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scaffold_9_LTR-Caulimovirus_441

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

358

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2405476  

End:

2405833

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_441

ACCAAATTTACAGATACATATGAATACAACCACAAAGGAGATTTATTAGTATCAAGAAATATATTTAAAAAGTTATTTAATGATGGAAGAAGTGATTATACAAAGAGTGATATTTTATTTATATTGAACACTCAATTTACAAAGATTCACAAACTTTATCTTAGACCCGATTACATGATTTGGCTTGGTTTATGCAATCACGCAACCCTCTTATTTATAGTGTTGAAATTATACAAATGGATATCTAACTTAAAAATACTTATATTCCTCATGCATAATTATTTACTTTTTACTTATTCAACATATACATTATTATTCATAATTCTAAACTTATTCAACATATGCATCATTATTTATT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_442

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

396

Start:

4715792  

End:

4716187

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_442

GTTTGAAAAAATGCATTTTGTAAGAAGTTCAAAATCTAATGAGTTTTTTAACCCTTATCTTGTTTCTCTATAGTATATGTTCATCATTAATTTAATCAAAATCTATTGACCACAATTTAAGAATTGTACTTGTTGTCGAGAATAGATTATAGTGGTGTAGCTGTGTAGACAAAAATGATTCAAATAGTTCCAAAAAAAAAAAACAAATGATTCTAAGGGCAATATTTATCAAAAGAGTTTTACACCGGTGCTAATGCCTACAGAATTTGAAAATAATTTTCCAGATAAAGAAAAAAAATACCAGCTATGTTAAGATGTATAAACTATCTTTACGATATTTTACCTTATATACATAATAAAGTTATTATTTAACAAGGTTGTAGAAGAATCCATATC

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_443

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

323

Start:

7732643  

End:

7732965

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_443

AATCTACTTCTCTTTTAAAGACAGGGGGAATAAATAATTATGCACATATTAAATAAGTAAATAATAAATAATTATGTATGAGAGTAAGTTAGGTATCCACGTGTGTAATAACTCTTAAATTAAGTATCCATATATATGTAATAGCTCTAAGTTAGGTATTCATGTGTATAATTCCATCATTATAAATAAAAGGTTTAGGTGCTTGCATAAACTAAACTAAATCTTGTAATTGAGTCTGAGAGAAAGCTTGAGAGTCTTTATAATTTATGAGTGTTCGATATAAAATATTTCTCATTGTATAATCATCTCTTCCATTTTTTAAA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_444

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

846

Start:

7736001  

End:

7736846

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_444

AATAAATAATTATGGACATGTTGAATAAGTAAAGAATAAATAATTATGCATGAGAGTAAGTTATGTATCCACGTGTTTAATAACTCTAAGTTAGGTATCCACGTGTGTAATAACTCTAAGTTAGGTAGCCAAGTGTGTAATTCCATCACTATAAATAAGAGGTTTGGGTGCTTGCATAAACCAAACTAAGTCTTGTAATTGAGTCTGAGAGAAAGCTTGAATCTTTGTAATTTGTGAATGTTCGATATAAATAAAATATCTCCTCTTGTATAATTATCTCTTCCATTCTTTAAATAACATTTTATACTTTTGATCATTCAAAACCCTCTTCGTGATTGTACCCATTATGTATTGACAGTTTAAGCTCTAATTCTTATCTCCCCAAAGAATAATATGCCTACGAGTTGCCTTTATCTACAATCTAGTATGAGAGTATACTATGTGGTTGCCATTTAGTGAATCCTCCACATCAAAAGTCTTATATAGCTAAAGAAAAAAAAAGAATTTTGAGAAAAAACTTATGAGATCATAATGCTCAAAGTACTTTGAGACTCAAAGTTATGAAGTATTGCCTCGGTTATTGAGCTAAAACATCTTACGAGGGATTTCTCAAATATTCTTAGCGCATCATAAACAACTCTTGACTTAATATGACTCTAAGGGATAGATAAGAAATAAAACAATCTGTCTTGGTTTCTGGTCTCATCACATATTATGAAAAGTTCCCTAAACACAACTACTTTCAGAAAAATAACTTCTAGTAAGATAGATTACCTATATGAAATATAATATGTGAGTGAAGACAGTAAAATACCCATCACCCAGTTACTTTTACTTAACCCATAT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_445

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

339

Start:

7745792  

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7746130

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_445

AGCCACATTGACTCACACAACAGTTTCTCTTTCGACAATGTTTCCCCATCAAAATGGAGAGACAAAATCTACGAGGTGCATGCATGGCTCACAGAACAGCTTCTCAGCTCAGGGGCTATTTTTCATACAGTAATAGACAAGTTGGTCTCCAAATTCCACGGTCGCTTCAGACAGTGGTGGATTAGCTTGGGAGATTACCGACATCTACAGACCCGTCAACCTCCAAAAGTGGACACATTGATCAAACATATCCACAATGAATTTTTTTTGGCACATGGAACCACTACACAATTCAAGCAAGAGAAGAGTATATGAGCATGAGCTGCTGTTCCTTCAAAA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_446

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

295

Start:

7746126  

End:

7746420

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_446

CAAAATAGTGTCCAAATAAGAAGAAGAGAGATAATCTCCATGGATATCTATCCCAAATTGAAGACCTCGACGACTCAGACGTGGAATATATTTTCTCTTTTGATGATGAACCAACTGATGATACAGTCTTTGTAACGGGAATTGAGCAAGATGATGAGTTCTCAGAAGAATCTGAAATTGAAGAAAAAGAAGAAGATGCTAACGACCAAATTCATGTTTTTTGATCTCTAAACCCTAGACTCCTGCAAAGTTGAAGGGTCAAAAGAAGCAGATTTGGCGTACCTGTCCCAACCAG

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_447

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

451

Start:

7750453  

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7750903

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_447

TTTCTGACAGTGAAGAAGACGAAGACTCAGACTTTGGATAAGAGAGAATCTACCTCTCTTTTGGAGACAAGAGGAATAAATAATTATGCACATGTTGAATAAGTTAAGAATAAATAATTATGCATGAGAGTAAGTTAGGTATCCATGTGTGTAATAGCTCTAAGTTAGGTATCCACGTGTGTAATAGCTCTAAGTTAGATATCCATGTGTAATTCCATCACTATAAATAAGAGGTTTGGGTGCTTGCATAAACCAAGCTAAATCCTGTAATCGAGTCTAAGAGAAAGCTTGAGAATCTTTGTAATCTGTGAGTATTCGATATAAATAAAATATTTCTCTTTGTATAGTTATCTCTTCCACTCTTTAAATAATTTTTTATATTTTTGATCCTTCAAAACCTTGTTCGTGATTGTATCTATTATGTGTTTGTAAATTTGGAATTTGATACCAT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_448

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

310

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8023898

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_448

AATTTACGGACACATAGTGGGCACACATAAGGTTTATAAGGATCAAGAGTATTTAAAAAGGTATTAAAGTATGAAAGAAATAATTATATAAAGGGAGATATTTTATTTATATGGAACACTCACAAATTACAAAGATACTCGAGGTTTTCTTTTAGACTCGATTACAGGACTTAGCTTGGTTTATGCAAACACTCAAACCTCTTATTTATAGAAATACAAGGGATACCTAACTTAAGATTATTACACACGTGGATAAGATTATTACACATGTAGATACATAACTTAGAGCTATTTAACATGTGAATACCTA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_449

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

515

Start:

9750120  

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9750634

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_449

CAAATTTACAGACACATAAGAGGTACAATCACACAGAAAGTTTATTAGGATCAAGAGTATTTAAAAAATTGTTTAAGAATGGAAAGAGATGATTATACAAAGGGGGATATTTTATTTATATGGAATACTCACAAATTACAATGACACTCAAAGTTTTCTCTCAAACTCGATTACAGGACTTGGCTTGATTTATGCAAGCACCCAAGCCTCTTATTTATAATGATACAATGGATACATAACTTAAGATTATTACACACGTGGATACTAACTTAGAGCTATTTAGCATGTGGATACCTAACTTCCTCATGCATAAATATTTTATTCTTTTCTTATTTAACATATGGATTATGATGCTTTACTTATTCAACATGTGCATCATTATTTATTATTATCCCCCCTACCTCCAAAAGAGAGATAGATTCTCCCTTATCCGAAGTCTGAATCCTCGTCGTCTTCTTTGCTGTCAGAAACTATCTTCGTTATGAAGATTTTGTGGCCCGGGATATACCTTTTGA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_450

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

720

Start:

9754694  

End:

9755413

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_450

AGGAACAGTTGGGTGTTTATTTTTTGCAGGACGTTGCTCTTTGATTCTTGTTGGTAAGAAGGAGGATGATCCAAAGATACTTGGGTCATGGGAAAAGGAGAGAGGTTGTGTTTGGGTCATGGCTGGTGAAGAATATATAGGATAGGGTGTGAAGAGATCATATGGCATTACAGTCTGTGTTTTGGGCTGGTTTTGTAATGATTGTAATTGGGCTTTAAGGGATCTTAGCTCTGATTCCTTTTGGTACATGAGTGGGGAAGTTGTAGAAACGCCAGGTGTAAGAGTTCTTGGTGAAGAGAACTTATCCTTTTGTTGATTTCTTTGATTGAAAGGTCCAGGATAGATACCTTTCTGTCAATTTGGCTCAAGAGATGGTTTTGGACCATAGCGTTTTCTGATTGCCAATTTAAATTTGTTTCTACTGCACTAACTTGTTTTGTCGTTCCATCTGGATTTTTAACGTTCGGATTTCTGATTTTCCATGAGTGCCTGATCTTGCCTTCTTCAAATTCTCGTGTTGGAAATGTTGGCTCTTGAGAGGACGAAGAACCGAACATATAACATGTGCGGACATCTTCATTGTCAGGTGTTGGTGGAGTTGGTCCGTTTGAATACAAGAAATAGTATTCAAACTCCTTCCCCGTAGGTTCTCCAAGAAGACCAACTTCGGGGTCTCCAGATTCATATCGTTCCTTGAAAATTTGCTGGGATGACTTCTTT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_451

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

519

Start:

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9758925

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_451

TCAAAAGGTATATCCCGGGCCACAAAATCTTCATAACGAAGATAGTTTCTGACAGCGAAGAAGACGACGAGGATTCAGACTTCGGATAAGGGAGAATCTACCTCTCTTTTGGAGACAGGGGGGAATAATAATAAATAATGATGCACATGTTGAATAAGTAAAGCATCATAATTCATATGTTAAATAAGAAAATAATAAAATATTTATGCATGAGGAAGTTAGGTATCCACATGCTAAATAGCTCTAAGTTAGGTATCTACGTGTGTAATAATCTTAAGTTAGGTATCCATTGTATTACTATAAATAAGAGGCTTGGGTGCTTGCATAAACCAAGCCAAATCATGTAATCGAGTCTGAGAGAAAACCTTAAGTGTTTTTGTAATTTGTGAGTGTTCCATATAAATAAAATATTTCCCTTTGTATAATCATCTCTTTCCATCCTTAAACAACTTTTTAAATACTATTGATCCTAATAAACTTTTTGTGTGATTATACCCACTATGTGTATGTAAATTTGGT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_452

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

823

Start:

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10638917

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_452

ACGTTGAAAAAGTAAAGAATAACATCTCTACGCTGAATAAGTAAAGAATAACAGTTATGCATGTAGAAAGAAAGAAGTTAGGTGTCAACGTGCTAAAAAACCTTAACTTAAGTATCCATGTGTTCAATAAGTTACTGTAATTTCTGCACTATAAATAAGAGGTCTGGGTGTTGCATAAAAACAAACCAAGTCCTTAATCGAGTTTGAGAGAAAGTTTGAGAGTCTATGTAATGCTTATGTGTTTAATATAAATTAAATATTCCTTTTGTATAATCATCTCTTCCATTCTCTAAATAACTTTTTAAATATATCTTTGAACTTAGAAAACCTTCTTTATGGTTTCACCCACTATGTCTGTATTTTTGGTATCAGAACCATGACAGTCTAAGCCTTAGCTCTTATCTCTCCAACGGATAATATGTCTACGAGTTGTTTTCATCTACAAATTAGTCTGGAAAGTATGCTCTATGGTTGCTTTTTAGTGGATCCTCCAAATTAGAAATTTTACATAGCTAAGAAAAAAGAATTTTAAGGGAAAACTCATAAAATCATATTATCTCGGTTATCAAGCTAAAACATCTTATGCAGGATTCTTCAAATATTTTTAACGCTTAATAAAAAGAAGAAAAACTCTTGATTTGATATTAGGGCCCCCTTGATATTACTCTAAGGATAGATAAGAAATTAAACATTCTCTGGTCTCATTATTCATCATGGAAAGTTCTTTAAACTCTATCCCTTTCAGAAAATCAACCTCTAGCAAAATAGATTATCTATATGAAATAAAATACATGAATGAAGATAGCAAAATCCCAATTACTCA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_453

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

603

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Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_453

TAAATGTGTTATTGGGATTTTGCTATCTTCACTCACGTATTCTATTTCATATAGATAATCTAGTTTGCTAGAGGTTGGTTTTCTGAAAGGATTTGGGTTTAAAGAACTTTCCATGATGAATAATGAGACCAGAGGCCAAGACACAATGCTTTATTTCTTATCTATCTGTAGTGTAATATCAAAGCAAGAGGTTGTTTTCCTTTATATTAAGCGCTTAGAATATTTGAAGAATCTCGCATAAGATGTTTTAGCTTGATAACCGAAGCAATACTTTGTTGTCTGAAGCCTCAATATTCTTTGCCTTATGATGTTATGAGTTTTCTCTTAAACTTTTTCTATCTTAGCTATGTAGGATTTCTAATGTGGAGGATCCACTAAGTGGCAACCACAGAGCATATTTTCCATATTAGTTCTTAGATGAAAACAACTCGTAGACATATTACCCCTTGGGGGTGATAAGAGCTAAAGCTTAGATTGCCATGGCTCTGATACTAAAATAACAGACACATTGTGGATACAACCATAAAAGAGGTTTTCTAAAATCAATAATATATTTAAAAGTTTATTTAAAGTATAGAAAAGATGATTATACAAAGGGGATAT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_454

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

439

Start:

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11044963

Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_454

CTTCGAATAATTCACAAATTATTCTGAAGGAGTTTCCAAAAAAACTCACCCTCTGAAAATTTTGAAAAAAACTATTTACCAAAACACTATAAATCTTAGAAAAGGATTTTTGGTCAGCAACGACCCGTTGTTAACAATCGAAACCTCATAATACAGATAAAACTGAGTTATTCTTTCAAATTTTGAAAATAACAAAATCAGTGTCCTTTAAACACTTTTATCTCAATGAAAACCACACTAATCCTGCTTATTCAACTTTTAAAATACATAAGGTCATTGCTCCAAGCGATTGGGAATATGATCTTAATAAAAGTCTAAATTTCCCAGAAAATCTAAAAGATCTCTCATGTTTCAATGTCTTTTTTAATTAATGAGACTATTGTCAGACTTTGTATAATTTCTTTTTAATCAAATCTCCAAAACACAAACACACATGGTT

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_455

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Strand:

+

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_455

TGTTTCACAGACCTCAGGAATCGGATCAGAATATAATATCCCGGATGTCGATGAAGAAATATTTGGAAACAGTAGTGTATGATTTCCCGCCACCAAAATATAAATCTCGACAGAATCATTATTACGAATATTTGTAATATCTACAAATCTTTTGATACAATCCACAACTAATAAATATGACAATACCGTACCTCGAAGACCGCATTTTTCAGTGTTGTTTTCTGAAGACGTGACACCACTTCAATATTGGAGACAAGCTTTTGTAAAGTGGAGACAAGCTTTTATTATTATTTTTATCATTTGAACTCTTGTAAAACTCCTATATAAAGGAGTGTGTGTTTAGTTGTAATCTCCACGTCCTTA

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_456

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

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Start:

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11049071

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_456

CATATAAAAAAAATTGTGGATCATAATAAATTGTAACATAAAATTGTAAACATAAAATAGAAACAGAAATAAAATAGAAATGATAAATAAATATTTGATTACTTACGGTTAAACCAGCCACTTAAACATAAATTTAAATATAAACATAAAC

ID:

scaffold_9_LTR-Caulimovirus_457

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

175

Start:

11057028  

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11057202

Strand:

-

>scaffold_9_LTR-Caulimovirus_457

TGTAATTTAAATAAGATAAAATACTTTTATTACATAAAATTAAAGGCGGTTAAACCAGCCATAGTACAAGTTTGAAAAACTTACTTATTGGAGATCGTAACAATGTAAGAAGATTACAGGACTCAGCGAATATGGTAGAGAAAGAAAATGAAAAAGAAGGATGAAATGGAGAATG