ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
A07_LTR-Caulimovirus_81 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus279649765564979351-
A07_LTR-Caulimovirus_82 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus892558956525589653-
A07_LTR-Caulimovirus_83 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2692961275029613018+
A08_LTR-Caulimovirus_84 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus130458103595811662-
A08_LTR-Caulimovirus_85 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus106158950205896080-
A08_LTR-Caulimovirus_86 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus50258960965896597-
A08_LTR-Caulimovirus_87 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus51558966725897186-
A08_LTR-Caulimovirus_88 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus50958972495897757-
A08_LTR-Caulimovirus_89 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus227958978245900102-
A08_LTR-Caulimovirus_90 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus80359002105901012-
A08_LTR-Caulimovirus_91 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus105459010725902125-
A08_LTR-Caulimovirus_92 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus29859039625904259-
A08_LTR-Caulimovirus_93 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus59076104197611008+
A08_LTR-Caulimovirus_94 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus10276121117612212+
A08_LTR-Caulimovirus_95 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus64876151077615754+
A08_LTR-Caulimovirus_96 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus55676173097617864+
A08_LTR-Caulimovirus_97 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus100376218497622851+
A08_LTR-Caulimovirus_98 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus27676287617629036+
A08_LTR-Caulimovirus_99 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus100376349407635942+
A08_LTR-Caulimovirus_100 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus27676364377636712+

< 5 6 7 8 9 > Total 37


Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A07_LTR-Caulimovirus_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2796

Start:

4976556  

End:

4979351

Strand:

-

>A07_LTR-Caulimovirus_81

TATAACGTTAATAATTTTACAATTGCATAGATTATCAGACAATTCTTGTGCTTCTATTGAAGAATCACTAATATTTCCTATCTCATCTATAGAGTTATCACTACTCGATTCCTCTGATGTTTCTGGTTCTGATATTAATGGTTTAGTTAATTTTTCTTGTATATCTGGTTGATCTTGAAATATATCATTTATCTTCTTTTTCATTTTACAATCCGTGGATTTATGTCCAGGTCTTTTATAATTCCAACATACTATCTTTTGTTTATTATTTGATTTGTGCTTATTATTCTTTGCATAGTATTGATTTGTATTTTTTTATTAAATTTATTATTTTTATAAAAATACTTAGTTTTATTATTCCTATGCTTAGTCGTTTAATTCTTGACGATTATTAAGTTGATTATAGCCATACTCATCACAAAATGATCCCATAGTTATTTTAAATTTAAATTTCTCATTTCATTTTTTATTTTTATGTTCTTGAGATATAGCTAATCCTTCTTTCTTTATAAATGAAAATAATTGACCGTAAGTAATTGTATTCCAAGGGAGTGGTTGTCCTCCTGAATACTCTTTTAATTTACCAATTACTCTTTCTGCAAAGAAAGATGGTAATCCTGAGATAAACAGCTCTTTCCAAAATGCTTGATTACAATCGTTTCTTTGAAATATGTTAGTTATAAAAACATCTTTGTACCATTTAAAATCTACTAATGTTGGACACCTTAAATTTGTTAATATAATTTTTTTACTTTCTAATTCTTCTTTAGGATTTCCGATAAAAAGCATTGTTAAAGTATGTATTAATACTTCTACTGCGTTTTGTACTTCTATATCATTCATAAATCCTTCTTCATCTTCTTGTTGTTTTATTTCAACATGATTAATTATAGATTCTTGTGTAATTGCGTCTAATGAGTTATCCCACCAATATCTTAATGCTCCAGTAATTCCAGCTATTAATAAAATGCATGACTGTTGATCATTATTTCCTCTACCTTTGTAAGCCATTGTAGCCATTCCCATTTCTTGAAATAAATTCATCATTTCATATTCTGATCGTCCATCTATATTCCATTCGTATATACTTTCTCCAGAGTATTCTTTACTAGTATATTTGTGATGTTCTTCAAATAATAAATCAGGTGGAGTATGCCTAGGATAATATGGTTTTCTTGATTTATTTTTTATTCGATTTATTTCTTGTATATCGTTTTCTGATTGTGAGGAGGTTTGGATAGATTCATTGTCATCTTCATCTATAGTGTTTATTCATTTTCCTTTATCTAACCTGTCTAATCTGGTCGAGATTGATTTTAAAATTTCATTTTCAGGAAATTTGATTTGTCTTGTTGTTGGTTTAAAGATTGGGTAGGTTGTTGATGAGAAAGGGTGTTGGTCCACTTTTCCTTTTTCATTAATATTTATTTTATTATCAATGCTTTCTATCTGCTTTGAAATTATATGTAGTATTTGACTTTGATAATTGTTCTGTTGATATATAGATTTAATATCTTGCATTACTACTGGTTCTTTATCATCTTTGTTAGCTCCAGTTTTAAAGGGAGTAGCTAAAATTTGTCGGTTTAGGGTATTTATCTTAAATCATTTAAAGGTGGATGAATTGCTTTAATTTTATTTTCATCAACTTGTTCTCATACTTGGCTTAATGATGTACTTGCATTAATCGTCCTGAATGGATAATTGATATTATGAGCCATTGAATAAATTTCAAATCATATGAAAAATGGAATATTCATTTCTTTTAGTATCATACAATCATACCATTTTTCTCTTTTGAATAAAAGTCTTCTCTTATATATTGTTTATCAATTTCGTATTTTTTAGTTATAACATTTATTGATCTAAAATCTGATGGAGTAGGTGATGTTGGACACGCATCTTGATCTGGTTCTGCTATTGGTGCTTTAAATTTTATCGGTTCATCTTGTTTAGTATTTTGATTTACACTTTCCGTTTCTAAATTTGTACTGGATTGACCAGTACGATATTCAGAAAAAGAGGCTCTTGAATGATAAGAACTTATTCTAGGTGGAAGTGGATCCCTATAAGATCCAAACCTTAATAATATTTTTCCATCTTTCTGCTCAATTATTTTGGATATATTCTTTTGTTCAAAATTTCTAGGAGGTTGAGTAATTTCAATTTTCCATTGATCTGGAATAGTTATTTCATCCCATTTTAATTGCTTTGGTGTGTATGTAGCTGTTGGTGTATTTTTATCTCATGCTATAATTGTTGTTTCTCCTTTATCATCTTGCGATAGACATCTTGGGTTAAATTCAGAAGTTGATTGCTTAAAATAAACTCAATAAAGTAGTAGATATCCATGTCGTTCATTTTGAAATTTTATTTCAGGTAAATGTACATTTAAAGTTAAAGTATTGAGTATGGTTGGGTCATGCAAGCTTACTTGAAAGTTAGGGGCACAATTAAAATATACAGCACCATTGCATAAATTTGATTGTACTGCTCCTAAAAGAGAGTCTTCAAATTTTAAGAGAGTTTTATCTCTTAATAACATTAATATTGGCGAGTCTATACCTGTTCTTGATAAGGGTTTTATAGCAATTTGGATTAGACCAAAATGGATGGAATTAAATCCTTTTTGCCTATATTTATCCAAAGCTAGAGAAGATAATAACTTGATTTCTTCAAATTCGTTTTGTAGAGACAAAGTTTGTTCATGATCTTTAATTGAATAAGCTGTTTTAAAATCAAAAGTTCCTATTTGATATATATGTTCTGGATTAATATGCGGTAAATGATCTTTTG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A07_LTR-Caulimovirus_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

89

Start:

25589565  

End:

25589653

Strand:

-

>A07_LTR-Caulimovirus_82

TCGGATGAAGGTAACACAAGATCAAGAGCATGATCTTGAATTTGGTAGAAGATCTAGTGATGTAGGGTAGCTACTAAACTCTTTTCTTG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A07_LTR-Caulimovirus_83

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

269

Start:

29612750  

End:

29613018

Strand:

+

>A07_LTR-Caulimovirus_83

TTTCTCTCTCAATGTTTCTCTAAAGTTCTCAAGTTTTCCAGATCTTATCTCATCTTTGATAAGTTCTGATTTCTATCTTCCATACACAAGATGCAATCTAATCAATAGCTGTAATCTTTTCTTGATCGGTTTTGTCAACACGACTCTGTCAATACAACTTTCGGGGGGTGTGGTTTCCTAACAGTGGTTGAGCTCGATCTAAAGGCCATGGTAGTGCCTATATCACTCTCTTTACCTAGAAATCTCTGATCTCGTCTGTCAACACGACT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1304

Start:

5810359  

End:

5811662

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_84

ATAGAAAACACAGCTTATCAAAGATGAGATAAGTTCTTGAAAACTTGGGAGTTTAGAAGAACATTGGAGAGAGAAACTTTAGAGAGAAGTTTTTATGAAATTATTTGATGTTATTTCACAATGGGGGTACACACATATTTATAGTACAAGATAAGGCACTGACATAAGCGATTATCTCAGCGATTACATCATCTCTTACATCACGCTGTAGTAGCGATTACATCATCGCTTACATAATTATTCATGACACTTATTTTACATAATTAAACACACTTATCTTACATAATTATACATTGCAAATGACTTACTTAGTGGTCCATTTCGAACTCGATGATGTGTTTCTCACAACATCCATAGTGATCGTCTGGACATTCAAACACATCTCCTGGATATTAGTACATATTCTCTGGCTCTTCTTCTTGAGGCTGCTGTGAGTCGTCGTTGATTTCAATATTAAACATTCTTCCAACTTCATCAATGTTCATTGAGTCGTCTGGGAGCTGAGCGTCTTGAAAATACTCTGGCGGGCATTCTTGAGACTCAGAGTTACGTTTCTCTTTCTTCGGCACACGTTTAATCATTGGTGGTTTGTCACTCTTATCCAAGTAGAATTGCAGATCTTCGTCGAGACTCATTTGGTAGTCTATTGGGTAATAGAACCAATTTGGGACGAAGGGAATGGGAAATGATTGTGTGGCACTGTTGAGGCGGAACGCATGAGTTTGAAAGTCTTCAAATGGCTTGTTGTCATTGAGGTTGAAATCTGGTCTGACTCCTCGTTGGTAGTCATTGTGGTGAATGAGAGTAGACAGTGCGTGGACTTTGCCGGTTTTTTTGTTGACTTGAACAGGGCGGTGGAAGAAGTATATTGTGTGAGGGTTGAAGAAAGGGTTGAGACCTCCTTGACTTTTTAGCTTCTTAAATGATAAGCCTGTTGCTTTCGTTGATTTCCTTAACTTACCGTTCCAGAAAAATAATGGCGCGAACCAGGTTAGAAATGTCGAAAGACATTCCTTGTGACCTCGTTGAGAGTTGGTGAATTGCATGTTGATGTATTGGTATAACCATTGAATATCAAAGGTTATACCAATAGTGTAGATCGAGCAGAGGTACCAGAGAAATCAGAGAACTTCTTCTGGAATGTAAGCGTTTTCGATCCTGTAGAGATGAGCGAATGGGTAGTCCGGGTGAATTCCCATAGGTGAAATAAGATGATTATGGGTTCCGTATTTTGACAGGATGATGGATTGATAGAAGAAAATCTTGTTGCGGAAGTGCTCATGTAGGGTTTTTCTGTCGATAAG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1061

Start:

5895020  

End:

5896080

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_85

GGATTTGTTTGGGATAATTGGGTTGGGTTGAGAAGAGGTATGGATTTGGATATAGTTTGGATTACTGTTTTGGCTTGATTTGTAATTTGGTGGATATTGGCGAGGGAACATATGTCGATGTTATATTTTTTCCACCTTTTGACTCTGAATTCTCAGAGGAGAGAATAAGGCATGTATTGAAGAGCGATAGCGAGGGTAAAATGCCATGAACATATCCATGGGATGCCCATGTCGATATAAAACCAGATTTTGTTTAGAGGCCCAACTGGTTGATCAAGTACGTGTTTCTTGTAGAATGGGTAGGAGGTCTTGAACACTTCTTCGGGGTAGATTGGATCTGCTGGTCCGAACCAGTACCACCATTCGTTGAACCATCCTGGTATCGTCCTTGTGCAGTTTTGATCAAAACTGAAGAACCAAGAGTGGTCATAGGGTCTAAGTAAAAAATCTCGGAAAAAGGCATTTTAGTAATCGGTATAGGTGTAGCCGTTGATATGATAGCCTGGGGTGAAAAAAGGTTTAGTTGTATGATTATGGATAAAACCAAGGTCTTGGGTAGAACAGATTCGTAGGAATTTGCAGGTTGAATAGTTGATGAGGTTTGGGTTTGTCTTGTTTTTATAGTGGGTGTTTTCTACAGATTTAGAGTCTACTAGAATATACTCATAAAAGGATTGGTTTTTGATTATGTTGTATGTTGGCCAGGGACTGCCTTCGTAGAAGACTCGATTGATGAAGGTTTTGAGTTGAGTAAGCTTTATTGGTTTGGTGAATGGGGTCGTCATCAGGTGTTGCTTATGAGGTTTGGTGTAGTAGACTGGTTTAGTGTTTGGGGTAGTGTTTGTGGTTGTGTTTAGGGTTGCTGTAGATGATTGTATTTCTTCCTTTGATGACTTTTCAGAGACTGCTTTTGAATAGGATAGAGGAGGATATTCAGCTAATGCTGAGTAAGGGTTTGGAGTTAAAGTCCTTCCTTGGAGATGTGGTTGGTTTTTGATATAATCTGATGCTCTCATAGGCTTTTCATTTTCTGGTCACTCATTTTGAATATCTTGTTGTTG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_86

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

502

Start:

5896096  

End:

5896597

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_86

TTTAGTATATTGAATATCAAAATTGAAAACGGATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGATACTAGGTTTTTTACATCTTTTTGTAATATTTCTTTTGCTGATTTGCAATCTATTCGCAATAAAAAAATTTGTTGATTAAGTCGTCTTGGAATTTTTAGATACAATTAACAATTGAGAGAACTTCCTTCTTAACTGTTGAATAATGCTTTTGTGGTCCTAACCAGACTCCTGAATGGAATCAAACTATAGATTCTTGTTTTGATTGTGGTAATTTTTGCTTAAGAATTCCTCCATAACCTATTTCTGAAGCATCAGTTTCAACTATCATGTCAGCTTCAGGATTTGGTATGGAAAGGCATGGAAGAGTTTTAACCTTTTGCTTAACTTGTTTGACTAAAAGGGTATGTTGATTAGTCCATGGTTTTGGATTCTTTTGTAACCGTTGAAATAATGGGTGAATTATTTTCCTAGATTGGGTAAGAAGTCTGAAAC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_87

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

515

Start:

5896672  

End:

5897186

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_87

ATATATTGAATATCAAAATGAAAAACGAGATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGATACTAGGTTTTTACATCTTTTTGTAATATTTCTTTTGCTGATTTGCAATCTACTCGCAATAAAAAAATTTGTTGATTAAGTCGTCTTGGAATTTTTAGATACAATTAACAATTGAGAGAACTTCTTCTTAACTGTTGAATAATGCTTTTGTGGTCCTAACCAGACTCCTGAATGGAATCAGAACTATAGATTCTTGTTTGACCCTGTGAGATTTTTGTTTAGATTCCTGCTAACCTATTTCCTGAAGCATCTGTTTCTACATATCATAGTCAGCTTCAGGATTTGGTAGTGAAACAAGGAAGGGTTTTATACCTTTTGCTTAATTTGTCTAACTAAAGGGTTGCTTGACTAGACTCTATGGCTTATGGATTTTTTTGGAAGTTTAAAATAATGGTTGTATTCGTTTTCCTGAGGTTTGGTAAGAAAGTCGTAAATCATAGTTTAGACAT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

509

Start:

5897249  

End:

5897757

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_88

TTAATATATTGAATATCAAAATCGAAAACGGATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGATACTAGTTTTTGACATCTTTTTGCTAATATTTCTTTTGCTGATTTGCAATCTACTCGCAATAAAAAAATTTTTGTTTATTAAGTCGTCTTGGAATTTTGAGGATACAATTAACAATTGAGAGAACTTCTTTCTTAACTGTTGAATAATGCTTTTGTGGTCCTAACCAGACTCCTGAATGGAATCGAACTATAGATTCTTGTTTTGATTGTGGTAATTTTTGCTTAAGAATTCCTCCATAACCTATTTCTGAAGCATCAGTTTCAACTATCATGTCAGCTTCAGGATTTGGTATGGAAAGGCATGAAGGAGGTTTTAACCTTTTGCTTAACTTGTTTGAACTAAAAGGAGTATGTTGATTAGTCATGGTTTTGGATTCTTTTGTAACCGTTAAATAATGGGTGAATTTTTTCCTGAGATTGGGTAAGAAGTCTAACATAGTT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2279

Start:

5897824  

End:

5900102

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_89

TTTAGTATATTGAATATCAAAATAAAAACAGATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGATACTAGGTTTTTGACATCTTTTTGTAATATTTCTTTTGCTGATTTGCAATCTACTCGCAATAAAACTTTTTGTTGATTAAGTCGTCTTGGAATTTTGAGATACAATTAATAATTGAGAGAATTTCTTTCTTAACTGTTGAATAATGCTTTTGTGGTCCTAACCAGACTTCTGAATGGAATCGAACTATAGATTCTTGTTTTGATTGTGGTAATTTTTGCTTAAGAATTCCTCCATAACCTATTTCTAGAAGCATAGTTTCAACTATCATGTCAGCTTCAGGATTTGGTATGGAAAGGCATAAGAGGGTTTTAACCTTTTGCTTAACTTGTTTGAACTAAAAGAGTATGTTGTTAGTCATGGTTTTGGATTCTTTTGCTAACCGTTGTAAATAATGGTTGAATTGTTTTCCTAGAGATTGGGTAAGAAGTCCAAATCATAGTTTAGGACATCCCTAAAATTCTTTGTAATGTTGGGTCTCTTCTCTTAATTCGTCAGGAAATTTATCTGCGAAATTCAATTGATCTTGAAATAGGTGTGATTGTTCTTTTGATATATATTATGCCTAAAAATCTTAATTTTGTTTGGAATCAAAGAAATTTTCTTGGCTGATATAACTAATCCATGTTTTTTTAAACTATATTGAGGAATGCATTTAAGTGACTAATGTGTTGGTCTATTGAAGTTGAATATACTAATATGTCATCTATGTAGACAATTGTAAATTTTGAATAATTATTGAATATATCATTCATTATATGTTGAAATTCAGAAGGTGGATTTTTAAGGCCAAAAGGCATTACATTCCATCATAATGTCCAAATGGTACGTGAATGCTGTTTTATATTTATCTTTTTCGGCAATTTGTATTTTTGCCAAAAGCCACTTTTCATGTCAAATTTTGAATAAATTTTTGCATTATAAAGATCGTTTTGATAAATCTCTTTTGTTAGGTATTGGATATCGTATCCATTGTAATACATAGTTTAATGGTTTATAATTTATTACTAATCGTGGTACCCATGCTCTTTTCTGCTTGATTATTTACATAAAAGGCCGAACAGCTCCATGGAGATTTGGATGGCCCTTATTACCATTTTTTGTCTAATAAATTTTTTATTTCTTTTTTACAGTGTTCTAATAATTCCTTATTCATTTGAATAGGTCGTGCTTTAGTTGGTATATTTCTTTCGTTAAAATATTTTATATATGAAAGTTCAACTGTATGCTGTTTTCTTTCCCAAAAGGCATTTGGCAGTTCTGAGCAGATTTAGTTTAGTATATCATTTTCAATAGCTTTTATCTTGCTTATTATGTAAGGCATCTTAAGTTGTTCTTCTATTTTTTTGTATGCTATTTCAATTTGTAGATATTGTATATGATTATGTTTTCCTTTTATTAAATTAATGGTTTTTTGAATGGAATTTTGCTGTAAGTTTAGTATTTCTTTGGTTTTCATAGGTGATAAGAATTCAAACGATAATTTGTTCCTACTACTTTTGTAGTTACTCCTATTTCTGTTACTTTGAACAGATATATTTGAGTAAAAAATGAAGTTCATAATATCACTTCTTGTGTTAAGTTTTTTACTAGAATAAATTGATTTTCGAAGCAATATCCTTGGTTACATATTTTTTGCACATGGTAATTTATATTGAACTTTTAAATTACTTCCGTTTGCTCCACTTAATTTTTCAATAGTTTTTTTCATAATATTTAGTTGGTATAATTCCTTCGCGAATACAATTGTAATCAGCACCTGTATCCATTAATGCTATTATATTTATTTTGAAATCATGTCCCACGTGTAAGGTAATATTTGTATACCATTTTTGATAATTGAATTTATTAATTATTTGAAATTTAGTCTTCGGTAGGTCCAATTTGCTTATTTTCGTCACTTTCTAGATTTGTATTACTTGTGGATGCTTGATTTAAACTACTTGTAGATGCTGGAGTAGTATTTTTTGCTTCGAATAATGATAATATAGCATATGTTTGCAATTGTTTTAATTCGTGTTGATTTACTATTAATTGTAATTCTTTAATCTGTGTCTTTAATTGCTTAACTTCATTTTGTAGGTCTCCTGTAGTTACTTGCTTAAATAAACTTTGTGTAGGATATTTATCAAATATTTTATTTAAACTAAAGGGTTGAGGGCTAGATAATTGGTTTTCTTGATATATTATATCTTTTAGTTTAGTTAAATATT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

803

Start:

5900210  

End:

5901012

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_90

GACAATTCTTGTGATTCTATTGAAGAATCACTAATATTTTCTATCTCATCTATAGAGTTATCACTATTCGATTCTTCTGATGTTTTTGATTCTGATATTAATAGTTTAGTTAATTTTTCTTGTATATCTGGTTGATTTTGAAAAAATGTCATTTATCTTCTTTTTCATTTTACACACCGTGGATTTATGTCCAGGTCTTTTACAATTCCAGCATACTATCTTTTGGTTATTATTTGATTTGTGCTTATTAATCTTTGCATAGTATTGATTTGTTGATTTTTTATTAAATTTATTATTTTTATGAAAATACTTAGTTTTATTATGCCTATGCTTAGTCGTTTAATTCTTGACGGAGGGTTAAGTTGATTATAGCCATACTGATCACAAAATGATCCCATAGTTATTTTAAATTTAAATTTATCATTTCGTTTTTTATCTTTATGTTCTTAACATATAGCTAATCCTTCTTTTTTTTATAAATGCAAATAATTGACCGTAAGTAATTTTATTCCAAGGGATTGGTTGTCCTCCTGAATACTCTTTTAATTTACCAATTACTCTTTCTGCAAAGAAAGATGGTAATCCTGAGATAAACCGCTCTTTCCAAAATGCTTGATTACAATCGTTTCTTTGGAATATGTTAGTTATAAAAACATCTTTGTACCATTTAAAATATCCTAATGTTGGACACCTTAAATTTGTTAATATAATTTTTTACTTTCTAATTCTTCTTTAGGATTTTCGATAAAATGCATTGTTAAAGTATGTATTAATACTTCTACTGCGTTTTGTACTTCTATATC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1054

Start:

5901072  

End:

5902125

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_91

TTGTATGTAGTATTTGACTTTCATAATTGTTATGTTGATATATAGATTTAATATCTTGCAGTAATACTGGTTCTTTATCATCTTTGTTAGCTCCAGTTTTAAAGGGTGTAGCTAAAATTTGTCGGTTTAGAGTATTTATTTTTAAATCATTTAAAGGTGAATGAATTGCTCTAATTTTATTTCCATCCACTTGTTCCCATACTTGGTTTAATGATGTACTTGCATTAATCGTCCTGAATGGATAATTAATATTATGACCTATTGAATAAATTTCAAACCATATGAAAAATGGAATATTCATTTCTTTTAGTATCATACAATCATACCATTTTTCTGTATACTCTTTAGTCTGTTGTTTAGAAAAAGTTTTAAAATACCAGCTTCGTTTTTCTTCATTTTCTTTTGAATAAAAGTCTTCTTTTATATATTGTTTATCAATTTCGTATTTTTTAATTACAACATTTATTGATCTAAAATCTGATGGAGTAGGTGATGTTGGATATGCATCTTGATCTGGTTCTGGTAAAGGTGCTTTAAATTTTATCGGTTCATCTTGTTTAGTATTTTGATTTACACTTTCTGTTTCTGAATTTATACTGGATTGACCCGTACGATATTCAGAAAAAGAGGCTCTTGAATGATATGAACTTATTCTAGGTGGAAGTGGATCCCAATAAGATCCAAACCTTAGTAATATTTTTTCCATCTTTCTGTTCAATTATTTTGGATATATTCTTTTGTTCAAAATTTCTAGGAGGTTGAGTAACTTCAATTTTCCATTGATCTGGAATAGTTATTTCATCCCATTTTAATTGATTTGGTGTATATGTAGCTGTTGGTGTATCTTTACTATGGACTGCTAGAATTGTTGTTTCTCCTTTATCATCTTGTAATAGATATCTTGGGTTAAATTCAGATGTTGATTGCTTCAAATAAACTCGATAGAGTAGTAGATATCCATGTCGTTTGGTAATTTAAGTTAAAGTATTGAGTATGGTTGGGTCATGCAAGCTTACTTGAAAGTTAGGAGCGCAATTAAAATATACTGACCCAT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

298

Start:

5903962  

End:

5904259

Strand:

-

>A08_LTR-Caulimovirus_92

TTTGATATATATGTTCTGGATTAATATGCGGTAAATGATCTTTTGATATTTCTTGATTAAACGTTGTTATTTTTGACATAATTTCTCTTGAGTTAATTGTCGAATTTGAAGAGGCTGATGCATTTTTTGATTTAAATTTTTTTTTAAACGAAGACGCCATGATTTAATCTATATTTAAACTCATTATAGAAGAGATACTAACCGATTCTAATTGGACACAACTGAGGTATACCAACGGTCTTACTGCCTTCTCTGCACTTGCTGCCTGGAACACCTACAGTAACAGTGTTTCTTTAGA

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

590

Start:

7610419  

End:

7611008

Strand:

+

>A08_LTR-Caulimovirus_93

TCTATGGAAACACTGTCCCTGTATGTATTCGAGGCAACAAGTCTAAAGAAAGGCAGTAAGACCGTTGGCAAGCTGCATTTTTGTCGACATAGAACCGATTAGTATCTTTTTAGTATGAGTTTAAATTTAGCATGATTAATGGTGTCTTTGTTTAGAAAACTTTTTTAATCAAAACATGCATCAACCTCTGCATCATATGCAACAATTAATTCAAGAGAAAACTTTGTCAAAAATAACCTCATTCAATCAAGAAATATCAAAAGATTATTTACCTCATATCAACCCATAACCTATATATCAAATATGTACTTTTTATATTAAAACTGCTTCTTCAATAAAAGAACATGAGCAAACTCTATCTCTCCAAAATAAATTTGAGGAGAGTAAACTATTATCTTCACTAGTTTTAAATAAATATAGACAAAAAGAATTCAATTATATCCATTATGTTTTAATACAAGTTGCTATAAAGCCTTTATCAAGAACCGGAAAAGATTCACCAATCCCCTTGTTTTATTAAGAGATAAAACTTTGCTAAAATATTAAGATTCTATCCTTGGAGCAGTCCAATCTAACTTATGCAGCGAAGC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_94

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

102

Start:

7612111  

End:

7612212

Strand:

+

>A08_LTR-Caulimovirus_94

AGTATACTTTAATTACGCTCCTAACTTTCAAGTAAGTTTACATGACCCAGCTAATACTAAATACCCTAACATTAAATGTTCATTTACCAGAATTCAAATCCC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A08_LTR-Caulimovirus_95

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

648

Start:

7615107  

End:

7615754

Strand:

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>A08_LTR-Caulimovirus_95

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Retrotransposons

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