ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
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scaffold_11_LTR-Caulimovirus_22 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3276476972480247+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_23 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1544480276481819+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_24 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1771482567484337+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_25 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3204485259488462-
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_26 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2191488509490699-
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_27 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus33314595181459850+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_28 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus137414635701464943+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_29 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus133167376216738951+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_30 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus133273814147382745+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_31 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus54573848417385385+
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_32 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus50374960867496588-
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_33 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus79274982357499026-
scaffold_11_LTR-Caulimovirus_34 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus27274995207499791-
scaffold_119_LTR-Caulimovirus_35 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus50916222130+
scaffold_119_LTR-Caulimovirus_36 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus57849955572+
scaffold_12_LTR-Caulimovirus_37 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus379307462307840-
scaffold_12_LTR-Caulimovirus_38 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus147308995309141-
scaffold_12_LTR-Caulimovirus_39 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2973309193312165-
scaffold_12_LTR-Caulimovirus_40 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1162312339313500-

< 2 3 4 5 6 > Total 23


Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_10_LTR-Caulimovirus_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3180

Start:

5237116  

End:

5240295

Strand:

+

>scaffold_10_LTR-Caulimovirus_21

TGAATCAACTTCGGATGAAGAACTCTCCCAAACCAATTTGCCATAGGCGACGAAAGAGGCGAAACATCAACTCCAAAACGAGAACCTGATATACTTGAAATCTATTCAAGCGATGAAGATATGGAGTACAGGCCTCCCAGGCAGCAAGAAATACCAACAAGACCATTTGCCTCTAAAGTCATGGTCTTCACGTTTGATGACATTCCTTTCGAAAAATGGAATGATCGTCTCGATGAATTTCATGCATGGATGAATTCTGAAGCAATCACGTCTCCCTTAGAGCTTGTGATTCAGCAGTTTACGGCCCGACTATCTGGAGCACTCAAAGAATGGTGGAATTCACTTGGTGAATACAGACAGCAGCAAGTCTATCAAACGACAATACCGCTACTTCTCGGAGAAATTCATAGAGAATTTATCGGTACACCTACACATTTGAAAGAACAGCTTCAAGAAGAGTTCTTTACTGCGAAATGCTGCTCATTGAAGAAAAGAGACCTAGCTAAGCATTTTGAGCGACAGACGCGACGTTATTACGCTCTTAATGGTTTCAACAATCCAAGCCTTAAGCAGGTGCATCTCTCTTCGATTGATGACTACCTCAGTCAACAAACAAAGCTATACATAAGAGATCAAAGCCAGACAGTGGAAGATATTTCCATTGGCCAAATACAGCAATATGTCTTCCGAACACTAGATAAACTCTGCAAGCAAAAAGAGCTTTGGATGGAATTCATGGATAAATCAAAGCAACTATCCAGGATCTGTGCAAGACCAGACCTATCCATCCAATGTTCAAAATCCAAGAAGACATGTTCGTGTGATGATCGTAGCAAATCACGGAGATTCAGAAAAACGTCTCACAAGCGTTTCAACAAGTTCAGACGCAAGCGATTTTTCAGAAAGAAACGAAGCTTCAAGAAAACAACGAAGTGTTTCCTATGTCGCAAAGAAGGTCACTTCGCAAAAAACTGCCCAAACAAGTCGAAGAAAAAGAAGCAGTACTTAATCAGCTCAATCTCGAAGATCGCACCAGACCTCGATTTCGACAGCCACGATCTAGAATCAGTACTATCCTATGATAGTGATGAACAAGATGCCATATGTGGCTACTCGGATTATGACTACTCATCCGACTCCTCCTCCTCAGAAGAAGAAGTCAATAATGACTGCTGTTTTAAAATCACTCGTATGCCGCAAAAAGAAGAAATTCAAACACCACATCTGCCAGTTACGATATTTCATCCACCACAAAAAGAGAAGCCAGTTCATGCAATTGCGTTCATCGACACAGGAGCATATACGACGATAATGAACCCTAAAATTCTCCCGACTTCTATGTGGCTACCACATCAACAAGAATTTCGAGTAGCAAACTCGGGTTCATTGACGGTCAAACTCAAGTCCAAACCGGTGACGATCGAACTTTTCCCAGGCTGTCAGATTACAACAGAAGTGCTTGGATCCTCAGCACCAAGAAAAGATTTGATATTAGGATGGGATTCCTATCACACCTTCAAGAAAAATTTTGATATATCTATTGAGACACGGGGAATGAGATGGAAGGCTTTCTACAAAGATTTTACAACAATCCCACGTCTATTCACGGTCGAAGGAGTCATATCTCAAGATTTCGAGAAAATCAATGAAGAGATCGCAATAGTCTCATGTGCAGACTCTCACACAGACTTCCTTCAAAATGTGACAAACCGTTATGGCTGAATTCAGAATTCTTCGTCTCTTTACCTTTCAAGGAGAATGTCCATACCACTCCGACAAAAGCAAGTCACGCAGGCATGCCACCAACATTATTGACACAAGCAAATGAAGAATGTGACCAACTAGTGAAACAAGGAGTTGTCTCATCAACAAATTCACTTTGGCATGTAAAGCATTCTATGTGAACAACCGGACAGAACAAGCAAGAGGAAAACTCAGACTGGTAATTGATTACAAACCACTGAACCAATATCTACAAGACGTCAAGTTTCCTCTACCAAACAAGAAGGCACTCTTTCAACACCTACAAGGAGCCACCATATTCTCCAAGTTTGATTTAAAATCTGGTTTTTGGCAACTTGGTGTTCATCCTGATGAAAGATACAAAACAGCTTTCTGCCTACCCAACAGACATCTCCAATGGAATGTTCTACCTTTCAGATTAAAAACAGCGCCATCGCTATTTCAGCAAGCGATGCTTCGTATATTTAAGCCTCTTCTCCACACGGCTTTAATATACATCGACGATATTCTGTTATTCTCAACAAGCGAAGAAGATCATATTCGGTCTCTCCGACAATTTCAAGGCATAGTTGAAGAATATGGAATTATGCTCTCGGCCCGAAAGATGATAATAGCCCAGCCCAACATCGACTTCCTTGGAATGCAAATCACAGAAGGAAAATTCACACCGCAAGCCCATTTAGCTACAGCACTCCTCGATTTTCCCGACGAAAATCTCACGCGAAGACAAGTCCAACAATTCCTTGGGGTAATTAATTACATCAGCGACTTTATTCCGCAACTTTCGCAAATGACTAGACCACTCCAGAAGATGTTGATAAAGAATCCACCCACGTGGGCTACCAAACAAACCGAAGCAGTCAAAAGCCTAAAAAAGGAGATACATAAGCTACCACCTTTAAAGATTCCTCTACAGGCCTACGAATACTGCAGACTGACGCAAGTGACAAATATTGGGGAGCCATTTTATTCGAAGAAATAAATGGTAAACGTCAAATCTGTGGATACAAGAGCGGACGCTTTAGAGATTCCGAGATGCATTATCACTCTACATTCAAAGAAATCTTAGCGGTCAAGAAGGCTATCGAGAAGTTCGAGTTTCATCTGATAGGACATAAATTTCGCATCGAAATGGATATGTCTTCTTTTCCGAAGATGTTACAATTCAAGCAGAAGATGGTCCCACATCAACAATTATTGCGCTGGAGCGAATGGTTTTCGAAATACGACTTCGAATCCTGGGTACGCAGAACACTCTTGCTGACATGCTCAGTAGAAACCCTCCTAAAGAAGTTGCCTCAGCTTCCTCAAGTTCGGAAAATCAATACTATGACTTCGACGCAAACATGCCTCTCGACGCTCACCAGCTCGTCGACAAGAGGACTCTGCATGAGCATCTTCAACACAGGATTTTCAAATATCAGTCCATCATCCTGT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3276

Start:

476972  

End:

480247

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_22

AGTTTTAAAAACAAGGATTTCGTGATTTTGACAAAATCAAACCTTTAGAAAAGACCTTTCCAATCTATGAGACCACGAAGCTGAGGGTGTTCCAGGCAGCAAGACCTAAGAGAGGCAGTGAGTCCGTTGGCAAGGCAGCAGCAGTGATCAACTAGAATCGGTAAGTCTCTTCTCATGAGTTTAAATTTTGTATAAATCATGGCGTCCTCGTTTAGAAAGTTTTTTAAGTCGAAACATGCATCTGTATCTTCGTCGCATACAACAATTAATTCAAGAGAAATAATGTCAAAAATAACATCCTTTAATCAAGAATTAACAAAGGATCAATTACCACATATTAATCCAGACAATATATATCAAATTGGAACATTTGATTTTAAAACGGCATATTCAATAAAAGAGCATGAGCAAACCTTGTCTCTTCAAAATGAATTTGAAGAGATAAAATTATTATCATCACTCGCCTTAGACAAATATAAACAAAAAGGATTTAATTATATTTATTTTGGACTTATACAAATTGCTATCAAACCATTATCAAGAACGGGTATAGATTCACCTATACTCATGTTACTACGAGACAAAACCTTATTAAAATATGAAGACTCCTTATTAGGAGCTGTACAATCAAACTTATGCAACGGAGCAGTGTACTTTAATTGTGCCCCGAATTATCAAGTTAGCTTACCCGATCCAACTATATTGAATACTTTAGTATTAAATGTTCATTTACCAGAAATGAAATTTCAAAACGAGAGACATGGTTATTTATTACTTTATCGAATTTACTTTAAACAATCAACTTCTGAATTTAATCCAAGATGCTTATTACAAGATGATAAAGGAGAAACGACAATATTAGCAGTTCATAGTAAAGATACTCCTACTGCTACTTACACACCTAAGCAATTAAAATGGAATGAAATAACTATTCCAGATCAATGGAAAATAGAAATTACACAACCCCCTAGAAATTTTGAACAAAGAAATATTTCAAGAATATTCAAACAAAGAGATGGTAAAATATTATTACAATTCGGATCATTTAGAGAACCACTTCCCCCAAGAATTAACTCTTATTATTCAAATTCAAGAGCCTCATTTTCCGAATATCGTAATAATCAACCTAGTACAGATTCTGATACAGAAAGTGTAAATCAAAATATTCAACAAGATAATCAAATTAAATTTAATGCTCCAATAGCTGAACCTACTCAACTAAGATGTCCAACATCACCTACTCCATCAGATTTTAAATCTATTAATGTAATATTAAAAGAATATACAATTAATAAACAATATATTAGAAAAGATTTCTATTCAAAAGAAAATGAAGAAAAAAGAAATTGGTATTTGAAGACATTTTCTAAGCAACAAACAATTGAATTTAGACAAGATTGGTATAACTTTATGCCAATAAAAGAGATAGATATTCCATTTTTCACTTGGTTCGAAACTTATGCAATCTCTCATAATATTAATTATCCATTTAAATCAATAAATACTAGTGCATCTTTAAGTCAAATATGGGAATTATCGGATGGTAATAAAATTAGATCAGTCCATCCACCCTTAAAAGATTTAAAAATAACTACACCTGATAGAATACTCGTAGCCTCACCCTTTAAAACAGGAGCTAATCAAGATGATAAGAATCTAATAACACAACAAGATATTAAAGCAGTATATCAACAAAATAATTATCAAAGTCAGTTACTCCATACAATATCCAAACAAGTAAATCACATAGATAATAAAATAAATGAAAGTGATAAATTATCTCTAAATAATCAAACTACCCAACATCCCTTTTCATCTGTATCAACCCCAATACTTAAACCAATTACAAGGCAAGTTGAATTCGGTGAAAATGAAATTTTAAAATCTATAGCCAATAGATTAGAAAAATTAGATAAAGGTAAAAGTATCAATAATATAGATGAAAACGATAATGAATCTATTCAAACATCTATATCGTCAGAAAGTGATATACAAGAAATAAATAGAATATAAAATAGAACTATGAGATCTAATAAACCTTATTATTCAAGGCATACTCCACTAGACTTATTATTTGAAGAACATCATAAATATTCTAACAATATGTATTCAGGAAATGGTATATATGAATGGAACATAGATGGTAAATCCGAATACGAAATAATGAATGTATTACAAGAAATGGGTATGACAACAGCGGCATTTAAAACAGACAAAACAATAACTGATAAAGAAGCATGTGTACTATTAGTAGCAGGATTTTCTGGATCATTAAAATATTGGTGGGATAACGCATTAGATACTAATCAACAAAACTCTATAATCAATCATGTAGAGAAAATTCATACAGAGGATGGTTTCGTTATTGAAACCGAAAAATCTAATGCAATAGAAGTATTAGTACACACTATATTAATGCACTTTGTAGGCAATCCGTCAGAAGAATTAGAAAGTAAAAGAATAATCCTAACAAATTTACAATGTCCTACACTAGGAGATTTTAAATGGTATAAAGATGTTTTTATAACCAATATATTTTTAAGACCAGATTGTAATCAACCTTTCTGGAAAGAAAGATTCATTTCAGGATTACCAAATTTCTTTGCAGAAAAAGTAATCAATAAACTTAAAGAAATCTCTGGAGGACAACCTGTCCCCTGGAATAATATAACTTATGGTCAATTATTTGCATTCGTTAAGAAAATAGGATTATCAATATGTCAAGAACAAAAGGATAATAAGCGTAACGATAAATTCAAATTTAAAGTAACTATGGGTTCATTCTGTGAACAATATGGTTACGAAACCTTTAATCCACCATCCAGAGTTAAGCGTATAAAGCATAGGCATAGAAGGTGTAATCAAATAGAATATCATAATAAAACAAGAAATTTTAACAATAAATCTAATAATCAAAAATATTCAAAAAATCAACATTACTCTAAAAATAAACGATATAATACAACCAATAAGCAAAAAATAGTATGTTGGAATTGTAAGCGACCTGGACATAGATCAACGGAATGCAAAATGAAAAAGAAAATTAATGAAATATTCCAAGATCAACCTGATATTCAAGAAAAATTAATTAAATTATTGCTATCAGAATCTGAGTCATCTGAAGATTCAGATAATGAATACTCAATAAACGAAATAGGAAATTCAAGTGATTCATCCAGTGAATCACAAGAGTTATCCGATAATTTATGCAATTGTAAAATTATCAATGTTATAACCAAAGAAGATGATAAACAATTTTTACTAGAAATAATAGAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1544

Start:

480276  

End:

481819

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_23

AATATTTAATAAAATTAAAAGATATGATAAACCGAGAAAATACTAGAGAATCTCCACAACCTTTTAGCTTACACAAAATATTCAAAAAATATCCAACTCAGAGTTTGTTTAAACAAGTATCTACGGGAGAATTACAAAATGAAATTAAACAAATAAAGTCACAAATTAAACATTTACAAGATATTGTAAATGATCAAGATATTAAGCAATTACAAATAAATGCAAGATTATCTCTGATAGAATCAAAGAATAACAATAATACTCAAGCATCCTCAAATAGACAAAACTTAGAAATTAATGAAGAACAAGATTCCGAAGATTATATTCAAATAATCAATAAAATCAATTATCAAAAATAGTATACAAATATTACCTTACATATAGGAAATGACTTTAAAATAAACATAATAGCCTTAATGAATACTGGTGCAGATTATAACTGTATCCGTGAAGGAGTTATCCCAACAAAATACTATGAAAAAACTACTGAAAGATTAAGCGGTGCTAATGGTAGTAATTTAAAAGTTCAATATAAACTACCATGCGCAAAAATATGTAATCAAGGTTATTGTTTTAAAAATCAATTCATTTTAGTCAAAAATTTATCACAAGAAGTAATATTAGGAACTCCATTTTTTACTCAAATATATCCCTTTAAAGTAACAGAACAAGGAATATCAACCAAGGTAGTAGGAACAAAATTATTATTCAATTTCCTATCGCCTATGAAGACTAAAGAAATTCTTAATCTTCAACAAAACACGATAAATAAAACGATCAATTTAATAAAAGGTAAGCAAACCCATATCCAGCATTTACAGGAAGAAATAACCTATAAAAAAAATAGAAGAACAACTTAATACTCAATATGTAAAAGATAAGATAAAAACTATAGAGAACAATTTGCTAAGTCAAATTTGTTCCGAATTACCAAATGCATTTTGGGAAGGAAAGAGCATACTGTTGAACTTCCCTATATACAAGACTTCAACGAGAAAAATATACCAACTAAAGCACGACCTATTCAAATGAATAAAAAATTATTAGAAACCTGTAAACAAGAAATAAACGATCTATTAAAAAAGAAATTAATCAGGCCATCCAAATCCCCTTGAAGTTGTTCGGCCTTTTATGTTAATAATCAAGCTGAGAAAGAACGTGGAGTACCACGATTAGTTATTAATTATAAACCATTAAACGATGTATTACAATGGATTAGGTATCCCATACCAAATAAAAGAGCTTTACTCAAACGATTATATAATGCAAAGGTATATTCAAAATTTGATATGAAAAGCGGATTTTGGCAAATCCAAGTAGCAGAAAAAGATAAATATAAAACTGCATTTACAGTACCATTCGGACATTACGAATGGAATGTAATGCCATTCGGCCTTAAAAACGCACCATCTGAATTTCAACATATAATGAATAATATATTCAATCAATACTCAAAATTCACTATCGTCTATATTGATGATGTACTCGTCTACTCAACATCTATAGACCAACACTTTAGTCCTTTAAACACATTCTTAAATATA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1771

Start:

482567  

End:

484337

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_24

ATTAAAAAACATGGCTTGGTAGTATCAGCCAAAAAGATGTCATTATTCCAAACTAAAATAAGGTTTTTAGGTCATAATATATATCAAGGAACTATCATCCCTATTTCAAGATCGATAGAATTCGCAGATAAATTTTCCGATGAATTAAGGGAAAAAACTCAATTACAAAGGTTTTTATGATGTCTGAACTATGTTTCAGACTTTCTTCCTAATCTTAGAAAAACTATTCAACCGTTATACCAACGATTACAAAAAAAAATCCAAAACCATGGACTAGTCAACACACTAAATTAGTTCGACAAATTAAACAGAAGGTTAAAACTCTTCCGTGTCTTACTATACCAAATCCTGAAGCATCTATGATTGTTGAAACGGATGCATCATAAATTGGCTATGGTGGCATTTTAAAGCAAAAAAATTCAAAAAACACTCAAGAAACAATAGTAAGATTCCACTCTGGTGTCTGGATAGGACCGCAGACAAATTACTCCACATTTAAAAAGGAAGTTCTTTCAATTGTTAACTGTATATCTAAATTCCAAGATGATTTAATCAATAAGAAATTCTTATTACGAGTTGACTGTAAGTCAGCTAAAGAAATATTAAAAAAAGATGTAAAAAACTTAGTATCAAAACAAATATTTGCCAGAAGGCAAGCTATCTTATCTGTATTCGATTTTGATATTCAACATATTAAAGGTGAAAATAATTCTTTACCGGATTTTCTAACAAGAGAATATTTACAGGGTAAAACAACAGATATTCAAGATAAACAAAATGACGGATAAAAAGCAGAAGAAACCGATGAGCGCATCGGATTATATCAAGCATATGCCACACCTCCAGGGCAAGCCCCTGACTACTCAAAACCAGTATTCGGCTTTAGCAGAATTTCCACCTCTATCTTATTCAAAGGCCGTAACCTCACAGCCAGGCCAAACCTCAACAGGCCAATCCTCAAACACTAATCAACCACCTTCTCAAAAATCCATTTATCATCTCAAACCCTACAACCAACACTTAAACACAACCCACTATACAAAAGAAATCACCCTTAAATAACTATATTCCTATACCAACCACCTCTTTTACAGTGATGCCCTGTATCCAACAGATAACGTAACCAAAAACCGTACCTTTTATGAGTATATTCTGGTAGACTCTAAATCTATCGAAGTTACTCATTACCCAGATCCAAAAGACCCTAACCATATCTCCTATTCAACCTGTAAAATACTTCGCATTTGCATCTATGCAACAGCTTGGTATTCTCAACCTCCATACCACAAAAACCTTTTCTCAGCCTGGATTTGTTCTCCCCGGCTATACCTACGTTGACTATATGCAAGCTTTTTTCCGTTTTCTCTATCTACGACCCTATGACCATTCCTGGTTCTTATCCTTTGACCAGCGGTTCAATAAACACGTACCAGGTTGGTTCAACGAATGGTGGCACTGGTTTGGACCCATTGACCAAATATATCCATCAGAAATAATCAAGACTTCTTATCCTTTCTACACCAAACACCTACCCAACACCAATCCTATTGGACCTCTAAACAAAATTTACTTCCATGCAGATATGGGTATTCCATGGATCTGTTCATGGCATTTCAACCTTGTCCTAGCCCTACCTAATATGCCATACTCCTTAGTCAAAGAATTTCGTGTTAAGTGGTGGGACAAATATAACATCGAAAGATGTTCCCTCACTAATATCAAGAAATTATTTGACGCAAATAAACAAGACCACCTTTTAATCAAATCCATC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3204

Start:

485259  

End:

488462

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_25

GATGGATTTGATTAAAAGGTGGTCTTGTTTATTTGCGTCAAATAATTTCTTGATATTAGTGAGGGAACATCTTTCGATGTTATATTTGTCCCACCACTTAACACGAAATTCTTTGACTAAGGAGTATGGCATATTAGGTAGGGCTAGGACAAGGTTGAAATGTCATGAACAGATCCATGGAATACCCATATCTGCATGGAAGTAAATTTTGTTTAGAGGTCCAATAGGTTTAGTGTTGGGTAGGTGTTTGGTGTAGAAAGGATAAGAAGTCTTGATTATTTCTGATGGATATATTTGGTCAATGGGTCCAAACCAGTGCCACCATTCGTTGAACCAACCTGGTACGTGTTTATTGAACCGCTGGTCAAAGGATAAGAACCAGGAATGGTCATAGGGTCGTAGATAGAGAACACGGAAAAAAGCTTGCATATAGTCAACGTAGGTATAGCCGGGGAGAACAAATCCAGGCTGAGAAAAGGTTTTTGTGGTATGGAGGTTGAGAATACCAAGCTGTTGCATAGATGCAAACGCGAAGTATTTTACAGGTTGAATAGGAGATATGGTTAGGGTCTTTTGGATCTGGGTAATGAGTAACTTCGATAGATTTAGAGTCTACCAGAATATACTCATAAAAGGTACGGTTTTTGGTTACGTTATCTGTTGGATACAGGGCATCACTGTAAAAGAGGTGGTTGGTATAGGAATATAGTTCTTTAAGGGTGATTTCTTTTGTATAGTGGGTTGTGTTTAAGTGTTGGTTGTAGGGTTTGAGATGATAAATGGATTTTTGAGAAGGTGGTTGATTAGTGTTTGAAGATTGCCTGTGAGTTGGCCTGCTGTAGGTACGGCCTTTGAATAAGATAGAGGTGGAATTCTGCTAAAGCCGTACTGGTTTTGAGTAGTCAGGGGCTTGCCCTGGAGGTGTGGCATATGCTTGATATAATCCGATGCGCTCATCGGTTTCTTCTGCTTTTTATCCGTCATTTTGTTTATCTTGAATATCTGTTGTTTTACCCTGTAAATATTCTCTTGTTAGAAAATCCGGTAAAGAATTATTTTCACCTTTAATATGTTGAATATCAAAATCGAATACAGATAAGATAGCTTGCCTTCTGGCAAATATTTGTTTTGATACTAAGTTTTTTACATCTTTTTTTAATATTTCTTTAGCTGACTTACAGTCAACTCGTAATAAGAATTTCTTATTGATTAAATCATCTTGGAATTTAGATATACAGTTAACAATTGAAAGAACTTCCTTTTTAACTGTGGAGTAATTTCTCTGCGGTCCTATCCAGACACTAGAGTGGAATCTTACTATTGTTTCTTGAGTGTTTTCTGAAATTTTTTGCTTTAAAATGCCACCATAGCCAATTTATAATGCATCCGTTTCAACAATCATAGATGCTTCAGGATTTGGTATAGTAAGACACGGAAGAGTTTTAACCTTCTGTTTAATTTGTCGAACTAATTTAGTGTGTTGACTAGTCCATGGTTTTGGATTTTTTTGTAATCGTTGGTATAACGGTTGAATAGTTTTTCTAAGATTAGGAAGAAAGTCTGAAACATAGTTCAGACATCATAAAAACCTTTGTAATTGAGTTTTTTCCCTTAATTCATCGGGAAATTTATCTGCGAATTCTATCGATCTTGAAATAGGGATGATAGTTCCTTGATATATATTATGACCTAAAAACCTTATTTTAGTTTGGAATAATGACATCTTTTTGGCTGATACTACCAAGCCATGTTTTTTAATTATATTTAAGAATGTGTTTAAATGACTAAAGTGTTGGTCTATAGATGTTGAGTAGACGAGTACATCATCAATATAGACGATAGTGAATTTTGAGTATTGATTGAATATATTATTCATTATATGTTGAAATTCAGATGGTGCGTTTTTAAGGCCGAATGGCATTACATTCCATTCGTAATGTCCGAATGGTACTGTAAATGCAGTTTTATATTTATCTTTTTCTGCTACTTGGATTTGCCAAAATCCGCTTTTCATATCAAATTTTGAATATACCTTTGCATTATATAATCGTTTGAGTAAATCTCTTTTATTTGGTATAGGATACATAATCCATTGTAATACATCGTTTAATGGTTTATAATTAATAACTAATTGTGGTACTCCATGTTCTTTCTCAGCTTGATTATTAACATAAAAGGTCGAACAACTCCAAGGGAATTTGGATGGCCTGATTAATTTCTTTTTTAATAGATCGTTTATTTCTTGTTTACAGGTTTCTAATAATTATTTATTCATTTGAATAGGTCGTGCTTTAGTTGGTATATTTTTCTCGTTGAAGTCTTGTATATAGGGAAGTTCAACAGTGTGATGTTTCCTTTCCCAAAATGCATTTGGTAATTCGGAACAAATTTGACTTAGCAAATTGTTCTCTATAGTTTTTATCTTATCTTTTACATATTGAGTATTAAGTTGTTTTTCTATTTTTTTATAGGTTATTTCTTCCTGTAAATGCTGGATATGGGTTTGCTTACCTTTTATTAAATTGATCGTTTTATTTATCGTGTTTTGTTGAAGATTAAGAATTTCTTTAGTCTTCATAGGCGATAGGAAATTGAATAATAATTTTGTTCCTACTACCTTGGTTGATATTCCTTGTTCTGTTACTTTAAAGGGATATATTTGAGTAAAAAATAGAGTTCCTAATATTACTTCTTGTGATAAATTTTTGACTAAAATGAATTGATTTTTAAAACAATAACCTTGATTACATATTTTTGCGCATGGTAGTTTATATTGAACTTTTAAATTACTACCATTAGCACCGCTTAATCTTTCAGTAGTTTTTTCATAATATTTTGTTGGGATAACTCCTTCACAGATACAGTTATAATATGCACCAGTATCCATTAAGGCTATTATGTTTATTTTAAAGTCATTTTGCTATATGTAAGGTAATATTTGTATACTATTTTTGAGAATTGATTTTATTGATTATTTGAATATAATCTTCGGAATCTTGTTCTTCATTAATTTCTAAGTTTTGTCTATTTGAGGATGCTTGAGTATTATTGTTATTCTTTGATTCTATCAGAGATAATCTTGCATTTATTTGTAATTGCTTAATATCTTGATCATTTACAATATCTTGTAAATGTTTAATTTGTGACTTTATTTGTTTAATTTCATTTTGTAATTCTCTCGTAGATACTTGTTTAAACAAACTC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2191

Start:

488509  

End:

490699

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_26

GCCATACCCATTTCTTGTAATACATTCATTATTTTGTATTCGGATTTACCATCTATGTTCCATTCATATATACCATTTCCTGAATACATATTGTTAGAATATTTATGATGTTCTTCAAATAATAAGTCTGGTGGAGTATGCCTTGAATAATAAGGTTTATTAGATCTTATAGTTCTATTTTTTATTCTATTTATTTCTTGTATATCACTTTCTGACGATATAGATGTTTGAATAGATTCATTATCGTTTTCATCTATATTATTGATACTTTTACCTTTATCTAATTTTTCTAATCTATTGGCTATAGATTTTAAAATTTCATTTTCACCGAATTTAACTTGCCTTGTAATTGGTTTAAATATTGGGGTTGATACAGATGAAAAGGGATGTTGGGTAGTTTGATTATTTAGAGATAATTTATCACTTTCATTTATTTTATTATCTATGTGATTTACTTGTTTGGATATTGTATGGAGTAACTGACTTTGATAATTATTTTGTTGATATACTGCTTTAATATCTTGTTGTGTTATTAGATTCTTATCATCTTGATTAGCTCCTGTTTTAAAGGGTGAGGCTACGAGTATTCTATCAGGTGTAGTTATTTTTAAATCTTTTAAGGGTTGATGGACTGATCTAATTTTATTACCATCCGATAATTCCCATATTTGACTTAAAGATGCACTAGTATTTATTGATTTAAATGGATAATTAATATTATGAGAGATTGCATAAGTTTTGAACCAAGTGAAAAATGGAATATCTATCTCTTTTATTGTCATAAAGTTATACCAATCTTGTCTAAATTCAATTGTTTGTTGCTTAGAAAATGTCTTGAAATACCAATTTCTTTTTTCTTCATTTTCTTTTGAATAGAAATATTTTCTAATATATTGTTTATTAATTGTATATTCTTTTAATATTACATTAATAGTTTTAAAATCTGATGGAGTAGGTGATGTTGGACATCTTAGTTGAGTAGGTTCAGCTATTGGAGCATTAAATTTAATTTGATTATCTTGTTGAATATTTTGATTTACACTTTCTGTATCAGAATCTGTACTAGGTTGATTATTACGATATTCGGAAAATGAGGCTCTTGAATTTGAATAATAAGAGTTAATTCTTGGGGGAAGTGGTTCTCTAAATGATCCGAATTGTAATAATATTTTACCATCTCTTTGTTCGAATATTCTTGAAATATTTCTTTGTTCAAAATTTCTAGGGGGTTGTGTAATTTCTATTTTCCATTGATCTGGAATAGTTATTTCATTCCATTTTAATTGCTTAGGTGTGTAAGTAGCAGTAGGAGTATCTTTACTATGAACTGCTAATATTGTCGTTTCTCCTTTATCATCTTGTAATAAGCATCTTGGATTAAATTCAGAAGTTGATTGTTTAAAGTAAATTCGATAAAGTAATAAATAACCATGTCTCTCGTTTTGAAATTTCATTTCTGGTAAATGAACATTTAATACTAAAGTATTCAATATAGTTGGATCGGGTAAGCTAACTTGATAATTCGGGGCACAATTAAAGTACACTGCTCTGTTGCATAAGTTTGATTGTACAGCTCCTAATAAAGAGTCTTCATATTTTAATAAATTTTTGTCTCGTAGTAACATGAGTATAGGTGAATCTATACCCGTTCTTGATAATGGTTTGATAGCAATTTGTATAAGTCCAAAATGAATATAATTAAATCCTTTTTGTTTATATTTGTCTAAGGCGAGTGATGATAATAATTTTATCTCTTCAAATTCATTTTGAAGAGACAAGGTTTGCTCATGCTCTTTTATTGAATATGCCGTTTTAAAATCAAATGTTCCAATTTGATATATATTGTCTGGATTAATATGTGGTAATTGATCCTTTGTTATTTCTTGATTAAAGGATGTTATTTTTGACATTATTTCTCTTGAATTAATTGTTGTATGTGACGAAGATGCAGATGCATGTTTCGACTTAAAAACTTTCTAAACGAGGACGCCATGATTTATACAAAATTTAAACTCATGAGAAGAGACTTACCGATTCTAGTTGATCACTGCTGCTGCCTTGCCAACGGACTCACTGCCTCTCTTAGGTCTTGCTGCCTGGAACACCCTCAGCTTCGTGGTCTCATAGATTGGAAAGGTCTTTTCTAAAGGTTTGATTTTGTCAAAATCACGAAATCCTTGTTTTTAAAACT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

333

Start:

1459518  

End:

1459850

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_27

GAACAAATTTATCAAATCTCAAAATTAAATTTTCTAAGAACTGATTACTCAATTAAAACTGAAGAACGAGATATACAACTTACAAAATCTTTTGAAACAATCCATTTGTTTTCTGAAAAAGCTCTAAAAAGACATAGAGAAAACGGTTTTAAATATATACATATTAGTTTAGTTCAAGTTGGAATTAAACCACTTTCAAAAGAAGGATTAAACACTTCTATTTTAGCTATTTTACGAGATACAAGATTTAAAATATTTGAAGATTCATTATTAAGCTCTATTGAATCAAGTTTGTGTACTGGTCCAGTTTCATTTGATTGTTATCCAAATTTT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1374

Start:

1463570  

End:

1464943

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_28

AAATTTGTTCAGAATTACCTACAGCCTTTTGGAATCGCAAACAACACATTGTTGATTTGCCATACGAGGGAAATTTCAATGAAAAAGAAATTCCCACTAAGGCTCGTCCTATACAAATGAACTCTGAATTAGAAAAACATTGTAGAAAAGAAATTTCTGATCTTTTAAACAAAGGCTTAATTTCAAAATCAAGATCTCCTTGGTCATGTGCTGCTTTTTATGTGAATAAAAATTCTGAAATTGAGAGAGGCACTCCTAGGTTAGTAATAAATTACAAACCTTTAAATACCGCATTAAAATGGATTAGATATCCAATACCAAATAAAAAAGATTTACTTCAAAAGCTTTATTCTGCCCACATATTTTCAAAATTTGATCTTAAATCAGGATTTTGGAAAATTCAAATCTCTGAAACAGATCGCTATAAAACAACATTTACGGTTCCTTTTGGTCAATACCAGTGGAATGTAATGCCATTTGGTTTAAAAAATGCACCTTCGGAATTTCAAAGAATCATGAGTGACATATTTTCTGAATATTCAAAATTTTGTATTGTTTACATTGATGATATTTTAATATTTTCAAATTCTCTTGATGAACATTTTAAACATTTGAAGACATTTTATTATGTTGCAAGAAAAAATGGTCTTGTTGTTTCAAAAACAAAAATGTCTTTATTCCAAACGATTTCTAGGGCATTACATATCGCAAGGTATGATAACCCCGATAGAAAGATCTTTAGAATTTGCAAACAAATTTCCAGATAAAATTTTAGATAAAACCCAGTTACAAAGGTTCCTTGGTAGTCTTAATTATGTATTAGATTTCTGTTCTAACATTAATAGGATAGCAAAACCATTACATAGTCGTCTAAAAAAAAACCCAGTTCCTTGGACAAAAGAGCATACTGCACTAGTACAAAAAATTAAAAAGCAGGTTCTTGAAATCCCTTGTCTGCATATAGCGGATCCAGATTTAGAAAAGATTGTAGAAACAGATGCATCAGATGTAGGATATGGTGGTATTCTTAAACAAAAGAACATAGATGGTCGAGAAAGTATAATACAATTTACATCTTCGCATTGGAATGATACCCAAAGAAACTATTCTACTATTAAAAAAGAGATTTTAAGTATAGTACTATGTATACAAAAATTTCAAAGTGATCTCTTGAATAAATTTTTTTAATTACGTATCGATTGCAAAAGCGCTAAAGATGTTTTACAAAAAGATGTTAAAAACCTTGCCTCAAAACAAATTTTTGCACGATGGCAAGCAATTTTAAGTATTTTTGATTTTGATATAGAATATATTAAAGGAGATTCAAACTCTGTTCCAGATTTCTTGACAAGGGAATTTCTTCAAAACATGTAC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1331

Start:

6737621  

End:

6738951

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_29

CCTTTTGGAATCGCAAACAACACATTGTTGATATACCATACGAGGGAAATTTCAATGAAAAAGAAATTCCCACTAAGGCTCGTCCTATACAAATGAACTCTGAATTAGAAAAACATTGTAGGAAAGAATTTTCTGACCTTTTAAACAAAGGCCTAATTTCAAAATCAAGGTCTCCTTAGTCATGTGCTGCTTTTTATGTGAATAAAAATTCTGAAATTGAGAGAGGCACTCCTAGGTTAGTAATTAATTACAAACCTTTAAATACCACATTAAAATGGATTAGATATCCAATACCAAATAAAAAAGATTTACTTCAAAAGCTTTATTCTGCCCACATATTTTCAAAGTTTGATCTTAGATCAGGATTTTGGCAAATTCAAATCTCTGAAACCGATCGTTATAAAACAGCATTTACAGTTCCTTTTGGTCAATACCAGTGGAATGTAATGTCATTTGGTTTAAAAAATGCACATTCGGAATTTCAAAGAATCATGAATGACATATTTTCTGAATATTTAAAATTTTGTATCGTTTACATTGATGATATTCTAATATTTTCAAATTCTCTTGATGAGCATTTTAAACATTTGAAGACATTTTATTATGTTGCAAGAAAAAATGGTTTTGTTGTTTCAAAAAAAAAATGTCTTTATTCCAAACTAAGATCAGATTTCTAGGGCATTACGTATCGCAAAGTATGATAACACCGATAGAAAGATCTTTATAATTTGCAAACAAATTCCCAGATAAAATTTTAGATAAAACCCAATTACAAAGATTCCTTGGTAGTCTTAACTATGTATTAGATTTCTGCCCTAACATTAATAGGATAGCAAAACCATTACATGGTCGTCTAAAGAAAAACACAGTTCCTTGGACAAAAGAGCATACTGCACTAGTACAAAAATTAAAAAGCAGGTTCTTGAAATCCGTTGTCTGCACATAGCAGATCCAGATTTAAAAAAGATTGTAGAAACAGATGCATCGGATGTAGGATATGGTGGTATTCTTAAACAAAAGAATATAGATGGTCGAGAACATCTTCGCATTGAAATGATACCCAAAAAACTATTCTACTATTAAAAAAGAGATTTTAAGTATAGTACTATGTATACAAAAATTTCAAAGTAATCTTTTGAATAAACATTTTTTTATTACATCTCGATTGCAAAAGCGCTAAAGATGTTTTACAAAAAGATGTTAAAAACCTTGCCTCAAAAAAAATTTTTGCAGGATGGCAAGCAATTTTAAGTATTTTTAATTTTGATATAGAATATATTAAAGGAGATTCAAACTCTGTTCCAGATTTCTTGACAAGGGAATTTTTTCAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1332

Start:

7381414  

End:

7382745

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_30

ATCAAAGAAGAAATTACCAAGACCTCTTGTGCCAGTTCTCACTCCGAATTCCTCACCAAATGTTCTTCACCCCTTTGGAAAAATCCAGACTTCTTCATATCCTTGCCATTCAAGAAAAATGAAGATATTAATCCCACAAAGGCTAGTCATCCAGGGATGAATCCAAATCATTATACTCTGGCACTTGAAGAAGTAAACCTACTCCAAAAGGAAGGTCTCATCAAAACAACAACTTCACCATGGGCATGCGAGGCTTTCTACGTCAACAAAAAGGCAGAACAAGTCCGAGGAAAATTGAGGTTAGTCATCAATTACCAGCCACTCAATCACTTCCTTGCTGATGACAAATTTCCATTACCGAAGCGGGAAGTCTTATTTCAACGGCTCCCACAAGCACAAGTGTTCTCAAAGTTTGACCTAAAAGCGGGATTCTGGCAATTGGGAATCAAGCCGGAGGATAGACCTAAAACAGGTTTTTGCATACCAGACCATCATTTCCAATGGAAGGTCATGCCATTTGGACTAAAGGTAGCCCCATCACTATTTCAAAAGGCAATGACAAAGATATTCGAGCCAATACTTCCAAATGCACTGGTAAACATCGATGATATCCTTTTGTTCTCTTCGGATATCGACTCCCATACCCGACTACTAGAGAAATTTCACAAGATCGTACAACAGTATGGCATCATGCTCTCCGAGAAAAAGATGGCCATTGGAGAGACAGAGATAGATTTTCTTGGCATGCATATCTCAAAAGGGCAATACCACCTACAGCCTCACATTGCAACACAGCTCAACAAATTCCCAGACGACAAGCTCTCTTTCAAACAAGTCCAACAATTCCTTGGAGTTGTCAATTACATGGCGGAATTCATTCATGGCTTAGCAAAGTACAGGTCAATCCTTTCAACACAACTAAAGAAAGATGCTCCTCATGGGACGAAAGATGTACAGAAGCAGTAAAAGAACTGAAACGGATCTCAAAGACTCTACCCTCATTGAAGATCCCTTCTAAAGGGAAAAAAATCCTACAAACTGATGCAAGTGACTGCTATTGGGGTGCTGTTCTCTTAGAAGAAGATGAAAAAGGGAAAAGAAGCATTTGCGGATACAAAAGTGGTGTTTTCAAAGACAGTGAAAAGCACTACCATTCTACCTACAAGGAAGTACTTGCAGTCAAGAGAGGCATAGAGAAATTCGAGTTCCACCTAGTCGGACAACACTTTCTCATCGAAATGGACATGTCCTCGTTCCCAAAGATGATTCAGTTCAAGCAAAAGATCTTGCCACAAGCAAAATTACTTAGATGGACAAGTTGGTTTTCACAGT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

545

Start:

7384841  

End:

7385385

Strand:

+

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_31

CATGGGTATACCCACCTACACTACGGAGCAATTCGGTTGGCGTTAACCCTGCATGGAAGAAAAGGCCTACCCGTCGTAGCAAGAGTTGCCCCACTCGACACTAGATACAGAGAATAACAGCATGCTTGCATAGCAACAATTCAGACGACCCTGAATGCAGGCACGGTATTTGTCACTCTCTACCCCAACTTCAACATATCACTTGAAGACCCTCAAATCTTCCAAAACATGCAAATCCAGCTACAAATCACAGGCGCTTCCCAAGTTGGCAACACATATGTAGCAACACTCCACCATCAGATGGCGTATAGGGTCCAAAACCATGCTATGGACCTCAGTCTCCCGCGAGACACAGGAGATGCACTACTTATACAGCTAGAATCTCATCATGCATCCATATCCCCAGGCAAATCCCTAGAGAAGAATTAGTCAAATTACTTCCAGAGTCTTGGGTGACAAATTACGAAAAGCTTCATGACAACAGCGTACCGATTCAATCCGTGGACTCTTCCATCTACAAAAGAAAAGACGGAGCAATCGAGATA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

503

Start:

7496086  

End:

7496588

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_32

ACTGTGAAAACCAACTTGCCCATCTAAGTAATTGTGCTTGTGGCAAGATCTTTTGCTTGAACTGAATCATCTTTGGGAACGAGGGCATGTCCATTTCGATAAGAAAGTGTTGTCCGACTAGGTGGAACTCGAACTTCTCTATGCCTCTCTTGACTGCAAGTATCTCCTTGTAGGTAGAATGGTAGTGCTTTTCACTGTCTTTGAAAACACCACTTTTGTATCCACAAATGCTTCTTTTCCCTTTTTCGTCTTCTTTTAAGAGAACAGCACCCCAATAGCAGTCGGTCGCATCAGTTTGTAGGATTCTTTGCCCTTTAGAAGGGATCTTCAATGAGGGTAGAGTCTTTGAGATCCGTTTCAGTTCTTTTACTGCTTCTGTACATCTTTCGTCCCATGGAGGAGCATCTTTCTTTAGCTGTGTTGAAAGGATTGACCTGTACTTTGCTAAACCATGAATGAATTCCGCCATGTAATTGACAACTCCAAGCAATTGTTGGACTTGT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

792

Start:

7498235  

End:

7499026

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_33

AGCTGTGTTGCAATGTGAGGCTGTAGGTGGTATTGCCCTTTTGAGATATGCATGCCAAGAAAATCTATCTCTGTCTCTCCAATGGCCATCTTTTTCTCGGATAGCATGATGCCATACTGTTGGATGATCTTGTGAAATTTCTCTAGTAGTCGGGTATGGGCGTCGATATCCGGAGAGAACAAAATGATATCATCGATGTATACCAGCGCATTTGGAAGTATTCGCTCGAATATCTTTGTCATTGCTTTTTGAAATAGCGATGGGCCACCTTTAGTCCAAATGGCATAACCTTCCATTGGAAATGACGGTCTGGTATGCAGAAACCTGTTTTAGATCTATCCTCCGGTTTGATTCCCAGTTGTCAGAATCCCGCTTTTAAGTCGAATTTTGAGAAGACTTGTGCTTGTGGGAGCCTTTGGAATAAGATTTCTCGCTTCGGTAATGGAAACTTGTCATCAGCAAGGAAGTGATTGAGTGGCTGGTAATTGATGACTAACTTCAATTTTCCTCGGACTTGTTATGCCCTTTTGTTGACGTAGAAAGCCTCGCATGCCCATGGTGAAGTTGTTTTTTTTATGAGACCTTTCTTTTGGAGTAGGTTTACTTCTTCAAGTGCCAGAGTATAATGATCTGGATTCATCCCTGGATGGCCTTTGTGGGATTGATATCTTCATTTTTCTTGAATGGCAAGGATATGAGGAAGTCTGGATTTTGCCATAGGGGTGAAGAACATTTGGTGAGGAATTCTGAGTGAGAACTGGCACAAGAGGTCTTGGTAATCTCTTCTTTGAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_11_LTR-Caulimovirus_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

272

Start:

7499520  

End:

7499791

Strand:

-

>scaffold_11_LTR-Caulimovirus_34

CATCCTCTTCTTCTTCGGTTTCAGATTCTTCTGAGAATTCATCATCATGCTCGATTCCCATTGCAAGGACTGTATCATCAGTTGGTTCATTATCAAGAGAGAAGATAGACTCGATGTCTGAGTCGTCAATGTCTTCTACTTGGGCTAGATATCCAAGGAGATTATCCCTCTTCTTCTTGTTTGGACACTGTTTTGCATAATGTCCTTTCTTTTTGCAGATGTAGCATCTGTGAGATTTCTTGTAGCCTCTTTGTTTCTTTCTCCTGAAGAAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_119_LTR-Caulimovirus_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

509

Start:

1622  

End:

2130

Strand:

+

>scaffold_119_LTR-Caulimovirus_35

CATGGCTATACCCACCAACACTACGGAGAATTTCGGTTGGCGTTAACTCTGCATGGAAGAAAAGGTCTACCTGTCGTGGCAAGAGTTTCCCTACTCGACACTAGATACAGAGAATACCAGCATGCTTGCATAGCCACAATTCAGACGACCCTGAATGCAGGCACGGTATTTGTCACTTTCTATCCAAACTTCAACATATCACTTGAAGACCCTCAAATCTTCCAAAACATGCAAATCCAGCTACAAATCACAGGCGCTCCCCAAGTTGGCAACACATATGTAGCAACACTCCACCATCAGATGGCGTATAGGGTCCAAAACCATGCTATGGACATCAGTCTCCCGCGAGACACAGGAGATGCACTGCTTATACAGCTAGAATCTCAACACAGTCCATCATGCATCCATATCCCCAGGCAAATCCCTAGAGAAGAATTAGTTAAATTACTTCCAGAGTCTTGGGTGACAAATTACGAAAAGCTTCATGAAAGCAGCGTACCGATTCAATC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_119_LTR-Caulimovirus_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

578

Start:

4995  

End:

5572

Strand:

+

>scaffold_119_LTR-Caulimovirus_36

AACACCATCAAAGAAGAGATTACCAAGACCTCTTGTGCCAGTTCTCACTCAGAATTCCTCACCAAATGTTCCTCACCCCTATGGCAAAATGCAGACTTCTTCATATCCTTGCCATTCAAGAAAAATGAATATATCAATCCCACAAAGGCTAGTCATCCAGGGCTGAATCCAGATCATTATACTCTGGCACTTGAAGAAGTAAACCTACTCCAAAAGGAAGGTCTCATCGAAAAAACAACTTCACCATGGACATGCGAGACTTTCTACGTCAACAAAAGGGCAGAACAAGTCCGAGGAAAATTGAGGTTAGTCATCAATTACCAGCCACTCAATCACTTCCTTGCTGATGACAAGTTTCCATTACTGAAGCGAGAAGTCTTATTCCAAAGGCTCCAAGCACAAGTCTTCTCAAAGTTCGACTTAAAAGCGGGATTCTGGCAATTGGGAATAAAACCAGAGGATAGACCTAAAACAGGTTTTTGCATTCCAGACCATCATTTCCAATGGAAGGTTATGCCATTTGGATTAAAGGTGGCCCCATCGCTATTTCAAAAGGCAATTACAAAGATATTCGACCC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_12_LTR-Caulimovirus_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

379

Start:

307462  

End:

307840

Strand:

-

>scaffold_12_LTR-Caulimovirus_37

ATAATAAAGCAATTTAATTTCTTCAAATTCATTTTGTAATGATATAGTTTGTTCATGTTCTTTTATTGAATATGCAGTTTTAAAATCAAAAGTTCCTATCTGATATATATTTTCAGGATTAACATGAGGTAATTGATCATGTGATATTTCTTTATTAAAAGTTGTAATTTTTGACATTATTTATCTTGAATTAATTGTTTTTTGAGAAGCAGAAGAAGCAATATGTTTAGACTTAAACCATTTTCTAACTGAAGATGCCATGCTTTAAACTCTACTTAGACTCTATGCGACATGCAAACTAACCCAAACTTTTCAAGGACGGACAGAACTGCGGCTTACCAATGATTTCACTGCCTTTAGGACTTACTGCCTGGAACAC

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_12_LTR-Caulimovirus_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

147

Start:

308995  

End:

309141

Strand:

-

>scaffold_12_LTR-Caulimovirus_38

GAGTAACGGTCTAAATTGTACTTGTCCCACCATTTTACTCGGTATTCTCGGACTAATGAGTATGGCATATCGGGTAAAAAAAGTATAAGGTTAAAATGCCAAGATAGTATCCAGGGAACCCCCATATCAATATGGAAAGATATTTTT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_12_LTR-Caulimovirus_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2973

Start:

309193  

End:

312165

Strand:

-

>scaffold_12_LTR-Caulimovirus_39

TAGAACCATCCTGGTATTGACTTAGGACAATGAAAGTCAAATGATAGAAACCAAGAGTGGTCATAGGTGCGTAGTTAAAAGGCATGTAGAAAGGCTTTTTGGTAGTCTACGTAGGTATATCCTGGAATATGATACCCTGAAACAGAGAATTCTTTAGTGGTGTGAGAGGTAAAGAACCCGATGTCTTTAGGATTGCATATCCTTAGTATTTTGCAGGTGGAGTATGAGATGAGGTTGGGGTTGGTTTTATCTGTATGGTGGGTTATTTCGACTGACTTGGTATCGACGAGGATAAACTCATAAAAAGTACGGTTCTTGGTAAGGTTGTCTGTAAGGTATTGGCTATCCTCGTAAAATATACGATTGGTAAATTGGGTTATGTATTTCAATAATATTGGTTTGGTGAAGGAGGTGGTGAAGAGGTGTTGGCGGTGTGGTTTAAGGAAATAGGAGGATTTTTGGTCAGTAGTTTTTTGTGAGGAGGAGGGAGTGGTTAATTTTTGAGGTATTGGGTTAACAGCTTTTGCATAGGACAAAGGAGGGAATTCTGCTAATGCAGAGTATTGATTACTGGTGGTTATTTGTTTTCCTTGTAGATGCAGTTGATTCTTGATGTAGTCTGTTGCGGACATCGGTTTCTTTTGTTCACTCATTTTGTAGGTCTTGAGATTTTCCCTGTAAATACTCTTTTGTTAGAAAATCAGGTAAACAAGTATTATTCCCTTTTATATATTGTATATCAAAATCGAAAACAGATAAAATTGTTTGCCATCTTGCAAAAATTTGTTTAGAAACTAAATTTTTAACATCCTTTTGTAAAATCTCTTTTGCGGATTTGCAATCTACTCGTAGTAAACATTTTTTATTTATCAAATCGTCTTGAAATTTAGAAATACAGTTTACTATAGATAAAACTTCCTTTTTAACTGTAGAATAATTTTTTTGAGGTCCAAGCCAAATTCCCGAATGAAAACGGACTATTGACTCCTGAGTAGACTCTGACATCTTTTGTTTAAGTATTCCCCCATATCCTATTTCTGATGCATCGGTTTCTACTATCATGAATGCATTAGGATGTGGAATAACTAGACACGGTAAAGTGGTGACTTTTTTCTTAACATCTTGAACTATACTAGTATGCTGACTAGACCACGATACTGGATTCTTCTGCAATCTCTGAAACAATGGTTGAATAATTTTTCTGATAATAGGTAAGAAGTCTGATATATAATTTAAACATCCTAAAAATCGTTGTAATTGAGTTTTATCTTTTATTTCATCTGGAAATTTATTTGCAAATTCTATAGACCTAGATATAGGTGTTATAGTTCCTTGATAAATATTATGCCCTAAAAATCTTATTTTTGTTTGAAATATTTGCATCTTTTTTGCGGATACTACTAATCCATGTCTTTTGACTATGTTTAAGAAAGTATATAGATGTTTAAAATGTTGGTCAATAGATTTTGAAAATATTAATACATCATCTATATAAACCATAGAAAAGGTAGAATAAGGGTTAAATATTTCATTCATAATATTTTGAAATTCAGAAGGTGCATTTTATAAACCGAAGGGCATGACATTCCATTCATAATGCCCAAACGGGACGGTGAATGCTGTCTTATATTTGTCCTTTTCGGCTATTTGAATTTGCCAGAATCCGCTTTTCATATCAAATTTTGAAAATATGCAAGCATCATATAGTCTTTTTAATAGGTCTCTTTTATTAGGTATAGGATACCTTATCCATTGTATAACATTGTTTAAAGGTTTATAGTTAATCACTAGGCGAGGTATTCCTCTTTCTTTTTCTGCTTGGTTATTAACGTAAAAGGCTGAATAACTCCAAGGTGATTTAGATTTCCTTATTAGTTTTTTATCTAATAATTCTTGAATTTCTTTCTTACAATGTTCTAAAAGTTCTTGATTCATTTGAATTGGTCTAGCTTTAGTTGGAATATTTCTTTCATTGAAATCCTTTTCATAAGGAATTTCAACAATATGCTTTTTTCTTTCCCAAAATGCATTTGGGATTTCAGAACATATTTGACTTAATAATTCATTTTCTATTTTCTTAATTTTGTTTATTATTTGTGGATTGGGTAAGTGTTGTTCTATTTGTTGATATTTTATTTCCTGTTGCAGATATTGAATATGTTTTTGTTTCCCATTAATTAAATTTATAGATTTTTCTATGGTGGAGTTTTGTAAGGCTAGAATTTCTTTAGTTTTCATAGGAGAGAAAAACTCAAAAATTATTTTCTCTCCAACAATTTTTGTAGTGATTCCTAATTCTGTGACTTTGAATGGATAAATTTGTATGAAGAAGAGAGTTCCTAATATAACTTCTTGACTTAAATTTTTAACTAGGATAAATTGTGTTTTAAAACAATAGCTTTAATTACAAATCTTTGCTTTGGGTAGTTTATAATTAACTTTTAAACTACTCCCATTTGCACCACTAAGTCGTTCATAGGTTTTTTCATAGTACTTAGTTGGAACTATTCCTTCTCTAATACAGTTATAATCTGCTCCTGTATCTAATAATGCTATTATTTCTAATTTAAAATCATATCCTATATGTAAAGTAATCTTTGTATACCATTTTTGATAGTTTATTTTGTCTATGATTTGGATATATTCTTCCTCATCTTTTGTCTTTTCTTGGTTTTCAGGGTTACTTGCAGATGGTTCAGTGGTAATAGGAGATACGAATTGATGAACTCTTGGTTCTATCAAGGCTATCCTAGCATTTATTTTTAATTGTTCTAATTGTTGTTGGTGGACTATTTGTTGTAATTCTTACTTGTGCCTTTAAATTTTTAACTTCTCCTTGTAACTTTCCTGTAGTTACTTGTTTAAACAAAGTAGGACAATGGTATTTTTCAAGTATTTTACTAAGGCTAAAAGGTTGTGGAGTAGATAATTGGTTTTCTTTATGTACTATATCTTTTAGTTTTAATAAATATT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_12_LTR-Caulimovirus_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1162

Start:

312339  

End:

313500

Strand:

-

>scaffold_12_LTR-Caulimovirus_40

CTACTAAGTTCTTCAGAGTTTTCTGATTCTGAAAGTAATAGTTTTTCTAACTTTTCTCTAATATCTTGTTGATCGTGGAAATTTTCGTTAATCTTCTTTTTCATTTTACAGTCAGAAGATTTATGTCCAGGGCGTTTACAATTCCAACAAACAAGTTTTTCTTGTTGAGCTGGTTTCCTGAATTTTTTATTTTTTGCATAGTAAGAGTTAAAGTACTTTTTTGAGAAATTTTTATTTCTATTATATGGTCGTGAAGGTGTAAATTTATTTTGTTTATAAGTTTTTCGTCTTTCTCTAGAAGGTGGAGTGAGACGGTGATAACCATATTGCTCACAAAATGAGCCCATAGTTTCACCAAATCTAAATTTACTAGTTTGTTTTTTATCCTTATGTTCTTGACAAATTTGTAAGCCTTCCTTTTTAACGAAAGCAAATAATTGTCCGTAAGTTATAGAATCCCAAGGTATTGGTTGTCCTCCAGAAAAGTCTTTTAATATACTTATTAATCTTTCGGCAAAGAATGATGGTAATCCTGAAATAAACCTTTCTTTCCAAAAGGGTTGATTACAATCATTCCTTTGGAATATATTGGTTATAAATATATCTTTATACCACTTGAAATCTCCTAGGGTTGGACATCTAAGATTTGTTAAAACAAGTTTTTTACTGGTTAATTCTTCAGAAGGGTTTCCTACGAAATGCATAGTCATTGTATGTAATAGTACTTCTATGGCATTTTGGATTTGTTCTTCTTCATAAAGTCCATCTTCTCCTTCTACCCGTCTAGTTTCAGTATGGTTGATAATAGAATCTTGAGAAATTGTATCTAAAGAATTATCCCACCAATATTTTAGTGCTCCATTAAATCCAGAAATGAGGAGGACACATGCTTGTTTGTCCGATAAGCCTTTAGCTTTATAGGCCAAGCCAGCAATCCCCATTTCTTGGAATAGGTTCATCATTTTGTATTCTGATCTACCATCTATGTTCTATTCATCTATACCGTCTCCGGTATAAAAGTTTGCAGTAGGGAACTTATGATGTTCTTCAAATAGTAGGTCTGGTGGAGAGTGTCTAGGATAATATGGTTTCTTTGATGGTTGAAATTTTCTTTATACGATTAATTTCTACTTCTTCATGAGTTTCAATTTGACTATTTTCA