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R1_LTR-Gypsy_83 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy34211377067713774097-
R1_LTR-Gypsy_84 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy5391377450013775038-
R1_LTR-Gypsy_85 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy3381386988113870218+
R1_LTR-Gypsy_86 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy1291387075613870884+
R1_LTR-Gypsy_87 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy2931387156313871855+
R1_LTR-Gypsy_88 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy911387360713873697+
R1_LTR-Gypsy_89 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy3361387382113874156+
R1_LTR-Gypsy_90 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy1031433489014334992+
R1_LTR-Gypsy_91 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy2381452987014530107+
R1_LTR-Gypsy_92 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy3941457655314576946+
R1_LTR-Gypsy_93 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy4841458291414583397+
R1_LTR-Gypsy_94 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy6411458352214584162+
R1_LTR-Gypsy_95 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy28051458427114587075+
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R1_LTR-Gypsy_97 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy3531484208914842441+
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R1_LTR-Gypsy_100 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy9901486867814869667+

< 5 6 7 8 9 > Total 1242


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

Length:

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>R1_LTR-Gypsy_81

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

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>R1_LTR-Gypsy_82

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_83

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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>R1_LTR-Gypsy_83

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

539

Start:

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Strand:

-

>R1_LTR-Gypsy_84

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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338

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+

>R1_LTR-Gypsy_85

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

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Retrotransposons

Order:

LTR

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+

>R1_LTR-Gypsy_86

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_87

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LTR

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293

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Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_87

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

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+

>R1_LTR-Gypsy_88

CCAGGTTTGTTGGGCTGACCCAGTTCGTTTTTAAACTTCTATAAATATCCTTTAGACCTAATTTTGAAAGATATCTCATTTTATCTCAAGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

336

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+

>R1_LTR-Gypsy_89

TCATGAAGATTAGAGAGTAGACACTTGATTCATGGGTTAAGGTGATTAGAGTGATTAAATGAAGATCTAGAGTGTTTAATATTATATCTACTTTTTTTTGCATGCTGAGTGTTCTTAATGCTATTTTAGTATTGATCATACTAAAATAGAGCTCTAGACATTTCATGCCCACAAGGTGTATGATGAAATGTCTGAACCAACTCTTCAACATTTTTTGTTTACCTTACCAAAGATCTTTGATGTTAAGGGAGCTTAGATTGCTAGTAGACTCATTCTTAATGATTGCTTAAGTCTTTTAAGCTCAAAGACCTTTGATGTCTAATTGATTAAAGTAAA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

103

Start:

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Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_90

GGATAGAACGGAGTCGAAATCCGTTCATAATAGAACTGGAACCAGGGACGGCCCCAATGTCAAAGAACCCATACTGCATGGCTCCTGCCGAGATGGCCGAGCT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

238

Start:

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End:

14530107

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_91

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

394

Start:

14576553  

End:

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Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_92

CTTAAGCCATATTATTTAGGCTACTTTATTTTAGTTTTGGGAAGAAATTAGAAATCCTTTAGAGATCGATTGGAATTCATTTTCTGGTTTATTTATGATATTTATCAAAAAATGATTTGTGTTTCATTGATTATGTCTGAGTAGATTCATAGTTAGATTTGGGTTAATCTAAGGTGGATGATTAATTTATTTATTAATTAAATGCTAGGATTATCTATTGATTTCTTCTATCTTGATTGTTTTTAAAACTAGATTTGGATTGAAAACCTGAAATCTTGATCATAGGATAATTAGTAGATACGAGAGTGTTATTAATTGCATGGAACAATTTTCTGAGTTAAATAACTATTGGCAAATAGATTTAGTTTAGATATTTAGTGAACATATCAAGCTT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

484

Start:

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End:

14583397

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_93

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_94

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

641

Start:

14583522  

End:

14584162

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_94

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_95

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

2805

Start:

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End:

14587075

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_95

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_96

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

369

Start:

14818458  

End:

14818826

Strand:

-

>R1_LTR-Gypsy_96

GATGTTCATTCGCTTACATTAATTAAACATCAAATGTCTTTAGGTTAATTCACTCAAACAATCATTAAGAACAAGTCTACTAACTATCTAAGTTTTCCTAACATCAAATGTCTTTGGTTAAGAGCAATATTGAGTTGGGTCAGACATTTCATCAAACACCTTCGGGACATGAAATGTCTAGAACTCTAGTGTAGTGAGATCAAGACTAAACTAGCATTAAGAACACTCAACAAGCAAAAAAGAAAGATCTAACGCTAAACATCCTAGATCTTCACTTAGTCACCCTAACCCATGAATCCAAAAGGTAACTACTCACTAATAGACATGAATAACCCAAAAACCATAGATGATTGAAGGTTAAACACAAGA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_97

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

353

Start:

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End:

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Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_97

GAAGCTGGTTACTGCCATTTTATCATTGAAAATCTGCAGAAGCCGCTCTTAATTGGTTCTCTCGGCTGGAGGCCAACACCATCAATATTTTTAACCAACTATCAAATGTGTTCATGAAACACTACTATATTTTCATAGAGAAAGGACACAGACCTGTGGACCATGTCTCATAAGGAACACGAGTCACTTAGCACCTTCATCGGCAGGTTCAAAACCGTTCTCTCCAACATCGTTGTGAGTGACGGTGGATGACTATCTGCTTTACGAAATGCCCTATGGCATGAGTCAAACTTACGTGAAGAAGTCTTGCTCAACAAGCCCACAACTTTGGAGGATGTTCTCCACCAAACTAA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_98

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

260

Start:

14867964  

End:

14868223

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_98

TCAAGTTATTGCAGAGTATGAGGACATATTTGAGGGCTTAAAAGGGTCATTACTAGCCAGAGGAGATGCTCTTACGATTGAGTTGGAACCATGGACAGCACCAATTACACGAGCTCCATACCGTGTAGCACCAGCAATTGGAGGAACTATCTGATAAGGGTTTCAGAAGACCTATTACTTCACCATAAGGAGCATAAGTATTATTTGTGACGAAGAAAGATGAGAGTTTTAGAGTTTGCATCGTCTGCAGAGACTTGAAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_99

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

419

Start:

14868232  

End:

14868650

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_99

CATCAGGTTGCTAATTGCTATAGCTGAGGAGCATGTACAGAGGACGGTTTTCTGTATACGCTATGGACATTTTGAGTTTGTGGTGATACCATTTGGGTCGACAAATGAACCGGTAGCATTCAAGAAACTTATGAACGATATCTTTTGTCAGCACTTGGATAAGTGTGCCATTGCCTTCATCGACGATATCGTGATTTATGCTTTGAGCAGAGAAGAGCATGCGGAGCATTTACAGATTGTGTTGGTTAAGCTGGAGAGCATCAATTAGTTGCTAGCTTGGTAAGTTTTTCTTTTGGCTGGAGAAGGAAAACAAAAAAAAATTAGATTTTGGATTATGTGGTTTCAGAAGCAGGAGTTACTAAGATTTGGAATATACCACTACGATTTCAGCGCGGCCAACATCTAAGAGTTACATAAAT

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Gypsy_100

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

990

Start:

14868678  

End:

14869667

Strand:

+

>R1_LTR-Gypsy_100

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