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AA_scaffold5296_LTR-Cassandra_61

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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267

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155599  

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155865

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-

>AA_scaffold5296_LTR-Cassandra_61

CCGTGAGCCCATTTACGGCCGGTGCGCTATGAGAAGTTTCAATGTCTTGATGAGTGATCTTATAGACCACCACGAAAGCTTAACACGTGTTCTTGTTCTCACTCACACGATACTGAAAAATTACTTCCCATAAAGTTACTGATACCGAAATTACTACACCTTAAGCACGCTTAACTGTGGAAATTCTAACAAGAGGTGTGACCAAAAATCTAAGTGAACTTAGCCTTAACACTTTTTTTAAGTTTTTTCGTTATGCATCACTATCTT

ID:

AA_scaffold5370_LTR-Cassandra_62

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

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147

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87918  

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88064

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-

>AA_scaffold5370_LTR-Cassandra_62

CTCAAACTCGTTTAGTTTTAGAATTTTGACAAGATGTGTGATTGAAAAACTAAGTGCACTTCAGAAATATATATAATCTAATCAATTTTTGTAAGTTTTCTTTGCCATACATTACAAATTTCATTTTCATGAACTCGGGATGTTACA

ID:

AA_scaffold5413_LTR-Cassandra_63

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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323

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37402  

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37724

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+

>AA_scaffold5413_LTR-Cassandra_63

TGTAACACCCCGTTTACAGGAGATGGTATTGGTGGTACATTGCGAGAAAGTTTAAGAGAATTGATTAGGCTATCTATATCACCAAAGTACACTTAAATTTTTGGTCACATATACTATCAAAACTCCATAGTTAAGTGTGCTTAAAGTGGAATAGTATCGTGTAAGTGAAAACAAAACACGTATTAAGCTCTTGTGGTGGTTTGTAGGGTCAGTTGTCAACTCTTTAAGCTTCTCGAACTAATGTACCGACCATCGGCCAAGGTGGGTCCGGTGAGTCGTGGACCGGGTGATGGGCCCATGGTAGGGGCGGTGGGAGCGTTATA

ID:

AA_scaffold5442_LTR-Cassandra_64

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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210

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56987  

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57196

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-

>AA_scaffold5442_LTR-Cassandra_64

TATAACACCTCGACCGTCCTGTCATGGGCCCACCTCTTTTGGCCCATTTAAGGCCCACTTAGGCCGCCTTTTTGACAGCGGTGCAGTACTCCGAAAAACTTGAAAGATTTGATGACTGACCCTACAAACCATTACAAGAGTTACCACGTGTTTTGTCTTAGACTCTCACGATACTGAAAAATGACTTTCCAATAAATCATCATCGTGAAA

ID:

AA_scaffold5471_LTR-Cassandra_65

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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258

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45568  

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45825

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-

>AA_scaffold5471_LTR-Cassandra_65

TAGATCCACTTTGTCTGACGGTCGGTGCGTTATTTCTAGAAGTTTGAAAGACTTGACGATTGAACTATAGATCAAGTCGAGAGTTTAACACGTGTTTTGTGTTCACTCACACGATATAGGAAAATGACTTCCCAGTAGATCAGCTATCTTGAAACTATGGCATATCAATCATATGTGTTATCGAAAAGCTAAGTGCACTTAAGTGATATGAATATCCTAAGCAATTTTTTAAGTTTTCTTGTCATGCACCATCATCTT

ID:

AA_scaffold5519_LTR-Cassandra_66

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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364

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16928  

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17291

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-

>AA_scaffold5519_LTR-Cassandra_66

TATAACGTCCTGATCGTCTCTACCATGGGTCCATCTCTCGTCTCATTTAAGGTCCATTGGGCCTATCTTGTCAGTGCGCTATTTCGAAAAGTTTGAAAGATTTGACGACTAACTATACATGCCACCACGAAAGCTTAACATGTGTTTTGTGCTTATTCATCCGATACTAAAAAATAACTTCCTAGTAGGTCACACATCCTGGAATTACTACCGTTTCATACATGCTTAACTATGGAATTCTGACATGATGTATGACCGAAAAATTAAATGCATTTTGGTGATATAGATAGCCTAATCATTTCTTTTAAACTCTCTCGCTATGCACCCTATGTTTAGGACCGTCTTCCTAAACATGGGTGTTACA

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AA_scaffold5519_LTR-Cassandra_67

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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275

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81624

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+

>AA_scaffold5519_LTR-Cassandra_67

TGTAACACCTTGTGTTCAAGATGGTGGTAGTGCATGAAAAAAAAAGCTTAAAGACATGATTAAACTAACTATATCACCATAGATGCATCTAATTTTTTGGTCATACCTCCCACCAAACCTCCACAGTTAAGTGTGTTTAAGATACTGGAAAGTCCCTAGCTTTCCAATGTGAATGAGGACAAAACAGTGTTAAACTCTCGTAGTGATACATACGTGCAGACATTAAATTTTTCAAGCTTTTCATAATGCGCTAACTGTCGGACAAGATGGATCTA

ID:

AA_scaffold5540_LTR-Cassandra_68

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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24311

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+

>AA_scaffold5540_LTR-Cassandra_68

TCAGAAAAATGGTGGTGCATGGTGATAAAACTTAAAAAAAATGATTAGGTTATATAAATTACCAAAGTGGACTTGGTTTTTCGGTCACACATTCTATCAAAACTCCGTAGTTAAGCGTGTTCGGATGTAAAATTTTTACGATGGATAACCTACTGGAAAATCATTTTTCAATATCATGTGAATAAAAACAAAACACATATTAAACTCTCGTGCTGGTCTGTAGAAATGGTCGTTAAGTCTTTCTAATTTCTTCGAGTAGTGCCCTGAC

ID:

AA_scaffold5666_LTR-Cassandra_69

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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156

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108650  

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108805

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-

>AA_scaffold5666_LTR-Cassandra_69

CTTGAAACTCCTGCATCTCAAGCATGCTTAACTATGGAATTCTAACAAAATCGGTGACCGAAAAGCTCAATGTACTTTAGTGATATAGGTAGTCTAATCTGTTCTTTTAAGTTTTCTCATCATGCACCATTATCTTCCTAACTCAGGGGTGTAACA

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AA_scaffold5762_LTR-Cassandra_70

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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6186

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+

>AA_scaffold5762_LTR-Cassandra_70

TGTAGCATCCTGAGTTCAAGAAAATGATGGTGCATAACGAGAAAATTTACAAGAATTGATTAGACTATTTATATCACCAAAATACACTTA

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AA_scaffold578_LTR-Cassandra_71

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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-

>AA_scaffold578_LTR-Cassandra_71

AACGCCCCAACCGCCCTGCGGTGAGGCCACCTCTCCTAGCCCATTTAAGGTCTATTGGGTCTAATCCTATCCAACGGTCAGTACGTTATTCCAAGAAACTTGAAAAGCTTGACAATTGATCATAAATACCACCACAAGAACTTAACACAATACTGGAAAAATGACTATAATAGGTTACCTATCCTGAAATTTCGATACATCAAGCATGCTTAACCATGGAGTTCTAACAAGATGTGTGACCGAAAAGTAAATGCACTTTAGTGATATAGATAACTTAATTAATTCTTTTAAGCTTTCTTATCATACACCATCCTCTCCTTGAACATGAGGGGTTACA

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AA_scaffold5785_LTR-Cassandra_72

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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-

>AA_scaffold5785_LTR-Cassandra_72

TTATCCTCACTCGTGTGATATTCTAAACCACTTCCATGTATATCATCCATCGTAAAATTGTTTCAACTCAATCATGCTTAATTATGAAGTTTTTTCAGAGTAGTTACCAAAATATTAAATGCACATAAATGATATAGATAGCCGAATCAATTTTTTAAAAGTTTTTCAATATGTACCACCATTTTCTAAAATTTGAGATATTATA

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AA_scaffold580_LTR-Cassandra_73

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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-

>AA_scaffold580_LTR-Cassandra_73

AGATCACTCAGCTTAAAATTCTTGCACCTCAAACAGGTGTAACTACTGACTTTGATAGGAAGTGTGACCTAGAAAGTAAGTGAACTTTGGTGATATAGGTAGACTAATCAATTCTTGTAAGCTTTCTTGCCATTCACCAACATTTTTCTGAACTCGAGGTGTTACA

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AA_scaffold5810_LTR-Cassandra_74

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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>AA_scaffold5810_LTR-Cassandra_74

GCTACATATATCACCGAAGTACATTTAACGTTTTGGGCACACATCACGCCATAACTCTACAGTTAGACGTGTTTTATGTGTAGTAATTTTAAGATAGGTGACCTACTCAGATATTATTTTATATTATCATGTGATTGATAATAAAACACATGTTAAACTCTTGAAGTGGTTTATAAGATCAATCGTAAAATCCTTCAACCTATTCAGAATAACGCACCGACTATTGAACATGGTTG

ID:

AA_scaffold6059_LTR-Cassandra_75

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Retrotransposons

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LTR

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ATAGTAGTGCATAGCGAAAAAACTTAAAAAGACTTGATTAAACTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTAACTTTTCGGTCACACATTCTG

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AA_scaffold6059_LTR-Cassandra_76

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Cassandra

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GTGGTGGTCTAGTAGCATCATTTGTCAAGTCTTTCAAGGCTTCTCAGAGTAGTGCATCTACCCTTGGAAAAAGTGGGGCCAATGGGACTTAAATGGGCCAAGAGAGATGGATTCATCGCAGGAGCGGTTAGAGCATTATA

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AA_scaffold6148_LTR-Cassandra_77

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Retrotransposons

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TGTAACATCCCAAATTCAGAAAGACCGTGGTGGGTGGCAAAAAAGTTTAAAAGAAATGATTAGGTTATTTAAGTGTATTTTGCTTTTCGGTTACACATTTTGTTAGAATTTGCAATAATTTCAGGATTAGTGATTCTATTGGGAAGTCCTAATATCTTGCTAGTGAAGACAAAACACGTGTTAAATTCTCGAGATGGTTTGCAGGATCAATCATCAAACTTTTCAAGCTTCCCGGAC

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AA_scaffold6151_LTR-Cassandra_78

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Retrotransposons

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GTGGTGAATGATGTGAAAACTTAAAAAGAATTGATTAGGCTATATCTATATCACTTTTGTGCAATTAGTTTTTCGGTCACACATTTTTGTCAAAACTCCACAGTTAAGTGTGCTTGAGTTGTAGTAGTTTCAGGATGGGTAAGCTATTGGTACGTCATCTTTCAATATGTGTGATTGAGAACAAAATACGTGTTAAGCTTGTGGTGATT

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AA_scaffold6330_LTR-Cassandra_79

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Retrotransposons

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AAGATAATTGATTAAGTTACCTATATCACCAAAGTGTACTTAGTTTTTCAGCTACATATCCTCTTAAACTCAACAGTTAAATATGCTTAAAATTGATTAGTTTCAGGATGGGTGGCCTACCAAGAAGTCAATTTTAGTATCGTGTGAGTGAAGATAAATAACATGTTAAGCTCTCGTGATGTTCTCTAGGGTGAGTCGTTAAATATTTCAAGCTTTTCAGATTAGCGCACTGATCGTGGGATAAGGTGGGTCAAATGGGTTGTAGACGGGCCAAAAGAGAGGTGGGTCCATGGTAGGGGTTGTCAGAGCGTTACA

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AA_scaffold6330_LTR-Cassandra_80

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Retrotransposons

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LTR

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>AA_scaffold6330_LTR-Cassandra_80

TTAAAAGAATAATCGGGTCTAGCTACCTACATCACCAAAGTGCACGTAGCTTTTCGGTCGTACACCATGTTATAAATTCATAATTAAGTGTGTTCAAGATGAATTAGTTTCATGATGGATGATCTACTAGGAAGCCATTTTCGAATATGTGTGATTCAGGACAAAACATATATTAACCTTATGTGGTGGTTTGTAGGATCAGACGTCAAATCTTTCAAACTTCTCGGACTAGTGCACTGACTTTCGAACAAGGAGGTCCCAATGAATCATAGATGGGGCATAAGAGAGGTGGAACCATGGTAAGGGCGGTCGAAACGTTATA