ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
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LA_scaffold98_LTR-Copia_6642 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1402005120190+
LA_scaffold988_LTR-Copia_6643 RetrotransposonsLTRLTR-Copia4981324213739-
LA_scaffold99_LTR-Copia_6644 RetrotransposonsLTRLTR-Copia657137393138049+
LA_scaffold991_LTR-Copia_6645 RetrotransposonsLTRLTR-Copia11777311907-
LA_scaffold994_LTR-Copia_6646 RetrotransposonsLTRLTR-Copia6943492135614-
LA_scaffold994_LTR-Copia_6647 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1003989839997-
LA_scaffold997_LTR-Copia_6648 RetrotransposonsLTRLTR-Copia4721612316594-
LA_scaffold997_LTR-Copia_6649 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1043080830911-
LA_scaffold999_LTR-Copia_6650 RetrotransposonsLTRLTR-Copia3091196012268+

< 329 330 331 332 333 > Total 333


Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold98_LTR-Copia_6641

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

848

Start:

16059  

End:

16906

Strand:

+

>LA_scaffold98_LTR-Copia_6641

GAACCACTGATATACAATGTTTTAATCTAAATAATACCGCAAGTGTACGATGTACCGTTGAAGTATGTTAGGATCGAATCCATAGAGAACAATGTATTACTCAATGAAACATAGAGTTTATCGTTATGCTAAAACGAAAATAAGGTTGTTTAATGTTGTGTTCTGTATCTAAAACGTAATAGCAGAATTGAAATGGTTTGAACTATGGATTTAAAACGTTTGGCACTAGGATATTCGGGAATACAATACTAGGAAATCGGATTACTATTCAGTATCAGAATTAAACCACATCTTAAACTCAAACAGATACGACTAATCAATCCACTTCCTTGGCATTGATCACTAATGAACTAGAATTCGAGCATCTAAGTTTCTGCTTGATCACGACAATCCTAATCATGCATTACCTACATGTTTGATCGGTTCACGGATTTCAATAACTCAATTTCTATTGGCAAAGGAAAGATATGCTTATCTAGATCTAATCCGGTGATTCTCAGACTTTCGGAATGAGAAATCTAACATAAGTTCATCAATTCAATGATTAGTTCAATCAAAGCATTAAGCACAACCAATATGAAGATCTAACATCCTATTTGAATCCAATTCTCAGATCTAATCCCTAGAATCATAGAAACCTAACAAATGATCTACTCACACATCATCAATGAAACAAAGTATGAAATTGAATCAGAAATCATAATTAAACAATAAAATTAGATTGAATTAAGAGTTTAGAAAACTTTTCCAATACAAAGCTGAGGTTAGAGAGAGATTAGAGCTTCATAAACGTTTTTAGAAAGAGAAAGCATATGTTTAAAATGATGAAAACACGTTTAAGTATCTAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold98_LTR-Copia_6642

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

140

Start:

20051  

End:

20190

Strand:

+

>LA_scaffold98_LTR-Copia_6642

GTTTTCCGACTCCATGCCTCCTAAACATGTATTCTTCATTCCAAGCTCCTAATACTTGCACAATGACTCAAAACAAACTAAAAAGACTCTAAAAACACTACGACTCTACGGTTTAAACGTATAAAAATTCAATATATCAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold988_LTR-Copia_6643

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

498

Start:

13242  

End:

13739

Strand:

-

>LA_scaffold988_LTR-Copia_6643

TTGGGCATGGACCTATCAATCTGGACGACTTGAAGTGATAAAAATAACTTTGAAGTCGTAAAATAGAGGAAAACATCTTTTTGAAGCAAAGGAAGAAACATAACTAAGAGAAGAGGGAGAAGGGAGAAGAGAAGGGGATATAAGGTAAAAAGAGATGAGTTTTATCCTTTTTCCTACTGATTTGAGTTGGTAAACTCATGGATAATGTTGTGGTGTTGTTTAAGTTTAAGGTGAGAAAAGAGGAAATGCTTCAAGATTGAATCAAGAAGTTTTGGAGCTCTAAATAAGTAATAATAAAAGATAAACTCATGTGTAATACTTGTGTTACTTTGATTTAGAGTTTGGGGAGTTTTTAGGTGAGGTTCAGCCATGGTGGCCGCCTTGGAGATCGATCGGGTAGTTTGTAAGTCGGCCACTGGTTGTCGCGTACGGATCGGTCGGGCGGGACCGGTCACGGTAGGGTGATACGGCCGGGTGACATCCATTCACGATCGACCG

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold99_LTR-Copia_6644

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

657

Start:

137393  

End:

138049

Strand:

+

>LA_scaffold99_LTR-Copia_6644

CAGAAACATATTTTCCTGACAAAAATATATAAATATATTTTTCTGTCAGTAATATAGGATAAATTTTTTTGCAAAAACACGGAAACAATTTTCCATAAAAAAAAAGAAACATATTTTTCTACAAAAAATATAGAAACATAATTTTCTATAAAAATGAGAGGATAAATTTTTTCGTGAAAAAAACGGAAACACTTTTCAAAAAAAAGAAAACATGTTTTCCGCAAAAAAATATAAAAACAAGTTTTTCCGTTAAAATACATGATTTTGTTTTGTAAAAATGCGGTAATAAATTTTTCTTAAAGGACATGGAAACACTTTTCCGCCAAAAATATGAAAACTTGTTTTTTCGCCAATAATACGGAAACACTTTTTGCAAAAATACAAAAATATATTTTTCTGCCAAAAATACTGAAATAAGTTTTTTCTATAAAATCACGAAAACATTTTTCTGATAAAGAATAGAAACATGTTTTTCGCAAAAAATACGTAAAAAAGATTTCCTGTCAAAAAATACAGAAAAATATTTTCTGTTTTTTCGTAAATAATACATAAACATTTTTCTGCAAAAAACAGAAACATATTTTCCCACAAAAGTATAGAAACACGTTTTTGTCAAAAAAAATACAGAAACATGTTTCTGCCAAAAATACAGGAACA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold991_LTR-Copia_6645

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1177

Start:

731  

End:

1907

Strand:

-

>LA_scaffold991_LTR-Copia_6645

TTTAGGCCCGTTTGGTTGCACATTTGATATTTACCTTCAAATGGTTCATTTAAATAATCTATCTAAATGAACCATTTAGATGTTGTTTGTTTTAATTGATTTTTTTTGTTTCTCATCTAGATAAATCATTTAAATGAAAATGAGAAATGATGTTTGTTATTGTTGAAATTACATTTTTTCATAAATTATATTTTAACTTCGACTGTATTTTCGGAAACTTTGTATTAGTGTTTTGGTTAGAAATTAAGTTTTTATATTTTTAGTTGAAAATTATATTTGGGTGTATTTGGAGAAAATTCATATTTTCATATGTTTTGTGGGAAATTATATTTTTACATCTCTGAAGAAATTTTTTTATATATATTTTTTAAGAAAAAAAATATTTCGACATTTTTGACAGAAAATTATATTTTCATTTTTTGGTTGAAAGTTGTGTTTCTATTTTTTTGGAAAAAACTACGATTTTGGCAGAAAAATGTATTTCTTTATGTTTGGCAGAAAAATTATATTTCTGTTTTTTGACGTGAAATTGTGTTTACATGTTTTCACCGAAAATATATATTTTTGTATTTTTGGCTGAAAAATTGGTTTCAACGTTTTTGGCTCGAAATTATGTTTCTACATTTATAGTGTAAAAATATGTTAATATATTTTTAGTCGGAAACTTTGTTTCAACGTTTATGGTCTGATATTGTATTTAAGCGGCAGAAAATAGTGTTTAGTACTTTTGAGTAGAAATTTAATTTGTGTATTTTTGTACCAATTATGTTTCTGCATTTTGGTAAAAAATTATGTTTTTGTGTCTTTTTACGGAAATTGAGTTTTCGTATTATTTGAAGGACTAATGGATCATCCAAATATTTGCAACTTTTTTTGTTTTTTAAGAAAAGCATGTTTCTGCGTTTGTACCGCAAAACATATTTCCTTGTGTTTTTACGAAAAAATTATGTTTTTATTCTTTTGACAGAAAATTATTTTGTATTTACTTTCTATTTTTATATTGTTATTTTATTTTTAAAATAAATAAAAACTGAATTATCTAATTTAGCCTAAATTTTACAATTCATTCAAATGTTTTAATATTTAATATTTGTTATTTAATATTCAACTCAATGAATCATAAAAATATTTAATATTTGTTACAAAACAAACATTAATAATCACATCAACATTAAAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold994_LTR-Copia_6646

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

694

Start:

34921  

End:

35614

Strand:

-

>LA_scaffold994_LTR-Copia_6646

TTTGTTTTTTTTAATCTAGATGAATAATCTAGAAGAATATATGAATTAATATTTATTTTAAAATAAAAATTTATCATTAATTTATTAAATAATTCATTTGAATAGTTAATATAAATATATTATCTATTGTTTATTTTTTTATTTTTCATATAGATAAAAATAAAAATTGTTGTTTGTTTATTGTTAAAATTAGAAATAAGAATTGATGTTTGTTTATTGTTAAAATTATATTTTTCCACAAATTATAATTTAGCCAAAATTATATTTTTAGAAATATTATTTCAACGTTCTGGTTAGAAATTGTATGTTTATGCTTTGGTTGAAAAATATGTTTTTAGGGTATTTGACAGAAAATCGTATTTCTATATCTTTTGTGGAAAAATATGTTTTTACGTTGTTGGCTTGGCAGAAATTATGTTTCTACATTATAATATAAAAATATATTTATGTGTGTTTTTAATCTAAAACTCTATTTTAACGTTATTTAAGTGACAGTAAATTATGTTTTAATATTTTTGACTAGAAACTTAGTTTCTGATTTTTTACCAGTTATGTTTATTTATTTTTGAAAATATGTTTATGTGTTTTTGCATAATATTATGTTTATGGAAAAGTGTATTTCTTTGTTATTTACATAAAATTTTGTTATTATATTTTTGATGAAAATACTTACTTTTTTATTTTTTGGTTTAAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold994_LTR-Copia_6647

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

100

Start:

39898  

End:

39997

Strand:

-

>LA_scaffold994_LTR-Copia_6647

TGTTTTTGATAAAAAAGATATTTGTACGTTTTTCTATTTTTTAAGAAAAATATGTTTATATATTTTTAGAGAAAAAATTATTTCGGTGTGTTTTATAAAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold997_LTR-Copia_6648

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

472

Start:

16123  

End:

16594

Strand:

-

>LA_scaffold997_LTR-Copia_6648

TTGGTGACTGGTTGGAGAAGGTCACCTTGTCGGGTGAAATGTGGTGACCGACCGTGTGGAAGAACCTTTGGACCAGTCGGGTGGAAAAGTTACCCAACCGGGTGAGAAGTTTTAAACTTTGGGCCTTAAGCCCAATTGAATGGCTGACCTTGGGAGGAAGAAAAGGTCGAGCAGAAGCAAGAACAGAGCACCAGAGCTCAGTTTAGAGAGAAAATAAGGAGATAGAGGAAAGGGAGAAAAAGAGGTGAATCTAGGTAAGAATTGTGATTTTGCTTCCTCCTTTGTTGTTATTTGTAGTTCATCACTCATTTCCCTTGTTGGTTGTGGTTTAAGTATTGGAAGAGAAGAGGAGAAAACATTCAAAAGAGGAATCAAGGGATTTGGAGCTTTAAACAAGTTGTTTTGAGGTAATACTAATGGATTCTTGTTTATAAATGTTGGTTTAAAAATTGGGAAGGATTTGGGATGATTT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold997_LTR-Copia_6649

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

104

Start:

30808  

End:

30911

Strand:

-

>LA_scaffold997_LTR-Copia_6649

TTGGTGACTTGTTGGAGGAGGTCACCTGGTCGATTGAAATGTGGCGACCGACCGGGTGGAATAACCTTTGGACCGGTTGGGTAGAAAGGTTACCCGACTTGGTG

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_scaffold999_LTR-Copia_6650

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

309

Start:

11960  

End:

12268

Strand:

+

>LA_scaffold999_LTR-Copia_6650

TCCCTTTCTTTCTCCTCCCTTCTTTTTCTTATTTTCTCACTTTCTCTTCACTTTGTCACTCTCAAACAGAGTACTTCCTCTGTTTTGGTCGACCACAACTTGGTCAATTATCACACCAATTCGGCCAAACAATTGGGCCTAAGGCCCAACCCAAAATTGACTTCACCCGGTCGGGTGAAATACTTTACCCAACCGATCCGTAGCCAACACCACCCGACCAGTCGCACACCTACACTCGACCGGTCCGTCCTAGCCATCACCCGGCCGATCCCAACATGTCACCCGACCGGGTGACTCTCTAGGCAGTCA