ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
scaffold42|size1480117_LTR-Ngaro_21 RetrotransposonsLTRLTR-Ngaro145470964471108-
scaffold54|size764999_LTR-Ngaro_22 RetrotransposonsLTRLTR-Ngaro195579915580109+
scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_23 RetrotransposonsLTRLTR-Ngaro44319656101966052+
scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_24 RetrotransposonsLTRLTR-Ngaro11237247093724820+

< 1 2 > Total 2


Boechera retrofracta (v1.0)

ID:

scaffold42|size1480117_LTR-Ngaro_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Ngaro

Length:

145

Start:

470964  

End:

471108

Strand:

-

>scaffold42|size1480117_LTR-Ngaro_21

GTTGTTGCCGCTGCCGTTGTTGCTGCTGCCGATGTTGTTGATGCCGAAGTCGCCGCTGCTGCTACTGCTGCCACCGATGTTGCTGTTGCCGCCACTATTGTTGTCGATGTTACTACTGTTGCCGTTGATGCTACTGATGTTGCTG

Boechera retrofracta (v1.0)

ID:

scaffold54|size764999_LTR-Ngaro_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Ngaro

Length:

195

Start:

579915  

End:

580109

Strand:

+

>scaffold54|size764999_LTR-Ngaro_22

CCGACGAATCATGACCAGCAGCTATTCCTCCAACAACAACAGCTACAACAACAGCAACAACAACAGTTTCAACAGCAACAGCAACAACAACAACAGTTTCATCAGCCACAACAAGAGATGCAACAGTTTCAGCAATTCCAACAACAGCAACACTTCATTCAACAACAGCAATTCCAACAACAACGGTTGTTACAA

Boechera retrofracta (v1.0)

ID:

scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Ngaro

Length:

443

Start:

1965610  

End:

1966052

Strand:

+

>scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_23

CAACAACAGCAGCTGCAGCAATTGTTGCACTCCTCTTTCAACCATCAGCAACAACAATCGCAGTCTCAACAACAGCAACAACAATCGCAGTCTCAACAACAGCAACAACAATCGCAGTCTCAACAACAGCAACAACAACAGTTGCTGCAGCAGCAACAACAGTTGCAGTCTCAACAACACTGCAACAACAATCAATCGCAGTCTCAACAACAACAACAACAACAATTGCTTCAGCAGCAACAACAACAACAATTACTGCAGCAACAGCATCAACAACCGTTACAGCAACAGACTCAGCAGCAGCCGCTAAGAACGCAGTCATTGCAATCTCACTCGCATCCACAGCCACAGCCACAGCCACAAGGCCCACAACAGTTACAACAACATAAGTTGCAGCAACTTCAACTTCCTCAGAATCAGCTTTACAATGGTCAACAAGCAGC

Boechera retrofracta (v1.0)

ID:

scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Ngaro

Length:

112

Start:

3724709  

End:

3724820

Strand:

+

>scaffold6|size5173884_LTR-Ngaro_24

CAGCAGCAACAACAACAACAACTTCTCTATCAACACCAATTACAACAACAGCGACAACAACAAATGCTTCTATTGCAGCAATTGCAGAAACAGCAACAGCAACAAGCAGCAA