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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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+

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TAAAGTTTGCTAGGATCTTTAGAAGATGTGTTAACGAAAAATCGATAGTTGGACCCTCAAGATAGACGTCCATGAAACTACACACTGGTGTAGGGGCGAATTTCTGTCTTAGGAGATTGCTAAAAGCAAGCCTCTATCGTCCTACAATTTGTTCAAAGTTTGAAAAAGAAGAAATCATTAAGTA

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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129

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10857063

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_62

TCGGACAGAATTGTCGGTAGTACAATCGTAATTGTAACAATTCTCATAATTTGTAATAAATAATAAATCAAGAGTTAAAAAAAAAACTAAATGCTATTAATGTTAATTAGTAATAATATTTTAGATATT

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Retrotransposons

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LTR

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158

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10867842

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+

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GAAATAATCATCATCAACAGTCGAACTTTTTTCACTGTCTATATGTTCAATGATGCAAAACTCAACAACACTAGTTACCTCATGTGTAACTGTCGAGTTTATGTTCTCTTTGATGGCTATGAACTAATCAGCTGTTTAGACAGATTTGTTCACATCCC

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Retrotransposons

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LTR

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1800

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11471143

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-

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ACAATTCCATCATTTTCTTGAAACACTTCAATCCCAAGATAATAAGTAAGCTTCCCAAGGTCACTCATTTCAAATTTCCTTGCCATGCCTTTCTTAAACTCAAGTATCATCTCTAGACTTGAACCTGTGACAAGAAGATCGTCAACATACACAGCCACAATAAGAAGATGCTCTTTATCTTGTTTCCTGTACAAGGAAGGCTCCTTGGAACATTTGATAAAACTTAATTCACCAAGAATGCTGTTCAGCTTAATGTTCCAAGCTCGAGGTGCTTGCTTAAGCCCATAAAGAGCCTTATGAAGCTTGTAAACTTTCTCTTCACTACCTTGAACTATAAACCCCTCCGGTTGATTGACATAAACATCTTCTTTCAAGTCACCATGGAGAAAAGCAGTTTTAACATCAAGGTGATGTACTTCCCAACAGTTTGACGCTGCTAAGGCAATGATGAACCGTATCGTCTCAATACGAGCCACCGGAGCAAAAACTTCGTCAAAATCTATGCCATGTCTCTGTACATATCCTTTTGCTACAAGTCTTGCCTTGTATTTACTAATGGTATTGTCAGCATTTCTTTTCACTTTGAACACCCACTTTAAGCCAATTGGCTTAACCCCAAAAGGTAGGTCAACTAAGGTCCATGTGTTGTTCTTTGTGATAGACCTGATTTCTTCTTCACAAGCATCTCTCCATACCATTAGTGTTCTTGCTTCCTTATAACTCCATGGTTCTTCATTAATTGCTAGTAAAAGCTGTTTTCCCTCGCTTTGTGCTAGAAGCACAAAATCATTCAAATGACCCGGAAGCTTTACTTGTCTTTGAGACCGTCTTAAACCAGGTCCGTGTTGTTGTTGCGGTTGATCTTGCTCACCATAACCATCTTGTTCTTCTTCGTTTTGCATCTCATCATCTTCATCAATACCATTGTTATCACTTCCGTTTCCATTTTCCTCTGTTTCGTCAACAACATCACTCTCATCATTGTTTCTGAAATTCCCAAAATCAAGTGTGAATGTTCCTGGCTCTATCATCATATCTTCTGAGTTCTTCCACTTCCAATTTGCTTGTTCATCAAAGACCACATCACGACTGACTATAACCTTCCGACTCAGTGGGTCAAAGAGTCGGTAAGCCTTGGAACCTGGTTCTGTTCCGAGATGCACTAACATCCGCGACCTGTCATCCAATTTCTTTAGGTGATTTGATTCGACTTTGGCATAACAGATGCATCCAAAGACTCGTATGTGCTCTATATTTGGTTTCTTTTTCTTGTAAGCTTCATACGGAGTAAGATTTTCCAAAGCTCTTGTTCCTACCCTATTGATGATATAGGTCGCATGTCTCACCGCTTCTCCCCACAGGTAGTTGGGCATTCTCATATGTTTCAGCATGCTTCGTGTCATCTCAAGCAATGTTCTGTTTCTTCTTTCGACAACTCCATTTTGCTGCGGAGTATATGGAGCGGTTAGGTGTCTGTTGAGGCCTTCTTTTTCGCAAAAAGTTTGAAATTCTTGGGATAAGAACTCTCCTCCTCTATCCGTCCTAAATGTCTTGATAGAAGTTCCACATTCTTGCTCTACATGTGCCTTGAACACTTTAAATTTCTCAAATGCTTCGCTCTTCTCCTTCAAAAGAATCGTCCACATGTATCTCGAATGATCATCAATCAAAACAAATATGTATCTTTTCTTTGCTGCAGTAGGAGGTGTTATAGGTCCACAAAGATCTCCATGGACGAGTTCAAGTACATGTGAGGCACGATATGAGGTAGCTTTCGGGAATGCTTGTCTTACTTGCTTT

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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163

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11471647

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-

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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406

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11471930  

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11472335

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_66

CCACGACCTCTGCCTTGACTGCCTTCTTGATCATGACTCGATGATGAATGATCTGAGTTTGCGTACATAAGCTTGCCTTGACTCTCTTGTGACTCCTCTGCAGCACTTATCCGTTCCTCATAAGTTTTGATTCTCCCTATTATATCTTCAAAAGTTGTCGTTTTGAGGTCCAAGACTTGTTCAAGGGTAGCCGAAATCTGTATGTACTTCTGCATTGGTAAGCTTTTGAGAAATTTCTTAACAATCTTGGTTTCTTCAATGCTTTCCCCAAGAGTTGTTGCTTTAGAAGAAATTTCAGAAAGCTTACCAACGAAGTCATCAATGGTGTCTGTCTCTTTCATCGTCAATCGATCAAACTCGACCATAAGAGTTTGGAGTCGTGCTTCTTTTACTCTCTCTGCTCCAA

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Retrotransposons

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LTR

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303

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11472766

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-

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Retrotransposons

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LTR

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278

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11473044

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-

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AGAGAAAGATTATGAATTCAAGAATTTAAAGAATAACTCTCTTTATTTGCTTAAGAAAATAACTTAAAACTTAAGCTTCTAAAACTCTTAATCTCTCTCTAATCTCTTAAGGTTACCACAACTTTGATAACTCATATATATAGAGAGGAGATAACACCTTATTCTAATAGGAATTGTATCTAGATAACTCCTAAACACAATCCAATTCCTAAGTCATAACTCAACTAGGAATTAAATAACTTGTCTCCTAAGTCTTCTTTTTCAAGCTTATCCCAACA

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Retrotransposons

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LTR

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-

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TGTTGGAATATTGAGAGAATGAAAAAAACATAGTAAGAGACCTTTTGTCTCTTCTCTTGTAAAGAAGACAAGAACAAAACTTTTTTATGAAACTAACACTGTAATGTGTTACAGCCACACGAATATACTTATATACATGTCCTACGGTCGTAAGTGTAATTAACTGTTATTAATGGTTGTGTCTTAGTTGACAAGTCATTCACTACCCTTACATACATACCTCTTGACTTAGTATATACACTAATTTATACTAAATAATATGACCAAACTCAATTATAAAACTAACA

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Retrotransposons

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LTR

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+

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CCGGTTATTGAGATTGAATACCGGTTTAATGTTGGTTTAATATTGTAAAGATAATTAGCATATATAAGCTAGTTAATCTGAAATGTTATGGTTAAGCATTTGTAACAAACTTTTAACACATTAATAAAAAGGTGTTTTTCTCTCTTCTTCTCCGATCTTGATTCTCCGGT

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scaffold_1_LTR-Copia_71

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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11847447  

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11852162

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+

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TGATCAAACTGATAATCCATATTATGTGAGTAATAACGATCATGCTGGTTTGATTTTAGTTTCTGACAGATTGACGAATGCTTCGGATTTTCATTCATGGAAACGTTCTGTAATGATGGCATTGAATGTTAGAAATAAGCTAGGTTTTGTTGATGGCACGATAACTAAGCCTTTAGAGAATCATCGTGATTATGGGGCTTGGACTCGATGCAATGATATTGTTTCTACCTGGTTAATGAATTCTGTGTCCAAGAAGATTGGCCAGAGCTTGCTATTCATACCAACTGCTGAGGGTATTTGGAAGAACATCTTAGCTCGTTATAAGCAAGATGATGCACCACGAGTGTTTGCTATTGAACAGAGGTTAAGTAAGATAGAGCAGGGATCAATGGATATATCTACTTACTACACTGAATTGCTCACTTTGTGGGAGGAGCTTCGGAATTATGTGGAGATTCCGGTTTGCACTTGTGGACGTTGTGAGTGTGATGCTGCTGTTAAGTGGGAGTCGCTACAGCAGAGAGGACGTGTTACCAAATTTTTGATGGGTTTGAATGAGGGTTATGATCAGACAAGACGACATATTCTCATGCTCAAGCCAATACCAACAATGGAAGAGGCATTTAATATGCTTACACAAGATGAACGACAGGTTGTTATCAAGCCTGCAACTCGTGTTGATAATGTTGCTTTTCAGGCTTCAGCACCAGTGGATACTGATATGGAGAATGCTTATATCGCAGCATATAACACAGTTAGACCATCACAAAAACCAATATGCACTCATTGTGGGAAGATGGGGCATACTATTCAGAAGTGCTACAAGTTACATGGTTATCCACCGGGTTACAAGACTAATGGCAATACTCCTAGGCCTCAGATGGTTCCAAATCAACAATTTCAGCCTCGAATGCCTATGTCTCAGTTTCAACCCCGGATGTATGCACAACAAAGACCACCAATGGGAAATTATGAGTCAATGCAAAAGGCTAATGCCATTGCTCAAGTTTATTCTGAGAATCAGTTACCTGCTCCTGATTATAGTTCTTATGGATATATCCCACAATATAATACAGCTCAGTCAATGCCTTATGTGACTAATGAAGGCTCTATTCAGAATATTCAGAATCTCACACCTCAGCAGATTCAACAGTTGGTTCAACAATTCAATTCTCATGTTCAGTCTACTTCTCAAGACTCAGATGTACCAATTGCAGCTGTTACAAGTACTCATGGAACTGCAACTATTTCTGAGAATGGCATAATGGCAAAAACTTCTACTTCTGGTAATGTTTCTTTTCCTTCTACTAGTTTAAAATATGAGAATAGTAATCTCACTTTTCAGAATCATACTCTTTCTTCTTTACAAAAATTTTTGCCTCATGATGCTTGGATAATAGATAGTGGAGCTTCTAGTCATGTTTGTTCAGATTTGGCTATGTTTAGGGACTTAAGGCCAGTATCAAATGTAACTGTAACTCTTCCAAATGGTACTAGGGTTCCTATAACACACACTGGCACTGTTTGCATTTCTACAGTTTTAATATTGCATAATGTTTTACATGTACCTGATTTCAAATTTAATCTCATTAGTATAAGCTGTTTAGTAAAAACTTTGAATTGCTCTGCTCATTTCTATGTTACTTGTTGTTTGATACAGGAACTTTCTCAGGGCTTGATGATTGGGAAGGGTAAAATCTACAACAACTTATACATTCTTGATACTGAGAATCAATCCCTTCCTTCATCGCCTGTGATCTGTTCCTACTCTGCTTCAAAATTGTCTGATGGTGTTTTATGGCATCAACGGCTGGGTCATCCTTCACCTAATGCTTTGAATAAACTTGTTAGTGTGATTCCTTCTTTAAAACATATATCATCTAGTATATCAGAATGTAAGATTTGTCCTTTAGCAAAACAAAAACGATTAGCATATCTTTCAAATAATAATCTGTCTTTACAAGCTTTTGATTTGATTCATATGGATGTATGGGGTCCTTTTAGTACTGAATCTATAGAGGGTTATAAATACTTTTTCACATTAGTTGATGATTGTACTAGAGTAACATGGGTGTATATGATGAGAAATAAAAAAGATGTTTTGACTATTTTTCCAAGTTTTCTGCAAATGGTTTTTACTCAGTATAATGCAAAAGTAAAGGCAATAAGGACAGACAATGCTCCTGAGCTTGCTTTTAATGAATTAGTTAAGGAAAATGGAATGATACACTACTTTTCATGTGTTTACACACCACAACAAAACTCTGTTGTGGAACGTAAACATCAACATTTACTGAATGTTGCTAGATCTTTGCTTTTTCAATCAAATATTCCTCTACAGTATTGGAGTGATTGTGTTAATACTGCTGTATTCTTGATAAATAGATTGCCTTCTGTTCTTTTAAATGATAAATCACCTTATGAATTACTTCTAGGCAAGTTACCAGATTACACTCTTTTGAAAAATTTTGGCTGTCTGTGTTTTGCTTCTACTTATGCTCAAGATAGAAACAAATTCTCACCTAGAGCAAAACCTGGAATATTCTTAGGCTATCCATCTGGATACAAAGGTTATAAAATTCTAGACTTAGAATCGCATTCTATTTTGATTTCCAGAAATGTAACTTTTCATGAAGAGACTTTTCCTTTTAAGACTAGTGAATTGCTAAATCGATCTGTTGATATTTTTCCAAATACAATCTTGCCTTTACCTGTTCCTCTGCATTTTGTTGAAACTTTTCCTGTTGATGATCTTAGAAATGCTAGGACTGTGCATACATCTTCTTCTGCATCTGCATCACTTAGAACTGTTACACATAGCAATCCTAGTACCGTTTCAAATGAACCTCTAACAGAACCATTAGATACTGGAATTAATACTGAGACTATTGCTAGGCCTAGACGACAGATTAAAGCACCTAGCTATCTGACTGAGTATCATTGTTCTCTGGTTCCTTTTACTTCTTCACTTCCACCTACAGATCATCCTTCTTCTTTACTATCACCTACAAATATAACTATCCCAGATACTAAACCTCATACTACTCCATATCCTATCTCTTCTTATATATCCTTTGATAAACTTTCCCCTTTATATACTTCCTATATATGCTCTTATAATACAGAAACAGAACCAAAAACATTTAGCCAAGCTATGAAATCAGAAAAATGGATAGGTGCAGCTAATGAGGAATTGACTGCACTAGAACAGAATCAAACTTGGGAAATTGAATCTTTACCACCAGGGAAGAATGTGGTGGGTTGCAAGTGGGTATTTACCATTAAGTACAATCCTGATGGCACAGTGGAAAGATATAAAGCTAGGCTTGTTGCTCAGGGTTTTACACAACAGGAAGGACTTGACTATATTGACACTTTCTCACCTGTTGCAAAGTTAACCAGTGTCAGGTATATACTTGCTCTTGCTGCTGCAAAAGGATGGAGTCTCACTCAAATGGATGTTTCAAATGCCTTTCTACATGGAGAGCTTGATGAGGAGATATACATGAGTTTGCCTCAAGGTTACACTCCACCAAAAGATTATGTCTTGCCTTCTAATCCGGTATGTCGACTCAGAAAATCCCTATATGGTCTAAAACAAGCATCACGACAATGGTATAAACGATTCTCATCAGTCTTGTTAGGAGCTAACTATATACAGTCACATGCTGACAACACTCTCTTTGTCAAAGTTAGCTCTGTAGCTTTCATTGCAGTCCTAGTGTATGTGGATGATATAATGATAGCTAGTAATAATGATAAGGCAGTAGAGGAATTGAAAGAATTACTGAGATCTGAGTTCAAAATAAAGGATCTAGGACCAGCCAGATTTTTCTTAGGCTTAGAAATAGCTAGATCATCTGCGGGTATCTCTGTTTGTCAGAGAAAGTATACTCAGAACTTGCTGGAGGATGCAGGTTTATTGGGATGCAAACCAAGCTCAATTCCCATGGATCCTAATCTACATTTGACTAAAGATCTTGGTACTCTGTTACAGAATCCAACAGCCTACAGAGAACTGATTGGTCGGATGTTATATCTTACAAATACAAGGCCAGATATCACTTTTGCAGTTCATCAGTTGAGTCAATTCATTTCTGCTCCTACTGATGTTCATCTTCAAGCAGCTCACAAGGTTCTCAGATATCTAAAAGGAAATCCGGGTTTAGGTCTTATGTACTCTGCAACTTCAGAGATTTGTCTCAATGGTTTTGCTGATGCAGATTGGGCAAATTGCAAGGATTCACGGCGATCAATAACAGGGTATTGCATGTATCTTGGTACTTCACTCATTTCATGGAAGTCTAAGAAGCAGAATGTAGCAAGCAGAAGTAGTACAGAGTCAGAATATAGAAGTTTGGCAAATGCTACTTGTGAGCTTATCTGGTTACAACAGCTTCTCAAGGATCTACATGTGACAGTCACTTGTTCTGCCAAATTGTTTTGTGATAACAAGTCAGCTTTACACATTGCAATGAATCCAGTTTTTCATGAGAGGACTAAACACATTGAGATTGATTGTCACATTGTTAGAGATCAGATAAAGTCTGGCAAGCTCAAGACTCTACATGTTACTTCTGAGAATCAACATGCAGATATTCTAACAAAACCACTTCATCCAGGTCCATTCTACAATCTTCTTCAACAGATGTCATTGTCAAGTCTTTATCTTCACAATTCAGACTTATTGAAGCTAAAGACTTGAGGGGAGGATAT

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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170

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11852177  

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11852346

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_72

CCGGTTATTGAGATTGAATACCGGTTTAATGTTGGTTTAATATTGTAAAGATAATTAGCATATATAAGCTAGTTAATCTGAAATGTTATGGTTAAGCATTTGTAACAAACTTTTAACACATTAATAAAAAGGTGTTTTTCTCTCTTCTTCTCCGATCTTGATTCTCCGGT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_73

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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2274

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11853905  

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11856178

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_73

CTCCCCTCAAGTCTTTATCTTCATTATGTCTGGTTAGGAAGATAAAGACTTGAAAGTGACATTTGCTTCAGAAGATTGTAGAATGGACCTGGATGCAAAGGTTTGGTTAAGATGTCAGCATGTTGATTCTCTGATGTAACATGTAGAGTCTTGAGTTTCCCTGACTTGATCTGGTCTCGAATTATGTGACAGTCTATCTCGATGTGCTTGGTCCTCTCATGGAAGACCGGATTCATAGCAATGTGCAGAGCAGACTTATTATCACAAAACAATTTTGCAGGACAAGTGACAGTAACATGTAGATCCCTTAGCAATTGTTGTAACCAGATAAGTTCACAGGTTGCATTAGCTAGACTCCTATATTCAGATTCTGTACTACTTCTGCTAGCCACATTCTGTTTCTTGGACTTCCATGAGATAAGAGAAGTACCAAGATACATGCAATAGCCTGAGATTGATCGTCTTGAGTCTTTACAATTAGCCCAGTCTGCATCAGCAAAACCATTGAGACAAATCTCTGAATCAGCAGAGTACATAAGACCCAATCCTGGATTACCTTTTAGATACCTTAAGATCTTATGAGCTGCTTGCAGATGAATATCAGTTGGTGCAGAAATGAATTGACTGAGTTGATGAACTGCAAAGGTGATATCAGGTCTAGTATTTGTAAGATACAGCATCCGACCAATGAGTTCTCTATAAGAAGTAGGATTTGGTAGCAGTATCCCCATATCTTTTGTTAAATGCAGATTAGGATCCATTGGTATAGAACTTGGTTTACATCCAAGTAAACCTGCATCTTCAAGTAGATTCTGAGTATATTTTCTCTGACAAACAGATATTCCAGCAGATGATCTAGCAATCTCCAAGCCTAAGAAAAATCTTGCTGGTCCTAAGTCTTTAATCTTGAATTCTGATCTCAGTAAAGTCTTCAATTCCTCTACAGCCGTATTACTGTTACTAGCTATCAGAATGTCATCCACATACACTAGAACTGCTATAAAGGCAACAGAACTAATCTTGACAAATAGGGTATTGTCAGCATGCGATTGAACATAGTTAGCTCCAAGCAAAACAGAGGAAAATCTCTTATACCACTGTCTAGATGCCTGTTTAAGGCCATAGAGAGATTTCTTGAGAAGACATACCGGATTAGGAGGTAATTTTGTTTCTTTAGGTGGAGTGTAGCCCTGAGGAAGACTCATGTAGATTTCTTCATCAAGTTCACCATGCAGAAATGCATTGGAAACATCCATTTGAGTCAAGGTCCACCCTTTTGCAGCAGCAAGAGCAAGAATATACCTGACACTAGTTAATTTGGCAACTGGTGAGAAAGTGTCAATATAATCAAGTCCTTCCTGTTGAGTAAAACCCTGTGCAACAAGTCTAGCTTTGTATCTTTCAACTGTGCCATCAGGATTATACTTGATTGTAAATACCCATTTACAACCCACCACATTCTTCCCTGGTGGTAGAGATTCAATTTGCCAAGTATGGTTCTGTTCTAATGCAGCTAATTCCTCATTTGCTGCAGTTGTCCACTTCTCTGATTTCATAGCTTGGCTAAATGTTTTTGGTTCTGTTTCAGTACTATAAGAACAGATATATGAATGATAAGAAGGGGAAAAGTTATTAAAAGAAACATAAGAAGATATAGGATAGGGTGTAGTATGTTTAGAAATATCAGAAATAGTATTTGAGGAAGGTGTAAGAGTAGTTGGTATAGTATCAGTAGGAGGAAGTAATGAAATAGAAGGAATTAGGGAACAATGATACTCAGTCAGATAGCTAGGAGCTTTAGTAGTTCGTTTAGGCCTAGCATTATTCTCAGAATTTACACGAGTATCAATTGTTTCTGTTATTGATTCAGTAGGAATGGTACTAGAATTTCTATGTGTACTAGATGCAAGAGATGCAGGTACAGGAATAGATGCAGAGGAAGAATCACAAGACATTCTAGCATTCCTAAGATCATCAACAGGAAAGGTTTCAACAAAATGCAATGGAACGGGTAAAGGTAATATGGTGTTTGGGAAAATATCAACAGAAGTAGACAACATATCACTGGTTTTAAAAGGAAAATTTTGTTCATGAAAAGTTACATTTCTAGAAATCAATATAGAATGGGATTCTAAATCTAAAACCTTATAGCCTTTATATCCAGAAGGATAGCCTAGGAAAACTGCAGGTTTAGCTCTAGGTGTAAACTTATTTCTATCTTGAGCATATGTTGAAGCATAACATAACATAAATTAAATTAATATGTAATAAGTT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_74

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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134

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End:

12018264

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_74

TCCTAATCCTATTAGAAATACATATACTAAGATATCTCCTAAAGTATATGATCCTTATCTCTAATTAAACCATTGCTCGGTTTACGACTAGGATAGCTTCCATCCCAAGTTATCTATTCAAGCTTAATTCAACA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

585

Start:

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End:

12050812

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_75

ATTGGTAGCAGAGCGGGAAACCGATCTGTGAGACTTTCTCGTCTCCTAACAGGTTAGATCCTGAACGATGGAACCTACTAACGATGGTGCGGGTACAAGCAAGAACATCATGCTTGATACAAAGAGGTATGGCTACTGGAAAGTTCGAATGACACAGCTCATCAGAGGTCAAGGTGAAGATGCATGGACAGCGGTTGAAGAAGGATGGGAATCTCCATTTGAGCAGACAGAAGCAGGAGATAAAATACCTAAACCAAAGTCTAGTTGGACTACCGAAGAAAAGAATCTGTCAAAATTCAATGCGAGGGCCATGAATGCCATCTTCAGTGGTGTTGATGAAGATGAGTTTAAACTCATTCAAGGATGCAAGTCAGCTAAGCAGGCTTGGGATATTCTTCAGAAGTCTCATGAAGGTACGACGAGTGTTAAGCGTACTAGGCTAAATCTTTTAGCTACTCAGTTTGAATGTCTTAAGATGGAACCAGACGAGACCATTGTTAAGTTTAGCTCAAAGATAAGTGCCATTGCAAATGAGGCTGAAGTTCTTGGAAAGACATATAAAGATCAGAAGCTTGTGAAGAAGTT

ID:

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Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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493

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End:

12053092

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_76

GACATAGAGAAACTAAACTACGATACTTGAAGAGAGTTGTTTGAAACTCTTTGTCTTACCTTTTGGCGTCATGGGTCATCTCGATGGCTCATCCTCTCCTACGTAGCAGATCAAGACCAATGGAAGGAACACGATGTACTTGTCAATATGTGGATCTACGACACCATCTCTGAATCCATCCTTGAACTTTGGTTAGCAATCAAGAATCTCTTCCGTGACAACAAAGAGGCTCGTGCCTTGCAGCTCGACAACGAGTTGTGTACTCTCTCCGTTGGTGATATCTGCATCCATGATTATTGCAAGAAGCTAAAGTCCCACTCTGACCTCTTTGCTAATGTGGATTCACCTGAACGCACACTAGTGATGCACATACTTAATGGCTTCAATGACAAATTTGATTCAATCATTAATGTCATTATGCACAAGACCCATTTTCCATTGTTCTCTGTGGCCAGATCAATCCTCATCATGGAAGAGGATCGTCTCAAGAAGC

ID:

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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236

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12138378  

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12138613

Strand:

+

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TTTGTTATTCATTGATTCTCTGAAAGTACCATGCTGCCCAATGTCTTTTATTCATAAGTTTAATCACAGTTTCTTTTTGCATTTTTATTTACAAACTGAAAAACCAAACAACAAGTCTTTTCCGCTTCAGCTGATAACGAGTCTCGCAAGTCTTTAGTGTACCATTGCTCCTTGTGATCGATCCCGCATATACTTTACTTCGGTTAAGTTATCGGGTTAAATACTCGTGTAATCAA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_78

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

Length:

312

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12149972  

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12150283

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_78

CAAAGCTTTTTGTTAAGTAAAATTTCAGATCTGAATCTTGCTGCTTATTGTGATTCATATTGGGAAGCATGTCCAAAACCTCGTCTTCATTCGGTAGAGTAAGTAGTATGGCTCTAAAACTCTCCCATTCGTAGGAAAACAAAGAAGCAACAAATTGTATTGCTTTCTTCTACGAAGTTTGGATATTAACCTATGCCTTTTACATAGCAATAAATCAAATGACTCGAATAATTGTAGTTTCTCATCACATTGCCGCTAATCTAATATTTCATGAACGTACAAAGCATATTAAGAAAGACCAGTATTGTCTCT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_79

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Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

187

Start:

12298129  

End:

12298315

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_79

TTAAACGAACGGTTGTAAACGTTTGTCACACCCATTAACCATTATAAAACTCTGGCGTTTGCACCAAAAATTGCAGAGAAAAAACGTGAGTAAGAAAAGAAAAACAAAAGACAAAAATTTGAGAAAACTTTGGTGAAAACACAAAAACAAAACAAATTACTCTGTTTGTTTCTCTTGTTTAGCCAAG

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

318

Start:

12312465  

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12312782

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_80

GTTATTTTACTAACCAACACAATTCTTGAGTGTATGGTTGCCTATTAAACGAACGGTTGTAAACGTTTATCACACCCACTAACCATTATAAAACTCTGGCTTTTGCACCAAAACTTGCTGAGAAGAAAATGTGAGTAAGAAAAGAAAAACACAAGACCAAAGATTGAAAAAACTTTGGTGAAAACACAAAAAAAAAAAAACATAAAACTTTATTTGTTTCTCTTGTATCTTAGCGTAGAACAATAAAGAAAACTTTGATTATCATATTCTATAAGAGATTTTGTCTAACCAAAGGCTTGAGAGAAGTGTCGAATTACT