ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Thla_scaffold235_LTR-Caulimovirus_61 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3187827978596+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_62 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2998104716107713+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_63 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus170107925108094+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_64 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2342108146110487+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_65 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus474112304112777+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_66 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2624117858120481+
Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_67 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3240120598123837+
Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_68 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2966444198447163-
Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_69 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2012447413449424-
Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_70 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1298449416450713-
Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_71 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus147298486298632+
Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_72 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2871298644301514+
Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_73 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3779314305318083-
Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_74 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1401318189319589-
Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_75 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1521319626321146-
Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_76 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1548321180322727+
Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_77 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3098312501315598+
Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_78 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus521315715316235+
Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_79 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1256340863342118+
Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_80 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus585364699365283+

< 4 5 6 7 8 > Total 12


Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold235_LTR-Caulimovirus_61

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

318

Start:

78279  

End:

78596

Strand:

+

>Thla_scaffold235_LTR-Caulimovirus_61

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_62

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2998

Start:

104716  

End:

107713

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_62

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_63

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

170

Start:

107925  

End:

108094

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_63

AATATTTATTAAAATTAAAGGATATAGTACATAAAGAAAATAAACTATATAGTCCAGAACCATTTAGCCTTAATAAAATACTTGAAAAATACCCTTCTCCAACATTATTTAAACAAGTAACTACTGCAGAACTAAAAGGAGAAGTTAAAAATTTAAAAACTCAAGTAAAA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_64

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2342

Start:

108146  

End:

110487

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_64

TAGAAAATGAATTACTAGATCAAGTATGTTCTGACCTCCCAAATGCATTTTGGCAAAGAGAAAAACATATTGTTGAAATTCCCTATGAAAAAGATTTCAATGAAAACAATATACCAACTAAAGCTAGACCAATTCAAATGAATCAAGAACTTTTAGAATATTGTAAAAAGGAAATACAGGAACTATTAGACAAAAAATTAATACGAAAATCTAAGTCATCATGGAGTTGTTCTGCTTTATATGTCAACAATCAAGCAGAAAAAAAAAGAGGAGTACCTCACCTAGTAATTAAATATAAACCTTCAAACAATGTTTTACAATGGATAAGATACCCTATACCAAATAAAAGAGATTTATTAAAAAGATTATATGATGCTTGTATCTTTTCAAAATTTGATATGAAAAGTGGATTTTGGCAAATAAAAATAGCCGAAAAAGATAAATATGAAACTGCATTTACTGTACCTTTTGGGCACTATGAATGGAATATTATGCCATTCGGTTTAAAAAATGCACCCTCAGAATATCAAAATATTATGAATGAAATATTTAACCTTTACTCTACTTTTTCAATAGTATACATAGATGATGTTTTAATATTTTCAAAATCTATTGATCAACATTTTAAACATTTATATACTTTTTTAAGTATTGTTAAAAAACATGGACTAGTAGTATCAACAAAAAAGATGCAAATCTTTCAAACAAAGATAAGATTTTTAGGACATAATATATATCAAGGAACTATGACACCTATATTCAGGTCTATAGAATTTACAAATAAATTTCCTGATGAAATAAAAGAAAAAACTCAACTACAACGATTTCTAGGATGTTTAAACTACATATCAGATTTTTTACCTAATATACGAAAACTTATTCAACCATTGTTTCAGAGATTGCAGAAGAATCCAGTCCCATGGTCTAGTTTGTATACTAGTATAGTCCAAGATATTAAAAAGAAAGTTGTATCCTTACCATGCTTAGTCATTCCACATCCAAGTGCATTTATGATAGTAGAAACCGATGCATCAGAAATAGGTTATGAGAGAATCCTTAAACAAAAAATGCAAGAGTCAACCCATGAGTCAATAGTTCGGTTTCATTCTGGAGTATGGCTTGGCCCCCAAAAGAATTATTCTACAGTTAAAAAAGAAGTTTTATCTATAGTAAACTGTATTTCTAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAATTTTTTTATTATGTGTTGATTGCAAATCTGCAAAAGAGATTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTAGTTTCTAAACAAATTTTTGCAAGATGGCAAGCTATTTTATCTGTCTTTGATTTTGATATACATTATATAAAAGGTAAAAATAATTGTTTACCCGATTTTCTAACAAGAGAGTATTTACAGAGAAAATCTCAAGACCTCCAAAATGAGTGAACAAAAAAGGCTCATGTCTGCAGCAGACTACATCAAGAATCAACCACATCTACAAGGGAAACAAATCACCACCAGTAATCAATTCTCTGCATTGGCAGAATTTCCACCTCTGTCTTATGCAAAAGCCGTCAACCCATTACCTCAAAAAACAGCCACCCCTTCCTCTCCATAAAAAACTACTAACCAAAAATCCTCATATGTCCTTAAACAACACCGCCAACATCTCACAACTACATCATTCACCAAACCAATATCACTAAAAGACCTTACCCACTTTACCAACCGTATATTTTACGAGGATAGCCAATACCTCACCGACAACCTTACAAAAAACCGAACCTTTTAGGAATTTATCCTTGTCGATACCAAGTCAGTTGAAATAACCCACCATACAGATAAAACCAACCCTGACCTTATATCCTATTCCACATGTAAAATCCTCAGGATATGCAATCCTCAAGACTTTGGACTCTTTAACTTCCATACCAGAAAAGACTTTTCTATTCCCGGGTACCATATTTTAGGGTTTACTTACGTAGATTACCAAAAAGCCTTCCTTCATATCATTTACCTAGATACCTATGATCATTCCTGGTTTATCTCTTTTGACTTTCACTGTCCCAAATCAATACCCGGATGGTTCTATGAATGGTGGCACTGGATTGGACCATGTGACCAAATTTATCCTCCACAACTACTCAAAGTATCCATACCCTACTACACTAAACACGAAAAACATGAACCCATTGGACCTTTACCCAAAATATCCTTCCACGTTGACATGGGAGTACATTGGATCTTATCATGGCACTTTAACCTCATACCTTTTCTACCTGACATGCCGTACTCTTTGGTCTGGGAATACCGAGTCAAATGGTGGGACAAATACAACTTGGATCGGTGTTCTGTCACCAA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_65

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

474

Start:

112304  

End:

112777

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_65

AGGTGTTCCAGGCAGTAAGTCCTAGTGGCAGTGAGACCGTTGGCAAGCCACATAGACGTCCGTCCTTGATAAGTCTGGGTTATTTTGCATGTTGTCTCGAGTCTAAGTAAAGTTTAAAGCATGGCATCTTCTGTTAGAAAGTGGCTTAAGTCTAGACATGCATCTTCTTCTGCATCTCAAAAAACAATTAACTCAATAGAAATAATGTCAAAAATTACCTCTTTTAATAAGAAATATCTCATGATCAATTACCTCATGTTAATCCAGAAAATATATATCAAATAGGAGCTTTTGATTTTAAAACAGCATATTCAATTAAAGAACATGAACAAACTATATCATTACAAAATGAATTTGAAGAGATTAAATTACTTTCTTCTATGGCCTTAGAAAGTTATAGGCAAAAGAAATTTAATTGTATTCATTTTGGATTAATATAAATAGCAATAAAACCACTATCTAGAACTGGGATTG

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_66

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2624

Start:

117858  

End:

120481

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_66

ATTGATTCTCCTATACTTATGCTATTAAGAGATAAAATTCTATTAAAATTTGAAGACTCCTTATTAGGAGATGTACAATCAAATTTATGTAATGGAGCTGTATATTTTAATTGTGCTCCAAACTTTCAAGTAAATTTATATGATCTTACTATATTTGATACATTAGTATTAAACGTACACTTACCAGAAATTAAATTTCAACAAGAGAGACATGGCTATTTATTGCTATACCGAATTTATTTCAAGCAATCTACATCTGAATTTAATCTAAGATGTTTATTGCAAGATAGTAAAGGTGAAACAACAATATTAGCAGTACATAGTAAAGATACTCCAACATCTACCTATACTCCTAAGCAACTAAAATGGACAGAAATAACAATTCCTGACCAATGGAAGATTGATATTACTCAACCACCAAGAAACTTCTAACAAAAAACTATTACTAGTATAACTGAACAAACTGATGAAAAAATACTATTAAAATTTGGATCTTTTAGAGAACCACTCTCACTAAGAATCAACTCATTTTATCCTAGATCCTCCTTTTCTGATTATAGAACTGGTAGAACTAGTACAGAATCAGAAGAAAGTGTAGAATAAATTTTAACTCAAAATAAAAAAAAAGACCTATTAATTTTCAAGCACCTATAGCAAAACCAGTTCAGGATTCTGAAGTAAGATCTAGTTTTCCTACTTCTCCAACACCCTCTGATTTCAAATTTATAAATGTTATCTCAAATAAATTTGAAATAAATAAACAATACCTTAAAGAAGAATTTTTATCTAATCAGAATACAATTAAAAGACAATGGTAATTTAAAACATTTACCAAAGAAACAACTATTGAGTATCGGGAAATATGGTATAATCATATGAAATTTATGGAAACTAATATTTCATTTTTCACATGGTTTGAAACATATTCTTTAGAAAATAAAATTTACTACCCTTATAAAAGTGAATCAATTAACAGTAGCTCAACTTTGTATAATACTTGGGAAATGACTAATGGGGAAAAACTTAAATCAGTTCATCCACCTTTAAAGGATTTAAAACTTCATACACCCCAAAGACAAGTAGTAGCTACATCATTTAGAACTGAAGAAAATAGAGATGATAGAGACACAATAAGTATGGCCGATATTAAAATAGTTTATGAACAAAATAATTACCATAGTCAAATACTTCACACCATTTCAAGACAAATAGACCATATAGATAACAAATTAGAAAATGATGAAAATAAATTAATCATGGGTTTCTAACCATTTTCTTATCCATTTAACTCTATATCACCACCTCTATTCAAACCTTTAACAAAACCAGTGCAACTTCCAGAAAATGAAATTTTAAAATCTATTTCAAGTAGACTAGATCGACTAGATAAAAATAAAGGAATTAATAACATTGATGAAAATAGTCAAACTGATACTGAAGAAGAAGTAGAAATTAATCGTATAAAAAGAAAATTTCAACCATCCACAAAACCATATTACCCTAGACACTCTCCACCTGACATTTTATTTGAAGAACATCATAAATTCCATACTGCAAATTTTTATACTGGAGAAGGTATATATGAATGGAATATAGACGGCAGATCAGAATATGAAATGATGAATTTATTTCAAGAAATGGGAATTGCTGGTTTGGCATATAAAGCCAAAGGTTTATCAGACAAACAAGCATGTGTCCTTTTAGTTTCAGGATTTAATGGGGCATTAAAATATTGGTGGGATAATGCTTTAGATACTATAGCTCAAGATAATATAATAAATCATACGGAAACTAGAAGAGTAGAAGGTGAAGATGGATTATATGAAGAAGAACAAATTCAAAATGCTATCGAAGTACTACTACATGCTATGACTATGCACTTTGTAGGAAATCCCTCAAAAGAATTAACTAGTAAAAATTGGCCCTAACAAACCTTAGATGTCCAACTTTAAGAGACTTTAAGTAGTATAAAGATATTTTTATAACTAATATATTTCAAAGAAATCATTGTAATCAACCTTTCTAGAAAGAAAGGTTTATAGCAGGATTACCTTCTTTCTTTGCAGAAAGATTAATAAGTAAATTAAAAAAATTTTCAAGAGGACAACCAATACCATGGGATTCAATAATTATGATCAATTGTTTGCCTTCGTTAAAAAAGAAGGATTACAAATTTGTCAAGAACATAAAGATAAACAACAAACCAATAAATTTAAATTTGGAGAAACTATGGGTTCATTCTGTGAACAATATGGTTACCACCGTCTTACCCCACCATCTAGAGAAAGACGCAAAATTTACAAACAAAGTAGATTTTCACATCCACGTCCATATCGTAAAAACAAAAAGTTTTCCAAAACAATTTCTAACCCTTATTATACAAAAAACAGAATACCAAAAAATCCAACTAAGAAGGAAAAGATTATATGCTGAAACTGTAAAAGACCAGGACATAAATCAACCGAATGCAAAATAAAAAAGTAAATTAATGAAATTTTCCACGATAACCAAGACATTAGAGGAAAATTATAAAAACTACTTCTTTCAGAAACAGAAGATATAGAAAAATTTAGTAGTGAACCATCCTTAGATATTATAGAAGATCAAAGCGAATCATCATCTGA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_67

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3240

Start:

120598  

End:

123837

Strand:

+

>Thla_scaffold249_LTR-Caulimovirus_67

AATATTTATTAAAATTAAAGGATATAGTACATAAAGAAAATAAACTATATAGTCCAGAACCATTTAGCCTTAATAAAATACTTGAAAAATACCCTTCTCCAACATTATTTAAACAAGTAACTACTGGAGAAATACAAGGAGAAGTTAAAAATTTAAAAACTCAAGTAAAAGAACTACAACATATAGTTCATCAACAACAATTAGAACAATTGCAGATGAATGCTCGTTTAACCTTGATTGAACCAAAAATTCACCAATCGATATCCACCATACCCGATCACGTATCTACTAGTAACAGTCAAAACAAAGAACAAATTAAAGCTGAAGAAGAATATATTCAAATAATAAACAAAATAAACTATCAAAAATGGTATACAAAAATTACATTGCACATAGGATACGATTATAAACTAGATATAATTGCACTACTCGATACATGAGCAGATTATAACTGCATTAAAGAAGGAATAGTCCCAACTATGTACTATGAAAAAACATGTGAAAAACTTAGTAGTGCAAACGGAAGTAGTTTGAACGTTAATTATAAACTCCCAAAAGCAAAAATCTGTAATAAAAACTATTGTTTTAAAACACAATTTATCCTTGTTAAAAATTTAAGTCAAGAATTTATATTAGGAACACCCTTTTTTACACAAATCTATCCTTTTAAAGTTACACAATCGGGAATAACCACCAAAATTGTAGTTGAAAAGATAGTATTTAAAATTTTATCTCCCATGAAAACTAAAGAAATCTTAGCTTTACAAAACTCTACAATAGAAAAATCTATAAACCTAATAAATGGAAAACAAAAACATATTCAATACTTACAACAAGAAATAAAATATAAAAATATTGAACAACAATTACATGACCTATTAATAATAAATAGAGTTAAAAAATTAAAAAATTAAATACTAGATCAAGTATGTTTTGACCTCCCAAATGCATTTTGGCAAAGAGAAAAACATATTGTTGAAATTCCCTATGAAAAAGATTTCAATGAAAAAAATATATCAACTAAAGCTAGACCAATTCAAATGAATCAAGAACTTTTAGAATATTGTAAAAAGGAAATACAGGAACTATTAGACAAAAAATTAATACGAAAATCTAAGTCACCATGAAGTTGTTCTGCTTTCTATGTCAACGATCAAGCAGAAAAAGAAAGAGGAGTACATCGCCTAGTAATTAAATATAAACCTTTAAACAATGTTTTCCAATGGATAAGATATCCTATACCAGATAAAAGAGATTTATTAAAAAGATTATATGATGCTTGTATCTTTTCAAAATTTGATATGAAAAGTGGATTTTGGCAAATACAAATAGCCGAAAAAGATAAATATAAAACTGCATTTACTGTACCTTTTAGGCACTATGAATGGAATGTTATGCCATTCGGTTTAAAAAATACACCCTCGGAATTTCAAAATACTATGAATGAAATATTTAACCCTTACTCTACTTTTTCAATAGTATACATAGATGATGTTTTAATATTTTCAAAATCTATTGATCAACATTTTAAACATTTATATACTTTTTTAAGTATTGTTAAAAAACATGGACTAGTAGTATCAATAAAAAAGATGCAAATATCTCAAACAAAGATAAGATTTTTAGGACATAATATATATCAAGGAACTATGACACCTATATCCAGGTCTATAGAATTTACAAATAAATTTTCTGATGAAATAAAAGAAAAAACTCAACTACAACGATTTCTAGGATGTTTAAACTACATATCAGATTTTTTACCTAATATACGAAAACTTATTCAACCATTGCTTCAGAGATTGCAGAAGAATCCAGTCTCATGGTCTAGTTTGCATACTAGTATAGTCCAAGATATTAAAAAGAAAGTTGTATCCTTACCATGCTTAGTCATTTCACAACCAAGTGCATTTATGATAGTAGAAACCGATGCATCAGAAATAGGTTATGGGGGAATCCTTAAACAAAAAATGCCAGAGTCAACCCATGAGTCAATAGTTCGGTTTCATTCTGGAGTATAGCTTGGCCCCCAAAAGAATTATTCTACATTTAAAAAAGAAGTTTTATCTATAGTAAACTGTATTTCTAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAAAGTTTTTATTACGTGTTGATTGCAAATCTGCAAAAGAGATTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTAGTTTCTAAACAAATTTTTGCAAGATGGCAAGCTATTTTATCTGTCTTTGATTTTGATATACAATATATAAAAGGTAAAAATAATTATTTACCCGATTTTCTAACAAGAGAGTATTTACAGGGAAAATCTCAAGACCTCCAAAATGAGTGAACAAAAAAGGCCCATGTCTGCAGCAGACTACATCAAGAATCAACCACATCTACAAGGGAAACAAATCACCACCAGTAATCAATTCTCTGCATTGGCAGAATTTCCACCTCTGTCTTATGCAAAAGCCGTCAACCCATTACCTCAAAAAACAGCCACCCCTTCCTCTCCACAAAAAACTACTGACCAAAAATCCTCATATGTCCTTAAACAACACCGCCAACACCTCACTACTACATCATTCACCAAACCAATATCACTAAAAGACCTTACCCACTTTACCAACCGTATATTTTATGAGGATAGCCAATACCTCACCGACAACCTTACAAAAAGCCGAACCTTTTATGAATTTATCCTCGTCAATACCAAGTCAGTTGAAATAACCCACCATACAGATAAAGCCAACCCTGACCTTATATCCTATTCCACATGTAAAATCCTCAGGATATGCAATCCTCAAGACCTTGGACTCTTTAACTTCCATACTAGAAAAGACTTTTCTATTCACGGGTACCATATTTCAGGGTTTACTTACGTAGATTACCAAAAAGCTTTTCTTCATATCCTTTACCTACGTACCTATGACCATTCCTGGTTTATCTCTTTTGACTTTCACTGTCCCAAATCAATACCCGGATGGTTCTATGAATGATGGCACTGGTTTGGCCCATGTGACCAAATTTATCCTCCACAACTACTCAAAGTATCTATACCCTACTACACTAAACACGAAAAACATGAACCCATTGGACCTTTACCCAAAATATCTTTCCACATTGACATGGGAATACCTTGGATCATGGCACTTTAACCTCATACCTTTTCTACCTGACATACCGTACTCTTTGGTCCGGGAATACCGAGTCAAATGGTGGGACAAATACAACTTGGATCGGTGTTCTGTCACCAA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_68

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2966

Start:

444198  

End:

447163

Strand:

-

>Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_68

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_69

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2012

Start:

447413  

End:

449424

Strand:

-

>Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_69

AGAAAGTAACCAAGGCTTATGACGATGTTAGGAAGTCTGAAAAACTTAAAGACTTTAGAGACTCATTTAGAGAGAGAAATTAGAGAGAAATTTTTATTGAAATTCTGAGATGATTTGTTACAAGGGGATACACACATATTTATAGGGAGGAAGAGTGCACGCTGACATAAACGCTTACCTCATCCTACATTATTGATGTGCTGACATAAGCGCTTACATCACTACTTATTTATTTCAAACATGCTTATAATCTTACATAATTATACATAATGAAGTATTTAGAGATACTTTATTTAGTGATCCATCTCGAACTCAATGAAATGTTTGGCGCAACAATCGTAGTGATCTCCTGGACATTCGTATTCTTCTTCTGGTTCTTCAAAGTTTTCTTCGGGCTCCGTGTTGACGTCGATGTTGAACATTTTCCCGATTTTATCAATATTCATAGAATCGTCAGGGAGTTGTGCATTTTGGAAATATTCTGGCGGGCACTGTTGAGACGTCTCTTCTAGTTTTGCTATCTCTGGAGAGATCTGCCTTGTGATCTTCGTATTATCCGTCATGCTTTCGTGTTTCATCATGAAGTATTGTAAATCTTAGTCGAGGATCATCTGGTAGTCAGCAGAATAGTAGATCCAGCTTGGGTTGAATGGAATGGGGAATGTCTGCCTGGCTGTGTTGATGCGAAATGCGTGTGTTTGAAAGTCTTCGTAAGGCTTGTTTTCATGGATATTGAAATTTTGGCTGATTTCTCTTCGGTAGTCGTTGTGGTGAATGAGTGTGGGTAGTGCATGAAGTTTGTTGGACATGATGTTGATTTGAACAGGTCGGTGGAAGAAGTATATATTGTGATGGTTGAAGAACGGATTAAGGCATCTCTGACCTCTTAATTGCTTGAATGGCAAGCTTGTTGCTTTTGCTGATTTTCTTAGTTTTTTGTTCCAGATGTTGAAAGATGCAAACCATGTTAGGAAAATCGAGATACAATCCTTCTGACCTTGCTGGGCATTGATGTATTGATATAGCCATCCTATGTCGAATGTGATGCCAATGGTGTAGACCGAGCATATATACCATAGGAAGCACAGAACTTCCTCAGGTATGTTCAAATTTTCGATCCGGTAGAGGTGAACGAAAATTGTCCGGGTGAATCCCCATTGGTGCGATGTAGTGACAGTTGATACCGTACTTTGAGAGGATGATTGACTGATAATGGAAGATCTTATGCTGAAGATGTTCGTGTAGAAAGTTTCTTTTGATTAACTGATGGGTGTCTTCGGGCATGTAGGCTTCCAAGTCGTAATAACGCTTTGTCGAAGTAGATTAGCTCGCCATTAGATGAATCTCCTTTGGTGGGTTTCGGCTAAGCATGTCTGCAAGAGTATTTTTCTTGCCCTTTAAATAGAATGATTCGAAGTCGTATTTTGAAAACCATTCGCTCCATTGTAGTAGCTGCTGGTGTGGGACAATTTTTTGCTTGAATTGTAACATATTTGGGAAAGAGGACATATCCATTTCGATACGAAATTTATGTCCAATCAGATGGAACTCGAACTTCTCGATAGCCTACGTGACCGCTAAGATTTCTTTGAACGTGGAGTGATAATGCATTTCTGCATTTTTTATAACCACAGATTTGACGTTTCCAATTTATCTCTTCAAACAGTATGACTCCCCAATATTTGTCACTCGCATCAGTCTGTAAAATACGTGTCCCCGAGGAGGGAATCTTTAGTGGTGGTAGCTTATGTATCTATATCTATAGCCTTTTGACTGCTTCTGTTTGTTATTTTGCCCATTGTGGTGGATTCTTCGTCAGCATATTTTGGAGTGGTCTTGTCAACTGCGAAAGTTGCAGGATAAAGTCGCTTACATAATTGATTACTCCAAGGAATTGTTGGACTTCTCGCCTTGAGAGATTTTCGTCTGGAAAATCAAGAAGAGCTATATCTAGATGAGACTGAGGTGATATCTGTCCGTTGTTAATCTTCATTCCAAGGAAGTCGATGTCG

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_70

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1298

Start:

449416  

End:

450713

Strand:

-

>Thla_scaffold254_LTR-Caulimovirus_70

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_71

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

147

Start:

298486  

End:

298632

Strand:

+

>Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_71

AAATGAAAAGAGACATGGCTATTTATTGCTATACCAAATTTATTTCAAGCAATCTACATCTGAATTTAATCCAAGATGTTTATTGCAAGATAATAAAGGTGAAACAACAATATTAGCAGTACATAGTAAAGATACTCTAACATGTAC

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_72

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2871

Start:

298644  

End:

301514

Strand:

+

>Thla_scaffold273_LTR-Caulimovirus_72

ATGTACTTACACATAGGATACGATTATAACTAGATATAATAGCACTATTAGATACATGAACAGATTATAACTGTATAAAAGAAGGAATAGTCCCAACCATGTATTATGAAAAAACATGTGAAAAACTTAGTAGTGCAAACGGAAGTAGTTTGAAAGTTAACTACAAACTTCCAAAAGCAAAAATCTGTAATAAAAATTATTGTTTTAAAACACAATTTATCCTTGTTAAAGATTTAAGTCAAGAAGTTATATTCGGAACACCCTTTTTTACACAAATCTATCCTTTTAAATTTACCCAATCATGAATAACCACCAAAATTGTAGGCAAAAAGATAGTATTTGAATTTTTATCTCCCATGAAAACTAAAGAAATCCTAGCTTTACAAAATTCTACAATAGAAAAATCTATATATCTAATAAATGGAAAACAAAATCATATTCAATACTTACAACAAGAAATAAAATATAAAAATATTGAACAATAATTACATGATCCATTAATAATAAATAGAGTTAAAAAAATTAGAAAAGGAATTATTAGATCAAGTATGTTCTGAACTCCCAAATGCATTTTGGCAAAGAGAAAAACATATTGTTGAAATTCCATATGAAAAGGATTTCAATGAAAAAAAAATATACCAACTAAAGCTAGACCAATTCAAATGAATCAAGAACTTTTAGAATATTGTAAAAAAAAAGAAATATAGGAACTATTAGACAAAAACATTAATACGAAAATCTAAGTCACCATGGAGTTGTTCTGCTTTCTATGTCAATAATCAAGCAAAAAAAAGAAAGAGGAGTACCTCGCCTAGTAATTAATTATAAACCTCTAAACAATGTTTTACAGTGGATAAGATACCCTATACCAAATAAAAGAGATTTATTAAAAAGATTATATGATGCCTGTATCTTTTCAAAATTTGATATGAAAAGTGGATTTGGCAAATACAAATAGCTGAAAAGGATAAATATAAAACTGCATTCACTGTACTTTTTGGGCACTATGAATGGAATGTTATGTCATTCGGTTTAAAAAATGCACCATCAAAATTTTAAAATATTATGAACGAAATATTTAACCCTTACTCTACTTTTTCAATAGTATACATAGATGATGTTTTAATATTTTCAAAATCCATTGATCAACATTTTAAACATTTATATACTTTTTTAAGTATTGTTAAAAAAACATGGACTAGTAGTATCAGCAAAAAAGATGCAAATATTTCAAACAAATTAGGACATAATATATATCAAGGAACTATGACACATATATCCAGGTCTATAGAATTTACAAATAAATTCCCTGATGAAACAAAAGAAAAAAACTCAACTACAATGATTTCTAGGATGTTTAAACTATATATCAGATTTTTTACCCAATATAGGAAAACTCATTCAACCATTGTTTCAGAGATTGCAGAAGAATCCAGTCCCATGGTCTAGTTTGCATACTAGTATAGTCCAAGATATTAAGAAAAAAGTCACAACCTTACCATGCTTAGTCATTCCACATCCAAGTGCATTTATGATAGTAGAAACTGATGCATCCGAAATAGGTTACGGGGGAATCCTTAAACAAAAAATGTCGAAGTCAACCCATGAGTCAATAGTTCATTTTCATTCTGGAGTTTGGCTTGGGCCCCAAAAGAACTATTCTACAGTTAAAAAAGAAGTTTTATCTATCGTAAACTGTATTTCTAAATTTCAAGATAATTTAATAAACAAAAAGTTTTTATTACGTGTTGATTGCAAATCTGCAAAAGAGATTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTAGTTTCTAAACAAATTTTTGTAAGATGGCAAGCTATTTTATTTGTCTTTGATTTTGATATACAATATATAAAAGGTAAAAATAATTATTTACTCGATTTTCTAACAAGAAAGTATTTACAGGGAAAATCTCAAGATCTCCAAAATGAGTAAAAAAAAAGGCCAATGTTCGCAGCATACTACATCAAGAATCAACCACATCTACAACATCTACAAGGGAAACAAATCACCACCAGTAATCAATTCTCTGCATTGGCAGAATTCCCATCTCTGTCTTATGCAAAAACCGTCAACCCATTACCTCAAAAAACAGTCACCCCTTCCTCTCCACAAAAAGCTACTGACCAAAAATCCTCATATGTCCTTAAACAACACTGCCAACACCTCACTACTACATCATTCACCAAACCAATATCACTAAAAGACCTTACCCACTTTACCAATTGTATATTTTACGAGGATAGCCAATACCTCACCGACAACCTTACAAAAAACCGAACCTTTTATGAATGTATCCTCGTCGATACCAAGTCAGTTGAAATAAACCATCATACAGATAAAACCAACCCTGACCTTATATCCTATTCCACATGTAAAATCCTCAGGATATGCAATCCTCAAGACGTTGGTCCCTTTAACTTCCATACCAGAAAATACTTTTCTATTCCCGAGTACCATATTTCAGGGTTTACTTACATAGATTACCAAAAAATCTTCTTTCATACCCTTTACCTATGTACCTATGACCATTCCTGGTTTATCTCTTTTGACTTTCACTGTCCCAAATCGATATCCGGATGGTTCTATGAATGGTGGCACTGGTTTGGACCATGTGACCAAATTTACCCTCCACAAATAACCAAGGTATCCATACCCTACTATACTAACCACGAAAAGCATGAACCCATAGGCCCTTTACCAAAAATCTCCTTCCACATTGACATGGGGGTACCTTGGATCATATCATGGCACTTTAACCTCATACCTTTTCTACCTGACATGCCATACTCTTTGGTCCGGGAATACCGCGTCAAATGGTGGGACAAATACAAATTGGACCGCTGTTCTGTCACCAA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_73

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3779

Start:

314305  

End:

318083

Strand:

-

>Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_73

TTCATTATGAAATATTGTAAATCTTCGTCGAGACTCATCTGGTAGTCTGCAGAATAGTAGATCCAGCTTGGGTTGAACGGAATGGGGAATGTCTGCCTGGCATTGTTGAGACCAAAAGCGTGCGTTTGAAAGTCTTCGTAAGGCTTGTTGTCATGGATATTGAAATCGGGCGGATTGCTCTTCGGTAGTCGTTGTGGTGAATGAGTGTGGGTAGTGCATGAAGTTTGTTGGACTTGATGTTGATTTGAACAGGTTGGTGGAAGAAGTATATAGTTTGAGGGTTGAAGAATGGATTAAGGCTTCTTTGACCTCTTAGTTGCTTGAATGGCAAGTTTTTTGCTTTTGCTGATCTTCTTAGTTTTCCGTTCCAGATGTTGAAAGATGCAAACCACATTAGAAATGTCAAGAGACAATTCTTCTGACCTTGCTGGGCATTGATGTATTGATATAGCCAACCTATGTCGAACATGATGCCAATGGTGTAGACTGAGCATATGTACCATAAGAAGCACAGAACTTCTTTAGGCATATTCGAATTTTCGATCCGGTAGAGGTGAGCGAACAGATAGTCTGGGTGAATCCCCATTGGTGCGATATAGTGACAGTTGATACCGTGCTTTGAAAGGATGATTGACTGAAGTTGGAAGATCTTATGTTGAAGATGTTCGTGTAGAGAGTTTCTTTTGATTAACTGATGGGCGTCTTCGGGCATGTTGGATTCTAAGACGTAATAACTCTTTGTAGAAGTAGATGAGCTCGCCATTAGATGAATCTCTTTTGGTGTGTTTCTGCTGAGCATGTCTGCAAGAGTATTTTTCTTGCCCTTTAAATAGAAGGATTCGAAGTTGTATTTTAAAAACTATTCGCTCCATCGTAATAGCTGCTGGTGTGGGACCATTTTTTGCTTGAATTGTAACATCTTTGGGAAGGAGGACATATCTATTTTGATGCGAAATTTATGTCCAATCATATGGAACTCGAACTTCTCGATGGCCTTCTTGACCGCTAAGTTTTCTTTTAACGTGGAGTGATAATGCATTTTTGCATCTTTAAAGCGTCCGCTTTTATATCCACAGATTTGACATTTCTCATTTATATCTTCGAACAGTATGGCTCCCCAATATTTGTCACTTGCATCAGTCTGCAGAATCCGTGTCCCCGAGGAGGGAATCTTTAGAGGTTGTAGCTTATGTATATCTATCTTTAGCCTTTTGATTGCTTCAGTTTGTCGTTTTGGCCACTGTGGTGGATTCTTCGTCAGCATCTTCTGGAGTGGTCTTGTCAATTGCGAAAGTTATGGGATAAAGTCGCTTACATAATTGATCACCCCTAGAAATTGTTGGACTTGTCGCTTTGAGAGATTTTCGTCTGGAAAATCAAGAAGAGTTGTAGCTAGATGAGATTGAGGCGTAATTTATCCGTCTGTTATCTTCATTCCAAGAAAGTCGATGTTGGGCTGGGCTATAATCATCTTTCAGGTCGAGAGTATAATTCCGAATTCCTTGACAATGCTTTGAAACTTTCTTAGAGTCTTAATATGCTTTGTTGTACTTGACGAGAATAAGAGAATGTTGTCAATGTAAATTAAAGCTGTGTCGATTAGTGGCTTGAATATTCTCAACATCGCCTGCTGGAATAGTGAGGGTGCTGTCTTTAATCCAAAAGGCAGAACACTCCATTGAAGATGGCGATTTGGAAGACAGAATGTTGTCTTGTACCTTTCTTCTGGGTGAATTCCAAGTTGCCAAATACCTGATTTGAGGTCGAACTTTGAAAATATCGTTACTCCTTGTAGATGTTACTGAAGGCCTCCTTGTTTGGCAGAAGGAACTTGATATCTTGAAGATATTGGTTCAAGGGCTTGTAATCGATAACTAGCCTAAGATTCCCTCTTTCTTCTTCTGCTCTGTTATTGACGTAAAATTCTTTGCACGCCCATGGTGAAGTTGTTGCTGAGACGATTCCTTGACTGACTAGTTGGTCACAATCTTCATTCGCCTGTTGTAGTAAGGTATGTGGCATTCCTTCATGACTCTCCTTTGTCGGAGTGATGTGAACATCTTCTTTGAAAGGTAAAGACACAAAGAACTCTAAATTTAGCCACAGTGGGTTGTTGCACTTTTGAAGGAAATATGTATGAGAATCTGCAAAGGAGATTATCGTGATTTCTTCTTTGATCTTGTTGAAGTTGGGAGATGCCGCTTCTTCAAGTGACAATACGCGAGGAATTGTTGTGAAGGCTTTGAGAAAGACTTCCACTTCATTCCCCGTGATTCGAGTGAGATGTTGAACTTCTTCTTCAACGCATAGTACATATCCCATTCCATGATTAGATCTTTTCCAGGGACAGATAAACCAAGGACTTCAGTTGTAATTTGACATCCCGGGAAAATTTCTATGGTTATTAGTTTTGACTTGAGCTTCACCGATAGCGAGCCCGCGTTTACGTTTCAAAAATCTTGATTGTGCGGCAGCCACATAGACGACGGAAGAACTTTGGGATTCATTATAGATTAATGAGCGCCTGTATCTATAAACGCGATTGCATGAACCGGCTCTTTTTTTCTTCGTGGGTCAAAGATTATGACAGGCAAGTGTGGCGTTTGAATCTCGTCTTGTCGCGGTATTTCAGAAGCAACATTCTTCTTCATCTTCTCCTAATGATGATTCCGAAGAATTATCAAAATCTGAGTATCCGCAGATAGCATCATTGTCGTCACTGTCGTATGATAAAATAGACTCCAAGTCATGGTTATCGAGGTCGATATCTGGTGCAATACTGGATATCGAGTTAATGAGATATTGCTTCTTCTTCTTCGACTTGTTCGGACAATTTTTTGCGAAGTGTCCTTTTTTACGACAAAAAATCATCTTGTCGATGCATTTCTTTCTGAAGAAACGTTTACGCCTGAACTTGTTAAAGCGTCCTCGGAATGGTTTTCTAAATCTTCGAGATTTGCTTCGAGGTTCGCATGAACAAGTCTTCTTGGATTTAGAACACTTGATTGATAGGTCTGGTCTGGCACATATTTTGGACAGTTGCTTTGATTTTTCTATGAATTCCATCCAGAATTCCTTTTGCTTGCAAAGCTTGTCGAGTGTTCGGAAGACGTATTGTTGGATTTGACCAATAGATATTTCTTTGATTATCTGTCTTTGGTGTCTGATATACAGCTTGGTTTGTTGACTTAGGTAGTCATCTATGGAGGATAGGTAGACTTGCTTCAAACTTGGGTTATTGAGACCATTAAGTGCACAATATCTTCGTGTTTAGTGTTCAAAATGTTTAGCCAAGTCCTTCTTCTTGAGCAAACAATACTTTGCCAAGAAAAACTCTTATAATAGTTGTTCTTTTAGATGAGTAGGTCTACCGATGAATTCTCTGTGAATTTCTCCCAGAAGTAATGGAATAGTCGTTTGATAAACTTGCTGCTGTCAGTATTCACCTAGCGAATTCCACCATTATTTAGGAGCTCCAGATAGTCGTGCCGTAAATATCTGAATGACTAGCTCTAGGGGTGATGTAATGGCTTCTGAAGTCATCCATGCATGAAATTCGTCGAGTCGATCATTCTATTTTTGAAGGGAATGTCATCGAATGTGAAAATCATGACTTTTGAAGTGAACTGCTTTGGTGGTAGCTCTTGCTTTCTAGGGCGCATGTAACTCATCTCCTCATCACTCAAAAAAACCTAATTAATGTTTGGTTCTCTTTTTGGAGCAGTTGAACCTTCTCCGATGGCAAATTGCTTTGGGAGAGACTTCTTATCTGATATATC

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_74

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1401

Start:

318189  

End:

319589

Strand:

-

>Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_74

AGAAGTTTGCCTGATAGTATCGAGTAAGCTGGACATCGAAAATTTAATTATCCCAATATATTTCTCTTTGTTCTTTGAATTTCCAATAGATTTGTGGCTTGAAGAGGAGGTTAGCGTAGGCCTCTTAGTTGGATTGACTAGGAATTCTGATTCTTTTTTTCTTCTTGGTTTTGCTCGAGTTGGCTTAGATTTGAAATTGCTAGCCAATAGTGTGTCATATCGAGAACTGAAAGCTTTGTCGGATGATACGAATTCTGGGGGAGATGGCTTCGTCCTAAGTTCTTGATAACCAGAGAAAAATCATGGGGAGTAAGATCTCTAATACATAGGAAATCCTGATGGCATACTTCCAAGAGGATTAAAGTATGTATCTACTTGATCCAGGTTATGAATCATGCTTTCTAGACATCTTTGGAGATCTTTTAGCTGGTTTTTGAGGCTGATTGTCTCAGATTCTATGCTTCAGAAGTTAGACATATTAACCATCATGTGTTGTGACATAGCTGTCATCTCTTCATGAAGATTGTTGAGTCAGTCGTGGATCTCCATTATTGAATTTTGTAGGCTGCTTAATCTTTTGTTGTAGCCATCGGTGAGTTGATCAACTTTATGATGTATTGTTGTCAGAAGTTAATTTTGGGCTAGGGCATTTTCTGTTTGCCAATTAAGGACCTTTTCTCCTTGGCCTAGTTGGTCAGGTCCGGTAGAGTTGACGGCTCTCGTGAGGATCTTTGGACTATGAGTGATACTGTCTTTGGTGAAATCTTCAGGTAGAGGGAAATTGTTTGCTTGCATCATCAAGATTTGAGGTTCTTCCCTTTTTCCGAGTATTAGACAATAAAGTCGTACTTGTCATCACCTAACGGTCTGGCAGTGGAATCGCCCTCGAGATATCTCTTGTAAAGAGGATCTTTCTTTTTTCTTCGTCTTCGGCAGATTTTGTTATCGGATTCGTAGAATTCTTCTGTGCAAGCTGTGCAAGAACATACATCAAAGTATTGATGTCCGTTCTCATCCTTGAAGGGGTAGACGACTTATCCGTCTTGACCAAAACAAAGAGGTTGTAGAGCGCCAGCTTTGAATGGGCCATGGAATTCGTGTTCGCCAATTTGTATGGCAAATTGAGTGAACAGTTGCATCCGAAACGATGATGATCTTGGTGTTTTGAACTAGATCTCTGTTGTTCCATTATTTTGAGAATGGAAACTGACTTCTGATGTTTGAACCGGAGTCTGGATTGCTTGATGGAGCTTCTCATAGCTTGTGATCCATGATTCAGGTAGTCGACAGAATAATTTATCGCGAGAGATCTATCGAGGAATCTCAATTGAGTTTGGTGCCTGTAATGCCCGCGGTGACTTCGAGGTATAAAGCTTCATCAGATGATGGTAGTGCTAGATC

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_75

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1521

Start:

319626  

End:

321146

Strand:

-

>Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_75

GAGTCGTGTGTTGACAGACGGGGCAGTATTTTCCAAATAAAGGGAGCTCTACTGGGCACTTCCGACCTCTTACTTGCTCAACCACTGTTAGGAATTTACACCCTCCAAAAGTCGTACTGATTCTAGCCGTGTTGATAAACCAGAAAACTCAAGCATCGATCTGGAGCAGATCGGCGTCTTTCTGATGACAGAAAGTAAATAAGGCTTATGAAGATGTTAGGAAGTCTGGAAAACTTAAAGACTTTAGAGACTCATTTAAAAGAGAAACTATATAGAGGTTTTATAGAAATTCTGAGATTATTTGTTACAAGGGGGTACACACATATTTATAAGGAGGAAGAGTGCACACTGATATAAGTGCTTACCTCATTCCTACATTATTGATGTGCTGACATAAGCGCTTACATCATTACTTATGCGATTACATCATCGCTTACATCACTACTTATTTATTATATACATAATGAAGTATTTATAGATACTTCATTTAGTGATCCATCTCGAACTCGATCATATGTTTGTTGCAACATCCGTAGTGATCCCCTGGACATTCGTATTCTTCTTTTGGTTCTTCGGGCTCTGTGTTAACGTCGATGTTGAATATTTTTCATATTTCATCAATATTCATGGAATCGTCAGGGAGTTGGGCGTCTTGGAAATATTCTGGCGGGCATTGTGGAGGTGTCTCTTCTTGTTTCACTATCTCCGAAATGTCATGCCTTGTGACCTTCGTAATATTCGCCATGCTTTCGTGTTTCATCATGAAATATTGTCAATCTTCGTTGAGACTCATCTGGTAGTCAGCAGAATAGTAGATCCAGCTTGGGTTGAACGGAATGGGGAATGTCAACCTGGCATTGTTGAGGCAAAAAGCGTGCGTTTGAAAGTCTTCGTAAGGCTTGTTGTCATGGATATTGAAATCTGGGCGGATTGCTCTTCGATAGTCGTTATGGTGAATGAGTGTGGATAGTGCATGAAGTTTGTTGGACTTGATGTTGATTTGAACAAGTCGGTGGAAGAAGTATATAGTATGAGGGTTGAAGAATGGATTAAGGCTTCTTTAACCTCTTAGTTGCTTGAATGACAATCTTGTTTCTTTTGCTGATCTTCTTAGTTTTCCGTTCCAAATGTTGAAAGATGCAAACCACTTTAGGAAAGTCGAGAGACAATCCTTCTGACCTTGCTGGGCATTGATGTATTGATAAAGCCAACCTATGTCGAACGTGATGCCAATGGTGTAGACTGAGCATATGTACCATAAGAAGTTCAAAACATCTTTAGGCATATTCGAATTTTCGATCCTGTAGAGGTGAGCGAACAGATAGTTTGGGTGAGTCCCCATTGGTGCGATGTAGTGACAATTGATATCGTGCTTTGAGAGGATGATTGACTGATAGTGGAAGATCTTATGTTAAAGATGTTCGTGTACAGAGTTTCTTTTGATTAACTGATGGGTGTCTTCGGGCATGTTGGCTTCGAAGTCGTAGTAACTCTTTGTAGAAATATATGAGCTCGCCATTA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_76

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1548

Start:

321180  

End:

322727

Strand:

+

>Thla_scaffold281_LTR-Caulimovirus_76

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_77

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3098

Start:

312501  

End:

315598

Strand:

+

>Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_77

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Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_78

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

521

Start:

315715  

End:

316235

Strand:

+

>Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_78

AATATTTATTAAAACTAAAGGATATAGTACATAAAACAAATAAGCTATATACTCCAGAACCATTTAGCCTTAATAAAATACTTGAGAAATACCCTTCTCCAACATTATTTAAACAAGTAACTACTGGAGAACTACAAGGAGAAGTTAAAAATTTAAAATCTCAAGTAAAAGAACTACAACATATAGTTCATCAACAACAATTAGAACAATTACAGATGAATGCTCGTTTAACCTTGATTGAACCAAAAATTCACCAATCGATATCCACCATACCCGATCACGCAACTACAAGTAACAGTCAAAACAAAGAACAAATTAAAGCTGAAGAAAAATATATTCAAATAATAAACAAAATAAACTATCAAAAATGGTATACAAAAATTACATTGCACATAGGATACGATTATAAACTAGATATAATTGCATTACTCGATACAGGAGCAGATTATAACTGTATTAAAGACGGAATAGTCCCAACCATGTATTATGAAAAAACATATGAAAAACTTAGTAGTGCAATG

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_79

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1256

Start:

340863  

End:

342118

Strand:

+

>Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_79

GCAAAAATCTGTAATAAAAACTATTGTTTTAAAACACAATTTATCCTTGTTAAAAATTTAAGTCAAGAAGTTAGATTAGGAACACCCTTTTTTACACAAATCTATCCTTTTAAAGTTACACAATCGGGAATAACCACTAAAATTGTAGGTGAAAAAATAATATTTGAATTTTTATCTCCCATGAAAACTAAAGAAATTTTAGCTTTACAAAACTCTACAATAGAAAAATCTAAAAACCTAATAAATGGAAAACAAAAACATATTCAATATCTACAACAAGAAATAAAATATAAAAATATTGAACAGCAATTACATGACCCATTAATAATAAATAGAGTTAAAAAATTAGAAAATGAATTACTAGATCAAATATGTTCTGACCTCCCAAATGCATTTTGGCAAAGAGAAAAACTTATTGTTGAAATTCCATATGAAAAAGATTTCAATAAAAAAAATATATCAACTAAAGCTAGACCAATTCAAATGAATCAAAAACTTTTAGAATATTGTAAAAAGGAAATACAGGAACTCTTAGACAAAAAATTAATACGCAAATCTAAGTCACCATGGAGTTGTTCTGCTTTCTGTGTCAACAATCAAGCAGAAAAAGAAAGAGGAGTACCTCGCCTAGTAATTAATTATAAACCTTCAAACAATGTTTTACAATGGATAAGATACCCTATACCAAATAAAAGAGATTTATTAAAAAGATTATATGATGCTTGTATCTTTTCAATATTTGATATAAAAAGTGGATTTTGGCAAATACAAATAGCCGAAAATGATAAATATAAAACTGCATTTACTGTACATTTTGGGCACTATGAATGCAATGTTATGCCATTCGGTTTAAAAAATGCACCATCAGAATTTCAAAATATTATGAATGAAATATTTAACCCTTACTCTACATTTTCAATAGTATACATAGATGATGTTTTAATATTTTCAAAATCTATTGATCAACATTTTAAACATTTATATACTTTTTTAAGTGTTGTTAAAAAACATGGACTAGTAGTATCAGCCAAAAAGATGCAAATATTTCAAACAAAGATAAGATTTTTAGGACATAATATATATCAAGGAACTATGACACCTATATCCAGGTCTATAGAATTTACAAATAAATTTCCTGATGAATTAAAAGAAAAAACTCATCTACAACGATTTCTAGGATGTTTAAACTATATATCAGATTTTTTACCTAATATACGAAAACTTATTCAACCATTGTTTCAGAGATTACAGAAGAA

Thlaspi arvense (v1.1)

ID:

Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_80

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

585

Start:

364699  

End:

365283

Strand:

+

>Thla_scaffold288_LTR-Caulimovirus_80

ATTAAAAAGAAAGTCATATCCTTACCATGCTTAGTCATTCCACATCCAAGTGCATTTATAATAGTAGAAACCGATGCATCAGAAATAGGTTATGGGGGAATCCTTAAAGAAAAAATGCCAGAGTCAACCCATGAGTCAATAGTTCGTTTTCATTCTGGAGTATGGCTTGGCCCCCAAAAGAATTATTCTACAGTTAAAAAAGAAATTTTATCTGTCGTAAACTGTATTTCTAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAAAGTTTTTATTACGTGTTGATTGCAAATCTGCAAAAGAAATTTTACAAAAAGATGTTAAAAATCTAGTTTCTAAACAAATTTTTGCAAGATGCCAAGCTATTTTATCTGTCTTTGATTTTGATATACAATATATAAAAGGTAAAAATAATTGTTTATCCGATTTTCTAACAAGAGAGTATTTACAGGAAAAATCTCAAGATTTCCAAAATGAGTGAACAAAAAAGGCCCATGTCCGCAGCAGACTACATCAAGAATCAACCACATCTACAAGGGAAACAAATTACCACCAGTAATCAATTCTCTGCATTGGCAGAATTTCCACCTCT