGAATCATATGACGGGTACACTTGAGTTTTTGCTTGATATACATGGCATGGCACCTGTTTTGATAAAACTTCCGGATGGACGGTTCACAACCTCCACAAAACATGGTCGTGTTTTGATGGGTTCTTCATTAAGTCTCCAAGATGTGTTCTTTGTTGATGGGCTTCATTGTCATCTCATTTCAGTATCACAATTGACTAGAGACAGTGGATATATGTTTCAGATAACTGACAAGGTTTGTGTTATTCAAGACCGCATCACGAAGACGCTGATTGGCGCAGGTGAACAGCTTAATGGTCTTTATTTCTTTAGAGGATTGGGAGTTGCAGCGCCTGTTCAACACAAAGATTCTACACCCATCGATGTGTGGCATAGACGTCTCGGGCATCCATCTTCTAAAGCTATGGAGATGTTGAAATTCTCAGATTTTAGTAGTAGTGGTTTTGATTCAAAAGATTGTGAGATTTGTATTAGTGCCAAGCAGACAAGAGATTCGTTTCCTTTGAGTTCAAATAAAACAAGTTTTGCTTTTGAATTGATTCATTGCGATCTATGGGGTCCTTATCGATCATTCTGCTTGTG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

435

Start:

6720181  

End:

6720615

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_45

GATCATTCTGCTTGTGAATTCTCGCGACGATCTCTCACGGGCTGGTTTATACAACTAGGTGGTTCTCCTATTTCGTGGAAGACAAATAAACATGATGTGGTCTCACGTTCTTCCGCTGAGGCTGAATACAGGGCCATGGCTGACACCTTCAGTGAGTTATTATGGATCCGTCAGTTACTAAATGTTTTAGGAATTGATTGTTCACAGCCTATCACACTACACTACGATAGCTTGTCTGCAATTTAATTGGCTGCCAATCCGGTTTATCATGCAAGGACAAAACACGTTGGCCGTGATGTTCATTTCGTCCGTGACGAGATAATTCGTGGAGTAGTAAAGACAACGCATGTCAATACAAAGTCTCAGCTCGCCGATATCATGACTAAAGCTCTTGGTCGAAAGGAGTTTGAAGAGTTCCTTTGCAAGCTAGGTATT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

188

Start:

6880497  

End:

6880684

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_46

TATTAACACCGGTGAAGTTCCGGTGTAACGGAGAAGAAGAACGGAGATATAACGACTTCTTATTAACAGCTGAAAAGTGTTTGTTACAACTTAATCAATGATCTAATGTGATCTTAAACTTATATAAACAACACAATAACTAACATTAAACCAACACCTCAATAACCGGTGTTAACCGGATCTAACCA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

141

Start:

6947448  

End:

6947588

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_47

TACAACATTGTTGTAGCGTCATCAAAGCTTGGAAATGGTTGGCGATGCTTAATCATGTTGATGTTGTTATCAAATTTGGAATTTAAGTCATTTAAAACGTACATAATCAGAGTTCGATCTGAAACAAGGGTATCGATATTA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

210

Start:

7163126  

End:

7163335

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_48

CAATTTGTTTGTGTTATTGATCACGATCGAATGTGTACAACATAAATACAGAGCCTTTACAACAGAACCCGTAAACTCAGGAAAATCTATACATTTGAGAAGATCTAACTCTATCTTTCGATGCACAATATCAGCATCTGTTAAAGCATATTCGTTGTTGAGTAACCCAAGAGAAGACCAAACATAACCGGTCTTAACCATCCTCTAATA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

104

Start:

7394419  

End:

7394522

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_49

TTATCATTTTTCTTTAATATCTGAATTTATTATTTATTGTAAATTATGAGATTGTTATATAGATAATTCTATCACCGATAATTTCTTTCGATCCTTATTAAATT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

92

Start:

7428740  

End:

7428831

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_50

GGTTTCGCGATGGTTCCGTCGATGAAACCGATTTTGCTCTTGCTTTGAAGGAAAATGACAAAATCAATCTTCCACATGAAGTAGTTATCTTC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

439

Start:

7714707  

End:

7715145

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_51

TGTTGAAAGTTAAACTTGATTTTGAATAAGTTTAATTATTGGATCAATTATCCAATAATTAATTATGGCCAAATCCAAGTTCTAGAGTTTTCTCTAGAAATATCATCATTTCCACCTCCTTAAAAGATTCTAGAAATTTTCTAGAATCATCTTCCACCTCCTTAAACATAAAAATCTAGATACTCTAATAGAATAATCTAGATAATTTGAATAATGTAATCTAAATCTTATGTAAGAACTCTCTAGACTTAGGATTAAAATATTTTAGATATTTTGTAGTTTGGAGGCTATAAATACCTCCTCCCCCTCTCAAATGTTGCAATGTTGTGAAGTTATCTTCAAGTTTAAAGCAAAGTAATAAAAGTTATATTTCCTAAAAAACTCTCTCAAAACACTTAAACACTTTCTCCATTACCTCTAAAAGAATTTTACTCTAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

440

Start:

7717356  

End:

7717795

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_52

TGTTGAAAGTTAAACTTGATTTTGAATCAAGTTTAATTATTGGATCAATTATCCAATAATTAATTATGGCCAAATTCAAGTTTTAGAATTTTCTCTAGAAATATCATCATTTCCACCTCCTTAAAAGATTCTAGAAATTTTGTAGAATCATCTTCCACCTCCTTAAACATAAAAATCTAGATACTCTAATAGAATAATCTAGATAATTTGAATAATGTAATCTAGATCTTATATAAGAACTCTCTAGACTTACGATTAAAATATTTTAGATATTTTGTAGTTTGGAGGCTATAAATACCTCCTCCTCCTCTCAAATGTTGCAATGTTGTGAAGTTGTCTTCAAGTTTAAAGCAAAGTAATTAAAGTTCTATTTCCAAAAAAACTCTCTCAAAACACTTAAACACTTTCTCCATTACCTCTAAAATAATTTTACTCTAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1708

Start:

7717795  

End:

7719502

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_53

AAAGTGGTAGCAGAACTTGAAGATCCTAAAGATGGCGAGTAACAATGTTCCCTTCCAAGTCCCGGTGCTCACAAAGAGCAACTATGATAATTGGAGTCTACAAATGAAGGCTATCCTAGGAGCACATGACGTGTGGGAGATAGTCGAGAAAGGTTTCATTGAACCGGAGAATGAAGGTAGTCTTTCTCAAACTCAAAAGGATGGTTTGAGAGACTCAAGAAAGAGAGACAAGAAAGCTCTCTGTCTAATCTATCAAGGATTAGATGAAGATACGTTCGAGAAGGTCGTTGAAGCTACGTCGGCGAAAGAAGCATGGGAGAAGCTTCGAACCTCTTACAAAGGTGTCGATCAAGTCAAGAAAGTACGTCTTCAAACTCTAAGAGGAGAATTTGAAGCACTACAAATGAAGGAAGGTGAACTCGTCTCCGACTACTTCTCAAGAGTGTTGACGGTTACTAATAACCTTAAAAGAAACGGAGAGAAGCTAGATGATGTGAGAATCATGGAGAAAGTTCTTAGATCATTGGATCTAAAATTTGAGCATATTGTCACCGTCATTGAAGAAACAAAAGATTTAGAAGCTATGACAATAGAGCAACTTCTTGGGTCATTACAAGCTTATGAAGAAAAGAAGAAGAAGAAAGAAGATATCGTCGAACAAGTCCTCAATATGCGAATTACAAAAGAAGAAAACGGCCAAAGTTACCAAAGAAGAGGTGGTGGTGAAGTACGAGGACGAGGTCGTGGTGGATATGGAAATGGACGTGGTTGGAGGCCACATGAAGACAACACAAACCAAAGAGGTGAAAACTCATCAAGAGGTCGTGGGAAAGGACACCCAAAATCAAGATACGATAAATCAAGTGTCAAATGCTACAATTGTGGGAAGTTTGGACATTAGGCTTCTGAATGTAAAGCTCCTAGCAACAAAAAATTTGAGGAGAAGGCCAACTACGTTGAAGAAAAAATTCAAGAAGAAGACATGTTATTAATGGCTAGCTACAAGAAAGATGAACAAGAAGAGAATCATAAGTGGTACCTCGATAGTGGTGCAAGTAATCACATGTGCGGGAGAAAAAGTATGTTCGCGGAGCTTGATGAATCGGTGAGAGGAAATGTGGCTTTAGGAGATGAATCGAAGATGGAGGTAAAAGGTAAAGGAAACATTCTCATTCGATTGAAGAATGGAGATCATCAATTTATATCCAACGTTTACTATATTCCGAGCATGAAGACAAACATCTTGAGCCTTGGACAACTCTTAGAGAAAGGTTATGATATTAGATTAAAAGATAATAACCTTTCAATAAGAGACCAAGAAAGCAATCTCATTACCAAGGTGCCAATGTCGAAAAATAGAATGTTTGTCCTCAACATTCGAAATGACATTGCACAATGTCTCAAGATGTGTTACAAAGAGGAGTCTTGGCTATGGCATCTTCGATTCGGACATCTAAATTTTGGAGGATTGGAGTTGCTTTCAAGGAAGGAAATGGTGAGAGGGCTACCTTGTATAAATCATCCAAATCAAGTGTGTGAAGGATGTCTACTTGGAAAGCAATTCAAAATGAGCTTTCCAAAGGAGTCAAGTTCAAGAGCTCAAAAACCGTTGGAGCTAATACATACCGATGTGTGTGGTCCGATCAAGCCGAAATCACTTGGTAAAAGTAATTACTTCCTTCTCTCAAATGTATAACTCCCCAGGAAT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

2395

Start:

7719713  

End:

7722107

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_54

TCTTGATTGATGATTTTTCAAGAAAAACATGGGTATATTTTTTGAAAGAAAAATCCGAGGTGTTCAAAATTTTCAAAAAGTTTAAAGCCCATGTTGAGAAGGAGAGTGGTCTTGTGATCAAAACCATGAGATCCGACCGTGGAGGAGAATTTACATCCAAGGAGTTTCTTAAGTATTGTGAAGACAACGGCATTCGAAGACAATTAACGGTGCCAAGATCCCCTCAACAAAATGGTGTAGCAGAAAGAAAGAATAGAACAATTCTTGAGATGGCAAGGAGCATGCTCAAAAGTAAGAGACTACCAAAAGAGTTGTGGGCGGAAGCGGTCGCGTGTGCGGTTTATCTATTAAATCGATCTCCAACAAAAAGTGTCTCCGGAAAAACACCACAAGAAGCTTGGAGCGGAAGAAAGCCCGGTGTTTCTCATTTAAGAGTCTTTGGAAGTATTGCTCATGCTCATGTACCGGATGAGAAGCGGAGCAAACTAGATGACAAAAGTGAGAAGTATATCTTCATTGGTTATGATAACAACTCCAAAGGCTACAAGCTCTATAATCCCGATACGAAGAAGACAATTATTAGTCGAAATATAGTGTTCGATGAAGAAGGAGAATGGGATTGGAACTCAAATGAAGAAGATTATAACTTCTTTCCACATTTTGAAGAAGATGAGCCGGAGCCAACAAGAGAGGAGCCACCAAGTGAAGAGCCTACTACACGACCAACTTCACTAACAAGTTCTCAAATAGAAGAAAGTTCGAGTGAAAGGACTCCGCGTTTTAGAAGTATACAAGAGCTCTATGAGGTAACCGAAAATCAAGAAAACCTTACCTTATTTTGTTTATTTGCGGAGTGCGAACCCATGGATTTCCAAGAAGCCATTGAAAAGAAGACTTGGAGAAATGCCATGGATGAAGAGATCAAATCAATACAAAAGAATGACACATGGGAGTTAACTTCACTTCCAAATGGACACAAGGCAATTGGCGTGAAGTGGGTGTATAAAGCAAAGAAAAACTCTAAAGGAGAAGTGGAAAGATACAAAGCAAGATTGGTTGCAAAAGGTTATAGTCAAAGAGCCGGAATTGACTATGACGAGGTATTTGCTCCCGTTGCTCGTCTAGAAACGGTTAGACTAATCATCTCACTAGCGGCTCAAAACAAGTGGAAGATACATCAAATGGATTTCAAGTTGGCCTTCTTAAATGGAGATTTTGAAGAAGAAGTTTACATTGAGCAACCACAAGGCTACATAGTCAAAGGTGAAGAAGACAAAGTCTTGAGGCTAAAAAAGGCGCTTTATGGATTAAAACAAGCCCCAAGAGCTTGGAATACTCGAATTGACAAGTATTTCAAGGAGAAAGATTTCATCAAGTGTCCATATGAGCATGCACTCTATATCAAAATTCAAAAAGAAGATATATTGATCGCATGCTTATATGTAGATGATTTGATATTCACGGGTAACAATCCAAGCATGTTCGAAGAATTCAAGAAAGAGATGACGAAGGAGTTCGAGATGACGGACATTGGATTGATGTCTTACTATCTCGGAATTGAAGTAAAACAAGAAGACAATAGAATATTCATAACTCAAGAAGGCTATGCTAAGGAGGTACTTAAGAAGTTCAAGATGGATGACTCAAATCCCGTTTGTACACCAATGGAATGCGGAATCAAACTATCAAAGAAAGAAGAAGGGGAAGGAGTGGATCCAACAACCTTTAAGAGCTTGGTTGGAAGCTTGAGATACTTAACATGCACAAGGCCCGATATTTTATATGCGGTCGGAGTTGTTAGTCGTTACATGGAGCATCCAACAACAACTCATTTCAAAGCGGCAAAAAGGATTCTTCGCTATATCAAAGGTACCGTAAACTTTGGCTTACATTATTCAACTACTAGTGATTACAAGCTTGTTGGATATAGCGATAGCGATTGGGGTAGAGACGTAGATGACCGAAAGAGTACAAGTGGTTTTGTGTTTTACATTGGAGACACGGCTTTCACATGGATGTCGAAGAAACAACCAATTGTCACTCTATCCACTTGTGAAGCGGAGTATGTAGCGGCTACGTCATGTGTATGCCATGCTATTTGGTTAAGAAACCTCTTGAAGGAGTTAAGCTTACCACAAGAGGAACCAACGAAGATCTTTGTGGACAACAAGTCGGCAATAGCTTTGGCGAAGAACCCGGTCTTCCATGATCGAAGTAAACACATTGACACACGCTATCACTACATTAGAGAGTGTGTTAGCAAAAAGGACGTGCAATTGGAGTATGTGAAGACACATGATCAAGTAGCCGATATTTTTACCAAGCCTCTCAAGCGTGAAGACTTTATCAAGATGAGGAGTTTGCTTGGAGTAGCAAAATCAAGTTTAAGAGGGGG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

440

Start:

7722108  

End:

7722547

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_55

TGTTGAAAGTTAAACTTGATTTTGAATCAAGTTTAATTATTGGATCAATTATCCAATAATTAATTATGGCCAAATCCAAGTTCTAGAGTTTTCTCTAGAAATATCATCATTTCCACCTCCTTAAAAGATTCTAGAAATTTTCTAGAATCATCTTCCACCTCCTTAAACATAAAAATCTAGATACTCTAATAAAATAATCTAGATAATTTGAATAATGTAATCTAAATCTTATGTAAGAACTCTCTAGACTTAGGATTAAAATATTTTAGATATTTTGTAGTTTGGAGGCTATAAATACCTCCTCCCCCTCTCAAATGTTGCAATGTTGTGAAGTTATCTTCAAGTTTAAAGCAAAGTAATAAAAGTTCTATTTCCAAAAAAACTCTCTCAAAACACTTAAACACTTTCTCCATTACCTCTAAAAGAATTTTACTCTAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

178

Start:

7742716  

End:

7742893

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_56

TAAGCTCCGGTGAATCGGAGAATCGTGAGAAGAAAAAAAGAAAGAGAAGATAACAAACTTTTCTTATTGTTTATTAAGTGTTCGTTACAAGAGTTTAATCTAATTAATGTCTTATATAAACACATATAATTACATTAAACCAACATTTAGTTAACCGAAGTTAACCAGACATTGAACC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

127

Start:

8053168  

End:

8053294

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_57

CTCTCTCTCAACAACTCAGATAAAAAGCCTGAATGAAAGAGAAGGCAACAACGGCTATATATGTTTCCTCAGTCGTAACAGCAAAGCCTCCCTCTGGAACAAAGTCTTTCTCTTCCTTCTCTTCTTC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

388

Start:

8160178  

End:

8160565

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_58

TGAAAATCCAAATTCTGACAACAACGAGCTAATCGAAATCAAGGAGCTGTTGGGAATCAAAAAGCTGCATTATATCACATTAGATGGCTGAGTTCCTGACATGGATGTGTGAGCTGACATGGCACAGATGTAGCGCTTGATGTGACGTGCCAAGTAGCCTTGCTGACTTGGCGTGGTCATCAAAGACGAAGGTCGGTTGAGAAGATATGGTGAATATCCTTCCGATCACATATGGAAAGGGATAAGCTTGAAGATCAAGGGAGATCCTAGAGATTATGGTCCTGGAGATTAGTATAAGTATTCTAGAGGTCGGCCATAAACCGATTGAGCACTCTAGAATATTGTCATACGATTGTAAACTTCCAAACCTAGCAAAGAGATTAGAAGG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

122

Start:

8376450  

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8376571

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_59

TATTGTTGTTTGGTACAATGTAAACCGGTTACTAAACCGGAATACTCTACTATATAAAGAGTGTTTCATGTAACAGAACAATTTAAGAAGAATAACAAACTTTTTTCATCTTCTTCATTTCT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

228

Start:

8578102  

End:

8578329

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_60

TTTAGAACAACTCTCTAAAGCCTCTTAATCTCTCTCTTGTGTCTTATGGAACATCTCTCCATAAGCGCTTATTTATAGTTATTAAACTACTCCTAATCTTATAATGAATAGAAAAACTTACGAACTTATCCAACTTGACTTTTATTTGTATTTTCTATTTTCTTATTATCTCTTCTAAAATCTTCTAGAGAGATTACTTGCTGCTCAAGTAATTGGAATTATCCAACA