ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
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Contig1007_LTR-Copia_42 RetrotransposonsLTRLTR-Copia903126031349+
Contig1009_LTR-Copia_43 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2071217512381+
Contig1009_LTR-Copia_44 RetrotransposonsLTRLTR-Copia15191262714145+
Contig1011_LTR-Copia_45 RetrotransposonsLTRLTR-Copia106747945860-
Contig1014_LTR-Copia_46 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8276747755+
Contig1015_LTR-Copia_47 RetrotransposonsLTRLTR-Copia7733227533047-
Contig1015_LTR-Copia_48 RetrotransposonsLTRLTR-Copia963677636871+
Contig1015_LTR-Copia_49 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8935046651358+
Contig1017_LTR-Copia_50 RetrotransposonsLTRLTR-Copia684186869-
Contig1017_LTR-Copia_51 RetrotransposonsLTRLTR-Copia85211922043-
Contig1017_LTR-Copia_52 RetrotransposonsLTRLTR-Copia12140404160+
Contig1017_LTR-Copia_53 RetrotransposonsLTRLTR-Copia87741515027+
Contig1018_LTR-Copia_54 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10049045003+
Contig1018_LTR-Copia_55 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2261351113736-
Contig1018_LTR-Copia_56 RetrotransposonsLTRLTR-Copia12633731238574+
Contig1018_LTR-Copia_57 RetrotransposonsLTRLTR-Copia7813896539745-
Contig1019_LTR-Copia_58 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10730923198-
Contig1019_LTR-Copia_59 RetrotransposonsLTRLTR-Copia3129966699977+
Contig1019_LTR-Copia_60 RetrotransposonsLTRLTR-Copia758100060100817-

< 3 4 5 6 7 > Total 318


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1007_LTR-Copia_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

99

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26893

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-

>Contig1007_LTR-Copia_41

TGATATGGATCATGATGTTGATGATGATGATGATGGAATTGATTCTCATGATGGTGATGAGTATGTTGATTCTGGGCATGATGAGGATGATAATGAAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1007_LTR-Copia_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

90

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31260  

End:

31349

Strand:

+

>Contig1007_LTR-Copia_42

CTAATAAACGGGTGATTCGTTTGTACTCTTTTTCCTAGCCTTTGGTTTTTTTCCCACTGGGTTTTCCAAAGGAAGGTTTTAATGAGGCAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1009_LTR-Copia_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

207

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12175  

End:

12381

Strand:

+

>Contig1009_LTR-Copia_43

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1009_LTR-Copia_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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1519

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12627  

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14145

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+

>Contig1009_LTR-Copia_44

AAACTTTCAGTGATGCAACAGAGAAAGCAGAATGGCACAAAGCAATGGATGAAGAGATAACATCCATAGAGAAGACTCAAACTTGGCAGTCAGTTGAGCTTCCTGAATGTAAACATTCAATTGGTGTGAAGTGGGTGTTTAGAACAAAGTATCATGCAGATGGTAGCATTCCAAAATACAAGGCAAGGCTGGTGGTTAAGGGTTATTCTCAAGTGTATGGAGTGGATTATGAAGAAACGTTCTCTCTGGTGGCACGGTTTGACACGGTGATAACTCGACTTGCCTTAGGAGCTTATATGCGTTGCCCACTATATCAGTTTGATGTTAAGTCAACTTTCTTGAATGGTGAGCTACTTGAAGAGGTTTATGTTGATCAGCCTGAAGGCTTTGTGGTTCAAGGCAAAGAGGGATTCGTCTACAGGCTGTACAAGGCATTTTATGGACTCAATCAAGCTCCTAGAGCCTGGTACAACAAGATTGATTCGTTTTTTGCAGAAACTGGTTTTGAAAGAAGCAAAAGTGAGCCTACTCTCAACATAAAGAAGCAAAGTGAAGGTGATATCCTTATTGTGTGCTTATAGGTAGATGATAAGATTTACATGGGTTCCAGTGCTTCACTTGTTGCTGATTTCAAAGTTAGCATGATGGAGAAGTTTGAAATGTTTACTGCATTATTTTCTTGGTCTTGAGATTAAGCAAGTAAAAGATGGGATATTTGTGTCTCAGCGCAAGTATGTGACAGATTTGTTGATGAGGTTCAACAGGATGAACTGCAATGCGGCAGAGACTCCTATGAATGTCAATGAGAACCTGCAGATGGAAGATGGAACAGAAAAAGCAGATGCAACAAGATTCAGAAGCTTGGTTGGAGGTCTTATTTATCTGACTCATACAAGACCTGATATTTCTTTTGCTGCGAGTGCAATTTCTAGGTTTATGGACAGTCTAACGAAGCAGCATTATGGAGCAGCAAAAAGGGTGTTGACGTATATTTCCGGTACAACAGATTTTGGTCTGTGGTACGACGAAGTTTCAGAGTTTGAGTTGGTAGGTTTCACAGATAGTGATTGGGCAGGCTGTGTTCAAGAAAGATGCAGCACTTCAGGACATGTTTTTAATCTGGGTTATTGAGCAATTGGAGTTCAAAGAAGCAAAAGGTGACAGTGTTATCATCATCAGAAGCTGAGTATACAACAGCTACTGCAGCAGCTTGTCAAGCTGTTTGGTTAAGAAGAATTCTGGGAGATATCAAGCAAGAGCAAAAGAAGGCGACAACTATTTTTTGTGACAACAAGGCATCAATAGCAATGACAAAGAATCCAACATATCATAGAAGAACAAAGCATATATCAATCAAGGTCTATTTCATCAAAGATTTGGTAAGTGAAGGTTCAGTTACTATGGAGTATTGTAGCATAGATGAGCATAATGCATACGTTCTAACAAAGGCATTGTCGAAGAACAAGTTTGACTACTTCAGAAGTAAGTTTGGAGTGTGCAAGTTTGAATCAAGGGAGAG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1011_LTR-Copia_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1067

Start:

4794  

End:

5860

Strand:

-

>Contig1011_LTR-Copia_45

CTATGGCCGTTTACTCTCCAGCGCGAAACTCCTTTCCCCTTCTACCTGCATCCTTCCTATCATAGTCCGCAGCTTGAATGATTCGACGAAACTTGTCATCAAACTGCCATGAACCACTCCACTCACCATATCCGAGCAGCGCACATATGGTTGCTGCATCCCGAGTCTAGATACCAAACATGTTCATCTTCTTCCTTCGTGAGATTCACTTGTGCCATAAGTAGCACATCTTCTTCTAACTCCGCGTAGTTGACTGTTTTCTCCCAGGTAGGACATTCAATTTTAAAGTGTCCCATCTTGTGACACTTATAGCACTCGACGTTCTCCTTATTAAAGCCTGAATATCCTCTTCCGCGGCCTCCTCTGCCTCCGCGATATCCCCATCTACCTCGGCTTTCACCACCACGTCCTCTTCCTCCTTCAATCTTCAAGGCATGCTCTTCTCTAACATGCTTACTAAGATTCTGCTCATGAACCAATAATGAGCTTTGTAGCTCATCCACTGTTAACTCCTTGATGTCGTTTGACTCTTCTATCGCACACACGATATAAGTAAATTTCTCCACAAGTGTTCGAAGTATCTTCTCCACTATCTTGGCATCAGGCATGTCTTCTCCCAAATTCCTCATGTCATTAGCCACCACCATAACTCTTGAGAAGTACTCTGTTATGGTGTCTCCTTCCTTCATCTCCAGCACCTCAAAACTTCTCCTAAGTCTCTGCAACTGAGCACTTTGAACCCTCTTGTTACCTTGATACTTGGTTCTCATAGATTCCCAAATATCCTTCGAGGTCTCTTTCTTTGCAATCGTCTTTAGGATGGTCTTGTCAATGGAAGCAAAGAGATAATTCTTCACCTTCAGATCTTTGAGCTTCATCTCTGCAAGCTCTGTCCTTTGAGGTCCTGTCAATATCACGTTCCTCTCCGGCTGTGTAACTCCGGTCTCAATGAGATCCCACCATTCTCTTGATCTCAAGAGATTTTCCATGAGCATTGCCCAATGCTCATAATCACCATCAAATTTTGGTATACTCAACAAACCATCTTTGTCACTCATTTTCACTCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1014_LTR-Copia_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

82

Start:

7674  

End:

7755

Strand:

+

>Contig1014_LTR-Copia_46

GATTTATTGAATTAAAGAAATACTATCATATCTCGCTTTCGTGTTCTTCATTTCCTCTTCTCCTTAATTATTCTTTTTTAAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1015_LTR-Copia_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

773

Start:

32275  

End:

33047

Strand:

-

>Contig1015_LTR-Copia_47

TGCTATATCTGGAGCCAAGACAAAATTTGTCTTTCCAAATCATTTTCATCTCAACTTTTTTCATATGAGTTTGTGCATCATCAATCTCCTTTTGAGTTCCAATAATTGTTTAGTCATCGGACGTTATACAGCAATGATCACAAATCCCGATGGAGATTTCTTAATTAAAGATGCTAATTCATTATTTATCATATCCTTTCTTCAATAGGTATCCTTTAAGCGATTGTAACCAGCATGCGTCTGGATTGTTTAATCCGTAAACAGTGATTCTGTAAACTTGACCGCTCAATATATCCTTAGATTTTTGAACTAGTGCCTCTGGATTTTAAAATCCTTCTGGGTAATTGTTCATATATATAATCATTATCCGTCGATCCTATATATGCTGTCCCCACATCTATAAGTAGCATATCTGATTTGTAAGATGCAGTTAAGCTCATTACAGTACATGAATGTAAATTGCTCCCATGACCGGAGAATCTGTCTCTTTATAAGTCAACTTCTTGGTCTTTGAGAAAAGCCTTGTGCAACAAGTCAGGATTATATGTGGTGAATTTATTTTTCTCATTTCTTTCTCACGAAAACCCATTGCACCAACAGGTTTTACATCACCAGATTAGTGACGACATGTCAACGATATTTCTTTTATTGAGGGAGAACACATTCAATTTGCATGACACTTTTTCATTTCTCCAATACATGTCTTTTCTTGACATTTAATCGGACCTTTGGATATGGCTATCATTTTCATGATCAATCTCTTTAGATACAGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1015_LTR-Copia_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

Start:

36776  

End:

36871

Strand:

+

>Contig1015_LTR-Copia_48

CTATGGCTCACTTACACTCTTTTTTCCTTGCCTTTGGTTTTTTCCAAAAGGTTTTCCAATGAAGGTTTTTAATGAGGTTCGTGGTCCATAGGTTCC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1015_LTR-Copia_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

893

Start:

50466  

End:

51358

Strand:

+

>Contig1015_LTR-Copia_49

TAATATGGTATCAGAGTTTTCAAGCTCCATTTCTCTTTGATTCAAGCATTTATGATCTTAATCTGAGTTCCAATTTCAATTGTTTTCCTCTAACGATGGTGACTATGAAGAATATTCTGTGAAAATCAACTCGTTCAAAGTTTTCAACGAGTTATGGAGTAATTTCTACTTGAAAATCGACTGTATATGCCGTCATAGCAGCTTCTCCTCGCGATTCTCGTCTAGTTGCCATCAATCAAGCTTTTGGAGGTTTGCAAGCTTCTGTTACTACAGAATCTTTGGATTCATCTCCTTTCTTTATAATGGATATCGCCGATCATCTAGGTTTGTTAATAATATCTCTTTGTCTTGATGGAACAAGTTGTGATTATTATAATGTTGTGGAGCCTATTTTTCTAGATGCTAAGAATAAGAACGGTTTTATAGATGGAACCTTACCTTTTCCTGTAGAATCGGATCGTAATTTTATGATTTCGTCTAGATGTTACAGTATGGTGAAATTGTGGTTGATGAATTCGGTCGTCTCACCATAATATAACTGTAGTATCACGCCTTAATGAGTCTAATGATATATGGCATAATCTTATGGTCGTTTTCATATGAGTAAACTGCCACAAACTTTCAATCCCACTCAAGAGATACAAGATTTTCGTCAAGGATCTTTGTCTTTGTCTGGCTAGTACACGACTTTGAAGACTTTGTGGGACAATCTAGAGAGTACTGAAAAGCCAGACGATCCATGTACTTGTGGAAAGGCTGTGCGTTTGCAATTTAAGGCTGTGAGAGCTAGAATTGTGTAGTATTTTTGCTCAACTGAATGACTCATATTCAATTTTCACAACAAAAATTATAACTCAAGAAAGTGCTTTCTTCTCTTGCTGATATGTATAATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1017_LTR-Copia_50

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

684

Start:

186  

End:

869

Strand:

-

>Contig1017_LTR-Copia_50

AATCAATTAATATCATAAAATATCGAAACGGCCCGCATGATGGGTGGATAGGACCACATATATCACATGTATTCTCTTTAAGAATTCTGGAGATTCATTCCCAATTTTGGCTGGAGATGGCCGAATGATGAGTTTTTCTTGAGAACATGCATCACATGAAAACTCACAAGATTGAAAAATCTTCTTGTTTTTCAATGAGTGGCCATTAGAATTTTGCACAATTTTTTGCATCATGACTGAACCAGGATGTCCAAGTCTTTCATGCCAAACTTTAAATGTATCAGAATATTCTGTGGCATATGATGCGACCATATGAATCTTTGTGCAATACAAGCCAGAGGATAACATTGGCAGCTCTTCCAATATATGTTTCCTCGCTTTTATAATGCAAAGATATTCAATGCCATTTTTATTCATAGTCTCTATATGATATCCATTACTTAGGATATCTCTGAAACTTATCAAGTTTCTATGAGACTTAGGGGCATATAATGCATCATCTATTTCAAATTTTGTTTCCCTTGGCATTGAGAAACTTGCTCTTCCAGAGCTTATGATAATCTTTGCATTTCTAGAAATAGTACTCACGCTTCCAGCATATTCTTTTATATTGAGAGAGGAGAAATATTTTTCATCTTTGAGTATCGTATGAGTCGTAGCACTGTCTGCTAGACATATATCTTC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1017_LTR-Copia_51

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

852

Start:

1192  

End:

2043

Strand:

-

>Contig1017_LTR-Copia_51

TCAGCATCCTTTTTTTTTTCCTTTTGCCATGCTTGATACAGATCGGCCAAATGTTTTGGTATACGACATGCTTGATACCAATGCCCTTTTATTCCGCATCAATAACAAACATTTTCACTTTGCTTTTTCACAACGCGGCTACCATCATTCACATGAAGGTTTTTGTTGGCTTTTTCGGTGTTGAAATTGTTAAGATGGGAAATCTTTCCTCTTGCTCGTCCACCACCTCTTCCACGACCGCGTCCACGTCCTCGTCCTTGCCAATTATTAAAACTGGATTAAGTAACATTCACTTCAGGCAGTGGAGCTGATCCAATTGGACGAGTTTGATGGTTCATCATCACGAGCTCATTATTTTGTTCAGTAACTTGAAGGACTTACATCAAGTCAGAGTACCGAATATAATTTCTTGCTCGATACTGTTGCTGCAGGACTACATTTGTAGGATGAAATGTTTGGAAAGTTTTCTCGATCATATCATAATCGGAAACATTCTCTCCACATAATATCATCCTTGAAGTGATTCCGAACATCGCAGAATTATACTCACTTACTGTTTTATAGTCCTGAAACCGTATATTTAGCCATTCATGTTTGGCTTTTGGTAAGATCACATATTTTTGGTGATCAAACCTATCTTTGAGACATTGCCAAAGATCTGCGGGATCTTCTTTCATGATGTATTCATCCTTTAGACCATCATGGAGGTGATGATGTACCATGGCTTTTGCCTTTTTTCTCATCAGTCGTCGTTTCCGACGGCTCGATGGTTATAAGCAAATCCTTTGATTTTAGATATATTTTGGCCTCTAATGCCCATGAAAAATAATTTTTCTAAAAAGCATCAAGAGC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1017_LTR-Copia_52

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

121

Start:

4040  

End:

4160

Strand:

+

>Contig1017_LTR-Copia_52

ATATGAACTTAGGAAAGGTAACATACATTTGTACAAATACCTGAAAGTGTAGGGGTGTCTTAGGAAAAGTCGAAATACCACCTCCTATGGTCATAAATGGACCAAAACCAATGGATTATAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1017_LTR-Copia_53

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

877

Start:

4151  

End:

5027

Strand:

+

>Contig1017_LTR-Copia_53

TGGATTATATTCTATTTTTGGAGAAACCAGCCCCAACATTATGTGTACAATGTGATAGTCACTCGGCTATTGCCTGGGCACTGAGTAATCTCTATAATGGTAAGTCTTGTCACATCATAAGACGACATAAAATAATTAGACACTTGATCTCAAGTGGTGTAATAATGATTGCTTACATAAAATCAGCCAACAACCTAGCAGATCTATTTACTAAAAGTTTGGCTCGTGATCAAGTTTTGAAATCATCAATGGGAATTGGTTTATTGCTATAACCAAAAAAAAAAAATGTTTGATGGAAACCCCAAATAGGTGACTGCAAATCTCAAGATGTAGGTTCAAAGGGAAAACGAAATTAAACAAAATCTATTAAAAGCACTAATCAACCTTATGTCACTACTTAGTTCCCAAGATGATAAACAATGCAAGCATTAGCTTTGTACGTGGGGTATAACATGATATTTCGTAAAACAAAGACTAGTGGTAATTACCTAGTGAGTGTGAAATAAGGCCGTTTTTAGGAGAATGAAGTTCAGGCTATATTATCTAAGTTCACTCACGAATAACCAGACAAGTTCAAAGCCAAAATGAACACAATAGAGAACAAAGTTCTACGAGAAAATGAGCTGGGTTATATCAGTTGTCTCGTTTTACATAAATATCTTGGTGGTTCAAGACATCATGCTCACCTCCTAGTCGAGTAAACCCGATAGATTTTAACAATGAGTTGATCAAGGCTGAGATATGCCACCCTCTCAGACACAGTAAATTTTTGTTTATACTCTTGAAAAATCCTTAGTCGAGTCTGTCTAGTGTGTCTAATCTGTCTAGTCTTTCGAGTATTCTTATGTTTAGAGTAATTTCTATTTATGTGGAGGAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1018_LTR-Copia_54

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

100

Start:

4904  

End:

5003

Strand:

+

>Contig1018_LTR-Copia_54

GATCTATCGATCCGATGACCAGATCGAACGATCCATGGGTGAACCCGAAGAAATGGAAGTTGACGAGGATCGATCGATCCAGCAACTGATCGATCAATCC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1018_LTR-Copia_55

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

226

Start:

13511  

End:

13736

Strand:

-

>Contig1018_LTR-Copia_55

ATATGACCAGATCGATCGATCTGGGTGTGGATCGATCGATCTGGTCTGGATCGATCGATCCTGTCTTGGCTGGTCGATCTGGAAAGTGCTCACATAGCTGGATCGTCGATCTGGATCGATCGATCTGGTGTCTGGATGGTCATTCTGGCCTCCTATGGTCGATCCAGGAAGCTCTCGGCTTTCTCCTTATGCAGGATCGATCGATCTATGCCTAGATCGATCGATC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1018_LTR-Copia_56

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1263

Start:

37312  

End:

38574

Strand:

+

>Contig1018_LTR-Copia_56

TTTTCTTGAATCTTGGATCATTGAAACTGGTGCATCAAATCATATGACCGATAGTTTGGATTTTCTCTCTGATGTGTGTAATATGGCTCCGGTTTACATTAAACTTCCGGATGGAAGATTTACTGTTGCTACTCAACAAGAACATGTTCATTTGGGTTCTTCTCTGCGCATGAAAATTGTATTCTTTGTTGATGGTCTCAAATGTCATCTCATATCCGTTTCTCAATTAACTAGGAATCATGGATGTATTTTTCAAATCTCTGATAAGATTTGTGTTGTTTAGGACCGCATCACATGGACGCTGATTGGCGCAGGTGAGCAGCAAAGTGGACTATATTTTTTTAGAGGAGTGGATGTGGCAGCGATGACTCAGACCTCGGCTTTGCAACAGTATGATGTTTGGCATCGTAGACTTGGAAACGCTTCCTCTAAAGCTATCAAGATGTTGAATCTTTCTGAAGTTAGTTGGAGCAGTAGTGTTTTTGAAACTAGAGCGTGTGCAGTACGTGTCCGCGCCAAACAAACAAGAGATTCATTTCCTTTGAGCGATAATAAAACCAGTTCGGTATTTGAATTAGTCCATTGTGATTTATAGGAGCCATATCGTACTCCAGCTCTTTATGGAACACGTTATTTTCTCACTGTTTTAGATGATCTTGCACGAGCTCTTTGGATATATCTCCTCTCGTCAAAACAATCTGCACCAACTGAACTTACAAATTTTATTGTTCTAGTGGAACGACAATATAATCGACAAGTCAAAACCATACGCAGCGATAATGTGGTCTGAATTCATATGCTTAACGGGTTTTTTTTGTTTTGTCAAAAAGGGATCATACATGAAACTTCTTCCGTTGGCACTCCACAACAAAATGGAAGAGTTGAGCGTAAATACCATCACATACTAAATGTTACGCGAGCTCTTTGTCTTCATGCAAATCTTCCCATATAATTTTGGGGATATTGTGCGATTACTGTTGGATACTTAATTAACAGGACGCCTACAGCTCTACTCAACGGAAACTCTGGTTTCGAAATCTTGTATAATCGGCCACCTCCTTTGAATCATTTGAGAACATTTGGTTGTCTTTGTTATGTGCATAACCAGAAGCATGACGGAGATAAATTTGCCAGCCGCAGCAACAAGTCTGTTTTCATTGGGTATCCCTACGCGAAAAAGGGCTGGAGGGTTCACAACCTTGAAACTGGTATTGTCTCCGTTTCTCGTGATGTTGTCTTCTCAGAAACAGAGTTTCCATTCCC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1018_LTR-Copia_57

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

781

Start:

38965  

End:

39745

Strand:

-

>Contig1018_LTR-Copia_57

TGATCTTCCTCGAGGCCGGTCACCCCACTACTCCGGATAACCAATGACGACAAATCAGTTATATGGTGAGTGACCTCCACGATTACAATGCTTAAAAATTCCAAACTTCTCATGTTCTTCTGGTTTCAAACGTGGTCTAGACATCGCAACAAATGCTGTCTTCTTTAATCCGGCGATTGTTGAGCATGTCTTCTTCTTGTCTTACCACGTCATATACTTCCTCCAAACCAGGCAGTGGCTCACAAGACGTCAAGGTAGACCGAATTGTATGAAACACAGTCTCATCAAGACCAAACAAAAATTGATGCACCATGTTCTATCTTCTCTGTCTTTTTTCTTGTTGTGTACTTGCAGATACGAATAACATTGTTCCAAATCTTGTTGAGTTTTCTATAATAAGCTTCTACTGTCACACCTTGCTGCTTACACACAGCCAGATCAACCTTCATCTTCTGATTTCGAGGTCCATTCGAAACTGAAAATCTCTTTCTGATGTGTTCCCACAGATCTCTCGCACATCACAGTGTGAGATATTTGTTAAAAGCTCCGGATCAATCGTCATCTTCATCCAAGAGACGAGCAAAGCATTTATCGTCAACCAATCTCCTAGATCTGGCGATCCTTCTGCAGGTTGAGCAATAGTTCCGTCAAGAAATCCAAACATCTTTCGTGAGCGTAGTGCTGTCTTGAAGACACACACCCATTTTACATAATTATTTGCTTTCAAAATCAATGGGAGATTATGGCTCCTGGATTATCTGCTGCTGTTAAATCATATGGC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1019_LTR-Copia_58

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

107

Start:

3092  

End:

3198

Strand:

-

>Contig1019_LTR-Copia_58

CTCTAATAAAAGAATCGGTTCTTAGGATAATAACCCATTTTTCATTTAATTTTGATCAATTAAATGCTAAAAACCCCTTCTAAAAAACCCCGTTGGAGATGGTCTAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1019_LTR-Copia_59

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

312

Start:

99666  

End:

99977

Strand:

+

>Contig1019_LTR-Copia_59

TGTTGGATTAAGCTTGAAGATAACTTAAGATATAAGTTATTCAAAGTAGATTAGGATTAGGAAATATATTTAGGAGTTATCTAAATATATTAGGAGTTATCTAAACCTAGAGGTTTTCCTAATTGAATTGTGTTTGTGTCTAAGTCTCTCAATATATAAGGAGATGTCAAGCTGTGACATAACTTATGAGTTTTGAAATTGAGAGAACTTGAGAGCTTTAGTTTTGAGTAGTTTTCTAAAGCATAATAAAGAGAGTTATTCTTTATTAATCTTTGAGTTCTAAGCCTCCTTTAAACTCTTGAATTGGTATCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1019_LTR-Copia_60

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

758

Start:

100060  

End:

100817

Strand:

-

>Contig1019_LTR-Copia_60

TCCCTTTCGTTGTTTACAACCTCCTTGTTTGTTATTGCCGTGAGACCCACGTCCTCGTTCCCCTGTCCCGGTAAAGACGTCCACCTTGACCTCCTACCCTTCTTTCCTGGCACAAGTAATCCTTCTGTGCATAGGGTTGAGATCCATGGTAAGCAGTACAAATTGGTCCTTGGTCATGCCACTTGGTTGATCTTCTTCATCACAAAATCCTTTCCTCATAAAGTTTTTAAACCTTCCTTACATGTCAGCGAAGCTTGTTGTATTAAGATCAAGGCGACCTTGTTCAATGGCGGCAATGATATGTATGTATTTTTTTTCGTGGATAACCTCCTTAAGAAACTTCTTAACAAGTTTTGCTCTTCAATATTTCTTCCCAGAGCCCTGCCTGATTTTGTGGACAATTCCCGAGAGTTACCAAACAAAATCATCGATTTGTGTCAGTTTCTTCAAAAAAATCTTCATTTATCAAAACTCGGCCCAGTCCAAATTTGTAGTCGGCTTCTTTTAACACCTGTCAGTCTCCTAAGTGCCTAGCTTTTATTGCATCCCAAACAGTCTTTTGAGGTGTCAAGATCTCCAACTTGTAAGATTATGCTTCGGATCATGGAATTGAAACAACAAAGCAATTGCTATGTCGTTTCTTGGGTTTTGGCTGAAACCGTGATCATATCGTCTCCCATAACCTTCGTGAACACGCCAAAACACCTTCCAACCTCTCCGACCACACCGTTAGTTTGATGAGTTTCAACATCGGGAAC