ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig4373_LTR-ERV1_21 RetrotransposonsLTRLTR-ERV18926022690-
Contig447_LTR-ERV1_22 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1871196912055-
Contig5136_LTR-ERV1_23 RetrotransposonsLTRLTR-ERV111917421860+
Contig534_LTR-ERV1_24 RetrotransposonsLTRLTR-ERV112160816201+
Contig6130_LTR-ERV1_25 RetrotransposonsLTRLTR-ERV12269141139+
Contig631_LTR-ERV1_26 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11124116541276-
Contig742_LTR-ERV1_27 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1889075990846-
Contig745_LTR-ERV1_28 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1906097961068-
Contig759_LTR-ERV1_29 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11187734177458+
Contig7764_LTR-ERV1_30 RetrotransposonsLTRLTR-ERV113881218-
Contig887_LTR-ERV1_31 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11246579365916-
Contig90_LTR-ERV1_32 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1948286382956-
Contig990_LTR-ERV1_33 RetrotransposonsLTRLTR-ERV110986878795-

< 1 2 > Total 2


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig4373_LTR-ERV1_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

89

Start:

2602  

End:

2690

Strand:

-

>Contig4373_LTR-ERV1_21

TGGATGTATTTATGTATGTATGTATCTATGCATGTATTATGGCTTGATTGTATGTCTATGCAGTTATGTTCATGGCGATATCGGTCTAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig447_LTR-ERV1_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

87

Start:

11969  

End:

12055

Strand:

-

>Contig447_LTR-ERV1_22

TATGTATGTATGTATGTATGCATGCATGAATGCGTATGTATGTATGTATGCATGCATGAATGCGTATGTATGGATGTATGCATGCAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig5136_LTR-ERV1_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

119

Start:

1742  

End:

1860

Strand:

+

>Contig5136_LTR-ERV1_23

GTCCAATTTTTTTTTTATGGTAAACTCATTTCACTACATAATATGAACGATATGTATATATATATATATATATATATTTGTGTATATATATATGTGTATATGTATATGTATATATACAG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig534_LTR-ERV1_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

121

Start:

6081  

End:

6201

Strand:

+

>Contig534_LTR-ERV1_24

CATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATATATATATATATATATATATTATTTGTATCTCCATATGTATATAGATGGAATATATGTACATTAGTGGCATGAAATGTTATGTTTAACTTATTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig6130_LTR-ERV1_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

226

Start:

914  

End:

1139

Strand:

+

>Contig6130_LTR-ERV1_25

ATATATACATATATGTAAATGTATGTATATATATATTATACATGTATAATATATATATACATACATATATATATGTGTAATATGTATATGTATATATATGTAATAGTTAGAGAGGAAAGAGAAATAAAATAAAGTTAGATTTTAATTATTTATTTATTTAAATTGTATAATGGCAATTGGGTAAATAAAAGAAAAGTTAAAGGATATATAAGATTTTGTACATCTA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig631_LTR-ERV1_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

112

Start:

41165  

End:

41276

Strand:

-

>Contig631_LTR-ERV1_26

ATATATAAATATGTGTATATGACTCGTGTCTATGTATGCATCGATTTATATGTGCACGTATGATGTATGTGTGTGTATGATATGATACACTTATGCTAAATATATTCTGTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig742_LTR-ERV1_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

88

Start:

90759  

End:

90846

Strand:

-

>Contig742_LTR-ERV1_27

GTGTATATTTACTGTCGACAAGCAACATGAAAATGGACATAAATATGCCATTTCCTCTGCCATATGGTATCCCATTGACACTGGGCTG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig745_LTR-ERV1_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

90

Start:

60979  

End:

61068

Strand:

-

>Contig745_LTR-ERV1_28

ATGAATGCATATGATGTATGCATGTATGTATGTATGTATGTTTATGCATGCATGAATGCACATTAATGTATGTGTGTGTTTATGCATTTG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig759_LTR-ERV1_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

118

Start:

77341  

End:

77458

Strand:

+

>Contig759_LTR-ERV1_29

ATATACGTATGTACATACATACATGCATGCATATGTGTGTATCTATGTGCATGCATGTATTTTATATGTATGCAGTTTGATAATATCCATGGTTTTGTGTTGTACAACTAAGTGAAAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig7764_LTR-ERV1_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

138

Start:

81  

End:

218

Strand:

-

>Contig7764_LTR-ERV1_30

GGCAATATATATATAGTATCAGTATATTATATTCCATTTATATATAGATTTACTATCTATATATATATATTCATTTTTACACAGGCGTTGACTACCGAGGTATATATATATATATATATATATACATTTGTATATAGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig887_LTR-ERV1_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

124

Start:

65793  

End:

65916

Strand:

-

>Contig887_LTR-ERV1_31

TTTATTCTTTGCAAGTAATATATATTACACACATAAATACGTAGATATATATATATGTATAGTATATGCATATGTAGATGTATATCAGTGTATATATATATATATGTATATGTATGTAGATGTA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig90_LTR-ERV1_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

94

Start:

82863  

End:

82956

Strand:

-

>Contig90_LTR-ERV1_32

TTACTGTTACCATTATATATATATAATATGGATTATACTATACATGCCTATATAATATATATATATATATATCCATAAACACATACACATATGT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig990_LTR-ERV1_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

109

Start:

8687  

End:

8795

Strand:

-

>Contig990_LTR-ERV1_33

ATATACATATCATTTTATATATACGTACATACATATATATATATATATATGTGTGGGGGTGTCTCTCTATATACATTATATCAAGCATATACACATTACACTAGGCCTG