ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
A01_RC-Helitron_81 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron6482502827225028919-
A01_RC-Helitron_82 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron6372503752725038163+
A01_RC-Helitron_83 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron6122512487825125489+
A01_RC-Helitron_84 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron64992560407425610572+
A01_RC-Helitron_85 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron2382754709127547328-
A02_RC-Helitron_86 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron168730778883079574+
A02_RC-Helitron_87 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron20461854566185659+
A02_RC-Helitron_88 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron144381469808148422-
A02_RC-Helitron_89 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron65081487348149383-
A02_RC-Helitron_90 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron86681496028150467-
A02_RC-Helitron_91 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron19781507468150942-
A02_RC-Helitron_92 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron33281512088151539-
A02_RC-Helitron_93 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron10383491078349209-
A02_RC-Helitron_94 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron98583493788350362-
A02_RC-Helitron_95 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron70989123648913072-
A02_RC-Helitron_96 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron7081005058310051290-
A02_RC-Helitron_97 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron6151011863810119252+
A02_RC-Helitron_98 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron1091011927610119384+
A02_RC-Helitron_99 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron1021144959011449691-
A02_RC-Helitron_100 DNA transposonsRC-HelitronRC-Helitron9811144986111450841-

< 5 6 7 8 9 > Total 187


Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_RC-Helitron_81

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

648

Start:

25028272  

End:

25028919

Strand:

-

>A01_RC-Helitron_81

ACGAGAGGGAACACAGTAACGCCAGTACGAAGAGGCAGATATTGTGTGTACGTATAATTACAACGTCACAAAATATTTTGTGTGTTTACAAAGATACTTTCATTTAAAAAGTAGAATAAATAGTGTATAGTTTTAGAGGTAACAGATTTTATATTATCATTAATTAGAATTGTATTGTATATGTTTCGTAATTCTTTATTTTAGGTGAATAATATTATTTTTCCATAAATAATAAACAAACATTTATGTAGACATATTAAAAGAAAATATAATAAAAATCAAAATATTATCCATAAATAATATAAATTATAAAGTACATTTCTCGATAAAGAAAGCAAATTCAATTAGAAACTTGCAAAAAATTAAATAAATTTTGTAAGAAATTTGACGGGTTAACATTATTTGATAGATTTATAAATTTCTAAATTTTATTGAACATGAAATAATATTAAATTGACATACTGTCATCGGTCTTCTAACTCATCACAACCCATCTAGCAAATACAAAAAATAAATAATTGCAACAGTTTATTCATTTTAAAATTTGTATTTGAAAAAAAGTAGATTAAAATTACGTACCGTGACTACGAAATATTCTGAAAAACTTGTTTGTAGACAACATTCAATATTTTTGTCTGCGACTTCCTT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_RC-Helitron_82

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

637

Start:

25037527  

End:

25038163

Strand:

+

>A01_RC-Helitron_82

GAAGGAAAGTCGCAGACAAAAATATTGAACAAGTTTTTCAGAATATTTTGTAGTCACGGTACGTAATTTTAATCTACTTTTTTTGCAAATAAAAATTTTAAAATGAATAAACTGTTGCAATTATTTATTTTTTGTATTTGCTAGATGGGTTGTGATGAGTTAGGAGACCGATGACGGTATGTCAATTTAATATTATTTCATGTTCAATAAAATTTAGAAATTTATAAATCTATCAAATAATATTAACCCGTCAAATTGCTTACAAAATTTATTTAATTTTTTGCAAGTTTCTAATTGAATATGCTTTCTTTATCGAGAAATGTACTTCATAATTTATATTATTTATGTATAATATTTTGATTTTTATTATATTTTTTTTAATATGTCTACATAAATGTTTGTTTATCATTTATGGAAAAATAATATTATTCACCTAAAATAAAGAATTACGAAACATATACAATAAAATTCTAACTAATGATAATATAAACTCTGTTACTTCTAAAATTGTACACTATTTATTTCATTTTTTGAATGAAAGTATCTTCGTAAACACACAAAATATTTTGTGATGTTGCAATTATACATACACACAATATCTGCCTCTTCATACTGACGTTACTGTGTTCTCTCTTGT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_RC-Helitron_83

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

612

Start:

25124878  

End:

25125489

Strand:

+

>A01_RC-Helitron_83

AAATATAATACAATAATTATTTGTAGATCCAAACTGGTACGTTTAACTTTATGGGACGAGGAGACGTCTAATTTCAGGGAGTTAAATCTCATATCTACCAGAAAAAACCAAATCGTAATCATCACAAGTATCATTCTACGGTTACATGAAGGTAATAAACTAAACATAAAGTTTATGTCAAACTAAATGCTTACAAATATTTCACTTTTTCAGGGAAACTATCACTCATAACCACACCTGGATCGCGCTTCTACTTTGACAACGATATTGATATCATACAACGCTTCCAAAAGAGGAATAAATTACTATCCTAAACCTCATAGCAAACGACACCAGTCAACTTTTTTAAAATTTACGTTACAGCTTTCTACGTCAATTAAATAGGCACACTCAAATATTATTTTCTTTTACGAATATTAAATTCATCAACATAATTTATTATTCAAACTTAATTTAGTTTATAAAAAAAATGATCACCGCTTCCAACGTCTTCGCATTATAAAAGAAACAAAACTTAACTTACACTTTCAGAAACATCAAAACTCCCAATTTTAATTAAACTGTTCTTTAATTAAATATGTAATCCGCGCGAAGCGCGGACACGGGCTCTAG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_RC-Helitron_84

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

6499

Start:

25604074  

End:

25610572

Strand:

+

>A01_RC-Helitron_84

TCTTGGGTCACTAACCACTTACCTGATAAGGGAGTTGCCACTTATGCCAACTTACTATTAAATCATCTAATAGTCGTGTCTCGACTATTTAAATTTTACAGCCCCTTTAGATGCGTCTTCCTCCTCTGAAGCAACAAACAACCCAATTTTAGAATGTCCATCGTGTGGTGCTTTGGTCTGGCAATCCGAGAGCACCGGAAGAGACCCTAGAACGAAGGAGTTACGCTTTACCATTTGTTGCAACCAAGGATAGATAAAGCTTCCGCCTATGAGACAACCTCCACCCGTGTTAGAAAAGCTACTGCAATGTAAACAATTTCGCGAGACAATCCGAGTCTACAATTCCCTCCTAGCTTTTACATCTATTGGAGCGAATATAGATTACAGTGTTGTCTTCGGGAGGGGGCCATTTACATTCCGTATTCAAGGGCAAACTTACCACCGTATCGGATCCCTCATTCCTAAGCCAGGTTTACCACCCAAGTACTTGCAGCTCTATATTTTTGATACGGCAAACGAAGTTAAGAATCGGCTGGAAGCTTTAGGCCAAACAACCTCTGAAGGAAAAGCAACCGAAGCCACATTAAAAGTCCTAATAGAAATGGTGGATACCAACAATTGCCTTGCAAAAGTTTTTAGGAGGGTTCGAGATCGGTACGAGGCAAACTCTGAAGAAGATTTTACGATCAGTCTCATATCTGATAAAGGGAAAGGCAAACAATATGACTTACCCCAATCATCTGAGGTTGTTGGACTAATTGTCGGCAAAATGTCAGACACTATATGTGAGAGAGATATAGTCGTCAAGTTTCAGTCAACTAATTTGACAGAGATACGAGATGATCATCCACTCTACATGAGCCTCCAGTACCCACTTCTGTTTCCTTATGGTGAGTATGGTTTCAATACCGAAATTCCATTGCATTTAGAGGAAGGAAGCTCGAGGACAAGAAAATTTGTAAGTATACGGCAATTTTATGCCTCTCAAATACAAACTCGGTTAAAAGAAGGAATGACACTCATTAAGTCTGGGCGCCTTCTCCACCAATATGTGGTCGATGTATATTCTTCAATCGAGGAAGATCGTCTTCGATGGCATAGGCTCAATCAAGACGTTCTAAGGGCTGAGTTATACAGTAATGTTTGTGATGCAGTCGGAAAAGGTGACACCGATGCAAGGACGGTTGGTAAGAGGTTTATTCTACCACCGAGTTTTACTGGTGGGCCCCGTTATCTGATTGAAAAATATCATGACGCAATGGCGATATGCAGACAGTTTGGGAATCCAGATTTATTCATCACAATGACGGCAAACCCAAATTGGAAAGAGATAAAAGACCATCTAGCAGCATACGGCGGTGATAGCCCGAATGACAGACCAGACATTGAATGCCGAGTTTTCAAAATGAAACTAGACCAGCTGCTAGATGATTTTAAGAAGGGTACATTCTTCGCCCCATACACCGCAGGTATTCCCTTTAATTGGAAAATTTAATTCACATAAATCTTCATATAAGTAATTAAACTCTTTTTTATACCAGCTCTTCATAGGATTGAGTTCCAAAAAAGAGGTCTCCCCCACGCACATATTTTGTTGTGGTTTGGAGACCACTCTAGAACACCCAGCCCAGAAGAAATCGACAAGATTATTTCGGCCGAGCTTCCGGACAAGCAGAAAGACCCCGAAGCCTATGAATTGGTTGCAAAGCACATGATGCATGGGCCATGTGGACTCGATAGACCTCGATCACCATGTATGGAGAATCATGTATGTGCGAAGAAATTTCCCCGCCCATTTACTGAGTCTACATCAATTGATAAGTCTGGGTACATAATATATCGTCGCCGGAAGAACGAAAATGCGAATGTTTTAAAGGATGGAATTCTTCTAGACAATGCTTCTGTCATCCCTTATAACATAGAAATCCTGAAGAAGTATGCAGCTCATATAAACGTGGAATGGTGCAATCGGACATCCGCTATCAAATACCTTTTCAAATACATCACAAAAGGAGTTGACAGGGCGACAGTTCTGGTTGAGAAAGGCCCCGACCCACCTACATCCGAGAATGGAAGCGACCCCCAGACATCCGAGAAAGGCAAGGAAAAGGTCAAGAAAGCAAGGAATGAGATAAAAGAGTATCAGGACTGTCGATACTTATCCGCTTGCGAATCCATGTGGAGGACTTTCGCTTATTCTATACATAAACGCCAACCATCCGTCATGAAGTTGGTTGTCCATCTGGAAGGTGAACATAATATCACTATCAAAGATACGGATAACCTAGGAAGAGTTATACAGAAGCCAGGCATCGAAAAGACTATGTTCACCGAGTGGATGGTTCTATGCAGAACATCCGCGTTCGCCCGTACCTTAACGTATGTCCAGATTCCTGAGTTCTTCACATGGAACAATAGCTCAAAAGTCTGGTCAGAGCGAAAGAGAGGAACTTCAATTGGTCGGGTTGTTACTGTACATCCCGCTTCAGGGGATCGATACTATTTGAGGATACTGATAAATAAAGTGAAGGGCCCTAGAAGTTACAAAGAGCTTAGAACCTTCAACGGTGTCACATATCCCGATTTCAAAAGCACCTGCTGCGCACGAGGTCTTCTCGCTAACGATGCTGAATGGCACGAAAGTATGGCTGAACTCAACACATGGGGCACACCTTCTCAGCTAAGAGAAATGTTTGTCACGTTACTTATCTACTGTCATGTTGCTAACCCTAAGGAATTGTGGGATAAGTGCTGGAAAACTCTGAGTGAGGACATCCTTTACAAGAAACGTAAGGAATTCAAACACCCACAGCTAGAAATAGATGATGCTAAGCTCGAGCAGTATACATTACTTGAACTCGAGAAGGCTTTGCGGAACCAAGAACACACCCTTACTGATTTTCCAGGAATGCCTACTCCTGATCCTCTCCTACTTAAAGAGCTAGGTAATACTTTGTGGCAGCAAGAGCTACAGTATAATCTCGCCGAGGAGAAGAGTAGACATGACACCCAATACACGTTGCTCAACCGTGAACAATTGGACGTCTATCAGGCTATTATCGAGTCGACTCAAGAAGACTACGGGAAGCTATTTTTTGTCTACGGGGCTGGGGGCACAGGCAAAACATTTTTATACCAGACAATCATTTCGAGACTACGGTCAGAGAAAAAGATAGTCCTTCCTGTTGCTTCATCTGGAATAGCAGCCCTACTACTACCAGGCGGCAGGACTGCCCACTCCCGTTTCAATATCCCAATCGATCTAAAGGCCACATCCACCTGCCACATTACACCTGGAACTATGCTCGCAGAGTTAATAGAAAAGGCAGCTCTAATCATATGGGATGAGGCACCTATGACACACAGGCATGCTTTCGAAGCCCTCGATAAGTCCTTAAGAGACATTCTTTCTTTACATGATCCCAAAGCCAAAACTCTCCCATTCGGCGGAAAAACTGTTCTTCTAGGAGGTGATTTTAGACAGATCTTACCAGTCATCCCACAAGGCACCAGAGCTGAAATTGTCTCTGCCTCCATAAGTCATTCATATTTATGGGAATCATGCCACAAATTCACCCTCCAGAAGAATATGCGCCTCAGCGAAGATGAGAAAGAATTCTCCAACTACGTCCTAAGAGTTGGCGACGGGAACCCCCTACCTACTGAGGTCAATGAATTTGATGAAGATGAAGAAGATCAGCTCATTTCTATTGACCGAACGTTGGTCGAGGAGGTCAGCTCAGATCCTCACAAACAAATTCTAGAAGCTACTTACGGGCGAACTGATCAGTGGAAAGGAACCAAACAAGACTATACAGAAAGGGCTATCCTCACACCAAGGAACGAAACGGTGGATGAGATCAATGAATACATGATATCTGAAGCTGACGGTGTTTCAAAGGAATATCTCAGTTCCGATAGCTTCGGTATAATCGACACCGACTCTGCGAACAACGAGACATTGTACCCAGTAGAGTATTTAAACTCACTGAGCTTTCCAGGCCTGCCTGCACATAAGCTTACATTGAAAGTGGGTGCCCCTTTCATGCTCCTAAGGAATTTAAATCAGAAGAAGGGGTTATGCAACGGAACACGTCTGATTGTCACTTACCTAGGTGAGCGTGTTATTAGAGGTGAAATAGTTACAGGCTCCCATATTGGACATAAAGTGGACCTTCCAAGAATCATACTATCGGAATCAGTAACTAAACATCCGTTCACTCTAGAAAGGCGGCAATTTCCGATCAGGCTATGTTACGCAATGACAATTAACAAAAGTCAGGGTCAGAGTTTGAAAGGTGTCGTGCTGTATTTGCCCAAGCCCGTTTTCACCCATGGGCAACTCTATGTTGGTCTTTCCCGAGTTACTACCAAGTCAGGCCTCAAAATTATACAAGGAAAGGATCAAAAGATAGGAAGGGTCAAAAACACTGTCTACAAAGAAATATACAACGGTTTACCAGGTAATCAAATATTATTTGCAACCCAGTTCACAACATCATCCATAAATACTCACCTCATTTCTCTCTCTACTCCAGAGTCAATATCCGATGATCACCCAGAGCAGGCTTCCCGGAATCTTCAACAACTTTCTATACCATAAGATGCAAGCTACCAGTAAGTCTTCCGGTCCGAAACTCTTCAAACCCATTAATGAACATGTGCTAACAAAATTGTTTATATCTATAGGTCCGCCCGCAAAAGAAAGTCGCCGCTCTACAAGACCATTCACAATAACCCTACAAGCCATCGTCTACGGCTTATCTTATTTTATTTTATTTTCGCTACCTACCACTTACTATTTCCTTTGGACAATTACTTATTTCAACTATCGAACTTTTATCTTTTGCATTTACTATTATTTCAGACAATTTTAAATTTCAAATGTTTTCTATAATAATGTGCGAATTGCCAAAGTTCCCTTTAATCTTAAAATAGTACGTCCAAGATAATAAAATCTCCTCATTTCACACACAGCCCCTGTAAATTACTAAAAATAACAAAATTCTCATATCAAACCCACCCAGCTAATTTACTACTACCACCTATAATTATGGCCCAGCCTACTTAAAATTTTAAAAAACCTTGACAATACTTAAAAAAAAACACCCTAACTATGTTCACTTCAAAAAAAAATAAAAAAAATTTGCGCAGTAATTAAAAAATAATCATTCTCATCGATCTAGCACATGCAGCAGAAGAGCAAATCAACTGGGGCAACACCCTCGGACCTCATCCAATAATCGTTAGGATCCTTAGGGTCTGGCCCATCACAAATCATAAAAATAAAGATGCTTTCCTAGGAACAACTTTCATCTGTCTTGACATCCAGGTATGCCTAAAATTCCTATTTTTAATTATTCCAACTATATTTCAAATGATTGCTTCTAACCACTAAACATGAACAAAAAATGGAGGGGAGGGTGCCTATATCTACGTCTGACACAATGTACCAACGCTTCGAGGAAGGGAAAATTTATCACATTAGATATTTTAATCTCCTCCCCAATAACCAACGTTACAGGCTTACGGACCAACCATACATAATCAATATCAAAGAAACAACAACTATTACACTGATTCAAGAAAACATTCCACCGATCCCTTCATACATATTCCAGCCCCAACGCTACACCCAGTTGTTCAGCTCAGCAAGTGAAACCAACTTCCTACCAGGTAAAAAAAAACCAAAAACTCTCTCACATAAAAATAAATCCTACTTTTTTTTAAAACAACCAAATTATTCCTACAGATGTTGTCGGCCGCATTTGCCTCATCCAAGGTACCGATTTATATAACCACTACACAAATTCAAAAATCATCATTGGATTGCGTTTAGACAGGTACAAACTTTTAATTAAGTAATAATTGGTTTACAACTAAACAAAATCTAATACATTAATTATTTGTAGATCAAAATTGGTACGTCTAACTTTATGGGACAAGGAGGCGTCTAATTTCAGGGAGTTAAATGGCATATCAACAAGGAAAAACCATGTCGCAATCATCACAAGTATCATTCCACGGATACATGAAGGTAATAAACTAAACATAAACTTTACAAAAAACTAAATGCTAACAAATATTTCACCTTTTTCAGGAAAACTATCACTCACAGCAACACCTGGAACCCGCTTCTACTTTAACAACGAAATTGAAATCATTCAGCGCTTCCAAAAGAGGAATAAACTGCTATCCTAAGCCTCATAGCAAACGACACCAGTCAACTTTTAAACCATTTACGTTACCACTTCCTACATCAATTAAATTGTCAGCCACATAGATTATTTTCTCATTCAAATATCGAATTGCTCAAAACTATTTATTATTCATCCTTACAGTTGTTTTTTTTTTAAAAATGATCACCGCATCAAACTTCTCCCCTGTATAAAAAAACAAAACTTAACTTATCTTTTCAAAAACTTTAAAACACACAATTTCAATTCACATCATTTATATTAAACATGTAATCCGCGCGAAGCGCGGACACCGACCCTAG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_RC-Helitron_85

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

238

Start:

27547091  

End:

27547328

Strand:

-

>A01_RC-Helitron_85

CGTGTGAACTCCGATCTTATGCATAAAACCATCTATTTAATGAACATAGTTTTTTCGATGTCAGGTTTTCGGAGAACACGCCCCAGATCATATGTTTCTTTAACTGTGATATTATGTTCACCTTCCAAGTGAATGATTAGCTTTTGGACTGATGGTTTCCTTTTGTGAATATGGAATGCAAACATTCACCACATAGACTCACAAGCTGTTAAGTAGCGACAGTCGATGAAGTCTTGGA

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_86

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

1687

Start:

3077888  

End:

3079574

Strand:

+

>A02_RC-Helitron_86

TTACTTATTTCAACTTTCAAACTATTTTCTTTTGCATTTTCTATTATTTCAGACAATTTTTTATTTCAGCTGTTTTCTATAACAATGTGCAAACCGCCTAAGTTCCCTTTGATCTTAAAATAGTACGCCCAAGATAACAAAACCCCCTCATTTCACACACAGTCCCTGTAAATTTCTATAAAAAACTAAATTCTACTATCAAACCCACCCAACAAATTTACTACTACCACCTATAATTATGGCCCGGCCTACTTAAACTTTAAAAAAAAACATGACAATACTTAAAAAAAACACACCCTAACTATGTTCACTTCAAAAAAAAAAAATTAAACAAAATTGCCAAAAAAATACTAATTCTCATTCTTATCTATGTAGCACATGCACCACAAGATCAAAGCAATTAGGACAACACCCTCGAACCTCATCCAATAATCGTTAGGATCCTTAGGGTCTGGCCCATCACAAATCACAAAAATAAAGATGCTTTCCTAGGGACAACTTTCATATGTCTTGACATCCAGGTTTGTCTAAAATTCATATTTTTAATTATTCCAACTATATTTCAAATGATTGCTTCTAACCACTAAACAGGAACAAAAAATGGAGGGGAAGGTACCTATTTCTACGTCTGACACAATGTACCAACGCTTCGAAGAAGGAAAAATTTATCACATTAGATATTTTAATCTCCTCCCCAATAACCAACGTTACAGGCTTACCGATCAACCATACATAATCAATATCAAAGAAACAACAACAATTACACTGATTCAAGAAAACATTGCACCGATTCCTTCATACATATTCCGGCCACAACGCTACACCCAGTTGATCAGCTTAGCAAGTGAAACCAACTTCCTACCAGGTAAAAAAAAAACAAAAACTCTCTCACACAAAAATAAATCCTAATTTTTTTCCAAACAACCAAATTATTCCTACAGATGTTGTTGGCCGCATTTGCCTCATCCAAGGAAGTGATTTATATAACCACTACACAGATTCAAAAATCATCATTGGATTACGTTTAGACAGGTACAAACTTTTTATTAAGTAATAATTGGTTTACAACTAAACAAAATCTAATACAATAATTATTTGTAGATCGAAATTGGTACGTCTAACTTTATGGGACAAGGAGGCATCTAATTTCAGAGAGTTAAATCGCATATCAACAAGGAAAAAACAAGTCGTAATCATCACAAGTATCATTCCACGGATACATGAAGGTAATAAACTAAACATAAACTTTACAAAAAACTAAATGCTAACAAATATTTGCCTTTTTCAGAAAAACTATCACTCACAGCAACACCTGGAACGCGCTTCTACTTTAACAACGAAATTGATATCATTCAACGCTTCTAAAAGAGGAATAAACTGCTATCCTAAGCCTCATAGCAAACACCACCAGTCAACTTTTAAAACATTTACGTTACCACTTCCTACATCAATTAAATTGTCACACACAAAGATTATTTTCTCATTCAAATATCGAATTCCTCAAAACTATTTATTATTCATACTTACAGTTGTTTTTTTTAAAAAAATGATCACCGTTTCGAACTTCTCCCCTGTATAAAAAAACAAAACTTAACTTATCATTTCAGAAACCAAAAAACACACAATTTTAATTCACCTGATTTTTATTAAACATGTAATCCGCGCGCAGCGCGGACGCCGGCCCTAG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_87

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

204

Start:

6185456  

End:

6185659

Strand:

+

>A02_RC-Helitron_87

CGAATAGTGAATTCGTTAAAACAATTTATTATTCAAACTTACTGTTGTTTTTAATAAAAATAATGATCACCGATTCCAACATCTTTCCTTAATAAAATAAACAAAACTTAATTTACCCTCTCAGAAACTTCAAAATTCCAAATTTTAATTGACCTGACTTTTATTAAACATATAATCCGCGCGAAGCGCGGACACCGATCCTAG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_88

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

1443

Start:

8146980  

End:

8148422

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_88

TTTCCTTGACTTCACCCGAGACACAGCGACATACAACTGTCCATGGGAAAACACCGATTTGGGTAGATACAACCCTACGTTTGATAATGTTTGACCCTGGCTCTTGTTGATTGTCATCGCAAACGCAACCTTTAATGGGAATTGCCTACGCCGCATTTTAAATGGAAGCTTTGTATCAGATGGCGTAATTAACATTCGATGTAACCATACGATCTCACCGACTCTAGTTCCTGTAATCACTTTCGCCTGTAGAATATGATTTGCCAGCTGGGTTATCTGTAAACGCGTTCCATTGCACAAACCCTCTTCCGGATCGATATTTCTTAATATCATAACAGGGGTTCCAACTCTCAGTCTAAGAGTATGGTTTGGTAACCCTGAAGTTTTTATACTATTGAGGAATTCCGGAGAGAAAATAGAATCATCTTGCGATTTCGTATCAGTTGGATCGATACTGTCAGAACTTAAGTATATCTTCTCCTCACCTATAACGAAAAACACATTTTTAAAATATTTCTTTTGCTTACGAACTGCTAAGTATTAATTGAAAATTGCGGTTAATATATAGTACAACTTGACGCACCTGTTAGCTGATCAAGCATGTAGTTGTTTATCACCTCAACATCTGCATTTGTTGGACACAAAATAGCTCTTTCTTGAAAGAATATTGGATCTCTAGAATCTTTGAAAGTGTTTCCATATACTTCTGAAACAATAGCACGAATTGGATCATTAGCCTCTTTAATCAATAGATCTTTCGGAATATCAATCAGAACTTCTCCACTATTTGGTTCATTGATTCTTCCATCTCCCAAAGCCAATATCCAGTCTGAGAATTCTTTAATCTCTTCAGCTTCGCGAATATTTGTTTCTGCTAACAACCTCATATTTTTTGACAGTTGAAGAACTTTGCAATGCTTCCACAAGTATGAATAATTAAGCGTCGCCATTACAATGTCGGCCCTATTTCCCCTTGGAATAACTGGTAATATCTGTCTGAAGTCCCCTCCAAAAACGACAACTTTTCCGCCATAAGGTGTTCCATCTGCAGTCTTCATAATATAACCCAAACTCCGATCTAGTGCTTCAAAGCAGTGTCTACTCATCATAGGTGCCTCATCCCATATAATTAAAGAAGATTTTTCTATTACCTCGGCTTGATCACTGCCTGGTTGAATATTGCAAGTGGAGGATTCATCTGGATTGATAGGAATTCCGAACCGTGAATGAGCTGTTCTCCCACCAGGTAGTAGTAAAGAGGCAATGCCGCTGGATGCCACATTAAGTACAACATCACCTTTAGATCGTATTGCAGCTGACAAAATATTCCACATGAATGTTTTTCCTGTTCCTCCAAATCCATAAACAAAAAAAACTCCACCTTTTTTGTTTATAACTGCAGATATTATCTCCTCGTACACTGATCTTTGCTCATCTGTCATC

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_89

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

650

Start:

8148734  

End:

8149383

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_89

CGTCGTTTTTTTCGCTCCATATAAAGCACATCTTCAGACAAAATATCTTTAGTTTCTTCCCAAACTAATTTAGGCATAGACAAACTATCCGATATCAACATCTTAGCAAACAGTTTGCGCGCATATCCACTTGATGCCCAGAAACTACACTCTTTCAAACCTTCAATATATTCTTTGTCATCATCCAACAGTCCAAGGTCGAAACATGCATCCTCATAACTCGGGTGAATAACACCATTGACAGTTCTGATATCTGCATAGCACGTTGGGCCTTTTACCTTATTTATCAAAACCCTTAGATAATATTGCGGACCTGAACCTGGGGATACCGGCGCCAATCTACCTATCGCAAAACCTTTCTTCCGTGGGTTCCATTCTTTCTGTTTTGCGTCGTAAACAAATCTTGTTGGCATTTGCGCATATGTCAGTTCTCTCGCCTCGGGGTACTTGATACAACATTCAAACCAAGCTAAGAACATTGTCTTGCATAAAAAACTGCGTTCCATAACACTTGAAACCGTATCACCCTCCCTGTATATAACCGGTTGTTCGCCTTCTAAATGGAATGTAAGCTTCTCCACGGGTGTAGATCGGTAATGCGTTGGAAAAGCCAGTATTCTCCACGTTGCTTCGCAAGAAGAAATATACCT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_90

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

866

Start:

8149602  

End:

8150467

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_90

ATTGTTGCGGTGACACGATCTTGGCCCTTGTTGATGTATTTAAATAAATATTTTATAGATCTTGACTGATTACACCACTCCACGTTGATGTGTGCATTGTAGCTAAGTAAGAGTTCCTTGTTATAGGGGACTACAAACCTGTTGTCACATTTAATTCCCTTCTTCTCAATGAAAGCTCCATTGTCCCTTCTTCGATACACGGGGTACCCTTGAGCATCTACTGTCGTTGTCTCTACAAAATTCCGTGGAAAAAACTTGCTACATCGTCCATCTACCATACATGGAGATCCTCTGTTCACAACACCACATGGCCCATGAATCATCATGTTTTTCACAACTTCATATAATCTCGGTTCAGACTCTTTATCAGGGATTTCAGCAGAAATTATACGATCTATATCTTCCGCTCCCGGTAGCTTGTGCAACGCATCCATAAATAGCAGAATATGCGCATGTGGAAGGCCTCGTTTTTGAAACTCGACTGTGTAGATTGCTGTGAGTAATACACTGAATAAGTTAGGTATTATAAAACGACATCACAACCTATCTTTAAAATTCACAATACACACAAAGTATATACATACCAGCAACAGTTTTCCCAAGCAGATATTTCTTTGTAAGATCGTCCATTAACCTATCCAACTTAATCTTGAAGAGTCGACAACACAGTTCGGGTCTGTCCTCAGCCTTTAGATTAAACTTCTGCATATACCTTTCCAGCTCAGGCCATTTTGGATTACACGTGAATGTAATAAATAGAGAGGGAAATCCAAAGTATTTGCAAATCGTCATGGCATCTAAATACATTTGATGCATATATCGAGGACCCCCAGTGAAAGAAGCTGGTAAGATAATGCGGTTTCCCT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_91

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

197

Start:

8150746  

End:

8150942

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_91

CGAAAACCGTCCTCACCGTAAGGGAAAATAAGAGGATATTGCATAGGTAGATAGCAAGGATGCAACTCATTTATCCTCTTAAGTTTCCCAGACGTTTTCTCTAGAATAATATCACGCTTGTCCATATTCTCCCGAAAATCACCAACAACCAACGCAGCTACTTCCGAAGCTGTGGGTAGATTGGTAACACGTCCATC

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_92

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

332

Start:

8151208  

End:

8151539

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_92

AATCGATTTTGAACTTCATTCTCTGTATCATGGATATATAACTGAGAAAACTTTGCCGTCTCGTTAGGTTTTGGCTTCACACTTCCAATTAAATGATAATTCTCCCCATGCATCTTGAAAACTTTTGGACCCTTTCCCGTGTTAATAGAATTATCTATTTTCCCTCCTAGTGATGTAAAGGAAAACATCATGTTTAAGGGTCTTATATTGTCCCGATAATGTTTGCTGATAACATCATCATTAGTAAGCAGCCTTAAAAGCAGTTCCGGTGGTTCTTTAAGAACAGGAAGCTTTATTTTGCCTCTCATACAACACATGGTGAATACTGGATT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_93

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

103

Start:

8349107  

End:

8349209

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_93

CTAGAGCCGGGGTCCGCGCTTCGCGCGGATAATATGTTTTATTAAAGTAAATTTTTATATTTTTGTAGTTTTAAATATTAGATATTGGAAGTTAAGTTTTGTT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_94

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

985

Start:

8349378  

End:

8350362

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_94

GTATGCCATCAGGCTTAGGATAGCAGTTTATTCCTCTTTTGAAAGCGTTGTATGACATCTATGTCGTTGTCAAAATAAAAGCGTGATTCTGGTGTGGTTGTGAGTGATAGTTTCTCTGAAAAGTGAAATATATGTAAGCATTTAGTTAGACATAAACTTTATGTTTAGTTGATTACCTTCATGTAATCTTGGAATGATACTTGTGATGATTACGATTTGGTTTTTCCTGGTAGATATGCGATTTAACTCCCTGAAATTAGCCGCCTCATTGTCCCATATAGTTAGACGGACCAATTTGGATCTACAAAAAATTATTGTATTATATATTTATTGCTTAACGCAATCCAATGATGATTTTTGTATATGTGTTGTGGTTATATAAATCACTTCTTTGGATGAGGCATATGCGGTCAAAAACATCGGTGGGAATAATTTGTTTTTAGCAACAAAAATAGAGAATTTATTTGACTGTGTGATAGGTATGGGTTTTGTTTTTGACCTGGGAGGAAGTTGGTTGCACTGGCTAAGCTGATCAACTGGGAATAGCGTTGGGGCTGGAAATTGTATGAAGGAATCGGTGGAATGTTTTCTTGAATCAGTGTTATAATTGTTGTCTCATTGATATTGATTATGTATGGTTGAACAGTAAGCATGTACCGTCAGTTATTGGGAAGAAGATTAAAATATCTAATGTGATAAATTTTTCCTTCCTCGAACTGTTGGTACATTGTGTCAGACGTAGAAATAGGCATCCACCCTTCCATTTTTTGTTCCTGTTGAGTGGTTAAAAGCAATTATTTGAAATGTTGTTGGAATAATTAAAAGTAAGTATTTTTTTAGACAAACCTAGATGTCAAGATAAATAAAAGTTGTTTCTAGGAAAGCATTTTTATTTGTGTGATTTGTGATGGGCTACATCATAATGATTCTAGCGATAATTGGTTGCGGTCCGAGGTTGTCGCTCCACTTGTTGTGAACTTCGGCT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_95

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

709

Start:

8912364  

End:

8913072

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_95

ACGAGAGAGAACACAGTAACGTCAGTATGAAGAAGCAGATATTGTGTGTATGTATAATTGCAACGTCACAAAATATTTTGTATGTTTACGAAGATACTTTCATTCAAAAAATAGAATAAATAGTGTATAGTTTTAGAAGTAACAGATTTTATATTACCATTAATTTGAATTGTATTGTATATGATTCGTAATTCTTTATTTTAGGTGAATAATATTATTTTTCCATAAATAATAAACAAACATTTATGTAGACATATTAAAAGAAAATATAATAAAAATCAAAATATTATCCATAAATAATATAAATTATAAAGTATATTTTTCGATAAAGAAAGCAAATTCAATTAGAAACTTACAAAAAATTAAATAAATTTTGTAAGCAATTTGACGGGTTAACATTATTTGATAGATTTATAAATTTCTAAATTTTATTGAACATGAAATAATATTAAATTGACATACCGTCATCGGTCTCCTAACTCATCACAACCCATCTAGCAAATACAAAAAATAAGTAATTGCAACATTTTATTTATTTTAAAATTTGTATTTGAAAAAAAAAGTAGATTAAAATTACGTACCGAGACTACGAAATATTCTGAAAAACTTGTTTGTAGACAACATTCAATATTTTTGTCTGCGGCTTCCCTTCTTTACCAGTTATTAGGATTTTTAATCCAGATCTCGACTTAACTCTTGAAAGTGCAAC

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_96

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

708

Start:

10050583  

End:

10051290

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_96

ACGAGAGAGAACACAGTAACGTCAGTATGAAGAGATAAATATTGTGTGTATGTGTAATTGCAACGTCACAAAATATTTTGTGTGTTTACAAAAATACTTTCATTCAAAAAATGGAATAAATAGTGTATAGTTTTAGAAGTAACATATTTTATATTATCATTAATTAGAATTGTATTGTATATGTTTCGTAATTCTTTATTTTAGGTGAATAATATTATTTTTCCATAAATAATAAACAAACATTTATGTAGACATAATAAAATAAATTATAATAAAAATCAAAATATTATCCATAAATAATATAAATTATGAAGTACATTTCTCGATAAAGAAAGCAAATTCAATTAGAAACTTGCAAAAAACTAAATAAATTTTGTAAGCAATTTGACAGGTTAACATTATTTGATAGATTTATAAATTTCTAAATTTTATTGAACATGAAATAATATTAAATTGACCTACCGTCATCGATCTCCTAACTCATCACAATCCATCTAGCAAATACAAAAAATAAATAATTGCAATAGTTTATTTATTTTAAAATTTGTATTTAAAAAAAAAAGTAGATTAAAATTTCGTACCGTGACTACGAAATATTCTGAAAACTTGTTTGTAGACAACATTCAATATTTTTGTCTGCGGCTTCCCTTCTTTACCAGTTATTAGGATTTTTAATCTAGATCTCGACTTAACTCTTGAAAGTGCAAC

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_97

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

615

Start:

10118638  

End:

10119252

Strand:

+

>A02_RC-Helitron_97

TCCCAATCAGGCTATGTTACGCAATGACAATTAACAAAAGTCAGGGTCAGAGTTTGAAAGGTGTCGTACTGTATTTGCCACAGCCCGTTTTCACCCATTGACAGCTCTATGTTGGTCTTTCCCGAGTTACTACCAAATCAGACCTCAAAATTATACAAGGAAAGGATCAAAAGATAGAAAAGGTTAAAAGCATTGTCTACAAAGAAATATACAACGGTCTATCGCACCTACCAGGTAATCCAATATTATTTGCAACCCAATACACAACATTATACAAAAAATACTAAATTCCTTTCTCTCTCTCCTCCAGAATCACGATCCGATGATCACCGAGAGCAGACTTCCCGGAATCTTAAACAACTTTCTATACCATAAGATGCAAACTACCAGTAAGTCTGCCCACCCGAAACTCTTCAAACTCAATAATTAAGATGTACTAACAAAATTGTTTTTATCTATAGGTCCGCCCGCAATAGAAAGTGGCCGCTCTACAAGATCATACATAATATACTTCACAGACATCGTCTACGTCTTATCTTATTTTAATTCTTTTTCGTTATCTACCGGATTCTATTCTCTTTGGATAATTACTTATTTCTACTGTCAAACTATTTT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_98

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

109

Start:

10119276  

End:

10119384

Strand:

+

>A02_RC-Helitron_98

AAAAAAACAAAACTTAACTAATACTTTCAGAAACTAAAACTCCAAATTTTAATAAAACATTACTTTAATTACATATGTAATCCGCGCGAATCGCGGACACCGGCTCTAG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_99

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

102

Start:

11449590  

End:

11449691

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_99

CTAGAGCCGGGGTCCGCGCTTCGCGCGGATAATATGTTTTATTAAAGTAAATTTTTAAAATTTTGTAGTTTAAGTATCAGATATTAGAAGTTAAGTTTTGTT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A02_RC-Helitron_100

Class:

DNA transposons

Order:

RC-Helitron

Superfamily:

RC-Helitron

Length:

981

Start:

11449861  

End:

11450841

Strand:

-

>A02_RC-Helitron_100

GTATGCCATCAGGCTTAGGATAGCAGTTTATTCCTCTTTTGAAAGCGTTGTATGATATCTATGTCGTTGTCAAAGTAAAAACGTGATCCTGGTGTGGTTGTGAGTGATAGTTTCCCTAAAAATTGAAATATATGTAAGCATTTAGTTAGACATAAACTTTTTGTTTAGTTGATTACCTTCATGTAATCTTGGAATGATACTTGTGATGATTACGATTTGGTTTTTCCTGGTAGATATGCGATTTAACTCCCTGAAATTAGCCGCTTCATTGTCTCATATAGTTAGACGGTCCAATTTGGATCTACAAAAAATTATTGTATTATATATTTATTGCTTAACGCAATCCAATGATGATTTTTGTATATGTGTTGTGGTTATATAAATCACTTCCTTGGATGAGGCATATGCGGCCAACAACATCTGTGAGAATAATTTGTTTTTAGCGACAAAAATAGAGAATTTATTTGTATGTGTGATAGGTATGGTTTTTTTTTGACCTAGGAGGAAGTTGGTTGCACTGGCTAAGCTGATCAACTGGGGATAGCGTTGGGCTGGAAATTGTATGAACGAATCGGTGGAATGTTTTCTTGAATCAGTGTTATAATTGTTGTTTCATTGATATTGATTATGTATGGTTGAACGGTAAGCATGTACCGTCAGTTATTGGGAAGAAGATTAAAATATCTAATGTGATAATTTTTTTCTTCCTCGAACCGTTGGTACATTGTGTCAGACGTAGAAATAGGCACCTGCCCTTCCATTTTTTGTTCCTGTTGAGTGGTTAAAAACAATTATTTGAAATGTTGTTGGAATAATTAAAAGTAAGTATTTCTTAGACAAACCTAGATGTCAAGATAAATGAAAGTTGTTCCTAGGAAAGCATTTTTATTTGTGTGATTTGTGATGGGCTACATCCTAATGATCCTAGCGATAATTGGTTGCGGTCCGAGGTTGTCGCTCCACCTGTTGTGAACTTCGGCT