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Aa.chr2_LTR-Cassandra_82 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33453376835338016-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_83 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33259458185946149-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_84 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35561230256123379-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_85 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9861234236123520-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_86 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35361235436123895-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_87 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra18969496216949809+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_88 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra35470504187050771-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_89 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9870508157050912-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_90 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra37970509157051293-
Aa.chr2_LTR-Cassandra_91 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra30675176137517918+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_92 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9875179237518020+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_93 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33975180567518394+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_94 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra30675205797520884+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_95 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9675208897520984+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_96 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra10075210187521117+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_97 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31575211537521467+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_98 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra13475214857521618+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_99 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra19475298507530043+
Aa.chr2_LTR-Cassandra_100 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra9875300467530143+

< 5 6 7 8 9 > Total 46


Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

330

Start:

5110483  

End:

5110812

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_81

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

334

Start:

5337683  

End:

5338016

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_82

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_83

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

332

Start:

5945818  

End:

5946149

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_83

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

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6123379

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_84

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

98

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6123423  

End:

6123520

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_85

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_86

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

353

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Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_86

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_87

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Cassandra

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Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_87

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

354

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7050771

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_88

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

98

Start:

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7050912

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_89

TCACCCTCTCTCACAACGCGCAACATCCTCGTTGCGTACCAAGATCGTTATCTTGACAGTGCTATTCCCACACTCGTCAAGGTTCGGCTCTTATACCA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

379

Start:

7050915  

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7051293

Strand:

-

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_90

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

306

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7517918

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_91

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

98

Start:

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7518020

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_92

TGGTATCAGAGACGAACCTTAACTAGTGTGAGTATAACACTGTTAGGGTGACGATTTTGGTACGCAATGAGAACGTTGCGCGCTGTGAGAGGGGGTGA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

339

Start:

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7518394

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_93

TTTCAGAGAATATGTGGTGCATGCGAAGACTTAAAAAAATTAATTTTGGCTATCTATATCACCAAAGTGCAGCTAACTTTTTAGTCACACATCATGATAGTACTCCACAGTTTAGCATGCTTGAGATGGAGCAATTTCATGATGGGTGACTAACTGGAAAGTAATTTCCAGTACCGTGCGAGTGAGGTCAAACTACACAGAAAGAATGCATGGTGATTTTAGAGTAAGTAAACATGCATTTCGACTCTCCCGGACTAATGCACCGACCGTTAGAGAAGTTTCGGCCTGCGGGCCACGAGTGGGATTAGGGTCCACATGCAGGCCGGTCGGGGTGTTATA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_94

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

306

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Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_94

TTTCAGAGAAAATGTGGTGCATGTGGAGAGACTCAAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCGGTCACACATCATGATAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGAGCTGGACCAATTTCATGATGGGTGTTTCCTGTACCGTACGAGTCAGGTCAAAACACAGGGAAAGATAATGTGAACATACATTTCGAGTCTCCCGGTCTAACGCAACGAACGTCAGAGAAGTCTCGGCCCGTGGGCCACGAGTGGGATTGGGGTCCAAATGAAGAGCGGTCGGGGTGTTATA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_95

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

96

Start:

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7520984

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_95

GTACCAGAGACGAACCTTGAATAGTGTGGGTATAACACTGCTGGGGTAACGATCTTGGTACGCAACGAGGACGTTGCGCGTTGTGAAAGTGGGTGA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_96

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

100

Start:

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7521117

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_96

AATGGTATCAGAGACGAACCTTGACTAGTGTGGGTATAACACTATTAGGGTGACGATCTTGGTACGCAACGAGAACGTTGCCCGCTGTGCGAGGGGGTGA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_97

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

315

Start:

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Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_97

TTTCAGAGAATAGGTGGTGCATGCAGAGAGACTTTAAAGAATTGATTTGGCTACCTATGTCACCAAAATGCACTTATCTTTTCGATCACACATCATGATAGAACTCACGAGTTAAGCGTGCTTTGCTGTAGCAATTTCATGATGGGTGACCGAGTGGGAAGTAATTTCTTGTACCATGCGAGTGAGGTCAAAACACAGGGAAAGAATGCGTGGTCGTTGCAGAGTCTGTAAACATGCATTTCGAGTCTCCCGGCCTAACACAACCACCGTCAGAGAAGTCTCGGCCCGTGGGCCGAGAGTGGACTTGGAGCCCAC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_98

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

134

Start:

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7521618

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_98

GAATATGTGGTGCATGTAGAGAGATTTAAAAAAATTGATTTGGCTACCCATGTCACCAAAATGCACTTATCTTTTCGGTCACACATCAGGAGAAATAAATTTGCTTGAGCTGCAGCAATTTAATGATGGGTGAC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_99

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

194

Start:

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7530043

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_99

GTGACCTAGTGGGAAGTAACTTCCAAGACCGTGCGAGTGAGGCCAAAACACAGGGAAAGATCGCGTGGTGATTGCAGGGTCAGTAAACATGCATTTCGAGTCTTCCTGACTAACGCACCGACCGTTACAAAAGTCTCGGCCAGCGGGCCAAATGAGGGATTGGGGTCCACATGCAGGGCGGTCGAGGCGTTATA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr2_LTR-Cassandra_100

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

98

Start:

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End:

7530143

Strand:

+

>Aa.chr2_LTR-Cassandra_100

TGGTATTAGAGACGAACCTTGACTAGTATGGGTATAACACTGCTAGGGTGACAATCTTGGTACGCAACGAGGATGTTGCGCGCTGTAAGAGGGGGTGA