ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

1021

Start:

12407191  

End:

12408211

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_61

TGAAACAAGCGTTTTGTGTGCTATTGGAGTTCAATTCCCCAATGCGATGTAGCATAAGAGGTTATCGATCCAAATGGATGTATTGTAAACAATCAAGATATAGCAGAACTAATCAAGTCAAGCCAAGCAGTTGAAAGTTTGGTTTAAAGAACTCTAATGCATAAAAGTAAACTACAGAATGATAAACTAAAAGATCTAAGAACAGTACTGAAGATAAACTAAAGGATCTAAGAGAACTACTGAAATGAAACAGAAATGAAAGCAGGTAAACAATCAGATAAACAAGGGTCTTAAGGATGGGCTAATGGGGTGATGAATCCTCTTAATCTCTTTGGGATGCTTAACATGCTCAGATAGATCTAATCCTAGACAATGAACCACTTAACCTAATCAGTCCAATCTCTTGGCAAAGATTATCAGATCTATATCACTTCCTAATCTCAACTTTCATTGATGAAACATACTATAGATATGCATAAAGAAAAAGTTCATTAATGTCAATCTACTCCTTAACAGCCAATCTCTTGGGTAAGTAAATAGATCTCTGGCATTAGTTGATCAGACATTCCATTTGAACACTTTTTGAGTGTTAGAATGTCTAAGATCTAATCCCACATGGTTAATGCTAAGATTAGCAATTAAATCTCCTAATTCAGAAGGTATTTACCTAAATATATACTTAAGCATCCCTAGAAACTAAGATTCCTCATCACCTAACCCATCCTCTAAACCCAGAAAACTACTCAAATCTGGAGTTCATCATGAAGAACATAAGCCCAAAAATCTTTGAATCTTGCATAACCAGATAGATAATGATCTAAGGAGCAAAATAATATAAAGAAGCAACCTTAAAAATTCAATAGATCAAAAGATATTAAGATTACAAGTTTCTGGAAATATTTGGTGGCTACAGAGTAAAACCTTAATGAAACTCAATTTTTGGCTTAATAACCGAAGGGGTCTATTTATACTAAAGACATGAAGCCTTAAAACAGAAAAAGACAAATTACAAAGTCGGTTT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

171

Start:

12458138  

End:

12458308

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_62

TGACATTGAAAATATTGATTTTAGAACACATGGTGGACTTTATGAATTTCTGATGATATCCTTTGGGTTATGCAATACACTTGAAACTTTTCAAGTATTGACGAATGAGCAGTTTAGGCCATTTGTTAGAAATTTTGTGTTCGTTTTTCTTGTGATATATTGATATGTAGT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

243

Start:

12528173  

End:

12528415

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_63

AAGTTCTAAAACAGGGTGATCAATCCTATTCTAGCATTGAGAACATGTAAATTGAAGAACCTAATGATTAATAATTCCCTAAGACAATTAAATCTATCAAATCATTGAATTCTCCTACTTCAAACCCTAAAACCCAATTTAGAGACTACTCAGACATAACAATCGAAACATAGCAAATAGATTTTAAAGGAAACATGATTCAATAGATTAGAATAAGAAAAAGGTTTAGAAATCTTCTCTAAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

155

Start:

12535189  

End:

12535343

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_64

AAACACCAATGAGCGCCTAGATCATCCTCCTCTCCTCGCCATGATTCCACGGATCACACTTTGCTTTTACCTGCATCAAAGAAGAAGATGCATAAGTATTTCATAAATACTTAGTGAGGCAATCATACCACCACTAGCTATACACACAAGCACAT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

210

Start:

12629994  

End:

12630203

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_65

GCATCTTTATTGTTGTAGTAAAGGTAAAGATAAGCTGTGATGTCGAATTATGGCGACAAAGAAGGGGATGATCTAAGATCTCAGTTGTGTGGTGCTTATTTATGTTCCTCTTATTTTTGGTTATAGCATGTTTAGGATGTTAGTTAATATTTGCATTACAATTGAATTAGTTTTTTTAGAAAATGGAACTGATTTTGGTTTATGGTTTAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

200

Start:

12632014  

End:

12632213

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_66

CTTATTTTTTCTCATTCCTTGCGTTAGATTCATAAGGGGAAGTCTTTACATCTTCATATTGGTTTCATTGAAGCAGTCTCTAAACCCTTTTTAGTTGTTATTCCTTTTATTTATATGAATTACTTAACCCTTTCTTTGATGATTACCTAAGTATGCTTGAGTAGTATACTTGTTGGTTTAGAGGGATAATTAAAGGGGGA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

431

Start:

12638003  

End:

12638433

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_67

TTTATACTGCTTGTGTGTATAGTCAGTGGTTGGGATGAGTGTCTCACTAAGTATTTCTAGCAACTTATGCATATTTTTTTGTGATGTAGGTAAAAACAAAGTGTGACCGTGGATTCAAGGTGAGAGGAGAGGAGAATGATCTAGGGGCTCGTTGAATGCTTTATGCCTTTGTTATGATGTTGTTAGGTTTTTAGTTTTGGGAACTTAGTAGCATGTTAGGATTGCTGGAACAATTGAATAATTGCTGGTTTAATGAATTTGGTTTAATCTGAATTGTGTGGTTTAATCTGAATAGGTAGGTTTAATTTGATTTACTTGGTTTAATTGCATTAGTCGGTTTAATATGGTTTGCTTGGTTTAATTGGAATTGGTTGGGTTAATCCGGTTTAGTCTAATTAAATTGTAAAAAAAAATGGAGTCGGGTGGTTTCA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

288

Start:

12642092  

End:

12642379

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_68

TTGTTGAAAACTCTTAGCTTGAAACAAAACCAAAGTGGTTTGATAAGCTTTTCATCCTACTTGTTGCCCAGATCATGTTGGCTCAAAATTTGATAAATTAATTATCTAATAGCTTCGTTAAACATTTTAGCTCTTCACTAAATCATGGGTACAAATAGTATGACAAGAGCATCCTCGACTACAAGCTTCTCCACTCTGAGCTGCTTATTCTCAGCTGCAAGCTTAGCTCCTTTAGGTTCCAGCTCATGTTTATGCTTCATTTCCTAAGTGCTATCGACGATCGTATCA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

253

Start:

12642385  

End:

12642637

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_69

AGATGTAAGGATCGCCTTCCTGAGTATTTGTGATAAAATTCAGGCATCTTTATTGTTGTAGTAAAGGTAAAGACAAGTTGTGATGTCGAATTATGGCGACAAAGAAGGGGATGATCTAAGATCTGAGTTGTGTGGTGCTTATTTATATTTTCTTGTTTTTGGTTATAGCATGTTTAGGATGTTAGTTAATATTTGCATTACAATTGAATTAGTTTTTTAAAGAAAATGGAATTGGTTTTGGCTGATGTTTTAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

265

Start:

12644593  

End:

12644857

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_70

TTTTACCCATTTTAGTTATAGTTTTTGTATGTTTTTAGGAAGCGTTTGATGTAATATCAAGGCTAAAAGATCAGTTATCAAGTAATTTAGGGATAAAGAAGGTTTTACAGGTTTTAAGGCAAAATGGACAAAAAGACGAGGGAAATCCGGTGTAGAAAATTTCCAAAGCACCAAAATTTTGGTATCTGTTGGAGACCTTTCCATGCATCGAATTTAAAGATCTTGGACTCTATACAAATATAGAAGAGTCAAGATTATCCTCAAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

394

Start:

12654574  

End:

12654967

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_71

TGAAGTGAAGCACCTATCTCATTAAACACACTGTCAAGAAAATCTATTGGGACAAAAATTGACAATGGAAAAAGAAAAAGATTACAAACAACACTATTCCCATTGTTGAAAACTCTTAGCTTGAAACAAAACCAAAGTGGTTTGATAAGCTTTTCATCCTACTTGTTCTCCAGATCATGTTGGCTCAAAATTTGATAAATTAATTATCTAATAGCTTCGTTAAACATTTTAGCTTATCACTGAATCATGCATGGGTACAAATAGTATGACAAGAGAATCCTCGACTACAAGCTTCTCCACTATGAGCTGCTTATTCTCAGCTGCAAGCTTAGCTCCTTTAAGTTCCAGCTCATGTTTATGCTTCATTTCCTAAGTGCTATTGACGATCGTATCA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

259

Start:

12654968  

End:

12655226

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_72

TTAGGAGATATAAGGATCGCCTTACTGAGTATTTGTGATAAAATTCAGGCATCTTAATTGTTGTAGTAAAGGTAAAGATAAGTTGTGATGTCGAATTATGGCGACAAAGAAGGGAATGATCTAAGATATCAGTTGTGTGGTGCTTATTTATATTCCTCTTGTTTTTGGTTATAGCATGTTTAGGATGTTAGTTAATATTTGCATTACAATTGAATTAGTTTTTTTAAGAAAATGGAATTGGTTTTGGCTGATGGTTTAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

135

Start:

12669220  

End:

12669354

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_73

GTGAAGTTAGGGCTTCGGTGTCGATCAACACTAGTGGCGAGTGTCGATCGACACAAACTTTCTTTCTCGCGAGGATAGTCTCGAGTGTCGATCGACACCAGTGGAAGGTGTCGATCGACAATAGTCGTCATATTG

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

241

Start:

12669367  

End:

12669607

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_74

ATTGTTCATAGATTGTTGATGCTTGTGATGGTTAATGCTTGAATGTGTTTCATTATTGCTTGTGTGTACGGCTAGTAGTGGGATGAATGCCTCACTAAATATTTCTAGAAATACTTATGCATCTCTTTTCCTGATGCAGGTAAAGGAAAAGTGTGACCATGGAATCAAGGCGTGGAGAGCGGGATGACTAGGGACTCGTTAGTTGTTTCTGTATTATTGTATGAATTGTTAGGATGTTAGT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

135

Start:

12684188  

End:

12684322

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_75

GTGAAGTTAGGGCTTCGGTGTCGATCAACACTAGTGGCGAGTGTCGATCGACACAAACTTTCTTTCTCGCGAGGATAGTCTCGAGTGTCGATCGACACCAGTGGAAGGTGTCGATCGACAATAGTCGTCATATTG

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

186

Start:

12684370  

End:

12684555

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_76

TGCTTGAATGTACAGCTAGTAGTGGGATGAATGCCTCACTAAATATTTCTAGAAATACTTATGCATCTCTTTTCCTGATGCAGGTAAAGGAAAAGTGTGACCATGGAATCAAGGCGTGGAGAGCGGGATGATCTAGGGACTCGTTAGTTGTTTCTGTATTATTGTATGAATTGTTAGGATGTTAGT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

226

Start:

12717240  

End:

12717465

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_77

TTGAAGCCTTGGAGTTTGCCAGATCACTTATTTTTTCTCATTCCTTGTGTTAGATTCATAAGGGGAAGTCTTTACATTTTCATATTGGTTTGATTGAAGCAGTCTCTAAACCATTTTTAGTTGTTTTTCGTTTTATTGATATGAATTACTTAACCCTTGCTTTGATGGTTCCCTTAGTATGCTTGAGTAGTTTACTTGTTGTTTTAAGGGGATAATTAAAGGGGGA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

167

Start:

12739023  

End:

12739189

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_78

TGGTTTGGTTGTTTGGTATTCGTTTGTGTGTGATTGTGATCTTAACGCTTGTGTCCATAGCCCAGTAGATGGGATAATCGCTTCATTGAGTATTTTTGATAATACTCACGCATCTCATTGTGTTTGTGGTGTAGGTAAAGTGTGGCATGGAATCATGGCAATAAAAA

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

155

Start:

12819185  

End:

12819339

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Gypsy_79

ATGTGCTTGTGTGTATAGCCAGTGGTGGTATGATTGCCTCACTAAGTATTTATGAAATACTTATGCATCTCTTTCGTTGATGCAGGTAAAAGCAAAGTGTGATCCGTGGAATCATGGCGAGGAGAGGAGGATGATCTAGGCGCTCATTGGTGTTT

ID:

scaffold_1_LTR-Gypsy_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

410

Start:

12825389  

End:

12825798

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Gypsy_80

GAACATTTTCCAAGCATGAAATTCCTAAATTGTAAATTAATATAATCAAGATTGATTTAGTCTTATTAGCCACCACCAATAAGTAAGAATCCTAAGCAATATGTCCCTAAACTCCATAACCGAGCTCCTAATTCATCATAATCTAGTGAAACCCAAAAAAAATTATAAGACTACTCACTCATGATCATGAATTCACAATAAAATTGATATTTGATGAAGAAACATGATTAGAGGAAATTAGAAAATAAATCTAAAAAAGAACAAGATTAAGCTGTATAAAAGTACTTAAGATTTATACAAGAATTTCAAAGATAGAAAATAAATTCAAACAAACATAAAACATAGCATCCCCCTTCCCAAAGTGGGATTACAGTACTTATAGAGATAGAGAAACTAAACCAGAACAAACC