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Chr1_LTR-Copia_22 RetrotransposonsLTRLTR-Copia479144061684410958-
Chr1_LTR-Copia_23 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16244109594411120-
Chr1_LTR-Copia_24 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10045199114520010-
Chr1_LTR-Copia_25 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16248354504835611-
Chr1_LTR-Copia_26 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10549310184931122-
Chr1_LTR-Copia_27 RetrotransposonsLTRLTR-Copia19756917565691952+
Chr1_LTR-Copia_28 RetrotransposonsLTRLTR-Copia453756919395696475+
Chr1_LTR-Copia_29 RetrotransposonsLTRLTR-Copia19656964765696671+
Chr1_LTR-Copia_30 RetrotransposonsLTRLTR-Copia11057977485797857-
Chr1_LTR-Copia_31 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8459991995999282+
Chr1_LTR-Copia_32 RetrotransposonsLTRLTR-Copia30160092986009598-
Chr1_LTR-Copia_33 RetrotransposonsLTRLTR-Copia410560096026013706-
Chr1_LTR-Copia_34 RetrotransposonsLTRLTR-Copia24460138056014048-
Chr1_LTR-Copia_35 RetrotransposonsLTRLTR-Copia55063026076303156+
Chr1_LTR-Copia_36 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8364781896478271+
Chr1_LTR-Copia_37 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16264782676478428+
Chr1_LTR-Copia_38 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16365384186538580+
Chr1_LTR-Copia_39 RetrotransposonsLTRLTR-Copia479365385816543373+
Chr1_LTR-Copia_40 RetrotransposonsLTRLTR-Copia16365433746543536+

< 2 3 4 5 6 > Total 128


Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

162

Start:

4406006  

End:

4406167

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_21

TGTTATAACCAAAGAAAGAGATAGAAGAAATGAGTGTGTTATTCCATTGAGATAAAGTGTTATTTATATAGAAGTATAAGGAAAGGGTAAAACCCTAAAAACATGTAGATGATGGGCTTAGATGATGGGCCTCATAATGGGCATCCATCTTTATTCATAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4791

Start:

4406168  

End:

4410958

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_22

CTCTCCCTGATGACCATTATAGTATCATAACTCGTAAACTATTTGAAATGTTGCCTCATTAAAAACCTTACTAGGAAAACCCAATGGGAAAAACCATGGTTAAGGGAAAAAGAGTGCAACATACAATTACTCCCCCTTATGAGTATATTCGTCGAGATCTTTGAGACGGCGTAATCCGATACGATAGACTAACTTCTTGAAAGTAGCAGTAGGTAGCGCCTTGGTGAATAAGTCAGCCAGATTATCATTCGAACGGATCTGTAGAACTCGTACATCGCCGCTCTTTTGTAGATCGTGTGTGTAGAAGAATTTTGGTAGGATGTGCTTTGTTCTATCGCCTTTGATGTATCCGTCTTTGAGTTGTGCGATGCATGCTGCATTGGCTTCGTACATAATTTTGGAGTCTTTTTCCCTGCATATATACCACAGTCTTCTTGTATATGGTGAACTATGGATCTTAGCCATACACACTTGCGGCTAGCTTCATGAATTGGTAAAATCTCTGCATAATTAGAAGATGTGGCAGAGAATAAACAGTATTTGAGAATAAGTCTGCCAAATCTTCTCTTGAACAAATTTTTAGATAAAGTACAACGCCATTCTTCTGCTCATGAATCTTTTAGATGATTCATCTTGACCATCTTATTTATTTCTCTAAATACCATTAGTGTATAATATTCATTTGGATGATTGATAGAATTTCTTAATATTCATCAAGTGTATTATTTGCGTGTTCTTTAATGTCTCGTTAAAAACCTTGTCATAGAAAAATCATGTGGGATAAAAACTATGATAACGAAAAAGGGTACATCTACGCATATCATTCAATCTCCCCCTCGGAAACATCTTCTTCAGGAGATGATTTTCAATCAAATACAGTATCTCGTTGGAATTAATAACCATAATCTTAATGATCAAAATTATATGGTTTTCATATAGACTTATAAATATCATTATCTAATGATATTTTATCATAGATTATTGTCATCGTATTACTTATGATAACTCTGTAGGAGTTTTAATGATTTTCAAAACAAATATTAGTTTGATCAATATATTTTGACAAACTCAACGTAAATATACATTTATATGATTATATGTCATGTTACATATTTCTTTTTATTCGATCGAGTAGAGTTCTAGAGAACATAATTCTCATATAATTAATCCTTCAGAGATTATATCTTTCAAGAATTTTATATAAATGTCATATCCAGTGTTCCGTCTCTTATTGCCAGACTTTAGATACTTAAAAAAAATATTACATCCACCACAAGAGAATATATCTCTTCATAATACATTTCTTATCTTTGTGAAAATCTCATTAATTTCACTATTCTTTCACATAAAGACTCATTTATTTTCCACTGGTTTTACACATCATGTGCATAGATTACTAGTCCAAATATCTCTACTAGAGATTATAATTATATGTCTATTTCTTCTTTTCCATTTTTTTTGCTAATCATTACTTTGTGTACACTTTTCAATAGACTTTCTTTCATGATCCTCCTTTTTGTCTATAATATCAACTGCTCATAGCATGCAAATATATTACGATGTCGATTTGCTTTTGATTCCATTATATTTTGACATGACATAGCTAGCTAGATCTCTTCATTGTCAAGTACTTGAATGTTTCATTTGTCATGTTTATGTCTCTTTTAGAGATCATTCACTCTCTTCAAGAGATCATCAAAATATTTATTTCCTCAATTTGGTCATTTTTAATTTTGTGCTCCTTCACTTTTACGAGGATATTTATATTTGGAACCAAGGTCTATTACGCTTCATGCGATCTTAAGACTCAAAAGCAGTTTGAAATTGGTCCTTACAGGACATTCATTATATTCTGGAGCATTTAATTTACAACTGATATAAGTGACTTCATCACTTTATTTGGGTCAGCAAATGCGTCTGGCAATTACAACGCTAAATTCTGTAATTGAATTATCTTTTGGACTCTTAATATACATTCTTTACTCCGAGGATCATTGATAATTCATTTCTATTTATCTTTTTCACCAGCTGTATACATTCTCCCCCTTATGTTGGAATAGCTGACTATATAATATGATAGTCTTCAAAACGAGCGGTATATAAATCCTTCTAAGATGGCTTAGTTATCATTCATATCCAACATGTATTCTTATCCTCCTTTGAGGGTTCATCTCTGCGTGCTGTGGTGGAGCACTTTTCACATTCAAAGCTTTTAGATGAAAACTATTTGGTTTCTGACCCAAAACCAATAATAATGGGGAAAACTATTAATTATTCATTGGCTTGATGCGTATCGATGTTACTAAACCATTTTGTGTATGAACATGAATTTCAAAATGTTAAACACTTATCCCAACGGATATCTAATAATGGTTATTATAAATAAACACTGAAATACTCTTGTACTTTAATCAAGAAAGTAATCTCGCAAACTCTATGTTGCGGGTTTATAACAAGGATAAATATGACCTTCTTGTCGATTCAACAATCGAGTCAATGCGTCCATTGAATCGATGCATCTTTTACAACCATTAGGTATCTAAATGTCATATACTGGGTGATCAACCCATAATTATCTTCTTGTATATACTTACGAATAGATAAAGTCCAAATTACTTACACTGGTAAAAATCACATTATCATATTGCTTTCTGAGCAAGTAACATTTGATAAATCATTAGAGAGAATCTTCTGGTTTTTCACCTAATGTCCACATAATTCTCAATACTTTCACATCATCATTAAACCAGGATGACCAATCCGGTTAAGCCAAATATACTCTTGAAACTTTTAATTCTTTTGAAACTTCTAGTTCTTTCAAAACTTCTAATTTACTTTTCATTGCTTATCACTTACTCCCTTAATGAGATCTTATAATCAAAATTACTTCCATGTATTTTAATAATCAATCATATGTTAATAAAACAATAACGAGATAATAATTAAAATTTTATATTCTAGTATAAACGATATTAAATTTGACTAGCTATGTAAGATCTTATATTCACTTGAGTTACTTATCAGTGATAACTCTTATGTTTTCTTAGCCTTTGAAAAACACTCGATTTAAGTTTATAATAGTTCTCAAAATTTCTTTCAAAATATTGTATCTACAGGACAACAATACTTGCGTAAAAGTTTAAGCGTCTGTTTTACCATCTCTGCATCATAGATATTCTCTTAACAATGTGAGTTATATTCACAAAGAGACTTCAAGTCTTGAAGTTTCAGTAATAACTAATTATAACTTATTTTATCTAATAACACATCCATATAAGAATTATTTTGTACAACTTTTAGATCTTTAGTAGTCAAAGATTGAACATAATCTTCTGGATATGTCACTTATTATCCATGTGAGATTCATTACTTCTCCTCCTCGAAATGATGAAACTTCAAGTTCATCCATCTCGTTTTTAATTCCACTCTAGAATCATAATGTATTTTATATCTGATCATATTAACTTTAAGATTTGGAGAATTATATGGCATCAATGATTTTAATTTTGTATTCCCATAAAAAACAATGTATATGCTCTTCTAGAGTCTTTTAATAAGATTTTATACTACTTGATATACTAGATTATTTCATCGTTAGAAATTTTTTTTTTTTTTTTACCATATTTATTTTCTCAACTTCTCGTGATAATTTAAATTCTTGAAAAAACTTTGACCATCAAAAATATGATATCTTCTTAAGATACATTAAAATAGTCATTCATGAAAATTTCTATAAGTGATTATACCTTTAAATTAAGTTATTTATCAATCAATTTATTTTATAAAATAATCAAGTATTATATACTAATACAATTTTAATGCAATATTGTAAAACCAATCAGAATAAAACTATTTTGTGCAAAATCTGGATTTTACATATATCTTGACAAAACTTTTATTTAGGATAATATGAATTTGTGCAAAATTTGGGTAAAATGATTTCGTGCAAAATTAGGGCAAAACCATGAACAGTTTTTTTTTTTATTTATTTATTTAGATACCACAAAGATTTAGAGAAAAGAATCTTATAAAAAAAAAATTATCTTGCAACGTTTTAGTAAAAATAATAATAACACAATCAAATATATGGAAATCTTATAAAAAGATTTAAATAATAATAACACAAAGATTTAGATATATGGAATCTTATAAAAAGAAAAATTATCTTGCAACGTTTTTAGTAAAAATAATAATAACACAATCAAATATATGGAAATCAAATATTTAATATAGAAAAGTCAATATCTAAAAGTGATAAGATATGTATAACGTTTTAATCAAAGGAGTTAAATAAGGGATATCATATCAATCATAAATGGATTTTAGACAATATAATATTTATAAAATGATATTGAATATAGATGCAACTATTCAAAACTGGAATGCTAAAACATTAATACATGCTTGCATCACCCACCACCGGGTTATGAATAGTTACAAAATTAGTTATATAATTATAAAATTGGTAATTTATATATTCAATATTATAATAGTAAATCACAAAAATTAACAATTAACAAGCATGATTCTCTTCTTTAACGATTTTCTTTGTAGAATCATTGAATCATGCGATAGTAATCATAGAAACAAATGATAAGCATGATTCTCTTCTTTATTGAATCATTGAAAACATGCTTTTACCGATCTATACTATAATCATCGATCGGCTCATATTGTTTTGTTTCAATAATAGAAAATAAGTACTATGAACCATGAGTCGATAAGTAAACATGGTTCTTAAAAAAAAATGTAAGAATCTCTATATCTACCTTTTAGAGCGTGCTGATAACG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

162

Start:

4410959  

End:

4411120

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_23

TGTTATAACCAGAGAAAGAGATAGAAGAAATGAGTGTGTTATTCCATTGAGATAAAGTGTTATTTATATAGAAGTACAAGGAAAGGGTAAAACCCTAAAAACATCTAGATGATGGGCTTAGATGATGGGCCTTATAATGGGCATTCATCTTTATTCATAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

100

Start:

4519911  

End:

4520010

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_24

ATACGAACGAGGATGGAGATGAAGAAGAAGATGAAGCTCAAGATGATGATAATGAAGAAAATCAAGATGATGACGATGATGATGATGGGGATGATGATGG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

162

Start:

4835450  

End:

4835611

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_25

TTTTAGATATCCAACTACTCTTAAAGCTGCACGCCGATGGTTCTTGCATAATTTGTGCCAACACATACACACAATATGCAAAAATTAGTTCTTGTTACTGGCCAAGTAGATCAATCTACCAATGGTTTGGAGATAAGGCTCAGGATCAAGTACAAGTGGCGA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

105

Start:

4931018  

End:

4931122

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_26

TGTTGGAATATTGAGAGAAAGAAGAAACAGAGTAAGAGATAATATCTCTTCTCCTTAGAGAAGACAAAAGAACGAAAGAGAAACTTTTATTGAACTGAAACTTGT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

197

Start:

5691756  

End:

5691952

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_27

TTGTAAATACCTAACCGGTTTGTTCCGGGTTAATTAGGTTAGATAGGGAAAGTGTATATAATGTCTTGTATTCACTCTTTAATAAGATAACAGAAACATTTTCCACTTTCGGCTCCTTACATTTTTCTCTTCTGGATCTTCTTCTTCCTTAGTATTGAGCTCTCTTTCTGTTCATCTCTACTTCTAATATGGTATCA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4537

Start:

5691939  

End:

5696475

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_28

CTAATATGGTATCAGAGCTATACGCTTAGCTCGCTTTTCTCTCTGATTTTGTTGTGCCTTCGATTTGGTTTCATAAAATCCGAAAATGGTTAAAGCTGTGGTTCGTCGCAACACTCGCAAGACAGGAAGCTCATCACGCGCAGGAAGCACCTCTCGAGCAGGAAGCTTACCACCCATTCAGGAAGCATTGTTTGCTCCGTTTGGCTCCTCCGTTCTGATGAACCCTGACAGTGTTCACTCTCCTCTGTTTCTTCATAACGCCGACCACCCAGGGATATCGATTGTCTCTGTGCAGCTAGACGGCGCGAACTACAACCAGTGGAGCTCTGCGATGAAGATAGCTCTGGATGCGAAGAATAAGATCGCATTCATTGATGGCTCTTGCCCTCGCCCTGAAGAAGGTAACCATCTCTTACGCATCTGGTCTAGGTGTAATAGCATGGTCAAGTCCTGGATTCTTAACTCCGTTAACAGAGAAATCTATGGTAGTATTTTGTCCTTTGATGATGCTGCTCAGATCTGGAACGATTTACACAATCGTTTTCACATGACAAATCTCCCTAGAACCTTTCAGCTTGTTCAACAAATCCAAGACCTTCGTCAAGGCTCTATGAACCTTTCCACCTACTACACAACTTTGAAAACCCTTAGGGATAATCTCGATGGTGCAGAAGCTAGTGTACCCTGCCATTGTTGCAAGAAATCAACTTGTGAAAGTCAGATTTTTGCTAAGTCTAATGTGAACAGAGGAAGGATTATCAAGTTCCTTGCTGGTTTAAATGAGAAGTACTCAATCATTCGTGGACAGATAATCATGAAGAAGCCTCTCCCTGACTTAGCAGAAGTTTACAACATCCTGGATCAAGATGATAGTCAAAGACAGTTCAGTAACAATGTTGCTTCAGCTGCTTTTCAAGTTACTAAGGATGATGTTCAGCCTGGTGCGTTGGCTTCGTCCTCTAACATGCCTCAACCTGGAATGTTGGGTGCTGTTCAAAAGAAAGACAAAAAGTCGATATGCTCTCACTATGGTTACACAGGACATACCTCTGAGAGATGTTACAAACTCCATGGGTATCCTGTTGGCTGGAAGAAAGGAAAGTCTTTCTATGAGAAAATTGCTCAGGCCTCTCAGTCTTCACAGGCTCCTAAGCCAAATTCTGCTGTCACTGCACAAGTAACAGGAAACAGTCAGAATACTCCTGCAGGTCTGGAAAGTCTCATTGGGAACATGAGCAAGGATCAGATACAGAATCTCATTGCTTTGTTCAGCTCTCAGTTACAGCCTGCTTCTCCGGTTCTGAACACTGCTCCAATGTCCACTTCTCACAACAATGACCCATCTGGTATTACTTTCTCATCCTCTACTTTCAGCTTCATTGGTATTCTCACTGTCTCTGAGACTGAAATGACACATGGTACATGGATTGTGGATTCTGGTGCCACACATCATGTATGTCATGTCAAAGATATGTTCCTTAATCTTGACACTTCAGTTCAACATCATGTGAATCTGCCCACTGGCACTACCATTAGAGTTGGAGGTGTTGGGAACATTGCTGTAAATGCTGATCTGATATTGAAGAATGTTCTGTATATTCCTGAGTTCAGACTGAATCTGCTTAGTGTTAGTGCTTTGACCACAGATATTGGTGCCAGAGTTGTGTTTGATCCGACTTGTTGTGTGGTACATGATCTTACCAAGGGGTCAACGATTGGAAGCGGTAGAAGAGTTGGAAATCTATACTTGCTGGATGTTGAAGATTCAGTGTCTGAAGACGTTGTATCTACTTCTTTTGTTGCAAACTCTGTTGTTGATGCATCTGTTTGGCATTAACGACTTGGTCATACATCTTTTGATCTCATAGACTTGCTCACAGATGTACTTGGAATTTTTAAAACCAAGAATAAAGGATTGTTACATTGTGATATTTGCCAACGTGCTAAACAAAAGAAGTTAACTTATCCTAGTCGTCATAATATTTGCTTAGCACCTTTTGATTTGCTGCACATAGATGTCTGGGGACCTTTCTCTGAACCAACACAGGAGGGGTATCATTACTTCTTAACCATCGTCGATGACCACACACGTGTGACATGGGTCTACCTTATGAAATACAAAAGCGATGTCCTCACCATTTTTCCTGATTTTATCACAATGGTAGAGACACAGTATGACACAAAGGTCAAGGCAGTACGGTCTGATAATGCTCCAGAACTTAAATTTGAGGAGCTATATAGAAGAAAAGGGATTGTGGCATACCACTCTTGCCCTGAAACACCAGAACAGAACTCAGTGGTAGAGAGAAAGCACCAACATATCCTGAATGTTGCCAGGGCTCTTCTCTTTCAGTCTCAAATTCCTCTCTCATATTGGGGAGACTGCATACTTACTGCAGTTTTCATTATCAACAGGACACCATCTCCAGTTATCTCTAACAAGACCCTTTTTGAGATGCTGACCAAGAAAGTGCCTGATTATACTCACCTGAAGAGCTTTGGCTGTCTGTGCTATGCTAGTACTTCTCCAAAACAGCGTCACAAATTTGAAGACAGAGCTCGTACGTGTGCTTTTCTCGGGTATCCTTCTGGGTATAAGGGATACAAACTTCTTGATCTTGAGAGCCACACTATCTTTATCTCAAGAAATGTGGTCTTTTATGAAGACTTGTTTCCCTTCAAGACCAAACCTGCAGAGAATGAAGAGTCTTCTGTTTTCTTTCCACACATCTATGTTGATAGGAACGACAGTCATCCTTCTCAGCCACTGCCAGTCCAAGAAACATCAGCGTCGAATGTGCCTGCAGAGAAACAGAATTCTAGAGTATCAAGGCCACCAGCTTACCTCAAGGACTACCACTGCAATTCTGTTACCTCCTCTACAGATCATCCTATATCAGAGGTTCTCTCTTACTCCTCTCTCTCAGACCCCTACATGATATTTATCAATGCTGTGAACAAGATCCCAGAACCACACACATATGCTCAAGCACGACAAATAAAAGAGTGGTGTGATGCTATGGGAATGGAAATCACAGCTCTTGAAGATAATGGAACTTGGGTTGTTTGCTCTTTACCAGTGGGTAAGAAGGCTGTAGGATGCAAATGGGTTTACAAAATCAAGTTGAATGCTGATGGTAGCTTGGAGAGATACAAAGCCAGATTGGTCGCCAAAGGATACACTCAAACTGAAGGGTTGGATTATGTTGATACCTTCTCTCCTGTTGCTAAACTCACCACTGTCAAGTTACTCATTGCAGTTGCTGCTGCAAAAGGATGGTCTCTTAGTCAATTGGACATCTCTAATGCTTTCTTGAACGGTAGCTTAGACGAAGAGATCTACATGACCTTGCCACCTGGATACTCACCAAGACAAGGGGACTCCTTTCCGCCAAATGCAGTCTGCAGGCTGAAGAAGTCTCTATACGGTCTAAAGCAGGCTTCTCGGCAATGGTACTTGAAGTTCTCTGAGTCACTCAAGGCCCTTGGCTTCACACAATCTTCAGGTGATCACACTCTTTTCACCAGAAAATCTAAGAACTCTTATATGGCAGTGCTGGTCTATGTAGATGATATTATCATTGCTAGTAGCTGTGATAGAGAGACAGAATTGCTGAGAGACGCATTGCAGCGTTCCTCTAAGCTCAGGGATTTGGGAACCCTCAGATACTTTCTAGGCCTAGAGATTGCTAGAAATACTGATGGAATCTCAATCTGCCAAAGGAAGTACACGCTTGAGTTGTTGGCTGAAACTGGTCTCCTTGGATGCAAGTCAAGTTCAGTTCCCATGGAACCAAATCAGAAATTATCTCAAGAAGATGGTGAGCTGATTGATGATGCAGAACATTATCGCAAGCTGGTTGGTAAACTCATGTATCTCACATTCACCAGACCTGATATCACTTATGCGGTTCATAGGCTCTGTCAGTTCACATCTGCACCTCGAGTTCCTCATTTGAAAGCAGTCTACAAAATCATCTACTACTTGAAGGGAACAGTTGGTCAAGGTCTGTTCTACTCTGCGAATGTGGATTTAAAGTTGTCTGGATTTGCTGACTCCGATTTCAGTTCCTGCTCAGACTCAAGAAAATTAACAACTGGGTACTGTATGTTTCTTGGAACGTCCTTAGTAGCTTGGAAATCTAAGAAGCAGGAAGTGATCTCCATGTCTTCGGCAGAGGCAGAATACAAGGCAATGTCCATGGCTGTTCGAGAAATGATGTGGCTCAGGTTTCTTCTTGAGGATCTTTGGATTGATGTTTCAGAAGCTTCAGTTTTGTATTGTGATAACACAGCAGCTATTCACATTGCAAACAATCCTGTTTTCCACGAAAGGACGAAGCACATCGAGCGGGACTACCATCATATTAGAGAAAAGATCATTCTTGGTTTGATAAGGACTCTTCATGTGAGAACAGAGAACCAGTTGGCTGATATTCCTTACAAAAGCTCTATTTTCAGGTCAGTTTAAACGACTTCTAAGCAAGATGAACATCATTAACATTTATGCTCCATCTTGAGGGGGACTAATAGACTT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

196

Start:

5696476  

End:

5696671

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_29

TGATTTACATTGGTTTGATTCTTTTGTTAATACCTAACCGGTTTGTTCCGGGTTAATTAGGTTAGATAGAGAAAATGTATATAATGTCTTGTATTCACTCTTTAATAAGATAACAGAAATATTTTCCACTTTCGTCTCCTTACATTTTCCTCTTCTGGATCTTCTTCTTCCTTAGTATTGAGCTCTCTTTCTGTTC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

110

Start:

5797748  

End:

5797857

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_30

TGCTCTGATTCCATGATTATAGAAGTGATGATTTTATTATAATACAGAGATGAGCTTATATACAAAGAGAGATATCTAGGGTATTACAATCAAAGTAAATGTGAATATAT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

84

Start:

5999199  

End:

5999282

Strand:

+

>Chr1_LTR-Copia_31

TATTGGGGATAGAGTATAATCTTATTAGGATTATTACTATATATCTTGTGATAGAGTTTAGGTCCTATATTTGAGGGATTAGAG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

301

Start:

6009298  

End:

6009598

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_32

TTTCAATGAAGAGATTAAGAACACAAAATCAAAAGAATGAATCTCTTTTTATTAGTCTAGGAAAATTCCTCAAAACCTAAACTCTCAATGTATTCTACAGCTCTCTCAAAGGCTATGTTACAACCAACATGTCCTTTATATAAGATTCTAATCCTAAACCTAATAGGATTACATGATTTAGATATCTCCTAAATCTCACTAATCTTATCTTCACATTAAACCATATCTCGGTTTAGCCATAATTCGGTTTAGTCTTGGTTTAGACTTTCTTCTTCTTCAAGTCTTTGAGCTTACTCCAACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4105

Start:

6009602  

End:

6013706

Strand:

-

>Chr1_LTR-Copia_33

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

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Chr1_LTR-Copia_34

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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244

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-

>Chr1_LTR-Copia_34

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_35

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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550

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+

>Chr1_LTR-Copia_35

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

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Chr1_LTR-Copia_36

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Retrotransposons

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LTR

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+

>Chr1_LTR-Copia_36

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

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Chr1_LTR-Copia_37

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Retrotransposons

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LTR

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

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Retrotransposons

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LTR

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>Chr1_LTR-Copia_38

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

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Chr1_LTR-Copia_39

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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>Chr1_LTR-Copia_39

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Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr1_LTR-Copia_40

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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163

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+

>Chr1_LTR-Copia_40

TGTTATGAATAAAGATGGATGCCCATTATAAGGCCCATCATCTAAGCCCATCATCTAGATGTTTCTAGGGTTTTACCCTTTTCCTTGTACTCCTATATAAAGAACCCTTTATCTCAATGGAATAACACACTCATTTCTTCTATCTCTTTCTCTGTTTATAACA