ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr1_LTR-Cassandra_61 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3341434737514347708-
Chr1_LTR-Cassandra_62 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1091434771014347818-
Chr1_LTR-Cassandra_63 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2801434787914348158-
Chr1_LTR-Cassandra_64 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3081488825114888558+
Chr1_LTR-Cassandra_65 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2061505731615057521-
Chr1_LTR-Cassandra_66 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1111505752215057632-
Chr1_LTR-Cassandra_67 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2011505769315057893-
Chr1_LTR-Cassandra_68 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3231528285715283179-
Chr1_LTR-Cassandra_69 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1101528318015283289-
Chr1_LTR-Cassandra_70 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3161583158315831898+
Chr1_LTR-Cassandra_71 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3331592966415929996+
Chr1_LTR-Cassandra_72 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3221594234115942662+
Chr1_LTR-Cassandra_73 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3171613005016130366+
Chr1_LTR-Cassandra_74 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3241615709616157419+
Chr1_LTR-Cassandra_75 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3341616009516160428+
Chr1_LTR-Cassandra_76 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3431628978616290128+
Chr1_LTR-Cassandra_77 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2441639366316393906-
Chr1_LTR-Cassandra_78 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3491640607916406427-
Chr1_LTR-Cassandra_79 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1741668520416685377+
Chr1_LTR-Cassandra_80 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1741668833916688512+

< 4 5 6 7 8 > Total 204


Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

14347375  

End:

14347708

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_61

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Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

109

Start:

14347710  

End:

14347818

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_62

TTCACCCTCACTAACAAATCGCAACGTCCTTGTTGTGCACCAAGACCGTCATCCCCGAAGGTGTGAGCCCACTCGAATCCACACTCGTCTCAGTTTGGCTCTGATACCA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

280

Start:

14347879  

End:

14348158

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_63

CCACCTTTCTTAATGGGCCTCATGTCCTCTCACTAGACCCGTTAGCCCATCTATATCTGACGGCCGGTTTATTACATCTGGGAGGCTTTAAAGATTTGTTATCGTCCTTACAAATCACCACATGATCTTTCCTTGTGTTTTGTCATCAGTCACACAGTTCCGACAGTCACTTCCTGGAATGTCACCCATCCTGGAGTTCTCTTAGGGCCTTTGACTGAAAAGATAAGTGTACTTTGGTGACATAGGTGTCCAAAT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

308

Start:

14888251  

End:

14888558

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_64

TGCGGCGAGGTTTAAAAGAATTGATTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCAGTCAAGGGGCCTAAGAGAACTCCACAGTTAAGCGTGCTTATGCTGGAGTAGTCTCAGGATGAGTGACCTTTCCAGAAGTGATTGTTGGAATTGTGCGAGTGGGGACAAAACACAGGGAAAGATCATGTGGTGACTTGTAGGGACGGTAACAAGTCTTTAAAGCCTCCTGGACGTAGCAAATTGACTGTCGGA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

206

Start:

15057316  

End:

15057521

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_65

TTGTCCTTACTCGCCCAATTCCAACAATCACTTTCCGGACCGTCATCCATCCAGAAAATATTGCAGCATAAGTACATTTAACTGCTGAGTTTCCTAGGGATCATTGGCCGAAAAAATAATTGCAATTTGGTGACATATGTGGCCAACTCAATTCTTTTAAATACATCTGCATGCACCACCGTATTTTCTGAAACAAGGGTGTCATA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

15057522  

End:

15057632

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_66

ATTCACCCCCACTTATAGACCGTAACGTCGTCGTTGCTCACCAAGACTATCACCCCTTGATGATGTGAACCCTCTTGACTCCATGCTCGGCTGGATTCGTCTTTGATACCA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

201

Start:

15057693  

End:

15057893

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_67

CCATCTTTCCTAGTGGTCTCCACATCCACTTTTGGTCTGTGAGCCCACTCATATCTGACGGCCGGTTTGCTACGTCCCAAAGGTTTTAAAGACTTATGTTTTCAATCCTATGAATCATCACATGATATTCACCTATGTTTTGTCCTCAGTCGTACAGTTCCGACAATCACTTCCCAGGAGGTAATTGTAACATCCCGACAC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

323

Start:

15282857  

End:

15283179

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_68

AATAGATCTCACGTCTTTTCACTAGGCCCGTGTGCCTATCCATATTCGACGATCGGTTTGCTACGTCTGAGAGGCTTTAAAGACTTGTTACCATCCCTATAAATCACCACATAATATTTTCCTGTGTTTTATACTCACTCGCACAGTTCCGACAGTCACTTCCCGGAAGGTCATCCATCCTATGACTACTCCAGCATAAACACGCTTAACTGTGGAGTTCTCTTAGGATCCTTGACCGAAAAGATAAGTGCACTT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

110

Start:

15283180  

End:

15283289

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_69

ATTCATCCCCACTAACAGATCACAACGTCCTCGTTGCATACCAAGACCGTCACCCCCGATGGTGTAAGCCCACTTGACTCCACACTCGTCTGGGTTCGGCTTTGATACCA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

316

Start:

15831583  

End:

15831898

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_70

GGGACATGCGACGATGTTTAAAAACAATTGATTTGGGCACCTATGTCACCAAAATGCAATTATCTTTTTTGTCAATGGTCTTAGAGAACTCCACAGTTAAATGTTCTTGAGCTGGAATAGTCTCAGGATATGTGACCTTCCGAGAAATGAATGTCGGAACTGTGCGAGTGAGGACAAAACACAGGGAAATATCATTTGGTGATTTGTAGGGATGGTAACAAGTATTGAAAACCTCCCGGAGGTAGCAAACCGACC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

333

Start:

15929664  

End:

15929996

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_71

TGTGACACCCCGTTTCAGGGACATATAGAGAGGTTTAAATGAATTGATTTGGTCACCTATGTCACCAAAGTGCATTTATCTTTTTGGTCAAAGGTGCTAAGAGAACTCCATAGTTAAATGTGCTTATGCTGAAGTAATCTCAGAATGGGTGACCTTCCGGGAAGTGACTGTCGGAACTGTGCGATTGAGGACAAAACACAAAGAAAGATCATATAGTGATTTGTAGAAACGGTAAGCAAGTCTTTAAAACCTTCT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

322

Start:

15942341  

End:

15942662

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_72

TGTGACACCCCGTTTCAGGGACATATAGAGAGGTTTAAACGAATTGATTTGGCCACCTATGTCACCAAAGTGCATTTATCTTTTTGGTCAAAGGTCCTAAGAGAACTACATAGTTAAACGTGCTTATGCTGAAGTAATCTCATAATGGGTGACCTTCCGGGAAGTGACTGTCGGAACTGTGCGATTGAGGACAAAACATAAAGAAAGATCATATAGTGATTTGTAGAAACGGTAAGCAAGTCTTTTAAAACCTTC

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

317

Start:

16130050  

End:

16130366

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_73

TGCGGACATGTTTAGAAAAATTGATTTGACCACCTACGTTACCAAAGTGCAATTATCTTTTCGATCAAGGATCCTGAGAGAACTCTAGATTTAAGCGTGCTTATACTGGAATAGTTTGAGGATGGGTGACCTTTCGAATTGTTGGAACTGGGCGAGTGAGGACAAAACACAAGGAAAGATCATGTATCGATTTTAAGAGACGGTAAAGAAGTCTTTAAAGTCTTCTGGAGATAGCAAACCGACCGTCGGATTTAG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

324

Start:

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End:

16157419

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_74

TGCGGAGAGGTTTAAAAGAATTGATTTGTCCACCTATGTCACCAAAATGCACTTATCTTTTCGGTCAATGGTCTTGAGAGAATTCCAGAGTTAAGCGTGCTTATGCTGGAGTAGTTTCAGGATGAGTGACATTCCCGGAAGTAATTGTCGCAACTTTGCAAGTGAGGACAAATCACAAAGAAATATCATTTGGTGATCTGTAGGATCAGTAAAAAAGTCTTTGAAGCCTCTCGGACGTGGCAAACCGGCCGTCGG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

16160095  

End:

16160428

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_75

GAGAAGTTTATAAGAATTGATTTGATCACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTTGGTCAATGGTCCTGAGATAACTCCAGAGCTAATCGTGCTTATGCTGGAGTAGTTTCAGGAAGTTGTTGAAGACAATGTTTGATAGTGAAGTGAATACAAACCATAGGGAAAGTTGATGTTAGAACTTTGCGAGTGAAGACAAAACACATGAAAATATCAAAAGATGAATTGTAGGATCGGTAAACGAGTCTATAAAA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

343

Start:

16289786  

End:

16290128

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_76

TGTGACATCCCAGTTTCAGGGACTTGCGAAGAGGTTTAAAAGAATTGATTTGGCCACCTATGTTACCAAAGTGCACTTATTTGTTTGGTCAAGGGTCCTGAGAGTACGACATAGTTAAGCGTGCACTTATTTGTTAGGATGCGTGACCTTCCGAGAAGTGACTGTTGGATCTGTGCGAGTGAGGACAAAACACAGAAAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGACGATAACAAGTCTTTAAAGCCTCCCGGACGTA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

244

Start:

16393663  

End:

16393906

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_77

CCTATCTTAATGAGCTTCACGTCTACTCATTAGGCCTGTGAGTCCATCCATATCCGATGATCGGTTTGCTACGTCTGGAAGGCTTTAAAGACTTGTTTACCGTCCCTACAAATCACCACATGATCTTTACCTGTGTTTTGTCCTCACTCGCACAATTCCGACAATCACTTTCTGGAAGATTACCCATCCTGAAACTACTCCAGCTCGAGCACGCTTAACTATGGAGTTCTCTCAAGACTCTTTG

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

16406079  

End:

16406427

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_78

CCTACCTTTTTAGTGGGCCCTACCTCCACTCCTGGCCCATGAGTCCATCCGTATAAGATGGCCAGTTTGGTACAACAAAGAGGTTTTAAAGACTTGTTTACCAATCCTACAGCTACGAATCACCACATGATCTTTCTCGCTATTTTGTTTTCACTCGAACACTTCTGACAATCACTTCTCGGAAGGTTATCCATCCTAAAACTACTCCAGCATAAGCACACTTAACTGTGGAGTCTCTCGGGATGGTTAATCGAA

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

174

Start:

16685204  

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16685377

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_79

GTGACTTTCCGACAAGTGATTGTCAGAATTGTGCGAGTGAAGACAAAACACATGAAAAAATCATGTAGTTATTTGTAGGGATGGTAACAAGTCTTTAAAGCCTCCTGCACGTAGCAAACCGACCGTCGGATATGGATGGGCTCACAGACCTATTGAGAGAACGTAAGATCCATT

Camelina sativa (v2.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

174

Start:

16688339  

End:

16688512

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_80

GTGACTTTCCGACAAGTGATTGTCAGAATTGTGCGAGTGAAGACAAAACACATGAAAAAATCATGTAGTTATTTGTAGGGATGGTAACAAGTCTTTAAAGCCTCCTGCACGTAGCAAACCGACCGTCGGATATGGATGGGCTCACAGACCTATTGAGAGAACGTAAGATCCATT