ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr1_LTR-Cassandra_21 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1101145868511458794-
Chr1_LTR-Cassandra_22 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3101145886611459175-
Chr1_LTR-Cassandra_23 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3121182668211826993-
Chr1_LTR-Cassandra_24 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3311182790611828236+
Chr1_LTR-Cassandra_25 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2631194807711948339+
Chr1_LTR-Cassandra_26 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2631194932911949591+
Chr1_LTR-Cassandra_27 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2661206730112067566+
Chr1_LTR-Cassandra_28 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1901209228212092471-
Chr1_LTR-Cassandra_29 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2771259148212591758-
Chr1_LTR-Cassandra_30 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3231314369813144020+
Chr1_LTR-Cassandra_31 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1121314409013144201+
Chr1_LTR-Cassandra_32 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3221314420213144523+
Chr1_LTR-Cassandra_33 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2951335222513352519+
Chr1_LTR-Cassandra_34 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2341344229613442529+
Chr1_LTR-Cassandra_35 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2941349250413492797+
Chr1_LTR-Cassandra_36 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1291349891413499042+
Chr1_LTR-Cassandra_37 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1131349909913499211+
Chr1_LTR-Cassandra_38 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3261349921213499537+
Chr1_LTR-Cassandra_39 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2991354345913543757+
Chr1_LTR-Cassandra_40 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra861354374813543833+

< 2 3 4 5 6 > Total 204


Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

110

Start:

11458685  

End:

11458794

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_21

ATTCACCCCCACTAACAGATCACAACGTCCTCGTTGCGCACCAAGACCATCATCCCCAACGGTGTGAGTCCACTCGACTCCACACTCGTCTGGGTTCGTCTCTGATACCA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

310

Start:

11458866  

End:

11459175

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_22

AATGGGCCTCACGTCCTCTCACTAGGCATGTGAGCCTATCCATATCTGACGGCTGGTTTGCTAAGTCCAAGAGGCTTTGACTTGTTACCTTTCCTACAAATCACCACATGATCTTTTCCTGTGTTTGTCCTCACTCACACAATTCCGACAGTCACTTCCCAGAAGGTCACCCATCCTAAGACTACTCTAGCATAAGCACGCTTAACTGTGGAGTTCTCTCAGGACCATTGACTGAAAAGATAAGTGCACTTTGGT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

312

Start:

11826682  

End:

11826993

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_23

AATGGGTCTCACGTCATTTCATTAGGTCTGTGAGCCCATCTATATCCGATGGACGTCTGGGAGGTTTTAAAGTATTGTTACCTTCCCTACAAATCACCACATGATCTTCCCTGTGTTTTGTCCTCACTCTCACAGTTCCGACAGTTACTTCCCGGAAGGTCATCCATCCTAATACTACTACAGCTCAAACATGCTTAACTCCAAAGTTCTCTCAGGACCATTGACCGAAAAGATAAGTATACTTTGGTGACATAT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

331

Start:

11827906  

End:

11828236

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_24

TGTGACACGCCGGTTTCAGAGACTTGCGGAGAGATTTAAAAGAATTGATTTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAGGGTTATGAGAGAACTCCAGAGTTATGTGTGTTTGAGCTGGAGTAGTCTCAGGATAGGTGACCTTCCCGGAAGTGATTGTCGGAACTGTGCGAGTGAGGTCAAAACACAGGGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGAGACGGTAACAAGTCTTTAAAGCCTTC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

263

Start:

11948077  

End:

11948339

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_25

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Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

263

Start:

11949329  

End:

11949591

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_26

ACAATCCGGTTTCAGAGACTTGCGGATAGGTAAAAAATTTATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAGGGTCCTGAGAAAACTCCAAAGTTAAGCGTGCTTAAGCTGGAGTAGTCTTAGGATGGGTGACCTTCCGCAAAGTGATTGTCGGAACTATGAGAGTGAGGACAAAACACAGGGAAAGACTATGTGATGATTTGTAGGGTCGGTAACAAATGTTTAAAATCTCCGGGACGTA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

266

Start:

12067301  

End:

12067566

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_27

TGCGGAAAGATTTAAAAGAATTGATTTGACTACATATGTGACAAAAATGCACTTATTTTTTTGGTCAAGGATCCTCAAGGAACTTCATGATGGGTGGCCTTCGTGGAAGTGATTGTCGAAACTGTGCGAATGAGGACAAAACACATGAAAAGATCATTTGTTGATTTGTAGGGTCGGTAAAAAAGTTTTTAAAGTCTCCCAAACATAAAAAACCGGCCATCGAATATGGGAGGATCCACAGTTCGGGAATAGATA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

190

Start:

12092282  

End:

12092471

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_28

TGAGATGTTTTAAAGACTTGTTTACCGTCTTTACAAATTTATATGTGTTCTTTTTATGTGTTTTATCTTCACTTACACGGTTCCAACAATCACTTTCTGGAAATTCATCTATCTTAAAATTGTTCTAGCTCTAACATGTTTAACCGTGAAGTTGTCTCAGAATGGTTAACCAAAAAATAAATTCACTATG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

277

Start:

12591482  

End:

12591758

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_29

GACCCACCTTCCTAAGTGGGCCCTAAATCTATTCCCAGCCTATGGATCCACCCATATTCGATGGCCGGTTTGTTACGTCTGGTAGGCTTTAAAAACTTATTTACCGATCCTACAAATCAACAAATGATCTTTTCCTGTATTTTGTCTTTACTCGCACTGTTCCGCCAGTCAATTCCAGAAAAGTCACCCATCATGAAGTTCTCTCAAGACCCTTGACAAAAAAATAAGTGTATTTTGGTGACATGTAGCCAAATT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

323

Start:

13143698  

End:

13144020

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_30

TATGACACCTCGGTTTCAGAGACTTGCAGAAAGATTTAAAAGAGTTGATTTGGTCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAGGGTCCAAAGAGAACTCTAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGATTAGTTTTAGGATGGGTGACATTCCCGGAAGAAACTGTCGGAACTGTGTGAGTGAGGACAAAACACAGGGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGATGGTAACAAGTCTTTCAGGCCTCCC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

112

Start:

13144090  

End:

13144201

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_31

AGTGGTATCAGAGCCGAACACAGATGAGTGTGGAGTCGAGTGGGCTCACACCGTCAAGGGGTGACGTTCTTGGTGCGCAACAAGGACGTTGCGATCTGTTAGTGGGGTGAAT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

322

Start:

13144202  

End:

13144523

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_32

TATGACACCCCGGTTTCAGAGACTTGCAAAGAGGTTTAAAAGAATTGATTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAGGGTCCTGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTCTCAGGATGGGTGACATTCCGCGAAATAACTGTCGGAACTGTGTGAGTGAGGACAAAACACAGGGAATGATCATGTGGTGATTTGTAGGGACGGTAACAAGTCTTTCAAGCCTCCC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

295

Start:

13352225  

End:

13352519

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_33

TTGATTTGTCCACCTGTGTGACCAAAGTGCATTTATCTTTCTGGTCAACCATTATGAGAGAACTCCACAGTTAATCATGTTTAAGCTTTGAAAGTTTCATGATTTGGAAAAGTGATTGTCGCAATTATGCGAGTGAGAAATGAAGAAATATTACATGGTGATTTGTAAGGTCGGTAAACAAGTCTTAGACATGATGTCCTCCCGAACATAGTGTACCGGCTGTCGGATAAAAGTGAGTTCATGGGCCTAGAGAGG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

234

Start:

13442296  

End:

13442529

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_34

TGCAGAAAGGCTTAAAAGAATTGATTTGGTCACATATGTCACCAAAATGCATTTATTTTTTTGGTCAAGAGTTCTGAGAGAATTTCATGATGGGTGACCTTACTGGAAGTGATTGTCGGAACTGTGCGAGTGAGGACTAAATACAAAAAAAGATCATTTGCTAATTTGTAGGGTCGGTAAACAAATTTCTAAATCTAACAAATTGGCCATCGAATATGGATGGATCCACAGGCC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

294

Start:

13492504  

End:

13492797

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_35

GAGATGTTTAAAATAATTAATTTGGACACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTTGGTCAAGAGTCGTGAGAGAAAACCACAGTTAAGCGTGTTTATGCTGGAATAGTCTTAGGATGGGTGACCTTTCGGGAAGTGATTATCGAAACTGTGTGAGTGAGGACAAAACACAAAAAAATATCATGTGGTGATTTGTAGGGACGGTAACAAGTTTTTAAAGCCTCCTGAACGTAGCAAACCGACGTCGAATATAC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

129

Start:

13498914  

End:

13499042

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_36

AGATCATGTGGTGATTTGTAGAGACGGTAACAAGTCTTTCAAACCTCCCGGACGTAGCAAACTGGCCGTCGGAAATTGATGGGCTCACGGGCCTTGTGAGAGGACGTGAGGCCCATTAAGGAAGGTGGG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

113

Start:

13499099  

End:

13499211

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_37

AGTGGTATCAGAGCCCAACCCTGACGAGTGTGGAGTCGAGTGGACTAACATCGTCAGGGGGTGATGGTCTTGATACGAAATGAGGACGTTACGATCTGTTAGTGGAGGTGAAT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

326

Start:

13499212  

End:

13499537

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_38

TGTGACACCCCGGTTTTAGAGACTTGCGGAGAGGTTTTAAAAAAGAATTGACTAGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCAATTATATTTTCGGTGAAGGGTCCTGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTCTCAGGATGGGTGACCTTCCGAAAAGTGACTGTCGGAACTGTCCAAGTGAGGAACAACCACAAGAAAAGATTATCTGGTGATTTGTAGGGACGGTAACAAGTCTTTAAAGCCT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

299

Start:

13543459  

End:

13543757

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_39

TGTGACACTCCAGTTTCAGAGACTTGCGGAGAGATTTAAAAGAATTGGTTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAGGGTCCTGACAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGAGTAGTATCAGGATGGCTGACCTTCCGGGACGTGATTGTTGGAACTGTGCGAGTGAGGACAAAACACAGGGAAAGATCATGTGGTGACTTGTAGGGACGATAACAAATCTTTAAAACCTCTC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

86

Start:

13543748  

End:

13543833

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_40

CTCACGGGCCTAGTAAACCGTTCGTCAGATATGGATGGGCTCACGGGCCTAGTAAGAGGACGTGAGGCCCATTAAGAAAGGTGGTC