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Chr1_LTR-Copia_83 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1531061033210610484+
Chr1_LTR-Copia_84 RetrotransposonsLTRLTR-Copia27011061048510613185+
Chr1_LTR-Copia_85 RetrotransposonsLTRLTR-Copia7811061325010614030+
Chr1_LTR-Copia_86 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1531061403110614183+
Chr1_LTR-Copia_87 RetrotransposonsLTRLTR-Copia3281067548810675815-
Chr1_LTR-Copia_88 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1841069671510696898+
Chr1_LTR-Copia_89 RetrotransposonsLTRLTR-Copia45021069689910701400+
Chr1_LTR-Copia_90 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1841070140110701584+
Chr1_LTR-Copia_91 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1811091597610916156+
Chr1_LTR-Copia_92 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2961114809111148386-
Chr1_LTR-Copia_93 RetrotransposonsLTRLTR-Copia41531114838711152539-
Chr1_LTR-Copia_94 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2961115254011152835-
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Chr1_LTR-Copia_96 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2281123901211239239+
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Chr1_LTR-Copia_99 RetrotransposonsLTRLTR-Copia901147499911475088+
Chr1_LTR-Copia_100 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2381153714511537382+

< 5 6 7 8 9 > Total 128


Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

238

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10317758

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_81

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

431

Start:

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End:

10522868

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_82

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_83

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

153

Start:

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10610484

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_83

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

2701

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End:

10613185

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_84

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

781

Start:

10613250  

End:

10614030

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_85

ACTACCGGTGTGTTAGGTGCTAAGCCGGTCGCTTTCCCTATGGTGCAAAACCACAGACTAGCATTAGACGAAGGGGAACCTATTACGGATCCTTTACGCTATCGTCGTCTCATTGGCAAGCTAATCTATCTTGGTGTTACACGGCCTGAATTATCATATGCGATACACATCTTATCGCAATTTATGAGTCAGCCTAAGGAACAACATTGGACTGCTGCTCTCCGAGTTCTTTGTTACTTGAAAAGCAGTCCGGGCCAAGGTATCTTTCTCCGAGCTAACACACTTCTTGTTCTCACTGCTTGGTGTGATTCAGATTGGAGTTCTTGTCCCGTTTCACGTCGAAGTCTCACTGGATGGTTCATTCAGCTGGGTGGATCTCCTATCTCTTGGAAAACAAAGAAGCATGACGTCGTTTCCCGCTCTTCAGCAGAAGCTGAATATAGAGCAATGGCCGACACAGTTTGTGAGATCTTATGGCTACGGGAGTTGTTACCTGCCTTGGGAATTGATTGTAGTGCTTCCACGATACTTCATTCGGATAGTTTATCTGCTATTAGTCTCGCCAAAAATCCGGTCTATCATGCTCGCACAAAACATATAGAGAATGATATACACTTCATTCGTGACGAGATATTGCGTGGTACTATTGTTCCTAAACATGTCAATACGACTTCACAGCTCGCCGATATCATGACTAAAGCGTTGGGGAAGACTGCATTTGAAGCTCTTCTAGTCGAGATGGGTGTTCGGAATCTCCACACTCCACCTTGAAGGGGGGTAT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_86

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

153

Start:

10614031  

End:

10614183

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_86

TGGGCCATATGGGCCTCGGTTTAATCTTACTTAGCCCACAAGCTGTTGTTGTATCATAGATATTAGGTTAAACGAACATATGTGTATATAAGCTGTTTCAGCCGTATGAATACAAGCAAGAAAACCTTTTACCACTTTATAGGTTTCTTAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_87

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

328

Start:

10675488  

End:

10675815

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_87

TTTGTAGAGTAAGAAATTTGTAGATTATAAGGTGGTATGATAGAGTGAGCATCGAGGACGTAAAGATTGGAGATTTGATCACCCTTTCCAATCATTAATCCCTTGGTATGATCATGTATCATAGAAGAATCTTTATCAAACGTTACTCGATAACCCTAATCTTTGGTCAACTGACTAATGCTCAAAAGATTAAGCCGGAAACCTGGGATGTATAGAACATTGTTCTATATAAGAAACTCATATAGCTTTACTGTGCCTTAACCTGTGATTTTAACTCCAAAACCTATAGGTAAAATGTTCTGAATTGTTCATAGTTTCAGATAAACTC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

184

Start:

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10696898

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_88

TATTGGGAGGCATTGTATGATTTTGTAATTGTTAGCTGGTTAAGTTCGGTTTAGTCAGGTTTAGTTGGTAGAGTTTACTTGTATATATACTCACAATGTACAGGATTTTATCAATAAGAGAAAATAGAAACTTCTTCTTTTACAATCTTTCTCTCTAAAACCCTCTTCTTCGTCTTTACTATTA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

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Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_89

TGGTATCAGAGCAATCACGGTTCTAATCTTCTTCTCTCCGATCTGATTTTGTTCTTCTCTTGCTGGTTTCCTCCATCTTTTGAGCTCTTTTTCGTTCAAAATGGTGAAGGCAGCTCGAGTCACTCTCAAATCAACTCGATCCAAGTCCGTTGCGAGCTCCGTTGCGAGCTCCATTGTTCGCCGATCTACTCGATCTACCTCCGATGGTAACGTTTCTCCTCTAATCGATCATCCAGCAGCTATATCTCAAGTTTCCGGACTTCCAAGAGGTGTTCCATCGCCAGATCTCTCTGATCCAACTCAGTCACCTCTGTTTATGCACAGTGCAGACCATCCAGGTTTAAACATCATCTCTCTTCGTCTTGAAGAAACGAATTATGATGATTGGAGCTATGCGATGCGTATTTCTCTTGATGCTAAGAACAAAATAGGTTTTGTTGATGGATCCTTGCCTAGACCATTGTCTATAGACCCGATGTTTAGAGCATGGTCGAGATGCAACTCTATGGTGAAATCATGGTTGTTAAATGCAGTTTCTCCACAGATCTATCGTAGCATCTTGTGAATGGATGATGCTTCTGATATTTGGTGTGATCTCTGCGGTCGATTTCATCTTACTAACTTACCTCGCACCTACAACCTTACTCAGGAGATTCAGGATCTTCGTCAGGGTTCTATGACTTTATCTGAATACTATACTCGTTTGAAGACATTGTGGAACCATATGGACAGCTCAGAAGAACCTGATGATCCTTGTGTTTGTGGGAAATCTGCTCGTCTGCAACTGAAGGCAGAGAGAGCTAAGACTGTGAAGTTTTTAGCTGGCTTGAATGAATCTTATGCGATTGTTCGTCGTCAGATCATTGCTAAGAAAGTTTTGCCATCACTGGTTGAAGTCTATAATATTCTGGATCAAGATGACAGTCAGAAAGTATTCACTGTTGCTACTCCACCCTCAACTTTTCAGATCTCTCAAGCAACACCTACACATGATGATTCTGTGGTTCCTGATGTAATGTATGTCCAAAATGGTCCTAACAAGGGAAGGCTAATTTGTTCCTACTGCAACAGGGTTGATCATATTGCTGAAAGGTGTTACAAGAAACATGGATTTCCTCCGGGCTTCACACCTAAAGGGAAACCCACTGATAAAGCTCAGAAACCGTCTCCAGTGGCTGCTCAAGTTACCCTGTCTGCTTCACCTGCTCCTCAAGGCAACATTGCAGGTTTACAGGGAACTTTATCTAATGATCAGCTCCAGAATATCATTGCTCACTTCACATCTCAACTGACAACTCAATCTCCTCTTGGTGCTAGCACTTCTCAGTCAGCTCTGGATCATACTGGTATCTCTTTCTCTAACTCCACTTATTCTTTTGTTGGCATTCTGGCAGTCTCTCAACACACACTGTCACGTAACACATGGGTGATTGATTCTGGTGCTACTCACCATGTGTGCCATGACAGAAATCTGTTTGTTTCTCTCGACTCTTCTGTGGTGAATTTTGTGAACTTGCCTACTGGTCCTAAAGTGAGAATTAGTGGAGTTGGATTGGTTCGGTTAAATAAAGATATTCTTCTTCAGAATGTCTTATTTATACCTAAGTTTCGATTAAATCTCATCAGTATCAGTTCATTGACTTCTGATATTGGTTCACGAGTGGTTTTTGATCCATCTTGTTATGAAATACAGGATCCTATCAGGGGGTTGATGAATGGTAAGGGTCGCCGTATTGGGAATCTCTATGTGTTAGATACAGAATCTCCATCCGTTTCAGTGAATGCAGTGGTGGACATTGGTATGTGGCACAAGAGACTCGATCATCCATCTTTCTCAAGACTGGATGTTATATCAGAAGTTCTTGGAACTACTCGTCATAAGAATAAGAAGAATGCTTTTTGTCATACTTGTCACTTAGCTAAACAGAAGAAGCTGTCTTTCCCTTCTGAAAACAACATTTGTAATTCAACTTTTGAGTTATTACATATAGACATTTGGGGGCCATTTTCAGTGGAAACTGTTGAAGGTTTTAAGTACTTCTTGACTTTAGTTGATGATCACTCCAGAGCAACTTGGATTTATCTGCTAAAGAACAAAAATGATGTTCTTAGTATCTTCCCTGCTTTCATCACTCAAGTTGAGAAACAATACAACACAAAGGTTAAAGGTGTTAGATCAGATAATGCTAAGGAGTTACAGTTCACTCAGTTTTACAAAGATCATGGAATTGTTTCTTATCACTCATGCCCTGAAACTCCAGAGCAAAACTCAGTGGTAGAGCGTAAGCATCAACACATTTTGAATGTTGCTCGTGCTTTATTCTTTGAGTCCAAGATGCCATTGTCTCATTGGGGTGACTGTGTTCTCACTGCAGTGTTTCTGATCAACCGAACTCCTTCTCAGGTACTCTCTAATAAGACTCCATATGAAGTTCCCACGGGTAAACCTCCAGATTACACTCGCATTCGAACTTTTGGCTGTTTGTGCTATGCTTCAACCTCACCTCAGCAACGTCATAAGTTTCAGCCTAGGTCAAGAGCTTGTGTTTTTCTGGGATATCCTTCAGGTTACAAGGGGTACAAAGTCATGGATTTGGAGACTAACAAAGTCTATATCTCTAGACATGTTGAGTTTCATGAGGATTCCTTTCCTATGGCAGATTTGAATAAAGAAGCTGCAGTGAACGATGCAGATAATGATCTTCAACAGATGAATTCTTTGCCCTCAGGTAATTCGATCATTCCTCATCTTCCATCACCTCAAATTTCTCCATCAACACAAATTTCTTCTCATAGAGCACGAAAACCACCTGCTCATTTAAATGATTATCATTGTTACTCTCTTGACAATGATGTCACCCAACATCCCATTTCCTCTTCTCTTTCATATTTCAAACTCTCTCCATCACGTTTGCTATACATTAATAGCATTACTCAAATTCCAATCCCTCAATCTTACTCTGAGGCAAAGAATTCGAAAGAATTGTGTGGGGCTATTGATAAGGAGATTGGAGCAATGGAAAGTACAAATACTTGGGAGATTACTGTGTTGCCACCAGGGAAGAAAGTTGTGGGTTGTAAATGGATATTCACTGTGAAGTTTTATGCAGATGGAACTCTTGAGAGGTACAAAGCCAAAATTGTTGCTAAGGGTTTTACTCAGAAGGAAGGCTTGGATTATAATGAAACATTTTCACCTGTGGCTAAAATGGTTACTGTGAAAATGCTTCTTAAGATCTCAGCTTCTAAGAAATGGTTCTTGAATCAGTTGGATATCTCAAACTCTTTTCTCAATGGAGACTTGGATGAAGATATCTATATGAGAGTTCCTGAAGGCTATGCCGAGAGTAAGGGGATCATTTTACCAAAGAATGCTGTTTGCAGATTAAAGAAATCTATCTGTGGTCTGAAACAAGCTTCACGATAATGGTTCCTCAAGTTTTCAGCTTCACTTCGTCAGCTTGGCTTCATTAAGTGTCATGGTGATCATACTCTTTTTGTTCGTCCTTATGGTTCTGAGTTCATTGCAGTTTTGGTTTATGTGGATGATATAATGATTGCTAGTACTACACAAGAGGGTGCTACGCAGTTAACAGAAGCATTGAAGCAGAGTTTTATATTGCGTGAACTTGGTCCTTTGAAGTATTTCTTGGGTTTGGAGATAGCTCGAAATGATTCAGGTATATCCATTTGTCAGAGGAAGTATGCTCTTGAACTTCTTACTTCTTCAGGCATGCTTGGATGCAAACCATCTTCAGTTCCCATGATTCCAAATCAGAAGTTACTTAAGACAGATGGTGAACTGTTGGAAGATAAGGAGTTGTATCGCAGTCTTGTTGGACGGTTAATGTATCTCACAATAACTCACCCTGACATTACTTTTGCTGTGAATAAGTTGTGCCAGTTCTCTTCCGCGCCTCGCACTTCCCACCTCACAGCAGTTTACAAGGTTCTGCAATACATCAAAGGCACGGTTGGTCTAGGTCTCTTCTACTCTTCAGATCCTGATCTCACTCTCACTGGATTTGCAGACTCAGACTGGGCTTCCTGCCAAGATACTAGACTATCGACTACTGGTTTCACCATGTTTCTAGGATCATCACTCATCTCTTGGAGATCCAAGAAACAACCTGTAGTATCTCGATCTTCTGCTGAAGCAGAGTATAGGGCACTTGCTCTTGCTTCATGTGAAATGTCATGGCTGGTTATTCTTCTTGTTGGTTTGAGGATTGGTCCTTCATCAGTTTCGGTTCTCTTCTCAGACAGTACTGCAGCCATTTACATAGCAACCAATCCAGTCTTCCACGAACGGACTAAACACATCGAAATAGATTGCCAAACGGTTCGGGATAAGCTGGATGCAGGCTCATTGAAGATGCTTCATGTTCGCACTGAAGATCAGGTTGCAGACATTCTAACTAAACCTCTTTTCCCTCAGCAATTCAATCACTTACAGTCCAAGATGAGTCTCATCAATATATTCGGCTCATCTTAAGGGGGCA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

184

Start:

10701401  

End:

10701584

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_90

TATTGGGAGGCATTGTATGATTTTGTAATTGTTAGCTGGTTAAGTCCGGTTTAGTCAGGTTTAGTTGGTAGAGTTTACTTGTATATATACTCACAATGTACAGTATTTTATCAATAAGAGAAAATAGAAACTTCTTCTTCTACAATCTTTCTCTCTAAAACCCTCTTCTTCGTCTTCACTATTA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

181

Start:

10915976  

End:

10916156

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_91

TCTTGGAGTACATATACCATCCAGTTTAGTTAGAATATATTATTATCCGGTTCAATTGACTGGTTAAGTTAGAACAGTTCTATATAAGAAAATTGTTTTACACTTTACTCTTTAAGAAATAAGAATCGAAAATCTTAACAAACTTTTCTTAATAGCTCAGCTCAATTCTTATTTTGTAATA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

296

Start:

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End:

11148386

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_92

TGAAACGATTAGAGAAAGTTTCAAGCTTTTGGTAAAAAAATCGTTTCTTTCTCAATAATTACATTAGGGTTTTACACTACTCTTTTATAGACATTGTAGAAGGAGCTAGATATGGAACAGTCTAGAATATGGCAGATGCTGTGTAGCTGGCTATGGTGAGTCATCAGGCAAAACGCCCCTCCTCTGTACGATCGTTGCTCTGTTTTGAGCTGGAGTCTATTTTGTCTTCTTCTATTTGACTGGGCTGAGATGGGCCTTTTGTTGTTGTTGGGCCGGTTACTTGTTTGTTGCTCACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4153

Start:

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End:

11152539

Strand:

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>Chr1_LTR-Copia_93

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