ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr2_LTR-Cassandra_81 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra13285606268560757+
Chr2_LTR-Cassandra_82 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra18496881649688347-
Chr2_LTR-Cassandra_83 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra30697833409783645-
Chr2_LTR-Cassandra_84 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1241055216810552291-
Chr2_LTR-Cassandra_85 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra921229711412297205-
Chr2_LTR-Cassandra_86 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2141247570312475916+
Chr3_LTR-Cassandra_87 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34183035848303924-
Chr3_LTR-Cassandra_88 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3351103238911032723-
Chr3_LTR-Cassandra_89 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3151173940711739721-
Chr3_LTR-Cassandra_90 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1001173973011739829-
Chr3_LTR-Cassandra_91 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1741173986411740037-
Chr3_LTR-Cassandra_92 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2951174008611740380-
Chr3_LTR-Cassandra_93 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra2351180522311805457-
Chr3_LTR-Cassandra_94 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3541185192511852278+
Chr3_LTR-Cassandra_95 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1101185227911852388+
Chr3_LTR-Cassandra_96 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3521185238911852740+
Chr3_LTR-Cassandra_97 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3121193131911931630+
Chr3_LTR-Cassandra_98 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1111193163111931741+
Chr3_LTR-Cassandra_99 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3531193174211932094+
Chr3_LTR-Cassandra_100 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3521273433012734681+

< 5 6 7 8 9 > Total 9


Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

132

Start:

8560626  

End:

8560757

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_81

GGTGATTTGTTAGATCGGTAAACAAGTCTTCAACTTCCTAAACGTAACGAACCGACCTTTAGAAAGGAATGAAGCCTATATACCTAAAAAAATATGTGGGTGTTCGTAGGTATAAGCGATCTGGACATTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

184

Start:

9688164  

End:

9688347

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_82

AATTACTTCTAAGCAAGTCACTCATTCTAAAAGTGCTCCAGCTCAAATACGTTTAATTATAGAGTTTTAACACGATGTTTAACCCCAAAAATAATTAAGTGTAGTTTAGTAACATTGATAAATAAAATAATTCTTTTAATCTTTCTTTATGTACAACCATATTTCTAAAATTAGGGATGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_83

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

306

Start:

9783340  

End:

9783645

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_83

TGTAAATCTCCCAGACCGATCTTACCAGTAACACCCACAATTCTCTCGGACATGTGAGATCCAACCCTATCCGACCGTATATACGCCATGTTCAGAAGGTTGTAAAGACTTGTTTACCAATTCTATAAATTATCGTATGATATTTTTATATGTTTTCACACGGTTTTGACAATTATTTTTTGGAAGATCACCTATTCTGAAATTGCTGCAGTCCAAACACGTTTAAATGTATAATTTGTTTCAAAATAGTTGACCAAAAAATAAATGTGATTTGGCGATATAAGTGACAAAATCAATTCTTTTAAA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

124

Start:

10552168  

End:

10552291

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_84

TCTCTTGGTCTATGGACCCACCCTTTTCGGTTAGCTGGTACGCTACTTGGGAAAGCTCGAAAGACTTGTTTTCTATCTATACAAATCACCGTAAGATCTTTCAATGTGTTTTGTTCTCACTCGC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

92

Start:

12297114  

End:

12297205

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_85

ATAACTGCACTTTTGTGATATAGTTTTTCAAATCAATTCTTTTAAATTTTTAGGCATGTACCATCATATTTTTAAAATTTGGAAGTGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_86

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

214

Start:

12475703  

End:

12475916

Strand:

+

>Chr2_LTR-Cassandra_86

TATAACACTCCAGTTTCAGGAATATAGTGATGCATGCGAAGAATTTTAAAAGAATCAATTTGGTCATTGGTGTCACTAAAATACATTTATCTTTTCGGGTGTCACTAAAATGCATTTATCTTTTCGGTCAAATGTTCTCAAAAATACTCTGAAGTTAAACGTGTTTGAGCTGGAATAATTTTTAGGTGAGCGACCTTCCGAAAAATAATTATTG

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_87

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

341

Start:

8303584  

End:

8303924

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_87

TGTAACGTATAGACTGCCCTTATTAGTGAACATTCACGTCTTTTTTCGGACTCGTAGGTTTAATTTCTATCAAACGATCGACTGCTATATCCGAAAGTTTTAAAAATTTGAAATCAGCATATGGTGTTTTCTCTTGTTTTGTCTTCATCTACACGATTTCGACAATCACTTTTCGAAATGTTATCCATTCTAAATTTTTCCTAACTCAATTACCATTAACTTTTGAGTTTTTTTCAGATTAGTTAACCAAAAAAATAAGTAAATTTTAGTGACATAAATGGTCAAATCATTTTCTTAAACCTCTGCACAGCATCAACACATTTCCTAAAACAAGAATTTTA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

335

Start:

11032389  

End:

11032723

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_88

TGTAACGAGACGACGACCACCACTTTTCATGGACCAAACGTTTTTTCTCGGTATATGGGCCAATCTCGTCTGACAGTTCATTTTTCTGGAAGCTTAAATATTTGTTTACTGATTCTATAATTCACCATATAATCTTTTTCTTGTGTTTGTTTTCACTCATACGAACTAACAATCGATTCACGGTTAATCACCCATCATAAGTTTGCTTTACTTTAAATGCGCTTAACTTTAGAGTTTTCTTTAGATTTTTAATCAAAAAAAAAAAATAGTGCATTTTAATAACATATATGACCAAATCAATTTATTTAAATTTTCCTTATACACCACTATATTTC

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

315

Start:

11739407  

End:

11739721

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_89

GTGGGTCCCATGTCCTTTCTTGAGGAACGGCTTCCTACTGCTGAATTGCTATATTTTAGTCTTTCACAACATGTTTACCAATTATGCAATCACCACGTAATCTTTCTTTGTGTTTGTCCTTGCACAATACCTAAAATCACTTAAATGTTTGTTAACTGATCTTGAAATCACTTCTGGTCAATCATGCTTATTTGTGAAACTTTTTTCATGATGTATGATTGAAAATATAAAAAACAATTATGACATTGATATCCAAATGAATTATTTTAAGATATCTTCATGCACCACTATATTTGCTGATATTAGGTTGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

100

Start:

11739730  

End:

11739829

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_90

ACTAACACATCACATCATCCTAGTTGTTTACGAAGACCATCACCCCCGACCGAGTCAACCCTTTTGTCTTTACACTCGTTTGGGTTTGGCTCTGATATCA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

174

Start:

11739864  

End:

11740037

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_91

ATGTTCTCTCTCGACACATGTGTCCACCTTCTTCTAATGGCCAATTCGTTACTTTTAGAAGATGTAAAGACTTGTTTACCGATCTACATATCACTAGTGATCTTTTCCGGTATTTTGTCCTTACTTGTACTGATAATTACTTCCATATAGGTCACAAATCCTAAAAGCGCTCTA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

295

Start:

11740086  

End:

11740380

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_92

TGTAATGTTACGACCGCCACCTTTGGTGGACCCCATGTCTTTTCTCGGTCTGTGTGCCACCCTTTTTCGATGGCATGCTCACTATTTCTTGAGGCTTTAAAGAGTTATCTACCGATCCTACAAATCACTATGTGATCTTTCCTCATGTTTTGTCTTCGCTCGCATGGTAACAACAACCACTTCAGCTCAAGCATGCTTAACTGTAGATAAGTTCACTTTAAAGATATAGATGATCAAATTAATTATTTTAATCTCTTCTCATGCAACATCATATTTCCTAAAATTGGGTCTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

235

Start:

11805223  

End:

11805457

Strand:

-

>Chr3_LTR-Cassandra_93

CCGAATGCCATTTTAGTGAGCCTCCACATCTTCTCTTGATCCGTGGATTTATAATTTTCGGACAGTCGATTTGTTAGTTTTGAAAAGTTTAAAAATTTGTTTACTTACCCTACAAATTACCACGTGATATATTTGTGTGTTTTGTCCTAACTTACATAATACTAACAATTAATTTCCAAAAATCATATATCAAAAATTGTTCTAGCACAAGCACACTTAACTATGGAAGTTTTTT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_94

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

354

Start:

11851925  

End:

11852278

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_94

TGTACCATCCCGGTTTCAGAAATACGGTGATGTATGTGGAGAGGTTTAAAAGAATTGATTTGGCCACATTTCACCAAAGTGCACTTTTCTTTTTGGTTAAACGTCGTTAGAAAACTCCACAGTTAAACGTGTTTGGGCACCAATAATTTCAGAATGGGTGTGCTTCTGGAATGTAATTGTCGGAACCATGTGAGTGAGGACAAAGCATAGGGAAAGATCATGTGGTAGTTTGTAGGATCGGTAAACAAGTTTTCCAAGCCTCCTGGACATAGCAGACTGACCGTCGGACAAGGGTGGGCTCACATGCCCGAGAGAGAACGAGGGCACATTAGTAAGGACGGTCGGGATGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_95

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

110

Start:

11852279  

End:

11852388

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_95

AGTGGTATCAGAGCTAAACTAAGACAAGTATGGGATCAAGAGGGCTCACACTGTCGGGGTGACAATCTTGGTGTGCAATGAGGATGTTGCGTTTGGTTAGTGGGATGAAT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_96

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

352

Start:

11852389  

End:

11852740

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_96

TGTAACACCACAGTCTCAGAAATATGGTACCGCACGCATATATATTTAAAAGAATTGATTTACCTACTTGTATTACCAAACTGCTCTTATCATTTTGGCTAAACGCGCTGAAAGAAATCCATTGTTAAAGGTGCTTGGGCTGGAGTAATTTTAGGATGTGTGACCTTCCGACAAGTGATTGTCGGAACCATGCGAGTGAGGACAAAGCATGGAGAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGAGTCGGTAAACAAATATTAAAGTCTGCTGGACGTAGCAGACCGACCATCGGGCAAGGATGGACAGAGTGTCCAAAAGAGGACCTGGGACCCTAGTAAGGACTGTCGGGCGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_97

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

312

Start:

11931319  

End:

11931630

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_97

TGTAACACCCTGCTTTCAAGAATATGGTGGTGCATGCGGAGAGGTTTCAAAGAATGATTTGGACACTTATGTTATCAAAGTGCACTTATCATTTTGGTCAAACATCTTGGGATGGGTGACCTTCCGAGAAGTGATTGTTGGAACCATGTAAGTGAGGACAAAACATGAAAAAAGAACATGTGGTGATTTGTAGGGTCGGTTAAAAGTCTTTAAAGCCTCCTCGACATGGTGTACCGACCGTCGGACAGGGGTGGGCCCATGGGCCCAGAAAAGAAGTTGGGGCCCACTGATAGGGGCGACCGATGCGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_98

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

111

Start:

11931631  

End:

11931741

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_98

AGTGGTTTAGAGTCGAACCTAGATGAGTGTGGAGTCAAGAAAGATCACACCATCGGTGGTGATGGTCTTGGTGCGCAACGAGGACGTTACGAGCAGTTAGTGGGGGTGAAT

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_99

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

353

Start:

11931742  

End:

11932094

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_99

TGTAACACCATGGTTTCAAGAATATGGTGATGCATGTAGAGAGATTTAAAATAATTGATTTGGACACCTATGTCACCTAAGTGCACTTATCTTTTTGGTCAAATGTCCTGAGAGAACTACACAGTTAAGCGTGCTTGAGCTCAAAATGTCTCAGGATGTGTGACCTTCCGGAAAGTGATTGTCGGACCATGTGATTGAGGACAAAACATGGAGAAAGATAATGTGGTGATTTGTAGGATCGGTAACAAGTCTTTAAAATCTCCCTGACGTAGCGTACTGACCGTCGGACAGGTGGGCCCATAGGCCCGAGAGAGGACATGGAGTCGACTAATGGGGGCGGTCGGAGTGTTACA

Arabidopsis thaliana (TAIR 10)

ID:

Chr3_LTR-Cassandra_100

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

352

Start:

12734330  

End:

12734681

Strand:

+

>Chr3_LTR-Cassandra_100

TATAGTACCCCAGTTTCAGGAATATGCTGGCGCATGCAGAGAGGTTTAAAATAATTGATTTGGCCACCTATGTCACAAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCAAAAGTCCTGAGAGAACTCCAAAGTTAAGTGTGCTTGGGTTAGAGTAGTTTCAAGATGAGTGACCTACCCGGAAGTGATTGTCGGAACCATGCGAGTAAGGGTAAAGCATGGGAAAAGATCATGTGGTGATTTGTAGGGCCGGTAACAAGTCTTTAAAGCTTCCCGGACGTGGTGTACTGATTGTCGAACATGGGTGGGCTCATGGGCCCGAGAGAGGACGTGAAGCCCACTGGTAGGGGCGATTGGAGCGT