ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr8_LTR-ERV1_21 RetrotransposonsLTRLTR-ERV19124677142467804-
NSCAFA.226I_LTR-ERV1_22 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11003029130390-
NSCAFA.226I_LTR-ERV1_23 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1114100052100165+
NSCAFA.226I_LTR-ERV1_24 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1101103811103911+
NSCAFB.271_LTR-ERV1_25 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1101113307113407-
NSCAFC.98_LTR-ERV1_26 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1998739487492+
NSCAFC.98_LTR-ERV1_27 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1131121114121244+
NSCAFC.98_LTR-ERV1_28 RetrotransposonsLTRLTR-ERV199137205137303+

< 1 2 > Total 2


Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr8_LTR-ERV1_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

91

Start:

2467714  

End:

2467804

Strand:

-

>Chr8_LTR-ERV1_21

GCATGTCAGCATGAATGTATGTATGCATGCATGAATGATGTATGTATTTATCCATGCATGTATGAAAGTACGCAAGCATGTATGCATATAT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFA.226I_LTR-ERV1_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

100

Start:

30291  

End:

30390

Strand:

-

>NSCAFA.226I_LTR-ERV1_22

AATGCATATGTATGTATGTATGTATGCATGTATGGATGCTTATGTATGCATGAATGCTTATGTATGCATGAATGCTTATGTATGTATGCATGCATGTATG

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFA.226I_LTR-ERV1_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

114

Start:

100052  

End:

100165

Strand:

+

>NSCAFA.226I_LTR-ERV1_23

ACACATGCATACATGCATACATTCATGCATCATTTCACGCATGCATACATGCATCATTGCACACATGCATACATTCATACATTCATGCATCATTGCACACATACATACATGCAT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFA.226I_LTR-ERV1_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

101

Start:

103811  

End:

103911

Strand:

+

>NSCAFA.226I_LTR-ERV1_24

ATGCATACATTCATGCATCATTTCACACATGCATACATGCATCATTGCACACATGCATACAATCATACATTCATGCATCATTGCACACATACATACATGCA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFB.271_LTR-ERV1_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

101

Start:

113307  

End:

113407

Strand:

-

>NSCAFB.271_LTR-ERV1_25

ATGTAAATAAATATATTATATACATATTATATATACAGTTAGAATATATATACATGCATATATACATACATACATATAGTTTTTCTTACTGTCTTATTCAT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFC.98_LTR-ERV1_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

99

Start:

87394  

End:

87492

Strand:

+

>NSCAFC.98_LTR-ERV1_26

AGTACATATATTATACATACATGCTTGCATACATTCATACATGCATGCATACATACATAAGCATTCATGCATGCATACATACATACATACATATGCATT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFC.98_LTR-ERV1_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

131

Start:

121114  

End:

121244

Strand:

+

>NSCAFC.98_LTR-ERV1_27

AAGGTATGTTCTCTTAAATCTTCTTCTTATGCACACATACACACATGCATACATATATATATATATATGCACACATACACACATGCCTACATATATATATATATATATATATGTATGCCTACATGCTTGCA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

NSCAFC.98_LTR-ERV1_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

99

Start:

137205  

End:

137303

Strand:

+

>NSCAFC.98_LTR-ERV1_28

AGTACATATATTATACATACATGCTTGCATACACTCATACATGCATGCATACATACATAAGCATTCATGAATGCATACATACATACATACATATGCATT