ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
C07_LTR_41 RetrotransposonsLTRLTR862530497325305058-
C08_LTR_42 RetrotransposonsLTRLTR30949830274983335+
C08_LTR_43 RetrotransposonsLTRLTR24077582507758489-
C08_LTR_44 RetrotransposonsLTRLTR17592563159256489+
C08_LTR_45 RetrotransposonsLTRLTR3321288816012888491+
C08_LTR_46 RetrotransposonsLTRLTR2551289911512899369-
C08_LTR_47 RetrotransposonsLTRLTR3241956424419564567-
C08_LTR_48 RetrotransposonsLTRLTR14212446741624468836-
C09_LTR_49 RetrotransposonsLTRLTR3253478804234788366+

< 1 2 3 > Total 3


Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C07_LTR_41

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

86

Start:

25304973  

End:

25305058

Strand:

-

>C07_LTR_41

CCTTTATGTCGATTGCGATCTGGTGGCTTGCGATGAAATTGCTGATGACAATCCTGTTCTCCCAAACCAAAATTTATATGTTCCTT

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_42

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

309

Start:

4983027  

End:

4983335

Strand:

+

>C08_LTR_42

GTTGGTATCAGAGCTCTGCTACGCTCTGAAACTTTCTCAACCGCTACTATGGTTCGCAAAACTCGTGCTTAGCAATACGCTGATGACGATACCCCCGCTACTCAACAATCCATCAACGATCTCCAATCCCAAATCACAAACCTTGTTGCTGCTGTTACCGCCTTAACAACCCAACAGACCGCCCCTGTTCAATGCCCCCGCACCGATCAGGTTTCTCTCCACAACGAGTCAGACGAGGATGATAATCCATTCGCTCCATTCCGTCAGCATAGAGCGCGGCGTCGCAATACTAACGCCTATGAGTCCGAT

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_43

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

240

Start:

7758250  

End:

7758489

Strand:

-

>C08_LTR_43

GTTTTATTTTTTTCAACAGACCTTCCATGCACAAAAACCGTTTGTGAACTTGAATGGATCTCCCTGATAACCAAGACCAATTGTTGACTTCTCTGTTCTTCCCATGCTCAGAATCTTGTCTAAAGTTGAAGATCCTTTGTTTAACATACGGATTTGTTTATGCGTTTGGTTTAGTTCATGCTCCAAATTCCTGCTTTTCTCTTTCTCCAAGGCAAGAGCTTCCCTAAGATAAGTAATCTT

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_44

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

175

Start:

9256315  

End:

9256489

Strand:

+

>C08_LTR_44

TTTTCAGAAAAGTGTTTCTCCAATATATGACTTGCTTGATGAGCAAAGTGTTGCTCCAATATATGACTTGTACGATGATGAGATTGAACAAGTCACTATCGATAGAGTGGAAGATGAAAGCCTAATTTTTGATTGCCCAATCTATGATACAGAAGCACTAACGCATTCTCAGAAG

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_45

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

332

Start:

12888160  

End:

12888491

Strand:

+

>C08_LTR_45

GTTGGTATCAGAGCTTTGCTACGATCTGAAACTTTCTCAACCACTACGATGGTCCGAAAAACTCGTACTCAGCAATACGTTGAAGACGATGATATCCCAGCTACTCAACAATCAGTTAATGAGCTTCAGGCTCAAGTCACAGCACTTGTTGCTGCGGTAGCGGCGTTAAATACGCAGAATACCGCCCCAGCCCTTCGCAACAGACGCGGCACACGACCGCATAACCAGGACGGCTCAGAGGAGGAAGATGACGGCGATGAAAATCCGTTCGCTCCTCTCCAACGAACTCAACAAAACCGCAACAACAAAAACGATTCCGACTCCGATGATGA

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_46

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

255

Start:

12899115  

End:

12899369

Strand:

-

>C08_LTR_46

ATTGTCATACTCATCATCGTCGAATTTGTCGTTGATATCATCATGTTCCTCGCGTCCATGGCAAGTTGTAGGGGCCGCTCTTTGCTTTATTAAATTAGTAAAGGCAGTAACAACAACCGTGACTTGAGCTTGAATTTCGTTGATAGATTGTTGAGTAGCTGGGATGTCGTTATCAGGTTGTTGCTGAAAACGGCGAGTATAAACCATCGTAGCGGTTGAGAAAGTTTTGGAGCGTAGCAGAGCTCTGATGCCAAC

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_47

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

324

Start:

19564244  

End:

19564567

Strand:

-

>C08_LTR_47

TCTTCATCTGAGTCGGAGTTGTTGTTGGTAGTGCGGTTGTTACGTTGTTGTTGTCGACGGAGCGGGGCAAAGGGATTATCGTCTTCCTCGTCTGAATCAGGGACGTTGCTCGCGCATGTGTTCCGTCCATGGTCGATAGCTGGTGTAATGTTTTGTGTAGATAACGCAGCTACCGCGTTCACAAGAGCCACGACTTGAGCTTGCAGGTCATTCACGGATTGTTATGTAGCTGGGGTGTCACCTCGACGTATTGTTGAGAACGGGTTTTTCGAACCATCGTAAGTGGTTAGCGATACCGGAGCGTAGCAAAGCTCTGATACCAAC

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C08_LTR_48

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1421

Start:

24467416  

End:

24468836

Strand:

-

>C08_LTR_48

GATGCTGACAAATTCTTCACCAATCAAGCATCTCTGGGTTTTAAGAATAGCAGACATGATTCCCCTACTCCATTGTTGACGCACACAGCCTTGATGTTGCGAGAGATTTATCTCAGAATAGCGAGTGTACACGTTTGAGACGGTGGGAAACTCCATAGCTGGATTCTTAGCAGATTCGAAAACAACATCAGGTTTGTTGGTTTCCACATAATTACTTCGAACAAATACAGTGTGTGAACCTGATAGACCTCCTTGATAACCAAGACCAGCCGTTGTCTTCTCTGTTCTACCCATACGTAGGATCTTGTCTAAAGTTGTGGAGCCTTTATTTAACATTCGTATATTCCTGCGTATTTCACTCAACTCATGCTCTAAAATCAGGTTTTTCTCCTGCTCTAAGGGAAGAGCTTCGTCAAGTTTAGTGATCTTTGCAGTCAATATTTTTGTATCCTCTTGTTCAGCCTCACGAGCTTGGTGTGGAACACGATCCGGTGGTTCGCGATTGATGTGTCGGTTAAAATTGTTTCTCCATGCACCATAATTCATATATTTCTTCTGTAAATCCAAAAAGGCATTGCCAGCTCTCTCTCGTCGCAGATAGGAATAAGTTCTGGTTTGGGAGCATCCATATGATCTTCTCTGTTGTTGGACCTACTGCTCTCCCAAAAATAATAATCACTTCGCCCAACTGTTGCCACCATCGTTTGAAAGGGAGGAGAAGTATCTTTGAGATCAAAGTCATGTATAATACAATACCATTACTTTTCACAAAAGCTTCATTAGAAAAAAGTTGGAATTTTTTGGGCATAAACTGATTCATTAAACTTTATGCTTTCATCTTCCACTTTTCCCACTATGACTCGGTTCATCTCGTCTTCTTCCAACATGTCATAGATTGGAGCAATTTCTGTAACGTCTTCATTAGCCACGTCATGGGTTGAAAGGTTTTCTGTATCGTCTTGATCAGACACATCGAATATTGGATCAAAATTTTGCTCTGAAAATTTTTCTCCTTCTTCTTCTGTATCAGAAACGTCAAAAATTGGACCTCCAAGTTGAACAACATAAGAGTTCTCATTGTCTCTTGTGTCCTAAACTTTTGTATCTAAGTCTTCATACTTATTATCAAAGTATGAATCGTTGTTTTTGTTGTTGCGGATAGGGGGTTGATAACGAAGGCGGGACAAAGGATTTTCGTCCTCCTCAAATTCGTCGTCGATAGCAGCTTGGTTGTTGCGTTCTTGGCGAAATACAGGAGTCGCGTGCTGTGTACTCAAGGCGGCCACTGCAGCTGTAAGGTTCTCGATTTGAGCTTGAAGATCTGGGACGGCTCGTCCCGTGATTCCAGTCTCTGTTGGAGGAACAGATTTCTTTAGCCTCACCATTGAATCGTAGGAGCGTATCGAAGCTCTGATACCAAC

Brassica oleracea (Capitata_V1.0)

ID:

C09_LTR_49

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

325

Start:

34788042  

End:

34788366

Strand:

+

>C09_LTR_49

TTGGTATCAGAGCCAGGTTACGCTCCGAATCCTTCTCAACCCGCTACAAAGGTTCGTAAGACTCGTGCTCAGCTGATGACGATGACACCCCTGCTACTCAACAATCCATTAATGATCTTCAGGCACAAGTCACGGCTCTGGTAACTGCTGTTGCTAAACTAACAGCGCAACAAACAGTCCCTGCCGCACGCCATGATCGTCGCGATCGCAACGACCAAGTCTCCGTCCATAACGACTCAGACGACGACGCAAATCCGTTTGCTCCTCTCCGCCAGAACGCACGCCGCCGCGAGGATAATAATGACGACTCAAGTTCTGATGACGA